4KA3A

Structure of map kinase in complex with a docking peptide
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
351
structure length
340
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGHRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLAQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the p38 alpha MAP kinase in complex with a docking peptide from TAB1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase/protein binding
source organism Mus musculus
total genus 102
structure length 340
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2013-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ka3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ka3A01
4QMLA 4IAIA 5HE3A 1U59A 4RA4A 4CFVA 3ZFXA 5CASA 3UVRA 4WT6A 4YZDA 4MVFA 4O38A 4HVHA 4MXAA 2YCQA 3LM0A 5LVNA 5FM2A 5BVWA 2OO8X 5AP1A 3ANRA 4TPTA 4EWQA 1L3RE 4RIWA 3VUMA 3EQDA 4M66A 5LVLA 3DZOA 3KULA 3IOPA 2QOFA 3VHKA 5ETFA 2ZVAA 3EZVA 2HCKA 5AP0A 1PXJA 4KUJA 1PW2A 2OXXA 4AGCA 5HE1A 5AAGA 3H9OA 5AX9A 4J52A 4L44A 4XHKB 3F69A 1H25A 4X6QC 3EL8A 3QKKA 2QR8A 5AM7A 1O6YA 4UZDA 4UMPA 3KREA 4IC8A 2C47A 2WTIA 3E62A 2ZYBA 3F3WA 4HNFA 1P14A 4OTQA 5HZNA 3CQWA 2XCKA 1WBNA 2GS6A 2OJFE 2VTSA 4JDHA 4NZWB 4J98A 3R8VA 3TCPA 5HLWA 3TUDA 4CNHA 4R3PA 4EQUA 4U3ZA 1KOBA 4JRNA 2ETMA 4RC2A 3VUGA 4H1MA 3W2RA 3TNQB 4DITA 1FMOE 2WMQA 4BCMA 3W8QA 4KB8A 1AGWA 4BIBA 4U42A 4YO4A 4F6SA 4YJTA 3C4CA 4XG6A 2Y4IB 1JBPE 2G2FA 2V5QA 3VWAA 5IISA 3LE6A 2XK8A 5HTBA 2CNUA 2OSCA 4RC4A 3ROCA 2G9XA 1G8SA 2QOHA 3MA6A 1OL1A 2QOQA 3LMGA 4LG4A 1UV5A 2BVAA 2BHEA 3Q9XA 3BEAA 3Q9YA 4AZFA 5AADA 3L8VA 1PMNA 1QMZA 3PXQA 4BYJA 2YLEA 2QR7A 3PVWA 4O96A 3KVWA 1O6LA 4OT5A 3BI6A 3GCUA 3TZ7A 3QX4A 2WMWA 4ZLZA 4U81A 4J96A 1OKYA 3HDNA 3MVJA 3ENHA 4O2PA 3BHTA 3IDCA 5E8VA 4BCJA 4BTJA 5BNJA 3MTLA 4UY9A 5CEMA 2OJIA 