4NCTC

Human dyrk1a in complex with pkc412
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
346
structure length
339
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of a dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinase 1A-PKC412 complex reveals disulfide-bridge formation with the anomalous catalytic loop HRD(HCD) cysteine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1
total genus 109
structure length 339
sequence length 346
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-10-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4nctC02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4nctC01
1K3AA 4N57A 5FUTA 1FOTA 4LM5A 4OBQA 4C3FA 2XCHA 3RNIA 2YFXA 4KBKA 4F9CA 4K6ZA 3H9OA 4FSTA 3I6UA 3CKWA 4ZS4A 3C4ZA 4QT1A 1H08A 5LMBA 5E8TA 4O7NA 4V0GB 4L3JA 5FXSA 1GIIA 3QUEA 4CFMA 2CNUA 3KN5A 2XF0A 3A2CA 5M44A 5HI2A 4Q5HA 3F3WA 4UXQA 2VO0A 5KMMA 4BL1A 3QX2A 4JBOA 3IS5A 4EOPA 3T3VA 5FDPA 5H9BA 4BCMA 2EXEA 5AUXA 4RSSA 2I0VA 5DR6A 3R6XA 3IECA 4RT7A 5J95A 4CT2A 1GIHA 4IAKA 5E8UA 1H0VA 4EH3A 1G3NA 3MBLA 1WBPA 3RWPA 1XBAA 2ZVAA 3ZRLA 3FE3A 5DIAA 4EOLA 4ITJA 4Z9LA 3BELA 3D5VA 3Q4ZA 4HVIA 5AX9A 1FVVA 4UEUA 5DH3A 2I1MA 5C1QB 4FNXA 5L2QA 2YJSA 5BMSA 3U6JA 3R28A 3AD6A 4AW1A 2JGZA 2WMWA 2I0HA 2JKMA 3ZBXA 3F5PA 4JBPA 3IGOA 4AOIA 4C33A 4C3RA 5CEIA 3F5XA 4F6SA 4WD5A 3OXIA 2R7IA 3LQ5A 3PSDA 1UWJA 1YW2A 2FO0A 3QQUA 4TWCA 3F3UA 2EUFB 2PY3A 1Q8TA 5ETCA 1RDQE 3RVGA 4CZUA 5L8KA 1OIUA 3PJ3A 5HNIX 3EZRA 5EH0A 3QCXA 3R21A 1J1BA 2YZAA 2JEDA 4EJ7A 3E62A 1FINA 5HLPA 4RPVA 4QTAA 4U40A 3IO7A 4JRNA 4ZS0A 5HO8A 2YM3A 2IVTA 3LFEA 4W4YA 2VNWA 5I3OA 4D4VA 5IQHA 3DQWA 4O21A 2CSNA 3KXXA 4GMYA 4A7CA 3PXYA 4PPCA 4QMYA 4C37A 1Y8YA 3HAMA 3IPHA 1L8TA 2HXLA 2X1NA 3EQDA 2VO6A 5D11A 1PXPA 2BPMA 4MD9E 1WBSA 3GT8A 3D2KA 4JG8A 4RC4A 1A9UA 