4IAFA

Room temperature x-ray structure of camp dependent protein kinase a in complex with high mg2+ concentration, adp and phosphorylated peptide psp20
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
336
structure length
333
Chain Sequence
VKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Phosphoryl Transfer Catalyzed by cAMP-Dependent Protein Kinase: An X-ray Crystallographic Study of Complexes with Various Metals and Peptide Substrate SP20.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/peptide
source organism Mus musculus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 108
structure length 333
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iafA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iafA02
2XP2A 2EXEA 5LCJA 4XCUA 3ZLWA 2IN6A 3KXHA 1ZYDA 5HBHA 4I5CA 5EYKA 1YW2A 3MIYA 4DH3A 2ERZE 2FSTX 3PPZA 4M0YA 4R7IA 4AW1A 2OFUA 3QTZA 5FXSA 3U9NA 3D83A 5I9WA 4FEWA 4FL2A 4KIPA 3IGOA 4OGRA 4DLIA 4DA5A 1SVGA 5CU2A 4CTCA 2GHGA 4ALUA 3WF7A 3DS6A 5IUIA 3PVBA 4DH7A 1URCA 2R3HA 2WMTA 2XIYA 3C4XA 2F2CB 1O6YA 5L2WA 3SVVA 3A8XA 5LMBA 2LGCA 1XH5A 3OT8A 2RKUA 4FNXA 2VTHA 3OD6X 4IWDA 4A4OA 5I9YA 5LMKA 5LQFA 1U54B 2YA9A 4PMPA 4F6SA 1WBNA 4GW8A 3DNEA 3M11A 4XNEA 2Y8OA 1A48A 4QMNA 4QT1A 4JDHA 2J4ZA 5H8BA 3H3CA 4LQMA 4ACGA 3KREA 3ZFMA 3V5PA 2VNYA 4NEUA 3ZO3A 3FLZA 5J7HA 3PVGA 3E64A 2BAKA 4J8MA 3GC0A 4RT7A 4BDKA 3HV6A 3GP0A 4X6RA 1OL6A 2QOIA 2YIYA 4CQGA 4RZVA 5CQUA 4C59A 4BZNA 2WTJA 2EB3A 5AUYA 5EDPA 1S9IA 2XNPA 3PA5A 5DR2A 3VUHA 2P55A 5ANGA 4MF0A 3VC4A 4S2ZA 2CGVA 2B9HA 3LQ5A 4LRMA 4EI4A 2HWOA 4U0IA 5KMOA 4RIYB 5F9EA 3BV3A 4FTOA 1OMWA 4C0TA 4V0GB 5AP3A 3EN9A 3L8PA 2CNQA 3TT0A 5L8KA 5C4KA 1BYGA 1JQHA 2R7IA 4TRLA 2PHKA 2YM6A 4X7QA 3DBDA 2EXCX 3H9OA 3R2BA 3F3WA 4XV1A 2WMSA 3HMIA 2R3RA 4D2VA 4JL9A 5HX6A 4FK6A 4H05A 3U8WA 5CSVA 4NYEA 4RWIA 3VRZA 5HG8A 1ZMVA 3UNJA 4RJ3A 4FKLA 3SG9A 1FVTA 2VWBA 4UBAA 5CSWA 4JR7A 5CLPA 4ZS4A 4A9UA 2BZJA 4PDPA 4YLLA 4JQEA 2OJ9A 4FKSA 4ENXA 4O81A 3CQWA 1KE9A 4MNEB 3P0MA 4RWJA 4E4LA 5A54A 