4MD7E

Crystal structure of full-length symmetric ck2 holoenzyme
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Active Form of the Protein Kinase CK2 alpha 2 beta 2 Holoenzyme Is a Strong Complex with Symmetric Architecture.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit beta
total genus 110
structure length 332
sequence length 332
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4md7E01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4md7E02
2RSVA 5BUEA 3GCSA 1CKIA 3GFWA 3F9NA 3OWKA 5AR3A 2HZIA 5HVJA 4QQTA 4E1ZA 5A6OA 4NW6A 1XJDA 5D10A 3TKHA 4Q2AA 3DDQA 4HGSA 4D58A 3HECA 2XNMA 4YJQA 3TCPA 3HV5A 3ORIA 5HBEA 3UQCA 4R6VA 1WBPA 2VTHA 4G2FA 1MP8A 3FC1X 4NM0A 3KRLA 2V5QA 4B9DA 4O0YA 1YI4A 2YM8A 3TV6A 1FOTA 1XR1A 2BAKA 2UW3A 2CKPA 3BLHA 5EKOA 3RWQA 4LUEA 2JDRA 4DH8A 2IN6A 3R9HA 3UNZA 3R7IA 4N57A 5DHJA 4FV8A 4ZTMA 4YBJA 1JOWB 4YLLA 4ALUA 3EQCA 5HOAA 4XOZA 2UVXA 4RZVA 3ULZA 4D0WA 2WQMA 3FSKA 3HV6A 4Q9SA 4TYHA 5DWRA 2ZMCA 4FT9A 4DYMA 2P2IA 3P9JA 4ACHA 2BAJA 4GFGA 4PPCA 3LE6A 3ZFYA 3DB8A 5CSPA 2XJ1A 4GU6A 5C01A 2JFLA 2OWBA 1MUOA 5A4LA 4E20A 5M4CA 1CKPA 5HTBA 5AJQA 1YXSA 1HCLA 1UWJA 3MS9A 4JQ8A 2EVAA 3RPVA 5D9HA 3VBXA 3RTPA 3RCJA 4ZTQA 2XJ0A 2ITZA 4YO6A 4BHNA 1H1PA 5LJJA 2C1AA 4IDVA 1Q62A 2AYPA 2B9HA 2VO6A 4FKJA 1OL1A 4XRJA 5JFWA 2I40A 3E3BX 5J8IA 3BYMA 3WILA 3R83A 4W9WA 4CGAA 4QYHA 3UPZA 1KV2A 5CXHA 3V8WA 3KVXA 5DEYA 4EC8A 2UZDA 4EH9A 5FTGA 4F64A 2QG7A 1PXPA 2WQOA 3TNIA 1OPKA 4PTEA 5CLPA 3MI9A 5CQUA 4DTAA 5T3QA 3R0TA 3VN9A 5GINE 2BILB 2YISA 3PVBA 4FYNA 5FEEA 3CTJA 5M53A 3FWQA 4K77A 5HE3A 2XVDA 3I4BA 3P0MA 5AFVA 3QU0A 4OW8A 4A9UA 1I44A 1ZAOA 1ZOEA 2FSLX 4OTFA 4K0YA 1Q97A 5LMAA 4OTPA 3QHRA 5DT0A 4DT9A 4C7TA 2BRGA 4U0IA 2B9JA 3ZYAA 3GQLA 3PXRA 4PDYA 2J9MA 2OKRA 4BTKA 3UO5A 5E90A 4BFMA 3OOGA 1H24A 4F70A 4W8DA 2O8YA 2Z7RA 4AF3A 3L8SA 3PSDA 4BDGA 5IA1A 4L46A 2VO0A 1JSVA 2EWAA 4U3ZA 1W7HA 3DTWA 4XYFA 4LUDA 4RC2A 4PDOA 5KMJA 5HI2A 4OTDA 5FQDC 2ONLC 