5AR3A 4YTIA 5L8LA 2HOGA 4OTWA 4M7IA 3COIA 2YIWA 4U42A 4E20A 3LM0A 4BDAA 3G51A 3OT3A 5LCKA 5IQAA 3MWUA 3PJCA 4IC8A 4AWIA 4FSUA 3F61A 4C4FA 4C34A 4EKKA 4RVKA 1Z57A 3G6HA 3PA3A 3ZRMA 3VS2A 4FA2A 1Q8WA 1TQMA 2YEXA 4H3PA 4OAVB 5EDPA 3C1XA 3UC4A 3AC5A 1J7UA 2O65A 2P2IA 4FKTA 3FDNA 2W7XA 2XNNA 3I7CA 4UALA 2YN8A 3WI6A 5AA8A 2JFLA 3QYZA 4GUBA 5CASA 4EI4A 5KUPA 2G01A 1PXJA 5K3YA 1WBWA 3I1AA 1H1QA 4ALUA 5DVRA 2XBJA 2ZOQA 3O2MA 5A4CA 3V8SA 2OU7A 4UV0A 3ZLSA 3RPOA 1TQIA 3ZYAA 4DG3E 4U0IA 2YITA 3SXRA 1W83A 4MCVA 4O81A 2A2AA 4AACA 5BVOA 3PXKA 2ZV9A 1SVEA 5HU9A 3GCSA 1Y6BA 2XIRA 4YMJA 3ID6C 4DFNA 4S31A 2GQSA 3TIZA 2ACXA 2DQ7X 4C8BA 4V04A 3O7LD 5AR8A 3FLYA 4JNWA 5L4QA 5M06A 4B8MA 4M12A 3PA4A 3QRUA 5FM2A 3LCSA 4R5SA 3H30A 3DU8A 3PRIA 2C3JA 3QYWA 4FV7A 3FY2A 4ACMA 1YHWA 4O7VA 1UU7A 3QU0A 3QXOA 4RIYB 2CDZA 3BQRA 4BICA 3PVBA 1KV1A 1JPAA 4F9BA 4ENXA 2BFXA 5HG5A 3UVQA 5L2WA 2UZOA 4JIKA 3UP7A 4EYJA 2WGJA 2ZJWA 3A62A 1W0XC 4FUXA 4QMXA 4RRVA 3QZIA 4C58A 4M0YA 5E8ZA 2F7ZE 3AMYA 3KVXA 4I94A 5M55A 2VTRA 2BRMA 4TXCA 4KIQA 3NS9A 3RK9A 5B7VA 3BHYA 3D7TB 4BDCA 4GW8A 5BUJA 1XH4A 4UZDA 3ZFXA 4BCPA 4JL9A 5GIPE 3BIZA 3DS6A 3KC3A 3Q2MA 4IX6A 3D83A 4RIOA 2OSCA 2EXCX 2CCHA 4R8QA 2HZIA 3A4OX 3LFQA 5ANEA 4O22A 5CVGA 2X8EA 4USEA 5K0XA 1S9IA 3SA0A 3OOGA 5GIOE 1H28A 3OMVA 4DG2E 4UB7A 2J0MB 4L7SA 2VWBA 3UVPA 4IDTA 1U46A 4QQCA 3ZM4A 1H25A 3U6HA 3OWPA 1Z5MA 4U81A 4CCBA 2H96A 4F64A 3BZ3A 4QP3A 2BAKA 3QBNA 4EWQA 5F9EA 5CZIA 4F0IA 2P0CA 3G0FA 4EOQA 4IB1A 3SD0A 3UNKA 3SDJA 3E8NA 4PTGA 5KMOA 2PE2A 1OL7A 2R3RA 2VX0A 4G16A 4J96A 3IQ7A 5HD4A 5T3QA 3EFKA 2R3QA 3WYXA 4FVQA 2LAVA 2VTJA 5C27A 2HXQA 4X6QC 1URCA 4EOIA 2PSQA 4PNIA 3W2QA 3BYMA 3F2NA 3CD3A 3W2PA 4L00A 4PUZA 4GVJA 4FIJA 2IW8A 4EUUA 4NCTA 2C68A 2XEZA 4OTRA 4G6LA 5FD2A 5IG1A 4IZ5A 1ZY5A 4QMOA 4AF3A 3ODYX 2WQOA 