5A4LA

Dyrk1a in complex with fluoro benzothiazole fragment
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4lA01
1ZYCA 5B0XA 1P4FA 4M67A 4KIKB 4YJVA 5L6OA 4FKIA 2J51A 3ORIA 3DLZA 4BDCA 4MTAA 3NNXA 4J7BA 4O0UA 2JDVA 5EM7A 2X8IA 4CG9A 2YAAA 3F3WA 5TF9A 1F3MC 4PTCA 4IM2A 2OICA 2O3PA 3DA6A 2ZM4A 4BB4A 3PUPA 3BGZA 2B53A 2YDIA 5D10A 2E2BA 2A2AA 2BZJA 3AGLA 4QMXA 3BU5A 3PIXA 4UWYA 1RJBA 1H1QA 2HW7A 3LJ2A 4IB5A 5CAOA 2GNIA 3QUEA 3A8WA 4D2TA 5CF6A 4EHZA 2HY81 4F65A 4FI1A 2OKRA 4DF3A 4EWQA 5AR2A 3VRYA 5KX8A 2A4LA 4HGSA 4JQ8A 5CSVA 4O81A 2AYPA 2FSMX 2P0CA 4YZDA 3RINA 2GPHA 1Q3DA 3PXZA 1H0VA 5C8KA 4BYJA 3C4WA 2WKMA 4CYIA 2C69A 4FKQA 3ATTA 4D0WA 2EB3A 5KHXA 3DFAA 2A27A 1U54B 3RP9A 2WB8A 4EQCA 3V5JA 2VO6A 3BV2A 3ROCA 1IAJA 4PL4A 5DFPA 3SV0A 5CAVA 2X39A 1YHSA 4FUYA 1OI9A 4YZMA 2ITZA 3UIXA 4ZLOA 3PZHA 4GK4A 4RIWB 5EW8A 3UTOA 4G31A 1PXIA 3PLSA 4K18A 2CN5A 5GINE 3E8NA 5C03A 4O1OA 2CHLA 2FH9A 4OTFA 1OL7A 1OPLA 4RIXB 4OGRA 3FBVA 4KS7A 3GENA 4ZEGA 4NM7A 4PNIA 2CMWA 1W82A 3LOKA 1OKWA 3FMMA 5HIDA 3FY0A 2C5YA 4IQ6A 3UYTA 3PSDA 1LEZA 3CQUA 4MXCA 4OTGA 4WNPA 1IEPA 4IVAA 2VTSA 2WIPA 3HKOA 4AUAA 4E20A 3WE4A 5AA8A 3HRFA 5AUZA 3ZH8A 4TPTA 3FSFA 3SX9A 1JKTA 3KF7A 4CV9A 5KKRB 1JSUA 5IZFA 2FVDA 2XMYA 1JOWB 2GNHA 4NKSA 5FDPA 3A4PA 3NNWA 3RHKA 3VS4A 5BMSA 5JFXA 2XK3A 5F20A 2JKMA 3QD3A 4BC6A 4Y73A 3IW8A 3KVXA 4FKRA 5FEQA 4YJPA 5HO7A 5I9VA 3DTCA 5CSHA 5KNJA 2XRUA 5H2UA 1VZOA 3SOCA 5A4TA 1OB3A 5CXZA 2O2UA 2QOOA 4DCAA 4K2RA 4DINA 2VO3A 4DH7A 3Q32A 4OTPA 3BYSA 4YBKA 3JVRA 3KK8A 3TACA 4I41A 4MXZA 5A9UA 1YI4A 2WFYA 3GVUA 4U80A 1NVRA 3ZFMA 1FQ1B 4NFMA 2NO3A 2PVJA 5E8ZA 3C0HA 4KKHA 4BFMA 4DITA 3TZ8A 3NVMB 3KRLA 4ZXTA 4RGJA 5M56A 4UMUA 5AFVA 5IEVA 2VWVA 3IONA 3QZGA 4RPVA 2F49A 4ALVA 3ZRKA 4NZWB 3BKBA 3FI3A 3KK9A 4YHFA 2I6LA 3BLHA 3PVBA 4P5QA 3RTPA 4WIHA 4YLKA 1GNGA 4NSTA 3B8QA 3QRKA 4PRJA 3MN3A 1ZOGA 1M17A 