4JBPA

Novel aurora kinase inhibitors reveal mechanisms of hurp in nucleation of centrosomal and kinetochore microtubules
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
265
structure length
255
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Aurora kinase inhibitors reveal mechanisms of HURP in nucleation of centrosomal and kinetochore microtubules.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Aurora Kinase A
total genus 85
structure length 255
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jbpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jbpA01
4X2FA 1JKKA 3PYYA 3VHEA 2OXDA 3PIYA 3DKGA 3ZZEA 5JFXA 4TT7A 4FNZA 3QRUA 3EH9A 2EU9A 2W0JA 3R83A 3BHHA 2W99B 2B1PA 2PU8A 3KKVA 4S32A 2ZV9A 3DFAA 5HLNA 4O0TA 3R2BA 4EL9A 2BKZA 1P4OA 1OIRA 3ORNA 2BHEA 4HYHA 4ZZNA 3ENHA 3FI3A 1STCE 2XNEA 3ZO3A 4PV0A 3SGCA 1LP4A 1YXXA 3C51A 3LCKA 3K3JA 4ANSA 3B2TA 2WIHA 4ZY6A 2WMRA 4I6HA 1OECA 1LEWA 4E7WA 2GSFA 3MW1A 5EOLA 4AZTA 5J1VA 2Q0NA 5AX3A 4GT3A 2PZ5A 2E9NA 3A2CA 4IJ9A 4W8DA 3SXSA 4ZSGA 2C5OA 2CHLA 4U6RA 4D2VA 4QMTA 1OMWA 3NWWA 5CEPA 5DMZA 2O65A 4G3DA 4NM0A 3MIYA 4F9BA 2EVAA 4ZXTA 3DK3A 4GMYA 1XH7A 4R77A 2AYPA 1LUFA 2WTCA 4BDDA 3BU5A 5CEKA 3FKLA 3CTJA 3E8DA 3FQSA 3R1QA 2VTHA 1DAYA 4EOPA 2JFMA 3DB6A 3E8EA 2XUUA 4JRVA 4DLJA 4ZP5A 2W1CA 1SYKA 2GNFA 2UW3A 1CKIA 3GC9A 4A7CA 3CPBA 5HVYA 4MD8E 4D4SA 4E20A 3QD2B 3Q4CA 4DLIA 3FZOA 3OXTA 3PXRA 4F9CA 2Q83A 4O1PA 3ROCA 3Q6UA 1PF8A 3I81A 4YNEA 4K77A 2BILB 5ANJA 5AMNA 2YA9A 2W1HA 5M55A 5L3AA 4LM5A 4LMNA 5IUGA 2C3JA 3NZ0A 4FV1A 4OBPA 2EXCX 3MFUA 4GYIA 2IVUA 2C4GA 5I9XA 3Q6WA 3V5PA 5LWMA 4BWKA 4JL9A 2JDOA 2VX1A 4RJ8A 2ETKA 1SZMA 2F49A 3W2PA 4EQCA 5CX9A 2YM8A 4FNYA 4FZ7A 4CCBA 2O63A 4DEHA 4M0ZA 3K5UA 4C4EA 2YCQA 3PY1A 3D4QA 3LLTA 1JNKA 4I24A 5E92A 4O0XA 3UO4A 4ACCA 4ZZMA 3LCOA 3PP1A 4U40A 3TIYA 3F3UA 5GJFA 4BCFA 5A4CA 2FSTX 4CFNA 4ZS0A 4EOLA 3MFTA 4QP3A 3FMHA 3TDVA 4IDTA 4IADA 4ZTRA 4KA3A 2IJMA 4C0TA 4YJTA 3IECA 3PXKA 4AA5A 3BYSA 3FZPA 4DA5A 