4IJ9A

Bovine pka c-alpha in complex with 2-[[5-(4-pyridyl)-1h-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]-1-(2-thiophenyl)ethanone
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Accounting for Conformational Variability in Protein-Ligand Docking with NMR-Guided Rescoring
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 104
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ij9A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ij9A02
3NUYA 4EJ7A 3TKHA 3WIGA 3QYWA 3SXFA 3FLYA 2UZLA 4FZ6A 3DAJA 5CT7A 3COKA 3NNWA 3FMLA 4HGSA 4DCEA 2CLQA 2IVUA 1GIIA 2R64A 3QYZA 2ZAZA 4EKKA 1IR3A 2QOLA 1O6LA 4I0SA 4CQEA 2DYLA 4A4XA 2QHMA 5L8LA 4R1VA 5F1ZA 3R1YA 4HCTA 5LOHA 4H39A 3LFDA 2QKWB 5JSMA 2VTOA 3A99A 3NEWA 2EUFB 3JS2A 3PZEA 4OBQA 3UP2A 5HG8A 1SVHA 3JXWA 3S1HA 2QOFA 3U87A 4L46A 4CQGA 2WTJA 4D2WA 2OJJA 4AN9A 5FUTA 3QZIA 3RK7A 4EWHA 4QMWA 2YJRA 2WTKB 4UXLA 5AP2A 4DH1A 3FLNC 3NIZA 1DM2A 2XUUA 4H36A 5CI6A 1OPKA 4YHFA 3HKOA 3R9RA 4Y46A 4UEUA 5A6OA 4FTTA 4TYHA 3VBVA 2O8YA 4FV4A 4ZTMA 5CXZA 4M0YA 5AEPA 2YWPA 3HLLA 4U8ZA 1KE6A 3CR0A 3UG1A 3VN9A 3K3IA 3KEXA 4YLLA 2OH0E 3K5UA 3CEKA 5ANOA 2PVFA 3PG1A 2YCQA 4NYEA 4CLJA 4FZAB 4A4OA 4JIAA 5CT0A 3ULZA 3QGWA 2XK3A 4IX5A 5EG3A 2CHLA 3VW8A 1H28A 3QAME 2HELA 2ONLA 3E88A 4C58A 4FV6A 4ZS4A 3FMHA 2GNLA 2ITNA 4QTCA 2JC6A 4Z9LA 4RX8A 3W8LA 2E9OA 4PF4A 4BYIA 1Y6AA 4FL2A 2XF0A 3DTCA 3ZONA 3UP7A 4F1TA 2QURA 5CEOA 2PWLA 3CKXA 4JG6A 2EB2A 4KIOA 4MXYA 4XP2A 3W2SA 3DAKA 4W8EA 1JSUA 1YXVA 3TTJA 2VX1A 1ERKA 3FI8A 3DS6A 3ZLWA 4I1ZA 1URCA 5H8BA 4ITIA 4CYIA 3HAVA 1TQPA 4EUTA 3FZOA 4XRLA 4O7TA 3E92A 4IDTA 2ITZA 3WZJA 3MN3A 3NAYA 4XOZA 2BAQA 5H9BA 1OPJA 4FT3A 5M08A 3QTRA 4ITJA 4JR3A 5FBOA 1XJDA 5IA5A 3VUGA 3ZLSA 4FSUA 2WMTA 2FGIA 2XIKA 5HO6A 2C5OA 1U59A 5E8WA 3GXLA 4E6AA 3OWKA 2XNNA 4WIHA 4P7EA 5CU4A 5A14A 4F7JA 1QL6A 1PRYA 4BZOA 4XBUA 3F3VA 2QU6A 4U0IA 2O63A 5CSPA 3VUHA 3R8VA 4AT5A 3C9WA 3NR9A 3PA3A 2Z8CA 4GG7A 3EH9A 3ORKA 2EB3A 