4XP2A

Crystal structure of erk2 in complex with an inhibitor
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
346
structure length
337
Chain Sequence
GPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFPKEKLKELIFEETARFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Combining `dry' co-crystallization and in situ diffraction to facilitate ligand screening by X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 108
structure length 337
sequence length 346
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xp2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xp2A01
3R6XA 4QMNA 3ERKA 3SAYA 4DH1A 2V22A 4FKWA 4WKQA 2BRBA 4HGSA 1TQMA 2UZTA 3Q04A 5CEOA 4L9IA 4RJ8A 4WBBB 4QTAA 3IW4A 4CZTA 4WUNA 3ATTA 4LRJA 3MY1A 5FEDA 4NTSA 5TKDA 4JG7A 1ERKA 1U59A 3LMGA 4FVQA 4TWCA 2Y7JA 4WA9A 3QX4A 4IDTA 3KXNA 2UZUE 2C4GA 3LCTA 4YJVA 5HGIA 3H9FA 3ZO1A 4GG5A 5KE0A 3TL8A 2CCHA 5GINE 4AN3A 3QU0A 5EYDA 4UYNA 2WTCA 3D7TB 4FT5A 4RFYA 5GIOE 1R3CA 3NYVA 4IB5A 4DINA 2JD5A 2J0LA 1BI8A 3GBZA 2WMVA 2GHMA 3C4ZA 3I7BA 5JN2A 3QZHA 4FEVA 3A7JA 3QQHA 4RGJA 4BWXA 3RNYA 5EYMA 3EQDA 4RIYA 4XLVA 3GNIB 4YLLA 1MRYA 4FT0A 4X2GA 5AX9A 2R3NA 3GU7A 4BCOA 4QMMA 4W8DA 3W2PA 2XYUA 1REJA 3RBWA 2WMTA 4AU8A 3Q9WA 4QP6A 3BRBA 4FTRA 4M15A 4AAAA 1PRYA 3I60A 4DGGA 3FZPA 2PMOX 2ZM1A 3GCVA 3PA3A 2VGOA 3KRXA 4D2WA 5LJJA 4K33A 4MXXA 3IK3A 3TT0A 4D2SA 5IEXA 5H8EA 3HAMA 4GJ3A 4BTJA 4FTUA 3CC6A 3KEXA 3DK6A 3EMGA 3P7CA 4IEBA 5FXSA 2GNHA 2OIBA 3OW3A 3VW8A 2HW6A 2XF0A 4IB1A 4KD1A 3HA8A 2VUWA 4G6LA 2ITXA 4ID7A 2CDZA 4OTWA 3HRBA 3IS5A 5ANKA 3UIBA 1UNGA 4UWBA 3G51A 4QNYA 4WSQA 3VF9A 4I5PA 4NIFA 1MRVA 2JIVA 2WEVA 4RIXA 3ZYAA 4YZBA 4WNOA 2C6EA 4CMOA 5HX6A 4EONA 3L8PA 5HU3A 2OF4A 3HMMA 2BKZA 1XWSA 3OMVA 2CKEA 2FSLX 4RWIA 4YC3A 4AFEA 4YU2A 4D0WA 2PUNA 4ZY6A 3TNHA 2YCFA 5IUHA 5M08A 1B38A 2C3KA 2XIXA 4C8BA 5AR2A 4AS0A 4QYFA 4E4NA 3MIYA 3O8UA 4FKQA 3DJ6A 1OKYA 3UOKA 3V8WA 3QGWA 3CLYA 3E5AA 4MVFA 4MXZA 4DH8A 2UZOA 2X8IA 5ETAA 2RG6A 4ZJJA 3HMPA 