2BZHB 4FTRA 3JVSA 1GZOA 3ZLWA 3HMMA 3RHXA 3TKIA 5IA4A 2IG7A 3ZUUA 3UQGA 4GRBA 3HNGA 4GH2A 1O6KA 1R3CA 3CCNA 4QMNA 3DZOA 2YHVA 3I4BA 5DA3A 4J52A 5BVEA 3L9PA 4BDKA 2V7AA 4DCAA 3VBXA 3QALE 3DNDA 3BHVA 5T68A 2YABA 4LOOA 1UV5A 3ZLXA 5HBJA 5CYIA 2OFVA 3ORPA 1ZMUA 3P9JA 4AW2A 2OGVA 4BIEA 3QA8A 2WTJA 2KTYA 4Y95A 5FLFA 4C0TA 5HCYA 2WNTA 3UPXA 3ZFYA 5JT2A 3NCGA 5CSVA 2J5EA 4LV8A 3EQHA 2ONLC 2Z7LA 1E1XA 4MXXA 4AS0A 4AA5A 3P23A 2WQNA 3Q32A 3TIYA 5JRSA 4KD1A 5IISA 2PWLA 4GT4A 4MVFA 1DAYA 1S9JA 2ITXA 4EH9A 2ITNA 4FKOA 4IBMA 4FTLA 4MF0A 5L8JA 2G2IA 5FQDC 2PVKA 3E8EA 4O96A 2YLFA 4H1JA 4RLKA 1A06A 3RM6A 2W1GA 2ZYBA 5KMKA 3BEGA 3FC2A 2GNFA 4C57A 3QKLA 5JZNA 1IA8A 4NM0A 4XH6A 4ANSA 4BTKA 5AR4A 3NSZA 5GJFA 2GNGA 4F6WA 4EQCA 5J7HA 5CSWA 4G5JA 4FV3A 4OUCA 5JN2A 2XK8A 3VC4A 2QO9A 4K8AA 5F1ZA 3OXZA 4K2RA 4DINA 5IEYA 1JQHA 3F9NA 4U41A 3LXNA 4KNBA 4NIFA 4AT5A 3NAXA 4DC2A 2QD9A 4IH8A 4YPDA 2PVJA 4I93A 4ZSAA 2PULA 4D0WA 3F6XA 4JT3A 3FZOA 3QTXA 5IDNA 3MIAA 3TUBA 1BKXA 4I0TA 5E8XA 3DAEA 4C4HA 1UA2A 4O0SA 1Q8ZA 3NW7A 2I6LA 2UW7A 4KIOA 4QQJA 4XX9A 3NGAA 3PWYA 4FOCA 4AZSA 4QTEA 4JBVA 4G5PA 3UNZA 3NUPA 5H8GA 3TV6A 2UZLA 5IUIA 1LUFA 2Q0NA 4FSMA 3D4QA 4EH6A 3QQLA 3R7IA 3OZ6A 4HCTA 5KMJA 1NXKA 2G1TA 1RQQA 1PKGA 3ZC5A 2VTLA 4RIWA 4JG7A 2VWZA 4J53A 4UZHA 4J1RA 3TUCA 2GS2A 3R8PA 4CRSA 4B7TA 4B8LA 3I5NA 4X2JA 4CFFA 4FNYA 4G6OA 3TTIA 4DLIA 4JJRA 5J9YA 4YLLA 3MVJA 3OW4A 3ZXTA 5BVFA 1ZY4A 4RFZA 2XKDA 3R8VA 5E4HA 4CKJA 4MHAA 3V51A 1F3MC 2XIZA 3AC2A 4IQ6A 4IVCA 1JSVA 2RFEA 4O0VA 3F69A 4IZYA 3TM0A 3E5AA 4QP7A 4OTHA 5KKRC 4EH5A 3ELJA 3TL8A 3OVVA 4MNEA 4IVDA 3FSFA 2RG5A 2J0KA 2R3IA 4EYMA 2B9FA 4QPSA 4XP0A 3PJ8A 3RPVA 2IN6A 5IDPA 3KFAA 5IH6A 2PVFA 3HMPA 4ZTRA 3KXZA 3A7JA 5CNNA 2BZIB 4QP4A 3O51A 4CV8A 1BL7A 1RJBA 5CF4A 4P5QA 3NNVA 4ONAA 4M66A 5HIEA 5C8MA 3C50A 1YI3A 