4IE9A

Bovine pka c-alpha in complex with 3-pyridylmethyl-5-methyl-1h-pyrazole-3-carboxylate
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Accounting for Conformational Variability in Protein-Ligand Docking with NMR-Guided Rescoring
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 109
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ie9A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ie9A02
4ZMEA 2JAMA 4FL1A 2R3MA 3GQLA 4F7JA 2A0CX 2IJMA 4FTJA 1M2QA 3O50A 4Q5EA 3BU5A 3UIUA 4CGAA 2VTAA 2X8EA 5K5XA 3S00A 5BUJA 4FODA 1OIYA 5CASA 2CPKE 4JBVA 5EYMA 2VZ6A 2BIKB 5CNNA 1GZOA 2HY0A 3N4TA 2GHMA 5HHWA 4ACMA 3UMWA 2YITA 3I7CA 4QMTA 4GIIA 4R78A 3I0QA 5JGDA 3HUCA 2J50A 3EHAA 3UIXA 4DFYA 3K3JA 3W2PA 3MN3A 4IFCA 3Q9ZA 4RWKA 3NUAA 3D5VA 4ERKA 4H1MA 2QO2A 4YHTA 4NKSA 4YO4A 3UOHA 3FEGA 3LCTA 2ZYBA 3SXFA 4ALUA 4EK3A 2R2PA 4GT3A 4FTIA 1P4FA 3SXRA 1ND4A 2X8DA 3OF0A 3RAKA 1F3MC 3FMDA 4FBXA 5M4IA 3R1YA 3GC0A 3JS2A 2QI8A 5AR7A 3RBWA 5CQUA 5CU4A 4Z16A 3FI4A 3JY9A 2C5XA 4O82A 4IC8A 5FTGA 4AN2A 4TN6A 5F1ZA 4G1WA 5H8BA 3FHRA 4AW2A 5AFVA 2C3LA 3RAIA 1I09A 2XKFA 3G15A 2RSVA 3SHEA 2X6DA 3QU0A 3I6WA 5HESA 4BICA 4RWIA 1UA2A 4IVCA 4O81A 4K18A 4BYJA 3RK7A 4MXYA 5CXZA 4FKWA 2OKRA 3WYYA 2JIVA 3MY0A 2GNLA 4JT3A 2B54A 3BU3A 1YDTE 5HE2A 4PDYA 3BKBA 1PYXA 4CTCA 3OG7A 3QQGA 4S34A 3ZDUA 2O5KA 4DFLA 4O7LA 5CVGA 1R1WA 4YC3A 4RX5A 1PKGA 3VUIA 2J0MB 4L8MA 4FNXA 5CU2A 3L8VA 1HOWA 1ZRZA 3DZOA 4FSWA 4TL0A 4AT4A 3MBLA 2B7AA 3HMIA 4QMSA 3SXSA 4X2GA 4GG7A 4FKSA 2OH4A 2I40A 3AGMA 1OKVA 4EQCA 3ZEWA 2CN5A 4JIKA 3DTWA 3LFQA 3MB6A 4AZVA 3TKIA 4F65A 3SA0A 3LLAA 2XRUA 3ID6C 5DRBA 5HBJA 3II5A 4DTAA 5CVFA 3LXLA 1NVRA 2QR7A 3G6GA 1O9UA 4S31A 4C57A 1WBSA 4USEA 4C8BA 4UEUA 3VAPA 5FM2A 1Z9XA 5FDPA 3O17A 4C38A 2YDJA 4I0RA 4QOXA 3PJCA 3HP5A 4O27B 3PRIA 4KKEA 4WT6A 4N70A 5FG8A 3QQKA 3DOGA 4R5SA 4RIXB 2CKPA 3Q52A 3SW4A 4DH7A 3C4WA 3VBTA 4Y95A 2VTJA 4L6QA 4OW8A 4JJRA 3BWFA 4FEWA 4ERWA 4I94A 