4NFNA

Human tau tubulin kinase 1 (ttbk1) complexed with 3-({5-[(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)methyl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-yl}amino)-5-bromophenol
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
DILPANYVVKDRWKVLKKIGGGGFGEIYEAMDLLTRENVALKVESAQQPKQVLKMEVAVLKKLQGKDHVCRFIGCGRNEKFNYVVMQLQGRNLADLRRSQPRGTFTLSTTLRLGKQILESIEAIHSVGFLHRDIKPSNFAMGRLPSTYRKCYMLDFGLARQYTNTTGDVRPPRNVAGFRGTVRYASVNAHKNREMGRHDDLWSLFYMLVEFAVGQLPWRKIKDKEQVGMIKEKYEHRMLLKHMPSEFHLFLDHIASLDYFTKPDYQLIMSVFENSMKERGIAENEAFDWEKAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of human tau-tubulin kinase 1 both in the apo form and in complex with an inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tau-tubulin kinase 1
total genus 100
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4nfnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4nfnA01
2JD5A 3HKOA 2BHEA 4LFIA 4X3FA 2QKWB 2I0EA 4WIHA 5HLPA 5KKRC 3UIMA 3P0MA 1GZ8A 5D9HA 1WMKA 1PF8A 3R73A 5DNRA 3DBFA 2VWIA 4F65A 5F94A 4FV0A 3VULA 2PUPA 4MVFA 5AA8A 4LMNA 2X9EA 2X2MA 3RKBA 1YHSA 3WOWA 3TUCA 3EYHA 3OZ6A 4NTTA 4XS2A 3L9LA 4EOKA 2WMBA 4I0SA 4JRNA 5KZIA 3UOKA 4BTJA 4PL5A 3MB6A 3CQEA 3I6UA 2JFMA 4MXXA 5EDQA 4B9DA 2JIIA 5CVGA 3FAAA 2X0GA 4FMQA 4O0RA 5A4LA 2BKZA 3HV3A 1OMWA 2WEIA 5CEOA 2B7AA 5GZAA 3RI1A 2QOQA 4MF1A 5K5XA 3F7WA 4PMMA 2W1EA 1M52A 4J8NA 5KMKA 2VTOA 3DBCA 5J8IA 1GZNA 3DB6A 3VBTA 3LHJA 3UOJA 4KNBA 1IAHA 2EB3A 4LOOA 3UQGA 5HVYA 3HZTA 4O0TA 4DFYA 4HVIA 2RG6A 3MYGA 3H4JA 2HZNA 4CGAA 3A60A 4X6RA 3GQIA 4PNKA 4FTLA 4BDJA 3OCSA 1JOWB 1MRVA 2QURA 3R8ZA 3NMUF 4L00A 3MPTA 4K1BA 3B2TA 4I92A 3DZQA 4I94A 5T3QA 3ZEPA 2AC3A 2C4GA 3TZ9A 2R0IA 4CFVA 4CFWA 2HYYA 3OVVA 3OW4A 2BAJA 4EHVA 2WAJA 4BHZA 4RC4A 1WVXA 4W8DA 2I7QA 3MTFA 3HP5A 4C4GA 4S34A 4ALWA 4PV0A 3LFNA 4KB8A 2OZOA 4EC9A 1L3RE 4LRMA 1OM1A 4YHJA 5AR5A 3VHEA 5CU2A 4G16A 3Q4UA 2GHMA 4ZSGA 3MY5A 4FVQA 3GNIB 3QTWA 3DBEA 3BQCA 3HEGA 4KRCA 3WZDA 2XP2A 4GYIA 3V5LA 5HIBA 4TYHA 1UU3A 2R2PA 3OWJA 4O2PA 3NUUA 4R1YA 4KS8A 4P5ZA 5JFVA 3CGFA 