5ANIA

Crystal structure of cdk2 in complex with 6-chloro-7h-purine processed with the crystaldirect automated mounting and cryo-cooling technology
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
297
structure length
280
Chain Sequence
ENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Automated Harvesting and Processing of Protein Crystals Through Laser Photoablation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 280
sequence length 297
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5aniA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5aniA01
2BIKB 3VJNA 3GU6A 2CN5A 4RIWB 2BZKB 2B9IA 3BYUA 4MXAA 4RVKA 3GCQA 3IKAA 5D11A 4NJDA 3G51A 3F9NA 4NTTA 4BDHA 4CKIA 4P5QA 4EKLA 3G2FA 4YBKA 5EQEA 4O7NA 4DFLA 1ZYLA 5HVYA 4I24A 2W9FB 3QZIA 3ZO2A 2HIWA 1LP4A 4CFWA 2WMBA 3QF9A 3ORKA 5EOLA 4NU1A 4H05A 4JDKA 3VS6A 3RNIA 3WF9A 2HENA 3CTHA 3BWJA 2OXXA 4Q9SA 3QRUA 2VO7A 5E8VA 4QMSA 4RWJA 4A9YA 4F9CA 2W0JA 2WPAA 4P5ZA 4X0MA 3TIZA 3OOMA 3F66A 4EEVA 2Y8OA 2R3LA 3BE2A 3P0MA 5KNJA 1CMKE 2E9UA 1NY3A 5EHLA 3SW7A 5I9XA 1W83A 4DT9A 4G9RA 3HL7A 3KVXA 4QP8A 4RC4A 3MJ2A 5IQIA 3K5VA 2X6EA 4PTEA 2XBJA 1TQPA 4ID7A 3DKFA 4AT4A 3PXRA 4I23A 2SRCA 3D7TA 5DYJA 4FTAA 4Y85A 1GZOA 2C68A 2PTKA 2YIWA 4PTGA 5DEYA 4G16A 4MWHA 3P7AA 4DG2E 2OZOA 3FLSA 3TZ7A 2VTIA 4FK3A 1AQ1A 3ATTA 3WF5A 4X2JA 2BILB 4I6QA 5HVKA 3QWKA 2Z60A 4TKSA 4IJ9A 5CEKA 2C3KA 2Z7RA 3LFBA 4GUEA 3LE6A 5HIEA 4RQVA 2QOLA 2IZSA 2W1HA 1ZOGA 3F2NA 4FV8A 3D4QA 5JZNA 3VJOA 4F1OA 2PU8A 4GU9A 2IVVA 5AP7A 5M4UA 4CTCA 2OK1A 5JZJA 1WVXA 4ACDA 4YPSA 3GCUA 2WFYA 5HEZA 3ELJA 2PVKA 5L8LA 4HJOA 2H8HA 1OUKA 4IZAA 4EC8A 4Y83A 4G5JA 5E91A 4CFUA 5GJFA 1ZRZA 3U8WA 4YO4A 4O21A 2GQSA 1YRPA 4S30A 2UVXA 1P2AA 4A4OA 4ZY6A 4BIDA 3GOKA 4Y73A 4BVUA 3FKNA 5LCKA 3ZM9A 2OLCA 3FZPA 3P9JA 5LMKC 2UZVA 3VN9A 2ZM3A 4Z55A 3D0EA 5JFVA 3Q9WA 1PXIA 4LMUA 4PDPA 3E5AA 2IO6A 2DWBA 4YTIA 1FBNA 2VV9A 2J50A 4E3CA 5JN2A 