4QQJA

Crystal structure of fgf receptor (fgfr) 4 kinase domain harboring the v550l gate-keeper mutation
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
299
structure length
282
Chain Sequence
LPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVILECAAKGNLREFLRARRPGPLSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAPEALFDEVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title DFG-out Mode of Inhibition by an Irreversible Type-1 Inhibitor Capable of Overcoming Gate-Keeper Mutations in FGF Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Fibroblast growth factor receptor 4
total genus 87
structure length 282
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qqjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4qqjA01
2LGCA 3SRVB 4CRLA 4KRDA 3OWPA 5HU9A 5EI8A 5KMLA 1WBSA 1ZZLA 2R7BA 3D2KA 3R22A 5KE0A 3EL8A 2BZKB 5I9XA 4QQJA 2VO6A 2XUUA 5AAGA 2QO2A 3TM0A 4I92A 3VUMA 3L8SA 2ETMA 5HX8A 5L2TA 2XNBA 4ZXTA 3BX5A 2XS0A 5IQIA 4KRCA 3ZUVA 1H08A 3CJFA 4GSBA 3F3VA 3Q9XA 3S1HA 4FZ7A 3OWKA 4R7BA 3TDWA 1STCE 2GPHA 3DZQA 3QUPA 2C0TA 5AUWA 3R8VA 5GZ9A 3TKHA 4Z7HA 2ERKA 5CYIA 4KS7A 3RPVA 4BBEA 4LV8A 3WF5A 3PRFA 1W0XC 3PTGA 4ZK5A 4C2WA 3R9HA 3CD8A 3MFSA 2WMSA 2W1CA 3QWJA 4XG6A 4HZRA 4ENXA 4PP7A 5HVKA 3ZONA 3V6RA 2WAJA 3NSZA 2RSVA 4LUDA 4QRCA 2EXEA 4R8QA 1GIJA 3DQWA 2OFUA 3DAKA 3S95A 4O7SA 3R1QA 3LMIA 1XBBA 3KRRA 4FKGA 4K0YA 4OTIA 4R7HA 4EOIA 2G2IA 4IB3A 4JDHA 1ZRZA 4OTWA 1DM2A 4LQMA 4QP4A 4QTAA 4XP0A 5CXHA 3DFCB 4MK0A 5E8TA 4BI1A 1W82A 2BZJA 1R78A 4I1ZA 3S2PA 3U9CA 3OY1A 3VUGA 3HAVA 3HV6A 1XH4A 4E73A 4L7SA 5B0XA 3PIXA 4OTHA 4F6SA 4DH3A 3DNEA 2UZLA 3TG1A 3NRMA 2XNNA 1J7UA 2OIDA 3LCDA 3OS3A 3DJ5A 1QPEA 4EYMA 3CQUA 4HGLA 3FWQA 2J2IB 3UG2A 3PA4A 3V51A 4JR3A 4U43A 3ZLWA 2YLFA 2G01A 3EZVA 5A6OA 3GUBA 2WKMA 3F5GA 2J7TA 4EH8A 3TUDA 4FEVA 