4PQNA

Itk kinase domain with compound gne-9822
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
259
structure length
240
Chain Sequence
VIDPSELTFVQEIGSGGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEASVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGFPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAAI
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Property- and structure-guided discovery of a tetrahydroindazole series of interleukin-2 inducible T-cell kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
total genus 84
structure length 240
sequence length 259
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4pqnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4pqnA01
3L1SA 5CSPA 2VGOA 4KD1A 3ZDIA 3UODA 3WYYA 4FSTA 4EBVA 5FBOA 5BQ0A 4BTMA 4UV0A 4JQ8A 4ZJVA 2OJIA 4QTCA 4F99A 1PKDA 2JIIA 3PP0A 4B0GA 3D2KA 4F6WA 4QP9A 4OT6A 2F49A 2V55A 3I4BA 3SW7A 1YOJA 4QMOA 4GKHA 3PIZA 5E4HA 2YCSA 3ZDUA 1SVEA 3VHKA 1Z5MA 4CMTA 4XMOA 3LZBA 3E92A 4MXAA 2PZ5A 3W8QA 4DG0E 3NUNA 4NH1A 1YXSA 3NSZA 3FI3A 4WUAA 4OTQA 2P3GX 3A61A 5AA8A 1EH4A 2UZUE 5CU0A 4KINA 3KFAA 1ZRZA 4Y8DA 3P86A 5BYLA 1JBPE 3QGYA 4BTKA 3BQCA 1YI4A 1OPKA 3H0YA 2OI4X 4FZAB 3LXPA 4QMTA 5CNNA 5A4TA 4C3FA 2J5FA 5CS6A 2J0MB 3LIJA 3Q9ZA 5HCXA 3VW8A 4PMTA 2YIYA 1GOLA 3IW4A 2R0UA 3JPVA 4P90A 5A4EA 4YJPA 1JKSA 4QP3A 5FM2A 4DEIA 4FSZA 3BBWA 1J7LA 4NZWB 4JDKA 3QYWA 4L42A 4X6RA 2XK4A 3TDWA 3BLHA 3C4CA 4D4VA 3R1QA 4ACMA 4BDBA 1DAYA 4ZJIA 2AC3A 5FBNC 3ROYA 3WZJA 2XUUA 3W55A 2JDRA 5IMXA 4O38A 4S32A 4UALA 1OBDA 4Z3VA 3C7QA 4CFXA 2RG6A 5C8KA 2O63A 2Y6OA 5JFXA 1PRYA 2YABA 3AQVA 4ZMFA 3DAEA 3GFWA 4KA3A 4IZYA 4ARKA 5IQHA 3IECA 3R8MA 4MNFA 1BI7A 3M42A 2RF9A 4I41A 3LM5A 3SDJA 5M57A 3S4QA 4ITJA 5B0XA 4MXZA 2PVLA 4ID7A 2QNJA 2ETKA 3BYSA 3E62A 5FM3A 4HNIA 1KE9A 2WMSA 3SHEA 2A27A 1W84A 1NVRA 4AZEA 3KMWA 3UOLA 3WBLA 4D1XA 5A4QA 3BIZA 5EDPA 4JG7A 5JQ5A 1OGUA 2EXCX 3HMIA 3KN5A 3D94A 3HZTA 3IO7A 3QX2A 3UBDA 4E73A 4IM0A 4JNWA 5EM5A 4C3PA 4IXPA 2FGIA 2WKMA 3AD4A 