4X6RA

An isoform-specific myristylation switch targets riib pka holoenzymes to membranes
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
GNAAAACKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Isoform-Specific Myristylation Switch Targets Type II PKA Holoenzymes to Membranes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 107
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2014-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x6rA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x6rA02
3NNVA 5AX3A 1H07A 1ZZ2A 4IWPA 5JGDA 2VU3A 2UVXA 3ZH8A 5B2MA 5M06A 4YO6A 4NTTA 3BWFA 3EFWA 3VS4A 4M69B 3RWQA 4GT5A 5LWMA 3TNIA 1SVHA 2X7OA 4MEDA 3H9OA 4C35A 1XBAA 2E9NA 3V3VA 5FP5A 4U8ZA 3U9NA 3UMXA 4D5HA 4I6BA 1JKSA 3E8EA 4PDPA 1WZYA 2GHMA 4C36A 5EQPA 3FMLA 4JNWA 1PMUA 3L8XA 4IFGA 3KFAA 1Q97A 4W4VA 2R4BA 4IB1A 4DT8A 4FI1A 4DFNA 3OEZA 4G5PA 4F99A 4CLJA 4ZTQA 5L6WL 2VTPA 3VAPA 4J98A 4WO5A 3EQRA 4CMTA 2H6DA 5AP4A 3BLHA 4ZY6A 2OBJA 4FV6A 1GZKA 3GU7A 3ROYA 4DHFA 4TTHB 3PPZA 2J7TA 4L8MA 4S30A 3HAMA 1RE8A 3FXWA 4LGDA 1H24A 2OG8A 3P4KA 2QU6A 4L3PA 4LV5A 3F5UA 5AR7A 4A9YA 4ZLZA 5JFWA 3HMIA 3BE9A 3ALNA 3QCSA 4AGDA 4ID7A 3OOGA 3OY1A 3AD5A 5KUPA 5KX8A 2GNHA 3ZC6A 4A4LA 2VO0A 2PULA 3R1QA 1WBOA 4N57A 4BWPA 2XVDA 4IB5A 2HIWA 1Q5KA 4ERKA 2PVFA 4YZBA 4QMSA 4D0WA 2UZBA 3AC1A 3DS6A 1M2RA 4LL0A 3PWYA 4QNAA 3Q2MA 2BFXA 4ONAA 3C1XA 4PX6A 3BEAA 3GQIA 4IFCA 2GS2A 4KIKB 4JS8A 4Y46A 3FI8A 3EZVA 1B6CB 3A7JA 3ZDIA 5EYMA 1KOAA 3DBFA 1YWNA 5DFPA 5C01A 4RC2A 4CCUA 5EFQA 1CDKA 5EDQA 4DGNA 4DEBA 4FZDB 4S34A 4FTTA 4FNWA 3ZXTA 4DGGA 2GTNA 2WMBA 1ZZLA 3R21A 3NNXA 1OIYA 3DAJA 2W1EA 5CLPA 5LVMA 3D94A 3PPJA 2XCHA 4CMUA 1BYGA 3CIKA 4RA4A 1JOWB 2ZOQA 5AIKA 4M97A 3GXLA 3PG3A 2F7ZE 2GNFA 3ENMA 4I94A 2BDFA 3FLSA 3FZ1A 4C34A 5J9ZA 4QOXA 5D1JA 1YHSA 3RINA 4RWJA 4ZSEA 5L3AA 2XH5A 2GTMA 3QTUA 4FTLA 3DCVA 4FTAA 3JXWA 2C6OA 4FTMA 5JRSA 5KZIA 2W1HA 3W2QA 4YUQA 3W2OA 3DJ6A 3F3VA 4EKLA 3HV6A 1H00A 1PHKA 4G3FA 