4M69B

Crystal structure of the mouse rip3-mlkl complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
277
structure length
264
Chain Sequence
QIKEIPKEHLGPPWTKLKTSKMSTIYRGEYHRSPVTIKVFNNPQAESVGIVRFTFNDEIKTMKKFDSPNILRIFGICIDQTVKPPEFSIVMEYCELGTLRELLDREKDLTMSVRSLLVLRAARGLYRLHHSETLHRNISSSSFLVAGGYQVKLAGFELSKTQNSSSTIYVSPERLKNPFCLYDIKAEIYSFGIVLWEIATGKIPFEGCDSKKIRELVAEDKKQEPVGQDCPELLREIINECRAHEPSQRPSVDGILERLSAVEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Insights into RIP3-Mediated Necroptotic Signaling
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/signaling protein
source organism Mus musculus
molecule keywords Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3
total genus 79
structure length 264
sequence length 277
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4m69B02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4m69B01
2CKQA 4H58A 3BV2A 3CPCA 4I92A 3DV3A 4QMMA 3VBQA 3A4PA 2OJIA 5IQAA 3IDPA 1CM8A 3NNWA 5ANJA 1U46A 3EYGA 5HHWA 5EQEA 4RZWA 4WHZA 4B6LA 2CN8A 5L4QA 4IFCA 4DT9A 2HZIA 2VTIA 5IUHA 1ZARA 5D12A 4O1OA 4DGLC 2WQBA 4C38A 4AT3A 2C5YA 2BKZA 4C4FA 3RM6A 4CKIA 2XKCA 3DXNA 4FC0A 4JVGA 3RHKA 3W2SA 3SOCA 4BTFA 4EQMA 5CALA 4O21A 2FVDA 3S00A 5FD2A 1XH7A 5F95A 4R1VA 3FY2A 1XKKA 2P4IA 3CD3A 2VTMA 4FTAA 2R3HA 5A46A 3LMHA 5EM8A 4D9TA 3ROYA 2PZYA 3ZZEA 1SVHA 2JD5A 1ZYJA 2VX3A 2X2LA 4DH7A 3F2AA 3NLBA 4Y83A 4GU6A 4BC6A 4GK3A 3I7BA 5FXSA 1O6YA 4DH5A 4CNHA 4EK3A 2WB8A 3DB8A 3K5VA 2CSNA 5DR6A 2BHHA 3E87A 4ONAA 2B9HA 2OF4A 4IZ7A 2KULA 3KKVA 1APME 2WTIA 4D2TA 3QAME 1OL2A 1U54A 4EH7A 3ENHA 5J95A 2UZEA 3C50A 3O7LB 4FNXA 2R3IA 2W17A 3VUDA 5I9VA 2CLQA 3ORZA 5H8BA 3F3TA 4FKWA 4C8BA 3K54A 1YWRA 4FIJA 2WU6A 1XH4A 2EU9A 3LXPA 3CJGA 3AOXA 1ATPE 3KCKA 1WAKA 2UW8A 4BDAA 2PE0A 1PXPA 5EI8A 1YHVA 2RF9A 2XK7A 2YWPA 4JRNA 4Q2AA 5GIOE 3R7GA 3SV0A 2C68A 3ENMA 4IJ9A 4UX9A 3KXMA 3U9NA 3NWWA 3BHUA 4FT3A 2J0IA 3VBXA 1WZYA 4FYNA 4HGSA 2BRNA 4TN6A 3ZHPC 4CZTA 3UOJA 4FF8A 2GNIA 4O22A 4C61A 4PTCA 5IQIA 4HCUA 3NPCA 4N70A 1W83A 4MD9E 3VF9A 3Q3BA 5A9UA 4F6UA 2W99B 