4S32A

Crystal structure of erk2 amp-pnp complex
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
351
structure length
346
Chain Sequence
AAAAGPQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of ERK2 AMP-PNP complex
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 111
structure length 346
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4s32A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4s32A01
2YIQA 4HYHA 3MPMA 4RIXB 5HBEA 4ZEGA 3R73A 5IA3A 1OUYA 2RFDA 2ZOQA 4GL9A 3UIXA 3D5WA 4FEUA 3R30A 5ANGA 2ETKA 2ITWA 3TWJA 3ZFMA 4MNFA 5TO8A 4FEXA 4L7FA 3KU2A 1WBVA 2C3LA 4G6OA 3V8SA 3FI2A 4O1PA 2OU7A 1QL6A 4JQEA 5AP6A 5EW8A 3UG2A 4QMQA 3GU5A 4WSYA 3CJFA 3EFWA 2B53A 4OTRA 3PZEA 4FIFA 4FTMA 2R3HA 3NUUA 4F9WA 3VHKA 1OIYA 3TNPC 1DAWA 3FQHA 4E6AA 2JDVA 3ZUUA 3GC0A 3V5JA 1Z5MA 4NW5A 3GUBA 4DG3E 4G6NA 2UZBA 3W10A 5H8EA 3TUBA 5CSPA 3U6JA 3UNKA 1Q3WA 4MXYA 5DEWA 3VS5A 1WBWA 3PE1A 2BKKA 1YWRA 4BI1A 4JT3A 2XYUA 1XH8A 2HENA 3P4KA 3W55A 4FSUA 5BYZA 4NM5A 2IW8A 2PL0A 4BN1A 4S33A 3OT8A 4KBAA 4ACMA 5AAFA 4OAUC 3OCSA 5A46A 4H05A 3Q6UA 4EBVA 1YXXA 5KO1A 1R0PA 5L8LA 5A6OA 5FP5A 5BQ0A 3KULB 1IASA 4XG4A 3LJ0A 2WTWA 2XNMA 1BLXA 3CS9A 3KRJA 4CMUA 4RWKA 2LAVA 3SRVB 4DG0E 4E5WA 2YM4A 3MY5A 3TV6A 2W06A 4AT5A 4EQCA 4JDJA 2O2UA 4FEQA 3C4XA 4DT9A 2Y6OA 4BIEA 4AFEA 3DQXA 3GGFA 2EUFB 1YHWA 3A62A 3EQBA 2C1BA 2VU3A 5AX3A 4U97A 2E9NA 3NUPA 4O7NA 4EK6A 2JDRA 4FTUA 1MP8A 3NWWA 4FL2A 1R78A 1BYGA 4EOSA 3W2RA 3OFMA 3QYZA 2CKQA 1KUTA 3V04A 5DYJA 4EHEA 1ZAOA 5DMZA 1ZLTA 5IA2A 4I6BA 4O7LA 2FGIA 2V5QA 3H0ZA 2Y8OA 3DZOA 4O0UA 5ETCA 4NFNA 3FZ1A 5HQ0A 3UDBA 2OK1A 2W9FB 1V0BA 3MFSA 2AC5A 3PA4A 3BZ3A 3Q53A 4I5CA 4YBKA 5A6NA 3MSSA 1JKTA 4FTCA 4OAVB 2C5VA 2CMWA 4YZMA 3PY0A 1YI4A 1UWJA 2QURA 5E91A 4X2NA 3ZEPA 4BRXA 5IH6A 3KEXA 4MXZA 3LFCA 3KCKA 4WSQA 4I0SA 4R3CA 3W2OA 2P2HA 5E1EA 1XBAA 2XK6A 1OKVA 3SG8A 4KS8A 4M0YA 4QP7A 3F3UA 4X6RA 5EHOA 1LR4A 3FZSA 5CF4A 1IAHA 1IAJA 2C4GA 4M67A 