4L3LA

Crystal structures of human p70s6k1 kinase domain (zinc anomalous)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
KIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAMIVRNAKDTAHTKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESIHDGTVTHTFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of S6K1 provide insights into the regulation mechanism of S6K1 by the hydrophobic motif
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords RPS6KB1 protein
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4l3lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4l3lA01
3FPMA 4QP6A 1CKIA 5LVLA 4BGHA 4IFCA 5CSWA 3O2MA 2JDOA 4K1BA 3FLQA 3EFLA 4RFYA 3RHXA 3TV7A 4E4MA 1KV2A 2QODA 2XH5A 4XG3A 3PYYA 3ULIA 5TKDA 3U6IA 2Z7RA 3OXTA 3PSCA 4LGGA 4WNPA 1B39A 1OKVA 2B55A 2X2KA 3MFRA 3R22A 2VTTA 4KIKB 3V5PA 4APPA 1J7UA 3UIUA 3JR1A 3EN4A 3L1SA 4G5JA 2WMXA 2YAKA 3GNIB 3W2OA 4M67A 4YJTA 4HNFA 3ENMA 1DI8A 4BHZA 4GV1A 1Q62A 2WXVA 3OBGA 3UG2A 4E4LA 5J7BA 1DS5A 2BCJA 4XV9A 1ZLTA 4JIKA 4L8MA 1TQMA 5IH5A 2PVHA 1ZYDA 4MBIA 4U7ZA 1IG1A 3FHRA 1QPCA 2JD5A 3ITZA 4IVBA 4DFBA 1IA9A 1OKWA 4Y85A 3FY0A 1Z5MA 3ORKA 4XX9A 2Z7LA 3TZ7A 2GS2A 4MQ1A 2EUFB 4MXOA 3MTFA 4EOLA 2CKOA 4QMOA 3KKVA 3SLSA 2YJRA 2UW5A 2I0HA 4CV9A 2UZBA 4DGGA 4L52A 3F5XA 4E6QA 3IKAA 3CR0A 4LOOA 4FKVA 3EHAA 1CTPE 4X2FA 3UQGA 2E9OA 3D7TB 3FL5A 4PL3A 2RF9A 5KCVA 2FSTX 4U45A 3BYUA 4JVGA 3V5TA 2BPMA 2VZ6A 1SZMA 3R1YA 3COIA 1Q3DA 4HNIA 1UWJA 3PUPA 4EQMA 3KXXA 5J7HA 4YTHA 1W0XC 2Y6OA 4QMUA 4XS2A 4PDOA 3DB8A 4EH7A 4EKKA 5CAPA 5AUXA 3PXZA 5BUEA 5HHWA 3QF9A 4U42A 4FSQA 1TKIA 4E3CA 5IZFA 4XLVA 3LMIA 5B2LA 3NAYA 4CFNA 2R7BA 1IEPA 2DYLA 2F49A 3AT3A 3KRXA 5AUYA 4UZHA 4F08A 2H6DA 2YWPA 4HGTA 2YIYA 4JL9A 5CU6A 4ZK5A 2ONLA 4FKSA 3OXIA 4Z16A 3U87A 4JQEA 4O7WA 3M11A 4FIJA 4FTRA 2HWOA 2C3LA 3QYZA 1YDRE 4D55A 3CGOA 1M52A 2R5TA 3R1NA 2GDOA 4QYEA 2XKDA 3HRCA 1X8BA 2XCKA 3I5NA 4CRSA 4DFUA 2VTAA 2YM8A 5LMAA 3BCEA 5EW9A 1Q8ZA 4EOMA 5F9EA 3ORIA 3WZKA 1KV1A 4D2PA 