3U4UA 4E6DA 1CM8A 3NYOA 4X21A 4EC8A 5KBQA 4CRSA 5IEYA 3MB7A 5HNGA 1OPLA 3V01A 1IR3A 2BFXA 4IM2A 1B39A 4FNXA 4C34A 3QTZA 4FTKA 2X8EA 3WIGA 4EK3A 2W1DA 4Y72A 3IPHA 5HE3A 1GY3A 4CTCA 3MDYA 5JK3A 5AP6A 3DAKA 1ZLTA 5H3QA 1OZ1A 3LFEA 3LQ8A 4U5JA 4NL0A 4WD5A 1KOAA 4NYEA 2CLQA 4L7FA 2ITTA 2YZLA 2J5FA 1OUYA 4QMQA 4ENXA 2Z7LA 4WSQA 4XP3A 3UOKA 3VWAA 2GPHA 1SVEA 5E8SA 3EJ1A 4OUCA 4CD0A 3W2QA 2WMAA 2CN8A 5HD7A 1E9HA 1XH4A 1PMVA 2V0DA 3QHWA 5DHJA 5CSVA 5C03A 4A9YA 5J9YA 2PUNA 3LLAA 4CCUA 3IW7A 5CXHA 4G31A 1BL6A 2HWPA 3C4ZA 5E8WA 4YP8A 3VN9A 4JG6A 4AT3A 4AW5A 3FMLA 4BHNA 3AD6A 3W16A 3VS4A 1K2PA 3VS0A 3EWHA 2BRGA 3O2MA 3Q5IA 3H9RA 3ZFXA 4KIPA 1R3CA 3SG9A 3ANQA 2R3MA 3R1NA 1OITA 2A2AA 5EM8A 4AGCA 4AOJA 5IA5A 1UNLA 3BU3A 5H8GA 4DFYA 3QA8A 4CZYB 4NU1A 1YOJA 2OJFE 4AX8A 4ZSEA 4UWYA 2W1GA 1GZKA 1WAKA 2IW9A 3U8WA 3Q4ZA 3JR1A 3LM0A 4FIJA 3NYNA 4D0WA 1FOTA 3UP7A 4FBXA 4QP9A 1YKRA 4DTKA 3UZRA 1CMKE 4G9CA 2HYYA 4O0SA 4L8MA 3PXYA 1KSWA 2XP2A 3D5VA 3OHTA 3DJ6A 3ROYA 1VEBA 3T8OA 1Q41A 2XNPA 5IMXA 3LFNA 4C33A 2FSLX 3FV8A 2XIXA 4NJ3A 4DGGA 3A7JA 3GGFA 4YSJA 5BVFA 2YEXA 3FE3A 4R5SA 5EM5A 5AWMA 3W8QA 4BYJA 2Y0AA 4QYHA 4EQUA 3GFWA 4UEUA 2BZIB 4QRCA 3U9CA 4IAFA 5IQCA 3UDBA 1W0XC 3S3IA 3R7YA 3WE4A 4X6RA 4FG7A 5JFWA 2VWUA 2ITPA 2IWIA 4J95A 4KNBA 3VULA 5AAEA 3KU2A 3QKMA 3II5A 3LFFA 3DTCA 2V62A 2YACA 4DEDA 4N70A 3FHRA 2OXYA 4O0VA 4DG3E 4HCVA 2C3KA 2VZ6A 4YC6A 1XO2B 5I4NA 2P55A 1Q8YA 4WO5A 3RBWA 4BIBA 2OWBA 3F7WA 3HV3A 1YDRE 1DI9A 1OUKA 3QZFA 2R3IA 4V05A 3Q3BA 1IASA 2C6LA 2WQBA 1P4FA 3BHVA 3UTOA 3COIA 2WFYA 3GNIB 2P0CA 4U8ZA 4EH2A 5CAQA 4F9YA 3U54A 1X8BA 4EYMA 4F1OA 3ORIA 4FV7A 4LRKA 3QD3A 4IHPA 2O0UA 4DEAA 4F70A 3OW3A 1E1VA 5HE2A 4KSPA 2ZOQA 5CZHA 3VS5A 3ZH8A 1JAMA 4CXAA 3RCJA 3V5WA 3M42A 2E9PA 4FT7A 5IH4A 5LMBA 2WIPA 2WEIA 4O1OA 1AGWA 2C6EA 3EIDA 4EK8A 4HZSA 4DAWA 3CY2A 4YMJA 4TZRA 4FEVA 3SD0A 2XNMA 5JFVA 3SHEA 1KUTA 2P3GX 1JBPE 1ZYDA 3EB0A 3RPSA 5FUTA 4FMQA 4JAIA 1PXJA 1LEZA 3PSDA 2BHHA 3AC1A 2PVRA 3GOKA 4FT0A 3SOAA 