4KBCA

Ck1d in complex with {4-[3-(4-fluorophenyl)-1h-pyrazol-4-yl]pyridin-2-yl}methanol inhibitor
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
292
structure length
288
Chain Sequence
ELRVGNRYRLGRKIGSDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Ligand-protein interactions of selective casein kinase 1 delta inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
total genus 98
structure length 288
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4kbcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4kbcA01
4W4YA 4FUXA 1UV5A 4AGDA 2Q0BA 3EFLA 4RWLA 3PXKA 2W1GA 4FIGA 4DG0E 4GU6A 2B7AA 4I0SA 1ZLTA 3BHYA 2E9NA 3GCPA 3ORKA 3FMKA 2BALA 4FVPA 2RKUA 4MF1A 3PRFA 4C4EA 3KN5A 4DA5A 4O22A 3GNIB 1Z5MA 4Y83A 2XKDA 5ICPA 4ZZOA 2YERA 4EOPA 4NFNA 5DOSA 3ZS5A 3GI3A 4C33A 3OTUA 3DJ6A 2Q0NA 4DEHA 4K11A 4AX8A 1JKKA 2CN8A 4CYJA 1UU7A 4YLLA 3FLZA 4EH9A 3NNXA 4O81A 2SRCA 3BGZA 2X6DA 3EL7A 1QPEA 1WVWA 3WF6A 1S9JA 3Q6UA 3KRLA 3NYVA 5G1XA 4E7WA 1OGUA 1OMWA 2XZSA 3AD4A 3I5NA 5AP1A 2PE0A 1M7QA 2WFYA 3GU8A 3QCSA 2V55A 3QQKA 3OWJA 4LV5A 5CT7A 1ZMVA 3VBVA 5M08A 2HENA 3EH9A 2OZOA 4DEGA 3UMWA 1OECA 5EYDA 2RFEA 4QQTA 5CVFA 3TKUA 5JFVA 3DDPA 5KCVA 2BZIB 2JC6A 4MBIA 1Q3WA 2IVUA 3Q9WA 4IACA 3FHIA 4EH7A 5CEQA 1MRUA 4A9TA 4IAZA 4IWOA 3FSKA 5BVOA 3T9TA 4BL1A 4WNOA 4EHGA 3O23A 4KAOA 3LXPA 3ZC5A 1H26A 3MVMA 3LLTA 4TZRA 2ONLA 5DE2A 5AFVA 4WSQA 4KKEA 3QHWA 4GVAA 5F20A 2JBPA 4C4GA 4DGMA 4HYUA 2W1ZA 3DZQA 4G6OA 5EDPA 3NYOA 5FTQA 4B6LA 3ZLWA 4PX6A 4C62A 4JDHA 2VTTA 2R4BA 4U7ZA 2JBOA 4QYHA 3F3UA 3BEGA 3VNTA 2J0JA 3AQVA 5ETAA 4CZUA 4O0SA 2LAVA 4MAOA 4P7EA 5A46A 3FZTA 4RIYB 4XP3A 4EJ7A 4ASZA 2BZKB 3OY3A 4IBMA 2ZDUA 5AIRA 4I6FA 4RZWA 4U3YA 5K0KA 3RKBA 4S34A 5CF6A 3N4UA 3U9CA 1TVOA 4HGTA 5HTCA 1KOAA 2YFXA 5M57A 3DKOA 4BCOA 2BVAA 4QP6A 3ULIA 3AD5A 4FSUA 4QP4A 2XK3A 4BTFA 4WA9A 5H2UA 3R04A 3OW3A 2HZNA 4OBOA 5CAPA 5CZIA 5CEIA 1ZZLA 3R22A 4C61A 3NYXA 4KBKA 2PYWA 3E8DA 3FLSA 4OTRA 3HMNA 4B4LA 2VX1A 2X4ZA 