2WEVA 4RC4A 3QALE 3KC3A 3DT1A 4V0GB 3Q4TA 3SA0A 2PE1A 2YJSA 4G9CA 1YVJA 3WF9A 4BIDA 2RG5A 4XLVA 3MI9A 3DY7A 3N4UA 3GC9A 3NUAA 3VUHA 4AA0A 4ANSA 1H01A 1P14A 2E9VA 3Q4ZA 1WBTA 2GPHA 4J99A 3G6HA 2C3JA 2IVUA 3OP5A 3FI2A 4GG7A 4JBOA 5D7AA 5B2LA 4O0TA 3EMGA 3VW6A 3DOGA 3QKKA 3D5UA 4JBQA 1U59A 3OOGA 3TZMA 4FV6A 3BV3A 2VX0A 4HGSA 5CAVA 1YI6A 5IDNA 4GIIA 3CQWA 4C57A 2C68A 5JFSA 2W7XA 2I0HA 4NU1A 2WZJA 3H4JA 4KIQA 4R3PA 5EOLA 5FEEA 5E8ZA 5DRBA 3R8UA 2W4OA 3DJ7A 4BWKA 1UKHA 2XIXA 3FAAA 3ITZA 2JIUA 2YJRA 5IA1A 4U7ZA 3MDYA 2VTNA 1W83A 2ZAZA 2PPQA 2WTKC 4OBPA 3RCDA 4BY9E 2VX1A 1UWHA 5IEXA 3OBGA 4FL2A 2QHMA 2YM3A 3FMNA 2GHLA 3AC4A 4RQVA 4EC9A 5HESA 3TZ7A 3QHRA 2J51A 4FTTA 5BMSA 4CRSA 5HTIA 4RQKA 5EM6A 4IZ5A 4J98A 3ZTXA 3ZZWA 4A9YA 3BQRA 4ZOGA 1J3HA 4BZNA 4E5BA 4EHVA 4TY1A 2VO7A 2WMTA 4IANA 5CF4A 4A4LA 3AT3A 5A54A 2V0DA 2GFSA 3F5UA 1RE8A 2FUMA 3Q60A 4MWHA 4RX9A 3SX9A 1OKYA 2CJMA 3UYTA 4LG4A 4P2KA 4B4LA 2GS6A 5EDQA 3ENMA 3MW1A 4EQUA 5J9YA 2VWVA 5C4LA 5DR6A 2WEIA 2GS2A 2J0KA 2E2BA 5TT7A 3COMA 2X7OA 3VS5A 3ZSHA 2VN9A 4FT0A 5F94A 2V22A 5D7VA 2WAJA 3QUDA 3IS5A 1DM2A 3ULIA 3TG1A 4MH7A 2WD1A 4O7TA 1WZYA 4FTCA 4QPMA 4WBBB 4FV2A 1G8SA 4DT9A 3EQHA 2PVKA 4H39A 4YC8A 2UW0A 2XYNA 3E7VA 3OW3A 4BN1A 4CV8A 3FEGA 4FTIA 4V04A 5IISA 3DXPA 4O7SA 3A7FA 3LQ8A 2PMLX 3ZUVA 5DWRA 1J7UA 5L4QA 1H00A 4IAKA 3CE3A 4R7HA 5J79A 2ZM3A 4DEGA 4IVBA 4QP4A 1LUFA 4GU9A 3ZM9A 2XIYA 2BDJA 4RC2A 5CALA 4IVDA 3ROCA 1U54B 1TKIA 3WOWA 3OUKA 4FTMA 3BWFA 4E26A 3LQ3A 4CTBA 5DYJA 3DAKA 2HZIA 3CKWA 5HLNA 5AJQA 5M56A 3R9RA 5M07A 4MD8E 4FV8A 2OH4A 4O22A 4G9RA 5J5TA 3GC7A 2PMNX 2WTDA 2WB8A 4OBOA 4OTWA 2R3OA 4EOKA 3AC2A 3ZLXA 3ZM4A 4M67A 2BPMA 4NUSA 2YACA 3C4EA 4PDPA 2GTNA 1ZYDA 3KRJA 2ZV9A 5AR2A 3G15A 4F7SA 4X0MA 4XP3A 3ZO3A 3GU7A 4BDJA 2UZOA 5H8BA 5C4KA 2EUFB 5HE3A 2C3LA 4I4EA 2BUJA 4HVIA 3WILA 2JDOA 3KXZA 4PTCA 3C4WA 3EWHA 3NAYA 2UUEA 3QTIA 3H3CA 4GEOA 3PG3A 2C5XA 3UYSA 3HV4A 4KIOA 2OZAB 2XJ2A 3LW0A 3Q4CA 4U0IA 4UXLA 1FMKA 4MX9A 4F08A 2EVAA 4O84A 5HKMA 2IPXA 4GUEA 3L9PA 1AGWA 1VJYA 