4O38A

Crystal structure of the human cyclin g associated kinase (gak)
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
310
structure length
267
Chain Sequence
QSDFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDVGSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFLLLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLLLSNQGTIKLCDFGSATTISHYPLYSNFPIGEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNPEERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the human cyclin G associated kinase (GAK)
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-G-associated kinase
total genus 71
structure length 267
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4o38A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4o38A01
3P86A 4MNEB 4O0UA 2WMXA 5HVJA 4IH8A 5M44A 2VTJA 2OJGA 3FC2A 4M66A 5CAUA 2I0HA 4EH6A 5CANA 4L42A 4IXPA 4X3FC 2PSQA 5A9UA 2XA4A 2WELA 4FUXA 2JDRA 4JQ7A 3SRVA 3UYSA 1GZOA 4ACMA 2YZAA 3R9NA 3CQEA 3R0TA 4AE6A 2OZAB 3ORIA 3Q32A 1CTPE 4EOLA 1JQHA 4YR8A 3FLQA 4EYJA 3FLNC 5DIAA 1H1RA 1Q97A 2UZOA 3ZC5A 5LQFA 4BTKA 4FV6A 3BELA 3H10A 4IANA 2P33A 4YSJA 4YURA 3TDVA 2PULA 3HMPA 4Y83A 2VO7A 5AA9A 1YOJA 3LJ2A 4YHTA 4Z16A 4J8NA 3WIGA 4Q9SA 1LUFA 4XX9A 5E9EA 3W2CA 3HV3A 3BX5A 5HU3A 4XG2A 3H9FA 2ONLC 3MH3A 4MQ2A 3FLZA 1WVXA 4G1WA 4N6ZA 1OL7A 2W1EA 4AZTA 4IAAA 4R5YA 4YZ9A 5HVKA 4UN0C 1R0PA 5L2WA 4B8LA 3BHYA 2ITTA 2UZVA 4XEYA 3UO5A 5EDRA 2HAKA 4IWDA 4LRMA 4O2PA 4UWYA 2OLCA 3HMIA 2HENA 5E92A 3W8QA 5HNIX 5EK7A 2HYYA 2YJRA 4ACHA 5HD7A 4I24A 2BTSA 3UNJA 4ZY6A 4A9SA 3HP2A 4BC6A 5LVMA 2XNEA 5HVYA 1AQ1A 2XKEA 4P4CA 4CEGA 4KSPA 3VVHA 4ENYA 4EOOA 1Q3WA 3L1SA 5JQ5A 3DTCA 2XIRA 4L43A 2PVNA 2VWWA 4EK3A 3R30A 5A4QA 2VTQA 1ERKA 3FSFA 1BI7A 4ZJIA 3UIUA 3F5PA 4GFMA 3GGFA 1SVHA 3HV4A 2C6IA 3C1XA 4D2WA 4DF3A 4QNYA 3OXZA 3QRTA 4K1BA 5K4JA 4IM0A 5CVFA 1E9HA 3MY5A 4O6LA 1GIHA 3MPMA 4V0GA 1A06A 3TCPA 2JDSA 4FBXA 4CMUA 3KMMA 5HO6A 1PMVA 2HY81 3D7TA 5K0XA 4KS8A 4GUBA 4U41A 3NNUA 4ZLOA 5LVOA 1OL1A 5EYMA 3UMWA 3EZVA 1W84A 4LG4A 4LYNA 