5DT3A 3KXMA 4U80A 4J53A 2XCHA 1HOWA 3UNKA 5EYMA 1H01A 4CFXA 2WTWA 2VO3A 4FV6A 4IB5A 4IB0A 4ZZOA 5M4CA 1ZYCA 3GU7A 3AMYA 2W5BA 3WBLA 4FSZA 4RIWA 4BTMA 4CFNA 3BBTB 1Q8YA 5DMZA 2X2LA 4PL5A 1VZOA 5J1WA 2Z7SA 3MN3A 2QU6A 5E9EA 3LFCA 4HVGA 3I0QA 2IPXA 3COKA 4PDSA 4ANLA 5L2QA 4FIEA 3UIMA 4A9UA 3PDTA 5BPYA 2XKEA 4B7TA 4D2TA 5E8YA 5BX0A 3IQ7A 4JG8A 4EOJA 5AAEA 2VGOA 4FKRA 3AGMA 5AR7A 2WQEA 4L9IA 5FTOA 3NUUA 4PQNA 2C30A 4LOOA 4AT5A 4EHZA 2QHNA 4EOPA 5A14A 3FZ1A 1JLUE 2WKMA 4RVMA 3R8MA 5DA3A 5CI7A 3KXXA 2YHVA 1FOTA 1DS5A 4I0RA 4DH7A 4OTWA 2WMXA 1Q8TA 4WKQA 2QU5A 4TYGA 4I92A 4H39A 3UC3A 5K5NA 3T8OA 4U6RA 4O0TA 1H24A 4JBQA 4K77A 5HHWA 5HLPA 4U3YA 3ZSGA 3RWQA 5GZ8A 3R7OA 4K6ZA 3GB2A 4XV2A 4N0SA 3FBVA 3HV4A 4FKUA 4AZWA 3JY9A 2BCJA 2HK5A 2RGPA 4K8AA 4C57A 4E4MA 5CU4A 3MESA 2C6EA 4OR5A 4O7YA 1V1KA 5ETFA 4ACMA 2CHLA 4DTKA 2W1DA 3EQPA 1XWSA 4G3CA 5M57A 3TV4A 5J7HA 1PY5A 1IAJA 3NVMB 2VTNA 4RJ7A 3R7IA 4IB1A 2XK6A 3HMPA 3VUTA 4AGUA 4YNEA 5HE1A 5L2WA 3OTUA 4HOKA 4P7EA 3RAIA 2WMUA 2O2UA 4C38A 1JKTA 4FUXA 1MP8A 4HNFA 4IWDA 3IO7A 2OJIA 4JOAA 3SKCA 3VRZA 1ZYJA 3O7LD 3R63A 3KN5A 2HZNA 3KFAA 3ZFMA 3TNWA 1PMVA 4RPVA 4RFMA 3I79A 4PPAA 3P86A 3EH9A 4IQ6A 3UQGA 3E8EA 3BEGA 2BHEA 3U9CA 5AMNA 5TT7A 1PRYA 4C4HA 3R8LA 4MNEB 3FZSA 3NNUA 4IZYA 2B9HA 3IONA 3GENA 2RFNA 3KXNA 3QQUA 4IVAA 3ZSIA 3Q60A 2P3GX 3CC6A 3HMIA 5LVMA 4WUNA 1JAMA 3LFEA 3LLTA 5EDQA 3KB7A 4FIFA 4F1TA 5JGDA 4EK4A 1J1CA 3PSBA 4GSBA 5BUEA 5KX8A 2J0LA 2WD1A 3UPXA 2ERZE 4EK5A 1M7NA 3PJ1A 3BV3A 5EI2A 5BUJA 4FTNA 3ORIA 1UKHA 4IWPA 4XRJA 5EK7A 1YXXA 4BDAA 3OD6X 3Q2MA 5JFSA 4RIXA 3U9NA 4FV9A 1URCA 2PZYA 4X7QA 2W4OA 4CMUA 5CS6A 1E9HA 3FDNA 4NM3A 5CT0A 4FV2A 2OO8X 3ID6C 2XJ0A 2IZTA 3DKGA 3OF0A 3DTWA 5ETCA 1PJKA 4OBOA 4YLKA 5J5TA 4N70A 2ITWA 4IACA 4IIRA 4IANA 3E92A 1Q8UA 5HCXA 4F7JA 2JKOA 3CSVA 2W05A 5IQBA 5E8TA 1F3MC 4TRLA 2VTMA 5IH4A 3B2TA 3P5KA 3C4ZA 4GIIA 1ND4A 3UNZA 3FI4A 4ASEA 4IC7A 5AA9A 5CQUA 