4JVGA

B-raf kinase in complex with birb796
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
275
structure length
262
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGLATVKSSILWMAPEVIRMQDSNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELARELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibitors that stabilize a closed RAF kinase domain conformation induce dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 70
structure length 262
sequence length 275
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jvgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jvgA01
4RPVA 1RDQE 2FSLX 3GU5A 3KKVA 3QRJA 4L67A 4AW0A 3VF9A 5FDPA 2W7XA 4J1RA 2GSFA 3KN5A 4FBXA 2YIRA 4TYHB 4WUNA 5BVNA 1OL6A 3WZKA 5J1WA 3G90X 5AR3A 3UNZA 4A9YA 5EK7A 2W9FB 5KNJA 3DOGA 5HIEA 3HDMA 5EDPA 3GQIA 4UMUA 2FVDA 2WIHA 4Y72A 4IX4A 4FV0A 5K9IA 5JFXA 4ASZA 2HY0A 3RCJA 5J9LA 3R9NA 2IJMA 4D0XA 4HGTA 4NU1A 5HBEA 3KA0A 5L2WA 3FXXA 4K2RA 3EZRA 2Y8OA 5TT7A 4AW2A 4NJDA 1M14A 3A4PA 3MVJA 3MTLA 5ANJA 4ASDA 3PA4A 3EWHA 4O21A 4C57A 5KKRC 5F4NA 4J95A 2O2UA 4BDFA 4QYHA 1A48A 3MYGA 2W1DA 4BF2A 5BNJA 3U54A 4O7NA 3R8VA 3DKCA 2I0YA 4L42A 3UDBA 2C5VA 4EZ7A 2PY3A 3M1SA 4JVGA 4N70A 2WXVA 4EKLA 5A6NA 5L2TA 4R5YA 4AAAA 4F0FA 4H1JA 4IDVA 3QD4A 2IW9A 2WMTA 2WQBA 4YBJA 2GPHA 4NKSA 4HOKA 4LGDA 3TN8A 4YLJA 3V5LA 5JZJA 2ZM1A 4YSJA 2ZV9A 1ZY4A 3CPCA 1P5EA 3A7FA 3EN5A 5E92A 3L8PA 4CKJA 2X0GA 4KBCA 1DI9A 4E20A 4PDOA 4FEXA 2W99B 4GVJA 5CU3A 4AT5A 3QRIA 2UZOA 2VN9A 2W4JA 3KVXA 1M2QA 2GTNA 3IGGA 3IS5A 3F7WA 3NRMA 2ZOQA 3W1FA 5EQEA 2Y4IC 2GQSA 4W4YA 2F4JA 4EK6A 2WTJA 4XV2A 3AD4A 5DN3A 5HG9A 5K5XA 4FSQA 5HGIA 4F4PA 5L8KA 5LJJA 3VAPA 4XX9A 5IQDA 2PWLA 4GU9A 1XBAA 4ZXTA 3R7YA 3RPOA 3OC1A 3ROCA 3IKAA 4ZSJA 1IASA 3VW6A 3DK6A 4M97A 4XUFA 2XNNA 3F5UA 2YDJA 3CXWA 3E63A 1E1VA 4FMQA 2JKMA 3ULZA 3QLFA 4WNOA 3W32A 1Y8YA 3ZO4A 3L9NA 3G9LX 4JR7A 4XH6A 4B0GA 2G01A 3QFVA 4PDYA 4GJ3A 4EQCA 5KCVA 5BMMA 4A9UA 3QD2B 2BDWA 2BDJA 4BZOA 5J87A 4M13A 4C34A 