3ZTXA 4ANNA 4XHKB 4HNFA 3UP7A 3T9TA 5M09A 2UVYA 4WSYA 1M52A 4B8MA 4O91A 3SG8A 3SXRA 3NUXA 2J5EA 3SHEA 5LVLA 1O9UA 1M7QA 4FIGA 2UUEA 4BB4A 5IISA 2XYUA 3IS5A 4LL0A 4YJNA 3NMUF 2OXXA 4FZ7A 4MCVA 1UNHA 3FUPA 4RA4A 4FKSA 3V5TA 5ACBC 2PVYA 2R3MA 3AMBA 5AV2A 4Z16A 3H0YA 5BVOA 3BCEA 2JLDA 2VWXA 3MJ1A 4I4EA 1UVRA 3R8VA 1GY3A 3PXQA 1T46A 3LCTA 3QXPA 3KN5A 4AG8A 3NCZA 1B39A 2H6DA 4F9CA 4DYMA 3W32A 3DY7A 3IONA 4LMUA 1SNXA 4G3FA 2IVUA 1FVRA 1WBVA 2ONLA 3PE2A 4JL9A 4X2KA 4PX6A 2FYSA 1J7LA 3VS2A 4JQ7A 2VTJA 3UO4A 4NH1A 4TW9A 2I6LA 2JFMA 3LOKA 3QZGA 3F2NA 4WG5A 5AR4A 2QO2A 3R8UA 5JQ8A 2PWLA 2ITPA 3WZUA 5CENA 4TWNA 4YJSA 3AC3A 3EQDA 4FV9A 1NY3A 5D11A 2OIQA 4FT9A 1PMEA 2R3PA 3QHRA 1YXTA 4W4YA 4XG2A 3VIDA 4E6CA 3QWJA 3ZFXA 4EBVA 5ETCA 2X6EA 4X3FB 2WNTA 3HDNA 2HWPA 3MFTA 3ZMMA 2H34A 2BRGA 3KF4A 5G1XA 2PUNA 4M0YA 3W55A 3ZLWA 3TUCA 3H9OA 2XMYA 5JMSA 3AC5A 4O7LA 3I6UA 1GZKA 3PSDA 2GFCA 3K3IA 5EFQA 5GZ9A 3ORIA 2E9VA 2IZTA 2J2IB 4O27B 4WBOA 5DRDA 2ITUA 2Q0NA 3O50A 2OJGA 3D15A 4ZJJA 5ETFA 2QLQA 3VS1A 3ZSGA 2UZNA 3ZUUA 4BZDA 5FEQA 2ONLC 3OMVA 2WMBA 4X7QA 3F2RA 4IXPA 3U54A 2UW7A 1JAMA 3PZHA 4Y85A 3IW8A 2YM4A 3QLGA 3W2PA 3PA3A 4DFNA 3PVUA 3I0QA 4K1BA 4A9TA 4LM5A 1Y8GA 3D14A 3AD5A 4YSMA 3COHA 2ZOQA 4M97A 4O1PA 3UGCA 3OWKA 4CD0A 4AS0A 1YOLA 4D1SA 4JIKA 1CDKA 3O96A 3OWLA 1H26A 4L3LA 4BDIA 4BI2A 4ZSAA 4B4LA 3KRRA 5DYJA 3I4BA 5F4NA 2W1ZA 1GZNA 3D4QA 4JNWA 5I4NA 4BKZA 4WNKA 3S2PA 5JH6A 2V55A 4BTMA 3C4XA 5E8WA 4MXCA 2X7GA 4YJOA 2XJ0A 3E3PA 1KOBA 3ORKA 4YZCA 3ZSIA 1HCKA 5FUTA 3FC1X 3ACKA 5HU9A 4ZMEA 1FGKA 3QUPA 3Q9XA 3FXWA 4WUAA 3FMJA 4XV9A 4O83A 2FSOX 1VEBA 2W05A 5DH3A 3OF0A 1P4FA 3FI2A 4IAKA 1W0XC 4C4EA 2R7IA 1YWNA 4H1MA 3ZBFA 4HVHA 2VWWA 3EYHA 3EH9A 4I93A 4O6LA 5E8SA 2AUHA 1FOTA 3EKNA 4EH4A 2XK4A 3NSZA 4JXFA 4LRKA 4F9YA 3PP0A 4X6RA 1H00A 4FZDB 4CKRA 3QCQA 3BU3A 5CT0A 2I0EA 3MWUA 2XEYA 4FZAB 1TQPA 3NUSA 3FMHA 5I9UA 3QC9A 4TYJA 4OT6A 3ZS5A 4E93A 4TPTA 3WF8A 4EJNA 4DC2A 3A99A 4HYSA 4L8MA 3H10A 2GDOA 2RIOA 1H01A 2W7XA 3NS9A 3ZLSA 3SRVB 1EH4A 3UO6A 4J52A 1ERKA 4QTBA 4JR3A 2HK5A 4AW2A 4FICA 