3Q53A 3VBQA 5L6PA 5FEDA 3R7YA 1PMVA 5EDQA 5IH4A 4ZZNA 2F57A 1I09A 5FP5A 1R1WA 2C47A 2ITNA 2QU5A 2OH4A 3IGGA 4JLCA 4AW0A 4GKIA 2XIRA 3PXFA 4YLLA 5FM3A 1GZKA 4B0GA 3HV4A 4UX9A 1NT2A 2ERZE 5GIOE 1W8CA 2BKKA 3FSKA 1PXIA 4NH1A 5B0XA 4E4XA 3TCPA 4O7LA 3TIYA 1JAMA 4AOJA 3SGCA 4D2SA 5HE2A 4G6LA 2FA2A 2J6MA 1S9JA 3PXRA 2JKOA 4P2KA 5D12A 3D14A 2QG5A 3E3BX 4CV8A 3G2FA 3R00A 4QMPA 2WTCA 3DAKA 3R7UA 2DS1A 1NXKA 4MNEB 3KXNA 3MYGA 4CTBA 1Q8UA 5KMLA 4FIFA 3QTIA 3BIZA 4DFNA 5CLPA 3U9CA 1MUOA 2JBPA 3FXZA 3V51A 4D58A 4FEVA 2W99B 4CYIA 5JQ8A 5K5XA 4ANLA 4USFA 5E4HA 1FQ1B 5HTIA 3BQRA 2VO3A 4M66A 3CLYA 4RG0A 3PLSA 5BPYA 2PVMA 2VUWA 4G3FA 4C37A 4TYHA 2CLXA 3VF9A 5J9YA 2X9EA 2WU7A 4IHPA 1WBSA 3D2IA 4XP2A 5DNRA 3ROCA 4JRVA 2EXCX 2JFMA 3D0EA 3DNEA 5E8WA 4ANSA 4ZAUA 4UALA 5EM7A 2RG5A 5B2KA 2W1DA 2I40A 5AAGA 3KULA 4QMWA 1WBOA 3PPJA 3MPTA 2WQNA 2IO6A 2R3PA 2C5YA 3VAPA 2F2CB 1OIQA 2P2HA 4MXYA 3CIKA 5FD2A 5BYYA 4UBAA 1JSTA 2PU8A 4FKGA 1GNGA 4RJ6A 3TXOA 3FEGA 1P4OA 4AGWA 2JKQA 4FOCA 5KBQA 1OPKA 3ZOSA 4DH3A 4YZNA 5IQBA 4DT9A 2JAMA 4LGDA 4EOOA 1VYWA 5AV3A 1KOAA 1UNGA 1Y6BA 4GCJA 4GU9A 2I0YA 2KULA 4MNFA 4MXZA 1PKDA 4HPTE 2QR7A 5TE0A 5ANDA 3BZ3A 4YC3A 4HGLA 2GS7A 2RKUA 4QMMA 1V0OA 3MH1A 4YJUA 4BBFA 4E7WA 4S34A 3DFCB 2BRGA 4L43A 4BRXA 5DIAA 4JJRA 4O0YA 1CSNA 5FEEA 3GC0A 1B38A 5EQEA 2CCHA 4O22A 3MB7A 5L2QA 3AC5A 5JZJA 4XP0A 4WUAA 5AX9A 4XUFA 4QTAA 4UEUA 4DEHA 4RIWA 5LCJA 4I3ZA 3OWJA 4G6NA 5DPVA 5M55A 4XG4A 2HZ0A 4YZ9A 2OF2A 2IW6A 2YCFA 1Z9XA 2OICA 2Z8CA 5AP6A 4ZJJA 4BZOA 1BUHA 4CRLA 5JFSA 2Z7SA 5JSMA 4F63A 3LLTA 3U51A 4DFYA 4F9CA 3PJ3A 3O8PA 3BU3A 2JKMA 1UU7A 2I6LA 5FWKK 2BZIB 2PMLX 2C68A 5HG7A 2WIPA 3AGMA 3QLGA 5EKOA 3IW5A 5EK7A 2PULA 5AR7A 4D9UA 5LVNA 5IF1A 3DU8A 4MHAA 3R8LA 5L8LA 3UBDA 3R8MA 2OZAA 1R39A 4EKLA 4BCHA 4I21A 3L8VA 3IDCA 2BVAA 3Q9ZA 3CE3A 3ORNA 4FSTA 2X8EA 3FLZA 4V0GB 5HEZA 5HQ0A 2YERA 3CBLA 3PY0A 3T3VA 4M8TA 4KNBA 5AR4A 5IMEA 4BDBA 1Y91A 3RALA 4C3RA 3P7CA 5H8GA 4M12A 4F0FA 3BYMA 4PDSA 2J0MB 3M42A 3R21A 