4Y5QA

Activated calcium-dependent protein kinase 1 from cryptosporidium parvum (cpcdpk1) in complex with amp
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
472
structure length
449
Chain Sequence
LYFQGTFAERYNIVCMLGKGSFGEVLKCKDRITQQEYAVKVINKASAKNKDTSTILREVELLKKLDHPNIMKLFEILEDSSSFYIVGELYTGGELFDEIIKRKRFSEHDAARIIKQVFSGITYMHKHNIVHRDLKPENILLESKEKDCDIKIIDFGLSTCFQQNTDRIGTAYYIAPEVLRGTYDEKCDVWSAGVILYILLSGTPPFYGKNEYDILKRVETGKYAFDLPQWRTISDDAKDLIRKMLTFHPSLRITATQCLEHPWIQKYSSETPTISDLPSLESAMTNIRQFQAEKKLAQAALLYMASKLTTLDETKQLTEIFRKLDTNNDGMLDRDELVRGYHEFMRLKGVDSNSGSTIEDQIDSLMPLLDMDGSGSIEYSEFIASAIDRTILLSRERMERAFKMFDKDGSGKISTKELFKLFSEQVDNNKDGEVDFNEFVEMLQNFVRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Activated Calcium-Dependent Protein Kinase 1 from Cryptosporidium parvum (CpCDPK1) in complex with AMP
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Cryptosporidium parvum iowa ii
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1, putative
total genus 163
structure length 449
sequence length 472
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4y5qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4y5qA01
3S1HA 3VS1A 4GL9A 3UC4A 3HDMA 5A6OA 1I09A 1ZRZA 4X0MA 3QTXA 4M14A 3EN5A 1Q8UA 1OMWA 3BGQA 3HP5A 4OBOA 2FA2A 3O7LB 3DT1A 1Q99A 4AT4A 3GB2A 3TNQB 3W18A 2QOFA 4GMYA 4ZSLA 3POZA 4E8AA 4EOJA 4XG7A 2JDRA 4OTDA 4I22A 5E4HA 4M8TA 3F3WA 3TG1A 4E1ZA 4M97A 4O6LA 2OG8A 1XBBA 3KULB 3BHYA 2E2BA 2HZIA 1E1VA 3COMA 3NAYA 3U4UA 5F95A 5AX9A 3VS2A 3D5VA 1SVHA 3HUBA 4JBOA 5E9EA 1GZKA 3GC0A 4EBWA 5AAGA 5CY3A 5LCKA 3SX9A 1IG1A 3AMYA 4D2SA 3VUDA 3MY0A 3QLFA 2QLQA 1UV5A 2XEZA 3E8EA 3ZEWA 4DBXA 4ACHA 4E6DA 5BYYA 5HVJA 4PTEA 4XG2A 3REPA 3MH3A 2DS1A 4CV8A 4TRLA 5J8IA 2JFLA 3OCBA 3I7CA 2EU9A 4FGBA 5TE0A 4JJRA 4I21A 4XCUA 4MNFA 1WBNA 3QTZA 4FT9A 2E9VA 2X8IA 4YZDA 3QCSA 3V3VA 2VTHA 5GJGA 4AZTA 1YI6A 4BVUA 1JKSA 1VYZA 3AT4A 5F4NA 2GS6A 3TT0A 4BKYA 1WFCA 5G6VA 5KMKA 3BE9A 2YM3A 4RT7A 2C0TA 3FLSA 4MEDA 4FVRA 4NUSA 3L9NA 2HWOA 1JAMA 1X8BA 3NCGA 2WIPA 3R9RA 4QQJA 1QPEA 3NCZA 4FV4A 3DK6A 4O0SA 5CWZA 2UZLA 4S32A 3PE2A 4KIKB 4E4NA 4MBJA 4Z16A 