3AMBA 5ACKA 3OCBA 4AA4A 2PUIA 1R39A 3NVMB 5FUTA 2JKMA 3CKWA 5E8XA 3SXRA 5M53A 3SQQA 5BX0A 1WBVA 4CMUA 2ZMCA 3F9NA 1OZ1A 3QTSA 4QMVA 3IECA 4FNYA 4BDIA 3JUHA 4OTQA 5M4CA 3LLTA 2R3LA 3F5UA 4PMSA 3W8LA 3ORZA 4FSMA 4DEGA 5IA2A 5FTOA 4O6LA 4HPTE 3Q4ZA 2ESMA 3SW4A 3QTRA 4BTKA 4DGGA 4F7SA 2W0JA 3KK8A 5GIPE 3CGOA 2IZUA 5TF9A 4FSYA 4ZZNA 3GBZA 4CG8A 1BI8A 2ITWA 2OF2A 5ANGA 4E26A 3QYZA 4QP9A 1PXMA 3DBEA 4G5PA 4ZAUA 3ZU7A 4AX8A 2JIIA 2XIXA 2C30A 3GQIA 2WO6A 3G0FA 4AQCA 2QLUA 2QOOA 4DA5A 5HG5A 5FG8A 2FVDA 4NZWB 3SOCA 2W17A 4F7JA 4FKPA 3NYNA 3FPMA 5IQDA 2PZ5A 3ODZX 2XJ2A 4BCQA 3TKIA 3K5UA 5KBQA 3TKUA 4X2FA 1FBNA 1LEWA 2OJFE 2A27A 3HZTA 5AR5A 2P2IA 5FDXA 5B2KA 2VTAA 4O1PA 4F0IA 4FEUA 3D4QA 3F3UA 4H39A 2R5TA 3PUPA 1YXVA 3R30A 4FG7A 2I0VA 4FKUA 1UU3A 3VS3A 3ZCLA 3ZUTA 3PYYA 3MIYA 3Q3BA 4EZ7A 1NA7A 4BYJA 3PPKA 3G33A 3VVHA 2I40A 4I0RA 5HCYA 3IDPA 4C37A 4ORKA 4ZOGA 3MY1A 3SRVA 5E8WA 4KKGA 2BRBA 4AA5A 5HLPA 4I5HA 3UC4A 4FT0A 4D5HA 5A4EA 3AC4A 5CEQA 1JKTA 4AT5A 3D7TB 5HG8A 4ZTMA 4GL9A 3QALE 3EQHA 4QMPA 3W33A 4YJOA 4XG8A 1H1PA 2ITQA 1FMKA 3MPTA 3PE2A 4IVCA 3T9TA 3ZO3A 4FKSA 1JLUE 4YUQA 4JLCA 1ERKA 3DTWA 3VUDA 4UXQA 3TWJA 2JGZA 2X7OA 2W9FB 3I81A 3OWJA 1H00A 3IPHA 5K3YA 3KF4A 3KXZA 5HCXA 3W16A 2C5NA 3LXNA 3LJ1A 4I20A 4RA5A 3F3TA 3C4WA 5KCVA 3COKA 5KX8A 2YA9A 5KMOA 2IN6A 3RJCA 5K4IA 4EYJA 4DH5A 3QQJA 4CYJA 3FLSA 5CVGA 4CZTA 1Q8ZA 2XEYA 3HEGA 3I0OA 2UW5A 1ZY5A 2B9IA 4AZTA 3UQGA 3KVXA 3QUEA 1PW2A 4XYFA 4YHFA 3U87A 4O0YA 3ZDUA 3AD6A 4FICA 4DCAA 5EHLA 4GK2A 4IFGA 2V22A 4NTSA 3F2NA 5E8SA 3MIAA 4UALA 4BI0A 4EONA 1WBPA 3BYVA 3GU7A 3LFBA 3QWKA 3QD3A 5BQ0A 5I5ZA 1OL7A 3ZZEA 3IW4A 3I5NA 4DFZE 4ZZOA 4I4FA 3G90X 2HW6A 5CEIA 3KN5A 3GCUA 4RIOA 3C0HA 1CKIA 3KY2A 4YGAA 5ANOA 4XLIA 3FLNC 1OIQA 4DTBA 3PXQA 3VBTA 3W2PA 4F1MA 3F69A 3GU5A 1UU9A 4HVGA 2CNQA 4XH6A 2BRGA 2IVSA 4RJ8A 