4RWKA

Crystal structure of v561m fgfr1 gatekeeper mutation (c488a, c584s, v561m) in complex with n-{3-[2-(3,5-dimethoxyphenyl)ethyl]-1h-pyrazol-5-yl}-4-[(3r,5s)-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]benzamide (azd4547)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
MAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIMEYASKGNLREYLQARRPPGLEYSYNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Illuminating the Molecular Mechanisms of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance for the FGFR1 Gatekeeper Mutation: The Achilles' Heel of Targeted Therapy.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Fibroblast growth factor receptor 1
total genus 82
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4rwkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4rwkA01
1P2AA 2F4JA 1A48A 2PZ5A 4FV6A 2QQ7A 3KEXA 5DT3A 5IPJA 2PZYA 4DEGA 4NW6A 3D9VA 2YDJA 3LE6A 4AGWA 2PUUA 4RWLA 4WKQA 2GS6A 3DK6A 5HEZA 3KF7A 4V04A 3JR1A 4XV2A 3F5XA 1O9UA 3VS0A 3WE8A 4GU9A 3L1SA 2NP8A 3V5LA 4YBJA 3W18A 2ITZA 1CKPA 1CKJA 2FSOX 4I24A 4KS7A 4G34A 2C68A 1KSWA 4QMYA 3TV6A 2XIYA 4AGDA 3VJOA 4U0IA 1ZMUA 4QD6A 3HVCA 3G33A 3QD0A 1H01A 3NUUA 5DT0A 2PK9A 2W1ZA 3NCGA 4GT5A 4UWCA 1URWA 4KSPA 2YM5A 4PV0A 4O38A 4KB8A 5AWMA 2YWPA 4C62A 2XNMA 5HE1A 4E5BA 2Y6OA 2WQMA 2ERKA 4M8TA 4FKOA 4MEDA 2YM7A 3S4QA 4NK9A 4DHFA 4I6QA 4IJ9A 4WNMA 4YHFA 4EHVA 3PUPA 3D14A 3SGCA 3PJ2A 4ID7A 4PP9A 4K2RA 3CJFA 4KA3A 2FSMX 5LARA 2JKOA 2WMXA 3BU3A 5E1EA 4M15A 4LMNA 4BDFA 1NXKA 3M1SA 3QD4A 3IS5A 2JDVA 4I93A 4FTCA 2V55A 4IZ7A 4RIOA 5AP4A 5EM7A 1OUYA 4F64A 3Q9ZA 3GVUA 3Q6WA 2PZIA 4FIHA 5E8VA 4UMPA 3FLNC 4CLIA 4G5PA 3IPHA 4S32A 4N0SA 5AUTA 5JT2A 4X0MA 1OBDA 4XRJA 1OGUA 3H0ZA 5CANA 5AR3A 4HPTE 4PTEA 5CSPA 4QMTA 5EM8A 3UOKA 3DB8A 4ITIA 1OIYA 2O64A 4CMUA 5K4IA 4E4NA 3EQHA 3TJCA 1WVYA 3R02A 4U43A 4YLKA 3AMAA 5KMKA 4G2FA 2X2MA 2EUFB 4M14A 5IEYA 4XYFA 4HVGA 4FL2A 5CNNA 2XCHA 4FV3A 3QTUA 1UU7A 4FIFA 4AW2A 4BCOA 4E5WA 5DNRA 5IISA 4F9AA 1JQHA 3ACJA 3DFCB 2BKZA 4G31A 4P2KA 4UMUA 