1F0QA 4PL5A 2WQEA 3PY3A 4PV0A 3FY0A 3T3UA 4AOIA 2YISA 3LFAA 4WA9A 1FBNA 5FRIA 3VUGA 4R78A 3D5VA 1J1CA 4PPCA 5JRSA 3E8EA 5DT4A 4KIPA 1M14A 4YJQA 4YTCA 1VJYA 2WGJA 3TTJA 2V0DA 1Q8ZA 3VUHA 1LUFA 2CNUA 4O7NA 4PTEA 5CF8A 3LXLA 4PRJA 4MXXA 4O38A 4I0RA 3G6GA 3EFWA 1BL7A 4A4XA 5FXRA 3UPXA 3RTPA 3ORNA 4H36A 3GP0A 1OBDA 5FQDC 3NVKI 1A9UA 4F7NA 2BROA 4F63A 4JBQA 3I5ZA 1J7UA 1URWA 5AA8A 3KXHA 2AC5A 4DGMA 4OBOA 3EB0A 4PMTA 2UV2A 2PTKA 3MPTA 3DNEA 1RDQE 4RBLA 4YLKA 1KUTA 3OY3A 5M07A 5LMAA 4AZTA 1OB3A 2IPXA 2OXDA 2GU8A 2JBOA 5EH0A 4JS8A 4ANMA 2RL5A 4CT2A 3QQHA 4ZZNA 5DEYA 2F7XE 3ZM4A 2WOUA 4UN0C 4FKQA 4UMRA 1RE8A 2R3KA 4MBIA 1V0BA 3NNXA 3ID6C 3KXGA 4O7TA 2C5XA 3EFJA 4RGJA 3AXWA 3VUTA 1T45A 1WBPA 3PZEA 2OG8A 4E5AX 4HJOA 2W5BA 4MVFA 2B54A 3RAHA 3OC1A 5IG1A 1JSVA 4MHAA 5ANIA 5L2SA 5CASA 4IBMA 4PPBA 4WD5A 4ZOGA 3RPVA 5I0BA 1P2AA 4X21A 3CR0A 2Z7RA 4RZVA 4IVDA 5CAOA 3BEGA 3BGZA 4MBJA 4RJ7A 3DOGA 2VTSA 4IMYA 5AUUA 3S95A 1DI9A 3CQEA 3UDBA 5IQFA 3BYOA 3QQKA 4FODA 4BCJA 3LM5A 4BWPA 2QU5A 3EQHA 4U81A 4BYJA 4QMQA 1H4LA 3F61A 2P0CA 4QP6A 4IC8A 2WMXA 3L8XA 4YZ9A 4USFA 5L2TA 2YM7A 2E9UA 3QBNA 4IAYA 5A54A 3BEAA 3IW4A 2W9FB 4NKAA 2O0UA 5EDPA 3R8ZA 3Q9WA 4TXCA 3IW7A 2GQGA 3CEKA 4TNBA 4LGHA 3BRBA 2BRMA 3POZA 4NK9A 3QGYA 5EW3A 1GIJA 4L68A 3RP9A 4DH1A 4ZS4A 2EVAA 3T9IA 2YCQA 3R7VA 3GGFA 4YSJA 4FKRA 4ZIMA 3VBTA 3LPBA 1G5SA 4IFGA 4PMSA 3TDVA 3A61A 2ITYA 5CANA 1IRKA 3MA6A 4DEBA 2ITVA 3ZM9A 3L8PA 4I5MA 5HCYA 2R3QA 5T68A 1ZLTA 3GCSA 3IOPA 3OOMA 3ZOSA 2O63A 3NIZA 1JNKA 4TKSA 4Z7HA 5M06A 2Y4IB 3IDCA 4IAFA 4ACCA 4BR3A 2C6TA 4FR4A 5AR3A 4HW7A 4PMPA 3V5WA 3PA4A 2YM3A 3FI4A 4OTGA 4W4VA 1XH6A 4ALWA 4TYIA 2VWVA 4OTPA 3MY0A 4RQKA 3A8XA 1MQBA 1Q8WA 4U44A 5BPYA 4OW8A 3UVQA 5HNBA 2CGWA 2YEXA 3HECA 2B55A 3IDBA 4FTMA 4DEGA 4DFBA 1Q62A 5LOHA 3DBEA 2I40A 4UEUA 3SDJA 4FT0A 5IA5A 4NW5A 2JDVA 3TZ7A 5A4CA 5K5XA 5DT3A 3RGFA 5JFSA 4IH8A 1B6CB 1RW8A 4S34A 4FMQA 4ZLOA 3JR1A 2PK9A 2W96B 2XF0A 3JVSA 3C4EA 1UU3A 3VS3A 3TACA 2C3JA 4HVIA 2JKKA 4L52A 1R0PA 5EYDA 3V5PA 2C6IA 4EL9A 4D1ZA 2XBAA 4EH6A 4GL9A 3IW5A 1SMHA 3NCGA 