4XRJA

Crystal structure of erk2 in complex with an inhibitor
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
346
structure length
344
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Combining `dry' co-crystallization and in situ diffraction to facilitate ligand screening by X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule tags Apoptosis
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 109
structure length 344
sequence length 346
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xrjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xrjA01
2UW4A 3CJFA 2Z60A 4OLIA 3FHIA 4AGWA 2PU8A 3C5UA 3OT3A 2J5FA 3S00A 3UE4A 4I24A 2NPQA 1R39A 4RA4A 3ORZA 3SG8A 3QD2B 5CAQA 3QXPA 4X6RA 3UVPA 3P0MA 4MVFA 3TCPA 1ZARA 5EW3A 1LR4A 2X81A 3NUSA 3JY0A 4O1PA 4PL3A 4BKYA 5F94A 2BALA 4LRMA 3CLYA 4EQMA 4BCFA 3OZ6A 5JZJA 4QP6A 5LWNA 3IDBA 3IECA 3BCEA 3IPHA 3VIDA 5HNGA 4F64A 4BTJA 4PTEA 3I0QA 4WKQA 5LMKC 5CI7A 3QRJA 3SRVA 2UZTA 2GNIA 4D2SA 4BIEA 2ZV7A 3ALOA 3R9OA 5FQDC 5AR3A 4EH9A 3G9LX 3FI2A 3SOCA 1LUFA 3R8VA 1FMKA 1T46A 2C3JA 3CSVA 3MFSA 1FMOE 4RLLA 3I7BA 2C6MA 2JIUA 3C0HA 1H0VA 2O2UA 2XIXA 3ZUTA 2E9PA 3KMMA 4PNIA 3MVLA 3ORKA 4GW8A 4NM3A 4QYFA 5CSVA 4XS2A 4XBUA 3V5TA 5F1ZA 3TUBA 3EQHA 5FG8A 4J8MA 2X2KA 1BX6A 2E9NA 4FV8A 4WNKA 3GB2A 3RJCA 4FKGA 3AMBA 4B8MA 3RINA 1OIYA 4ZJIA 4IH8A 2RFNA 3FLSA 4N0SA 4APCA 4HYHA 3R7VA 2Y8OA 4G31A 3FXXA 2ZJWA 3GC9A 3BU6A 3F5GA 3O17A 1JSVA 5F4NA 2PZPA 3CQWA 3UIXA 4EC9A 4USEA 3ORIA 2ESMA 3F3ZA 4B4LA 1KE5A 2PVKA 2JAVA 1PJKA 5CNNA 5IISA 4ZLYA 1H8FA 2J0LA 5J7HA 3OC1A 5DR2A 3GENA 3KF4A 3VULA 3V01A 3FC2A 5KKRC 2YZLA 4KUJA 2A19B 2LGCA 4Z55A 4NT4A 4GEOA 2OG8A 3FQHA 5IPJA 4BZNA 2XCKA 2PZ5A 5M57A 4EYMA 3SLSA 4F4PA 3DQXA 2CJMA 4D5KA 5IG1A 5IU2A 3ZFMA 2ITUA 4IB5A 4XG7A 4FIFA 4YU2A 4C8BA 2BAJA 4QMPA 5BMMA 4BGQA 2O3PA 2XA4A 3G15A 3CEKA 2ITOA 3CQUA 3FXWA 2IVVA 2VTHA 1JVPP 3LFAA 2PMNX 3QFVA 4MK0A 3UMXA 3NYNA 4CLIA 5LVOA 3ZYAA 4L46A 4X3FA 3VUDA 2B55A 5I3OA 3R6XA 2B0QA 