3F69A 5HG7A 4LV5A 3GU6A 4EOPA 4I4EA 5JFXA 4FSRA 5FLFA 2WOUA 4OAUC 4DN5A 3CBLA 3DPKA 3QTRA 4OBPA 4BCQA 4D2PA 3HMIA 3V6RA 5LCJA 2OJFE 1H00A 4O21A 3RPRA 4DH5A 2R3HA 3ACKA 1AD5A 4NFNA 1QCFA 4CFMA 3R7UA 4R3PA 2FGIA 1YOJA 3OBJA 3QAME 4FNWA 2ESMA 4O38A 4CLJA 4KBCA 5CQWA 5K3YA 4F1OA 4AZWA 3VUHA 5CSXA 3FDNA 4R6VA 4FTKA 4ITHA 1GIIA 3BYVA 3IGGA 4JG6A 5CEQA 3P79A 4UBAA 4PDYA 3F66A 1X8BA 4ACHA 4TKSA 2PULA 5HVKA 4XUFA 5L2WA 3G90X 5CNNA 4U79A 5C8KA 3OEFX 3VBWA 3I81A 1GZOA 2XNGA 4YZ9A 4FYNA 5F1ZA 4DYMA 2WHBA 4XV3A 1P4FA 3Q3BA 3ZEWA 1Q3DA 3UMWA 4NM7A 3A7HA 3PE2A 1T46A 3CD3A 4TN6A 4UMQA 4V04A 3NYNA 4FBXA 4L3JA 4IVAA 3RAIA 3AC5A 3TN8A 4IC8A 3A4OX 4BGQA 2G15A 1AQ1A 2WTIA 3C4WA 3R2BA 4UEUA 5BUIA 4YHTA 2O8YA 3R00A 4NH1A 5T3QA 3POOA 4EOKA 5EQPA 4TYEA 5IZFA 4BDIA 4BIEA 4EHEA 4UZHA 3Q4TA 4O0TA 4AXAA 2YM5A 4BBMA 1H08A 4JDJA 3FKNA 4GSBA 3WYXA 3DA6A 4V05A 4RX5A 5HNIX 2VWBA 3VIDA 3EQGA 3NUYA 4O81A 2QOFA 3ZS5A 1M17A 5HE3A 4K9YA 4ZTSA 3ORLA 4EH3A 3IOKA 1KV2A 3F6XA 4O1PA 3UZPA 4A06A 4FTNA 3R8LA 1CTPE 3DGKA 4OTHA 4F7LA 4HJOA 3QZIA 2YLEA 3UJGA 4F63A 4XV1A 3CQUA 2HELA 4S33A 2XNNA 3NYXA 5AUYA 4G6OA 5BNJA 3NEWA 2XIKA 3QYZA 4LV8A 2IW6A 4I93A 1YI4A 3V5LA 3W8QA 5JZJA 5FDPA 4DLIA 3LKMA 4CG8A 4O0WA 1U54A 5EW3A 4EH9A 2CKOA 4GUEA 3SRVB 4YPDA 4W9XA 3K3IA 3DQXA 2ITOA 2YWPA 4RFZA 5CVHA 3RM6A 4U41A 3R21A 1L8TA 1GIJA 1W0XC 4LQMA 3MPMA 4C59A 2QONA 4OT5A 2JIUA 4MYGA 5GZ9A 2JDVA 3Q9ZA 3QQUA 4FL3A 4PUZA 3R8VA 3TWJA 1MUOA 2V7AA 3QQJA 3EB0A 3MTFA 5AMNA 2X0GA 3TTIA 1IAHA 4MD7E 4I0SA 3IGOA 4CFXA 1IR3A 4MXCA 5EOBA 2A2AA 3P5KA 4IIRA 2JKMA 2GFSA 4YTHA 4NM5A 3Q96A 4F4PA 4J1RA 2WMUA 2HAKA 3OWKA 4A9TA 3GEQA 3QD3A 4IQ6A 4YTIA 2QO2A 3UO6A 5GZAA 4ZTQA 3SW4A 3P7AA 3T8OA 3CQWA 3Q4CA 2VTTA 4AN2A 2WMWA 2HYYA 3D2KA 3GOPA 3NUXA 4G9RA 4X3FB 5TE0A 3DKGA 4FSYA 4WG4A 2QCSA 4F64A 4QP2A 3ZLYA 1M14A 1PMNA 5A46A 3TDVA 1UU8A 4TRLA 5GNKA 2FSOX 5CENA 5HHWA 3IW6A 3LFSA 1VYWA 3FMKA 4UZDA 2ITWA 1BKXA 4YZCA 3WZJA 3SA0A 2W5AA 2YABA 4BRXA 3AT4A 4AT5A 4OTPA 4F0GA 2F2UA 