4KBKA

Ck1d in complex with (3s)-3-{4-[3-(4-fluorophenyl)-1-methyl-1h-pyrazol-4-yl]pyridin-2-yl}morpholine inhibitor
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
291
structure length
283
Chain Sequence
LRVGNRYRLGRKIGSGGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ligand-protein interactions of selective casein kinase 1 delta inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
total genus 95
structure length 283
sequence length 291
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4kbkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4kbkA01
1YOLA 2JEDA 4EOMA 4K0YA 5CI7A 3WE8A 4BTFA 5HX6A 3D5XA 3HMPA 4RA5A 1T46A 3Q5IA 4FBXA 5IDNA 1RW8A 4RX9A 3T8OA 5CU2A 1F5QA 2PUIA 1Q99A 2BTRA 3P9JA 2WTIA 3UQFA 1U4DA 1HOWA 5LWNA 1J7UA 2WQOA 1PJKA 3EIDA 3A7GA 3RWPA 2XYNA 4CFXA 3FHRA 4FTQA 2EB3A 4S30A 5FM2A 2FSLX 4AZTA 4EC8A 4KABA 3FSFA 5IEYA 4W8EA 4RIWA 2BROA 2PYWA 3P78A 4AGUA 1KE6A 1SZMA 3R8PA 3ZFXA 2HW7A 4UYNA 4A9YA 4YJSA 2HXQA 4FG8A 4PL3A 3RCDA 4DC2A 4TWNA 2WEVA 2R5TA 4EKKA 3P4KA 2ZV8A 2X39A 4LRKA 4NK9A 4NZWB 3NDMA 3SV0A 3VS2A 3R22A 3ZOSA 2GQSA 2UW3A 2NRYA 3JXWA 5AP7A 4D28A 3VUHA 1NVQA 2WTKB 3QQLA 2HELA 4PPAA 4Q9SA 3F2NA 5CU3A 5JSMA 4OTPA 3G6GA 2ZV9A 3R63A 4PMMA 3RWQA 3BCEA 1OVEA 5LCKA 4QMSA 2PVHA 2YA9A 3CTHA 4QP1A 2GFSA 4FZ7A 3RHKA 1OKYA 3OROA 5J9LA 3PJ8A 1PXKA 4W4XA 4IAKA 4BKJA 3R9RA 5J9YA 4MCVA 3C0HA 4CFUA 3ACKA 1JOWB 1H08A 2VTQA 3PDTA 3HDMA 4U40A 5DRBA 5J7HA 2QKRA 4LL0A 4Y72A 3SW4A 1WBSA 5IEXA 1Q97A 2WMSA 4G3FA 2Y9QA 3QLFA 3F61A 4IZ7A 1OUYA 4JLCA 3F3TA 3GC7A 4BWKA 4D5HA 5KKRB 3QCYA 4IC7A 3V3VA 2ZJWA 4RT7A 5H8GA 4ANSA 5IUGA 4J71A 1JVPP 1TQPA 3RVGA 5JFWA 3Q60A 2QVSE 4KS7A 4PL4A 1XBBA 4C3RA 3UP7A 3AD6A 5DR6A 5M44A 4FEXA 4FKUA 2WEIA 4GFOA 3SA0A 4AT4A 3U54A 5IMXA 4BCIA 2HXLA 1U5RA 2XM8A 4LGGA 3EYGA 4AZVA 4CMOA 3H0ZA 1BMKA 4V04A 1WBVA 4D0XA 5F9EA 5HLNA 4FZFB 4K8AA 4UXQA 4CFMA 1M2PA 4Y83A 3UVRA 4IFGA 2R7BA 3IW6A 2UUEA 2C6TA 3VBTA 4I6QA 1YXVA 2YZAA 2QO9A 2VTRA 