5EHOA 3PUPA 3ULIA 4UMTA 2QC6A 4J97A 4WSQA 4Y73A 3PJ2A 4CFNA 4QMSA 4WIHA 2F7XE 4X2FA 3BE2A 4YHTA 4ANSA 3NW6A 4DFYA 1PHKA 2P2HA 4F09A 4AGWA 1PJKA 3IW5A 3FI3A 2IZSA 4ZTLA 5KE0A 4MKCA 4FV1A 3AT2A 3S4QA 4G16A 4NW5A 4FIEA 2R64A 4XJ0A 2BTRA 1Q3WA 2PVYA 3LE6A 3R9OA 5HI2A 4M13A 5K5NA 1M2PA 1Q8TA 1JOWB 3DK7A 3SA0A 4OTRA 3WZDA 2JC6A 4IX6A 5DH3A 1KE5A 4FA2A 3N4TA 4AS0A 4I4EA 3HV5A 3VRYA 3NGAA 4FKGA 4CMUA 3ACKA 3D7TB 3EN6A 3NUYA 5LJJA 3U51A 2QVSE 3R8UA 5KNJA 4I6HA 4ASZA 4C4HA 5A4QA 4FV7A 3KQ7A 2XRWA 4G3CA 4QD6A 4AZEA 4F9BA 3O23A 1HCKA 4CYJA 1OKZA 1SM2A 4F9WA 5A4EA 4NKAA 4EQCA 4WNMA 2W05A 4FZAB 3Q9WA 4XP3A 3FYJX 3IKAA 5FWKK 5E90A 3CJFA 3ET7A 3MPTA 4O7NA 3AOXA 4LYNA 3MWUA 5EYDA 4YJNA 4RX8A 4O7ZA 3SKCA 5I4NA 4AOTA 4A07A 5ANEA 5JMSA 3H4JA 2XBJA 1A9UA 3QCQA 4XV2A 4FOBA 3OVVA 5BVOA 2PUUA 3NWWA 3TZ9A 2CPKE 5BYLA 4LMUA 5JFVA 2XK6A 2ITUA 1VJYA 2QR8A 3A4OX 3BZ3A 3OP5A 5CVGA 2XIZA 4RWKA 1UNGA 3UC3A 4F7NA 3FY0A 3LOKA 4BHZA 3BU3A 2KTYA 1IEPA 2QI8A 3D0EA 4JJRA 4QPMA 4RJ6A 3I81A 2X4ZA 1F3MC 4YZ9A 3PXZA 5JSMA 3RBWA 5EI8A 5JGAA 4JG7A 4R7HA 3P7AA 4YBKA 4ZTNA 3W8QA 5J1VA 3OOGA 4JDJA 5EKOA 4O0SA 3VUIA 5EQYA 3LJ1A 2PVNA 5CSHA 4RVKA 1W84A 1KWPA 2R3MA 4D9UA 5DT0A 2Y0AA 1YI6A 3DA6A 4WG4A 5BYZA 4AFEA 5CAVA 1YI3A 5FP6A 5M07A 3NNXA 3UVQA 4RX9A 3ZEPA 2OFVA 4ZZOA 2DWBA 4L45A 5ANJA 4GK4A 2QLUA 3BHYA 2X39A 4J96A 3HA8A 5J7BA 5TT7A 2UW4A 2ZV7A 2RF9A 2CMWA 4S33A 4GV1A 4YHFA 3O0GA 2WHBA 3UMXA 4E73A 3DU8A 4LGGA 4GFOA 3GU7A 3MTFA 4TY1A 4X2GA 5GINE 3U6IA 3I79A 3CGOA 3QRUA 4PL4A 1WAKA 1APME 4TL0A 4UMPA 3MFSA 3SD0A 2O8YA 3MGYA 4ZJVA 2QOHA 2BRNA 3GFEA 3F3ZA 3PIZA 5EW8A 5B2KA 3LCTA 5BUJA 2BFXA 2XJ0A 3P23A 3R7IA 3T8OA 4KSQA 4FGRA 5L2SA 1PF8A 3KF7A 3R0TA 5DOSA 4P5ZA 3VO3A 3EQIA 1WFCA 2C0IA 4PL5A 3E3BX 4QYYA 3ZXTA 1W82A 3UG2A 3ZLXA 3E87A 1JVPP 4L00A 4FTMA 4S31A 3HDNA 3SRVA 5M08A 1GAGA 1JWHA 4I6BA 5KMKA 1UA2A 2RG5A 2VTNA 3VQHA 1H27A 1UWJA 2DYLA 4OLIA 5AX3A 5CEIA 3WE8A 4QMLA 1T46A 3NNUA 4IQ6A 2AC3A 5IMEA 3S00A 4QMWA 3PXFA 4BYIA 1SVEA 1YOMA 4GFGA 3C4FA 3FLNC 5H8GA 3TZ8A 2ACXA 3GFWA 