4IB5A

Structure of human protein kinase ck2 catalytic subunit in complex with a ck2beta-competitive cyclic peptide
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title First structure of protein kinase CK2 catalytic subunit with an effective CK2 beta-competitive ligand
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 110
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ib5A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ib5A02
5HG8A 4M15A 4FKRA 5IUIA 4JVGA 3HUBA 4OTHA 5C8KA 2VGOA 4RX8A 2JDTA 3EB0A 2XUUA 4OT6A 5IQDA 4O91A 2F7EE 2XCKA 4EBVA 3IG7A 5FDPA 3QQLA 3QC4A 3LFSA 3CTQA 5AMNA 4JIAA 4XMOA 4L52A 3TNWA 4CXAA 5EQYA 5J5SA 2VO3A 3G0FA 3EFWA 4QP6A 3RPOA 5EW8A 4WUNA 4GT3A 4RZWA 5J9YA 4QMWA 4L8MA 1YWVA 4P4CA 3ALNA 3QQJA 3G6HA 5DHJA 5I9VA 2ESMA 2JAMA 4Z9LA 4X6QC 3QF9A 4CLIA 3CXWA 4DGOA 3ITZA 4XG9A 4R6VA 3KVXA 2XK4A 2BMCA 2OSCA 2UW5A 4GKHA 4V05A 2R3IA 2XVDA 4FT0A 3VBWA 4APCA 5K0KA 1QPDA 3BYUA 3OOMA 3OP5A 3U51A 3P4KA 5FXRA 1OL5A 2OI4X 3BGQA 4BTFA 3R2BA 4JRVA 4I3ZA 1OL7A 2VGPA 3DLZA 4JOAA 5CQWA 3SRVA 5IQEA 3MA6A 2NNWB 2OH4A 3W2RA 4FX3A 4BF2A 2QU5A 3NW6A 3WF8A 3D5XA 1STCE 3AD6A 4XBUA 4O2ZA 4KRDA 2X8IA 4DHFA 3KN5A 1G8AA 3UQGA 2C4GA 1BL7A 1IAJA 3L8XA 3CKWA 3NR9A 3OCGA 4HPUE 5BMSA 3C4EA 2EWAA 3CQEA 2YCRA 2EB2A 3QRKA 4BDEA 4YHTA 3O8TA 5HIBA 4I4FA 4HYSA 2XIKA 4CQEA 2JDRA 3R1QA 2DS1A 3EJ1A 3CKXA 3RK5A 4F4PA 3HRCA 3OUKA 3SQQA 4JLCA 4NK9A 2R3HA 3U54A 5AR7A 3L8PA 3JVRA 5KO1A 5M07A 2W96B 3F3WA 4BB4A 4AX8A 1V0PA 5AP4A 3R9RA 3R02A 4RIXB 3KMMA 2O5KA 4BWPA 5HTIA 5FD2A 5FLFA 4ZOGA 5CF6A 3DAEA 3P7CA 1H0WA 3R8UA 3E62A 3RPRA 5HEZA 5EI2A 2O0UA 3QD2B 3MVMA 3PA3A 3ZMMA 2V5QA 5IQFA 1OECA 5CVGA 2GTNA 4K1BA 4AW5A 2C6IA 5DR6A 5EYCA 3VF9A 3DOGA 4CG9A 3PSCA 4GS6A 3W2SA 3F5XA 1ZYJA 3GC9A 3WE8A 3BHUA 2BIKB 4FIFA 3PG1A 4C2VA 3KF7A 4FZDB 4E26A 5AAGA 2VTHA 3UC3A 3ERKA 2P33A 3HL7A 1SZMA 2WIPA 4ZJVA 5AP6A 1OUKA 1YXXA 2C6TA 1PHKA 4L3JA 2X2LA 4XUFA 5GZ8A 3T3UA 2BRMA 4P7EA 