5K9IA 2P55A 5K5NA 4A7CA 3LW0A 3VO3A 2IWIA 4AU8A 4BKZA 5EK7A 2W4JA 2HZIA 2IVTA 2YCSA 3EQGA 4GL9A 5D7VA 5IDPA 2ZV2A 4BYJA 5IQAA 5CEQA 2Y7JA 3TKHA 4MF1A 4FOBA 3DBQA 3ORTA 5DFPA 5LQFA 1SYKA 3ZBXA 3LCTA 3UYSA 3WF9A 4C58A 3ROCA 3GUBA 4FOCA 3K2LA 3U9CA 1UU8A 1H8FA 2VX1A 2YHVA 3MPMA 5IPJA 3DV3A 3RPSA 3LFNA 2WD1A 4XEYA 4EOLA 3DLZA 4EL9A 5FBNC 3UGCA 3GU8A 4LL5A 4FA2A 4FV3A 2Q83A 2ITQA 3NUYA 3OY1A 3JY9A 5FG8A 3OWLA 3DCVA 4ZJIA 4GJ3A 1J7IA 3FXWA 2E9NA 3KCKA 3PG1A 3Q32A 2UW4A 4O21A 5CI6A 4HYHA 2JDSA 4MXOA 3V8TA 5HIBA 5KMLA 3SX9A 1FVVA 4XG4A 2KTYA 2I6LA 5DEWA 3HRCA 3BHTA 3DPKA 3NUXA 4DT9A 3UODA 4E5WA 4RWLA 3P5KA 4XG3A 4RZWA 5F95A 3QWKA 4CQGA 5IH6A 1R3CA 1TQMA 3NGAA 3TZ7A 3QTSA 4X3FA 2GHMA 3T3VA 4J95A 4BICA 3MA6A 4FVRA 5HI2A 1Q41A 3M2WA 2IW6A 4YC8A 4BDDA 3FXZA 4DYMA 5L8KA 2XJ0A 4FMQA 4JRNA 2X4FA 4JDKA 3SOAA 4FZ6A 2BRMA 1OI9A 3R8ZA 2IZRA 4AAAA 4ANQA 1M17A 4EH4A 3RAIA 3PIYA 4WSQA 4JQ8A 1W98A 4IBMA 3RPOA 4DFLA 3F3VA 1NVRA 4UMTA 2JIIA 3VBXA 4DEEA 4I0RA 4TY1A 3VNTA 3L8VA 1APME 3D14A 3MH1A 1KSWA 4E4XA 3HA6A 4FTAA 3IOPA 3NNXA 5HNGA 5T68A 1QPEA 4E4MA 3RK5A 3SG8A 2QHMA 4EH9A 1SVGA 5ANJA 5JZJA 4XX9A 3KN6A 2DUVA 4IM0A 4RBLA 4ZZMA 2Y4IB 3KREA 2R3RA 4C3FA 5FDPA 2OZAB 4D0WA 2G2IA 2OKRA 5HE3A 3W32A 2OI4X 3L9NA 4HVIA 3HAMA 3V5LA 4C57A 4AACA 2X81A 2OICA 3UPXA 3GC9A 5FEQA 2B0QA 3HV7A 3OEZA 3S95A 3GB2A 3FV8A 4M0ZA 1MRYA 2W1HA 4RVLA 1H1SA 5GJDA 2PUNA 2BRNA 3E8NA 4RG0A 4F4PA 1REKA 2ZYBA 3WBLA 1P5EA 2PVKA 2W06A 3MWUA 4NU1A 4C33A 4DEDA 2GDOA 2C30A 4NW6A 4YO6A 5BMMA 3KMMA 3DU8A 3OWPA 2JDOA 3QCQA 5L8LA 4O7TA 4BCGA 1FGIA 3QALE 4ZP5A 1GAGA 4X0MA 3QU0A 3GGFA 3Q6UA 3WYXA 5AMNA 2WMQA 3OEFX 4FSQA 4E26A 4NYEA 2XMYA 2JBOA 3R9NA 4LUEA 3KL8A 5KZ0A 5IEVA 3QD3A 1GZKA 1LP4A 5C8KA 5HVYA 5M56A 4KSPA 3UPZA 2ZMDA 3KMWA 3ZO2A 2R2PA 3R2BA 4S2ZA 5E8TA 2V7OA 4NTSA 5J8IA 1L3RE 3KRJA 3A61A 4QMTA 2YWPA 5EYCA 5B2KA 4Z7HA 4FKPA 4WNPA 4PTGA 4X6RA 4ACCA 4FL2A 2JKOA 2XKDA 1JSVA 1UKHA 2UW8A 2WTJA 2VWIA 4FTJA 2OJIA 4O0TA 5CAOA 4F1TA 3OXZA 