3BHTA 3QA8A 5GZ9A 5HE1A 3OFMA 2VO7A 2BRBA 3R8VA 4B6LA 4QQTA 2X1NA 4XG6A 4HPTE 4MTAA 3I60A 2JBOA 3VBQA 4CFXA 1WVWA 3EL7A 1Q41A 4ZTHA 4LL0A 1OL5A 4K6ZA 3HYHA 3DPKA 3PY3A 4GG5A 3AXWA 4BVUA 4I6QA 4XG7A 5H9BA 3IQ7A 3DLZA 4C33A 2EB2A 3AQVA 2YEXA 1NVRA 3AT4A 2C5OA 3P7BA 4QMQA 3RK5A 3BU5A 2Q83A 4U80A 2WMRA 4L7SA 2EXMA 3D14A 4QP4A 4W4YA 5GJFA 3SOCA 3TEIA 4BFMA 3G9NA 2QO9A 3PP0A 2QKWB 4FV8A 5EQPA 3PXYA 3DAKA 1QPDA 3TL8A 1NT2A 4O0RA 1FVRA 4YPDA 2OXXA 2O5KA 5EDQA 1S9JA 3MY0A 4M7IA 3R7EA 2VTPA 1Q99A 2ZDUA 3MB6A 3MFUA 4NFMA 5HD4A 1ZZLA 2XNEA 4EOMA 2JIVA 3KEXA 2I6LA 1JLUE 2JIIA 2F57A 3K5UA 4BCGA 4RVMA 4BTKA 3AMBA 3TI1A 2R3GA 2IVVA 3DQWA 3PFQA 4I0TA 2JDSA 4GK3A 5I3RA 3A7IA 3CY3A 4FT0A 4F08A 2WEVA 3AC3A 4GJ3A 3DBQA 4DYMA 2W9FB 3LCKA 3W16A 1OIRA 5LWNA 2PE2A 2XK4A 3A2CA 4XV3A 4FTQA 3Q4CA 2OH0E 1XH6A 2VRXA 4ZOGA 2CCIA 3BI6A 3QQFA 4OUCA 2VGOA 4DEBA 4F9CA 3FZRA 2X9EA 4EK4A 1Z5MA 4JI9A 4XG3A 4S32A 5KMLA 3Q96A 4U79A 4MEDA 4QMOA 3FI2A 4G31A 4RJ5A 1V0PA 2VD5A 3Q9ZA 4GUEA 4IXPA 4LOQA 5L6WL 5A4LA 3GQLA 2BHEA 5AR7A 3ZLYA 1H08A 1R3CA 4JRNA 3QUPA 3F2NA 2PVFA 5EHLA 4FSQA 2VU3A 3M1SA 3OY1A 4KIKA 5J95A 5IG1A 5E9EA 4DEDA 4CFUA 3BQCA 3UIXA 3L9LA 4JG8A 2J0KA 3CKWA 3FXZA 3U4WA 1SYKA 5IMXA 5HEZA 4EH2A 4F1MA 4O84A 2X7FA 2ZAZA 3AD4A 1REJA 5E7RA 5D7AA 5L2QA 5LOHA 5L3AA 5A3XA 3BLRA 4U41A 4DG2E 4ERWA 2UUEA 3AMYA 5AR8A 1Q8UA 2BAJA 4DTAA 3HV3A 2ZVAA 3LFBA 2ITZA 3NW7A 4I0RA 4APCA 2PVLA 4TWNA 3E7VA 3BELA 4V05A 4WUNA 2J0IA 3DNDA 3E5AA 4QPAA 1IR3A 3AGLA 4EL9A 2GNIA 2XB7A 2BROA 3HL7A 4LL5A 4G5PA 4GYGA 2GQSA 3CY2A 3QALE 5HICA 2YDKA 1PYEA 4NWMA 3V8TA 1PMVA 3KVXA 3V8WA 5E8WA 1JSVA 1V1KA 3LLTA 4RJ8A 4RC2A 2X2LA 4MK0A 2ETMA 4BDDA 2CNUA 1ATPE 4L3JA 3E8DA 5HVJA 2AUHA 4BCOA 4JAJA 3V5JA 1E1XA 4ITIA 4O1PA 3BE9A 1Q24A 1KSWA 2QO2A 3FKOA 3MBLA 3QLGA 2QG5A 5HNIX 2YLFA 5BVKA 4BC6A 3U6JA 3NYNA 1H26A 3OC1A 4E4NA 3KFAA 2XUUA 4WKQA 3R7UA 2XA4A 2NPQA 5K9IA 3VUDA 4WBOA 4XRJA 4ANMA 5J9YA 4MCVA 2HK5A 1W83A 3R1QA 2W7XA 5ACBC 2QG7A 4ZP5A 2WD1A 5B0XA 3ZM4A 5BQ0A 4XX9A 3EMGA 4BWPA 4O2ZA 3QTRA 