5JSMA 4NIFB 2QKWB 4KRCA 4KIPA 4D2TA 2DS1A 3QA0A 3A8WA 4CFFA 1UNGA 2BPMA 4I0TA 2XNPA 1H1PA 3NCGA 4FVRA 5CU2A 4X0MA 4YPDA 5E8TA 4ZTQA 3BYUA 4AQCA 4R5SA 3V8TA 2GHGA 4CXAA 5JRSA 4FV3A 4BWXA 4IDVA 4JJRA 1OUKA 1GAGA 2W96B 4TWCA 5E8XA 2VTOA 3CTHA 4S30A 3QXOA 3AC3A 1CTPE 2QOQA 3D5VA 3HNGA 2C6OA 4ANBA 4LGHA 3R0TA 2FSTX 4FIIA 4Y73A 3T9IA 3FJQE 4DFNA 1ZXEA 2W99B 3OS3A 1ZYSA 4D28A 3IKAA 3PFQA 4BCOA 5CI7A 4R78A 2R3MA 4F6SA 4QRCA 2YDJA 4FZFB 3MB7A 2PVKA 2YWPA 3EQRA 3QZIA 4W9XA 2R3JA 4Y8DA 3F3ZA 3U9NA 2GS6A 2B55A 4W4XA 2QO2A 3P08A 3MS9A 4U40A 4DGOA 5LCJA 3K5UA 3GU4A 3NEWA 3RCJA 3RVGA 1YXSA 4ZTHA 4RVLA 4RWLA 4UXLA 2WMQA 3SXSA 1ZYJA 4MX9A 3EQFA 3HZTA 5EI2A 3RHKA 2OH4A 3FZPA 5K5NA 4IACA 2R9SA 3V6SA 2IVSA 4MQ1A 2C6LA 1YWVA 1URWA 1VYZA 3QQLA 2OICA 2CSNA 4YJRA 5L6OA 5T6KA 5DBXA 1YW2A 5LVNA 4E5AX 4D2WA 3ZUTA 3L8XA 4L53A 2YABA 4PDPA 4AT4A 4BTKA 4BCQA 4HVIA 4XRJA 1ZMVA 2B52A 2GNGA 3ZO2A 3NVKI 4BHZA 4ENXA 4IM2A 1OITA 4XG3A 2PULA 5FEDA 4BGGA 1UNHA 4ITJA 4FG8A 3KGAA 2BAJA 1ZARA 2PVFA 3LCTA 4ZXTA 4QP2A 3BCEA 4EZ7A 1ZWSA 3LXNA 4FV7A 4LRMA 4AGUA 4F1OA 1OKWA 3DTCA 2C5NA 5KBQA 4RIYB 5CAVA 1YI3A 3ETAA 2NRYA 3P23A 1XR1A 2VTIA 4PWNA 2P0CA 5CEIA 4DH1A 5IA0A 4JRNA 5CTPA 2X8DA 3F7ZA 2ESMA 4GUBA 4FYNA 1PKGA 3PP1A 2EXCX 2A27A 2R3PA 4K11A 1W0XC 4CMTA 2GQSA 2OGVA 3SC1A 4G5PA 3PVUA 2KTYA 3IW7A 5KKRB 1QCFA 2VD5A 4LOPA 5FDXA 5DE2A 4OR5A 3C51A 5J7BA 2QLUA 3FUPA 3P7AA 3RI1A 4W4WA 4C35A 4BDCA 2GHLA 4S32A 3P86A 4AF3A 4UMRA 1UKHA 5AR4A 5JN2A 5D1JA 2VTJA 2W1EA 2OIDA 3G0EA 3MVMA 4HOKA 4GRBA 4MBLA 4O1OA 3IG7A 3T8OA 4OTGA 3SAYA 4G1WA 1QMZA 2B9JA 3AC2A 4BKYA 2BZIB 4YTFA 5ICPA 1PKDA 5IG1A 2UZLA 1V1KA 2G9XA 4O82A 3QU0A 2F2CB 5FXRA 2WMAA 3PA5A 3EFKA 3OROA 4PX6A 4QMMA 5IA1A 3PXZA 2OLCA 3OXTA 3CD3A 4FSRA 4EZ5A 4YP8A 4F7NA 4BDDA 3OBGA 4RWJA 3R21A 4CFMA 3IONA 1KE7A 1Z9XA 3F61A 3R6XA 2VUWA 3OMVA 3PVBA 2CLXA 4TYIA 2CCIA 3PG3A 4C2VA 2PU8A 4LOOA 3DT1A 3O8PA 4OTHA 1SYKA 1JOWB 2PTKA 4BDKA 4C0TA 4HVSA 4F1TA 