4D2VA 3DA6A 3NVKI 3QQHA 3WZDA 3ZLSA 4BCKA 4YSMA 4F9CA 1NY3A 2H9VA 4UYAA 4ZY6A 4DH7A 5H8BA 4L3LA 3V5PA 2J5FA 2GFSA 2YITA 4FC0A 2O64A 4JG6A 2CPKE 3TV6A 3G15A 2PZ5A 3CC6A 3LIJA 3KRXA 3TACA 5AAEA 2OZAB 2VU3A 2UZNA 1OBDA 3QA0A 4F64A 2Y6OA 3FAAA 2O8YA 2GNLA 3COIA 3OG7A 1U54A 2WD1A 4IJ9A 1PXNA 3I0QA 3PP1A 3MJ2A 3ZFMA 4OTFA 3R71A 5I9WA 1Y91A 4JRVA 3AC3A 5EYMA 3UVPA 4AAAA 4FOCA 5IUHA 5I9YA 5HGIA 2F2UA 3GP0A 5JZNA 4JBOA 3F2AA 3KXGA 2YM4A 3CY2A 3NW5A 5ACBC 4EK8A 2UZTA 4AG8A 1YXTA 4DFUA 1XKKA 3FLYA 2ITYA 3QFVA 2OF2A 2QCSA 4E6QA 2DUVA 1H1WA 1UKHA 4G5PA 3BGPA 4A7CA 2I7QA 4ZP5A 5DWRA 4A9YA 3ORNA 5IA1A 4DBXA 4FG8A 4UXLA 3ERKA 4DFYA 3QU0A 4IAYA 5FXSA 1OI9A 4H39A 3R22A 1YRPA 5FBOA 4B6LA 5ANJA 4GU6A 4K18A 1CKIA 1WZYA 5HBHA 5E8UA 5HNGA 5HD7A 4FL2A 5EI6A 4S33A 4BHZA 4LOQA 2NNWB 3DY7A 4W8EA 4L43A 4PP9A 4IFCA 3K5VA 2XZSA 1TKIA 3I4BA 4J7BA 5L2SA 2YIRA 2X6EA 4ZZMA 2OJGA 2OXDA 3VS6A 3V5QA 4I4FA 3ZBFA 1ND4A 4V01A 5E8YA 4IZAA 1YQJA 5IA4A 5IQBA 4HCTA 1YXUA 4C4HA 2B52A 1VR2A 2UVXA 3AMBA 3DNEA 4NH1A 4QQTA 2JDSA 5HO6A 4FTJA 3C4ZA 3O17A 3LXLA 4BDEA 3S0OA 3KU2A 3NVMB 2Z7LA 3EFKA 3JVSA 5LVPA 2UV2A 3EYGA 2UZOA 5DEWA 5CSXA 2XNMA 4I0SA 4OBPA 5IQEA 4LRMA 3IW7A 4GEOA 4IAFA 2PMOX 2FYSA 3ZH8A 3FQEA 5CVFA 2C1BA 5AA8A 2FA2A 3COHA 5EFQA 4BTFA 3FPMA 2IO6A 3VUTA 3QCQA 3RNIA 2W4OA 3TZMA 2XJ1A 4PL3A 2Y0AA 2C4GA 2YWVA 2WMUA 4M3QA 2EWAA 2XJ0A 4IE9A 2PYWA 3CKWA 2VTJA 2WIHA 4F65A 3QWJA 3TXOA 3KN6A 3RAKA 4ANSA 4CVAA 2IZUA 4GK2A 4I6HA 2VD5A 1SYKA 4IX4A 4U5JA 5DPVA 4EC8A 3BWJA 4BBFA 4D4YA 2B53A 5BUIA 5LQFA 1Y8GA 3TI1A 5B7VA 3W8LA 3FC2A 2BFYA 2IVVA 4I23A 4CZTA 4MTAA 5ITAA 4EBWA 3MY0A 3ZU7A 2BMCA 4XS2A 4DH3A 3FMMA 4EK3A 5KO1A 2Z7SA 3REPA 4UMQA 4K1BA 4AU8A 1TVOA 4TYJA 4FSZA 3RAIA 2I0HA 4O1OA 2BPMA 3U9CA 3ZDUA 2IJMA 1JKLA 3TNHA 4CMOA 5A4TA 3NAYA 3LMIA 4QQJA 3I7BA 3F2RA 4FL1A 5FRIA 3W32A 