2VO7A 3R8ZA 3DAEA 2ZMCA 3VHKA 5E92A 1OIRA 3IGOA 5BQ0A 4GFMA 4KKEA 4ACHA 3TNQB 2X7FA 4W4VA 5D1JA 4EQCA 3OUKA 4BHNA 2UUEA 4W4YA 2IJMA 5L2TA 3GB2A 3TNPC 4MK0A 4NWMA 3NUUA 4FNYA 4BGQA 3ZSIA 4RT7A 4FV3A 5ACBC 3Q4ZA 3HV7A 5ANIA 4EQUA 3IW8A 4FTAA 2WTDA 3B8RA 4O0TA 5K0KA 3MBLA 3OWKA 5F94A 2YIXA 2QR8A 4YZBA 2B9FA 3KMMA 4CLJA 3Q2MA 2W4OA 4TWPA 3R28A 3UIBA 3VNTA 3KXHA 3GOKA 5JRQA 4MF0A 4QMZA 3AD4A 4FV8A 3RBWA 4EOJA 2HY0A 4XG6A 4UN0C 3LPBA 3BGPA 5C26A 3U55A 3IW6A 3R63A 4EK6A 3LVPA 3R7OA 3FZTA 3ORLA 4I0RA 4M7IA 4OTHA 2OJFE 3UTOA 3HAVA 2YABA 2IG7A 1BI7A 5A4EA 3D9VA 3TG1A 4DE4A 3TNHA 1QMZA 2X8IA 3GU7A 4BR3A 2BRHA 1RDQE 2IWIA 2OSCA 3ZLSA 3QD3A 4HPUE 4KINA 1GAGA 4RJ7A 3W2PA 4EH6A 3E64A 4AW1A 4FK6A 2WELA 4FTNA 4YZDA 5DG5A 1PF8A 2W5AA 2P33A 3CKXA 2BIYA 2VX1A 4NIFB 4U43A 4XG7A 4AGDA 5LXMA 2PUNA 4C2WA 4DTKA 4FTMA 2Y4PA 3FMJA 4U8ZA 4XP3A 5FDPA 4DA5A 4XHKB 3W1FA 2YCRA 2W05A 3FI2A 3Q52A 4M13A 3H9FA 3LQ3A 4KIQA 3KF7A 3FJQE 3ZS5A 4F64A 4CKIA 4II5A 2C3JA 4RPVA 4WNMA 3FLWA 3UNZA 1XO2B 2DQ7X 2QC6A 5J1WA 4RA5A 1DAYA 2QKRA 2XKFA 3O0GA 4F9WA 4DF3A 3V8SA 2EXEA 3BHYA 5L8JA 3SKCA 3PPZA 5B2MA 4FC0A 3QZIA 4F1OA 3UNKA 2EB3A 4O6LA 4IAZA 1R0EA 3ZBXA 2O2UA 3SXRA 4YJNA 3QYWA 4WO5A 4CZUA 3G15A 3PY1A 5AP2A 4RX5A 3MPMA 2G2IA 2OGVA 2J4ZA 3F2RA 3OC1A 3PVGA 4R3PA 3O23A 2QLUA 4HZRA 3EQIA 4WBBB 4FTTA 5GZAA 4NKSA 4UY9A 3RPSA 3FBVA 3HEGA 5KMNA 2X2LA 3UOJA 2P55A 2J0JA 2VTPA 3UVPA 2JC6A 5HNBA 1PMEA 3A4PA 2VTIA 3FMLA 2ZYBA 5CVGA 3WOWA 3KC3A 4C57A 4OR5A 4S33A 3LW0A 3QQHA 4PP7A 2W4KA 2B9HA 2F7XE 1W84A 4RIWB 3NVKI 4M0ZA 3RPRA 2X9FA 1H27A 1YXXA 2BRNA 5LOHA 2PZIA 3DXNA 2W1EA 4PX6A 3GFEA 2XK6A 4FX3A 4I20A 4KKGA 3PTGA 4RLLA 2QD9A 5HE1A 2BDFA 3PJ1A 4O27B 4IX6A 5LARA 3V5JA 1VR2A 3ODYX 2FB8A 1Y8YA 4FYOA 4ACDA 3I1AA 5IUHA 5TOZA 5HLPA 4L7FA 4ALWA 2PVLA 3TZ9A 4HCTA 5HO6A 1VYZA 5K4JA 3RGFA 5TO8A 3U8WA 1GIHA 4E5AX 3TT0A 3A7IA 5DH3A 4BDCA 1OZ1A 5A4QA 5EQPA 3F5GA 4C61A 1ZZLA 4FL2A 5BMSA 5HU9A 2ZM4A 1UU9A 4LM5A 1OL1A 4JT3A 2BZKB 2YA9A 2XF0A 3D83A 4ZOGA 4I24A 