3AGMA 4I21A 2WKMA 1W82A 5D9HA 4JJRA 4FSZA 3JPVA 5EFQA 2UVYA 5F4NA 2WQMA 1UWHA 3BE2A 3F5PA 3DZQA 4Y85A 4B9DA 4A9UA 4I0SA 4G2FA 2CNUA 2BZIB 2REIA 2GCDA 2QC6A 1Q8UA 3R04A 2CN5A 4B8MA 3POOA 4IIRA 4QT1A 4BCOA 3Q53A 3EQPA 2OXXA 1QPJA 4QYGA 5EM7A 4U80A 1ZYSA 3R7VA 3V5PA 4EH7A 4JR3A 5LWNA 3FXWA 3TZMA 4ENYA 2BDWA 2F49A 3CD3A 4PUZA 4C33A 3CQUA 3QTUA 3ACJA 1UV5A 3GCQA 3KXHA 2W1CA 1PYEA 4QMQA 3L9LA 2B0QA 1TQMA 4DT8A 5M55A 3CSVA 4F9CA 4I92A 3R8LA 4D0XA 5JQ5A 2X9FA 2WMRA 4FTLA 4J95A 4CZUA 2C5XA 5AP5A 4F1MA 3BX5A 4NEUA 4ZXTA 4AAAA 4Z7HA 2YCFA 4YJTA 1WVYA 2JBOA 4R3RA 3FHIA 4HGTA 2JGZA 2ONLC 3QZHA 4A07A 3OXTA 4J71A 5F1ZA 4UZHA 4LV8A 4HNIA 1H28A 5K4IA 3ZXTA 5DG5A 3HV3A 4LMNA 3GC0A 2J0IA 3FZRA 4N0SA 4A7CA 5CF5A 4CFXA 2E9UA 1F3MC 3VO3A 4DEEA 2JFMA 2A27A 2UZLA 4ZZNA 5HNIX 4RBLA 3G15A 4JBOA 4A9SA 3GC8A 4L42A 5IPJA 5DA3A 2P3GX 1JKSA 1UU8A 3BV2A 3HRBA 4V0GB 2PMLX 2IVTA 3A99A 2W05A 3QUDA 3V6SA 2IZUA 3QL8A 2YEXA 3S1HA 4O0UA 2QOBA 3AC1A 3FEGA 4FV3A 4OTQA 4RX9A 1HOWA 3S3IA 1Q8YA 2YZAA 4FODA 4XS2A 3D7ZA 3I5ZA 3NAXA 2VNYA 3QQKA 4WNOA 1F5QA 5AIKA 4LRJA 4RVLA 5DR9A 2ZYBA 3A4PA 5EDQA 3ZSIA 3KREA 2GS2A 4NM7A 2VTOA 2XCHA 4I94A 3WF9A 4F9AA 1GIJA 2CSNA 3KCKA 3RPSA 4WO5A 3FZSA 5FWKK 2W9ZB 2XBAA 3DKCA 5EM5A 4FOCA 5ITAA 2BUJA 2ZV7A 2C0OA 5FUTA 4ASZA 5BVOA 4M0YA 2J0LA 3QZFA 3DAKA 3ROYA 5KHXA 4ZP5A 4FTCA 2HXLA 4PRJA 1H01A 4JQ8A 2O65A 2WZJA 2YIQA 2DUVA 4YTFA 1KE5A 2QO2A 3VQHA 5HBJA 4PX6A 3SW4A 4ACDA 4MXAA 5KMKA 2X4FA 4KBKA 3F7WA 4ID7A 5EI8A 2XIRA 4ZTLA 4AW0A 2CKPA 4E93A 2JC6A 2A2AA 4GCJA 2E9OA 4IX6A 2Z7SA 2FSMX 3OEZA 1R0EA 5BVKA 3RMFA 1OL6A 2J4ZA 4EZ5A 5T68A 1ERKA 5F94A 4ZZMA 4NW6A 4WNMA 5HLPA 1B39A 3DGKA 3ZEWA 3BV3A 2HW7A 4O0VA 4IMYA 2G1TA 2PMOX 4CG8A 4GU9A 1M2RA 1VEBA 4N6ZA 3NW5A 4DEAA 4Y95A 3VN9A 3FMMA 3AT2A 4IZ5A 3MTLA 3DBQA 4DITA 1DS5A 4DTKA 3BBWA 4EOKA 5JKGA 4CV8A 5A4TA 4IX3A 4BDDA 3GEQA 4G3FA 1ZLTA 4BIBA 2BDFA 4NKAA 1P4FA 4D9TA 1J3HA 5IDPA 5BUEA 2CJMA 5JRSA 4TYHB 5L2QA 3UIMA 5AV4A 4JR7A 