3FMMA 1KUTA 2REIA 3OOMA 4XG8A 1G3NA 2BIKB 3HGKA 4ANLA 4ENYA 4QYGA 3T9TA 2BTSA 4CFXA 4DG2E 2C6OA 2ZM1A 3R2BA 5J5TA 2R3QA 4XP0A 5AP6A 3PXQA 2EVAA 3C4WA 3VJOA 1JKSA 3V8WA 4F1MA 2OICA 4H58A 2Z7RA 4FKLA 3UO5A 4WHZA 4QTCA 3VUTA 2WMRA 3REPA 2PZRA 3O0GA 4YNEA 1YHVA 5FTGA 2PVLA 2WTDA 3B2WA 2HIWA 3EN4A 3IDPA 3R1NA 4LOPA 5IH5A 4BIBA 1KE8A 3MVHA 3FQHA 3CTJA 5IQDA 1UVRA 3A7GA 4EJ7A 1FGKA 1XH6A 3D2IA 3FV8A 3SC1A 3PXRA 5L6PA 3PZHA 3BE9A 4FV9A 2BTRA 2QR7A 3ZU7A 4BCNA 5FBOA 3U55A 4JXFA 3I7BA 4G2FA 3CC6A 2YERA 4JAJA 3ROCA 1ZYSA 3E7OA 2XK8A 4GK3A 5IZFA 3S0OA 4F63A 4YPSA 1GJOA 3QTIA 4B0GA 2R3IA 3CEKA 3FLWA 4RJ8A 3MFTA 4AP7A 5E8UA 4GFGA 3SLSA 3G6HA 5DRBA 4EOLA 3OUNB 5EQEA 3DK7A 4TNDA 3CS9A 2C5VA 3QZGA 3RBWA 1OZ1A 3R7EA 2A0CX 3MS9A 3R22A 4FV5A 5IQCA 2UW4A 3UVPA 3Q9WA 4L01A 2O64A 5AUZA 2XIYA 2XK7A 4DFXE 5I0BA 4CKIA 4WD5A 3C50A 3MFUA 4RX5A 1PY5A 1X8BA 3GI3A 3AC1A 4YJOA 2HW7A 3FSFA 4O7TA 4F7NA 1XWSA 3VNTA 5JN2A 2ZV7A 1ZRZA 5E8YA 1YI4A 2RFDA 3QRTA 4JQ7A 3NUAA 4BCGA 4TT7A 5HX8A 4D4VA 4EH3A 4F0FA 5M4FA 2A2AA 5DWRA 3GU6A 4RMZA 4UY9A 4QMYA 4EOOA 3WF9A 2HZ0A 3GOKA 4FV2A 2JFLA 4JDKA 5CX9A 5M09A 5J1WA 3WF6A 3LMIA 2VWZA 1JPAA 4IQ6A 3RAHA 1QPDA 1BL7A 2BRGA 1JSVA 2ITXA 2WQMA 1F5QA 1OL2A 1SNXA 2OZAB 3FZSA 4KKEA 4UZDA 5T68A 4DF3A 2JIVA 4C57A 4QQJA 4L53A 4PUZA 5C03A 4BGQA 3KN6A 2FSTX 3OEZA 4XEYA 3NUXA 3RK9A 4E4XA 5HI2A 5KBQA 4Y8DA 4YJTA 2PHKA 2UZUE 3PWDA 3RZFA 2VO6A 1BI8A 2X2KA 2XKDA 1JKLA 4HJOA 4D2WA 3UNKA 1PXIA 2HY81 4R7BA 4MWIA 4FT9A 3ZRLA 2VNYA 3HRFA 2OBJA 3P5KA 4KD1A 3C0GA 4DH8A 5ICPA 5I9ZA 4IJPA 4BRXA 3LKMA 3FY2A 2XJ0A 4N4SA 4S30A 4IX6A 4BKYA 4IFCA 5DBXA 4FTRA 4EQMA 1IR3A 4GMYA 4WNMA 5CF4A 2Q83A 1DM2A 4Q5HA 2J2IB 3NCGA 3KMMA 4R77A 1XR1A 3HP2A 5I9UA 3FMJA 3M2WA 3RPYA 3V3VA 4QMUA 2GHGA 4QPAA 3WYYA 4QTEA 4F6UA 3I0OA 3C0IA 1R0EA 4FG8A 3T9IA 3PP1A 1SVHA 5D7AA 2XNMA 4YZ9A 4NW6A 3U6IA 2OH4A 4EUUA 4ZSJA 2CGUA 4P2KA 5AAEA 5TO8A 2BDWA 4LV5A 1K9AA 1KV2A 3AD5A 3NSZA 4MXYA 4UBAA 4YPDA 5JFWA 3QTRA 2GHLA 2JIUA 3PVBA 3O51A 4OT5A 4DT9A 2Y0AA 3ZCLA 4I6BA 3AC4A 4UYNA 2PMLX 3CXWA 4P7EA 3PRFA 4AE9A 1Z57A 3DA6A 