3CKXA 4TXCA 4XBUA 5CI6A 2NRYA 3Q04A 2C6MA 3KVXA 5LWNA 4MXAA 4V05A 4I6QA 3RBWA 1IAJA 3CD8A 3I79A 3MVJA 3MVHA 2BRBA 3A60A 3ALNA 3NCZA 4PY1A 4C02A 3LFCA 2ETMA 4MYGA 4C4EA 4USEA 4FF8A 1GZ8A 2YCQA 2OFUA 3PYYA 2G1TA 4BIEA 1YHVA 4ZLYA 1ZY5A 5KHXA 3KXGA 4NYEA 4G2FA 3ZO2A 4O83A 2I40A 4KD1A 2PVKA 3FMEA 5EW3A 4M84A 5KZIA 3PG3A 3POZA 1PY5A 4TRLA 4WSYA 1UA2A 3NS9A 2IG7A 1Y6AA 2QONA 5CT7A 4CXAA 3IQ7A 3P5KA 3DK3A 3C4CA 4HCVA 2JBPA 4QPSA 2JITA 2W17A 3O7LB 4BCGA 4QMQA 3ORXA 3P7BA 1G3NA 3W2PA 3UVQA 4ASZA 2ITQA 5DNRA 4W8EA 2X8DA 3IOKA 2XBJA 1OIRA 4QMUA 3L9MA 3LCDA 4RIWA 4RA5A 2BHEA 3PPZA 4WUNA 4ZSLA 3HAVA 4FSRA 4QRCA 4C3FA 3NUSA 3R7YA 3RMFA 2PZIA 4DAWA 4EC9A 3PXYA 3Q5IA 4O22A 1KOAA 3MFSA 4RIXA 2XVDA 4YBJA 4AW2A 2PZ5A 2QOKA 4KSQA 2XF0A 1IAHA 2WTCA 5E91A 4IFGA 2VTAA 3QC9A 4FTRA 1DS5A 4YHFA 3LLTA 3ZLYA 4DTBA 4R8QA 3D94A 1OUYA 1U46A 4CRLA 3VS7A 2VWVA 4UEUA 5I9UA 3OEZA 4D4YA 3V5WA 4AG8A 3PJ1A 4BYIA 5M57A 2A27A 1GAGA 5BVDA 4NK9A 4G3GA 3R1SA 2QOCA 1OKVA 2C0TA 1YW2A 5EHLA 4CQEA 2YM4A 3HGKA 3KY2A 4AF3A 3ET7A 2WGJA 2PVMA 3BV3A 3R7UA 3L8XA 1B6CB 3TEIA 3WE8A 1XWSA 4E26A 4DE4A 2XJ1A 3OD6X 1A9UA 3ALOA 4IACA 3WZUA 1P4FA 4EOIA 3MJ1A 4X6RA 4CMOA 2QNJA 2ACXA 4XV9A 4GT5A 5E8TA 2FO0A 1UWJA 5JZNA 4O7NA 4IIRA 2A2AA 4OTIA 3TZ9A 4B4LA 1CKPA 3OT8A 4UZHA 4U40A 3VRYA 2YZLA 2ETKA 3U87A 2B54A 2J0MB 2ZMCA 1ZOHA 3DBFA 1OKZA 5AWMA 3SOCA 2R3NA 5CVGA 4XJ0A 3UQCA 3I5NA 4GG7A 4YZCA 5DYJA 2CGVA 3FKLA 4ZS4A 3FQHA 1RQQA 5BVNA 2Z02A 4LV8A 2C1BA 3DFCB 4J98A 4DTKA 3EYGA 4TYGA 3CTQA 1H0WA 4FT9A 3SKCA 4C61A 3MPTA 5G1XA 2ZMDA 2BVAA 5E8SA 2VTSA 3E62A 3U6JA 5CQWA 3QYZA 3KRLA 4PPBA 3BWFA 2G2IA 5AV2A 4GV1A 4FTLA 3F6XA 4DG0E 4CCBA 1J7UA 3JS2A 4FG9A 3B8QA 4F70A 3LQ8A 1ND4A 3KC3A 4NZWB 4I5HA 3HZTA 4Y5QA 3W32A 4JRNA 3SW4A 3R01A 3SXFA 3HV7A 2C3KA 4R1YA 5JT2A 3LJ0A 3IG7A 1J7IA 4TW9A 5JRQA 3FMMA 2BDJA 5C1QB 2R2PA 3UIMA 1O6YA 3JVSA 3I0OA 2ZV8A 4CYJA 4EOMA 4F63A 3MESA 1O6KA 2XIXA 4IW0A 4RJ3A 3ZHPC 5ETIA 5A6NA 4IAZA 4BDAA 4FKWA 4U5JA 2ZVAA 4IM3A 2VAGA 3RM7A 2JC6A 2QR8A 1YVJA 3ITZA 2YIQA 4RBLA 1P14A 