1ZYSA 2QU5A 1Q8YA 2XH5A 2XIXA 3WI6A 5EH0A 2A4LA 1UU3A 1CSNA 3FLQA 5DT3A 2OXYA 5CF4A 4MXZA 4E8AA 5IEVA 4NCTA 5FUTA 5IF1A 4M0ZA 3EQHA 3GCQA 1ZZ2A 5D10A 2JIIA 3BV3A 5K4IA 5KMNA 5L2IA 3IO7A 4FIJA 2ZVAA 2EXMA 4BCNA 3FMHA 4QPSA 3ZM4A 3LQ8A 4D4RA 4KSQA 3OF0A 2ZAZA 4PPBA 4AT5A 5JT2A 3CGFA 1PW2A 4GIHA 3D83A 3NWWA 4BCQA 4J96A 2XA4A 2X7FA 3P5KA 4Y95A 2VWVA 3QQUA 3NR9A 4MVFA 3ALNA 5D12A 5DR6A 4L9IA 4GK3A 3NUAA 3U87A 2YIXA 4M68A 4CKIA 4ONAA 4XJ0A 2VTAA 3HMMA 1GJOA 2XRUA 4ZS0A 2VGPA 5FXSA 3Q4ZA 2CKEA 1SVEA 4ZLOA 1PKGA 4MWIA 4G3CA 4O6LA 5BUEA 2FSLX 4EL9A 3DAEA 4R7IA 5HVYA 4E4MA 4EZ5A 2ZM4A 4FT7A 3E3BX 4FKUA 4DBNA 4DYMA 4G34A 5CAVA 5J5SA 3BU5A 4U79A 4EOKA 2UVYA 2OF4A 3TNWA 2PMOX 3E92A 4XBUA 4D4VA 3LFSA 5HE3A 3ALOA 3KEXA 5BMSA 4MF0A 4IAFA 5HTIA 1YWRA 4OTHA 3C4FA 2C6EA 3K54A 4JT3A 5HE1A 3EN5A 1H00A 4ANOA 4FE2A 3ZRLA 2PHKA 1ZOHA 4C0TA 4J8MA 3TKHA 1B6CB 1FMOE 4QYYA 4ZY4A 4DHFA 5JGAA 4CZTA 4OAUC 3GCSA 2QLUA 4AT4A 4PQNA 1XBBA 2GDOA 5M4UA 3QD0A 4OTIA 5DPVA 3PG3A 2R5TA 1H25A 3OZ6A 5EKOA 4ZOGA 4EYMA 3CKWA 5M51A 3UODA 1AGWA 3GOPA 4F0IA 4QMLA 3C5UA 1IA8A 3PSDA 1CKIA 1U4DA 2QG5A 3RCJA 4RJ3A 2XKEA 4HNFA 4TWNA 2JAVA 4YC8A 3S0OA 4FKGA 3DB6A 3O50A 4FNWA 2QOIA 2VO3A 3WBLA 3TI1A 3U6JA 2JLDA 1I44A 2R3GA 3QLGA 3KXMA 3SKCA 3F69A 5BNJA 3ZDUA 5ETFA 5J9YA 2XRWA 4K1BA 2PVJA 4IAKA 4E4NA 4QTBA 3FBVA 1JQHA 2JDOA 1IA9A 5M4CA 4RGJA 3EL8A 4TXCA 3R9OA 5AEPA 1OL5A 2C4GA 3PIYA 4EC8A 4KRDA 4ANQA 5LOHA 1BLXA 2HZ4A 1E1VA 3BWFA 5J7BA 4O7WA 1GZNA 5KBRA 4L3LA 2XMYA 3MS9A 5FTGA 2DUVA 4UEUA 4QMPA 4HYHA 4M84A 1REJA 1OPLA 3ZH8A 2JDSA 3ZO3A 4FTNA 4FGRA 1PMEA 1OB3A 4ASXA 3UOHA 1NVSA 2H6DA 5FDPA 5EKNA 2FB8A 4IB5A 4J98A 3E5AA 2YLFA 3KB7A 5TKDA 3KF7A 2WMBA 3NVMB 2YHVA 4I41A 3QU0A 1A06A 5JGBA 2OJGA 4M13A 1WBSA 3T9IA 2PMIA 1J3HA 4EKKA 3DK7A 4IM3A 2C69A 1I09A 1H1WA 5CU6A 3Q04A 4GUBA 3SC1A 5HG8A 2YWPA 2P33A 5CAQA 4QPAA 3DQXA 3O17A 3CJFA 3Q2JA 3HP2A 2C6IA 3SOCA 2VX3A 5ANDA 5BVDA 2V5QA 5IZFA 2WQOA 4KNBA 4AN3A 3QQFA 4EK6A 2YZAA 5J8IA 3ORLA 