4RX9A

Syk catalytic domain complexed with a potent pyrimidine inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
277
structure length
268
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVTDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery and profiling of a selective and efficacious syk inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
total genus 91
structure length 268
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4rx9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4rx9A01
1YOMA 3A61A 2QHNA 2QI8A 4V01A 4EKLA 2OIQA 2YWPA 4N57A 1ZOHA 3CXWA 4IHPA 3GU5A 2UVZA 1W7HA 5A14A 4HW7A 4H36A 4L00A 3GOPA 2REIA 4BYJA 5HLWA 5FP6A 2NPQA 2YN8A 3T3UA 3RZFA 5LCKA 4BHZA 2VWZA 4QMOA 4U80A 3NAYA 2BCJA 4IADA 3AD5A 1JKLA 4RA4A 5JFXA 1ZWSA 2V22A 4I24A 2Y0AA 4G31A 4JX7A 4LV8A 3SKCA 5BMSA 3HV5A 1RJBA 4KINA 3UNJA 3NUXA 4MNEB 2R3PA 2VWUA 4ZXTA 1PJKA 5D7AA 4JX3A 2XB7A 1I09A 2C3IB 4ACCA 2UZWE 4FIIA 4IDTA 5EYKA 5M57A 2B4SB 5IEXA 3GI3A 4M7IA 1NT2A 1OI9A 2XCKA 4HYIA 4ORKA 2QC6A 5KHWA 1E1VA 3ZRLA 3N4VA 2XIKA 4DCEA 2V7OA 3TKHA 5HD4A 4O7VA 4KABA 3UC3A 2ZDTA 4LGGA 4BL1A 4FTNA 3A60A 3UMXA 3KRLA 4AGWA 3C4ZA 3DQXA 5C26A 4FKJA 2QOFA 3S00A 2CKOA 4G5PA 2PMLX 3R8VA 5ANIA 5ETCA 3L8VA 4ZTQA 5GINE 3UIXA 5C27A 2HY81 1MUOA 2FB8A 4FEXA 2JBOA 3MVMA 2W4KA 5CSPA 4HNIA 4O7NA 4MX9A 3QQFA 4RZWA 3KN5A 5EHLA 2R3NA 3WYXA 4CZUA 5A9UA 3NW6A 1UNLA 3ULIA 1E1XA 5IUHA 2PULA 4FT3A 5DHJA 2PTKA 4DFBA 4BZNA 4QMVA 4C33A 3SW7A 5BUIA 4H3BA 3TEIA 3UO6A 4QTEA 3D7TA 5AV4A 3QZIA 2BPMA 1H1RA 4FV0A 3SLSA 4FSMA 2PVLA 1FMOE 2OJGA 2PZ5A 4FIJA 5FM3A 5K4IA 4PPCA 5A4TA 1OPJA 3GFEA 5AR8A 3D9VA 5AV1A 2QG7A 2XJ1A 4ANNA 2B9JA 3BHVA 2JFLA 5HKMA 3OW4A 3FYJX 1PXNA 4XNEA 1YWNA 3BWFA 3TKIA 4G2FA 4UY9A 3BLQA 3NWWA 4EK8A 1PYXA 5HTIA 3P1AA 4W4VA 4XG8A 5E8YA 5DT3A 4ANOA 4S32A 3PXZA 1YWRA 4EHVA 2X2LA 2HZIA 1TQPA 3FSKA 4QP7A 2W1FA 5CQWA 3G0EA 2RF9A 3E8CA 4XLVA 3PFQA 4YLKA 4BDAA 3B2WA 3IGGA 2F7EE 4RZVA 4AA0A 2C6LA 2BHEA 2WB8A 