4B99A 3MFRA 2YHVA 4YJVA 5HU9A 3DNDA 4F08A 1CSNA 1W8CA 4TYEA 2AUHA 3AGMA 5CU0A 3EYGA 3TT0A 2XA4A 2J51A 5AUUA 3EJ1A 4AZTA 4O1PA 3I7BA 3I5NA 3QX4A 4MXXA 4FEXA 3MIAA 5EOLA 3LLTA 5L8LA 4HZSA 2XJ0A 2HZ4A 4AUAA 3Q60A 2A0CX 4EBWA 3UJGA 5BQ0A 5J1VA 5HX8A 2BAKA 3FL5A 4RRVA 3TNQB 5DVRA 2EU9A 2HYYA 3W32A 5HHWA 3MY0A 4IVBA 1BI8A 4KKEA 4ENXA 4Y5QA 3ANRA 4LUEA 3KMWA 4GH2A 4QMOA 5E8UA 1YDSE 4WIHA 3ZEWA 3W2CA 4UZDA 3UNJA 3QKMA 4UWCA 3R8ZA 5M44A 5GNKA 3F3TA 2YCQA 2JAVA 5AWMA 4EWQA 5FWKK 4RJ8A 1PXJA 5I9VA 1OM1A 3U8WA 3BHHA 3EN7A 3FZSA 4GJ3A 1GY3A 1KOBA 5CAVA 4IZ7A 2BILB 4Y95A 4F6UA 5HKMA 4UWYA 5A6OA 3QTWA 1BKXA 3VBVA 3PP1A 3C4FA 3ZO4A 4IZAA 3QUPA 5DE2A 4D0XA 3UOHA 2EWAA 5EDPA 3QUEA 2GDOA 5CNOA 4HOKA 5AUTA 4A9SA 1H0WA 4N4SA 3LM0A 2PYWA 1O6YA 4XG2A 4GFGA 2I6LA 2C5NA 3RPSA 2ONLA 2YM3A 3ACKA 1STCE 4K2RA 1WBNA 2OI4X 4MHAA 4MKCA 4W9XA 5ACKA 4WG5A 3ZM4A 2WMWA 1ZOEA 3AMAA 3EFKA 2O0UA 4L53A 4M15A 2ZAZA 2PHKA 3OTVA 3LFBA 3DK6A 2O3PA 4PDSA 4CFMA 4L46A 2JIUA 4BC6A 3CXWA 3WZEA 3O7LD 2OK1A 1WBTA 2IVUA 4P7EA 4AGUA 3AT2A 5CZIA 4EWHA 1RDQE 3N4VA 2VX1A 5M51A 3OUKA 4V05A 1ZLTA 3ORTA 3DLZA 3GT8A 2VTIA 2PMNX 2WB8A 2Y4PA 4I6HA 3KF7A 3RPOA 2B0QA 4G31A 3NMUF 2PMLX 3FMNA 2FSLX 5A46A 1YHWA 3QQKA 3S00A 4KSPA 4F65A 3I0QA 5HVKA 1UVRA 5IA4A 3I6WA 3ORIA 2XIXA 1SVGA 3OCTA 4J99A 1SNXA 4ZLYA 4QMMA 4D2TA 5IQCA 5FLFA 4PNKA 3LMIA 3B2TA 1UU3A 5E8YA 4QMZA 2VGOA 4ALUA 3OP5A 3ALOA 3OZ6A 4G3CA 2VTAA 4O7WA 3R63A 4O7VA 3IGOA 3D14A 1VJYA 4YJQA 1XBCA 2VX3A 4BTKA 3MIYA 3C13A 2JIIA 2XZSA 4OR5A 4RFYA 5HQ0A 4FSWA 5HO8A 4IXPA 5BPYA 1ZMVA 3PA4A 4MWIA 3N4TA 5AA9A 4E6CA 2YZLA 3NUPA 1RW8A 4BDFA 4F4PA 4ZOGA 4UALA 1UNGA 4HVGA 1GIJA 2W4OA 4FSYA 4NKAA 4ZZNA 3FSKA 5CZHA 2YA9A 3B8QA 4LRKA 3A8WA 5IUHA 3CSVA 3OXZA 5D10A 4GS6A 2Y7JA 3E63A 3SKCA 4BDJA 1P4FA 2W5AA 3A7GA 4O2PA 2WTKB 3BQCA 2XK3A 5F9EA 3UQCA 3NDMA 3AC3A 1H01A 3QFVA 2WHBA 4QP6A 5CVFA 2EXEA 4YGAA 5ITAA 4TYIA 2BHHA 5CU6A 1U54B 3DGKA 2UW7A 4HZRA 4MD8E 2QO2A 4YSMA 4OLIA 2B55A 2W9FB 4U45A 