3MA3A 4Y85A 3QZGA 1YI3A 5A6NA 2JLDA 5L2IA 4BN1A 2W9FB 1Q41A 2JDSA 2BRGA 1YOMA 2Y8OA 5IDNA 2C6DA 2W1CA 4EKKA 4EUUA 1R78A 3NNWA 3QRUA 3I7BA 2IZUA 4QYFA 3UODA 2WOUA 3A7IA 4ARKA 1YXVA 3QTIA 3KQ7A 3L9LA 3MPAA 4UMPA 3G15A 4QP8A 2X6DA 5KMIA 2WNTA 1U4DA 4F1TA 4RJ6A 2P4IA 4WBBB 4O2ZA 2XS0A 5DG5A 3ZONA 2J0JA 4ZSGA 2B53A 3FLYA 2OSCA 3S95A 3DDQA 3TTIA 3R7EA 2WMXA 4YHFA 5L6PA 2B4SB 3QXOA 4EH5A 3F2AA 2BZHB 2A27A 5DBXA 4FV2A 3SQQA 4BL1A 2O65A 4FKVA 2RKUA 4L46A 2C4GA 4IVCA 5B2LA 3LFFA 3L1SA 1M7NA 4OTQA 2X7OA 3G90X 3K5UA 2XYUA 4C4GA 3GC9A 4P5ZA 4E6QA 2W9ZB 3WOWA 5IQBA 3U55A 3EQPA 3E92A 4LMNA 5FBNC 4GVAA 4ACDA 3R63A 4FTCA 4FZ7A 4LI5A 2ZAZA 3PZEA 4PWNA 3ZBFA 1NVQA 2GTNA 3HV7A 4EH9A 3TJDA 4BKJA 4I6QA 4FZDB 4NM5A 3GUBA 4LFIA 1VYWA 2WXVA 4GJ2A 3TEIA 4CFMA 5AFVA 4IB1A 3ZEPA 4DH7A 3CEKA 4RBLA 3FZOA 5LWNA 5EYCA 2EXMA 1UKIA 3EJ1A 4UYAA 4YC3A 5IF1A 4RFYA 3N4VA 3MESA 1BKXA 2Y9QA 4Q5EA 1XQZA 4IX3A 2UZOA 3THBA 2BAKA 5I9VA 5AAFA 4ASDA 4QMVA 4QP9A 4C34A 2XK4A 4NEUA 3FI3A 3HRBA 4RIXA 5GNKA 2X6EA 3OROA 2XNGA 1P4OA 4EOLA 4FTKA 2VV9A 4IWOA 3V5WA 4MAOA 4BDIA 4CZTA 4W4XA 4F7LA 4E4XA 3WIKA 1YOJA 2W4KA 4PPBA 4F64A 2BDJA 3FZPA 4OTGA 4AE6A 4EQMA 5JFVA 4FEXA 2OWBA 1OECA 4FUXA 1F5QA 5AUXA 4P7EA 5C26A 4GYIA 2R0UA 4WIHA 4Q5HA 5DGZA 4GK2A 3IW5A 4RX7A 4ZY6A 2XZSA 4NFNA 4F6SA 3CY3A 4UMUA 2ETKA 4C3PA 1BI8A 2VX3A 3NS9A 4NKAA 3GU4A 3GU7A 3IGGA 3GCPA 2B52A 4KRDA 4O27B 1Q3WA 5HORA 4FSZA 3C4XA 3N9XA 2NRYA 5E8XA 3QLGA 4BDGA 3CTHA 3MVLA 4CZYB 4MWIA 3LXPA 2XKCA 1M2PA 2CLXA 3FI2A 5M08A 4O2PA 4CQGA 5ANDA 4E6CA 2YIQA 4R6VA 5M44A 3LFAA 5AR5A 2ERKA 2P55A 4OTFA 5CF6A 4QMUA 2HELA 3KEXA 1JQHA 1Q4LA 4M3QA 2UZNA 3E62A 3MY5A 4GFMA 5IQDA 2B9IA 3NW6A 1ZLTA 3QC4A 5HX8A 3TL8A 4AXAA 3FZTA 1XH8A 3RTPA 3BQCA 5HD7A 3GENA 3ODYX 4EK8A 2C5YA 2XIKA 2BROA 5DE2A 1REKA 3JPVA 5DR6A 4Y8DA 4DG2E 3OP5A 3GXLA 2PK9A 1IEPA 3VVHA 4B7TA 2R3FA 5HG5A 4L9IA 1FQ1B 1I44A 4MXCA 5KZ0A 3AGMA 4XV9A 5AP5A 2C3JA 4C38A 4WG5A 3EFWA 5LVOA 4GK4A 4N0SA 3VWAA 5B0XA 4TYGA 3G0EA 4FTTA 3V01A 4PNIA 2C5OA 4DITA 1PXPA 4ZTHA 3SKCA 3RK5A 3SG9A 4DGGA 3BLRA 5B2KA 3IECA 4QO9A 3RZBA 3LMIA 3DXNA 3P5KA 4QQTA 3MB7A 1ND4A 4YTFA 4E4LA 2JKOA 