4OTIA

Crystal structure of prk1 catalytic domain in complex with tofacitinib
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
335
structure length
303
Chain Sequence
RKSPLTLEDFKFLAVLGRGHFGKVLLSEFRPSGELFAIKALKKGDIVARDEVESLMCEKRILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLMLHIHSDVFSEPRAIFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTEGYVKIADFGLTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSERDAEDVKKQPFFRTLGWEALLARRLPPPFVPTLSGRTDVSNFDEEFTGEAPTLPPRDARPLTAAEQAAFLDFDFVAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of PRK1 in Complex with the Clinical Compounds Lestaurtinib and Tofacitinib Reveal Ligand Induced Conformational Changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase N1
total genus 88
structure length 303
sequence length 335
ec nomenclature ec 2.7.11.13: Protein kinase C.
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4otiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4otiA01
4Y5QA 2HYYA 3BBTB 4QMXA 3VS7A 3MY5A 4ALUA 4X7QA 4BHZA 2YA9A 2ZDTA 3BYVA 3MVMA 3RWPA 3P1AA 3A8WA 4G6OA 1YQJA 2NP8A 2VTJA 5G6VA 5GJFA 2CPKE 4AE9A 4X6QC 3ORXA 2WQBA 5I0BA 2VTQA 3FLSA 5AR3A 2B9JA 4G6NA 4V01A 5CAVA 1H8FA 4BVUA 5IQGA 4FZ7A 3R02A 3KU2A 4LQMA 3FLYA 2YLEA 3RGFA 4A9UA 4GU6A 5M53A 5DI1A 5LMKA 5HE3A 3MH1A 4CLJA 5E8YA 3FSFA 3H30A 3REPA 4NM3A 5E8SA 3T9IA 4I94A 3D0EA 3IG7A 4ZLZA 5K5XA 3VUDA 3O8PA 2UUEA 3NR9A 3DK3A 4DT9A 4USDA 3I7BA 4CT2A 4V0GA 3EN7A 4CZYB 2E9OA 3EQCA 4FSMA 3E87A 2WELA 3VS4A 4XX9A 3QRTA 2V7OA 5A46A 4M66A 2ETRA 1H0WA 2B9IA 5FGKA 3HV7A 3FMDA 4V0GB 4TYEA 2VWIA 4USEA 2C5OA 2XNOA 3R9RA 1ZYDA 4AZWA 1KV1A 5C4LA 3G0FA 4NJDA 4EOMA 3QGYA 3Q6UA 3FZPA 4MNEA 5B7VA 5ACBC 3RNIA 4BCMA 2YLFA 3HA8A 5FQDC 2C6DA 3MESA 5EKOA 3PY3A 4D2RA 4NZWB 2YM5A 4HVIA 4FV7A 2IVUA 4UMPA 4DGLC 1TQPA 4CCUA 3GU8A 2GFSA 3R9DA 2HENA 5CXZA 4EJ7A 2WMBA 3F3ZA 3QTRA 2OO8X 2CKOA 3IW7A 3DCVA 4CKJA 4J53A 2XF0A 4MNEB 3PFQA 1XQZA 4NCTA 4PV0A 4P4CA 3KEXA 4IBMA 3OFMA 1KE9A 2VAGA 2I40A 2BKZA 2ITTA 2YM6A 3ELJA 2GS6A 1KOBA 4P5ZA 3WARA 3DDPA 3I0OA 4BBEA 2OH4A 4NTSA 3U87A 3ZDUA 