2O64A 3KKVA 3P0MA 3PPJA 4LL0A 3ZUVA 4D0XA 2ERKA 2J51A 3C50A 2Y9QA 4JIAA 2Z7LA 4H3QA 4CKIA 1IRKA 2FSTX 4WOVA 5FXRA 5D7VA 2YIRA 5FTQA 3PE1A 5EQEA 1JWHA 4MWHA 4U3YA 2PU8A 4IB5A 1IR3A 5LVOA 4ACMA 3CC6A 5H8GA 4HPTE 1XQZA 3KXZA 5K0XA 4MKCA 4A9UA 3D5XA 3M11A 5JZNA 3QYWA 4OTQA 4FE2A 2R3LA 2GQSA 4IACA 5L6OA 3IK3A 4DTKA 3TJCA 2X39A 3UOJA 4EH8A 4E8AA 3LQ8A 4MWIA 4CV8A 3QWJA 4U5JA 2O8YA 4LG4A 4AF3A 4DT8A 3MFRA 5H2UA 2V55A 1TKIA 1O9UA 4BWXA 1M7QA 3RAHA 3ZO4A 2B7AA 4L67A 2OZAB 2YA9A 1BL6A 2BROA 1V0BA 4FNXA 1HCKA 4YP8A 5CF5A 4I4FA 4GUEA 4Y95A 4NW6A 4AU8A 4C35A 5BUEA 2RFSA 3R8PA 3PXKA 4L46A 4IVCA 2P33A 1Q8UA 4QMSA 4EH6A 3D7ZA 4MXYA 1ZARA 2UW6A 2CLQA 4FSUA 3FPMA 5DR6A 4GIIA 3LFFA 2X8IA 2BFXA 3PG1A 4BIDA 4EOKA 4UMUA 5L2IA 3ORNA 4NM3A 4E5AX 3R8ZA 3SC1A 2H96A 3DK6A 2J4ZA 3VS6A 3ZYAA 4E6QA 4TNBA 4EOSA 2I0YA 4AE6A 3ZEWA 4TWNA 4GT5A 4BBEA 2Y6MA 3QU0A 3C5IA 4J71A 1OKYA 3DK3A 3NVMB 4M69A 1XO2B 4TYEA 2P2IA 5BMMA 5A46A 2PE1A 1OIYA 4UYNA 3UQGA 3VAPA 4D55A 4HVIA 1SNXA 5E90A 2BAQA 2WQOA 4ZJJA 3R9DA 3LFBA 4AOIA 3DBEA 2A4LA 3AC3A 3FC1X 3W2QA 3ROCA 4CRSA 5CI7A 5J79A 2IO6A 4H3PA 2J7TA 1H27A 2VU3A 4ZSJA 1TVOA 4I0RA 4U42A 5I9WA 1KSWA 2PUIA 2ITYA 2XZSA 2IG7A 3R71A 4BICA 4C02A 5D1JA 4S31A 4U8ZA 4F6SA 4I20A 4FZ7A 2X8DA 3I4BA 4L3JA 3QRKA 4O7LA 3CEKA 2GMXA 4HGSA 5AX3A 4XLIA 4E93A 2JFMA 2OIBA 4RFZA 5DWRA 2BKKA 3D4QA 2F57A 2UW5A 2B9FA 4V04A 3Q32A 5HNGA 1GAGA 4C4IA 4FVRA 4P5QA 3BI6A 3DGKA 2JKMA 4ZJVA 2UW0A 4MCVA 3V04A 4OLIA 4BGQA 2FGIA 3ELJA 4M84A 3R0TA 1YI3A 3RCDA 4O0SA 5AAEA 5BVDA 3NNUA 4IVBA 2YM5A 3PZEA 4IB0A 3P86A 4RJ8A 5C8NA 3DOGA 2W1EA 4QYGA 2QCSA 2UVXA 1URWA 4ANSA 2XYNA 1H00A 3HUCA 1XH9A 3BE2A 3ZO3A 2YABA 4QQCA 5B7VA 3HV3A 5F9EA 5DNRA 4BN1A 1Q5KA 1WFCA 2QKWB 4JBVA 3ORMA 2H9VA 4LUDA 2BFYA 5JGBA 4GS6A 3IW7A 1EH4A 4YZNA 1OITA 4C62A 2WMRA 4YJPA 1K9AA 4OBOA 3UG2A 4DEAA 5CEIA 4FV2A 3HRBA 2WU7A 4WUNA 4TW9A 4XX9A 5CWZA 3WF9A 4CTCA 2IZUA 4DEDA 1ZYJA 2ZDUA 2OKRA 5DEYA 2YACA 5BX0A 3PUPA 5D41A 1PRYA 3KXMA 2GU8A 3MW1A 