4RZWA 3GENA 5ANIA 1GZKA 4Z55A 3TNHA 5HE1A 2CCIA 4MX9A 4QYGA 5FGKA 4BCKA 4NYEA 2W99B 3Q9WA 2C5OA 4RQKA 5A4LA 2X81A 3DTWA 5IF1A 1IAJA 3BPRA 3NX8A 3SRVB 2Z7SA 3D5XA 4R7HA 5KMNA 3WE8A 3KGAA 5EQEA 4XV1A 3GB2A 4J8MA 2QC6A 3RNYA 2G2HA 4FT0A 2I0YA 3MPTA 5DBXA 3V6SA 5CF5A 4F7NA 2HAKA 3I0OA 2FB8A 4KB8A 4P7EA 5EQPA 5JGAA 4XJ0A 2GFCA 5AIKA 4O0RA 4OR5A 2CGVA 4WG3A 2HK5A 3IW6A 3HA6A 4I6HA 3CKXA 3CS9A 3OTVA 4HZSA 4IW0A 3GU5A 4ZLYA 4V05A 1YXXA 3AXWA 3SW7A 5DI1A 5M07A 1ZYDA 2PZYA 4AZVA 5CEPA 1PY5A 3NR9A 3VVHA 2ZB1A 3WZDA 3D5WA 3ZLYA 3TEIA 4X2KA 3DOGA 1X8BA 3PXQA 4K9YA 4BCGA 4FG8A 4PY1A 2WIPA 5AP4A 4Z16A 3JY0A 4CV9A 4AT4A 3OD6X 4HOKA 1XH9A 5M4CA 5I4NA 3AC3A 5CI6A 3A99A 2B1PA 3W2CA 5BX0A 3FI8A 4CG8A 2R3KA 2PTKA 4U9AA 4AFEA 3KQ7A 2B0QA 5AV0A 4GT5A 3P86A 4AUAA 1XHAA 2P4IA 3QCSA 4OAUC 2CNVA 3DFAA 4Q2AA 4R3RA 5TE0A 5EM5A 4BDDA 5BNJA 2W4JA 5DYJA 2VWXA 3F3VA 3UGCA 2RSVA 1Y6AA 3O8UA 4EC8A 4BWXA 4HZRA 3VNTA 2XIYA 2FYSA 3CQEA 4MXAA 1YOMA 4ACCA 3NMUF 2X6DA 3LJ1A 2Z2WA 3GUBA 4K18A 3VWAA 2IVUA 2JBPA 2X9FA 3HMIA 2AC3A 2JAVA 3B8QA 3NEWA 3F7ZA 3OHTA 5CEOA 3OC1A 2BDFA 4D1XA 3EH9A 2CPKE 4AZTA 3DDQA 5LWMA 2PU8A 3SHEA 2OF4A 3MPAA 3FZSA 4G3CA 3UNJA 3MH0A 5I9WA 5I9ZA 2OIDA 3R9NA 3W33A 3R1YA 1SMHA 2PMOX 3QF9A 5F95A 3U51A 2EB2A 2FUMA 4Y5QA 1E1VA 4EH7A 5JQ5A 3IONA 3KMWA 3OP5A 4AOTA 2C3KA 2WQMA 3VUTA 4RX5A 1QPCA 2WMUA 2XNEA 4Q5EA 2NNWB 2PL0A 3R7EA 3BLQA 3DK7A 1SNUA 4D28A 2WIHA 3EYHA 5I9YA 1M52A 4C2WA 2BVAA 2WB8A 4LV5A 2EB3A 2F9GA 2W4KA 3UDBA 5HO7A 2YDIA 5C4KA 3MY5A 3NNUA 3QLFA 5FEQA 2QOCA 4JG6A 2OH4A 4XLIA 3S3IA 4B6LA 4ASZA 3RHKA 3K3JA 4IANA 4DYMA 2NP8A 3GC9A 1OMWA 2XYNA 3DBFA 5CVFA 5M56A 4AFJA 2OLCA 4JX3A 2C1BA 5CI7A 4G3DA 4IM0A 3BKBA 4DTBA 3ANRA 3EZVA 3F7WA 4RMZA 3ZO2A 4PMSA 3G0EA 4EOMA 3GQLA 4QOXA 3QXPA 1KOAA 4RIXB 4S34A 5HO6A 3T8OA 3TKHA 5EW9A 2E9OA 