3I6UA 4UY9A 3WI6A 1G3NA 1XH4A 3R2BA 1J3HA 4BCPA 1JKSA 5DNRA 4UMTA 4FIGA 4FKIA 2WQNA 2JDOA 2R4BA 2XRUA 3DKFA 4PY1A 5ANIA 3FHIA 3QZFA 4FV5A 4HNIA 4E4NA 3GCVA 4OTPA 3C13A 2CKOA 5AP5A 3Q6WA 1QPJA 4DFZE 5LMBA 5HG7A 3O7LB 3QTIA 3F69A 1WBSA 3BLRA 2JITA 4P5ZA 4PTCA 2WMAA 4NW6A 1BKXA 4WSQA 4WT6A 3U8WA 4BCOA 4ANLA 5LWNA 2CNUA 3CPCA 3CGOA 2A0CX 4O0XA 5BVKA 1GIHA 2C5XA 2QI8A 4BWXA 5HBHA 4E4XA 2F7XE 2XP2A 4G3GA 3RHXA 3F66A 3QCQA 2UW6A 5M4FA 2BRMA 1L8TA 3IW7A 3CCNA 4C57A 4O0VA 1OM1A 1GAGA 3SAYA 1PY5A 3EWHA 2G2FA 3O8UA 3EZRA 1M2RA 2ONLC 3GP0A 3IW8A 3ZXTA 4EQCA 5FTOA 5J7HA 4FV2A 5KMNA 3FZTA 5AIRA 2WAJA 5CSXA 5E9EA 3BGQA 4QMTA 2PUPA 1ZWSA 4XG7A 3QQLA 4J98A 2QR7A 4L01A 4Q9SA 3UTOA 3V8WA 4EWQA 5CEKA 3R21A 3SRVB 5I9VA 2VWVA 2HZ4A 1M14A 3GU4A 2H96A 4UYNA 4CFMA 2J0KA 3U51A 3LMHA 2XBAA 4I94A 4TNBA 4CZUA 4GU9A 3REPA 1REJA 2UZWE 4U3YA 2YDIA 3DV3A 4TYIA 3LLAA 4FTNA 4RQVA 5E8YA 3O96A 5HG5A 4NH1A 4R7HA 4ASEA 5DOSA 1T46A 5EFQA 4YC3A 2V22A 3AMAA 3UOKA 3GT8A 2ITVA 4G9CA 4PL3A 3QRTA 4EHEA 3MVLA 4PNKA 2C5NA 2UZNA 5E8SA 4NJ3A 3COIA 2XKFA 2W5HA 3UIMA 3AC5A 5C26A 4F6SA 1XBCA 4WUNA 1GZOA 4CTBA 1G8AA 3BX5A 4EH4A 2QOQA 2VUWA 2YAAA 4C4GA 4X3FC 4ZXTA 3BBWA 4L3LA 3C4EA 2R7IA 2ZV2A 4WNOA 3L8SA 2WNTA 4UWCA 4EOOA 3WZUA 4K2RA 4F6WA 1HOWA 5HHWA 4AW0A 5AV4A 4MD7E 4RA5A 4XG2A 5I9XA 1B39A 2W9ZB 4ARKA 4CCBA 4FGRA 2R3LA 1Q61A 2J6MA 4AF3A 5FLFA 4K9YA 4Z55A 5EM8A 4RA4A 3IDPA 3A7HA 2B53A 4AGUA 5KMMA 5EHLA 3RPOA 3BYSA 5E7RA 5J9YA 5FEQA 2WHBA 4YC8A 2J50A 2OSCA 3ORIA 4JRNA 3Q9YA 5D1JA 3SD0A 3BU3A 3NX8A 2B9FA 4RFMA 1PYXA 3HVCA 3QLFA 4WG5A 1P4OA 2F7EE 1VYZA 3KN6A 3MA3A 2R7BA 5AX9A 1QPDA 3U54A 3RWQA 3VUMA 1F5QA 4FKPA 4XG6A 4XOYA 1YI3A 1WVXA 1JPAA 5HD7A 3RM7A 5A46A 3QD3A 1HCLA 2PE0A 2WMVA 4FK6A 4K11A 5FD2A 3DNDA 4BDEA 5KKRB 4IX3A 4EK4A 2W5AA 4IWQA 4A9UA 5GIOE 1Q8WA 5DR6A 3UNZA 4JI9A 3C0IA 1SYKA 3DB8A 4FR4A 3LHJA 3O71A 4CFWA 4ENYA 2GNGA 4DYMA 3M1SA 4I23A 4GJ2A 4YBJA 4D2TA 5CSVA 2V0DA 4ACGA 5KUPA 5L2IA 4QP7A 3U6JA 