4NSTA 3JXWA 4YJRA 3E8CA 4KWPA 3TL8A 2XK8A 4FBXA 3FAAA 5FTQA 2X39A 4O0VA 5AP1A 1P14A 4EOQA 5LMKA 1ZYSA 1L3RE 2H9VA 4R7BA 2YM3A 3PXYA 2OF4A 4R6VA 4NW6A 3NNVA 3QALE 1H01A 4F1TA 4TYEA 5B7VA 5HO7A 3CQWA 4L9IA 4IQ6A 2WEIA 2WU6A 2ZV7A 4L53A 2BUJA 4YHFA 3FZRA 4MH7A 4FSMA 4QYFA 3CPCA 2V7AA 1OL5A 3QTZA 4IB1A 4JAIA 4MWIA 5FQDC 3HUCA 1LEWA 4OBPA 3QHRA 5DRBA 3OCBA 4U79A 1YXUA 4O0SA 3EYGA 2GNGA 4NM7A 3R8UA 1HCLA 2C6IA 2VU3A 4AA0A 3D5WA 1XH9A 3TNWA 4RRVA 3NYOA 1PY5A 3E7VA 2PL0A 4ZY5A 2IZUA 1A9UA 3KXMA 3QQUA 2J0LA 4LUDA 4RA4A 2AUHA 4I93A 3RZFA 4I4EA 3E92A 3VUMA 3CKWA 2OH0E 2XIKA 5I5ZA 2IVSA 3PXKA 4FIHA 2GNJA 3KRJA 4FKQA 4Z9LA 4EWQA 5IG1A 2C5VA 3IG7A 4K77A 5GJDA 4IDTA 3DXPA 3ZLWA 1UKIA 2G2HA 4UWYA 3ULZA 4BIDA 3QC4A 5HICA 3I6UA 4YUQA 3OT8A 2QVSE 2OIQA 3K54A 4B7TA 5LJJA 4IAFA 3BV2A 2E9VA 5IA4A 4HOKA 3NCGA 2OJ9A 1Q97A 3AMAA 5IPJA 2HZ4A 3NW7A 2CNUA 2XKEA 4JBOA 3CD3A 4YHTA 3WILA 5JFXA 1YDTE 2UZWE 4XBUA 3RZBA 4BI1A 3MIYA 5HE3A 3SXSA 2JFLA 1AQ1A 2C3KA 1BLXA 3EQPA 4JR3A 3RK7A 3QUEA 2YZLA 3T3UA 3PVWA 5ETFA 1O9UA 3W2SA 4C4FA 4DBXA 4FEWA 2UW4A 5E1SA 2ONLC 2QOKA 4H3BA 3CY2A 5HVKA 3EYHA 2HY81 3ELJA 4UMQA 2R3MA 4RBLA 3BE9A 2YIRA 5EYDA 4DT8A 4XV1A 4KKHA 1K3AA 1ZARA 5HLNA 1H4LA 5AA8A 1OECA 2GHGA 3ZEPA 5A3XA 3RJCA 2UZVA 4TYGA 4AT3A 2CJMA 2ZAZA 2W1HA 3RPVA 3UIXA 1AGWA 4FL1A 3DOGA 5GJGA 2RL5A 5CY3A 4CFWA 3VUTA 2GMXA 2IVVA 3QGWA 4AXAA 4BKZA 5CQWA 3ZLXA 4PTGA 5AADA 2I7QA 4BDHA 4X2KA 4Y83A 4F7NA 5C4KA 4L44A 4OAVB 3QZHA 3RCDA 4P7EA 3C0IA 3H3CA 2WO6A 5JGBA 2R0IA 1RW8A 4BF2A 2W9FB 4S2ZA 4QOXA 1FGIA 4XV3A 2OFUA 2PVYA 4NT4A 4FNWA 5KZIA 3VUKA 4ACCA 3VUDA 3DLSA 4FL3A 3KA0A 4LV8A 1BX6A 4EH8A 4MXCA 2OI4X 4AQCA 5HGIA 1QPDA 1XQZA 5GZ9A 1ZOHA 5DA3A 4FG9A 4UYAA 4ZS0A 3N51A 4HGSA 4FGBA 2Z02A 4O7SA 3MA3A 4WBOA 3RP9A 2C5OA 3U4UA 4Y72A 4EOIA 3I5ZA 3SRVA 4Y73A 3K5UA 2WQEA 3ALOA 3GC9A 4IZ5A 5J95A 4M3QA 4TY1A 4BWKA 1SNXA 3LCOA 2ZDTA 4ZTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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