4GMYA 1ZAOA 5L2SA 3SHEA 2VWXA 3OROA 3QTSA 1SNUA 1B39A 4Z7HA 2ETKA 3FKNA 4C4FA 3U4UA 1E1VA 4QTEA 1KE6A 3I4BA 2HELA 4FV0A 3ZLWA 4ANBA 4NH1A 1JQHA 3QCYA 4FV7A 3R9DA 3FQEA 4FR4A 3ZC6A 4Q2AA 4FKOA 2PYWA 3QCQA 4CFFA 1YXVA 3SX9A 2GNLA 2W5BA 3R7UA 2XNEA 3C4ZA 4C4HA 4XP3A 2A0CX 3GEQA 4XOYA 2OSCA 4TYJA 2X39A 2KULA 4WIHA 1W0XC 5F95A 5KBRA 2HZIA 5B2KA 5LJJA 1OI9A 2CMWA 5JFVA 3ZC5A 3DPKA 5E1SA 2WOTA 2J50A 2QO9A 2QC6A 3FLYA 4PQNA 4C33A 4JG7A 4D4RA 4DG0E 3MI9A 5B0XA 3UPZA 4D2WA 4ACCA 3KK9A 2ZAZA 5BVKA 1JSTA 2AUHA 4YO6A 3UG1A 1VYWA 5ETCA 1PXPA 5FDXA 1JKTA 4JQ8A 2VTOA 3FQSA 2X2LA 4H39A 5J87A 3RAIA 3BHHA 4YZBA 3L1SA 4AOIA 2NP8A 4I41A 2XCHA 3V8SA 4I0SA 5IEXA 3DBEA 2XBJA 4EWQA 2OZOA 2W17A 5AV1A 3MVHA 5FXQA 5L2QA 5DBXA 4E1ZA 3HX4A 3DV3A 4JDIA 3H3CA 4DFBA 3HAVA 1U46A 3C5IA 4DBXA 1YOJA 2PZIA 1HOWA 1TQMA 3DKOA 2Q0NA 4MWIA 2VWVA 3T9IA 5IA2A 2R2PA 4O2PA 4FNYA 3TV4A 5FDPA 4XLIA 3Q52A 4ZMFA 4ZSLA 1YXUA 3TXOA 2UZEA 4GJ2A 4C34A 4H3QA 4WBOA 4WUAA 2H6DA 2UV2A 2WMUA 1FBNA 3NUNA 2GQRA 2B1PA 5FTGA 3RK9A 4CKRA 4ITJA 4YGAA 1CMKE 4FNZA 1MRVA 3HMMA 3NUXA 2PE2A 1FVTA 4O7ZA 4Y72A 4FV1A 4AQCA 2YA9A 2ITWA 3UBDA 4FL1A 2PVFA 1PKGA 3EQRA 5M06A 4FV4A 4DA5A 3ITZA 4JLCA 4E26A 5K5NA 2JDTA 3EQBA 3SXFA 2C0TA 4M68A 4QMLA 1V1KA 4WHZA 5FBOA 2OXXA 2WTIA 2QLQA 1M2QA 1KSWA 2VTNA 3OTUA 1O6LA 4BCQA 2QOIA 3R83A 4FV2A 4KIQA 3R9HA 4I0RA 5FM2A 2W4JA 5D10A 4PMMA 3LQ8A 4GKIA 4F1MA 3MB6A 4F7JA 1Y8YA 1J7IA 2OLCA 2UZUE 4ACGA 3KC3A 1OPLA 4QOXA 1P14A 4FKIA 5K4IA 4QMXA 5AM7A 2C6LA 4PDYA 3NNXA 4JT3A 2HXQA 4EZ5A 4CT2A 4XV3A 2HK5A 5AEPA 5FTQA 4RFZA 4FEUA 4ITIA 3HEGA 4FSUA 4HCVA 4RIWA 2CGWA 3EHAA 5IQAA 5CNOA 2V5QA 5BUJA 1KE8A 5LMKA 2FGIA 4YC6A 5L8KA 2WMVA 4WRGA 3LMHA 1F0QA 4KBAA 5ETAA 2YIRA 4XP2A 2CPKE 3QTIA 3KMWA 4L3JA 3WF5A 4CXAA 3ALNA 4D55A 4O7SA 5EQYA 3FXZA 3RZBA 4BI1A 3V6RA 5LVPA 3AMAA 4OTDA 1JAMA 3BZ3A 5LVNA 5HOAA 2UW5A 4I5CA 1YW2A 3II5A 4E73A 4FNXA 2X4ZA 2XIKA 4BGHA 2GQSA 1NY3A 4C2WA 5HIDA 3ZDIA 3RPVA 3PJ2A 4XJ0A 3IW7A 3ACJA 4CZTA 5DVRA 2WTWA 4F08A 