2QG5A 5E1EA 3TZ9A 4QMVA 3QGWA 2YISA 2WTKC 2QOLA 4L9IA 3I0OA 4W4YA 4BC6A 4BICA 2XNPA 2VUWA 5E91A 3PA5A 2ONLA 3W2PA 3MH3A 5CTPA 2Z7RA 3GUBA 3R7OA 4ALWA 1M7NA 3OY3A 3TDVA 1ZMUA 2EXEA 2C68A 3EN6A 2I0YA 4WBOA 1BUHA 5BYYA 1NT2A 3KK8A 2WMVA 4FG9A 3QC9A 4FTQA 3GQIA 4DBNA 4GIHA 1NA7A 4IB5A 2HIWA 1JVPP 2W5AA 2XM9A 3F2NA 3FHRA 4TNBA 3RWQA 2PVRA 4BCJA 5A4LA 4AGWA 3PIYA 1KWPA 5IQGA 2HZ4A 3NDMA 3ODZX 4RWLA 1JBPE 3KB7A 4A4OA 2BTRA 2PHKA 4J1RA 3O8UA 1KE8A 3VBQA 2UW9A 3ORXA 3QZGA 4FYNA 3H4JA 4WOVA 1JQHA 1EH4A 3ZM4A 1LUFA 5HU3A 1SVHA 5LVLA 1BX6A 4QOXA 4QMZA 4MH7A 3VS7A 1PYXA 5CQUA 5E92A 4JDKA 3HECA 4GT4A 5L2SA 4IVCA 4C57A 4C4JA 1KV2A 2CPKE 3VS1A 1ZXEA 3QYWA 4ZMFA 5J9LA 4PDSA 5IG1A 1ZZ2A 4FIJA 3NW7A 1VYZA 3PVUA 3OG7A 3ORIA 3BQRA 4QO9A 4TPTA 4CZYB 1PXIA 4MVFA 2Y6OA 3R00A 4L45A 4RIYA 2UZUE 3Q9ZA 5AWMA 5EQPA 4EZ3A 4Y5HA 3EZVA 3BPRA 1BLXA 2YHVA 3E64A 3RM7A 3VRZA 4NM5A 5GHVA 5JFVA 4I4EA 2R3OA 3PXRA 4EK4A 4CGAA 5HGIA 3TEIA 3TXOA 3RINA 5I0BA 1WMKA 3HMMA 2OIDA 2XK8A 4JAJA 3ORLA 5CXZA 4ANBA 2QOCA 3ENMA 3DJ6A 5EHYA 1W83A 3TM0A 2BFXA 4QD6A 4FL3A 4O38A 2OJGA 3GCPA 3TTIA 5L8LA 1M52A 1H4LA 2PZYA 4FKSA 1OKWA 4Z3VA 3KXZA 3D4QA 2R5TA 4I6QA 3ORMA 3N9XA 3I7CA 1FGKA 3LMGA 3OC1A 1E9HA 1YOLA 3V5WA 4E6CA 2JLDA 2Y0AA 4RIWB 4BKJA 4F6UA 3AC8A 2C3JA 3C0HA 4XNEA 2BAKA 4YJSA 5FQDC 4LGDA 5CALA 5M51A 4X3FB 2CNVA 3R30A 4MWIA 4XRJA 4PTCA 3O23A 3RNIA 4D55A 3JY0A 2G2HA 5M06A 3ATSA 1HCLA 2QHNA 3HX4A 2O8YA 3PPKA 3VUHA 4CCUA 1ZOEA 2QG7A 3UIBA 4ITJA 3VWAA 3LMIA 3C4ZA 3C4CA 3C4FA 3L9NA 4I5MA 5EYKA 4OAVB 4RFMA 5HX8A 3ZSHA 3U6JA 3REPA 2YAKA 2UVZA 5AA8A 2VTLA 3KULB 4RT7A 4IWDA 2PE0A 2VWBA 4M69B 4DEDA 3VJNA 4FE2A 4L53A 4DFBA 3PRIA 4DYMA 3SV0A 2UZTA 4FNXA 4AU8A 3FMKA 4K33A 4Y5QA 3SDJA 4FVQA 4CLJA 1R39A 2UW3A 3QTQA 4BCGA 2I1MA 4LGHA 4AW1A 5CEQA 4C2WA 2EVAA 2VWXA 4DINA 5DT0A 2X81A 3C1XA 3O0GA 5AUVA 1A48A 1L8TA 5GJFA 4FSNA 4R3PA 5EI6A 3QXPA 4AOJA 4FEXA 4FC0A 4QP2A 4YP8A 3UNZA 4PL5A 4MBIA 5AFVA 3UC4A 2XBJA 2Y8OA 4KIPA 