3PSDA 4G17A 3NCGA 4V01A 2W17A 5AR2A 4AF3A 3ZLSA 2UW8A 4DTKA 4UMUA 4HGSA 4F0GA 2OJFE 2R3GA 4JIAA 5CEIA 2Z2WA 2VTHA 1AD5A 4YJPA 4G9RA 3DDQA 1A06A 3A7IA 1JQHA 4J52A 2NPQA 4XOZA 4YO4A 1U59A 5GJFA 1ZOGA 4I93A 3DFCB 5M57A 4RJ5A 5A4TA 2YDKA 4H39A 4BL1A 3NNWA 3O23A 4C4IA 3GCUA 5JN2A 4I21A 5I9UA 5J5SA 5H8BA 4O7RA 1F3MC 3LJ0A 2WIPA 4JI9A 3MB7A 2IW8A 1DAYA 4EYJA 5CEMA 2OF4A 5IQDA 5HTBA 2OKRA 4AA4A 4RIOA 2IZTA 3V5WA 4L7SA 3EQCA 4XLVA 2UUEA 3ERKA 4OTIA 3R73A 5HBHA 4EL9A 3PFQA 3BEGA 4QQ5A 1H4LA 4DH3A 3AMYA 2QG7A 5AM7A 2VUWA 4M12A 4UMTA 5EM8A 3MBLA 2CN8A 5J1WA 4O7YA 2IN6A 4ANMA 2QLUA 3E8NA 1OIQA 2OIDA 2W96B 2PY3A 4G3EA 5HG9A 4C59A 2XS0A 2Z8CA 5JQ8A 2YISA 3QRIA 5AIRA 1ZAOA 4WNKA 3G6HA 2ITOA 1FMOE 5HOAA 3H4JA 1UA2A 5HG7A 4W4WA 4FTCA 1Y8YA 3KRRA 4JDIA 3OXTA 4JQ7A 3FDNA 4BGQA 3IPHA 3ZHPC 4CLIA 4L01A 1TQPA 4I5CA 4TW9A 2YDIA 3WZJA 4EK8A 3UIMA 3E88A 4A9RA 5J9LA 4R1VA 3L9MA 4AW2A 3KVXA 2WTIA 2OW3A 5TKDA 4DFUA 4TL0A 2OH0E 2C6MA 4FV0A 5F20A 1URWA 3R22A 3W33A 4FT3A 3LMHA 2XBAA 2IW9A 3D83A 2IZSA 4U79A 4FKPA 5BVOA 4ZSAA 1KE5A 4IB3A 1BL6A 4KIPA 4P90A 5CENA 4L42A 3ZONA 4D2VA 4H58A 5HTIA 4TXCA 4KBCA 4G2FA 2CGUA 1SZMA 3Q96A 2C6LA 4FSMA 4DA5A 3VBYA 5C03A 3LKMA 4L45A 3NWWA 1R1WA 2W0JA 5CSXA 5DA3A 3TZMA 3UP2A 3OFMA 4MXAA 4MX9A 5IUIA 4B4LA 4RIYA 5DMZA 3UVPA 4AZFA 5EI8A 3TZ8A 3KN6A 4RX7A 3UTOA 5I9WA 3VS1A 3FBVA 1SVEA 3MH0A 4IE9A 4PL4A 5E8ZA 3LQ5A 3QGWA 5FRIA 3RGFA 5HLWA 4EOMA 4O83A 5LMBA 3IDCA 4QMYA 1K3AA 4XJ0A 4LRMA 3R8MA 5IQEA 2WU6A 2W9ZB 2WMUA 4N70A 4NK9A 4RIXA 4RPVA 4CKJA 3IK3A 4L3JA 4QTEA 3D7TA 5IA1A 3TG1A 4ITIA 2C0OA 3IW4A 3VW8A 4EK4A 4GL9A 1W98A 5EI6A 2J0LA 3R2YA 2YIWA 4DG3E 3MH3A 1W0XC 5DG5A 3JUHA 3BRBA 5HG8A 4C0TA 4E5BA 4BF2A 4MK0A 4PPCA 3UODA 4F7JA 3REPA 3ZTXA 3MDYA 4FEWA 4F7NA 2ZDTA 4YPSA 2OU7A 4AN3A 5E8TA 5JMSA 4KABA 3EL7A 2OXXA 4YJOA 3V8SA 4IVDA 2QVSE 2JDVA 3MGYA 3FQSA 3VUTA 2R9SA 3A2CA 3SW4A 3F88A 4L52A 5H8GA 3ZEPA 4FTOA 1E1VA 2ITUA 4NM0A 2B53A 4X0MA 5A4LA 4BGHA 3CE3A 3CR0A 4K8AA 4K33A 4DEEA 