4RVMA

Chk1 kinase domain with diazacarbazole compound 19
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
271
structure length
264
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mitigation of Acetylcholine Esterase Activity in the 1,7-Diazacarbazole Series of Inhibitors of Checkpoint Kinase 1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 79
structure length 264
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4rvmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4rvmA01
2E9VA 1Q61A 4DGOA 3DA6A 2J2IB 4AZTA 5JZNA 1U5QA 3ANRA 2J5EA 2UVZA 2VTTA 4CZUA 2Z8CA 4AP7A 3QLFA 3OWPA 3R1YA 3K3IA 2R3NA 1ZWSA 4UY9A 2FSMX 2P2HA 3MBLA 4KAOA 4WA9A 1YDRE 1WBSA 5EFQA 4UYNA 4LMNA 1FOTA 1IASA 3OXTA 4ZXTA 4D1XA 4IC8A 3FI2A 2X4FA 3HYHA 3KXMA 2JIUA 1OB3A 4K1BA 4YU2A 2XUUA 5FDPA 4LMUA 4JJRA 5DYJA 3GC0A 5HG7A 3V6SA 2ITNA 2CKEA 1BKXA 2WGJA 3MPAA 1WVYA 3E92A 3L1SA 4OLIA 4OTGA 3UC3A 4CYIA 4IAYA 1YXXA 2CGWA 2GDOA 3MSSA 3BKBA 2B9FA 3PSCA 3TZ9A 5ETIA 5H3QA 3LXNA 4B8MA 4ANLA 4L3JA 5H8GA 2YFXA 4IAZA 4FTKA 5AJQA 5LQFA 3CTJA 3V8WA 2ZM1A 1XWSA 3G9NA 2VGOA 4FIHA 2XP2A 1PMVA 3ZLYA 4BDDA 4CLIA 1ZYJA 3WYYA 4EZ7A 4JDHA 3RPVA 3SHEA 2OG8A 3D7ZA 3QUEA 4TT7A 3MY0A 3O96A 1CKPA 1OKZA 3HX4A 3QUDA 4FTIA 4U40A 4YNEA 4BI1A 2BIKB 2JFMA 4FV6A 3K3JA 3UG2A 4D2VA 4OTWA 5BVNA 3PXFA 4DE4A 3KCFA 1AD5A 2VTAA 3UC4A 5C1QB 3QCYA 1YI3A 2XZSA 3D15A 1BUHA 5ANJA 3FZRA 1XBCA 2Z7SA 1ZXEA 3BBWA 3GU7A 4M66A 4O2ZA 4R7BA 4KKGA 3PA5A 4CG9A 2YJRA 3LIJA 2PZYA 4H3PA 3EFKA 3OOGA 4S30A 3KXGA 4YTHA 2F9GA 3RI1A 4MBJA 3LE6A 3EZRA 4J53A 3UDBA 4EH7A 1G3NA 4YTCA 2F7EE 3QRKA 3VN9A 2YM5A 4O96A 4E26A 4O7WA 2CNVA 4BC6A 5L8KA 3ZRMA 1IA9A 3LM0A 5M55A 5ANOA 4A4XA 2W1ZA 4RIXA 4LOPA 3NLBA 2UZNA 1LUFA 3TKIA 3RHKA 2PSQA 1BX6A 2WTDA 3QA8A 3ZO3A 3NUNA 2YCQA 4QMMA 4BTFA 4GW8A 4O38A 4JNWA 2QODA 5DT0A 4OAUC 4BBFA 3E8CA 5BQ0A 3ELJA 1LP4A 4IAKA 5EDQA 2PULA 3QYZA 4W4YA 3F9NA 5F95A 4J95A 5IDNA 1G8AA 3KRWA 2IW8A 4JX7A 4BDHA 2XNPA 5J9LA 4BCKA 