2VZ6A 4RWJA 4X3JA 4RC3A 2GPHA 2BDFA 4U9AA 5KZ0A 1VYWA 4L68A 1OITA 4JX3A 4BRXA 2A0CX 1TQPA 3QQFA 4EK8A 2Z7RA 4DH1A 1M14A 4OAVB 5L2TA 3R8LA 3V5QA 2RFDA 3Q9ZA 4AZFA 3NDMA 2RF9A 5F95A 3FY0A 5IMEA 1U59A 2ZOQA 4ZSJA 1KE8A 2W1DA 1OGUA 4WHZA 3CIKA 3O50A 5KHWA 3FYJX 4O7RA 5EH0A 3N4VA 4LMNA 4GVAA 4D9TA 1JKLA 5FD2A 4AAAA 3B2WA 3NLBA 4X2FA 4FKOA 3WYYA 3R9RA 3O0GA 3CC6A 1H26A 1OL6A 2BZIB 3F66A 4MXXA 3TN8A 3ZLSA 4RX8A 4NIFA 3RVGA 2BTRA 3QHWA 3SGCA 1V0OA 5T68A 1YWNA 2I0VA 2C5XA 5CU2A 5EM7A 2C6EA 4IZ7A 4ZTQA 5CNOA 3LMGA 2XNGA 4HGEA 4P90A 4XOZA 1VJYA 4RFZA 4BWXA 2BIKB 2WQEA 2YN8A 3NYVA 2GHMA 4Y85A 4BGHA 3H3CA 4JJRA 4TWCA 4IX5A 3GXLA 4FSTA 4XG3A 4CFWA 4AW1A 4G3FA 4BBFA 4L9IA 5JSMA 3LM5A 2X1NA 2BRNA 4NCTA 3WBLA 4FKJA 3PJ3A 3FL4A 3QX2A 4FTOA 4CSVA 1DAWA 2WU6A 3PLSA 4MWHA 1FMOE 2PVHA 5EG3A 4GCJA 5CF4A 4IAYA 3MN3A 4RC4A 3U9CA 2QVSE 3V8TA 4R1VA 1E1XA 1XQZA 1OL2A 3O2MA 3DT1A 3FZRA 3KXXA 2J50A 1OZ1A 4J1RA 3ZYAA 5IEXA 2XH5A 3TT0A 4BN1A 3RAKA 4YSMA 3FSKA 5J79A 3TUBA 2IW9A 2Z8CA 4KBAA 3VF8A 5IQCA 2J6MA 3F7ZA 3OZ6A 3GC0A 4B9DA 2F9GA 4MAOA 2PPQA 4F9BA 4BBMA 4PL5A 4IX4A 3CLYA 4CVAA 3AG9A 5ACKA 4QTDA 3CSVA 3TZ7A 4E3CA 5A4EA 1I44A 3HEGA 3LCOA 3EB0A 4FTQA 1K9AA 3KF7A 4QPAA 3AT4A 2ETRA 2CCIA 4MF0A 4GRBA 5KO1A 3PJ8A 2PUUA 4IADA 4QQCA 4E8AA 1UVRA 3CBLA 4GFOA 3SAYA 4Z55A 2GDOA 4IVAA 1OL5A 2QKWB 2RL5A 3PPJA 2VO3A 4FEQA 4DFZE 5IA2A 3MIYA 3P7CA 2OG8A 4QP1A 5CALA 3AT2A 4BKZA 4I92A 3A7GA 4NT4A 5GIOE 4D5HA 4ZP5A 4GT4A 1L8TA 4UYAA 3MY0A 2BROA 3N4TA 2Z60A 3IGOA 2YDIA 4FOBA 3VRZA 4X2JA 5I9ZA 2F49A 4TWOA 3QTIA 3OWLA 2OIQA 5AUYA 3TXOA 3UPZA 1F3MC 5J1VA 4IFCA 3FLYA 5DBXA 5EHOA 3OTUA 4QYEA 2W4JA 4CT1A 4PDOA 2OSCA 2Q0NA 4E20A 1GNGA 2QU6A 4BDDA 4C37A 4OTRA 4EHVA 2GQGA 4YZMA 1HCLA 3SX9A 4A9TA 4AN2A 4RC2A 3UJGA 4DCEA 5IUGA 5BYLA 4AA0A 3LFQA 4XBRA 5CLPA 4FKLA 3NSZA 4I4FA 3KXHA 3SHEA 2VN9A 5CSVA 3RTPA 4IDVA 3LAUA 2YEXA 4NSTA 4H05A 2CN8A 2R3PA 2QOFA 3PE2A 4TY1A 2XBAA 4GYIA 4NM0A 2WU7A 2HW7A 2G01A 2XJ0A 3FYKX 5A3XA 5GIPE 1IR3A 3VO3A 2CHLA 3LFDA 4IAFA 5EKOA 3R9DA 3CR0A 4FTMA 1Q8WA 