3FHIA 5JZNA 5DI1A 1WBTA 2PVLA 4EL9A 4IVBA 3DU8A 3EQHA 3RAIA 3KXGA 3NUYA 4ZLZA 4DF3A 4XRLA 4XYFA 3JUHA 1WMKA 5AP3A 4BDEA 4BIDA 3Q9WA 5ANOA 4HGLA 5AA8A 5JSMA 3IGOA 2W1ZA 3HMOA 4IBMA 4KBKA 3TN8A 2WMVA 2BR1A 4YZCA 3CJGA 5ANKA 3G9LX 2CPKE 1W98A 4I6HA 2RFDA 4RX9A 3EN7A 1RQQA 1AQ1A 4C61A 4FSUA 4EZ3A 3T8OA 4P2KA 3R04A 5BVOA 3S00A 2R3HA 3V8WA 4BR3A 2PULA 4F9AA 4AT3A 4IE9A 2W1GA 4MBIA 3HEGA 3OTUA 3CPBA 5I9YA 2QR8A 4DFUA 2WIHA 2XIXA 2VWBA 2YDIA 4ZSJA 2YHVA 3KN5A 3PJCA 4BICA 5CF8A 4BHZA 4FYNA 4X3FB 2YCSA 1ERKA 1PRYA 5HGIA 4AFEA 1Q8ZA 2RG6A 4FC0A 4EH3A 3V5TA 2VNYA 2ZMCA 4I6BA 5EM5A 3HLLA 3ZFYA 1V0BA 3JXWA 4X3FA 4U42A 4ZJJA 1XH7A 2PUIA 2NP8A 4QP6A 4R1VA 4ITHA 5AUVA 3V5JA 2WZJA 4PTCA 4CCUA 2VO3A 3QTRA 1WBPA 1ZOGA 1R3CA 1M14A 4HYHA 4TYHA 1IR3A 4G5PA 2C3IB 3AXWA 3H0ZA 5CXHA 1CMKE 2J5EA 1ZYLA 3VUIA 5C4KA 2QODA 4HGTA 2ONLA 2GHGA 3LIJA 1XO2B 1JKTA 4NCTC 3W32A 2J0IA 4BCIA 4BZDA 2BFYA 4GSBA 4YMJA 4ZP5A 3FKLA 3OWPA 4XEYA 1A48A 4HVGA 3OZ6A 4TNBA 1A06A 2BILB 2Z2WA 3GNIB 4O91A 5L3AA 5GJDA 2OGVA 5FGKA 2W99B 3E88A 2A0CX 2XF0A 3DZOA 4Y72A 4C57A 5CT7A 3AT3A 4GV1A 4DH5A 1KE9A 2C6MA 3Q9ZA 1NW1A 4MXAA 4DT9A 5GIPE 4RLLA 5LMKA 3ENMA 5FEQA 2X8DA 3EYGA 4K11A 4YUQA 3GU6A 3PXKA 4EOSA 2J9MA 5BUIA 2VTRA 5FEDA 4APCA 5J79A 4WO5A 4FV5A 4FIHA 2BPMA 3VAPA 4L7FA 3EWHA 1PHKA 4BCNA 4CYJA 5CAVA 5JGAA 4IC8A 4DFXE 4E93A 4YO6A 4CMOA 4FT7A 4M15A 4DEGA 4PMMA 4LG4A 4BYJA 3BHTA 1QPDA 4O0RA 4AGDA 3BV2A 4W9WA 2J50A 3SG8A 3KXXA 3GCSA 4XV1A 3ZCLA 4KSQA 3O8UA 2RFNA 4DFLA 5C8KA 2FB8A 4BWXA 2BZJA 3ZXTA 3PY3A 4YTIA 3UE4A 4NJDA 4E3CA 3ZO2A 4AAAA 4GUEA 4DN5A 5FP6A 3I4BA 2X9EA 4O7NA 3LFNA 5BX0A 5KMLA 5LVPA 4W4YA 3A7HA 4D4SA 2E9OA 3P08A 3R1NA 4IM0A 3IW8A 2O63A 3FMDA 2QOBA 4AOTA 4FIIA 5CU2A 4GJ3A 3MA6A 4DH1A 2UVZA 1H01A 1LPUA 4RX5A 2JIUA 4I4EA 2CCHA 4D4VA 3DNDA 5JRQA 4BTMA 2IG7A 5FRIA 3UO5A 1VR2A 3MDYA 4P90A 3ZDUA 3RVGA 2Y4IC 2C6LA 1BL6A 1GZNA 2PL0A 3C9WA 4JDJA 2VD5A 2JKQA 4JL9A 3OW3A 3QD2B 2F7ZE 4O1OA 4I1ZA 2WQEA 4O0XA 2B9HA 4XX9A 4QPSA 2FUMA 4TYIA 3ZMMA 2QU5A 1YVJA 3B2TA 2CGWA 3MFTA 5DEWA 4D0WA 4RC4A 5D7VA 5K4JA 5HD4A 1ZYCA 4UN0C 5I3RA 3EQCA 3PVGA 2WOTA 1U54A 3KB7A 4LOOA 1R39A 1XR1A 