2Z02A 3Q32A 2XK9A 1Q8UA 5AR8A 1JSVA 4R78A 1GNGA 2BZIB 3MA6A 4XV3A 1YQJA 4AW1A 2CDZA 4ZLOA 2OJJA 3AT3A 2O2UA 3ZZWA 5EG3A 4FKLA 5H9BA 1Q8WA 4YJSA 1LEZA 5CWZA 2XB7A 3VQUA 5HLNA 4DLIA 2B9FA 3L1SA 3TTIA 4RFZA 2CCHA 2WMXA 3CQWA 4H3BA 3ZFXA 4CTCA 3DZQA 4EOSA 1CKIA 3MESA 3C4XA 2BZHB 2YIRA 2VTLA 3CPBA 4FV2A 4E73A 3HA6A 2UZNA 3SV0A 3SQQA 3QZHA 5JFVA 1H1RA 1XQZA 3CTJA 2UZEA 3W8QA 5CS6A 1PMEA 3VBTA 3F3WA 1PMNA 4KRDA 3TUCA 4M67A 1XH4A 2J90A 2P4IA 2PVHA 2ITVA 5CSHA 4I5MA 4X3FC 4FIIA 3QTRA 1PXMA 5TF9A 2WOTA 3NS9A 4FV9A 2GNLA 1VEBA 4XP3A 5LVPA 5CALA 4O0YA 5ETFA 4MXZA 5LARA 4RIYB 4WHZA 2G2HA 4HCTA 3MJ2A 4JBVA 3ZM9A 2RKUA 4QP2A 2NRYA 4PY1A 4UBAA 4KD1A 2IZRA 3CGOA 1QPJA 4DEIA 2V0DA 3NUNA 2YIQA 5M4CA 3BKBA 5CI6A 4IX3A 1BMKA 5CSWA 3IS5A 3TNHA 2X8EA 2YM4A 4PNIA 5CANA 1REKA 4NW6A 4FTKA 3CKXA 4ZTHA 5I4NA 3VS2A 4O82A 1O9UA 1OGUA 2BRGA 3MFUA 5HU3A 1UWHA 3OHTA 4U44A 5BVNA 5LVLA 1WFCA 4DEAA 2QLQA 4C8BA 4ZZOA 5LVOA 4EZ7A 3ULIA 3KRJA 4IIRA 3ZRMA 4QTAA 4FKRA 1B38A 1OL2A 2C0TA 2VWUA 3M1SA 5IA2A 2JBOA 3F5XA 3FUPA 2E2BA 4I22A 4OBOA 5I3OA 2UZTA 2DQ7X 3FMJA 3W2RA 2X6DA 4JR3A 4CKIA 1YI4A 4HYUA 3NIZA 4MF1A 4NIFB 3RPYA 3Q5ZA 2JGZA 2IVSA 2KTYA 3BHYA 2WAJA 3QHRA 4FVRA 4X21A 3TUDA 2QOLA 2I7QA 2WTCA 3SVVA 3D2KA 4YC6A 4E8AA 5A4QA 3VBXA 3EQPA 3LFFA 4HJOA 4GT3A 3K2LA 3W16A 1DS5A 2QI8A 4RLLA 4O7TA 3BHUA 3PJ1A 1APME 2CMWA 4DEGA 2V55A 2YLEA 4AN9A 2YIYA 2B7AA 3C4WA 4GV1A 4Z7HA 4E6DA 2X4ZA 4TWNA 2R3FA 2V5QA 3TACA 2EXCX 1A48A 3NRMA 5H3QA 5AM6A 3TKUA 1OPKA 5BVDA 5AAGA 4O86A 2A19B 3U55A 2R0IA 1PXPA 2C1AA 2R3NA 1QL6A 4FIJA 3UOLA 3RAKA 1VYZA 2CLXA 3NUXA 3UO6A 2BDJA 1U5RA 5L6PA 2XCKA 1S9JA 4UYAA 4MCVA 4EORA 1LUFA 2CNVA 3HZTA 4FTUA 2FGIA 5JRQA 5CVHA 2OIBA 1DI9A 2FYSA 2JKOA 5LQFA 3LFEA 5FQDC 1H1SA 4XBRA 4ZIMA 4AT5A 5IF1A 4E4NA 5B0XA 2OIQA 3P23A 1ZYLA 3HL7A 4IWQA 4FK3A 2G9XA 5ANGA 2HELA 4J95A 3LOKA 2XP2A 3NUYA 5AAEA 1IRKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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