2I0EA 1YDSE 5HVJA 2YLFA 4MNEB 3V5LA 2YJRA 3MJ2A 3SQQA 1UV5A 5FM2A 4EC9A 5FXQA 3E7OA 3RPSA 4LFIA 2OJIA 3EQGA 1PHKA 3HMNA 3RZBA 1W98A 2J5EA 3QA0A 5F1ZA 4BCPA 3IS5A 4OAVB 4I6BA 4ZAUA 2ZV9A 5AIRA 2JKKA 3ZSHA 4DC2A 3F7WA 4IJPA 1HOWA 4OW8A 1UWHA 1UKHA 3I81A 4WSYA 3FKLA 3DK3A 3DZOA 5CQUA 1YXSA 1IAHA 4KD1A 2XM8A 4KWPA 4EK8A 4O22A 1NXKA 4FKVA 4FTJA 3E87A 3QTWA 3PIYA 3FLYA 4NTTA 1Q8UA 3R01A 4M69A 5JZJA 5FLFA 4EH4A 3VUMA 3AC4A 2XB7A 4U42A 4OBQA 4BBMA 4HVHA 1MRVA 5JN2A 4HGLA 3FMDA 3LFSA 5HCYA 3R04A 5AADA 5FBOA 2BROA 3HA8A 3OXIA 2HWPA 4NEUA 2YCQA 3AC1A 5I9ZA 5M53A 2W4OA 4GG7A 4ALWA 4KBAA 3TM0A 1IASA 1UNHA 4USFA 3A7FA 1PXMA 3ZXTA 5AV4A 3MH0A 3FY2A 4S34A 4UY9A 3CD3A 3R7VA 4LMUA 2VWXA 3M42A 3KXNA 2YHVA 4V0GA 3HP2A 5TR6A 3VBVA 4BKZA 4I6QA 5K4IA 4KIKA 1OGUA 4YJTA 5HE0A 4APPA 3OWKA 4GFGA 4TWNA 4JBVA 4RZWA 4ZSAA 3PA4A 3S0OA 1Q4LA 3TJDA 1U5RA 1GZKA 2JAVA 5E9EA 1R0PA 4IVBA 5HU9A 2YAKA 2YCSA 3MH1A 4I93A 4F6SA 3U54A 2YLEA 5F95A 1B6CB 2QG7A 3K5UA 5AP0A 4S32A 2Q83A 2F2UA 3BGPA 4CSVA 3EQBA 3OVVA 3PIZA 4EJNA 5K9IA 5AUTA 2CKPA 3UMWA 3SRVB 2Z7SA 5J9YA 2EXMA 5JGBA 3OTVA 3E5AA 1ZZ2A 5AIKA 1P14A 4KIPA 5ANDA 3KA0A 3QAME 4AZVA 2IW6A 3BEAA 3TEIA 4WBOA 5IA3A 1NA7A 1R78A 2R3OA 4IFGA 1XBCA 4L43A 2VX3A 4HJOA 3UIUA 4IACA 3CS9A 4AT4A 1BL6A 5AP4A 5C8NA 4QMTA 4MD7E 1U54A 3EYHA 4C57A 3NUUA 2ETRA 3QQHA 3K3JA 1OM1A 2R7IA 2XEZA 3QLGA 4S2ZA 5DA3A 3ZXZA 4DG0E 4HCUA 3LQ5A 4KRDA 5A4LA 3OCBA 3R9OA 4CKIA 3IDCA 3O8PA 4X2FA 3GP0A 2GQGA 4RIWA 4FKOA 5F9EA 3UQCA 4JI9A 3V8TA 2HZ4A 3NZ0A 5CX9A 3C0IA 5DNRA 4YZNA 4BIBA 4LRKA 1KV1A 4QMQA 4CXAA 4HOKA 4K33A 5CLPA 4KS8A 2FSLX 2XJ2A 3ATSA 3H30A 4RIXA 5EI8A 5EM5A 4U41A 3SXSA 3NNVA 4D4VA 4I5CA 3C1XA 1ZXEA 3QXOA 2WMRA 3VS6A 1OPJA 2JD5A 2YISA 2WTWA 3F88A 3IDBA 4QQ5A 1YOMA 5HHWA 4F7JA 4O38A 4C4JA 2G15A 2PE0A 5DT0A 2QO9A 4HYUA 4OTWA 3QTUA 2J0KA 1JAMA 4P5ZA 4U43A 4U7ZA 2B9FA 3Q4UA 4RJ5A 1GJOA 