5IU2A 1URCA 3I6WA 3N51A 4TYEA 3R63A 3I6UA 3RINA 3UOHA 3ZFXA 4APCA 2P3GX 4ZZNA 3HDMA 5CWZA 3QKLA 4FNYA 3RAHA 3E88A 4KBKA 4ZS0A 3EN9A 4O7LA 3BEAA 3R04A 4NFNA 3UIBA 3LFSA 4GL9A 2FSMX 3IOPA 4RZWA 5EM5A 4J96A 3UOLA 4Y5HA 5HX6A 3I7CA 4FNZA 5FTQA 1PMNA 5C27A 4IMYA 4ZY4A 2B7AA 4PPAA 4HOKA 5C03A 4ASEA 2XB7A 5KKRC 2CLXA 3T9TA 4HPUE 3KEXA 1U54B 5DR9A 5B2KA 3PIZA 1OPLA 4I5CA 4PMTA 3UZRA 4M3QA 3RWPA 4FNXA 3PIXA 2IJMA 5E7RA 4OBQA 2YFXA 3I60A 4CFUA 4DEDA 3QZFA 2F7ZE 2KTYA 4XLVA 2R9SA 1Q8TA 3VHEA 1BKXA 1Y8YA 3DDPA 5DT0A 4I5PA 3M2WA 5I3RA 2ZYBA 3BGQA 3W16A 3ORNA 2B9HA 3QGWA 4TPTA 4F0GA 3I4BA 4CKIA 4D55A 5KE0A 1XKKA 2W5BA 5C8NA 1KE5A 4RJ6A 4F4PA 4LM5A 2ITZA 2WOUA 2VTRA 3LCTA 4O6EA 2R3RA 5H2UA 3E92A 3ETAA 3N9XA 4LMUA 4NUSA 5K9IA 3I1AA 3A4OX 5AADA 1ZZ2A 3E7OA 4BB4A 2JKOA 3PSBA 4BYJA 4WBBB 3ENMA 4JOAA 3ULZA 4AACA 4YJTA 4DTAA 4DH7A 3TKUA 2EXMA 5DR2A 1PKDA 4HVHA 2YLEA 3MVMA 4TL0A 3ZBFA 3FC1X 3BE2A 3R7GA 3QTXA 2HOGA 4JI9A 4E4MA 4DEBA 3WI6A 2C5NA 1V0BA 3MFUA 2R3IA 4XRJA 5EI8A 1J91A 3F69A 4AUAA 4LGHA 4GU6A 4PV0A 4RLKA 5AUUA 3MW1A 2BAKA 3PY1A 2R3JA 4GIIA 1GZKA 1YRPA 4EWQA 5AX9A 3ZDUA 3EKNA 3VBXA 4AZSA 3KREA 4O7TA 2VTIA 5B7VA 4ZJJA 1FGKA 3LXKA 4BBEA 2ITWA 5J7BA 3UDBA 3KFAA 5FXRA 3NW7A 3OBGA 1A48A 1SNUA 2WQOA 4EOKA 3U54A 4EZ5A 3GCUA 3BRBA 3FLSA 3UC3A 2IW8A 3SW7A 3R8UA 1Y8GA 2BPMA 2GS2A 4QYHA 5IA1A 3KRJA 4J8MA 4RIYB 5HCXA 1OECA 3VBTA 3DLZA 3A2CA 3R1QA 4GEOA 5FEDA 2XIKA 4F09A 2V0DA 4Y95A 1Z57A 2WAJA 5IQAA 3KRWA 2BALA 4FKGA 4TKSA 4RSSA 4Q5HA 2PMIA 5I9WA 5IA4A 5KMKA 1M2QA 3SA0A 3BQRA 4FKIA 2ITUA 2JFLA 3LPBA 5HG8A 5LCJA 5B0XA 5AP3A 4A4XA 4ZAUA 2C47A 2W4OA 2JLDA 4DFBA 3IW7A 3QUPA 3BU5A 4FZDB 2JFMA 4IBMA 4X0MA 5GJDA 4YTIA 4ASDA 2PMNX 5FXQA 4LOPA 4QMXA 1CM8A 4X2GA 4CG8A 4K18A 3FY2A 3ID6C 4RJ8A 3C4ZA 2W1HA 3HYHA 4DC2A 2YDKA 2QCSA 4D4SA 2O8YA 3IECA 4YC8A 3V8SA 1QMZA 2ZDUA 4Y73A 4K0YA 4Z9LA 5DVRA 2PVFA 4EH2A 2ITPA 4A07A 4NM3A 1PHKA 2ESMA 2Y4IB 4P7EA 3PA4A 4JDKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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