5DOSA 4I6FA 4L45A 2OH4A 1JSTA 2VTRA 3BWJA 5AUTA 2WELA 2ZYBA 1QPCA 3FZ1A 4OGRA 4FKIA 4XP2A 2HW6A 3ZLSA 4MBJA 4P4CA 1H07A 4EK6A 3CPBA 4C3PA 4JR3A 2Q0BA 4JBOA 4UMTA 5E1SA 3F7WA 3GC7A 3RINA 1QPEA 4PWNA 4FIHA 4F1OA 4FSQA 4RRVA 5K9IA 1Z57A 4QMYA 4G3CA 3D5UA 4QPMA 2OK1A 4ZSAA 1LPUA 1UNGA 2VD5A 2WXVA 4CEGA 2XRUA 4RVMA 2PMIA 4F9AA 5CU0A 2BTRA 4IB1A 4O22A 3R7OA 2VNYA 3LJ1A 4O0RA 3QAME 5BYZA 3SG8A 1ZYDA 3O2MA 3H30A 5D11A 4CLJA 4DFZE 3RNYA 1URCA 3QQGA 4OAVB 3FXXA 2BRNA 2C0TA 5A4CA 3W2SA 5J9YA 3QFVA 2W1CA 3W18A 3FY0A 4FV7A 5F20A 4GU9A 3ETAA 3FLYA 2Y4PA 3VF9A 5ICPA 2W1IA 3EWHA 5H9BA 4KAOA 3G0FA 3FQEA 4YHJA 4BCJA 4BDJA 4O6EA 5HO7A 1H1QA 4TYJA 3W16A 5JSMA 2UZVA 3DBFA 3M42A 2CGVA 3TL8A 4EH4A 4R7IA 5DVRA 4O83A 3C4XA 1U54A 1Q24A 5AP0A 4D5KA 5AADA 4M0YA 4O91A 4W8DA 2JKKA 3TNQB 4YNOA 4X2FA 2ZV2A 4BY9E 2DUVA 2XJ0A 3UJGA 2RG6A 4RG0A 2WTIA 4R7HA 4OTWA 4ZLZA 3V5QA 3MA6A 4AFJA 2F7XE 3DBDA 4BIBA 4G9RA 5GHVA 3F3ZA 4FTOA 2JDOA 3PE2A 4ID7A 2PVKA 3F3UA 4ZY4A 1RE8A 4B4LA 4DGNA 4IH8A 4FG8A 4C37A 4IZAA 4PV0A 3NYNA 3H0YA 4UMPA 1AD5A 4J53A 3PSBA 3F82A 4QMMA 5A54A 3R7IA 4S2ZA 2PHKA 2YDJA 5KZ0A 1OVEA 4EK5A 2BDJA 3TXOA 4BTKA 4EH3A 3IGOA 4XJ0A 1LEZA 4EOLA 3EFJA 3GENA 5IDNA 1OIRA 2GNIA 4ACHA 3TUCA 4MH7A 1PXPA 5DE2A 2XK7A 5CNNA 1YHSA 3MFTA 4RBLA 2CN8A 2GS6A 4EOIA 1GY3A 1R1WA 4AZFA 4BDIA 4HVDA 3PJCA 2C5XA 3CCNA 4PY1A 5LARA 4TYGA 3R30A 3PJ3A 3EQPA 3TG1A 4I94A 3MDYA 3JY0A 3G15A 5GZ8A 3DJ6A 2BRHA 4C61A 1ZY5A 3DTCA 4MQ2A 3IDCA 3RGFA 4RJ4A 2A27A 2GS2A 2ITNA 3HNGA 4FTQA 4RWKA 2OGVA 4ERKA 1UV5A 1WCCA 2QR7A 3QQJA 4YHTA 3UVQA 2ZMCA 4MTAA 4X0MA 4EK4A 3IW4A 3NIEA 3LCDA 4CFVA 2PYWA 2EUFB 2VTQA 2BZIB 2QR8A 4HCVA 4IC8A 5JKGA 1G8SA 3PY3A 3UIMA 1BUHA 5FXSA 3BYOA 3ZEPA 4GKIA 4QMXA 4PDYA 4G17A 2QHMA 3PVBA 2OI4X 3DJ5A 3R2YA 3VUIA 3EH9A 3A7GA 3POOA 3E8NA 4W9XA 4Y72A 3W10A 4K8AA 3EIDA 2C0IA 4QMUA 4DEGA 4JG6A 4BZDA 3MGYA 3R7YA 2CKEA 2XNPA 2EWAA 2YM8A 5HO8A 3MH3A 4YZBA 3LW0A 4IIRA 5EYMA 4DLJA 3ZRKA 3E7VA 4IZYA 4BKZA 4EBVA 5EQYA 