3ORMA 5CWZA 4M13A 5KO1A 4II5A 4XH6A 5L4QA 2YLEA 3QRKA 4TPTA 2QO7A 2CSNA 3FQSA 4I5HA 2AUHA 3R8UA 3ZLWA 4Z16A 5CAQA 3N4UA 4BI1A 3SRVB 4BTKA 4EOSA 5HTIA 3CQWA 2YM4A 3QQFA 1H27A 5CEMA 5HVJA 3CTJA 3R7EA 3R8LA 2O64A 2B1PA 4DF3A 5G1XA 3ZUTA 1WBOA 2NPQA 4I6BA 1BLXA 3NUNA 4P90A 4IZAA 5GNKA 4DFBA 3OFMA 4QQ5A 3UOLA 3OBGA 3ODZX 3CD8A 5D11A 2JKQA 4U3ZA 2JFLA 1O6KA 3ORPA 4O0VA 3VUKA 4JR7A 4DGNA 5IU2A 5C4LA 4RVKA 4YTFA 1OL1A 4OTQA 4L67A 3NVKI 1GOLA 1OGUA 2W1DA 4NWMA 4EOPA 5IQBA 3EB0A 3BGQA 4EOOA 5I0BA 3U6JA 4CMUA 2XNNA 3QD0A 4A9TA 4FKIA 5AAFA 2V62A 3MDYA 4YJPA 4TYEA 4C3PA 5E90A 3DTWA 2XK4A 3OTVA 4ONAA 5AUXA 2GU8A 4I20A 4HVHA 4DT8A 2QOIA 2X8IA 2XUUA 3DK3A 4QMLA 5FD2A 3MBLA 1UNHA 3OC1A 4BZNA 3SVVA 5FDXA 2PK9A 3PVBA 3LFBA 1MQ4A 4DCAA 5AA9A 2Z7QA 3KVWA 3K5UA 4F0FA 4PP7A 4GKHA 4CKIA 4EQMA 4CLJA 3LXLA 2KULA 4GVJA 2ERZE 4F65A 3PJ1A 4N70A 4P2KA 3RNYA 5LVMA 3BGZA 3ANQA 2JBPA 3BLRA 4EYJA 4KAOA 1ZMUA 5LMKC 4IFCA 4UYAA 4FKSA 5DBXA 5IA2A 3RM6A 1JPAA 3LHJA 3PZHA 2H6DA 3H3CA 4G6LA 3BGPA 3M1SA 4J96A 4D9TA 3LFCA 3ZO1A 4E3CA 4YPSA 5HBJA 3ZS5A 3ENMA 4FGRA 4UV0A 2GCDA 1Y8GA 1VR2A 4L53A 2EXCX 3VUIA 3T9IA 4C4GA 5KMIA 3PFQA 2UW5A 4N6YA 2OJGA 3TI1A 4IDVA 4NT4A 1QL6A 2Z7RA 3C7QA 4QP3A 1P4FA 4RSSA 3AQVA 2WTKC 3QGWA 4FSNA 1JKKA 3RAKA 2C5YA 4FT3A 3VRZA 2GNFA 2RIOA 5DN3A 4UBAA 2VTAA 2J0KA 3DQXA 3O7LD 4FT7A 4FTIA 5DH3A 4C59A 2YM5A 2FYSA 3HUCA 4TNBA 3IPHA 4LOQA 4BCNA 3LFEA 1VYWA 2UZBA 3H0YA 2ETMA 2JGZA 3OUKA 1WCCA 2O5KA 2Y8OA 3Q2JA 3JR1A 2CMWA 4USDA 2BZJA 4CG8A 3ATSA 5KKRC 2EWAA 4E1ZA 3COIA 3G9LX 3LJ0A 3R7VA 3F5UA 3F3ZA 1CDKA 1GIJA 4L6QA 1WVXA 4CXAA 1XKKA 2B55A 3TIZA 5LCJA 4QMMA 5AV2A 5HCYA 4APPA 4QQCA 4BIBA 4N57A 2BKZA 3NYVA 5B2LA 3BBTB 3CD3A 3RCJA 3ALOA 2WOUA 3R01A 4D2PA 2WMWA 3ID6C 4OBPA 1PW2A 2ESMA 2VU3A 2GS2A 2W5HA 3ANRA 4FK3A 1UU3A 3RAHA 5HNIX 4BIDA 3TZMA 3BYUA 1QPDA 1XHAA 3SXSA 5I9YA 1GIIA 1YXUA 1MRVA 3QZGA 2VWZA 3CKWA 2C3JA 3RINA 2A0CX 2XS0A 4NFNA 4FV1A 1W82A 2XJ2A 3WI6A 1RJBA 2YIYA 5C27A 4UMQA 2GQGA 