5LJJA 2CHLA 1BYGA 4L42A 2PVRA 5HVJA 3RAWA 4W4VA 5EW9A 3PA4A 4USEA 4KIQA 5GIPE 3GC8A 4QMTA 4AW5A 4FBXA 2FSOX 5AP7A 1ND4A 4G17A 3U9NA 3HAVA 2RF9A 4Y85A 5JQ8A 4I3ZA 4E8AA 2QHNA 3PJ3A 4V0GB 5G1XA 2YZAA 2J4ZA 3BU5A 1I09A 3V01A 1OB3A 3ZM4A 4DG0E 3C5UA 4ZZNA 3QTXA 4WG3A 3V5JA 4CYJA 3DGKA 4W4YA 4AZVA 1VYWA 4CEGA 3TZ8A 4A06A 4CTCA 3G90X 4RVMA 3DV3A 4Y46A 3VRZA 2BROA 3BBTB 2BRNA 2A1AB 4BYIA 2BZKB 4XP2A 3G9NA 4W4WA 3FI8A 4CFUA 1V0PA 5T6KA 4AW0A 3LCDA 2VX1A 3S4QA 3PVGA 3DTWA 2WGJA 2XKFA 3HDNA 3H0YA 3BU6A 2OG8A 5H8BA 2EXCX 2R3RA 3EFJA 3PJCA 3EQIA 4DT8A 4MNEB 3E64A 1TQIA 4J98A 5CNNA 3LXKA 5ANOA 3FKOA 4AGWA 3RCDA 5L8KA 2P4IA 2BPMA 2BZIB 5CU3A 2J6MA 5JEBA 4CZTA 4MF0A 4TKSA 4A7CA 2W4OA 3RP9A 3FZPA 3QUPA 4GT4A 2X81A 5CAVA 3ATTA 2B53A 3SW7A 4O96A 2DWBA 3QQLA 3SRVB 5DRDA 4EH7A 4L6QA 5IG1A 3PUPA 1WCCA 2JDOA 4DC2A 4GCJA 3FQEA 2W1ZA 4NIFA 5FM3A 1CKPA 4DBNA 2JLDA 4H39A 3R71A 4ACDA 4ASDA 4WT6A 2A19B 3E3BX 5HBHA 4TRLA 1YOLA 4G31A 3BE2A 3NEWA 4D4YA 4JIAA 1H4LA 3H30A 2QO2A 5KZ0A 4R3PA 2C5YA 3LFFA 5LMBA 5B0XA 2WOUA 3CIKA 3D14A 4I4FA 3GFEA 2UVZA 2F7ZE 3NRMA 2F2CB 4DEIA 5CAQA 3FLNC 5EW3A 4DLIA 4M66A 3DJ7A 4BN1A 4RJ7A 2FGIA 3AG9A 3GC7A 3MN3A 2GPHA 5IKWA 3D9VA 5A4CA 3HNGA 1L8TA 2SRCA 4NWMA 5HD4A 2R0UA 3VS7A 3E3PA 3GVUA 4IZYA 2BIYA 3RWPA 2R3MA 4LM5A 4TZRA 3WZUA 4E5WA 1YXXA 4Z55A 4CT2A 3WZEA 4ENXA 4D0XA 2OF2A 4FT7A 3V5TA 3RPSA 2VWUA 4C2VA 3JR1A 5M06A 4ZTNA 1J91A 2C6EA 1Y91A 4EH5A 1GZOA 3GCUA 3KULB 4EYJA 3S1HA 3F3UA 5CTPA 2HXQA 2WTCA 4HGEA 4OBOA 4D1SA 3OCTA 3TNHA 3O2MA 3NVMB 4ZSLA 4YP8A 1ZZLA 4FTOA 2XUUA 3FZTA 3R83A 4AAAA 2W7XA 3GBZA 2JDRA 4PL3A 1G8SA 2B9IA 2FH9A 4HGSA 4C4JA 4DGMA 4LRJA 4S31A 3COMA 4EWQA 3T3UA 4KABA 4U42A 1V1KA 4K8AA 3CSVA 5HVKA 4O84A 2I0VA 2H34A 3HMOA 2FSLX 4IADA 3H10A 3LIJA 3DKGA 3MJ2A 4F1OA 4RRVA 2YJRA 1O6LA 4FV3A 3F3WA 3QRKA 2X8DA 1P14A 3EKKA 3DJ5A 4RZVA 4ACCA 4C33A 3WE4A 1BI7A 1HCLA 1M2QA 2FO0A 4QP3A 4RLKA 5ANDA 3AMBA 3UOHA 1J3HA 3FXWA 5HO6A 4AA4A 3K5VA 3OW3A 3TNIA 4RSSA 5AWMA 1R3CA 5E8SA 1BL6A 2JAMA 2C68A 4E7WA 3ATSA 4EOPA 4AT3A 3PY0A 2ZM3A 4H36A 3AC8A 2ZM4A 4MX9A 3UOLA 