1O6LA 2VTJA 3EFWA 2VWVA 4MEDA 3KCFA 3MN3A 3NCGA 4ZJJA 3FLWA 3L9PA 1H1WA 4OT6A 4RLKA 2OGVA 3PSDA 4WBOA 4TWCA 5AX3A 1OKVA 4DYMA 5LOHA 2UW0A 5JZJA 5E9EA 2XCKA 4F9YA 5LCKA 3QTQA 2QR7A 1UNLA 3QU0A 1LP4A 3UO6A 4ARKA 4CZUA 5A4TA 4RLLA 4KIQA 3P7AA 4CEGA 5CWZA 3RNIA 5T68A 2PYWA 3H0YA 3Q52A 3DBDA 3LOKA 4ERWA 5AAEA 4CGAA 4F70A 4FV2A 5IUHA 1Q8WA 2XNEA 4MWIA 3PIZA 3QTWA 4K11A 4NTTA 2J0MB 4ACCA 4RJ4A 4X7QA 5AP7A 4QP6A 3R21A 1PMVA 4O7VA 2E9PA 5HI2A 3V8WA 4JX3A 5AR3A 1Y8YA 5IUIA 1R1WA 4FOBA 2UW4A 4MQ2A 2G15A 4I6HA 2HXLA 3AC2A 4G17A 3RZFA 4WBBB 2OJIA 4C4JA 4C36A 5TE0A 4WG3A 2CJMA 5CAOA 3M42A 2YCRA 4J97A 3RM7A 1WVWA 3W8QA 1NW1A 3R8UA 3U51A 2VN9A 5EQEA 3QD2B 5AM7A 3R9OA 3FYJX 3LW0A 3VS5A 2WXVA 5DRBA 2JAMA 3AGLA 5IUGA 5ETIA 4HGSA 4QMQA 4XV9A 5F4NA 3FZPA 5GJFA 3B8RA 2UZNA 3HV4A 5AWMA 4W4XA 4BN1A 5FGKA 2CGVA 2HZ4A 1H8FA 2ZM3A 3ORLA 4QMTA 2YN8A 4J96A 1Z57A 3COIA 5E92A 2WOTA 4YURA 3MW1A 2FUMA 3ZEPA 3SC1A 4OR5A 3ZLXA 2O5KA 3B2WA 4RG0A 2Z02A 3N9XA 1V0PA 3EFKA 5B7VA 2VTMA 2HZIA 2X9EA 4G34A 2UVZA 4GS6A 3D7TA 4GKHA 1ZXEA 3DKOA 4IAKA 3FKOA 4MKCA 2OH0E 3F66A 3PSCA 4B99A 1RW8A 1CSNA 2VWYA 1P4OA 4QPAA 5FBNC 2OI4X 4C33A 2UW3A 4AGWA 2I6LA 1JKKA 3TNPC 4TT7A 4RPVA 1OPJA 2FSTX 5E8ZA 2PUPA 4JX7A 5F95A 2ITPA 3PDTA 4YZMA 2OIBA 3EQFA 4KB8A 3FKLA 2ETRA 4MF0A 2XB7A 4M8TA 3A8XA 4CRSA 4DCEA 4XBUA 3BLHA 3IDBA 3JPVA 3P86A 5HO7A 3LJ0A 5DA3A 2IW6A 3GU8A 4QP8A 5E4HA 2W1GA 4S34A 2Y9QA 3GC7A 4MQ1A 4L45A 2PU8A 2J0LA 3DGKA 5L8KA 3TL8A 4D55A 2XCHA 4CFFA 1HCLA 1WVXA 3MVLA 2B53A 2F49A 4GIIA 5E1EA 5FEEA 2W96B 4MCVA 4WSYA 4D1XA 3LQ5A 4TYJA 2OBJA 3R9NA 4X3FC 4FT7A 2WMBA 3EKNA 5EDRA 3W2QA 2O65A 2WMAA 4U44A 1FGIA 1O6YA 4UWBA 4NK9A 2BDWA 4GEOA 1H28A 1ZMVA 4RWJA 5F20A 5C9CA 3ERKA 3GFWA 4L67A 5AP1A 5C27A 4HW7A 1SZMA 3U6HA 4O0RA 1PXJA 1YXTA 5CXZA 3TJDA 3Q60A 4DEDA 4DLIA 2C69A 2P4IA 4H36A 2C68A 3VHEA 4YBKA 