2YEXA 4EH6A 4ZY5A 4QMXA 4K6ZA 3NNVA 4EOIA 3CKXA 3FL4A 4FZDB 4ANBA 3WE4A 4NSTA 4HVIA 5KUPA 4E6CA 3ZBFA 5D12A 4FV6A 5CF8A 2QO7A 3CD8A 3ANRA 3VW6A 3ZHPC 4I94A 3NAXA 2DUVA 2Y6MA 4Y85A 3UO4A 4YTFA 4DE4A 4MBIA 4BHZA 2C6IA 1P2AA 4FKUA 4RC2A 4FT3A 5ANIA 4XNEA 3BYSA 3F3ZA 4QOXA 1IEPA 2EVAA 3LJ0A 1R78A 5DHJA 4AGCA 2UZBA 3MYGA 4FSUA 4XV9A 3VNTA 4CNHA 3LM0A 3DNEA 4BCPA 2JFLA 3F5PA 2B54A 1F3MC 4B0GA 3DB6A 2BIYA 1ZY4A 1U46A 4O86A 2GU8A 2Q0BA 4FT9A 3W2CA 5IH4A 3LFNA 2VO7A 4HZRA 2XIYA 4JQ7A 2UW0A 3TM0A 3ZO3A 3SVVA 3R04A 4DH7A 3SX9A 4YNOA 4DFYA 2FB8A 1YVJA 4AGWA 4EQMA 3OBGA 3COKA 2B53A 4LOQA 5JH6A 2DYLA 3OUNB 4XV2A 3WF7A 2J0IA 2UUEA 3O51A 5M4UA 1R0PA 2OZAB 4TWOA 2PK9A 4FI1A 5AM7A 3F3TA 5AV3A 3C7QA 3QUEA 3TKIA 4EWHA 3GQIA 1WBWA 4YJQA 3HP5A 3WF5A 4GIHA 2V5QA 4E5WA 3TNQB 4IE9A 3AXWA 3D9VA 2C5VA 5IQDA 3QTZA 5AEPA 5L3AA 3DXNA 1AGWA 4CFNA 4EQUA 4GKHA 1ZOGA 5IEYA 3LLAA 4Q2AA 3N9XA 3D0EA 4GUBA 3H10A 4M0YA 3R7YA 5JQ8A 5M44A 3M2WA 1GY3A 2H6DA 4KWPA 4MQ1A 3BBTB 4H3BA 4P5QA 4X2KA 3O96A 5EKOA 2YIRA 2HZ0A 3VUMA 3G15A 1OKZA 3OCBA 2VWXA 1YHSA 3QTQA 2F7EE 2HZIA 4JR3A 2XNPA 5EM8A 5HESA 2F7XE 1H07A 3Q52A 4ITJA 4LMNA 4ACMA 2ITPA 1T45A 4B99A 1MP8A 2PZPA 3OW4A 3R30A 4MF0A 1BMKA 2Z7SA 3HV4A 3PG1A 5EW9A 2YIXA 3GVUA 4DA5A 4UX9A 5AAGA 5L8KA 3HZTA 5IA5A 5FUTA 2QC6A 3MVLA 3NNWA 3O50A 5EHLA 3C0GA 3FHRA 3PVBA 5BVWA 2QQ7A 3E7OA 3HECA 3ORIA 4UWYA 3ZZEA 3AMYA 3O0GA 5BMSA 3CY3A 5AP5A 5LWNA 2UVYA 5J1VA 5ANEA 4E1ZA 3UNZA 4D1XA 5A4LA 4E26A 5M09A 2X2MA 1PXMA 3QKKA 4YSJA 3OT3A 2E9OA 4DGMA 4M8TA 2B9IA 2C68A 2O64A 4IAKA 5LVLA 4A4LA 1DS5A 3GC8A 2V0DA 4JVGA 3QLFA 3VS5A 3QTSA 3I5ZA 2ERZE 3FLSA 3L9MA 4GJ2A 2WTWA 4JJRA 3KVXA 4FSQA 5EM6A 3R8PA 3A62A 4D4VA 3BHVA 2GQRA 4CTCA 5IQFA 4NCTA 3FYKX 5A4CA 4YZDA 3DXQA 3DZOA 2W17A 1PY5A 1W83A 5K5XA 3SGCA 2Y4IB 2YM8A 3MI9A 2QOCA 4PMSA 3V01A 2RFSA 3I0QA 3BELA 1FPUA 1XH7A 3TV4A 4CRSA 2QHMA 3ORKA 3Q2MA 2PMLX 2C6TA 2WAJA 3Q4ZA 5LVOA 3NUPA 4RVMA 3N4TA 4C4HA 4E4LA 4FSZA 4IAFA 3GU5A 1J1BA 4YO6A 5IH6A 3MVJA 3G6GA 4IVCA 