3GGFA 5L8KA 3FKLA 3QQUA 3NIEA 4EOMA 5KMKA 3DT1A 2W1GA 4QD6A 3PJ3A 4FNXA 4TYHB 4XG8A 4NCTA 3A8WA 2CDZA 3TJCA 5DH3A 1BUHA 4DFLA 5BMSA 3NUYA 1NT2A 3EN9A 3I81A 5C8NA 5EOLA 3LLTA 4O22A 4UV0A 4Y46A 4BYIA 3R8UA 5JFWA 3D2IA 1XR1A 1JSUA 4FNYA 3F3ZA 2ERKA 2OFUA 4JDIA 5ETCA 2R3GA 3PTGA 1R1WA 1FVTA 3E8CA 2RIOA 3PSCA 3R30A 4QMXA 3R9RA 3D7TB 4R6VA 3DFCB 4PPCA 2BRBA 2C6LA 3PIXA 3F5GA 3PPKA 1LUFA 2BUJA 4ONAA 4AE9A 5IG1A 1B38A 2W96B 4GT5A 3QTRA 2IVSA 5CI6A 1HOWA 3P79A 2VTAA 3PXFA 4BGQA 3QRJA 3MWUA 4C2VA 2X9EA 1YI6A 3PVUA 4C57A 1Q8YA 1DI9A 2JKOA 4DEBA 5H3QA 2YCSA 4YBJA 3PPZA 2ONLA 2XNGA 4DHFA 4MAOA 3UIMA 4BCHA 4F6WA 3BGQA 2FSMX 2PWLA 3C0GA 3LFFA 2JAMA 1MRUA 3R28A 4D4RA 4ZSAA 3PJ2A 3R7GA 4C34A 4QYHA 4O7NA 5ANGA 3VAPA 3G0EA 4JL9A 3FC1X 3VS0A 3O71A 3D5XA 5J9ZA 2GNIA 3KRLA 4PMMA 4OTHA 5TT7A 4D1XA 4MKCA 5IH5A 3O7LB 5IDPA 4O7LA 4B7TA 2VO0A 2X0GA 3UQGA 2OJ9A 3A60A 4PTGA 3FL4A 3KF4A 3M1SA 5K4IA 3R21A 1J7IA 2WTKC 4WBBB 1PJKA 5FLFA 3ZFYA 5IQCA 2XM8A 4GW8A 3VJOA 5M56A 1UNLA 2XEZA 2YFXA 3HZTA 4GJ2A 3V8SA 3A99A 2BR1A 4KIOA 2XKDA 4WD5A 4HVDA 4WSQA 4X2KA 3MB6A 1YHVA 3G6HA 3MN3A 2HW7A 2X4ZA 3QTWA 4KKHA 2VGOA 3VS4A 4PWNA 5CAQA 2ZM4A 4WG3A 3WI6A 4RFZA 4O82A 2P33A 4WRGA 3NZ0A 4RZVA 3JPVA 3WIKA 3QXPA 5CSWA 3DJ7A 1UWHA 2X8EA 3NUXA 4CQEA 4BRXA 3QZHA 1OUKA 2PUUA 4X2NA 3GC9A 2R3IA 3PVBA 1ZMUA 4XYFA 3SQQA 2OICA 4E20A 4ZMEA 3H4JA 3NNVA 1PMEA 2ITVA 4K11A 3HRCA 3P23A 4XUFA 4V0GB 4CZUA 1Z9XA 3R1QA 2P0CA 5HIBA 4BDAA 4IEBA 1J7UA 4QTCA 2E9NA 5CSPA 4JDKA 2VO6A 2QOLA 2CLQA 2W4JA 4YTCA 4PPAA 1P4FA 5F20A 4ZY5A 3LXNA 1ZY4A 4O6EA 2PK9A 5DN3A 2F7ZE 1IAJA 3R01A 2XMYA 1PYXA 4DLJA 3DDPA 1Q99A 3Q53A 4IADA 3W16A 3H30A 4M7IA 4IVAA 1REJA 1V0BA 3OW4A 4JVGA 5AX3A 4GVAA 2F7XE 2JD5A 3LFEA 4F7LA 4BY9E 4BKYA 3HAMA 3W2QA 1MP8A 4LL5A 4FEVA 3DV3A 4EOJA 4AFEA 2VN9A 2W1DA 5DBXA 1H26A 3PY0A 4IWOA 