4KB8A 1Y8GA 5CAVA 2B55A 2QOHA 3ZLXA 4EBWA 4H1JA 4Y72A 1ZZLA 3V3VA 4II5A 3A61A 4UXQA 4YSJA 3DFAA 1FVRA 3NNWA 4IZYA 5DEWA 4U3ZA 4GSBA 3TZ7A 4DC2A 2YM5A 3UMWA 2Q0BA 3LW0A 4QYYA 2HZIA 2QVSE 3RTPA 2VTSA 2Z7LA 4AN3A 2B9HA 4PDOA 2RFNA 2OJIA 1ZRZA 2QU6A 2PMIA 3T3VA 5CYIA 4N70A 3ZEPA 2CKOA 1IR3A 2ITUA 3FKLA 3UMXA 4NSTA 2ITXA 4DH8A 4FK3A 3PSBA 1H08A 1JSTA 4I1ZA 4TYEA 3S00A 3EFJA 4KIKA 3FPMA 3RZFA 3G9LX 4GH2A 4ARKA 3MIAA 2BHHA 3QZIA 4XG3A 5BVNA 2ERKA 4H05A 2C6MA 2F7XE 2EXCX 1PMEA 4MAOA 4FG8A 5AV2A 4AFEA 5A4CA 5L2TA 4YLJA 4M7IA 4JDIA 3NUPA 4CEGA 3DKOA 5HCXA 3LMHA 4DGNA 3PDTA 1Y6BA 3UDBA 4QYEA 2E2BA 3C13A 4YGAA 5ACKA 5FTGA 1Q41A 1Q99A 5AUXA 3DV3A 4U8ZA 1JAMA 2H6DA 4ZTNA 2R3MA 3UOJA 4YC8A 3D9VA 3FMHA 3QX2A 1CMKE 4L00A 3V8SA 1Z9XA 5KZ0A 4NW5A 4ZLYA 5FXQA 5BUJA 4E5BA 1VJYA 5I5ZA 4YLKA 3W18A 4U6RA 4FIGA 2ZDUA 2XKDA 1FMOE 1NVSA 2YM8A 2ZM3A 4HZRA 4U44A 2WTDA 2EB3A 5KHWA 5HBEA 1GNGA 2J5FA 4IXPA 3FBVA 5L2WA 2W5HA 3F61A 1GJOA 4QQ5A 4C0TA 5HLWA 2GFCA 5IH6A 3VS0A 2Z60A 3R1SA 4IB1A 5AR8A 4ZEGA 2QCSA 4YJPA 1CKIA 4O7LA 4FI1A 2XYUA 2B9JA 4XJ0A 4EKKA 3UNJA 3EQFA 5JSMA 5EG3A 3PWYA 3W2CA 4LQMA 4ANSA 4JBPA 3NYOA 5DVRA 2C30A 2UZNA 5CANA 2RSVA 2OZAB 4E4NA 4RMZA 2YFXA 3EN4A 3W16A 2X6DA 4S2ZA 4BCFA 3ZCLA 3NUUA 4QMPA 3FPQA 4M0ZA 3PG3A 5IA5A 4L3LA 3C5IA 3Q32A 1X8BA 4XG8A 5JMSA 3A7JA 3WBLA 4MBLA 5EW3A 5M4FA 4Y83A 2YWPA 3ORNA 4W8EA 4TYJA 4FKLA 3SD0A 5C8MA 2F2CB 3SXSA 1Q8WA 4XG7A 4FTOA 3P7AA 3G90X 3ZZEA 3R8VA 4BCHA 4EK6A 3PVWA 1K3AA 3MB7A 3VAPA 1J1BA 4D2SA 4NU1A 2OZOA 2XNMA 4HCTA 4W9XA 5DH3A 3GBZA 1FQ1B 2VU3A 5IQHA 1OIUA 4NFMA 4LYNA 4R5YA 3MN3A 5EOBA 1PKGA 2ITQA 3FQHA 2UZVA 3MH1A 3NUSA 3OEFX 3UPXA 3MVHA 3TN8A 2WXVA 3BIZA 4ZY5A 4C4GA 2R3JA 1V1KA 3HRFA 4CZTA 3C0GA 5CEPA 4YSMA 4GFOA 5E8SA 4BDGA 3SOCA 1H8FA 5KKRB 1PXPA 1OIYA 2J51A 3AD4A 5A4EA 3BGPA 4MNFA 3ZO1A 3QKMA 2C69A 2WMWA 5IH5A 3S0OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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