5KMLA 2UW6A 3C13A 4XUFA 5AFVA 4QMLA 3H0YA 3VBXA 5GIPE 3CTQA 4XG7A 3FMHA 1P4OA 4U7ZA 2PMLX 5CEPA 3VBVA 4EH2A 3KK9A 1E1XA 4NZWB 4AOJA 4ZJVA 3LMHA 4F64A 5HLPA 3DBQA 4Z55A 3NAYA 1PYXA 3UVPA 4JIKA 4HVGA 4QP9A 5LVMA 1LR4A 4L7FA 4XG3A 3R7YA 3JR1A 4S32A 4IAAA 2QNJA 1W83A 1KOBA 4BDFA 2WOUA 3OVVA 3FI8A 2WU6A 4XV1A 5AX3A 4FSMA 5AP4A 4CV8A 4GU6A 3TV6A 3SA0A 2R0IA 1OECA 1JBPE 3E87A 4R78A 3NR9A 4IACA 3T9TA 5GINE 3ZRKA 3R71A 5CNOA 3CPBA 3U4WA 4FTLA 3HV6A 5AUZA 2UW3A 2WHBA 2C4GA 2JITA 4R3RA 1WFCA 2R5TA 1UWJA 3ZO2A 2JGZA 1ZAOA 2IW9A 4YTFA 3EQHA 3ATSA 4U6RA 2DUVA 3GBZA 2J0JA 4FOBA 3F5GA 2BDJA 1XBAA 3FZPA 3COHA 5DNRA 3ORXA 3REPA 3TWJA 2AC3A 3ZC6A 1SMHA 5C8KA 5IA5A 4L6QA 4U80A 2E9NA 4AA4A 5EHLA 5ICPA 2FH9A 4IWOA 2KTYA 2QG5A 2QQ7A 4L9IA 4U8ZA 3AC1A 3S95A 5C03A 4F65A 5JFWA 4HOKA 3ZBFA 2G01A 4JBVA 4LV5A 4I1ZA 4L53A 2X4ZA 5FM2A 3W16A 2W05A 2GU8A 4EWQA 4F1OA 2VUWA 4TL0A 3DXPA 3MJ1A 3COMA 2HENA 4PDSA 1XHAA 2PMNX 4O91A 3IDCA 3SXSA 4A06A 5JQ5A 3SW4A 2W06A 5IH5A 5J7HA 4MH7A 4ZLZA 3BU3A 3T3UA 3G6GA 4PMMA 5CLPA 3B2WA 4O7ZA 3Q9ZA 5AUUA 2QURA 4G5PA 5EH0A 3QAME 5L6WL 2XIRA 2C6IA 3LQ5A 1IAHA 4L3PA 3DBDA 4AT5A 1U59A 3O7LB 4QD6A 3QZGA 4C2VA 4AZWA 3KRLA 2PK9A 3AG9A 4UB7A 4EQUA 3I4BA 4MK0A 5CALA 4IM0A 3EN6A 5I3OA 3QQHA 5IEYA 3BHUA 3PSDA 5EDPA 3DDPA 3ZCLA 4J8NA 3VUGA 4MTAA 2XNBA 3DK7A 3U87A 1PXOA 3FPMA 2J51A 2XNMA 4FIFA 3VHKA 3ZM9A 5HU3A 4ZSGA 2JKKA 1RJBA 3MY5A 1YXTA 4PNKA 3BWFA 4DA5A 5LVNA 1QCFA 3E3PA 3LFNA 4OTRA 3LFEA 3PPJA 3E88A 4C3RA 1Y57A 4EJNA 1NW1A 4I22A 2JKOA 3QKLA 5M53A 4DFZE 3FXWA 3L8VA 2O63A 5L2QA 3FJQE 1M2PA 3UMWA 3FEGA 1R3CA 4MKCA 5HORA 5IG1A 4W4VA 4JVGA 4F7NA 4YZ9A 3BU5A 4ZJJA 4G1WA 1TQIA 5E8ZA 2DWBA 2G2IA 2OXDA 3MA6A 4K2RA 5EM8A 5HI2A 4DH3A 5KX8A 2QR7A 4APPA 3MFTA 1TQMA 5H2UA 4HVHA 4HGLA 2GPHA 1T46A 2ZMDA 2JEDA 4F09A 5J7BA 1WAKA 3RM6A 1K3AA 3EHAA 5J8IA 2YZLA 2YM3A 2CN5A 3MH0A 4GFMA 3R8PA 1ZOEA 1OIUA 2QLQA 2R7BA 3QHWA 4I5MA 2BR1A 4I92A 2O64A 2Q0BA 4N6ZA 5CU6A 1W82A 1NY3A 4YSMA 3TKUA 1J3HA 