3IW6A 2B9HA 4HPTE 4L53A 3PZEA 3THBA 5BYZA 3I5ZA 4QQCA 5E90A 2WQMA 4TT7A 3B8RA 4QMYA 3QLFA 4NJ3A 1RW8A 4YLLA 3VS1A 4U79A 3QQLA 4E7WA 4O1PA 2X9FA 4MHAA 3HP2A 2ZDUA 3P5KA 4ASZA 2HW6A 4DF3A 3GXLA 4IDTA 2PMNX 2R3FA 4M69B 4BFMA 2EB3A 3ZSGA 3RCJA 4CGAA 2PMIA 1ATPE 1OB3A 1VYZA 4BZDA 3UP7A 4AE6A 5JMSA 1YHWA 5KKRB 4FEWA 3TIZA 4RWJA 2WMSA 2ZOQA 5CQWA 3BYMA 3MTFA 4HJOA 3DDQA 2BKZA 2OZAA 4PV0A 3GC0A 4HCVA 5EM5A 4E1ZA 2PUIA 4Y72A 4R7BA 3OBGA 2E2BA 4J1RA 5EM8A 5AUYA 2UW7A 3E8NA 1M2PA 3GC7A 4FKTA 4CFWA 3TDWA 4DEHA 4F70A 3V04A 1ZOEA 1CKJA 4X3FB 4JJRA 4O7VA 5FP5A 1ERKA 3D0EA 3LVPA 4QPAA 3V51A 3DBFA 4JG8A 1R78A 3NNXA 5AP3A 4EOLA 5AV3A 2NP8A 2PVLA 2JGZA 4BGGA 1UVRA 4DGLC 2XUUA 5KMIA 4IWPA 3R73A 2OGVA 2CNQA 2YM7A 3KXXA 4IAAA 3NIZA 1UU9A 5IA0A 3P86A 3EFLA 4QP8A 3OUNB 4FIFA 5AP7A 4YURA 1R3CA 3CXWA 5TKDA 1RJBA 4NU1A 2WQOA 3IW5A 4QQ5A 2G2HA 4W8DA 3E8DA 3RK5A 3FI8A 2W06A 4XG2A 2YZLA 1A06A 2UZDA 1R0EA 1Y6BA 4FT9A 1PKDA 3SKCA 4GKHA 3E8EA 4BDBA 3P1AA 2BCJA 3R63A 4I5CA 1KUTA 4IBMA 3ORKA 3UGCA 3QLGA 3HRBA 3NRMA 3QX2A 1G8AA 4EKLA 2NPQA 3KMMA 4I21A 4IM3A 3NDMA 2LAVA 5TR6A 2Y4PA 4JLCA 5TO8A 4GFOA 4FG7A 3ZRMA 3LFQA 1XHAA 2G01A 4QPMA 4EQCA 5FGKA 2Y7JA 3DAJA 4G9RA 2Z60A 4XG9A 5F4NA 3OY3A 2VX0A 4UN0C 5BVFA 4QP9A 2AC5A 2WELA 3ZONA 3PXKA 1RQQA 4P4CA 5FG8A 3ELJA 2A2AA 2YM6A 2F2CB 4G1WA 1OBGA 3MESA 3PJ8A 4BTKA 3BKBA 4Q9SA 5ICPA 5T3QA 3R1YA 3BV3A 5BUEA 2ACXA 5KZIA 4M0ZA 3KXZA 4EZ3A 3ENMA 3RI1A 3HMNA 3DOGA 1RE8A 2W0JA 1P4OA 5CAVA 4R78A 3VS2A 3U55A 1W98A 4KRDA 3M42A 1ZXEA 3PYYA 4RJ6A 5ANIA 4FV4A 3R1SA 2OXYA 1QCFA 2Q0BA 4RVKA 3WE8A 4YC6A 4AF3A 3MS9A 5GZ9A 1APME 5T68A 2O3PA 3R9HA 3WOWA 3UC3A 2OH4A 4XV9A 3FZTA 2XIZA 5HI2A 3F5XA 3UPZA 5A9UA 4RIXB 3GU4A 2XK6A 4I41A 4CFMA 3E88A 3AGLA 1OVEA 3CE3A 4ZY4A 3AOXA 4TNBA 3EFWA 4HOKA 3EQRA 2I0VA 5F94A 2QNJA 4FE2A 4HPUE 5HO8A 3QUEA 1H24A 