5BUJA 2JEDA 2QO2A 5CI7A 5J7HA 3FMLA 3L9LA 2R3NA 5BVNA 4KAOA 3BIZA 3PRIA 5C01A 3U9NA 4I94A 2E9VA 1BUHA 4FA2A 4CD0A 3QC9A 4LOOA 4DLIA 4FODA 4GMYA 4ZTRA 5IA4A 3IW5A 2PZYA 3JYAA 4JQ7A 3RWPA 4Y8DA 2GMXA 4C4GA 4ZS4A 4UZHA 4YLLA 3MVMA 2OZOA 3GQIA 3QX4A 4W4WA 3RBWA 3EFKA 2GHLA 3OTUA 5IUHA 4BY9E 1YQJA 4NM5A 2B9JA 2YIXA 3LFFA 3ZS5A 4EUTA 5FP6A 1KOBA 4IZ7A 3BYOA 5BYYA 4RWKA 5BYZA 4C4IA 3FI2A 3TZ7A 4NIFB 1RQQA 2ITXA 2KTYA 3NUSA 3PG3A 4X3FC 4OTQA 1Y57A 3KN6A 3GI3A 2H96A 3O2MA 4FZFB 4A4XA 3BELA 5EW9A 3OCSA 4X2JA 4JL9A 2F57A 2XA4A 3Q4CA 4D0XA 2X2MA 2J6MA 1Y6AA 1M14A 4N57A 2JBOA 2QURA 4ANOA 3V5WA 2P3GX 2WZJA 1OBGA 4Y5QA 2XJ1A 4NH1A 4BWXA 1BMKA 2FO0A 5D41A 3TXOA 2DWBA 3W18A 2CN8A 2J2IB 4MNEA 5DR6A 3PFQA 4IADA 4BTFA 4EH9A 3VS7A 1XBAA 2GFCA 3R6XA 5B2LA 5AP3A 2PE1A 3G33A 4F7LA 2PUPA 1XH8A 1YI3A 2BRBA 1PYEA 3A4OX 3TNQB 4RJ7A 3ZEPA 1OKYA 2WU7A 5E8XA 2C6TA 3MW1A 3PVGA 4MXYA 3V6RA 4UN0C 1KE5A 5JSMA 2BRGA 3ZHPC 2QR7A 4U79A 2UZEA 4PTEA 4EQUA 5A14A 2XZSA 3P08A 2WELA 2PE2A 3EN4A 3E8DA 3MIYA 4FTRA 5D9HA 4W8EA 4CKJA 4GW8A 2C1AA 1JWHA 2VTOA 4BCQA 4IHPA 2JIIA 1H1RA 1VYWA 4M0YA 2HYYA 3RZFA 1NY3A 1IR3A 3AC2A 4O86A 5C26A 2PSQA 3ZDUA 3HZTA 4EONA 4DFBA 4YGAA 2C3LA 3MY0A 4WKQA 5HORA 2G01A 2PPQA 4PPCA 3R7EA 3ZO3A 3VHEA 1L3RE 4IXPA 2RGPA 3ZBXA 4TYIA 3BHYA 2WMQA 5DBXA 4AFJA 1ZAOA 4E8AA 4E4MA 1NW1A 1OITA 3VVHA 3UP2A 4ASXA 1CSNA 4J1RA 3ZLYA 3QFVA 1CKIA 4G6LA 5CEOA 2VTNA 3GCSA 3ZONA 3OWLA 2H9VA 2ZV2A 4DN5A 4ORKA 1IA8A 2EB2A 3Q4ZA 4NUSA 3U55A 3OUNB 3G5DA 3OS3A 2R3LA 5ETCA 4GJ2A 4TRLA 1W7HA 3FLNC 2XNOA 3ORNA 4WNMA 3RPRA 3F61A 1J3HA 3UG1A 4F64A 3SW7A 1JKLA 3VS1A 2C5VA 5KUPA 4HNFA 3QXPA 2XBJA 4XG7A 3OG7A 3KMUA 4E4XA 5FD2A 3ALOA 4D9TA 3SRVA 2A19B 3DBFA 3QBNA 1IG1A 4OUCA 3MH2A 4DG3E 2RG5A 3AD6A 3AMAA 2XIRA 3DV3A 5HBHA 3ETAA 2Z60A 2WMWA 3KREA 3ZBFA 2HWOA 3EFJA 4FT9A 2ZMDA 1OPKA 4KINA 4L42A 4L52A 4IX4A 4OLIA 5M57A 3EFLA 