3E87A 3FKNA 3F6XA 4TWNA 5TOZA 1OGUA 4A9SA 3UVQA 5H8GA 2QLUA 2W0JA 3OFMA 3OT8A 4CRLA 2QHNA 5ICPA 5DWRA 3SRVA 3BPRA 1IAHA 3F9NA 3K54A 3BQRA 4EZ5A 5ANGA 5ANJA 3LQ3A 3E93A 3PZHA 4XMOA 4IAFA 1NT2A 2OIQA 2BRMA 4XBRA 2ESMA 3F2RA 5AV3A 5TT7A 3L9PA 1PXOA 1WBOA 5HLWA 3CPCA 5BMMA 5BQ0A 3U6IA 2Z8CA 2QOOA 2F2CB 3UTOA 4QMMA 3ANQA 3BV3A 4Y5QA 3DKGA 4RA5A 3Q32A 3OXTA 5EH0A 3R7IA 2UW4A 4E5AX 2YDKA 3RI1A 2C5NA 2YEXA 5E8TA 3N4TA 1P2AA 4DAWA 2C47A 5TR6A 4ACGA 4B6LA 2V0DA 3B2WA 3GC8A 4F1MA 3I0OA 3GP0A 4X21A 1FVRA 2ITVA 2H8HA 2PVMA 2UZBA 2VTQA 2WO6A 3DLZA 4D2RA 1RDQE 3QCXA 4NL0A 4PDSA 4U81A 4DA5A 5FXQA 4IX5A 3IOPA 5CEKA 1QL6A 5FUTA 1YQJA 4RC3A 1WCCA 4DFNA 3ULIA 5M07A 3NR9A 5E8ZA 5LQFA 5KNJA 4R7IA 3AC2A 5CI7A 1H07A 4PUZA 3C7QA 2ZV2A 3R22A 4XJ0A 2X4ZA 4P4CA 2HY0A 3UNZA 4D5HA 4EC9A 3NIZA 3ELJA 4XOYA 4HVDA 3WF9A 2O2UA 1J1CA 5LVMA 2XKFA 4KINA 1JNKA 2H6DA 2V22A 3O17A 4D4RA 4FVPA 1OM1A 3LCDA 4IADA 2WTJA 3ZLSA 4IVDA 1Y57A 4UMTA 3KF4A 1U59A 3RP9A 4E5WA 4AGWA 5A9UA 3ORMA 5J95A 5HE3A 3EZRA 3LJ1A 4QP4A 5CSHA 4EWQA 3TUDA 3ACJA 4YZNA 2BAJA 1OUKA 4HJOA 2DWBA 5IG1A 4O22A 4BCHA 2XYNA 2NNWB 3R7VA 1SM2A 2OZOA 3POOA 2ZOQA 4RQVA 4OBQA 4YNOA 3WILA 4C36A 4UEUA 2GPHA 5E8WA 3RM7A 4D4YA 3PRIA 4RZWA 2UVXA 2XKDA 2HW6A 3R6XA 2JEDA 4AF3A 3EN9A 4OR5A 3IDCA 3ODZX 2BHHA 3LMHA 4U41A 5FP5A 4ZMFA 1JKKA 3FEGA 5KHWA 2IZSA 3HV6A 3D7TA 4MQ2A 1WBSA 3R8PA 1M52A 2LAVA 3AD6A 4NU1A 2VTTA 1BYGA 1GAGA 4G3GA 4HZRA 3HRFA 3AC4A 3PVBA 2WD1A 1RE8A 3CLYA 5F9EA 3BLQA 5HIDA 1GIHA 3D83A 5CSWA 2XNOA 2OI4X 4TNDA 4WUAA 4EK4A 1PXJA 5HG7A 2QG5A 2C0OA 1P4FA 3EQBA 3TJCA 5I9XA 5KHXA 4RWKA 3RMFA 2GU8A 3GCUA 3NAXA 3Q52A 3QQGA 5B2MA 4LV5A 5JFSA 4QMLA 5AP4A 4EOOA 2UZTA 3Q53A 2WMAA 2QURA 1FINA 5AUWA 3LZBA 4FMQA 4MXXA 4FTRA 4D5KA 4DEAA 3KK8A 3FMJA 2H9VA 4C8BA 5FTGA 3UMWA 3CGOA 4JIKA 5IA5A 5J7BA 2P2IA 4NM7A 1M2QA 2FGIA 3FMHA 3IW4A 1XH9A 4YJVA 1REJA 4B99A 5BPYA 5E8YA 3LFQA 4FNZA 5L8JA 4A4LA 5IU2A 2ETMA 2R3IA 5DLSA 2OLCA 4I5MA 3A7FA 3HDNA 3WZDA 2R3MA 4BBFA 1IAJA 3O8TA 5CT0A 4EK6A 4CLJA 4ZEGA 4L45A 3ZUTA 5DIAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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