2WIHA 2W1FA 3CTJA 5CU2A 5AUWA 4LOPA 4O96A 1R1WA 1NA7A 4X3FA 5J5TA 5DGZA 2CKPA 4RZVA 3KULB 5EH0A 5EHYA 4I92A 4G16A 4EYMA 3EH9A 3NW7A 4FKGA 4KIPA 4ZMEA 1H1QA 4R1YA 5FM2A 5DIAA 4R8QA 3PUPA 5CXZA 2JLDA 4DG2E 1WFCA 3BE9A 5IH5A 3F7WA 4L45A 5E8VA 5AJQA 5BYZA 4LRKA 3TTJA 4PP7A 1YI6A 3FPMA 3TJDA 2HXLA 2C1BA 2W5HA 2WD1A 2BZHB 3PVWA 4BKJA 3C50A 3MBLA 4FTOA 2QOBA 3PSBA 4TYHB 3R1YA 5JFSA 2QODA 3L9PA 4Q9SA 1FINA 4PF4A 2R9SA 3R02A 3OCTA 4BCNA 1M2QA 5EDPA 4JOAA 5CI6A 4ANOA 2ITUA 4AT3A 1Y6AA 3CGOA 4X6RA 1IA8A 3QCYA 3WF9A 1CM8A 5CYIA 2OGVA 5AADA 4FTTA 1WBPA 4BWKA 3QTIA 1PXPA 4J71A 2VAGA 4PNIA 3G9NA 4I6FA 4M97A 3VUKA 4AW2A 4PPBA 4O6EA 2F9GA 3C9WA 1WCCA 1JSVA 2O63A 4RJ4A 5DR6A 2I40A 3KRJA 1WMKA 4H05A 2W99B 4ZSEA 3SOCA 3LMHA 4X2JA 4OGRA 2VWZA 1KSWA 3HP2A 4MQ2A 3C4XA 2G2FA 3I0OA 5EOLA 1Y8GA 3ZMMA 3MFSA 1JKSA 3WZEA 4PDOA 1U5QA 2CNUA 5AM6A 4CYJA 3L9NA 2QHNA 4C7TA 2CN8A 4D4YA 1UKHA 3VC4A 4GMYA 3CPBA 4KS7A 2ZV7A 4CFUA 3G9LX 3MTLA 4FK6A 5JK3A 3QD0A 4DH3A 5KKRC 1JNKA 2OJGA 2YAKA 3K5VA 4ZTHA 1PMVA 2DS1A 4RBLA 3ZLWA 3RHKA 1Q41A 3HRCA 3DY7A 4C3FA 4GFGA 4MXAA 2F57A 4B7TA 2JITA 3V3VA 1OIUA 3M1SA 2X2LA 3D7ZA 3QCQA 3BV3A 3QKLA 3ZXZA 5J5SA 5L6PA 4BDCA 5GZ8A 2HCKA 1XQZA 5D7VA 3E62A 3QFVA 3MIAA 4FEUA 2WTJA 3F3VA 4FV8A 4JIAA 3VULA 2X6EA 5I4NA 4NL0A 2RL5A 4B8LA 2QG7A 4PL4A 4U5JA 4BYIA 1J7IA 1Q8YA 2IZSA 3LXKA 4M14A 4R7IA 4DEHA 3E88A 4XYFA 3SXSA 3FMLA 1RQQA 3SG9A 4HVGA 4AF3A 1I44A 3GT8A 1KWPA 3UC3A 5IISA 1H0WA 1P5EA 2C3LA 2YCSA 3NSZA 4MD8E 2H34A 4G3DA 2XA4A 5HIBA 2RSVA 3WIKA 4DEDA 5CQUA 5AWMA 4MWIA 3SV0A 4X7QA 4EUTA 4UWCA 1PYXA 4YZMA 2IVTA 4EH7A 1YWRA 5EFQA 4O22A 4GIIA 2E9UA 3DLSA 5DT3A 3U55A 4A9SA 2VO3A 4USEA 2I1MA 1Q62A 5E7RA 5TOZA 1G8SA 2VTHA 1PF8A 1QPDA 1GZKA 2A0CX 1SVGA 4LFIA 4YP8A 2E9NA 5ETCA 3ZM4A 4EK8A 5HLWA 3AG9A 3BWFA 3BU6A 4JX7A 3FLZA 4S30A 3WE8A 1W84A 4TWPA 3U6IA 2O3PA 2W05A 4WG3A 4JDKA 4CYIA 4O6LA 3EFJA 3MH0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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