3MA6A 2P0CA 3H30A 4U40A 3G6GA 3WF9A 3ZHPC 3ORIA 1SNUA 5BVEA 1DAWA 3OT8A 4CT2A 4E4LA 5CX9A 4AZWA 1YWNA 4E4NA 2YIRA 3CBLA 5M56A 1OBGA 5E7RA 5FD2A 4BWXA 1Q5KA 1RQQA 1XKKA 3N51A 4QQTA 5CZHA 4YR8A 1WBNA 4JRVA 4CMTA 3MTLA 4F9BA 4O81A 5IQGA 1J3HA 2XKEA 3GU6A 4USEA 1UVRA 3ACJA 4EOPA 3R7VA 3VBVA 1E1XA 2UW8A 3QX2A 4DT8A 3TI1A 3IGOA 4PMMA 3TN8A 3OW4A 3W2SA 3AC1A 2UZVA 4DH8A 4QPSA 2XNOA 1CM8A 2BPMA 2EB2A 3V5QA 4D2WA 2J0JA 3D5WA 4ZJVA 4EQUA 3GQLA 1JKSA 1FINA 3UZPA 5KKRC 4QT1A 3WARA 4KKEA 3O8UA 4E7WA 3F3ZA 1YXUA 1PKDA 4DG2E 1ZYLA 3WILA 2UZBA 3VS2A 2R4BA 3QQKA 4C3FA 2XH5A 4PF4A 3QUDA 5BNJA 2IW9A 3LFSA 2C1BA 3DXQA 4G9RA 3AT2A 4DGOA 3FUPA 4CFNA 4O84A 3Q53A 1XH5A 3UGCA 2R0UA 4QYGA 4LG4A 3DLZA 3NUPA 4NM5A 5IH5A 3PXKA 2ITYA 3K3JA 4JQ7A 5GHVA 4C38A 5CQUA 5BUJA 3HDNA 3BQCA 5FWKK 3R9RA 5DWRA 5HQ0A 3NX8A 4AU8A 2ITVA 4BI2A 5AR8A 4ITJA 4YJRA 2YWVA 4ZTQA 1KE5A 1YOMA 2AUHA 2GSFA 2OJ9A 3ALOA 5E1SA 3VUTA 4A7CA 4PL4A 2XK3A 3RPOA 4XP3A 5ANDA 3QCSA 2W7XA 1OIRA 2XP2A 4QMYA 2VTHA 5IISA 2EXCX 2XBJA 4V0GB 3AD5A 2H8HA 4DGMA 3SA0A 3LKMA 4GFOA 3C0GA 3OEFX 5BUEA 5L6WL 3ZZWA 4DE4A 3P78A 2OFVA 1K9AA 2JKKA 3BHTA 3EN6A 5HCZA 2WOUA 2ZV8A 3I6WA 2ZM4A 5FRIA 2GTNA 2KULA 4ZSJA 1XH9A 5HIBA 5HNGA 2OKRA 2Y4IB 2X2LA 3DK3A 4RX8A 2P3GX 4Y5QA 4ZTHA 2WU7A 3KU2A 1Y6BA 2JIVA 4K1BA 2JIUA 4MXXA 4DEBA 4EZ3A 4NCTA 4R77A 4OLIA 3COMA 4FKOA 4EORA 4NYEA 1M14A 3I7CA 5ACBC 5CU4A 3RCDA 5FLFA 4NSTA 3PWDA 2VX0A 2B9HA 1PHKA 2J50A 3F7WA 2H6DA 3LCTA 1ZZ2A 3ZRMA 4ONAA 4KNBA 4DHFA 2CKEA 2XIYA 1U46A 4EUUA 2HAKA 3NVKI 3ORNA 4P90A 2CSNA 4TN6A 4C4HA 4G3GA 3KN6A 2Y6OA 4NFMA 5CENA 4JG6A 3GOKA 4TNDA 4J95A 4W9WA 5HLWA 5BYYA 2J0IA 1O9UA 2C0OA 3QXPA 3VN9A 1WFCA 4PPAA 3UC3A 4IWPA 4USFA 3ORMA 3CQWA 4XMOA 2BVAA 4QNAA 3EZRA 5CSXA 4FKRA 5HE1A 2A4LA 4MNEB 4FTJA 4TWNA 3R7OA 1MQ4A 4UZDA 4L8MA 1J1CA 1A9UA 4CV9A 2JEDA 2YJSA 4S31A 