2AUHA 2WQOA 4YO4A 3MA6A 4D58A 3LPBA 2G2FA 2EVAA 4QQJA 4DHFA 2V7OA 5FEEA 2VNYA 2BAJA 3TG1A 4E73A 3VQHA 5M55A 4I6FA 4WOVA 4MWIA 4FUXA 4CLIA 4AN3A 2VO0A 2W1GA 4USEA 3K2LA 2P55A 4BICA 2BRNA 3CEKA 3DDQA 3EMGA 3FMKA 4A9RA 2XIZA 4AZSA 4ACHA 4HCVA 4RX7A 4YZ9A 5LVMA 3Q04A 5AP7A 1GIIA 3MFUA 3VC4A 5CU6A 1ZMUA 2UZLA 2OF4A 2PULA 3PG1A 4G9CA 4IX6A 4O91A 4PUZA 2F7EE 2OJFE 3FJQE 2E9OA 4JDHA 3TNHA 2QD9A 3FQSA 4ZSGA 4ZTLA 5I9YA 4UYNA 2UVXA 2XJ0A 3TUDA 4XG6A 1XQZA 4MCVA 4MD9E 2ITOA 4FL1A 5T6KA 3HDNA 4RT7A 4Q5EA 4M8TA 3ORPA 3TNWA 3RK9A 3UVRA 2OXYA 2VTRA 1URCA 2BDWA 3R21A 1YVJA 3TV6A 2OH0E 3ULIA 4BYIA 1DAYA 3OWJA 3DQWA 4DEIA 1YXTA 4P7EA 2BRHA 3PWYA 4QMLA 4TYHB 1XH4A 2YERA 2RKUA 4QMNA 2WO6A 2BTRA 3UGCA 4JQEA 1PXKA 2X9EA 3PP0A 2FGIA 1Z5MA 3HMPA 3QRIA 4IAIA 2BFYA 4RVMA 4AA5A 4G3DA 4XG9A 3G15A 3R8PA 2P4IA 3D5UA 4EQMA 4W4VA 3R9RA 4JJRA 4H05A 4RIYB 3DAEA 5CF8A 4QYYA 3TKIA 5DWRA 4WA9A 4G17A 3DGKA 2HZNA 3ALNA 5AP5A 4TW9A 1K2PA 3EL7A 2PHKA 1MQBA 5KBRA 4QP8A 4FTQA 1CTPE 4FV8A 4E5WA 2ITPA 3THBA 3TKUA 4UBAA 4NIFA 1OUKA 1G3NA 3AGMA 3CD8A 4GYIA 4XUFA 1GIHA 3MFTA 3RMFA 5HVKA 3I60A 3MVLA 3W2OA 2VNWA 3REPA 3P7CA 3OUKA 4IC8A 5ANKA 5EG3A 3HA6A 4O7ZA 5K3YA 1YWVA 3NUPA 4D2WA 5I9WA 5AR4A 3KXHA 4LM5A 5CI6A 4ZZNA 1A9UA 5AMNA 5FBNC 4KBCA 4ASZA 4C35A 3EN9A 2C6MA 3K5VA 5AX9A 2QOHA 3FYJX 4GYGA 2X4ZA 1H24A 3BHUA 3QZIA 4UV0A 4DA5A 3ODYX 4FSYA 1QPDA 2HIWA 3Q96A 3OBGA 4ANLA 3EH9A 2ITWA 4QP9A 2Z2WA 4RVTA 3PXFA 3ZMMA 5EYKA 4EOKA 3IPHA 3ZUVA 3WILA 4DLJA 1XWSA 5DT4A 2JKQA 3Q52A 4ZJVA 4EH6A 3DNEA 3NYNA 4GRBA 4H1MA 4N6YA 4CFVA 1Z57A 3CJGA 4GIIA 3P4KA 5KZIA 4BDIA 3POOA 4UXQA 4GKHA 3Q60A 3L8SA 3WZEA 4DFLA 3GGFA 4K8AA 4EK4A 4QPSA 4X3FB 5M4CA 3SW4A 4DGLC 5M09A 2QOLA 3DK7A 2XF0A 1PMNA 3RPVA 5CSWA 1YOJA 1W84A 4IJ9A 3HGKA 4YC3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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