4BHNA 2R3JA 2ZVAA 4I92A 4GVAA 5AUYA 5AADA 4XRLA 4DH1A 4K77A 1OB3A 2WQEA 3SDJA 4M69B 5GHVA 3BU5A 2I0YA 4YZNA 1HCLA 5T6KA 5HNIX 4B6LA 3ACKA 2J6MA 3DT1A 3WYXA 1PXIA 3MJ2A 2BZIB 5E8WA 4O0TA 4EH8A 5CU6A 4IZ5A 1VZOA 4BDBA 4O1OA 4V0GB 3RWPA 3ORMA 2A4LA 3QWJA 3R02A 3TACA 4AFJA 1UNGA 2EWAA 3FL4A 1Q5KA 5CI6A 4C36A 2ETRA 5CLPA 5J7BA 1ZZLA 3ANQA 4KSQA 4TYEA 1AQ1A 2HZ0A 4WT6A 4Y5QA 2P2IA 4A9SA 4F1OA 5AV4A 2I0EA 3LPBA 3G9NA 5L8LA 4ZJJA 4CFWA 4JDJA 5AAEA 4L52A 1ZYJA 4FUYA 3K3JA 3F3TA 4L6QA 4YBKA 3DCVA 5M4UA 3OFMA 4TWCA 4IVAA 2C47A 3HMIA 4FTCA 4R1VA 4ZTLA 5IEYA 2F2UA 3Q9XA 3DS6A 5JKGA 3WF8A 4XG3A 4UX9A 4JAIA 4U43A 3QRTA 3I6UA 2GS7A 4GRBA 4FODA 3SG9A 2O63A 3OF0A 2BRBA 3U8WA 3NR9A 1IAHA 2OFUA 3KRRA 4W8EA 3BQCA 1XQZA 4QMWA 5EW9A 1CKIA 1UWHA 3LJ2A 4DT9A 1ND4A 3ENHA 3D5XA 2PUIA 3MVMA 1TVOA 5D41A 2F4JA 1ZYSA 2XK8A 1WBTA 1OL7A 1XH4A 3QLFA 2FSMX 2XK6A 4LOOA 4AZSA 2QLUA 3SOAA 1WFCA 4O7YA 3BV2A 4EHZA 4GV1A 3FEGA 4CEGA 5AMNA 1GIHA 4R5YA 4ERKA 4L01A 4DC2A 4AW2A 5DPVA 5IQFA 5TKDA 4YSMA 5JMSA 4QMOA 1JPAA 1BKXA 1QCFA 4AUAA 4GT5A 4GIIA 5J8IA 3DJ6A 3D2KA 2OZAA 3PVUA 4L45A 4CT1A 4FSNA 2YLEA 5ANKA 3RI1A 3UC4A 3VF9A 5L2IA 3VO3A 4FIJA 5AR8A 5A54A 3A2CA 2Y6MA 3D83A 3O8PA 3N4TA 4DFUA 2C1AA 3R1NA 3TG1A 3W8LA 3PVWA 3ZU7A 4BF2A 4MBJA 2UW7A 3RWQA 2FSLX 3I7CA 3RAKA 2C5OA 2VTJA 5EFQA 3Q96A 5JFXA 4BBFA 2XBAA 4TT7A 3MIAA 3I5NA 4MNEB 3V04A 5E8SA 4FG7A 5CVFA 4C57A 3NW7A 3T8OA 3FYKX 4ANLA 1PMVA 3ANRA 4TYIA 3QYZA 3ZFYA 2BKZA 2CHLA 5EYCA 2QOKA 2ZV9A 3SRVB 4XV2A 5CSHA 3WI6A 4EC8A 3I1AA 4D0WA 4UMRA 2C5VA 2C68A 2X9FA 3LCKA 1DI9A 4NW6A 3L9MA 3LMGA 3EN4A 4XG6A 4A07A 4EEVA 4AT5A 4HW7A 4YUQA 4QO9A 3WZUA 3SC1A 4IMYA 1LEWA 4FSRA 5FXRA 2EU9A 5AV3A 3ROCA 4ZY5A 5JEBA 5LWMA 4ZJVA 3PYYA 3GU5A 1Q3WA 5CX9A 2BZKB 1L8TA 4IAAA 4IZYA 3FLQA 3UP7A 3FZ1A 4G9CA 4EYJA 3QZFA 1YVJA 3AGMA 5IDPA 3HRFA 3PJ3A 2VTAA 1QPJA 4I5HA 4OTWA 2CN5A 3C4WA 5AR7A 3RP9A 4BDAA 4YHFA 5IKWA 4Q5EA 3BYVA 3F82A 4U0IA 2CCHA 5FEQA 3PG1A 4DFXE 1FINA 4RJ4A 3UYTA 1F5QA 5C27A 3TN8A 5HD4A 