4AN2A 5M4CA 3IOKA 1OL7A 3NS9A 4L52A 3OXZA 3OWLA 4DH3A 1SVGA 1JAMA 3FMEA 3I5NA 3WYXA 4A9YA 4ALWA 3FPQA 2BMCA 5CASA 2BZIB 4G31A 2ACXA 4FSWA 1BYGA 4YBKA 1U4DA 5DYJA 2WIHA 3PUPA 4L44A 4BWKA 4Z7HA 4I3ZA 2VWWA 4DLJA 3A8XA 3VUDA 2BRHA 2VTMA 3DPKA 3EN9A 4F08A 3D5WA 3MFSA 4FKRA 3WZDA 5E8ZA 2IW9A 3RWPA 3PZHA 3LJ2A 4S33A 3R7OA 4DGOA 1PXOA 5A3XA 1R3CA 5CU2A 2YHVA 4U97A 3RCJA 4ANSA 4EOIA 5HKMA 4QRCA 4W8DA 1NY3A 3FY2A 3WE4A 4F9WA 3KL8A 2W4OA 3D7TB 4USEA 1A9UA 4GCJA 4I6HA 5ETAA 2PHKA 3MYGA 5CNOA 1RJBA 1ZARA 4HYHA 4CLIA 2JBOA 3K2LA 2FO0A 4PL5A 5JGAA 3N4TA 2OK1A 4FNWA 4ACCA 5EDPA 3RPVA 3VF8A 1O6YA 3NDMA 4IHPA 2GMXA 3OXTA 3GEQA 5AWMA 1FPUA 3FKNA 3S95A 4FG7A 3K54A 2OJGA 1G8SA 4BDAA 5AP0A 1AGWA 2UZOA 4CMTA 5EW8A 4EBVA 4O7RA 5HIDA 2YWVA 4LUDA 3CSVA 4M15A 3S3IA 3GCUA 4KRCA 3OS3A 3QTSA 2R3GA 3R63A 5AUXA 3W10A 4X2JA 5IH4A 4O0YA 3ALNA 2I0HA 3I60A 3QWKA 5CF8A 4NL0A 3N4VA 4KABA 1WBWA 3T8OA 3HP5A 3TUCA 3WYYA 4YR8A 4UMUA 3KREA 3TNQB 3B2WA 5IUHA 2BAJA 4GU6A 2PVJA 1FINA 4G3FA 2OH4A 4DH5A 1OGUA 3II5A 4GYIA 4IM3A 4WNMA 5I9YA 3PXQA 1M7QA 2VTTA 3BEGA 4MD8E 4R78A 3UOJA 5A9UA 2Z02A 4BDCA 3MPAA 4C7TA 2DWBA 2R9SA 3AMBA 2VTSA 4DT9A 2JAMA 3QD4A 1F0QA 3TIYA 4W4XA 3HMNA 1OUKA 3PIZA 3PXZA 3WOWA 3DBDA 4O7YA 4IFGA 3UE4A 2W9FB 4RT7A 5FTGA 4H1MA 2W7XA 4W4WA 2XRWA 3UODA 3LIJA 4X2FA 3VHKA 3VRYA 4PDOA 2HWOA 3QX4A 3G9LX 3O7LD 4FUXA 4RIXA 3BV2A 3EFWA 4FV8A 3QUEA 4O22A 4XLVA 1M2PA 4AFJA 4A9RA 3PXYA 5DI1A 3HX4A 3UBDA 3OY3A 3MVJA 3FZPA 2OO8X 4L7FA 4QYGA 2XYUA 3PJ2A 2WEIA 5CYIA 1P2AA 5CEPA 2PMLX 4O83A 3UIXA 4CTCA 5CEIA 4X2KA 3FEGA 3W1FA 4AAAA 2ZYBA 2C6DA 1WFCA 2VRXA 5BUEA 1FGIA 3I0QA 4R3PA 3H0ZA 4ZTHA 5HCXA 1MQ4A 4IVBA 2ZVAA 4ZOGA 2W1GA 2UW5A 3NYXA 3A7JA 4M12A 4CZYB 1KE5A 5G1XA 4BWPA 2AYPA 1IRKA 4MQ2A 1XH7A 3MJ1A 3V5LA 3QQUA 3ZFXA 4BCHA 4L8MA 2GS6A 3E3PA 5E90A 4BGQA 3UNKA 2UZVA 1YHSA 3KCFA 4U79A 5AIKA 3P23A 2XK4A 4NJDA 5D9HA 3C5UA 4AU8A 2BZJA 4ASXA 4AA0A 3DJ6A 4BCIA 4I0RA 4XBRA 2O0UA 4O0UA 4O7ZA 4XV9A 3W2QA 