2J0MB 2VNWA 4GJ3A 4BI0A 4O7SA 1HCKA 4G17A 4ZXTA 2QHMA 3E87A 1SVEA 2Z7SA 1GIJA 3PIZA 4O6LA 1W82A 4MWHA 5M56A 2R3QA 2WTDA 5D1JA 2XKFA 2R3RA 3BYSA 2HXQA 4L8MA 3VF8A 5HQ0A 4FV4A 5I9ZA 3R9DA 4D5HA 2HZNA 4NCTA 5CZIA 4JAJA 5IZFA 2YM7A 4EWQA 2FSOX 4CT2A 1APME 2WU7A 4C4FA 4DTBA 4XBUA 2PE1A 3QD3A 1GJOA 1H1RA 1VZOA 3QZGA 5L2WA 5M44A 1FGIA 2C0TA 4DGNA 3CJFA 4EK8A 1YQJA 2REIA 3VS0A 2HXLA 4GVAA 2WELA 1VEBA 4DEIA 4CV9A 3IG7A 1OI9A 4LM5A 4PWNA 4V04A 4F9BA 4AZWA 4FV0A 4K9YA 2ITOA 5IEVA 1VJYA 5AUUA 4DLIA 2BR1A 4GK3A 3VNTA 3QC4A 4DINA 3NPCA 5HLPA 2YFXA 3T8OA 3AMAA 4K2RA 5EI8A 3OROA 2W1EA 3D94A 3E8NA 3A4OX 1Q3WA 4O7VA 3AC4A 4O86A 2RFSA 3HMMA 3BE2A 3QXOA 4P4CA 4EKLA 2B52A 3R7UA 4D2WA 3JS2A 4Q9ZA 4R3RA 4U45A 4GSBA 3D2KA 4NKAA 3E64A 3W2PA 5CF4A 5IDNA 4XP2A 4BL1A 3FMLA 2RG5A 3A4PA 1H08A 5M07A 4AZVA 4PNKA 4KBKA 4IACA 2QURA 4QMOA 3VULA 3MB6A 5GJFA 4FA2A 5LMKA 3ZMMA 4D1ZA 4BZOA 2HOGA 3PZHA 4FOCA 2QODA 2YLFA 4FV1A 1PXMA 3LFEA 2CKEA 3DA6A 4IZ7A 4L68A 3Q9WA 3GBZA 4O27B 3BPRA 3BIZA 4DBNA 3QQUA 5EW9A 4DITA 4F65A 1G5SA 2QOKA 3WZKA 3TZMA 4JBVA 4BI2A 1PY5A 4KS8A 3TZ8A 4BYJA 2YN8A 3BYVA 4QTCA 4BWXA 3P7CA 4TZRA 4IX6A 4FX3A 3VUDA 4N4SA 3U4UA 4GJ2A 3U6IA 4I5PA 3LIJA 2Y4IC 3UGCA 1IEPA 3PRIA 4TN6A 5AR4A 3QTUA 4JBPA 4XG2A 4B4LA 2C6MA 4S33A 2XS0A 2BFYA 4OT6A 4QP4A 1J7IA 3K5UA 2KTYA 4PRJA 2E9UA 4I94A 1XHAA 5BPYA 3C13A 1IAHA 1U5RA 2G01A 2XK8A 3NW5A 3QCQA 4C3RA 4XP0A 5AAGA 2RL5A 1P4FA 2WOTA 4QMSA 1YXXA 1BI8A 1R0EA 3C4EA 3MH1A 1QCFA 3EFKA 4QTAA 4QMQA 4JG7A 5IQDA 4X2JA 5FTQA 5BYLA 4FK3A 1P4OA 3GFEA 4DBXA 4FEVA 4M0YA 5F1ZA 4AGDA 4D9UA 4FTJA 1CM8A 3PPJA 3FY0A 3KXHA 4IFGA 2OIQA 4O96A 1UVRA 1J91A 4L7FA 5GJDA 4L3PA 3OS3A 2XKEA 3ANQA 3HMNA 4FKIA 3DAKA 5FBOA 3UO6A 4DFLA 1K2PA 3N4TA 2F9GA 3MFSA 4HCTA 1WZYA 5HVYA 2JDOA 5CF6A 2W0JA 2WQNA 3PA5A 4BGQA 4PNIA 4FSMA 4TNBA 4UY9A 2X8EA 5A14A 5AP3A 3HMPA 4EJ7A 2UZBA 4LGGA 3SVVA 2BRHA 4DEDA 4AOIA 2ZOQA 1A9UA 3DBQA 3DFCB 4DTKA 5DPVA 3FAAA 3OEZA 4IAKA 5AUXA 4HVDA 2XK6A 4FUYA 