4BL1A 4X2JA 5HQ0A 2VTOA 3NPCA 3KEXA 2VTHA 4ITJA 5AV1A 4XBUA 3A8WA 4FKTA 3V51A 2PMOX 4OTDA 2A1AB 4M67A 4PUZA 3DXNA 1A06A 4RLLA 2OXDA 4QTDA 1PXLA 5FP6A 3D5VA 3DAKA 4DFNA 3TKUA 1DAYA 1VEBA 1H07A 4GJ2A 3C0IA 4HOKA 3UMXA 3RNIA 3Q9YA 4RMZA 4YO4A 3UIMA 3OTUA 4XOYA 1YRPA 2QR7A 1GZNA 3PIZA 4FTUA 3TNIA 4IB5A 3FLZA 4QTAA 5FEDA 3VBVA 4YJVA 4IANA 1OPKA 3GC0A 4GT5A 4W4WA 3TKIA 2IPXA 2C68A 5CAVA 2W9ZB 5TR6A 3C4EA 3OW3A 4IB3A 5HVKA 5M07A 3LZBA 3UP2A 3O8UA 4BWPA 1SVHA 3VBQA 4PNKA 3MSSA 1H24A 2F9GA 4EOQA 4FL3A 4YNEA 4QTEA 2DQ7X 4MWHA 2W99B 5BVWA 5CF5A 2XNOA 2C5OA 4Z3VA 4HCTA 1R39A 3SXFA 4IAFA 4O0XA 4F6UA 3WZEA 4ZLOA 4O7VA 3EKNA 3OOGA 3OP5A 3C5IA 4B4LA 3UTOA 2CGUA 3VS3A 2VTSA 5CEPA 4ZMFA 1YQJA 4QYEA 5M09A 2QC6A 5CSHA 3UVPA 3EZVA 3GEQA 5CY3A 5CNNA 4FODA 3NW7A 4EOKA 4D9UA 2ZB1A 3KK9A 5CAPA 2B9HA 3PSBA 1BYGA 3FZOA 3FJQE 3KF7A 5EW3A 4NSTA 4GS6A 2GPHA 4CMTA 2A19B 3PTGA 4JDIA 5AR2A 3R00A 2YJRA 1MQBA 4HPTE 5KMJA 1H00A 2WTDA 4DE4A 3EYHA 3WE4A 3QQJA 3FLNC 2W17A 3KA0A 3PJ2A 4DG2E 2FO0A 2OBJA 2Y4IC 2QONA 4C4EA 5I5ZA 2OLCA 4GYGA 4FT9A 5TOZA 5GZ9A 3BWJA 3VW8A 2W5BA 1PHKA 3D5WA 3KXGA 2G2HA 2PVNA 4IAIA 4FVPA 4PMTA 2GHLA 5J9ZA 4TWOA 4IVDA 4CFWA 4DA5A 3FZPA 2V7AA 2WELA 2XNPA 4I6FA 5TKDA 5EYKA 5IQIA 4CKJA 4PTCA 2GNIA 3COHA 1Q61A 4X3JA 3M42A 3RP9A 1OPLA 4NTTA 5AAGA 4A06A 1L8TA 3I7CA 2ZOQA 3MVLA 4MD7E 4JG6A 3R7YA 3CPCA 1BX6A 1O9UA 4C4FA 3GVUA 4FEWA 4O7YA 2F7EE 3GCSA 4O1OA 3PLSA 4AFJA 2PVJA 4IWDA 4MTAA 2OIBA 3DKCA 3Q04A 4L68A 3MY1A 3W8LA 5JRSA 4L3JA 4P7EA 3C5UA 4QYYA 4WUNA 5AWMA 3ALNA 4X2NA 3ETAA 3HL7A 1CKIA 4FIFA 4TZRA 4XOZA 4XP3A 1Y57A 1OM1A 4YBJA 3KXNA 3QTQA 4XV1A 2PMLX 3F5XA 2E9OA 3FMDA 4F70A 4RPVA 1P4OA 3W2CA 2VO7A 2QU6A 4P4CA 1J7LA 4FNWA 2QOBA 5AUVA 4ERWA 3MH0A 3PVGA 4ASEA 1R0PA 4L7SA 2PY3A 2UVZA 3HV3A 3ORLA 4QPSA 2BZKB 4FZAB 3TTIA 3ZO4A 4LQMA 5DEYA 4M69B 5FRIA 4GK2A 4EJNA 2WQBA 4I1ZA 2RG6A 1B38A 3CP9A 2GS7A 4YLLA 4ZS4A 5IQDA 3QZHA 3PE2A 4IJPA 4RX5A 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