2VU3A 3UG2A 1J7UA 1UU8A 1JSVA 4OTFA 5FP5A 2VWZA 3TUDA 1FVTA 3UZTA 4BBMA 3BU5A 4H3QA 5FQDC 1O6KA 3KXMA 5JQ5A 3AT3A 1TQMA 3F5UA 4AACA 1UWHA 4RX7A 3PJ1A 2NO3A 5C27A 3ZLXA 3E8EA 4C4EA 2RFDA 5KE0A 3PWDA 5M55A 5GZAA 5KO1A 3FLQA 4ZTQA 2I6LA 3HV4A 3VNTA 3GU8A 4YJNA 5HCYA 5BMMA 5H2UA 3UJGA 3OD6X 5DT4A 3V5WA 1WAKA 4XEYA 2CCIA 4EYJA 5M4IA 4YJVA 4C02A 1ZYCA 1V1KA 3RI1A 3OWPA 2VTHA 4IVDA 4DFNA 3HV6A 4JXFA 4GRBA 3CLYA 4RVKA 2F9GA 4B8LA 4TYGA 1JKLA 1WVYA 3L8PA 1JWHA 2ZOQA 5TKDA 4ACHA 3FBVA 4ALUA 4APCA 4DG2E 4QMNA 5CVHA 1FBNA 1SVEA 3JY9A 2Q83A 4LOQA 3BKBA 4O0RA 4W4YA 3RK5A 3RNYA 4GYGA 5GJFA 3R7YA 2P55A 4AZVA 5JFWA 1W7HA 4FGBA 3KB7A 3PLSA 4QTDA 3UO6A 3EQCA 3NMUF 4F1MA 3RPYA 5HX8A 3FMJA 1MQBA 4FIFA 2VTNA 4FKGA 2J0JA 3IW4A 3PPKA 1YWVA 3UVQA 4D2VA 2VTAA 3ZBFA 3VIDA 3TNWA 2Y0AA 2WTDA 3QRUA 4QP1A 4FT9A 4Q2AA 4E6QA 3BLQA 3UDBA 2QCSA 5EQEA 5JKGA 4CFNA 3NCGA 4BR3A 3FE3A 4B99A 4QQCA 4FT0A 5IZFA 3HECA 4U9AA 3L9NA 3HMPA 3TZ9A 5KMJA 3ZDUA 4J97A 4OTQA 2Y7JA 1H1WA 3V01A 3ZSIA 4BN1A 3ZMMA 3BHHA 4IZ7A 3E8NA 3QF9A 5L3AA 4IFCA 3P08A 2GQRA 3ID6C 4TWNA 3F5GA 4FNYA 4C3PA 4HVHA 5JQ8A 3R28A 3VBYA 2OIDA 4F9BA 2WOUA 2BDWA 3ACKA 3MFRA 3OTUA 4GW8A 5IUIA 5CAPA 3UQFA 4G5JA 4FEQA 3FI3A 2OJIA 2C5YA 3OW3A 5AP1A 3MGYA 5CQUA 4FIHA 4ZZMA 4EJNA 3SQQA 4IXPA 3DAEA 2BILB 5BUJA 3LQ3A 1Q62A 4ZK5A 4DF3A 1Y91A 2C6OA 3MY0A 4CMUA 2C6MA 3OG7A 5KCVA 1NT2A 2I0VA 2QOIA 2YZAA 2WTWA 4HW7A 4WG4A 4HGEA 3KN5A 3ORLA 2GSFA 2VV9A 4G16A 1WBOA 4AZFA 3FI2A 3QTWA 5GINE 2X7OA 2JKMA 4BDIA 5HLPA 4KBKA 4E3CA 4IACA 5FM3A 4FVQA 3IGGA 4MYGA 4RLLA 5DLSA 3IPHA 4EH5A 3H4JA 2IJMA 4IH8A 2HW7A 4L45A 3L8VA 2A1AB 3L9MA 4GK2A 4YC6A 3CD8A 3UYTA 1CKIA 1K2PA 1OPLA 2X8IA 5E1EA 5HQ0A 4J8MA 5HD4A 3EQBA 2BRGA 2W1EA 3OF0A 4G17A 4TWOA 3WZEA 4DFUA 3RGFA 2G2IA 4KS7A 1R0EA 3MWUA 4TW9A 4CD0A 4XV3A 4AZEA 2RG6A 4M69A 4AT4A 1RQQA 4KAOA 5AADA 4LG4A 3FZSA 5IEYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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