4Y72A 4FKIA 3PG1A 5E92A 4YO6A 2IW9A 4G34A 4GIIA 4IB0A 4RQVA 3IG7A 4RVMA 5BYYA 4ENYA 1IG1A 3I6WA 2IJMA 4USFA 4LRKA 3M11A 1U5RA 1GY3A 4NTSA 3SG8A 4BCFA 3RP9A 2BUJA 2WPAA 3PP1A 4G17A 4YTCA 1YDTE 2B54A 3FMMA 3HMOA 3KXHA 3OCTA 5DT0A 3W2OA 3GI3A 3R9RA 5IEXA 4L45A 3FHIA 3BQCA 3QLGA 4D4RA 3AMAA 5IA5A 4RJ4A 3UZPA 3B2WA 5BPYA 3TJCA 5AUYA 3MVLA 2ZV8A 3PPZA 2OIQA 4QMPA 3FZRA 3WILA 3PE2A 4LMUA 5FTQA 3P7BA 2WOUA 4X3FC 3VIDA 3DBCA 4IAIA 3CR0A 4ASXA 3DAJA 1ZOGA 4IX4A 3FAAA 4F9WA 5AUTA 4RGJA 3UVRA 3KULB 4G6NA 3VBWA 3UP2A 4NU1A 2BCJA 2P3GX 5IA0A 4R7IA 1NVQA 4CLJA 4R3PA 4CNHA 5FTGA 2F2UA 5E8YA 2ZM1A 5AUWA 5M09A 3QD4A 3WF8A 2VWIA 3Q9XA 3VBTA 4NW5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K3A A;  4N57 A;  5FUT A;  1FOT A;  4LM5 A;  4OBQ A;  4C3F A;  2XCH A;  3RNI A;  2YFX A;  4KBK A;  4F9C A;  1XMM A;  4K6Z A;  3H9O A;  4FST A;  3I6U A;  3CKW A;  4ZS4 A;  3C4Z A;  4QT1 A;  1H08 A;  5LMB A;  5E8T A;  4O7N A;  4V0G B;  4L3J A;  5FXS A;  1GII A;  3QUE A;  4CFM A;  2CNU A;  3KN5 A;  2XF0 A;  3A2C A;  5M44 A;  5HI2 A;  4Q5H A;  3F3W A;  4UXQ A;  2VO0 A;  5KMM A;  4BL1 A;  3QX2 A;  4JBO A;  3IS5 A;  4EOP A;  3T3V A;  5FDP A;  5H9B A;  4BCM A;  2EXE A;  5AUX A;  4RSS A;  2I0V A;  5DR6 A;  3R6X A;  3IEC A;  4RT7 A;  5J95 A;  4CT2 A;  1GIH A;  4IAK A;  5E8U A;  1H0V A;  4EH3 A;  1G3N A;  3MBL A;  1WBP A;  3RWP A;  1XBA A;  2ZVA A;  3ZRL A;  3FE3 A;  5DIA A;  4EOL A;  4ITJ A;  4Z9L A;  3BEL A;  3D5V A;  3Q4Z A;  4HVI A;  5AX9 A;  1FVV A;  4UEU A;  5DH3 A;  2I1M A;  5C1Q B;  4FNX A;  5L2Q A;  2YJS A;  5BMS A;  3U6J A;  3R28 A;  3AD6 A;  4AW1 A;  2JGZ A;  2WMW A;  2I0H A;  2JKM A;  3ZBX A;  3F5P A;  4JBP A;  3IGO A;  4AOI A;  4C33 A;  4C3R A;  5CEI A;  3F5X A;  4F6S A;  4WD5 A;  3OXI A; 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