4IW0A 3UIMA 2O2UA 4E5BA 4U3ZA 4PPAA 3BYUA 4F1MA 2R2PA 4CYJA 1MRUA 3QQFA 5CT7A 2AC3A 1OIQA 3AD6A 4M69A 2BAJA 3KU2A 2C3KA 4L6QA 4ANQA 5IQEA 4DEEA 3KQ7A 3Q32A 4MF0A 5L6WL 4PY1A 3A7GA 2B0QA 2CNQA 3N4TA 2UZVA 2CCHA 2F7ZE 3M2WA 5ANEA 2PMNX 3ULIA 5B2MA 3DCVA 2C6MA 3CTJA 4ZAUA 2R3JA 5CF4A 1QPDA 4U40A 3RZBA 5L8KA 2GMXA 3F7ZA 4TYGA 1AQ1A 1Q3WA 4EUUA 4GJ3A 2X7FA 5ANGA 2ZDUA 1H1QA 4Q9SA 4IB3A 2BFYA 1UU9A 4RIXB 4BCIA 5KMIA 1Y6BA 1XH8A 3LJ1A 4J1RA 5M44A 3Q5ZA 5HG7A 4EH2A 4GKHA 4PDPA 4ASEA 5CLPA 3SD0A 4B0GA 4GFOA 4RX9A 3NUYA 4FGRA 2OZAA 3LFFA 3ZCLA 5CU0A 4UV0A 3I81A 1YDRE 4U45A 5AM7A 4D55A 3FLYA 4E6DA 3LCSA 5CS6A 3ALNA 3RJCA 4MQ2A 4HVDA 4KIKB 4FK6A 4GIHA 4G3EA 1Z57A 4FSMA 4L7SA 4F9WA 1ZYCA 4FV5A 4AX8A 3BYVA 5JN2A 5HESA 3SVVA 2P33A 2HXQA 2QOLA 4EEVA 4U79A 1H25A 3CIKA 4IEBA 2BRBA 3C1XA 3KVWA 4O7SA 4DFZE 4KIQA 4BCKA 2BALA 1TQMA 4RIYA 5EW8A 3VQUA 1U5RA 5HGIA 5F9EA 3UZTA 1QMZA 2F7EE 2P55A 5KHXA 3MY1A 5C26A 2A4LA 4XOZA 4EJ7A 4FEQA 4NUSA 1XWSA 4GS6A 4YPDA 5J87A 3F88A 5IQDA 4M12A 3NVMB 4QP1A 2IN6A 4O7VA 2VTAA 4N0SA 4RJ4A 2WTDA 1LPUA 1MP8A 3E8DA 4KABA 2FSMX 4U7ZA 4FZFB 3I6WA 4GT5A 4AF3A 2XIZA 4K33A 3ORPA 1WBOA 4F08A 2QLUA 3RPOA 4DFXE 1MRYA 3Q9ZA 4L46A 4L00A 4M14A 3ZO3A 5LVNA 1BKXA 5K9IA 3LFCA 4S30A 2NRUA 3GU4A 3PVGA 5IQBA 5B7VA 2VD5A 3WF9A 2VAGA 4ZEGA 2PZRA 3FDNA 5M4IA 4KS8A 4O96A 2YWVA 4WNOA 4D4RA 5HTIA 2XNOA 5KMNA 3PIYA 5IA3A 2YABA 4Z7GA 2PVLA 4ANLA 4ZMFA 1ZYLA 1BI7A 1H28A 4DLJA 3Q4CA 4AA4A 4HYIA 2QOOA 5AUZA 3KREA 1FMOE 4FTJA 2H9VA 5EM6A 3EZRA 3N9XA 2GNFA 3Q04A 4YNEA 4QP4A 3P0MA 4C4HA 3BYMA 5LCJA 5HLNA 3L8SA 4FKUA 5BNJA 5EDQA 1H0WA 4JBPA 3FMEA 3BQCA 3WYXA 1KV2A 1LR4A 4YZNA 3Q4ZA 5LCKA 2YIRA 4DCAA 4R3PA 3PG1A 4MBLA 4FSWA 3G0EA 5HOAA 4B8LA 3BZ3A 5AX3A 1OITA 3D0EA 3QC4A 4FBXA 4BBEA 1YI3A 4PTGA 3TZMA 4C02A 4EUTA 4HGTA 4HYUA 3R7EA 1GZ8A 2CCIA 5AR2A 3BBTB 3R7IA 5HNGA 3TWJA 5AA9A 3CLYA 5EK7A 2QHNA 5KMJA 3PVWA 1JLUE 3GC0A 4TTHB 4KAOA 3R9HA 4R8QA 4QMYA 4ALUA 5FTGA 2O5KA 3LXNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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