2GDOA 5JFXA 4BTKA 3HNGA 4FICA 1ZMVA 4IIRA 5M08A 3GT8A 2VTJA 4G6LA 3V8WA 3ZFXA 4MXOA 2WQBA 3FQEA 3KRXA 3UNJA 4UZHA 2YN8A 3GU4A 3D2IA 2WMUA 4A06A 1PW2A 2R0IA 3O7LB 3KGAA 2OIQA 3ZSGA 3NCZA 3N9XA 3F6XA 4XP0A 4J95A 1YWNA 1Z9XA 2KULA 4GFOA 1PXKA 4QP9A 3TKHA 4X7QA 5C26A 4CYJA 5HIDA 2HWOA 3PA4A 1WBPA 1Q61A 3C51A 3AC2A 5TO8A 2Y4PA 3DXQA 3DCVA 1K3AA 4AT3A 4TZRA 4F08A 2Y7JA 5EHOA 5EK7A 3ODYX 4IQ6A 4ANQA 1UU3A 4FG9A 4F6SA 4OTDA 4MWHA 2FA2A 3ULIA 4AGCA 3QTSA 2XIXA 4FF8A 3C9WA 5JRQA 3GENA 4Y5QA 5CLPA 3TI1A 2UZWE 4Z55A 5M57A 4R7BA 4LQMA 1WBVA 3RPYA 4U81A 2W1EA 3KU2A 3PY1A 4XG2A 5EHYA 3BLHA 4CD0A 3TNPC 2RFDA 1YDTE 3KK9A 5ETAA 4EOMA 3IOKA 4EOJA 1ZYLA 2XIKA 4GMYA 4XEYA 3IO7A 2VO3A 3DLSA 2W9FB 2UVZA 2BALA 4GJ2A 3ELJA 3O23A 3E64A 2F7EE 2UVXA 1V0BA 1XHAA 2R3FA 4GT3A 5CU2A 2BTRA 4HYHA 1JLUE 4C34A 4QMOA 2VTOA 2C69A 2UW7A 5AA9A 4B0GA 5LVMA 4BZNA 1G8AA 3EH9A 4NIFB 2HYYA 3CKXA 5CVHA 5BNJA 5C03A 4EJ7A 3SOCA 1XJDA 2VTHA 4QQTA 1PMUA 2YJSA 4FI1A 1ZYDA 2I0EA 3UPZA 4U9AA 3DDQA 1DS5A 3QZGA 3LCOA 2J7TA 4OW8A 3AGMA 3BYMA 4QRCA 4YTHA 5AX3A 3RWQA 4DTKA 1JAMA 3MJ2A 3FAAA 4YJQA 1CM8A 3OY1A 3M11A 4FYNA 3EKKA 4FSNA 4NM5A 4X3FA 1WBSA 3EOCA 4IH8A 5IG1A 3G9NA 4II5A 1Z5MA 3MV5A 3QX4A 4X2KA 2QOQA 3O8PA 4WNPA 5EOLA 2BZKB 1NT2A 2P3GX 5J9LA 3QXOA 4QQJA 4O2PA 4ZSJA 3W33A 5IH6A 4U45A 1PXIA 4IM3A 3A4OX 3W8LA 2YZAA 3UE4A 1RW8A 3R63A 4YR8A 3KREA 1H4LA 4FKLA 2R3JA 4OBOA 4F0GA 2UW6A 2JBPA 3OMVA 3OBJA 5AIKA 2BHHA 4PL5A 3SA0A 3MPMA 2IWIA 3A7JA 4J52A 2C30A 2ZV2A 5HG9A 4HZRA 4RFYA 4XV1A 4GK2A 1PRYA 4FKQA 2QONA 4RWKA 4U6RA 3R7IA 3UO4A 3NS9A 3ZRMA 2OZOA 4EYJA 5IDNA 1YXVA 3WOWA 3ZSIA 4YO4A 4DGNA 5CF5A 1XKKA 2J6MA 3QUDA 2VD5A 4C37A 3ZM4A 4YHJA 4FGRA 2VWIA 1TQMA 2OJJA 2QKRA 3OTUA 4QP8A 2CJMA 4BRXA 5CAOA 3HDNA 1W98A 1HCLA 3IK3A 3PRFA 4D4SA 4EKLA 4D2TA 4I1ZA 4BICA 2OH4A 2ZV9A 3KRLA 3PVWA 1UNHA 4EUTA 3CEKA 4CQGA 1QCFA 5AUUA 1YXUA 4RZVA 3WZEA 3EQPA 4APCA 2W1GA 4H3QA 2IW8A 3SOAA 4BBMA 4X6QC 3RGFA 5IA4A 5E8XA 1W83A 3R9HA 4ZY5A 4USFA 1U59A 4NUSA 4PL3A 4QTCA 5CWZA 4OTGA 3REPA 4FZAB 4CKRA 2CGUA 3R8ZA 2GFCA 