2GNJA 4EKLA 4FYNA 3VUHA 1KOAA 2ESMA 4RFYA 4O0SA 5KUPA 4DFUA 3R9HA 4TPTA 4ZS0A 3U4UA 2OKRA 2ZOQA 2G15A 4BHNA 3MESA 2ZV9A 3D7TB 4IW0A 3F5PA 4EK8A 4Y95A 4RG0A 4OAUC 4H3BA 4MXOA 4APPA 3VUDA 4BCJA 4EH2A 3F66A 3BQRA 4J8MA 4IX3A 4G6LA 2CKQA 4S32A 3ZRMA 2VTTA 3R63A 4U5JA 2YM3A 5HBEA 3TXOA 4LOQA 4TYGA 1Z5MA 3V04A 4JBOA 3DXPA 3OXTA 4BZDA 2XRWA 2XMYA 4KBCA 3C5IA 4FKUA 3LVPA 2WMSA 3RALA 3OCGA 5AUYA 5CQUA 4BWPA 3BELA 1OI9A 3CTHA 3FI2A 2Z02A 1R39A 4FIFA 4RC2A 4BZNA 1R0PA 4C3PA 3G2FA 1P4OA 2XA4A 5CAOA 2W96B 2DQ7X 1B6CB 4IAAA 3KCKA 3F5UA 3GUBA 4G6NA 5GJFA 3FWQA 4AOIA 2B0QA 2HY0A 3QCSA 4LL0A 4D9TA 4YNOA 4IEBA 5ACKA 4RA5A 2I0HA 4ITJA 5D7VA 5EW8A 3QF9A 5L8JA 5A14A 1YWNA 3LJ0A 5DFPA 4I23A 3QFVA 4YZCA 4JDHA 3PY3A 4QMNA 4USFA 1DAWA 4HYHA 1VJYA 5AADA 1NVRA 5JGBA 2OJGA 4OW8A 3KF7A 3NAXA 4EQUA 4IFGA 3EL8A 4NT4A 1M7QA 3COIA 4QTBA 1V0BA 3SKCA 2YLEA 4L45A 4BDAA 4JG7A 4TW9A 4CZYB 2XNGA 3VS3A 1RQQA 4O7ZA 2E9VA 3ZXTA 4AFJA 4FL2A 3F3VA 3Q60A 2OIBA 2PULA 1TVOA 3LLTA 3R7VA 5F9EA 4LGHA 4NFNA 1QL6A 2PUIA 5CAPA 5M4CA 4M13A 2JBOA 4O7WA 1E1XA 5CEIA 3OWKA 3A2CA 4FL1A 4QT1A 4FEQA 4AZTA 1YRPA 1AD5A 1R78A 3QLGA 5KMLA 2YITA 4DCEA 2NNWB 4ANMA 1U54A 3I4BA 2QOOA 5IEYA 1YWVA 2C5OA 4LL5A 3QD2B 5HNGA 5FBNC 2WQEA 4EK6A 2CCIA 2R3GA 4FKQA 2ONLA 4OTWA 3FBVA 4FTJA 4GS6A 4L3PA 1PXNA 1M2PA 4MEDA 4PL4A 3PVUA 3IW6A 3ORMA 4X3FC 3T8OA 3BGQA 3ZYAA 1SMHA 4FZ7A 2ZMDA 3BEAA 2XVDA 1XBBA 3FC2A 3GXLA 4DINA 3U51A 1Q4LA 3V51A 5E4HA 3EFWA 3FI4A 2CSNA 1LUFA 4YC6A 2YIXA 3AC5A 2YA9A 4YC8A 3DU8A 3KRJA 2PVKA 3PJ1A 2UZEA 3KVWA 3R8UA 1NXKA 3ZUVA 3TKHA 3A99A 5DMZA 4DEDA 3D0EA 5E91A 3FZOA 2YM7A 3Q9YA 3EL7A 4FVPA 4MQ1A 3NS9A 2Q0NA 4NSTA 3ZDIA 4OLIA 1Q97A 5BVOA 5JZNA 1TQMA 4FTNA 5FDXA 3BX5A 4YHFA 5LMKC 3UP2A 5EI2A 4CQEA 2BRMA 3PLAE 2YABA 4ZSAA 2XKCA 3IW5A 3LM0A 5EDRA 4EHGA 5LCJA 4AGUA 4DEAA 4OTQA 4AA0A 5IUIA 3HAMA 5IA2A 1SYKA 4GU9A 2R4BA 4QMVA 3V6RA 2J50A 3DAEA 4S2ZA 1YWRA 4IC8A 5CU4A 5HE1A 3V8SA 2W05A 2ZAZA 4NKSA 1KOBA 4YLKA 2B9HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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