5AUUA 3DK7A 2J6MA 3Q4UA 4TXCA 4HCUA 4FC0A 2F49A 3TWJA 3OCSA 3TG1A 1IA8A 2XK8A 3FI2A 2I6LA 3G0EA 3SOCA 1IG1A 2ZV2A 4HJOA 2XRWA 3ZC6A 3CCNA 4BVUA 3HMPA 2A1AB 2YJSA 4YJVA 4YC8A 2J0JA 3PLAE 3GEQA 4RIXA 2CMWA 4YTCA 2J90A 4IX6A 4ZTMA 5CALA 3A4OX 5L6WL 3PRFA 4AW1A 2AC5A 4PNIA 3A2CA 4X7QA 5JEBA 5GJFA 2W1GA 3DB8A 5JSMA 5EDQA 5K0KA 3LM0A 2W9ZB 3F5XA 2NP8A 4FKIA 5ACBC 4BCHA 4HPUE 1OITA 3ROYA 3QTUA 4FSNA 3W2CA 2VO6A 3PJ3A 2BRMA 2J7TA 3DLZA 4H36A 5IA2A 1OIUA 2WOTA 3I0QA 5IA0A 1XH9A 1PMUA 3LXKA 4L44A 4BBMA 4QYYA 2XJ0A 3KK9A 3GP0A 4G34A 4R8QA 4U81A 5H8GA 1KUTA 3FMJA 5A54A 2XNBA 4U5JA 1U5QA 3UO6A 1VJYA 1OPJA 4ERWA 1TVOA 4QPSA 3ZLSA 4AA5A 4ZTHA 1WVYA 4IDTA 3MVHA 3BWFA 3T3UA 5FEEA 3QX2A 3CY2A 5DR2A 4EH2A 3KF4A 5IKWA 4DGLC 5A46A 4S32A 4LOOA 1OPKA 4YNOA 2O64A 4QOXA 4O0VA 4J71A 4QQJA 3LFSA 3W55A 3MVMA 4CKRA 5E8TA 2C5XA 4LGHA 4FNZA 4X0MA 4BCGA 4WNKA 5J8IA 1JVPP 4DBXA 3JVSA 3ORTA 3VW8A 3PXKA 3A8WA 4XEYA 5CZIA 4OR5A 4WG5A 4UMQA 5KO1A 3LPBA 2XNMA 4KA3A 2C0IA 5AM7A 3UQGA 4ZAUA 3MDYA 4GCJA 2OXDA 3DV3A 1OB3A 4F7NA 1YXVA 3PSCA 2Q83A 1SMHA 1UNGA 3QTWA 4FV8A 4WSQA 4I21A 3BV2A 4A07A 4TYGA 3DNDA 2YZAA 1GY3A 4J97A 4OW8A 1K9AA 1QPEA 4RVLA 5LMBA 5BVWA 2C0TA 4TW9A 2B52A 4UMTA 2XIXA 3R8PA 3ORNA 4FT3A 4UWYA 4EK8A 4RX7A 5EHOA 5LCJA 3BYSA 1GIHA 4MTAA 2PUIA 4MKCA 4RVMA 3FQSA 4QQ5A 5EHLA 3RAKA 1G8SA 2OFUA 4OTWA 1YHVA 2PL0A 3F2NA 3GC8A 1NXKA 1U5RA 4QYEA 3AMYA 4XBUA 3UP7A 4E6QA 4RIYB 5AUYA 2W1IA 3TI1A 1ZWSA 4BDCA 4R77A 2C6TA 4RX5A 2R3LA 5M08A 3QRKA 3EB0A 4FIHA 1YDSE 4FUYA 4XRJA 5AR4A 5JRQA 4TTHB 4NYEA 2R3HA 1UWHA 4CVAA 5I9XA 4BTJA 1ZAOA 4CG9A 2IZRA 2OI4X 5HHWA 2X2MA 1O9UA 4FTKA 4EJNA 5LXMA 4BI1A 4K11A 1NT2A 2GCDA 2C69A 4JBQA 4O0WA 4IBMA 4AWIA 4KINA 4L52A 4MXZA 5HCYA 5AV4A 2R9SA 3R7UA 1H24A 2QOQA 5L6OA 3C4CA 4HGLA 5M56A 3E62A 4EBWA 1DM2A 1OIYA 2BDFA 3QZIA 3ITZA 2VO0A 3HAVA 4M14A 2V62A 2XNGA 1VYWA 3AMAA 4CMUA 5L2IA 3KRWA 2QC6A 3KGAA 4IH8A 5HTCA 3Q3BA 4DG3E 2W05A 4RVKA 1Q24A 2ERKA 2BVAA 5DHJA 3H30A 4AG8A 3WZUA 2BRHA 3M42A 3V6RA 1U59A 