5IF1A 2YM8A 1GIIA 5HNBA 2J0KA 2JITA 2VO7A 5AMNA 4TYHA 5CU0A 3QZFA 3TKIA 3NCZA 4OTGA 3DKOA 4ORKA 2CCHA 5B2LA 3PZHA 1V0OA 4KA3A 3VIDA 2YIQA 2GDOA 3FY0A 3TNIA 4BN1A 4IB1A 3C5IA 3MPMA 5CY3A 4O84A 4FKWA 5CZIA 3GCSA 4J71A 4RBLA 3IONA 3QGWA 2VNYA 3UNJA 4AN2A 3DBQA 1J91A 5EDQA 3D7TA 2UW9A 3KK9A 3FPQA 2GQSA 4MYGA 4EHVA 2PZPA 4X0MA 4GT4A 3FEGA 4NWMA 3ZUTA 2XP2A 3H9FA 4OTDA 4YJQA 4D55A 4JNWA 2F9GA 4IM0A 5E1SA 1WMKA 1YXXA 2UZWE 3CPCA 3BYSA 4O21A 4ASXA 3NYOA 5FDPA 4FYNA 2OKRA 3DTCA 3Q4CA 4QP1A 4YJOA 2RGPA 2BFXA 4FODA 4HGTA 4MQ1A 5GNKA 4BDHA 3RVGA 3R83A 3FDNA 4WRSA 4AGUA 4UWCA 1Q62A 4TYEA 4Y8DA 5CTPA 3ZO2A 4G6OA 4CFFA 3ACJA 4CKRA 5ANEA 4O7ZA 2R7BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QML A;  4IAI A;  5HE3 A;  1U59 A;  4RA4 A;  4CFV A;  3ZFX A;  5CAS A;  3UVR A;  4WT6 A;  4YZD A;  4MVF A;  4O38 A;  4HVH A;  4MXA A;  2YCQ A;  3LM0 A;  5LVN A;  5FM2 A;  5BVW A;  2OO8 X;  5AP1 A;  3ANR A;  4TPT A;  4EWQ A;  1L3R E;  4RIW A;  3VUM A;  3EQD A;  4M66 A;  5LVL A;  3DZO A;  3KUL A;  3IOP A;  2QOF A;  3VHK A;  5ETF A;  2ZVA A;  3EZV A;  2HCK A;  5AP0 A;  1PXJ A;  4KUJ A;  1PW2 A;  2OXX A;  4AGC A;  5HE1 A;  5AAG A;  3H9O A;  5AX9 A;  4J52 A;  4L44 A;  4XHK B;  3F69 A;  1H25 A;  4X6Q C;  3EL8 A;  3QKK A;  2QR8 A;  5AM7 A;  1O6Y A;  4UZD A;  4UMP A;  3KRE A;  4IC8 A;  2C47 A;  2WTI A;  3E62 A;  2ZYB A;  3F3W A;  4HNF A;  1P14 A;  4OTQ A;  5HZN A;  3CQW A;  2XCK A;  1WBN A;  2GS6 A;  2OJF E;  2VTS A;  4JDH A;  4NZW B;  4J98 A;  3R8V A;  3TCP A;  5HLW A;  3TUD A;  4CNH A;  4R3P A;  4EQU A;  4U3Z A;  1KOB A;  4JRN A;  2ETM A;  4RC2 A;  3VUG A;  4H1M A;  3W2R A;  3TNQ B;  3P5J C;  4DIT A;  1FMO E;  2WMQ A;  4BCM A;  3W8Q A;  4KB8 A;  1AGW A;  4BIB A;  4U42 A;  4YO4 A;  4F6S A;  4YJT A; 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