4TNBA 3MVJA 3QKKA 2JITA 4GK2A 3RNIA 4GU9A 3M2WA 4S30A 5M53A 4BDKA 5AX9A 4CT1A 4YTCA 4HVDA 3LJ0A 4EOIA 3C9WA 1UKHA 2IVSA 3O8PA 2R4BA 3OBGA 4DFLA 1B38A 5J79A 2XRUA 4F0IA 3BLRA 3F66A 4JT3A 5EI8A 3TI1A 1M2PA 2RFNA 4KKEA 3ZLYA 4J52A 4MD9E 4ITIA 4CMUA 4IX4A 5CZIA 1RJBA 4ONAA 2WKMA 4RVLA 3E5AA 2VTNA 4IB1A 4FTLA 4FTUA 4IW0A 4FG8A 4X2GA 5HO6A 4ANBA 3QX2A 4BVUA 5EW8A 1QL6A 3KFAA 2Z02A 4CQEA 5TR6A 4M0YA 4EH3A 3TZMA 3DA6A 1H27A 1OPJA 1MQ4A 3QTUA 3OXZA 4I0SA 3W32A 4XP2A 2VWXA 5GZ9A 1OVEA 2WO6A 2VX3A 3EN9A 2JDSA 3R21A 4FV9A 4RJ6A 5EKNA 2FGIA 5DRBA 4RFZA 5ACBC 4C36A 5IMEA 5H9BA 2R3GA 3EN4A 4IWOA 3TTIA 2F7XE 3QUPA 2WGJA 3UPZA 3CPCA 4GRBA 1BLXA 4JQEA 1H26A 4XX9A 3QYZA 4HNFA 5ANDA 5LCKA 1SM2A 4QTAA 5JN2A 1YXTA 3PA4A 4EKKA 3T9IA 2YM4A 4K1BA 5J7HA 5BVKA 4JIKA 3TZ8A 4HPUE 1H1SA 3F3VA 5CTPA 4YC8A 3D7ZA 4EOSA 4FEWA 4EK5A 4OLIA 1KE5A 2ERZE 4C7TA 2X6DA 3PG3A 3QHRA 4YHTA 2BKKA 4BKYA 3QXOA 5IA4A 3Q9YA 3LZBA 4QPSA 2FO0A 4GIIA 3O7LD 3LFDA 1JQHA 2XJ1A 4HJOA 5AUXA 4YTIA 4RJ7A 1Q3WA 4AACA 4XS2A 5GINE 3C4XA 2PVYA 5T3QA 2PVLA 5IQEA 4FZ6A 3P79A 3DKFA 5KKRB 4GJ3A 1J1BA 4R7IA 5HVJA 3I7CA 2PZRA 3BKBA 3FPQA 4P4CA 3I0OA 2WTJA 4YJUA 2QLQA 3L8XA 4NFMA 3GENA 4JG8A 3RMFA 3ZTXA 3EYGA 4YGAA 1Q97A 2YIYA 3EN7A 2QOQA 5CT0A 1Y6AA 3GCSA 4EONA 4OTHA 4HYIA 2CLXA 4ZSAA 5KBRA 3FLSA 2YLEA 2B9HA 2C47A 1OKWA 4GVJA 4ZK5A 3SX9A 4C02A 3O71A 4RZVA 2IW8A 5DVRA 3C0IA 3DNDA 4FKTA 3N4TA 2JIVA 3KK9A 3EFWA 1ZYLA 4YZBA 5M06A 3AT3A 3QZIA 3E8CA 4PMPA 4FUXA 3DBEA 3DDPA 2XBAA 4QMYA 4AW2A 5JSMA 2W1FA 2UVZA 4JXFA 1XH5A 3VQUA 3FWQA 1Q24A 4FNWA 3OZ6A 2OO8X 2ZM4A 5BVNA 5DEWA 5AV0A 1OIYA 3CJGA 3DLSA 4J1RA 1WVYA 2ERKA 2RSVA 4OT5A 3ORXA 4DBNA 3FZSA 4TWPA 4BWPA 5EYDA 2YAAA 2CGUA 1ERKA 4CG8A 4RRVA 3RALA 1NT2A 2HZ4A 3EFKA 1BKXA 1PYEA 3V3VA 5B2LA 3G2FA 3RHKA 5IQDA 1GOLA 2A1AB 4J53A 4DH8A 3ORKA 5GHVA 5J5SA 2XCHA 3WILA 3FJQE 3MIAA 3AG9A 4PPBA 2QOIA 2I6LA 5T6KA 4R8QA 1UU8A 2QKRA 2RG6A 3DQWA 4MQ2A 4PTEA 4CYJA 3IKAA 2FUMA 1GJOA 2OK1A 4I21A 4RIXA 2PMIA 2OZAB 3D94A 4KIOA 