4C58A 4OTFA 1PHKA 4YZDA 4YTFA 3BV3A 5EI6A 5FM3A 3LFNA 2FO0A 2F57A 3I6WA 3IW7A 4ZS0A 4R1YA 1MRVA 4J99A 1BMKA 2BUJA 3DBEA 3ZZEA 3ZM9A 4WHZA 4JDJA 4TWCA 1I09A 2FGIA 2OFVA 2WU6A 4QTAA 5EOBA 3T8OA 5EW9A 5AA8A 3U6JA 3DJ7A 3ZYAA 3PJ3A 5IH5A 4YTIA 4G3FA 3W2SA 4O7WA 1Y8GA 3CBLA 2FSLX 1OUKA 3EQRA 4UV0A 5KO1A 2QOIA 5IA5A 4AGUA 4UYAA 4FEUA 2DUVA 3GFWA 3LVPA 3PXZA 5ACBC 4XRLA 4IX6A 3E5AA 3Q9YA 1TVOA 5CQUA 3V8SA 2GCDA 3H9FA 4QMLA 3TUBA 4EK8A 1XH4A 4ZTRA 2ETKA 3G51A 3R1NA 4G5JA 3BRBA 4O7YA 3F69A 4KABA 3GGFA 1YKRA 3SG8A 3KA0A 2UW5A 3QUEA 2WQEA 5EDPA 5LMAA 2GHGA 2H8HA 1MQBA 2JBOA 3LCKA 4IC7A 2W1FA 3A7FA 5ANKA 3TZ9A 3OWLA 3LXKA 5L2SA 1SYKA 4QP7A 4FV8A 4KSQA 1W0XC 4DFNA 1Q97A 3RCDA 2OWBA 3GOKA 4X2NA 4DH7A 4IVCA 3R0TA 1WBOA 3U54A 4QMNA 3R22A 4ZMFA 4JL9A 4KS8A 3BU5A 4WRGA 4EH3A 4XP3A 2ITXA 4ZY4A 4C59A 5HO7A 5G1XA 1LR4A 3BBTB 3D5XA 2XYUA 3NAXA 1YDSE 3GB2A 3ET7A 2QOCA 2GU8A 2HZIA 3FL4A 4FNWA 2YA9A 3FLSA 5FEEA 3LMGA 4DLIA 2YFXA 4DFBA 3H9RA 4IAAA 1UV5A 2WU7A 1NY3A 3QTQA 3ZH8A 2ZB0A 4MHAA 4AOJA 4R3RA 4E73A 3FMLA 4AW5A 1UNLA 2AC3A 2R0UA 4RC3A 2R3GA 4AU8A 5EYMA 4U7ZA 2ITWA 3WZDA 2DYLA 2V22A 1A9UA 3GU8A 4I6HA 4XBRA 2VO0A 3R7VA 3PZHA 3BIZA 3PSBA 4QMSA 3NW6A 4Z9LA 3QRIA 3MB6A 3AQVA 3LW0A 5KZ0A 3ANRA 3NR9A 2UW4A 2C3KA 3O96A 4DC2A 4FTTA 5K0XA 2OZAA 3FPMA 3QCYA 2CNVA 5FEQA 4S30A 3R6XA 3AC4A 3AMBA 4O86A 1AD5A 1LUFA 4RJ4A 3OUNB 4A7CA 2R3IA 3LFBA 4UZDA 4ZJIA 1GIJA 3CY2A 4JI9A 5CT7A 5I9XA 5TT7A 3GP0A 5J8IA 4IEBA 5AP2A 3OCTA 2R3HA 3WF7A 3IECA 2V62A 5I9UA 1H1QA 5EYKA 3HMNA 3JYAA 4I6FA 1GIHA 3LKMA 4X3FB 4E93A 3FYKX 4ZTQA 2JIVA 1R3CA 2R3LA 4AFEA 5LMKC 3CQUA 5M55A 4RA5A 2W1IA 3DXNA 3FKNA 2PU8A 1JKKA 3G6HA 3Q4TA 3EN5A 3P78A 2W5BA 5EQYA 4NJDA 3GQIA 2F2CB 4F9CA 2OO8X 3KB7A 3R2YA 1U54A 1A06A 5AAEA 3PVBA 4ZJJA 3DKGA 4RIYA 1U4DA 4ZZOA 3OY3A 4QP4A 4TYHB 2O3PA 4IDTA 4OBPA 4I0SA 3C4CA 3PJCA 3A7IA 4NH1A 4YNOA 4FSTA 4L00A 5KBRA 2PVRA 4O7VA 2YCFA 2B9JA 2O5KA 1K9AA 3A2CA 1ZLTA 4FE2A 3L9LA 5B0XA 2Q83A 2C6MA 3BWJA 4JIAA 5LWMA 4D4RA 2VWUA 3EIDA 3LM0A 3MVJA 3UODA 3QL8A 4KIPA 1HCKA 5AR4A 3N4TA 3JXWA 