5GINE 1Q24A 4I5HA 3S1HA 1PMVA 2YERA 1NT2A 3F2RA 3V6SA 4HGLA 1HCKA 2ITUA 3AMYA 3DQWA 4C37A 4YC8A 2B55A 5L2IA 4DH8A 3I1AA 5TR6A 2I0VA 5IH4A 4YO6A 1UKIA 2FSOX 3I6WA 4EYMA 4XHKB 3R8PA 2QG5A 4CFFA 2YCQA 3E8EA 1ZRZA 2HAKA 3I60A 5EG3A 3FQSA 1OIQA 2JGZA 3HV3A 4YGAA 4O7VA 3LCOA 3FY0A 3G0EA 1KV2A 3R2BA 4WOVA 4O7WA 2Y4PA 4Y8DA 3PJ8A 4TN6A 3FKLA 5CEQA 3RAKA 3AT3A 1M52A 1LR4A 3IPHA 4AGWA 4FG8A 4LUDA 3IECA 1PF8A 5CZIA 4E6DA 2ITYA 3RAHA 3ANQA 3CS9A 4DFBA 4BY9E 4RC4A 3MPMA 1Q8TA 4R6VA 5J5TA 2V22A 1NY3A 5FBNC 5LCJA 3OEZA 4UWYA 4XRLA 4LV8A 5CEPA 1IA8A 2YIRA 3PZEA 4OTWA 4X2GA 5HTBA 3R6XA 3KB7A 4GUEA 3AC2A 3WF5A 2XNPA 3RAIA 4BGGA 4TXCA 3QC9A 4CQGA 2HY81 4HPTE 5K9IA 4X3JA 3DNDA 1FBNA 2J9MA 1OPLA 4HW7A 3I5NA 4DLJA 2J50A 5JFXA 3A60A 3WIKA 4F7LA 3NSZA 4N6YA 4ZTNA 4IB5A 3A7HA 3MB7A 3GU6A 5CNOA 4YZNA 3KXXA 2KTYA 3E3PA 4C58A 5AP2A 1VJYA 2P4IA 4W4WA 3EIDA 3ZXTA 1KSWA 4H3BA 4JDIA 2Y9QA 4IXPA 1TKIA 3DBEA 5I3RA 3BV3A 3E8CA 5I4NA 2BALA 1DS5A 2JDOA 5ETAA 4LRMA 2C6EA 5D1JA 2BDJA 3FYJX 1FVTA 1OL5A 4YHTA 3DKOA 3FHRA 3EFLA 3SXRA 4L01A 3PIZA 4BBMA 3KMMA 3KULA 3JYAA 4GCJA 4QYGA 4X2JA 4I21A 4MH7A 3D7TA 5JQ8A 3KKVA 2ZV2A 4MQ2A 4BI1A 5E8TA 5ANIA 3DAEA 5F94A 4EOLA 3EQFA 5B2MA 3C4EA 4PP7A 3F3TA 1OL6A 3QA0A 4N0SA 3ANRA 4X2NA 3QTIA 5EI2A 2VWBA 4TRLA 4FT3A 5KMLA 4GUBA 3R30A 4BGQA 4BC6A 3D7TB 4IANA 5HE0A 2NO3A 1Q99A 3OZ6A 4E26A 4ENYA 4JT3A 1YDRE 4QMWA 4DH7A 4H39A 4XJ0A 4GIHA 3TL8A 2OBJA 4D5HA 5HBJA 1LEZA 4OTHA 4KWPA 4TYGA 4QTEA 3PSBA 5BUIA 3ZS5A 2F2CB 1NVRA 4GK3A 4QNYA 3Q5ZA 5AAGA 3KQ7A 2QKRA 4D9UA 2BIYA 4EH2A 1UNHA 5EDPA 3OCSA 1RE8A 2BMCA 4IVDA 3V5PA 1L8TA 4H36A 2W1IA 2VUWA 3BIZA 4QRCA 4K18A 5D10A 4F0FA 3LJ0A 4K0YA 3FZRA 4KNBA 5IUHA 3OW4A 4JR3A 4L00A 5BNJA 5KMMA 1URWA 3Q5IA 3SXSA 3N4TA 2UZWE 3DK6A 4AGUA 4CGAA 5HICA 4MHAA 1H26A 3F5PA 2YIXA 3QKMA 3OD6X 5IEVA 4ZEGA 1UU9A 3QQJA 3SW4A 2C1AA 2OIDA 3P86A 4G3DA 3FKNA 4PTEA 2IVVA 4EH8A 3BEGA 3DZOA 2JKMA 5CQUA 5AA8A 4IC7A 4HCTA 5L8LA 5DYJA 4LL0A 3ZLSA 4EOKA 2UW5A 2UZDA 3R7OA 5AP7A 3ZH8A 3LOKA 4O6LA 4EH9A 2XKDA 3P78A 5JFSA 4YTHA 1I09A 3Q04A 3RK7A 4AW2A 4S31A 3UQGA 4XG2A 2QVSE 