5JEBA 1BL7A 1YHWA 4AUAA 3Q2MA 3PDTA 2CGWA 3FLWA 4G34A 5HORA 4JVGA 1K3AA 2JIUA 3LHJA 3FJQE 3MY5A 2BPMA 4OT5A 5JKGA 3I6UA 3R73A 3WE8A 5I0BA 4Q5EA 2ETRA 5I3RA 4JG6A 4V01A 2NNWB 3R71A 2Z7LA 3D14A 1JNKA 2X8DA 2ITTA 3UOJA 3R2YA 3KULB 2YABA 2Z8CA 3NUUA 2A1AB 3CJGA 2FVDA 4O7TA 1X8BA 4XG8A 1H4LA 2IJMA 4UMQA 5B2MA 3E63A 3CQWA 5EOLA 1LEWA 4EOQA 3GGFA 3MIAA 2PZRA 1ZOGA 4XCUA 2NPQA 2GNHA 3W8LA 4NCTC 5ANIA 3EQFA 3Q53A 3V6RA 4TNDA 2YWPA 3ORLA 5IQGA 4NFNA 4KD1A 3L9LA 5EG3A 4DG3E 3LXNA 4RGJA 3UVQA 1GOLA 1Q8UA 3KK9A 2WTKC 2WGJA 3R1YA 3ZCLA 3EHAA 2R64A 2UW7A 5F95A 2R3LA 4R1YA 5AA8A 4GFOA 4C02A 4XG6A 2XA4A 2XK3A 4E6AA 4RA4A 4Z3VA 2R3MA 2ZB0A 3AT4A 5J1WA 3FMEA 2A4LA 2W1ZA 2YIYA 3R8MA 5CEMA 4FT0A 5FP6A 3FEGA 5FWKK 1LR4A 2C5XA 2PHKA 2P55A 4CSVA 3EOCA 4M66A 4MXAA 2WMSA 3F3UA 3I7CA 4A07A 5BVKA 4IAAA 4BKYA 3ALNA 3UC3A 4CMTA 5FEQA 3ZC5A 3EQRA 5CEOA 5GZAA 4GV1A 3ET7A 4WBOA 4YPSA 4MXXA 4R1VA 2W1HA 4APCA 2XNBA 2W9ZB 2OW3A 4QNYA 3H4JA 5EOBA 4ZZNA 4PP7A 4X2FA 1ERKA 3L1SA 2GTNA 3JUHA 5FD2A 4GEOA 4OTGA 4BBMA 4QP1A 1H0VA 4QPSA 4EORA 5LMKC 4A7CA 3ORXA 3NNWA 3QGWA 2BCJA 4IVDA 2VWYA 1SVHA 4KSQA 3SKCA 1GY3A 1GIIA 3RP9A 4ID7A 3CIKA 4BCJA 2GCDA 4FKQA 1JBPE 5CVGA 4M12A 4IB3A 2A19B 2WB8A 1Q3DA 1WFCA 2YA9A 1OIUA 3HNGA 4FKUA 5KHWA 1Y8YA 4DT8A 2WQEA 2W4OA 3LQ5A 5FDPA 1Q99A 2PZ5A 2YCRA 4QYFA 3F7WA 3GNIB 2H34A 4ZZMA 2VTLA 2XIZA 1H1SA 1ZZ2A 3CXWA 4ARKA 5DOSA 4BN1A 4AN3A 1OB3A 3C7QA 5EM6A 5ITAA 2VO7A 3NNXA 4GYGA 5JZJA 4FMQA 4DEBA 4H3PA 4A4OA 1ND4A 3Q6WA 3R7GA 3EN4A 3E92A 5HICA 2Q83A 4YZDA 1KV1A 3U6JA 4LV8A 4HVHA 2PMOX 4D4RA 4FNZA 4QYGA 3CD8A 1XBCA 3MW1A 5BYYA 1OBDA 1ZZLA 3E5AA 2UZNA 3I79A 1Z57A 2GDOA 4O38A 2XNPA 2ITNA 3F2NA 2JBOA 3CPCA 2JDSA 1ZLTA 4WNMA 2OJIA 5FRIA 4AW1A 1M2QA 1QL6A 5TO8A 4QMZA 3P86A 1IRKA 3Q4TA 1P2AA 3W2OA 1QMZA 2F2UA 4RVLA 3F5UA 4EOJA 2R0IA 3CS9A 1IG1A 2A2AA 2PMNX 4GL9A 3PA3A 4B8MA 3OHTA 3PP1A 3MVHA 1H27A 5IF1A 3QTSA 4O22A 3QL8A 4HCUA 4AP7A 3OW4A 3TTIA 2VTJA 2PY3A 4GIIA 4YJPA 4C2VA 