2CLQA 3NW7A 3PZEA 3W2CA 4QMOA 4LQMA 3PPZA 4NK9A 4DEEA 3KULB 4U79A 3QFVA 1GOLA 4CG9A 3FC1X 2AYPA 2WGJA 5KBRA 2JITA 1XJDA 4IH8A 4JIKA 4TN6A 4RX8A 3AD6A 2NO3A 4NM0A 4EI4A 4D1SA 4FKIA 2FSTX 3F3TA 5FP5A 5CTPA 3DOGA 2VWBA 3EQHA 5DR6A 4KKEA 5HD7A 3I1AA 4F6WA 4A7CA 3WE8A 4Y46A 1W82A 3JYAA 4HPTE 4OT5A 4YC8A 1NT2A 5A4CA 2QLQA 3EFLA 4QOXA 4U44A 4ERKA 3PVWA 1LR4A 2R9SA 3ZDIA 3NYOA 5CNOA 4AA0A 3IECA 3PWDA 4G3FA 4G6LA 4XG3A 5TKDA 2YJRA 5AX3A 2GCDA 3TACA 5IU2A 1BMKA 2QOKA 4U40A 4W8DA 2IW9A 3DAJA 4PMMA 3SDJA 4ACHA 4C8BA 3BE9A 4F70A 3E88A 3LAUA 1UU9A 4ALWA 2YA9A 3EFKA 4BICA 4OTQA 5CSWA 2ZYBA 3HKOA 4ZY5A 2WQOA 1CTPE 4UB7A 5M53A 5IQAA 5FUTA 3I0OA 1GY3A 2QI8A 1PMEA 3ERKA 4FKLA 1WFCA 2VN9A 4E6DA 2I1MA 2V62A 5CF5A 4YTFA 4FL1A 4KABA 5FP6A 1KE8A 3QA8A 3U6HA 2YCSA 4E5WA 3U6JA 2HW6A 3KRJA 3FXXA 2REIA 2Y4PA 3F7ZA 3BWFA 1QPEA 3D5XA 3UOLA 2J4ZA 3FE3A 3R1QA 2PVNA 4U43A 1JBPE 5M56A 4RRVA 2W5HA 4AOIA 3PZHA 4EJNA 5AR2A 3R8VA 1APME 3O23A 4D5KA 3PPKA 2ITOA 4RZVA 4TWNA 5CEMA 3MH3A 3I5NA 5FGKA 3KK9A 4L7SA 1Q3DA 3IS5A 3U55A 5HCYA 2JC6A 3A4PA 2YACA 1W7HA 3N4VA 4OTDA 2UZBA 2YABA 3E7VA 2IW8A 4FKSA 3G6GA 4EK6A 3ENMA 1XBBA 5AAGA 1PHKA 3T3UA 1T45A 2B1PA 4D55A 2G2FA 3NIEA 4G31A 1KE9A 5EG3A 2VX0A 1DI9A 3KCFA 1GNGA 4S33A 4D5HA 4IM3A 4HYSA 4IW0A 2C6KA 2ZM4A 1RW8A 3DFCB 4FZ6A 4GVAA 4IAIA 3DA6A 3EJ1A 4NUSA 2WTCA 4EC9A 1JKLA 1PXOA 1X8BA 4G9CA 1WVWA 1VR2A 3ROCA 2PVMA 2A0CX 1BUHA 3QD0A 4E6CA 1IRKA 3JPVA 2YAKA 4JG6A 4FTCA 3VUGA 4FV3A 2UZDA 1PYEA 4BDFA 4I4FA 2O5KA 4LFIA 3KULA 3BPRA 4FMQA 3RCJA 3Q5IA 4PNIA 5KMIA 1PKDA 2J6MA 2YM5A 5DE2A 4E6AA 3AOXA 2OF4A 1Q8ZA 2JKKA 3EIDA 1SVGA 4FSUA 5FLFA 4MKCA 4NW5A 5D7VA 3HP2A 3TV6A 4KSPA 2UZTA 2VTPA 3IGOA 3RNYA 2R0IA 3DLSA 1PXPA 2R7IA 2DQ7X 4I1ZA 1OVEA 4TPTA 2WTDA 3LXNA 2XS0A 5HTBA 4LRMA 2ZOQA 4BGGA 3T9TA 3FL5A 5J1VA 3LFFA 4EH8A 3LJ0A 3ZLWA 3ZMMA 5KKRC 5B7VA 1KOAA 4MD9E 5AV4A 2PZ5A 5HG8A 2VNYA 4G6NA 3SOCA 3DJ5A 4M8TA 4MX9A 3DZQA 2JIVA 3ETAA 