4K18A 3BHUA 3EMGA 1ZOGA 1NW1A 3ZZEA 3OEZA 1P4OA 1WVWA 3E3BX 4R3CA 3BLQA 2W06A 5CSWA 3UOHA 4KBKA 4CFUA 4E7WA 4GJ3A 4ALUA 2WTVA 5CU2A 4QNYA 3E88A 3I79A 4XG4A 4G3DA 5TO8A 4AU8A 2QR8A 2X7GA 3HDMA 3DAEA 3EN6A 2R3PA 3Q60A 5J95A 2FA2A 1Y91A 3UQGA 4JXFA 4PP7A 2R3MA 3ORXA 4O91A 2WMQA 3CD3A 3V51A 4NM0A 3COHA 3IG7A 1O9UA 5LCKA 3DY7A 4FZ7A 4FT7A 2OFVA 4WA9A 3NIZA 2P3GX 4HYSA 3KK8A 4JNWA 5DT4A 4IAYA 5K0KA 2OF4A 4YR8A 5L4QA 4O81A 4RWIA 2XH5A 1IEPA 2PE1A 1ZY4A 2RFEA 4FK3A 5C8KA 2YIXA 3W2PA 4BWKA 5HIBA 4D5HA 3EKNA 3WIGA 3GVUA 3LLTA 3A60A 4II5A 2AC5A 4XHKB 2UZBA 5DGZA 4G6OA 3ZO2A 4O7VA 1Q8UA 3KULB 3TKUA 3EFLA 3BQRA 4G3CA 2PK9A 2H34A 1CM8A 4UMUA 2Z8CA 4RWJA 2DS1A 4FZFB 4EQUA 3PLAE 5LCJA 2R3NA 1MRYA 2UUEA 5AX9A 1QL6A 4MXCA 4X2FA 3TTIA 3VBVA 4FGRA 4FT5A 4R77A 3F2AA 4XOZA 1KE7A 3UZPA 3G90X 4E4MA 5EDRA 3LFDA 5E8VA 1BMKA 1GAGA 3H9FA 5GNKA 3UMWA 3U51A 5ANIA 3EQCA 4A9YA 4ZTRA 2BZJA 4B99A 2R3LA 3D4QA 5IDNA 3PP0A 4PPAA 3PXYA 4B0GA 4I5MA 3C7QA 4KIKA 2JITA 3W32A 2G2FA 3AOXA 4OBPA 5HG9A 2A2AA 4A9UA 4P5QA 4FKWA 3DBFA 4O0SA 4LUEA 3FZOA 2RL5A 2ZMDA 2DYLA 3BYOA 3SW7A 3CGFA 4QMVA 2WQNA 4EH3A 4G16A 5CQWA 3VS6A 4LV5A 1DM2A 3MY0A 2BDWA 4JVGA 3H10A 4UEUA 5CXHA 3W2QA 4EKKA 4KKEA 5D7AA 5ANGA 4UZHA 4ACMA 5IH5A 1Q8YA 2YHVA 4CV9A 5D1JA 3VQHA 4ZXTA 4G3GA 4ZAUA 1OECA 2I40A 3F5XA 3RBWA 1SZMA 2WMBA 2R3RA 3K5UA 3OW3A 2W7XA 2C69A 2HOGA 3R73A 5AUXA 5H8EA 4YTHA 3DB6A 4E20A 3TIYA 4FC0A 2ERKA 2WEVA 4EJ7A 1KOBA 2B9HA 4RWKA 5CSPA 3MPMA 1JSUA 1MRUA 2FVDA 2UVZA 4UXQA 3K54A 3UYSA 3RNIA 3HYHA 2ZV2A 4G17A 4YC8A 4PMPA 2BRHA 3FSKA 4MXZA 3RCDA 3UZTA 3AC2A 4QQCA 2Y9QA 4IB3A 4DF3A 1BLXA 3C4EA 3QD4A 1OL6A 2BPMA 4JQ7A 3LCOA 3OD6X 4XP0A 1B38A 2QU5A 3EYHA 5EH0A 3O2MA 4LMNA 5E8UA 3RPYA 4RIWB 1R78A 4IX3A 3DFAA 3NVKI 4ZTHA 4FSQA 2OW3A 1M7NA 3LXLA 4HGTA 3A7IA 2C6EA 3RK5A 1MP8A 3NNVA 1V0OA 4PY1A 3QZIA 3ZLYA 3ZRLA 5CT7A 3R21A 4LV8A 4OT6A 4IEBA 3S1HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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