3F88A 3PPKA 2OH0E 4G6LA 3GU6A 4KABA 3G51A 2QOCA 3P7BA 2YIRA 4BZNA 3FLYA 3GXLA 3QZFA 5HIBA 4ASDA 4MBIA 4QQTA 5JFXA 2B54A 5J95A 2E9OA 3EYHA 3VJNA 3DBFA 5I3OA 5I5ZA 2WHBA 4G2FA 5HE0A 4ZAUA 4QYGA 3RM6A 3BEAA 2I1MA 4FA2A 3IW6A 1H1RA 2PZIA 5LOHA 4DYMA 5HO8A 3MVLA 4UWCA 4DEDA 4DEHA 3R9RA 1NA7A 3BHTA 4QTDA 4BKZA 4O7WA 3HGKA 4NK9A 5CU4A 2UW0A 1U54B 3GOPA 5CF5A 4TNDA 5DG5A 5FBNC 3N4VA 1L8TA 3ZM9A 4HZSA 4ZSJA 2VO7A 4ZS0A 4JBVA 4F4PA 2F7EE 5J9LA 3C50A 3I5NA 5CZHA 4M7IA 2A19B 3MVHA 3W2PA 3SGCA 5BVNA 4IH8A 5CEQA 2R3QA 3JVRA 4IAKA 4EHVA 4FK3A 1H01A 4KSQA 2X0GA 3QAME 4CG8A 1JAMA 3DKGA 2GS7A 4KIOA 1NVRA 2BAKA 3CQUA 3MPTA 4M84A 5IEVA 4NW6A 4W8EA 2PWLA 4AN2A 2YLEA 5LWNA 2AYPA 2F7XE 1F0QA 4CFXA 3F2RA 3TG1A 2R3IA 3UNZA 4FNWA 2YFXA 2VTTA 3RK7A 4E6CA 1K2PA 4MWHA 3RWPA 3UQFA 5B2LA 3R8LA 1YRPA 5L2TA 3RAWA 4A07A 4KKGA 2A1AB 4RSSA 4TPTA 3D9VA 3R7GA 5GNKA 4Y46A 5HG7A 4IVDA 4MTAA 4CLIA 4MQ2A 2PPQA 2XJ2A 3QTWA 5H9BA 4YURA 4ITIA 3FHIA 5C03A 4W8DA 4XS2A 2OZAA 3GVUA 1UV5A 1GIJA 4MBJA 4F0GA 1PYEA 3OW3A 3LXKA 2XNGA 3PLAE 1QPEA 3GENA 3PZHA 1U5RA 2LGCA 3E8NA 4TYEA 2J0IA 5AV0A 5JGBA 3DFAA 5DA3A 4GU6A 2EWAA 4EQMA 4APPA 1ZYCA 3ZRLA 1P4FA 2CNVA 5JFVA 1SMHA 4GUEA 3BWFA 1RDQE 3BPRA 4YO4A 4UALA 3QCQA 5M55A 2GNJA 4ANSA 5DFPA 1OIQA 3BQRA 1SVEA 4YC8A 2W0JA 2X2KA 2O0UA 3LMIA 4U79A 1RW8A 4U44A 4BCJA 3OXIA 3H0YA 4CSVA 4EOIA 2HW7A 4DHFA 4F7JA 4WIHA 4EZ3A 5JGAA 3BYSA 1XO2B 3GBZA 4FKLA 5M4CA 3NDMA 4TWPA 3NCZA 1WAKA 4F70A 2WQBA 4IDTA 4FMQA 4X21A 5CNOA 5HNGA 4D2PA 3AC4A 4ZJIA 3QD4A 3H9OA 2HXLA 3HDMA 3IPHA 3WZUA 3D5XA 4F65A 5IDPA 2WFYA 4G34A 4AW1A 2OKRA 3DFCB 2PHKA 2PZPA 4ANLA 4S34A 3G2FA 3KK8A 4EK8A 3TKHA 3VBVA 3R9HA 2J0MB 2FA2A 4AX8A 3GOKA 4MAOA 4C4JA 5CANA 2ITZA 2R3RA 3QC4A 4PP9A 2OJFE 4A9RA 5AAEA 3MTFA 4G3FA 3CKXA 4E73A 2YA9A 4YJPA 5ACBC 5KBRA 1ZOHA 5HCXA 5CAUA 5IQAA 2QQ7A 4RPVA 1RJBA 2XKCA 4FEVA 4O0SA 4F09A 2GMXA 3LMGA 4QTBA 3O8UA 4N4SA 4BCNA 5HVKA 5HO6A 5J5TA 2NO3A 4HGEA 5DN3A 2GNFA 3DBQA 5HE1A 