4Q5EA 4RJ6A 4C4IA 4FEQA 3BKBA 1TQMA 3KXNA 4IDVA 2WB8A 4L7FA 4AOTA 4RZVA 4YURA 1VR2A 3Q4UA 2C6TA 3IW4A 3LAUA 4E8AA 1OKWA 4C61A 4AZFA 2F49A 3VS1A 3LVPA 2PUPA 3COHA 1UWHA 2YZLA 4IFGA 5I9YA 4FR4A 3DPKA 2W4JA 3P23A 4K33A 4XOYA 4ZZOA 2BRHA 1SZMA 3BU6A 3UO4A 3WBLA 2C69A 3DBCA 3EQGA 5M51A 5L8JA 4FGRA 3F66A 3QL8A 1J7IA 2QD9A 4M69A 1JQHA 4QMUA 4QMTA 3AXWA 2W1EA 4I92A 3LLTA 4YJRA 3R7IA 3MYGA 5IH5A 2UW3A 3NDMA 5CT7A 4C3PA 2IO6A 3M2WA 2WEVA 3O0GA 4UWCA 4M69B 3LKMA 3V8SA 2XK9A 3HV5A 5JQ5A 3LFAA 4IW0A 3W32A 3CTQA 3PXFA 2X9EA 4FTKA 3NGAA 4RVKA 4XG6A 4C8BA 5JMSA 3UQCA 5J9LA 4CVAA 4O21A 1QMZA 5AR7A 5HG7A 3OWLA 4G34A 1OUYA 3RP9A 5C8KA 4U41A 4XV9A 2R2PA 4RA5A 2CDZA 3Q2MA 1SVEA 2JDRA 3OUNB 4YO4A 2QO2A 4CV8A 4R7BA 4CXAA 2P33A 2WOTA 3PA5A 3PIYA 4UZDA 3MH3A 2OH0E 3UPXA 4BTMA 3TIZA 4DEAA 1WBNA 1M7NA 3CXWA 4U81A 3A61A 3RALA 4D2TA 4EONA 3TUDA 2EWAA 3HEGA 5DLSA 2UVZA 2YIYA 2G15A 4YZ9A 5LVOA 4ZK5A 1Q4LA 2OFVA 3CE3A 3NW6A 5HOAA 3TI1A 1G5SA 1SM2A 4A7CA 3ZZWA 4BTKA 1H1WA 4A4LA 4AU8A 3OTUA 3CSVA 4M7IA 5EYMA 5AX9A 4ACCA 2ETMA 2FUMA 3QCXA 4EEVA 4AT5A 3ENMA 1H4LA 3B2WA 5AP5A 3WZEA 4ERWA 4NIFA 4PPCA 4I5CA 3N4VA 4G6LA 3TV7A 2UZTA 3CLYA 4CRSA 2XK7A 2XKFA 3JXWA 2EXCX 3H0ZA 5HX6A 4F0IA 2QQ7A 3KK9A 3VS2A 2XM9A 3O7LD 3FI3A 4OGRA 4NIFB 3OP5A 4AP7A 3R7VA 1IEPA 3BCEA 5HQ0A 4C4FA 3FPMA 1V0BA 1BUHA 3MTFA 1KE8A 3PY1A 4BCQA 5J95A 2RG6A 2W05A 4FEXA 4FVQA 3TKHA 3CR0A 4F9BA 4KBAA 2QOLA 4PPAA 5A6NA 1H28A 5BMMA 3PVUA 3OCTA 4QP4A 4D4YA 2UW8A 3BQRA 1TQIA 4WNKA 2PVFA 2IVTA 3R9NA 3W8QA 3RCJA 5IDPA 2W9FB 1OIUA 1JLUE 2HELA 3MA3A 3W2SA 5BMSA 5J7HA 5EI8A 1R0EA 3GC8A 3ZO2A 2W9ZB 5AP1A 4G5PA 2OI4X 4EBVA 1GZKA 3VBTA 4IM2A 3QZFA 3Q9XA 2WQMA 1J3HA 1GIJA 4I6FA 2Y6OA 3SC1A 2YHVA 3A8XA 4PL5A 3ORKA 4C4JA 3LFSA 2R3MA 3H9RA 5CVHA 2LAVA 4FT0A 5CENA 4FIHA 4XG7A 3G9NA 4L3PA 1CDKA 3LCSA 3UQFA 3UIXA 4R1VA 4U45A 3ORNA 4I6QA 4D2WA 5AUUA 4DE4A 2O3PA 4KABA 5CAQA 3QTXA 2QODA 1ZAOA 3DXNA 3QKKA 5FTQA 3OOMA 2XRUA 4B8LA 3UP2A 3U54A 3HMPA 4IX4A 3UNZA 4FVRA 4I22A 2VO6A 2ZJWA 4G3CA 3HX4A 3H9FA 3UNJA 2YM8A 4V05A 5DVRA 3V5WA 2ZDUA 5CEIA 2EU9A 4DG3E 3HV4A 3ATTA 1H1QA 