4XYFA 3CD3A 3E8DA 4Q9SA 3PZHA 2C47A 4PP7A 4C58A 3BX5A 3K5VA 4QMNA 2ACXA 4O0WA 3VW8A 4AP7A 3FQSA 4C4FA 5KMJA 3U6HA 1JQHA 2BAKA 4DEBA 3VUGA 5L6PA 1M2RA 4IJPA 1YHWA 1YXUA 1Q99A 3PRFA 4IBMA 4APPA 1TQIA 4KIPA 3R8UA 1I44A 4FEUA 3OP5A 1GZOA 3AT2A 4FNYA 4F6WA 5HTBA 4JLCA 2J0KA 4FKVA 5CLPA 5A4EA 5FBNC 3TTIA 3OUNB 3V8TA 4FV5A 4YJUA 3BV2A 4X3FB 3BCEA 1MRYA 3QD2B 4QNYA 5CQUA 3QCXA 5FEQA 1CSNA 3MH2A 4RQVA 2VTHA 4MNEA 4IAZA 4BF2A 1MQBA 4YZ9A 3VS7A 4ITJA 4J8MA 3VBYA 4ONAA 3UMWA 3LJ0A 1UWJA 5A4LA 3RJCA 3G6GA 2VX0A 5J9ZA 2RKUA 3DLZA 4KBKA 2WZJA 4M67A 1RW8A 2Y4IB 1H1SA 2AYPA 2VTIA 3L9PA 3NNXA 4USFA 3LCOA 2G1TA 3HDNA 4UXLA 4YU2A 5M56A 5E8UA 4Y83A 3H9RA 3QA0A 4LGHA 4ZZOA 3QYZA 4YC8A 4BBFA 3GU6A 4O0XA 2C5OA 4ASEA 4EH2A 2R64A 3LAUA 4RJ7A 4XV2A 4D1SA 3SA0A 3OT3A 3FLZA 1CKJA 3Q52A 3A7FA 4I0TA 2UZTA 4C3RA 3MYGA 4D4YA 3AC8A 4DBNA 4FV1A 3FLQA 4BCHA 2RGPA 2PUPA 3L9MA 2LGCA 3MFUA 2IW8A 4OUCA 3NDMA 4TWCA 5LJJA 2EVAA 3P7CA 5J8IA 5KHXA 1OGUA 5HESA 3VNTA 5M4UA 2YWVA 4DFUA 3TACA 1J7LA 3E62A 3ATTA 2OLCA 1NVSA 2BALA 4DGMA 3DT1A 3UC4A 2VO6A 5IQFA 4F63A 3MB6A 4NYEA 2VTNA 4KBAA 3Q60A 5JQ5A 2WTVA 2FSLX 1Y6BA 3COKA 1H4LA 2HK5A 1YDTE 5HVJA 4CZTA 5JFVA 5KUPA 2BRGA 5HCYA 2C5VA 3K2LA 2XRWA 2R7BA 4EYJA 5CAOA 2R0UA 3C1XA 3LCTA 4AGCA 1DI9A 2C6TA 3VC4A 4FSRA 3KRJA 3KQ7A 4FSZA 4QTAA 3VS3A 3B8QA 3O51A 3V3VA 3CS9A 4BYIA 5J7HA 3U9CA 4ZK5A 3F2RA 4Q9ZA 3MPMA 4CVAA 5I3OA 4PMTA 1H08A 4D1ZA 5I9ZA 3KB7A 4FV9A 5EI6A 4GH2A 4YR8A 3E87A 4EHGA 4OTRA 5B0XA 3BKBA 2XK3A 2XEZA 4P7EA 4E5WA 2CNUA 4NEUA 5HG8A 4Y46A 4XCUA 1YOLA 4G16A 1YDRE 5KKRC 4WNKA 2ZMDA 3MN3A 1Q8TA 4YTIA 5ANJA 2F9GA 4OBPA 2VUWA 3DZQA 1YI4A 5JGAA 5G6VA 3RAIA 1P5EA 1FMKA 3CQWA 2CPKE 4E4MA 5DRBA 4OTHA 3O96A 5EI8A 2EXEA 3E93A 3AD6A 4GW8A 3SRVB 4L8MA 4GYGA 4P2KA 3UP2A 3V8WA 1MP8A 1J91A 2KTYA 5FUTA 4NTSA 5J87A 1JKTA 5CZIA 3O8TA 3WARA 2CKPA 4AW5A 4DG3E 1W82A 2QO9A 4DBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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