4PP7A 4ORKA 3H10A 3NYXA 2BILB 4BCFA 2R3GA 5L2SA 3DXPA 3KRRA 3HA6A 1F3MC 3UP7A 3MIAA 4P5ZA 1OZ1A 5IMEA 5JMSA 5FM3A 2W4OA 3HMNA 3SHEA 1YOLA 4HCTA 1STCE 4I1ZA 3U51A 1LPUA 4M3QA 4DFLA 3B8QA 1VJYA 3FMDA 4CD0A 1WVXA 3NIEA 2BDJA 4C37A 4O7YA 3Q9XA 5E4HA 3COHA 3E92A 5CSXA 2Q83A 4PPCA 3QD0A 3CJGA 3UODA 5HESA 3JUHA 3ZLXA 3VVHA 1H4LA 2DQ7X 4UMUA 5LVOA 3DKFA 4L3LA 2XIKA 2OSCA 3IW8A 5HU9A 3NNUA 5I9XA 4BWPA 3QX2A 3ET7A 3SXFA 4WUNA 2ITXA 3F2AA 4RVTA 4BTJA 2V55A 4IB5A 3C9WA 4YZ9A 3FDNA 4B8MA 5J7HA 4DF3A 4GYGA 4JBPA 5M53A 3VW8A 1UU8A 4M0ZA 2PMNX 2XCKA 4XRLA 3LQ5A 1YDTE 4EH2A 5AUUA 3EQCA 2YCRA 3DY7A 4IB3A 2HK5A 4JVGA 4PDSA 2BR1A 4FV8A 3A7JA 4FKQA 1JKKA 2ITQA 3HEGA 4WUAA 4ZSLA 4OBPA 3AD6A 4R3RA 3VJOA 5HTCA 4IAYA 3I5ZA 4AE9A 4QYFA 3PLSA 1NVSA 4Y85A 2CN8A 3WZDA 4EONA 4R5YA 4YJOA 1Q8UA 2J4ZA 3I0OA 4ZIMA 2Z7QA 3KF7A 3SOAA 3C13A 3R1QA 3WYXA 4DTKA 4O0YA 4FKTA 4O84A 4DA5A 4O6EA 1MRYA 2R3FA 1EH4A 2QG5A 3PXYA 3ZCLA 5IQHA 5AUVA 1SM2A 4PMTA 2WIHA 2QOBA 5AWMA 3TI1A 3TIZA 3Q6WA 4N70A 3KN5A 1M14A 2Y4IC 3EWHA 1Q62A 2WMWA 4FKUA 5FP6A 3VRZA 5K4IA 2QD9A 4QNAA 4ZTLA 4RIXA 2UUEA 3BYMA 4FIJA 5IA5A 4IX5A 2HZIA 4QMPA 4BI2A 3FY0A 2ITPA 2J7TA 4O2PA 2UW9A 4M66A 1KE9A 4L46A 3FSFA 4J8MA 3SA0A 4FKVA 1VEBA 5CVFA 4O0TA 3JR1A 3HV7A 3LZBA 3OUNB 3POOA 4AA4A 3C0HA 3ANQA 1H07A 4F6UA 2OF4A 3MGYA 5CSWA 2H6DA 3O96A 5HIDA 5J1VA 5EFQA 3ID6C 3EQIA 3A7GA 3OWPA 4XG8A 5DRBA 5AP4A 1QPCA 5J1WA 4UV0A 2JC6A 5AIKA 5FDPA 1YXUA 4LOQA 3FLZA 3LAUA 3NX8A 3RK5A 3ULZA 3C5IA 4F7LA 3ZLWA 2J9MA 2YAAA 3UOJA 4F64A 5BYLA 3A4PA 1ZRZA 3WOWA 2FVDA 4M15A 4TKSA 4GJ2A 3ZSHA 2PZ5A 4GK3A 4X3FA 1YOMA 3NNVA 2WB8A 3SX9A 4EKLA 3FI3A 4EOQA 5IUHA 5A4CA 3S4QA 5ACKA 2E9VA 4YC6A 4IJ9A 5EKNA 4DTBA 1PY5A 5HBHA 3KULA 2RF9A 4OTPA 2XMYA 3ZMMA 2XM8A 4R8QA 1ND4A 4FG7A 4IVAA 3PG1A 3RAIA 2V0DA 4I0RA 3LMHA 2W1GA 1GZNA 1V0OA 1WBNA 3ZOSA 4RIOA 3GEQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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