3U6HA 2I0HA 2PTKA 4LGDA 4RC4A 2X9FA 4U41A 4YSMA 5IQHA 5E8SA 3DBQA 3QAME 1NT2A 4CMTA 2CNVA 2ZDTA 2VX3A 2VO0A 3BBWA 4KAOA 4RIWB 3PXYA 3PXRA 5J9YA 4HYSA 3L9MA 5E9EA 4KRCA 3PTGA 4C3PA 2XJ2A 4I3ZA 2LGCA 4K9YA 2CLQA 2VTNA 4IMYA 1H1WA 4LV5A 2WPAA 3KC3A 4NFNA 4QMZA 3ITZA 3NUPA 2YIQA 5KE0A 4DH8A 1FQ1B 4UYNA 3KL8A 4IH8A 3H9OA 3EQIA 3LXKA 1Y8GA 2EXCX 4ZLZA 2ITNA 5K3YA 3TKUA 3FUPA 3POOA 3FXXA 3U4UA 5L8LA 3D7ZA 4BDDA 5KMKA 4L9IA 4R6VA 3R9NA 2OJJA 1FVTA 3FC1X 1IA9A 5CAQA 3QHRA 3MVMA 1JLUE 1OL5A 3GC9A 3OWKA 4Q5HA 4F99A 4LRJA 1M2PA 5M4UA 4D1SA 1ZOHA 4JG8A 1PY5A 4FZDB 1WCCA 2BVAA 4I24A 5IEXA 2OLCA 4XV3A 2W1DA 4FSNA 3KKVA 4EKLA 2J0KA 3V6SA 4AE6A 3D94A 3LJ2A 3OTUA 1GIIA 2YDIA 3R00A 1OIUA 4X6RA 4F9YA 1AD5A 2B9IA 2P2HA 3MH0A 2W9ZB 4PDOA 1OPKA 3MW1A 4BCQA 4IHPA 1U59A 5IEVA 4HNIA 3TUDA 2B0QA 4BKJA 3LFEA 3RINA 1ZMVA 4YZ9A 1MRUA 1YKRA 3ZZWA 4DAWA 3QA0A 4EK8A 3HRBA 3DJ6A 3NUSA 4IB0A 2B9FA 3ZH8A 2RF9A 3LMHA 4KA3A 4ASDA 3DAJA 4BHNA 4FF8A 4OR5A 1YDRE 5EM5A 3BHUA 4R3RA 4MBJA 4X6QC 3V5TA 3ZYAA 2PE0A 3U9NA 4CV8A 3EOCA 4PQNA 2WMSA 3B2WA 4CTBA 4E3CA 4BDKA 2W1ZA 3H3CA 5L3AA 3GVUA 3UIMA 4BKZA 2QOCA 2RFNA 2ITWA 4FOCA 4IC7A 2UZDA 2UZNA 3CGOA 5A54A 1XH6A 2OH0E 4BDHA 4DGMA 4FYNA 3D9VA 3GCUA 5DA3A 3Q4ZA 5IKWA 4IWPA 3UO6A 4ASXA 4F9AA 5HNIX 4RA5A 4QMPA 3T9IA 4K0YA 4N6ZA 2QURA 4BCKA 4EK5A 5AA9A 3FZSA 5ICPA 4U97A 3UBDA 5ETCA 2Z8CA 2UZBA 4BCPA 1JAMA 5FTQA 4ZS0A 2OF4A 2R3IA 2X4FA 3IW7A 3P1AA 4V04A 5AA8A 3UNJA 4BY9E 4BDEA 1F5QA 5IU2A 1PJKA 4BDJA 2HY81 2PZYA 3EQCA 3TL8A 3PFQA 2PULA 3TXOA 5EHOA 4G9RA 3ZS5A 3H9RA 4TYIA 4U81A 4XG6A 4BDAA 4NCTC 4FV5A 2X7GA 2PK9A 2W1EA 5M4FA 1MUOA 3Q60A 3FZRA 3D14A 3OY3A 2CNUA 4EHVA 3VF9A 4D2WA 4C62A 3P0MA 3OOGA 4F0GA 4LFIA 5C9CA 2ONLA 3SOAA 1VJYA 4O2PA 2R3JA 2EXEA 4FNZA 4QTBA 4ZSGA 5FWKK 5LARA 1ZYDA 3V5WA 3LFAA 3ZMMA 4B4LA 4CCBA 2YCSA 4RFZA 3DBEA 4H3BA 4CG8A 4FKPA 1A9UA 4L42A 1ZZLA 3GCSA 2XJ0A 4FV0A 4FIIA 3P9JA 4MYGA 4GK4A 4OTRA 5E92A 3C4XA 4AP7A 4YLKA 4FKGA 