2IZTA 5CXZA 3QZIA 5E92A 3JXWA 4C4IA 5EOBA 4ZIMA 4JDJA 1Y6AA 2WTJA 4KRCA 3B2WA 4G17A 4FEWA 3EOCA 4FG9A 4ACHA 5EK7A 4BDBA 3R9RA 3SD0A 5B2MA 5ETCA 4FZDB 4H1MA 4EZ7A 3UO6A 1XR1A 1YXUA 4D1XA 4FKWA 4ERKA 2VTQA 2ETRA 2GFSA 2W1DA 4G2FA 4CD0A 3ORNA 5FDXA 3QRIA 2PWLA 1TKIA 3BEAA 4JJRA 4DFNA 4FEUA 4U43A 1S9IA 3G51A 3OFMA 3WYXA 5L8LA 2CPKE 4G31A 4AZTA 5A54A 4O86A 2RSVA 3F3TA 5E8YA 2C5XA 3WILA 4CFMA 3UNZA 4BKZA 4WIHA 2PZRA 4E26A 3AT3A 4E6DA 4WRSA 5KHXA 4RX8A 3F7WA 5AAGA 2F9GA 4BWKA 2CKQA 3TDWA 2P3GX 5L4QA 4F9BA 3R63A 4QMSA 3EHAA 1WBWA 3DA6A 3KA0A 1PJKA 1Q8UA 2C3IB 3DY7A 4IAYA 4BIEA 4RA5A 1PYXA 3H3CA 2O63A 1GY3A 2G9XA 2VWZA 2YEXA 3F5PA 1XH8A 3HZTA 5IKWA 4O0WA 5C03A 4X2GA 3UVRA 5DT0A 5HNGA 3FPQA 3VQUA 3VULA 2F7XE 3S95A 5FGKA 2HWOA 4WBBB 1Q61A 4ZTNA 3OW4A 3S00A 4YLJA 5M06A 4RFMA 1Q62A 1H8FA 4PPCA 4A4LA 5K0XA 3PIXA 3OWLA 1OBGA 2OU7A 2W5BA 2JFLA 3W33A 4EQMA 4E1ZA 4HVHA 5AM7A 3LXLA 5HZNA 5BYLA 4E4LA 1JKSA 4FKPA 4PL3A 4EH6A 4DBXA 4Y8DA 4U5JA 5IQEA 3D7TA 5FBNC 2CKPA 3UPXA 4I3ZA 4IH8A 4MWHA 4FSRA 4UV0A 3R7EA 4HOKA 4D58A 3S2PA 2IPXA 3FSFA 3W8QA 5B2LA 3KK8A 3CPBA 2PUPA 3W55A 5CQUA 4QMWA 3C9WA 3PXRA 5GJFA 4D1ZA 4HW7A 4GFMA 2PUIA 2BZJA 3AT2A 1ZYLA 1XH6A 2VV9A 4KIOA 4F7LA 3S4QA 1FQ1B 2YDIA 2YIYA 2VX0A 4G1WA 4XS2A 3U55A 2XJ0A 3G9NA 2V7AA 5IDNA 1YI4A 2YM8A 4MXYA 2A1AB 3H4JA 1H28A 4TL0A 1Y8GA 1YOLA 2W17A 4Y5HA 3RZFA 4D55A 4FEVA 4DTKA 3LOKA 2QC6A 2HXQA 3BELA 3LJ1A 2QO2A 4FIHA 4JIKA 3GP0A 4QTDA 4RC3A 4OTDA 4LGHA 3TJDA 4KS7A 4A9YA 4LOOA 4CQEA 4CSVA 2X2LA 1RJBA 2CCIA 1KE9A 4M8TA 4RJ6A 3QWJA 4N6YA 3JYAA 5KBQA 3E88A 3H9FA 3QXPA 1REKA 5L2QA 3SG8A 4IC8A 5DT4A 5AA9A 3GVUA 1Q8ZA 3DKFA 3R8UA 1PXNA 4HGEA 4LMUA 4YR8A 2BAQA 3R30A 1LUFA 4O0UA 4D5HA 5M07A 1YWNA 2YAAA 4XP2A 4BGHA 3FXZA 5CU4A 1SMHA 1YOJA 3BE9A 1YW2A 4N4SA 4YHFA 3BYMA 4JBVA 4F9YA 2PVLA 2BFYA 3SG9A 4DC2A 4FV4A 4FKRA 2IO6A 1XHAA 3DAJA 3LFEA 2OWBA 5DI1A 1OKZA 4IZAA 4E6CA 4K2RA 3UG1A 3QALE 4DN5A 2VO0A 4L43A 1W7HA 4P5QA 5AP0A 4MD7E 3LM0A 3EQRA 4Y72A 1XH5A 