2DUVA 1ZYSA 4UMTA 3W10A 3ERKA 5IA4A 2R3JA 4O0XA 1YWVA 4X3JA 4CNHA 2F7ZE 3OVVA 5K4JA 5EQEA 2GHLA 4CZUA 3OXIA 4ZTLA 4X6QC 4YR8A 3G5DA 4FEQA 4DCAA 3SW7A 3DBEA 4GKIA 5LARA 1S9JA 3C5UA 4JQEA 5C9CA 5CANA 2OGVA 2H9VA 3T3UA 3BYUA 3ROCA 5J7HA 3D7ZA 4R7BA 2CLQA 3UOKA 2NO3A 3FMNA 4BDDA 2ITUA 4S31A 5HESA 4TTHB 3TM0A 3ZSIA 4C61A 1UNGA 5CVFA 5DVRA 3LZBA 2BRBA 5IQBA 1OKZA 4FTTA 4K1BA 3GC7A 4QMWA 4ASZA 2XJ2A 3UVPA 4A9SA 2R3PA 3P1AA 5HNIX 4EZ5A 4IX3A 1TQMA 1LUFA 1WVXA 2GTMA 3Q5ZA 2ITVA 5D11A 4JOAA 4E4LA 3LLAA 5HCXA 5TOZA 1UU7A 4U43A 3R21A 3W2QA 4AA5A 3I81A 3ZH8A 3RMFA 4ZTSA 4NZWB 3C5IA 4LG4A 4I93A 3DB6A 2AUHA 2PU8A 2QKRA 2UW0A 3V5QA 4EQMA 1J7LA 2BUJA 3HDNA 1OECA 2YM5A 5E91A 1OL5A 4CQGA 2VWBA 5DRDA 2W96B 5E8SA 2JFMA 2VNYA 2JDVA 3FLNC 4Y5QA 5DRBA 1FPUA 5AUYA 2IZRA 5DLSA 5DR9A 3E7OA 3ENMA 1JAMA 1LP4A 4FG8A 2WTWA 3W55A 2XK7A 3FDNA 5F94A 3DXQA 2BHHA 2XF0A 5L6PA 5IA2A 4WRGA 4AACA 3W33A 4HYHA 5DN3A 3H9RA 4ZMEA 4W4VA 5J95A 3RM6A 5AEPA 4MEDA 3KN5A 2XB7A 2XRWA 2VWIA 4U80A 5HCZA 4UYAA 4EH8A 5J9YA 1H01A 4HZSA 2CJMA 4IB1A 2C6OA 2XUUA 1R0PA 3Q4UA 4FSYA 5IG1A 5LVMA 4I4FA 4BI1A 4GKHA 4IJ9A 2R5TA 5GIOE 2OO8X 1GZNA 4D2RA 2VTNA 5TR6A 5CEPA 1REKA 3DLZA 3OY1A 4CRLA 3DV3A 2Y9QA 4ZZOA 4O81A 4ZLOA 4PMSA 4IJPA 3EQIA 3GT8A 4ALVA 3CC6A 3RZBA 4CXAA 4O7RA 2OK1A 5I9UA 3H0ZA 4BRXA 4LGHA 1TVOA 2GNIA 2ZDTA 3CGOA 2CKQA 5IQCA 1V0BA 3KF7A 3QALE 3UVRA 5CXZA 3BU3A 3WYYA 4RC3A 2FSMX 3NYOA 3A7JA 3KFAA 2CGUA 4CG9A 2QC6A 4U9AA 3E8EA 3E62A 1BI7A 3HA8A 3KRRA 2R3HA 3DJ6A 3MH3A 4UB7A 4QP2A 3MFTA 2X1NA 2Q0BA 2RFNA 4UEUA 3S2PA 3OFMA 3C4XA 3GP0A 4QP6A 3UG2A 1FVVA 5FGKA 1B38A 2IO6A 3HRBA 3NW7A 3PRFA 3F7ZA 2WKMA 1MRYA 3L9NA 4J52A 4TYEA 5CAVA 3RK5A 4D2VA 3UMXA 5DT4A 4Y95A 4B8LA 3COIA 4WG3A 3RM7A 3ID6C 2FYSA 2XIYA 4R7HA 4XLVA 5KMKA 5E8YA 3QRTA 5EYCA 4ZY5A 4I6FA 3NYXA 5CT7A 2YLEA 3DZOA 3ANRA 2VWXA 5CNNA 5BVDA 4O0UA 4ACMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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