2XKEA 2ZJWA 4RC2A 2P55A 5E8YA 3RCDA 1RW8A 5IA3A 2WPAA 2QI8A 3UIXA 3DQXA 4RJ3A 4BHZA 2RG5A 4EZ3A 3UIBA 4YMJA 3QTZA 3BEGA 3QHWA 2YM6A 4NJ3A 4QMMA 3LLAA 4ACMA 3L8XA 2OXXA 3DU8A 1Q99A 2VX0A 2ONLC 2FSMX 3PSDA 4RA4A 5I5ZA 4BRXA 3LXNA 2O65A 2WMXA 4FZDB 3V8SA 2KTYA 4E3CA 3SGCA 2UW5A 3FZOA 3E3BX 4KWPA 2CNUA 3ET7A 3UMXA 5M4UA 4I5CA 4FK3A 3AC1A 1YVJA 3WYXA 4ASEA 4TL0A 5FTGA 1H08A 4E7WA 1R78A 3SRVA 3JVRA 3TTJA 3U9NA 5IZFA 3D15A 1XO2B 3LFCA 4JAJA 3OWKA 4OTGA 2PTKA 3DDQA 1GZOA 3BKBA 3BEAA 5DT0A 3DQWA 5AR8A 3QKMA 5FWKK 3F3WA 2QR7A 3TACA 4FV5A 1ZYLA 4UYAA 5DMZA 4EOQA 3TZ7A 4L7FA 5B7VA 4X3FB 3IGOA 4DFZE 3DBCA 2QOOA 3QQGA 5BVEA 3UIUA 1IRKA 2CKPA 2Z7RA 5B2KA 3NNUA 1QL6A 4JRNA 2QNJA 3O7LD 3BX5A 3HYHA 4PV0A 5CVFA 5M51A 1XBCA 3HUBA 2ZAZA 2OZAA 2XYUA 3P4KA 4RWKA 3TZ9A 4CYIA 4R3PA 4QP8A 5E8SA 3PZEA 3CD8A 5BUEA 2VD5A 1VEBA 4A7CA 4PMPA 2QU6A 4F9AA 1OGUA 2HY81 2P4IA 3W2RA 2C3IB 2R5TA 1OL2A 3ODYX 5A4CA 2WELA 4IE9A 4TYHA 1JKSA 2YIWA 1VYZA 5KUPA 4LRKA 4EBVA 4EUUA 2UW0A 4HPTE 2XA4A 3ODZX 3SD0A 5IF1A 4MBJA 3ZUUA 4F6SA 2ZB1A 3L9PA 3HMNA 1E9HA 4MX9A 4BIBA 3BE9A 2VTPA 3DXNA 3KXGA 3PRIA 4FTOA 4C3PA 5HLNA 2CNVA 2J0LA 3BQCA 5M4FA 4UY9A 5H9BA 4EOIA 2XMYA 5M09A 2XIKA 4LYNA 4RLLA 5CAPA 3ACJA 3KC3A 4B4LA 3QQFA 4OTFA 3W8QA 4TKSA 4FEWA 4PTCA 3MFUA 4YBKA 4ZTQA 4DFXE 3NS9A 3S1HA 2VWVA 3UOJA 4UX9A 5K5NA 2GS2A 2ZYBA 3I81A 3NLBA 4FVQA 4DGMA 5JH6A 1PYXA 2ITQA 2PVNA 3HA6A 3GFWA 2IG7A 5GZ8A 2Z60A 4UALA 2XIZA 5KMNA 3BIZA 1B38A 4I6FA 4RC4A 4IVCA 4CG8A 4L3PA 3QGYA 3MS9A 5EDRA 3TNHA 1YOMA 1IAJA 4GYGA 4D4RA 4TNBA 3PVGA 3QF9A 5AV3A 5CU0A 3Q5ZA 3KN6A 3EFKA 4Y5QA 5ANGA 5HVYA 5HE0A 4OT6A 4NWMA 4QTCA 4DG2E 2EB2A 4IVDA 3GU8A 5DGZA 3R8ZA 2X9EA 1Z57A 1P4OA 4FTIA 1HCKA 4K9YA 2PSQA 3FLYA 4RIWB 5EI8A 3EOCA 1JKKA 2BTRA 3FEGA 4H39A 4PMSA 4GT4A 4G5JA 2O8YA 4MD7E 4MNEB 5DYJA 5IISA 4YJSA 1REJA 3DZQA 2VTRA 3OS3A 2E9PA 4R7HA 4D4VA 3COMA 4IM0A 4G6NA 4NM7A 4DBNA 4YLLA 4XBRA 4R7IA 3VVHA 4MXCA 4R3RA 5LCKA 5JQ5A 5LMAA 3E5AA 4I6HA 2OIBA 3JY0A 4F9CA 2X6EA 3LFBA 1R0EA 