5GZAA 4RZWA 4KSQA 2BRNA 1J7UA 2CNUA 2IZSA 3ZHPC 5DG5A 5HO6A 2PE1A 2HW7A 1KOAA 3CCNA 2B9HA 5TOZA 5CAQA 4L68A 4TYGA 3NS9A 3ZUTA 4D0XA 3EWHA 5ACBC 2P55A 4QOXA 2G1TA 4HZSA 4DH8A 4ZS4A 3NZ0A 1ZZLA 2AUHA 3POOA 4DG2E 4ZEGA 2I40A 5IQAA 3P0MA 3UP7A 2P33A 3CQEA 4EK4A 4FNWA 4HZRA 2QKRA 3VS4A 2I0YA 4KS8A 3JUHA 2ETMA 4J52A 4MD9E 3QHRA 3E93A 4P5ZA 4F70A 4QNYA 3MIAA 4B7TA 3GC9A 5HO7A 4X2KA 4BCPA 1JKLA 2E9UA 2ONLC 5G6VA 1Q24A 3JVRA 4RFYA 5AV2A 4UALA 3V5PA 4PPAA 4FG7A 4KIQA 5T6KA 3EFWA 4KA3A 4NL0A 3ENHA 3UVQA 3O8TA 2GHGA 1OGUA 5IUHA 4FT0A 5CEOA 2XEZA 5DWRA 5HX8A 5C4LA 1OMWA 2B1PA 1Q41A 4UXLA 2XK7A 1WMKA 4FSTA 3NX8A 3IS5A 4IB3A 4Z3VA 2XNEA 3T3VA 4I0RA 5BYLA 1PXNA 3ZDUA 2IZTA 2HELA 2WZJA 3E7OA 3GNIB 3KY2A 4CSVA 5CAUA 2ITOA 4IIRA 3OOMA 4NSTA 4YZCA 1BL7A 4DTKA 4BKYA 4QMXA 4RIYB 4W9WA 1UU8A 5T68A 2ITZA 3NCGA 3HMIA 1H26A 3NW7A 2NRYA 3ORIA 3WIKA 3I81A 4PDOA 4YJVA 5J1WA 1OL7A 2NPQA 4QTDA 3ANQA 2RG5A 1YW2A 3RM7A 2ETKA 4JX3A 4OBQA 5CNNA 3C1XA 4FV8A 4EK6A 5CF8A 3DQWA 4FTNA 4D58A 3FV8A 4G3DA 1A48A 1A9UA 2CGUA 2VX3A 4FK6A 2Y4IB 4FT9A 4PUZA 2IO6A 5D7AA 5GJGA 3VAPA 2WTWA 5FTGA 4TWNA 5L3AA 3UO4A 3QF9A 2J0LA 2XM8A 4X2JA 4Y5QA 3C4FA 4QYFA 3BRBA 3ZMMA 2QO7A 3OC1A 3EB0A 3IOPA 4RQVA 1OBGA 3R63A 1F5QA 4AUAA 5IA0A 1UA2A 4YJRA 3BCEA 3R7VA 3VQHA 3LFAA 3WZDA 3NW5A 4FTJA 5LVLA 2OIDA 2VO6A 4QP7A 1J1CA 2PVMA 3ETAA 3FLWA 4HPUE 3P23A 5FXSA 4OTHA 2R2PA 2XCHA 2X9EA 4V05A 3PRFA 4YUQA 3UBDA 3B2TA 5AUWA 1U5RA 2BTSA 2C69A 4I3ZA 4BN1A 3PDTA 4O1OA 4FF8A 2VTLA 5IQDA 4M84A 2IW6A 4AW2A 4XP2A 5FXQA 4B99A 4NTTA 2BZIB 3OP5A 3EJ1A 5EKOA 4FEWA 3I0OA 4GIHA 4JAJA 3ID6C 5CASA 3AMYA 4FYNA 2HY81 2XF0A 2P0CA 2R3HA 3HP2A 2I0EA 3QL8A 2PUPA 4QTEA 2JKMA 2RG6A 4Y85A 5HLWA 1WBOA 1GNGA 2EVAA 5DBXA 5IKWA 5JQ8A 3AGMA 3A4PA 1XQZA 1QPJA 4RLLA 3WZEA 4BIDA 2H8HA 5HIDA 4GEOA 5FUTA 3A7IA 4IHPA 3PXZA 4O0WA 4E4MA 2RFEA 4CCUA 2YCRA 3NNWA 3GCQA 5J87A 3V6RA 1SVHA 2W5BA 2Y6MA 3DLZA 3HA6A 3KGAA 2VNWA 4GCJA 4R1VA 4RIXB 1U4DA 5I5ZA 3VS2A 3H9OA 2BILB 3DTCA 