4RGJA 3BU6A 2QOBA 5AP3A 2W1FA 1XHAA 2ZV2A 1ZARA 3EHAA 2RG5A 3NAYA 2JBOA 4FE2A 3HV3A 3MDYA 3V3VA 3VS7A 4JDIA 2WQOA 3FMJA 1XJDA 3UPXA 4M69B 2Z7RA 3MYGA 2YM6A 3FV8A 3LXKA 3PLSA 3MI9A 2BAQA 2YM5A 4YJNA 3JY0A 3UTOA 2QR8A 1KE7A 5J9YA 3QTUA 3RK9A 4JG7A 1TQMA 2VO0A 3VQHA 2PVHA 4C35A 3PE1A 5FDPA 4TZRA 3JXWA 3PWYA 2Z2WA 5HHWA 3THBA 1ZOGA 3HKOA 2H9VA 3VS6A 2X6EA 2IWIA 4JIAA 2PWLA 4U79A 4GU9A 3R2YA 4EKKA 2P33A 3KXHA 5DI1A 3NR9A 4IBMA 4ZSAA 5JGAA 2VTPA 3R73A 3FBVA 4BBFA 3DU8A 5TOZA 3C7QA 3QA8A 3BELA 3NWWA 4NJ3A 4RWLA 2CGUA 4O0VA 2KTYA 4YZCA 4HYIA 5JN2A 5CQWA 4LOQA 3NMUF 4AGUA 3Q9YA 4EL9A 3DCVA 5JKGA 2FGIA 5EI2A 3I79A 4AWIA 4U5JA 5HTBA 5HESA 4U9AA 1IR3A 3DOGA 4QQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2LGC A;  3SRV B;  4CRL A;  4KRD A;  3OWP A;  5HU9 A;  5EI8 A;  5KML A;  1WBS A;  1ZZL A;  2R7B A;  3D2K A;  3R22 A;  5KE0 A;  3EL8 A;  2BZK B;  5I9X A;  4QQJ A;  2VO6 A;  2XUU A;  5AAG A;  2QO2 A;  3TM0 A;  4I92 A;  3VUM A;  3L8S A;  2ETM A;  5HX8 A;  3AKL A;  5L2T A;  2XNB A;  4ZXT A;  3BX5 A;  2XS0 A;  5IQI A;  4KRC A;  3ZUV A;  1H08 A;  3CJF A;  4GSB A;  3F3V A;  4O4C A;  3Q9X A;  3S1H A;  4FZ7 A;  3OWK A;  4R7B A;  3TDW A;  1STC E;  2GPH A;  3DZQ A;  3QUP A;  2C0T A;  5AUW A;  3R8V A;  5GZ9 A;  3TKH A;  4Z7H A;  2ERK A;  5CYI A;  4KS7 A;  3RPV A;  4BBE A;  4LV8 A;  3WF5 A;  3PRF A;  1W0X C;  3PTG A;  4ZK5 A;  4C2W A;  3R9H A;  3CD8 A;  3MFS A;  2WMS A;  2W1C A;  3QWJ A;  4XG6 A;  4HZR A;  4ENX A;  4PP7 A;  5HVK A;  3ZON A;  3V6R A;  2WAJ A;  3NSZ A;  2RSV A;  4LUD A;  4QRC A;  2EXE A;  4R8Q A;  1GIJ A;  3DQW A;  2OFU A;  3DAK A;  3S95 A;  4O7S A;  3R1Q A;  3LMI A;  1XBB A;  3KRR A;  4FKG A;  4K0Y A;  4OTI A;  4R7H A;  4EOI A;  2G2I A;  4IB3 A;  4JDH A;  1ZRZ A;  4OTW A;  1DM2 A;  4LQM A; 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