1WVXA 2R3GA 5C4KA 4AGCA 5AEPA 3EFJA 2DYLA 3EQDA 2R0UA 4YUQA 4YHJA 3OEFX 4F08A 4O2PA 1LEWA 1URWA 1AQ1A 2OJIA 3S95A 4IJPA 4A9TA 3SA0A 3R8MA 2VTHA 4Z9LA 3NUXA 4Z55A 3QCSA 3V04A 3D5XA 4H05A 3UYTA 1GZ8A 2UW3A 3P23A 5FBNC 4AE6A 4AZFA 4HCVA 4IWOA 3MJ2A 2IW8A 3GU7A 5CSWA 3MH2A 5CU6A 3FZ1A 3NW6A 3ORPA 3R7GA 5HCXA 4QYFA 2RFEA 4QP2A 3U51A 4HVDA 4FK6A 4QMSA 3EL7A 4YPSA 4DYMA 5I4NA 5DE2A 3D0EA 2PZ5A 4AE9A 3PP0A 3FJQE 3LW0A 5AP5A 4EH4A 4EH3A 4QTBA 4RJ8A 5LVPA 4Q5EA 1XH6A 5HNBA 4DEAA 3CLYA 4JI9A 3OTUA 4C4GA 1ZY5A 2ZM4A 3ZONA 5IH5A 3F3TA 2A4LA 5LVNA 2F7XE 2ITWA 4USDA 4ZS4A 3I5ZA 3ZRKA 5JK3A 1CKPA 4WBBB 2PU8A 1UV5A 3DB6A 2R0IA 2JDOA 4IWQA 3MN3A 5CEIA 4DITA 5M4IA 3HVCA 4IX5A 1XHAA 4JBPA 4M0YA 3T9IA 3ZXTA 3KXHA 4F0GA 2EU9A 3P79A 5J95A 2WAJA 4C62A 4CFNA 4DT8A 4LQMA 4RIOA 1FGIA 1MRUA 3O7LB 4AXAA 5AADA 5CAVA 4J96A 2J2IB 4FTJA 5F1ZA 1YOLA 2PULA 4BDKA 4FIGA 3QTIA 4FZ6A 4TWNA 3SV0A 3KK8A 4QYGA 5E9EA 1SZMA 2NPQA 5CWZA 3VF8A 3EQGA 1M17A 2YM7A 3LFAA 2CSNA 3LE6A 3NWWA 3UTOA 3ZMMA 3UOLA 5L3AA 3PJ1A 2OH4A 4H1MA 5HU9A 4O7ZA 3WE4A 4ITJA 5ETCA 3FZSA 2UV2A 2V5QA 2WMRA 4CLJA 3QD0A 4JG7A 5BQ0A 3MGYA 3DBEA 4AOTA 3UE4A 2R64A 5KMIA 3UC4A 3ORXA 1JWHA 2YCSA 2WMVA 2QKRA 1W82A 5KX8A 5HVJA 3KRXA 3SW7A 3C4XA 5AP0A 3FMNA 3IPHA 4O91A 4L46A 4XP0A 3KVWA 3ZUVA 4C4FA 4UB7A 2X1NA 4O0XA 2FO0A 4EK4A 3BRBA 3BHUA 3ATTA 3DA6A 3WIKA 1UKHA 2PMOX 3D94A 2QO9A 3R1NA 2FB8A 3RNYA 2BALA 5KMMA 3BV3A 4X21A 2WFYA 3I0OA 2F2CB 2VNWA 5AUWA 4ORKA 4NTSA 4FYNA 1Y57A 4O7LA 4BCKA 5M55A 2J4ZA 4ZLYA 4YJQA 4EONA 2WTIA 2XK9A 3NUNA 5IG1A 5BX0A 4G17A 1ZLTA 3DFCB 2ZM3A 5HCZA 3CKXA 3FI4A 3FMHA 5EKNA 5HIBA 3SC1A 3EQHA 4NH1A 2HYYA 4DEHA 1JNKA 2GHLA 3G9NA 2X81A 4WKQA 2UW6A 3P9JA 4JDKA 3VS4A 3HL7A 4FG9A 5AA8A 3U4WA 5IH4A 3GGFA 2J0KA 3PG3A 1OKYA 3UGCA 4F9YA 4RIYA 5EHYA 5EW8A 3Q2JA 3HV3A 1STCE 4O0SA 4OGRA 5HO8A 2XKCA 1KOBA 4I1ZA 1BUHA 4OBQA 1YHWA 4ANMA 1Y91A 3GVUA 3ZRMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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