2VTMA 2ITWA 2P3GX 3HKOA 5AR4A 4AWIA 3HMPA 2GS7A 2PZ5A 2YCFA 3A2CA 4G6OA 4OT5A 3U9NA 4DGLC 1H4LA 3CP9A 2BRGA 4DFXE 4KKEA 2OF4A 3F61A 4WKQA 3LLTA 3MTLA 1VR2A 4Y72A 5KUPA 2WAJA 3L8XA 4XHKB 3TTIA 3EN7A 2VTHA 5D7VA 4QMQA 3G6HA 3DU8A 4YC3A 3ROCA 3MN3A 5KMNA 3DQXA 4EOKA 3W2RA 4FV5A 4YBJA 4ZJIA 3L9MA 4QTAA 4MD7E 3PVUA 3IGGA 3WYXA 3VC4A 4JRNA 3RAKA 3SOCA 2C3LA 1H1QA 1PXMA 3L9LA 3JYAA 4C36A 5HTIA 2PVRA 3MPMA 3PIXA 2WTVA 3Q9WA 2WMAA 4GG5A 5KMMA 5E8XA 3SAYA 4XH6A 1KUTA 3C4WA 4FZ7A 3W2QA 4DEIA 2BRMA 5E8VA 1UVRA 4DLIA 4UZDA 5HICA 2HZIA 2WMTA 3PTGA 1XBBA 4OTIA 4FGBA 4V0GA 5A4TA 1JOWB 3IKAA 3ZC5A 3R7OA 3UZTA 4ASDA 3HRBA 3SV0A 4MF0A 1LPUA 3TT0A 4TKSA 1QPDA 4EK3A 2VRXA 2XJ0A 5DR2A 4K11A 3WF9A 1Q8ZA 3ZM4A 4O81A 2VTSA 3IG7A 4QYYA 4A9SA 4IE9A 2GQRA 1TQPA 3FKNA 1FQ1B 3F7WA 4AW5A 3D94A 3TTJA 3ZFMA 4CXAA 4O27B 4LFIA 4ANOA 4BWXA 3VS1A 1I09A 3TZMA 3AQVA 3A61A 4PDYA 2J4ZA 3DBFA 4I20A 4OTFA 4DGNA 2CKOA 3NIZA 1OI9A 1PXLA 4QT1A 4QYEA 5IPJA 3ODZX 3TNIA 5HD7A 4Z16A 4FKVA 3AXWA 1UU3A 1PY5A 2XMYA 3GENA 2PZIA 2YDIA 4RC2A 3FY0A 3UYTA 1SNXA 4GL9A 4NFMA 5CSVA 4I6HA 3TXOA 1HCLA 4GS6A 4MEDA 5BVEA 4BBEA 4DITA 2VN9A 4M97A 3EIDA 4N6YA 2BHEA 3BGPA 3OBGA 3ORZA 4QMYA 4F0IA 4GT3A 1JSUA 1XR1A 3L8SA 5D9HA 3W32A 4FEUA 2ZV2A 1JLUE 5CX9A 3HDNA 4X3FA 2VTIA 3EKKA 3DAEA 3PVBA 3UGCA 3W8LA 3RZBA 3WBLA 3UZPA 2Y7JA 2YWPA 3EQIA 3DGKA 3MFSA 5FBOA 2IPXA 2PZPA 5LOHA 1H1WA 4E8AA 1WVWA 3DJ7A 4RQKA 4PX6A 1KV2A 4YNOA 3R9HA 4ZTHA 5IU2A 2GFSA 3CQUA 3L9PA 3QU0A 2WEVA 2QCSA 2XKFA 3I7BA 4ANNA 1M14A 4KINA 5KMJA 3BQCA 4QMTA 4RC3A 2ZOQA 3G2FA 3TUCA 2UV2A 4RVKA 4WSQA 5CT7A 4QPAA 5HD4A 1V0OA 5IF1A 3TIYA 2WB8A 3QBNA 4G3CA 5M4CA 3K2LA 5GZ9A 5M56A 1OITA 3OS3A 3FMMA 1H24A 4FKRA 4CFVA 2W5HA 5JFXA 4N70A 4DH7A 4GG7A 4L3LA 4DG3E 4I5CA 1J1BA 3I1AA 4XJ0A 3HECA 4LOQA 4EZ5A 5KKRB 5L6PA 4IZ5A 3DK3A 4S2ZA 5DI1A 3LW0A 1ZRZA 4CD0A 3UIUA 2PVLA 4LL5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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