5HLPA 4FL2A 4AW1A 5IQCA 2BKZA 5CY3A 3IW5A 4FICA 1UWJA 3A8WA 4HJOA 4O86A 5E7RA 3R9DA 3GU8A 1KV1A 2I0EA 5F9EA 3VRZA 4GVJA 3D5WA 1OBGA 3BHYA 4HVGA 3G90X 3LCOA 2C1AA 1IG1A 1YVJA 3R04A 3WIGA 1OGUA 4FKQA 4IZYA 5CZHA 4C58A 4K6ZA 2BAKA 4L3JA 3ZSHA 2W1FA 3L9LA 2XNBA 1ZZ2A 4HZSA 4BTFA 5CEOA 4E6DA 3F88A 2C47A 4RFYA 3CSVA 4UMUA 5TT7A 5DOSA 2XYNA 4G5PA 5IF1A 1QPCA 4EORA 2J0IA 2IW8A 3Q04A 2JKMA 3NWWA 1JKTA 3BYUA 1EH4A 2W0JA 4XG2A 4ALWA 4DCAA 2YABA 3MVHA 4XHKB 5C8MA 3TNWA 1NW1A 1YWRA 2VN9A 3BE2A 4K8AA 3PDTA 1U46A 2B1PA 3MIYA 2BUJA 4DGOA 3KA0A 3NUNA 3ZBFA 3ROYA 3FC2A 1DI8A 2RIOA 4A9RA 4AA4A 3C5UA 2Y4IB 4YBKA 1YOJA 3DK3A 4U8ZA 5EFQA 3FLQA 3LFNA 4ITIA 5FBNC 2PMNX 3S3IA 5C8KA 4IEBA 5FBOA 4F63A 5JQ8A 4FIJA 3QKLA 2OXDA 2XNOA 2JC6A 3QLFA 4DGGA 4JXFA 3IGOA 5AP0A 2HZ0A 5CSXA 3QL8A 5CAVA 3TIZA 4L44A 2WOTA 3QLGA 3FMNA 1QMZA 4E8AA 2PZPA 3QX4A 4QMMA 5BUIA 3MPTA 4RIXA 4ZS4A 4C4FA 4F0FA 2BROA 5DH3A 4BRXA 2XVDA 2J0LA 3SC1A 3VS0A 3E8CA 3REPA 5HVJA 3KF4A 3NIZA 1KE9A 3D2KA 4FIHA 3I6UA 4BTMA 3CIKA 4CRSA 1K3AA 4RIWA 3KCFA 4A4XA 2ZM4A 3A60A 2FO0A 3Q9XA 3ZLYA 5CEPA 3MFUA 3RJCA 2I0YA 3LIJA 4OTWA 2BHEA 5CAOA 1QPEA 3A4PA 4EH9A 5EKNA 5E8TA 3ZLWA 2OXYA 5M53A 3FE3A 3DLZA 2W96B 1KOAA 4DLIA 2BIYA 2XH5A 1FINA 2X8IA 5AV2A 5HX6A 3QQUA 3IECA 1XWSA 4RMZA 2QOLA 4UWYA 3OCGA 1K2PA 3L9PA 4EC8A 3CBLA 4DT8A 5CSHA 3MH2A 1LR4A 2BCJA 4QQTA 4EH8A 5H3QA 3G5DA 1Q99A 2QOFA 3QTIA 2GNJA 1A48A 2PZRA 1UNGA 2P3GX 2VTQA 1AGWA 1Y6BA 3VWAA 5AM6A 1WVWA 3AC4A 3DAKA 4CYJA 2ERKA 2QU5A 2DUVA 3UVQA 3NX8A 3E7OA 3LM0A 4JS8A 3DT1A 3F82A 4HW7A 3BIZA 3IK3A 3V5QA 4OLIA 4R5YA 4CMUA 5CEKA 2C1BA 2VTRA 5DR2A 4C0TA 5A4TA 3CPBA 1VEBA 4G5JA 3WF9A 4EONA 4GS6A 4S30A 5C4KA 2C6TA 5TKDA 3F66A 2OICA 3CP9A 3G0FA 4UB7A 4C61A 3QTXA 3TUCA 2IVUA 4X2KA 2OF2A 3F3WA 3TDVA 3F3ZA 1PMNA 5BQ0A 4EC9A 2WQEA 5IEYA 3NYVA 4CLJA 4WNOA 3W32A 3VO3A 4O84A 2C6LA 2EVAA 3GC8A 4M13A 3ROCA 4D4RA 3WYXA 4QP7A 5IQEA 3FXZA 4OTDA 3ORNA 3FMEA 3ZXTA 2HZ4A 1WBOA 4MD7E 