4F7JA 4F9WA 4IVBA 4MX9A 3FYJX 4FSRA 1WBWA 4IZAA 3O8TA 3MS9A 5CT7A 3UOHA 4PDOA 1XBAA 2J4ZA 5AP4A 3RM6A 4NM3A 1NVQA 3NLBA 4C4HA 3UC4A 2BDWA 3EQIA 3CJFA 2XKCA 4FKSA 5I9ZA 5IZFA 1QPCA 2JD5A 3FKOA 4AE9A 1VZOA 4BIDA 3CD3A 5TOZA 3MVHA 2GNGA 3IW8A 2H8HA 3I1AA 3O0GA 3KK8A 5M08A 4EH6A 3BHYA 2W5HA 1GIIA 4PTCA 3UIUA 3E7VA 3PVBA 5A4TA 4G17A 4JOAA 2AC3A 5CNOA 2WU6A 2EWAA 5LXMA 3S0OA 4DEIA 4XBRA 4USFA 1SMHA 1FVTA 3HUCA 3WE8A 4D9UA 1PXNA 4E3CA 4O7YA 4BBFA 1O6LA 2OXXA 4C61A 5AUTA 5CANA 4RPVA 2PUPA 3WF5A 2B7AA 3RP9A 3JXWA 3V8WA 5CLPA 5CSWA 2CGXA 4E73A 3CIKA 2J0LA 3C50A 3COHA 3Q04A 4N6YA 5ETCA 5CVFA 2BRBA 2HAKA 2GNJA 2DUVA 3AMAA 4IAZA 3R8MA 1W7HA 2C6MA 3NGAA 4RLLA 3TNIA 2R3RA 4EOKA 5A14A 4KUJA 5K5XA 5JEBA 1QPJA 3F82A 3Q52A 3GEQA 4D2RA 1ZMWA 2CNUA 3HMMA 2QU5A 4FTCA 4ZTNA 3ZOSA 1BUHA 3L9NA 4I3ZA 3RAWA 2PTKA 4O2PA 3D14A 3GFEA 5EDPA 5BQ0A 2ZV2A 4R3CA 4NW6A 4LMUA 5L4QA 3MY0A 2IG7A 3AC4A 2CN5A 5DI1A 4QP1A 4B7TA 2PPQA 2HW7A 4D28A 4ZS4A 1IAJA 4YLJA 4E5AX 4GCJA 4D2PA 4F7LA 3FQEA 5EHOA 3UNJA 2WTVA 5C01A 2XNGA 3TNHA 1H4LA 2QOLA 3MH3A 5L6OA 4P7EA 1H07A 3VF8A 4J99A 4BIEA 2R3PA 3HP2A 5AAGA 3TJCA 3F2AA 1M52A 4IXPA 4XLIA 3ZU7A 4OAVB 4ALVA 4CRLA 3TUCA 3D15A 3ORPA 3O8UA 1YOLA 4XMOA 3FC1X 3WBLA 4APPA 5CF8A 1H25A 3BEGA 4RFYA 5L6PA 4Z9LA 3ITZA 4O7RA 3CC6A 5B2KA 3R8ZA 4XNEA 4Y5HA 2B55A 2X39A 1OGUA 2VWVA 3NSZA 5BUJA 3UVPA 4F08A 3LHJA 1JSVA 5D7VA 2Z7QA 5LWNA 3DV3A 1HCLA 4FTNA 1M7NA 3COMA 3FBVA 3PJCA 3P08A 1ND4A 3R71A 3DXNA 3UGCA 4AZFA 2WPAA 2OBJA 3HNGA 2OKRA 2X0GA 1FVRA 3NX8A 4N0SA 4O7VA 3S2PA 5HGIA 3NNWA 2X6EA 5HOAA 3REPA 4ITJA 4I4FA 1PHKA 2HXQA 3DAEA 5DOSA 5HX6A 3H30A 2UW7A 4RX8A 5DR6A 5AV2A 4DEBA 1L8TA 3RCDA 4E5BA 4CG9A 2E2BA 2XK6A 2PUIA 5K0KA 1XH6A 3ZRLA 4GW8A 5HNBA 1XJDA 4YJVA 3HRCA 4IAAA 3C4FA 2C3IB 2YIWA 2C6IA 3OMVA 5LVLA 4WT6A 3U51A 3ZDIA 2VD5A 4KBAA 2VGPA 5CQWA 1L3RE 3SG8A 3G6GA 2C1BA 4R5YA 4DCEA 4O83A 4ZTHA 1BMKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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