2BRHA 1F0QA 2F9GA 4QMUA 4M69A 4XG3A 4AG8A 1M7QA 2VZ6A 4FSMA 3WIGA 4EZ5A 2F4JA 4M66A 4ZIMA 2C6EA 3ZLSA 3DGKA 4BDGA 2Q0BA 5DPVA 5A3XA 4D2SA 3CC6A 5LARA 1MRVA 2R3JA 2O0UA 5DVRA 5I3RA 3PPJA 1MP8A 4FVRA 5JEBA 3FDNA 2UZDA 3DBCA 3MTLA 4JQ7A 4O6LA 5TO8A 4AS0A 3W2PA 2E9NA 4D2PA 2VTRA 5CWZA 3ZC6A 2NPQA 2OW3A 2QVSE 3TTIA 5L8KA 3R02A 4EUTA 4RX8A 1YDRE 4BKZA 3PSDA 1DS5A 4IAIA 4DAWA 5LVNA 4TPTA 3EQFA 1JKTA 2EU9A 2NRYA 3D5VA 3GVUA 4WG3A 3ZXTA 2PVRA 5AP4A 4BCPA 3ODYX 5L2IA 3TM0A 2GNFA 5E8UA 5DG5A 3WF6A 2CLQA 3HRCA 4EH8A 2Y4IC 1XH7A 1PYEA 3GCQA 3MGYA 3GU8A 1AQ1A 4IEBA 2XA4A 5DGZA 4CV9A 4D9UA 3UVPA 5I9VA 4BWPA 4C4JA 3DZOA 4DGGA 4JOAA 4Q5EA 4U42A 4YZ9A 1W0XC 3R04A 2PVMA 4HYIA 4ZZOA 3FXXA 3W18A 1APME 2XZSA 2YCQA 4PPAA 4FL1A 3MVMA 2VTHA 2X2LA 3NYNA 4F65A 3ZCLA 5AV4A 5C8MA 3VC4A 2QKRA 3P5KA 2XKEA 3I60A 2OJJA 2DUVA 3DTWA 1O6KA 3QTXA 4G16A 2YM4A 4LM5A 4JX3A 5FRIA 3V8TA 5HLWA 4MEDA 2WFYA 3NGAA 4F09A 2XBJA 3PVBA 4E6AA 2CNUA 3A8XA 4X2FA 1CKPA 3NYOA 3PYYA 3S2PA 4DEDA 3G90X 5BPYA 2R7IA 3IQ7A 3UG1A 2W96B 3EZRA 5HCYA 4CFFA 2JFMA 3FMKA 3IDPA 1OPLA 4ZZMA 3NNWA 3RNIA 1Q3DA 4EOPA 3JXWA 4ASEA 5TOZA 2PU8A 3TZ8A 4XOYA 4FIHA 1YHVA 2PUIA 1CKIA 5G6VA 3VUKA 4RIWB 5IA3A 5H8GA 3G9NA 3O0GA 3BEAA 4WRSA 4BZOA 5JFWA 5GIPE 3PVUA 4NCTC 4CFVA 5IKWA 4BRXA 5CAQA 3NR9A 4DH8A 3EQGA 5J9ZA 5HGIA 5E7RA 1XO2B 4FG9A 1J91A 2YM6A 3SOCA 3UMWA 4ALUA 3PZEA 2X0GA 3ATTA 4O7YA 2VTJA 1XKKA 3WZDA 4CNHA 4FTNA 5EW9A 4U80A 4B9DA 3GXLA 4IE9A 1DI8A 4ZP5A 2ITZA 3FWQA 5JRSA 4BGQA 4G3EA 4WBOA 2I1MA 2WMBA 1Q4LA 5ICPA 4V0GA 4C4HA 2XF0A 4XV9A 5IEYA 3OXZA 5KKRC 1ZMUA 4O83A 1ZYSA 4LUEA 5LXMA 1YI3A 4PF4A 1WFCA 2C5OA 4NWMA 2IW8A 1W8CA 4QMXA 5EKOA 4O96A 3T3UA 5D10A 1NVSA 4D0XA 2C5NA 4FTUA 4XH6A 4I3ZA 2YEXA 3E8NA 4UWCA 3W2QA 4DA5A 1R3CA 1CTPE 4JIKA 2W5BA 4LL5A 4QT1A 1YHSA 5GJGA 4BI1A 5JQ8A 3UZTA 2YZAA 3H10A 2QOQA 3QXPA 4WOVA 3MVJA 1YDSE 3K3JA 2QONA 4G31A 3VNTA 3F88A 2IZTA 3QWJA 5J95A 4U8ZA 2BHHA 4JBVA 1UKIA 4C35A 3DBDA 2WMWA 4BHZA 3M2WA 3FC2A 1B39A 3BLRA 4A06A 5KMMA 4IWQA 5GJFA 4RFYA 5E8XA 4RVLA 4MD9E 