4RLKA 4DF3A 5HTIA 2W1IA 4MBLA 4FV8A 4J96A 4BL1A 3C1XA 3Q5IA 3W2RA 3ZTXA 1UU7A 4QP8A 4DG2E 4FTOA 5GIPE 4FKLA 4U44A 4F1MA 3A2CA 2E9PA 5HKMA 2I6LA 4KUJA 2W5AA 4XP0A 3JY0A 2IZSA 3T3VA 2YWPA 3ZC6A 5HLWA 5AV3A 4H05A 3UC3A 4TYHB 1W0XC 2BZJA 2OI4X 3NGAA 4L7SA 4YHJA 3ENMA 5CU3A 1S9JA 5DEYA 3R30A 4Y5HA 4ZSLA 5AWMA 2IG7A 2W9FB 2FSLX 3PIZA 1ZYSA 4CFNA 3VS4A 2IWIA 5ETIA 3A99A 1L3RE 4R3PA 4UYAA 3SKCA 3THBA 5HGIA 4CT1A 5H2UA 4YJOA 4MWIA 2X2MA 2OFUA 4CLIA 3LCDA 4RVKA 3EN4A 2QHMA 4LM5A 5LVMA 3PXKA 4NFMA 2BZHB 2XNGA 2WTKC 3FZTA 2C5VA 1OKYA 4FG9A 4FSMA 4QQCA 2JDSA 4HOKA 4U3ZA 3DCVA 4O7SA 5T3QA 4LRKA 2OJ9A 3E63A 1P5EA 3RWPA 3SGCA 1REJA 3A8XA 3S0OA 4H39A 2JDRA 2P4IA 4ARKA 2GS6A 4PDPA 4O7YA 4NW6A 2YJRA 5F95A 4C02A 5HCZA 2WOUA 2WTKB 2WMUA 3LXPA 3FPMA 4M15A 3OEFX 4GUEA 3VBVA 4L53A 4OT6A 3QX2A 4EBVA 5K4IA 1CM8A 4XOYA 3T9TA 4HCUA 4RVTA 3KK8A 4I0TA 1Q3WA 4JDIA 4D0WA 5HCYA 4WA9A 3UP7A 4XYFA 1JOWB 3AMBA 2C5OA 5GJDA 3EIDA 3Q9WA 3I5NA 3UO4A 3V01A 4EHEA 5AUTA 1ZLTA 3LQ3A 1TQIA 4QP1A 1MRVA 1NA7A 3EH9A 1ZMWA 2XCHA 3HVCA 3RMFA 3FBVA 5DYJA 3MDYA 3BU6A 3OT8A 4R7IA 5AUVA 3QCXA 5HLNA 4MBIA 4EOLA 5HO8A 3R8PA 1IAHA 2ZB0A 2BKKA 3C7QA 3C4CA 3H4JA 5EH0A 2QC6A 2WEVA 3R8LA 3NVKI 4F4PA 3MFSA 3ORTA 4P5ZA 5CNOA 1J1BA 4RT7A 3WF5A 4GK3A 3C4FA 3TZ9A 1GAGA 3R71A 1OVEA 4I4FA 4RJ8A 3U9CA 3MPAA 3C0GA 3QZFA 4FNWA 4PL3A 3WOWA 4DEDA 3UYSA 4BDGA 4BZOA 3KXXA 4PUZA 2AC3A 2YIWA 3A7IA 3EQHA 2PVKA 4BCMA 4PMSA 3MESA 4BWKA 1YOMA 5L6OA 2C6KA 3PA5A 4KIOA 5AAEA 3E8EA 3EZVA 1H1QA 3L8XA 3MTLA 4YJQA 2HOGA 5I9UA 5JZNA 3VS5A 5IA4A 2GQSA 2Q0NA 2VTMA 3PWDA 2WMQA 2W17A 4APPA 3DXQA 2BDJA 2A19B 1U4DA 5EOBA 4DA5A 1UU9A 3JVRA 5G6VA 3SV0A 4WOVA 2FB8A 3DU8A 3UP2A 3F2NA 5CYIA 2R3LA 4GIHA 4O0YA 3HKOA 4CSVA 4N4SA 5C8NA 2BRMA 4WUAA 4AW5A 3TJDA 4XV1A 3NNWA 3A62A 4KKGA 3EZRA 3W2OA 4O0VA 4QMUA 4EHGA 4F7LA 5DNRA 2H9VA 3ANQA 5FUTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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