3KRJA 3TDWA 2J0JA 3IQ7A 4GL9A 5CU6A 5BYLA 4OW8A 4ZTSA 3F3UA 4I20A 3R04A 2OZOA 4CQEA 3W8LA 5FTGA 5C8MA 4Y5HA 2WQOA 4FT5A 3VBVA 1FMKA 3DKFA 2VTMA 3LQ3A 2W1DA 3OY3A 2BFYA 3QKLA 4M12A 3OCGA 5TOZA 4I93A 5EHOA 3A7FA 5D41A 3CIKA 3OG7A 5HO8A 3U9CA 3W33A 2B7AA 5EHYA 2C5NA 3KXZA 4ZTRA 5BUEA 4AN2A 1RW8A 1XJDA 3BWJA 3COMA 5KZ0A 4ANOA 2WD1A 1H1SA 3PVWA 4XP3A 5A4EA 4XG8A 3D2IA 4ID7A 4IADA 1J7UA 4EWQA 5KMIA 2BTRA 4O7NA 4M0YA 5CLPA 4WNMA 3TT0A 4ACHA 4EZ3A 4RRVA 5J9ZA 4FL2A 4FODA 5KX8A 2Z7QA 5HESA 4AOIA 1I44A 3TV4A 3LMGA 4O81A 5LOHA 4HJOA 4EK5A 3PE1A 3VO3A 2BRBA 3UO5A 1U54A 2J90A 4FKGA 3UNKA 2V5QA 1H00A 3EQBA 4FK3A 3FBVA 4LOPA 3ZTXA 1OMWA 4WG3A 1CM8A 3MJ1A 4FZAB 5AUYA 5M4IA 1YDTE 4O0VA 4AG8A 4E73A 3UG1A 5M07A 1XH5A 2XZSA 4RQKA 5HVKA 4OT6A 3DAKA 3HRCA 5LARA 2C6OA 3ZLYA 1WMKA 4JAIA 2ZAZA 3FPQA 1WBOA 5GJGA 5AM6A 2BVAA 2O0UA 4GT5A 5A54A 3LFBA 2J0LA 4YLJA 2F7XE 4A06A 2GNJA 3KN6A 3PJ2A 4IHPA 1UU3A 3RPOA 5AR5A 1BKXA 2VWVA 3ZM4A 3SG9A 3OBGA 3WZJA 1BI8A 3IS5A 5ETCA 3VF8A 4ITJA 4YJUA 3TG1A 2HZIA 1JNKA 1F3MC 1A48A 5DMZA 1GNGA 3SQQA 4IB0A 4NFNA 4RWIA 4II5A 4M14A 4I4FA 4QTAA 1KOAA 4D4VA 4PNIA 1DM2A 2ZM3A 1K2PA 2VO0A 2PVYA 3BHHA 3O7LB 4L52A 4RJ3A 3CGFA 4YZBA 5ETIA 4YU2A 3VUHA 3OVVA 4TWNA 1NA7A 5J5SA 4HYIA 4PNKA 2CJMA 3QUPA 4NM0A 5IQCA 2YAAA 3D5VA 3ZHPC 3RMFA 4LGDA 1JKLA 3ZSHA 3VQUA 4DH5A 3D14A 4PDSA 4UN0C 3TM0A 3V6RA 1IR3A 2JIUA 2X8IA 5EI6A 1KUTA 1XH7A 4DTBA 3C4CA 2FSLX 4O22A 3IOKA 5JFVA 4MKCA 3QQFA 4AZSA 5FD2A 2GS7A 2F7ZE 4GFOA 4LG4A 2E9UA 2QI8A 2QOQA 4G9RA 4O0YA 4AE6A 4C62A 3QBNA 4LRJA 4D1XA 1PXMA 4P2KA 2GQSA 4D28A 3RBWA 4BWKA 2XEYA 3ZOSA 4O1PA 1BL7A 5E4HA 3R7EA 1XBAA 1ZOGA 2UW6A 2ONLA 3QWJA 1OL1A 2Q0NA 4C2VA 3MN3A 4JOAA 3MGYA 4RBLA 3Q32A 3RPSA 3KA0A 4U97A 5DGZA 3NMUF 3PWYA 3FJQE 4M13A 5CNNA 2W4KA 1BYGA 2X6EA 3C4ZA 2WTJA 3LHJA 4QMSA 2GS2A 3FE3A 5AV0A 3ET7A 5HIBA 5I3OA 3ZUVA 5IEYA 1XH9A 3BGZA 5KMKA 3DKGA 2Y0AA 3IW6A 2LGCA 2YACA 3VULA 5E8VA 4ZY4A 4FSNA 4IFCA 5CTPA 1E9HA 3V5JA 3GGFA 2CKQA 3VW6A 3F5GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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