2HY0A 1JSTA 4FZ7A 4BCIA 3DB6A 5DH3A 3RALA 3F2NA 5JFVA 5HTIA 5IQIA 1WZYA 2BIKB 2F7XE 2XVDA 4C4FA 4F09A 3DKOA 3EQDA 3IDCA 3FJQE 4QMXA 5CNOA 4BBEA 2PZPA 4DCEA 3W2RA 3NUPA 4QP2A 3TXOA 4FKVA 4U8ZA 3IDBA 1BL7A 3SRVA 2XNBA 1Q62A 4HGLA 5D1JA 2SRCA 4BN1A 4L44A 4L7SA 3ZO4A 3BHUA 4KUJA 2UZBA 3LXPA 5BVDA 3U9CA 4FGBA 1Y8YA 4XH6A 3K3JA 2VTSA 3CTJA 5DA3A 5E7RA 5FBOA 1OKYA 3R7YA 4BDEA 5LCJA 5EM6A 3FWQA 4YSJA 5CSWA 3TTJA 2ETMA 3QLFA 4DITA 5J7HA 3GCUA 4DEDA 1NA7A 3O17A 4BKZA 1PXPA 2OJ9A 5CEMA 4MF1A 4G16A 4CFVA 4FV9A 2XEZA 3WIGA 5FRIA 3LQ3A 3PFQA 3C4ZA 2QO7A 4GG5A 5E92A 3UVQA 4NU1A 4IFCA 3VUGA 2UW3A 4RQKA 4O2ZA 3KY2A 5L2IA 5CU4A 3EN4A 1H00A 5CU3A 3Q52A 4GSBA 4HPUE 4O7SA 4MAOA 4ZSLA 5M4IA 5HX6A 2HZNA 1J1BA 4NKAA 3BLQA 4EBVA 4DINA 2BDJA 2VO7A 3UG1A 2C0IA 4KIOA 4F9YA 3V51A 1IA9A 4QOXA 2BAJA 4ACGA 2Z7SA 3LXNA 5D11A 4JR7A 4BFMA 4IX5A 4Z7HA 2YEXA 3AT3A 5E8WA 3UVRA 5L8KA 4NYEA 4WNOA 3ZLXA 3SW7A 4D1XA 1W8CA 5EDQA 2B0QA 4DLJA 3BGZA 4RVMA 4S34A 3P0MA 5HI2A 3F66A 3NAYA 2A19B 2XK9A 3ORXA 3HKOA 4I5HA 4Y5HA 4Y73A 3MVMA 4MCVA 4FZ6A 5ETFA 2F7ZE 1LEWA 3TUCA 1VR2A 4YJPA 2VGPA 2QNJA 2OFUA 3IGOA 4U3YA 4M97A 3F82A 2PMLX 5JGBA 4JQ8A 5AIRA 2UZTA 1FQ1B 3F3UA 5FP5A 5DMZA 3L9NA 2JC6A 5M09A 2GTMA 3SDJA 3U4WA 4BI2A 4E20A 3QGYA 4M69A 2XJ0A 2JFLA 5BYLA 2HW6A 2RF9A 4YC3A 2H6DA 3Q3BA 1ND4A 3RPVA 2VGOA 4IW0A 5EM5A 4FK3A 2AC5A 4AE9A 2C5XA 5DT4A 3QRKA 3ZCLA 2GNLA 2JGZA 5AV1A 1YXTA 5IEVA 5HHWA 1ZOHA 5C27A 4D4YA 4XOZA 2OG8A 5IU2A 4X6RA 4RGJA 5GJDA 3QWJA 4OUCA 1CDKA 5E91A 2OZAB 3HV5A 4I4EA 3ZDUA 2ONLA 1UNGA 3K5VA 2X9FA 3AD5A 5AUZA 3RP9A 4B6LA 2C0OA 2ACXA 2OJFE 4FG8A 5F94A 2ITOA 5M06A 4CZUA 2ESMA 2J0JA 3IONA 1WBNA 3VBVA 3LMHA 2XRUA 4YUQA 2WMBA 3MBLA 1DAYA 1DI8A 3KULA 2Y4IB 3OTVA 4MXXA 3VRYA 3MGYA 4CRLA 4X2JA 2BFXA 2BAKA 4P4CA 3SXFA 2JDTA 1UU8A 3LJ0A 4AAAA 3RK5A 3UYTA 3LCSA 4GFGA 4DEBA 4DYMA 4GYGA 5A9UA 5HORA 4UEUA 3DTWA 4FKTA 3RAWA 3AOXA 3FYJX 2VTAA 4AOTA 3Q04A 3R9RA 3FC1X 4B4LA 2HZ4A 4ANOA 5IQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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