2CKQA 1ZYLA 3LXLA 2WTVA 5IEVA 1W8CA 3TM0A 4R3PA 5TR6A 1CM8A 2UW0A 5EOBA 4AWIA 3QQHA 1YHSA 3LM5A 3QL8A 4UB7A 4EH9A 2WGJA 3KRWA 5AV4A 3TUBA 4O22A 4U43A 3FZOA 1I09A 3OEZA 4NSTA 2A2AA 2W4JA 2J0JA 4EWQA 3MY1A 3HAMA 2VTJA 4O27B 2X8EA 3EHAA 4NZWB 1P14A 4S34A 4FYNA 2ZM1A 4AXAA 4DFXE 3R30A 3ATTA 5FTGA 3QCXA 4WSYA 3TKUA 3ZU7A 4AA0A 4IJPA 4Y46A 5DT4A 2OI4X 5HTCA 2C5XA 3PDTA 4JR3A 4C4GA 4QTDA 4RC4A 3OXTA 4WA9A 3FE3A 4L7FA 1SVHA 4EJ7A 5L8JA 1XWSA 3QZIA 4YLJA 5E8SA 3IOPA 4EHGA 3TUCA 4RIXA 4FEUA 5I0BA 1J7UA 1Z57A 3QTXA 3ZONA 2E2BA 4D28A 4MF1A 1M52A 2GFSA 3PE2A 4IWPA 4W9WA 4D55A 2YHVA 1PXNA 1BUHA 3AT3A 3RZBA 4KRCA 3DAEA 2GS7A 3BLHA 3D5XA 4EK6A 2CLQA 5HCZA 3TCPA 3CGFA 4GVAA 3R02A 2UZOA 5E8XA 3C4CA 4IVDA 4OTDA 3JXWA 5CS6A 1DS5A 1F0QA 4HZRA 3G0FA 1G8AA 1H0WA 2PVRA 1H1SA 1R0PA 3BCEA 3GU4A 4AZVA 3E8CA 3FKLA 4FMQA 2GMXA 3OXZA 2G15A 4I92A 5EI2A 3B2TA 4OTIA 3R7YA 1MQ4A 3ID6C 3DTCA 1BKXA 3MH3A 4YHJA 2CCHA 4DGMA 5E8ZA 5FM3A 1PXKA 4FT9A 4IB0A 4PMTA 4BF2A 3ORLA 3AMAA 3IK3A 2YZLA 3NUPA 5FBOA 4F70A 3SHEA 3KRXA 3W2RA 2V62A 1YDSE 3A61A 4A9SA 4P7EA 3WIKA 4HVGA 1ZOHA 4L67A 5ETCA 2WTWA 4IBMA 5AP1A 3FJQE 1G8SA 1MRUA 3N4VA 1OKYA 4JIAA 3DBCA 3ROCA 3BGZA 1RE8A 3RPRA 3UOHA 1U46A 2FSOX 3LXNA 5AUWA 4JLCA 5D41A 4IAAA 3VJNA 3CTHA 4U81A 4ANLA 5CAQA 5IEYA 1TVOA 2B9JA 2BRMA 2V7AA 2OIDA 3U54A 3EIDA 3K2LA 1R0EA 1WCCA 4C4JA 1QCFA 2UZBA 4ZY4A 3MH2A 2FUMA 1LUFA 2RG6A 4ZTMA 4D2TA 3WE4A 4F63A 3D5UA 1J91A 1VYWA 1KUTA 1MRVA 4QMYA 4OR5A 4YTCA 3QYZA 2VTIA 2W5AA 4XEYA 3GCVA 3HKOA 2HXQA 1MQBA 2XYNA 1UWHA 3NYOA 2WIHA 3ZSHA 1OUKA 3PLAE 4ZTQA 2CKPA 5AAEA 3IECA 4HYUA 1KE8A 4Y5QA 3IS5A 4V01A 1NA7A 4OTHA 3Q9YA 4I94A 4JQ8A 3SX9A 4E6AA 2NO3A 4TTHB 3ZBXA 1UNLA 1QPJA 3EFJA 2R3NA 5EHYA 4RMZA 4FZFB 3V04A 4PY1A 5ANDA 4EH7A 4KBAA 2EWAA 4D2PA 5KMMA 3G6HA 2IW8A 3H30A 3DDPA 4R1VA 1V0OA 1WMKA 3PPKA 4C4EA 5BPYA 1YRPA 3BHHA 5HTBA 1KE7A 2GNGA 4KAOA 1YWNA 3DFCB 2HIWA 3MDYA 3R7GA 3ZDIA 5CAOA 3FZPA 4LGDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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