2C6TA 2W05A 4O7RA 3FC1X 1P2AA 3A99A 4O6EA 2IVTA 3FLWA 2UW4A 2F49A 3F6XA 4C36A 3VUHA 1APME 4IVAA 3R7YA 4PUZA 2W5AA 4EJNA 1M52A 5J9ZA 3KREA 5EOLA 3QZHA 5DWRA 4C37A 3WYYA 4ITIA 4YTHA 5EM6A 1FOTA 3V5QA 4C59A 1RE8A 2YM5A 3W18A 3D5VA 3QZGA 3DTWA 4J7BA 1GOLA 4QNYA 4RFZA 4RIYA 1XO2B 4C7TA 4WSYA 2I0HA 4EKLA 3UGCA 2UVZA 2W96B 4AA5A 4DH7A 4E73A 5IQGA 5HHWA 4ZLYA 4KKGA 3HV5A 5AAEA 4BHZA 4WUNA 4MXOA 1OPJA 3LCKA 5TO8A 5IH5A 2OGVA 3TXOA 3KK9A 3PXYA 4GJ3A 4PTGA 3L9MA 4O7SA 1WVYA 3AGMA 3FXWA 3QTWA 4M14A 3VS7A 2UZEA 4TPTA 2XK8A 2C6DA 2CKOA 5E8SA 3SGCA 2G01A 4DGGA 4AQCA 3HV3A 1O6YA 3EQDA 1NY3A 3UE4A 5CNOA 4I0RA 4JAIA 4BCJA 3ZXTA 2XK4A 1ERKA 4O84A 3OD6X 5IQHA 2JAMA 2B53A 3TV4A 2RGPA 2BR1A 3O8UA 3VAPA 5F95A 2J51A 4Z9LA 4PP7A 4IIRA 5HTBA 3DXNA 4BR3A 1M2PA 4NUSA 3F5UA 4KWPA 5LMKA 3DNEA 4YMJA 5L2TA 4F99A 4C58A 3BBWA 2QKWB 1ZY4A 3CS9A 3R2YA 5T3QA 3KXXA 3Q6WA 1FVTA 2F57A 4ZMEA 4AE6A 3UZRA 4BDIA 1YDSE 3CTJA 4EHEA 3DBFA 5FLFA 4EH2A 3NNVA 4ZSAA 4WNPA 4FKQA 1VJYA 5CEPA 5E91A 3K3IA 1U5QA 4IEBA 4ACDA 4D2RA 5BVEA 2WKMA 5CVGA 4BCMA 1OIRA 3BGQA 1OIYA 3TNPC 3ZSHA 5J87A 4WHZA 4IW0A 1P4OA 2BTRA 2WMAA 2OH4A 2ITTA 2CGUA 3NDMA 5JMSA 3MESA 3VUKA 5E8XA 3ORMA 4K8AA 4APCA 5TE0A 3DBQA 4IVDA 4IWPA 2G2HA 4AOTA 4FZ7A 2VTPA 4PF4A 2JFMA 2QODA 3R8VA 2HW6A 4ANMA 3QYZA 3LMHA 4YGAA 3EYHA 4IWQA 4I6QA 4XUFA 3PVGA 4GEOA 1M17A 1F0QA 3VVHA 4XMOA 4IADA 3DKGA 4FK3A 4KBCA 5A4CA 3ACKA 2PVYA 2GMXA 4RWKA 3B2TA 2WGJA 3BHTA 4LI5A 4MX9A 3ZLYA 2VTRA 3UDBA 1OI9A 5IPJA 4I24A 1URWA 2R3NA 4BI1A 4CMUA 1ZYCA 2BMCA 3HUBA 3R1NA 4OBPA 4U0IA 3DDQA 2BDFA 5E8WA 2X6EA 5C26A 3SW4A 4L3JA 4ZLZA 2RG6A 4PDYA 3VUDA 4I21A 5BYYA 1H1QA 3GC0A 4CLIA 4RVTA 2PMLX 1W98A 2XK9A 2P55A 3WARA 4L44A 3TIYA 4RZVA 4ERWA 2BRMA 3BBTB 4MKCA 4YBKA 2P2IA 3ATTA 4ZEGA 3AXWA 2ZDTA 2X9FA 2WIPA 2X2MA 4GSBA 3WIGA 2VO7A 4USEA 3GUBA 4RJ4A 3I79A 2CJMA 1GAGA 4U42A 2C5YA 5AUZA 3TCPA 2WU7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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