2NP8A 2VWUA 4NSTA 4O21A 3FLZA 4PNIA 4YJUA 4ZMEA 2FVDA 4USDA 3UIBA 2CKOA 1BYGA 4CCUA 3QLFA 1ZOEA 2WTWA 4O2PA 2O8YA 3FXWA 5IH4A 3NNUA 3UQGA 4CCBA 4I20A 4EYJA 3EL8A 4W9WA 4AGWA 2R3GA 5DR2A 4EKLA 5B7VA 5LQFA 2ERZE 1CSNA 3CLYA 2GFCA 2PMIA 2WIHA 4OUCA 2VWBA 1GIJA 2XB7A 5IUHA 4A9RA 4AN3A 3QU0A 4BKYA 2UZNA 1UNLA 4S33A 4UB7A 5EI8A 1KE5A 3UQFA 3BHUA 3IW6A 5I9UA 4YO6A 4YNOA 4CT2A 4ZTNA 5L6PA 1BKXA 3NX8A 3EQIA 4TT7A 4FA2A 3ORNA 4LOQA 4XS2A 4O0UA 5LVLA 2VO6A 4AA5A 3EFKA 4JJRA 2QR7A 4NW6A 5AR4A 4TXCA 2CKPA 1L3RE 3ZZEA 4ALWA 1OIQA 3FI8A 3TKIA 5BUJA 3ORZA 1PJKA 2J50A 4FV1A 3AMAA 3A99A 4KNBA 5EH0A 4L45A 5HE1A 4E3CA 4FKIA 3HMOA 2CN5A 3BGZA 3R7VA 1KOBA 2SRCA 4OTDA 2J90A 4I5MA 4GCJA 3GFEA 3QUEA 4HYSA 4QMWA 2R2PA 3VS1A 1PMVA 1QPJA 2PWLA 4FV7A 4ZSAA 3PFQA 4E6QA 1UU9A 2W5HA 3P23A 3BPRA 4L9IA 4QMQA 2VTTA 3UVRA 3QWKA 3OROA 3ZEPA 2AYPA 3AC5A 4JX7A 5HO6A 2XIRA 4D1SA 1YWRA 4QYYA 4EI4A 5AA9A 4BDIA 5HD4A 4FKSA 4JVGA 4L53A 4QP7A 4BB4A 3EQCA 3BHVA 3RAHA 3Q53A 4YPDA 4EOSA 3FLYA 1A06A 3FZSA 3I79A 4FV3A 3PWYA 4TN6A 5A6NA 5M4IA 4CVAA 3HECA 4UN0C 5CEMA 2A4LA 4QD6A 3DK3A 1U4DA 1UNHA 2VWWA 3QRKA 1OECA 5CSXA 5IZFA 3KXGA 3RK5A 3MFSA 4G3CA 4L00A 3C4ZA 3ORMA 1XH5A 4TTHB 1YQJA 5AX3A 3RTPA 2O65A 1GZOA 3MWUA 3RPVA 4RLKA 4UBAA 3CTQA 4DGLC 4I92A 4MCVA 3CY3A 3ZU7A 5IA4A 4C3RA 4NL0A 5EQPA 2H96A 4M8TA 4A4XA 4W8EA 5DHJA 4G6OA 4CKIA 2KTYA 4F1OA 4MNEA 2OZAA 4PWNA 3LFBA 4JIAA 3OOMA 4ANLA 3FXZA 4ACHA 2VWYA 5E9EA 2QG5A 3UPXA 3OHTA 3IW5A 3KVXA 3ENHA 2OWBA 1YXVA 3F2AA 4RIXB 4GT5A 1MRUA 4FKPA 4QMMA 2VTMA 3U6JA 4DCAA 4X2NA 4QP8A 2ZOQA 4JI9A 4WG5A 3D7ZA 3OY1A 4FSRA 1DAWA 4DFZE 3P7BA 4I1ZA 4NKAA 5ITAA 3EFWA 3FLNC 3PIYA 4ENYA 1H4LA 4BWXA 4FKTA 3V3VA 2JD5A 2UZTA 3QD2B 4NW5A 3P9JA 5EHOA 3T3VA 4C4EA 4YJSA 2XP2A 4EYMA 1UWJA 2BRMA 1P4FA 2JAMA 1ZYLA 3Q96A 2ZB0A 4DFBA 4DBXA 3OWLA 2UZVA 2JIVA 2YIXA 3OCBA 4CZTA 4ENXA 3V01A 3QQHA 1GY3A 1ZXEA 3H30A 3OD6X 3PXRA 4P7EA 3R9NA 3V5QA 5EKNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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