2ZB1A 4ZAUA 3GCSA 3P08A 4L8MA 1TQMA 3DK7A 5I9ZA 4I5MA 2OJGA 5T3QA 3SX9A 2VGPA 4X3FC 2QCSA 4M69B 2ITTA 4OW8A 3F69A 5HO8A 5IEXA 5JFXA 4RBLA 1J7LA 4ZZMA 1WBOA 2PUUA 4DH5A 3SAYA 2O63A 2W1EA 3KRRA 4XV1A 3V6SA 4BDEA 5J5SA 3O8UA 2XKFA 2QOFA 4HYUA 3KMMA 1Q61A 1M17A 5GINE 3TT0A 4FEWA 5HG7A 4TWOA 4YLJA 1JOWB 3NUNA 5L2TA 3G6HA 4MAOA 3ZH8A 4QMLA 2QR8A 3KK8A 1GJOA 4FKPA 4FTLA 3LW0A 4H3BA 4CZUA 3R04A 4K0YA 5DOSA 5A3XA 3CQWA 3RKBA 4FT0A 1A48A 3R71A 4EBWA 2B9JA 2O65A 4YURA 5DHJA 5CF4A 3FLYA 3C0GA 4V01A 2GMXA 3E3BX 4OGRA 3DAEA 4TNDA 2FGIA 5K9IA 1ZYDA 4MQ2A 4O0WA 4F9BA 3FMJA 2R64A 1CDKA 2OBJA 3HMNA 4DH3A 1K2PA 3WI6A 4DITA 5C4KA 5BUIA 2JLDA 4O7LA 4YC3A 3HDMA 3FYKX 3L8XA 3PY1A 2XMYA 3QTXA 4FSWA 3PLAE 3SD0A 3VVHA 4GYGA 3HRFA 1YDRE 4JI9A 1WBTA 2CKPA 2OH4A 4IX5A 3LPBA 3AMAA 3VRYA 4BHZA 4WNKA 4BKYA 3OWJA 3HV6A 3V3VA 4HVHA 3QTIA 3II5A 2UVZA 1BYGA 2YLEA 3OCSA 4DGMA 5KMKA 4FNZA 5D12A 4UMQA 1OBDA 3BLHA 3QTWA 1V0PA 2HWOA 1FVRA 1YI6A 5CZHA 4MNFA 5F94A 4JL9A 3IW5A 3ZU7A 5CEOA 3AD5A 4I94A 2PE2A 3A2CA 3FY2A 4L6QA 4WOVA 4CCBA 1AGWA 2PVFA 4IZ7A 5H8BA 3EHAA 5M06A 4AA4A 2VAGA 2WMWA 3HMOA 4D4VA 4PDYA 2CGWA 1M7QA 3C4EA 1WMKA 3FKOA 4FIIA 2B52A 4WG5A 3GU8A 2QNJA 4UXQA 5CU3A 4B0GA 4ENXA 3MVJA 3O0GA 4GUBA 1IR3A 2VTTA 5FBNC 2GNLA 4TT7A 1JQHA 5LJJA 3VUMA 4UZHA 4XS2A 3VQHA 4DT8A 1FQ1B 4GFMA 3W55A 1A06A 5CZIA 4WT6A 4FZFB 4BTJA 4XG2A 2WMTA 4FTKA 5IH6A 5EM7A 3D83A 2BRMA 3P23A 1NVQA 4H3QA 4ZSEA 3TZ8A 5A4EA 4FOCA 3UDBA 4BL1A 2XYUA 3EKNA 3FLNC 3FZRA 1YOMA 4CZYB 3MH0A 3POOA 4ERWA 3CE3A 5K4IA 3B8RA 5EH0A 3TIYA 4V04A 4ZTNA 4F4PA 5FEDA 2BRNA 4G17A 5T68A 3VF8A 1BLXA 4QTCA 3QQLA 4RWLA 4TY1A 3S1HA 2G9XA 4IX6A 4RA5A 4YJVA 3C13A 5LVLA 1BL7A 4AFJA 5KMLA 5LWNA 2W1CA 2FSOX 2G2HA 2VNWA 5DGZA 4EH6A 5C26A 2I0EA 3M2WA 4F1MA 4NIFB 1FMOE 3H3CA 4FBXA 4MK0A 3AC3A 2JKQA 3UE4A 3UC4A 3VHEA 3Q32A 1GIIA 2WOUA 2AC5A 1V0BA 3Q9ZA 4BCJA 2XNMA 3NR9A 4QP7A 2XB7A 4XV3A 4C7TA 4YR8A 3DBQA 5HLWA 5JH6A 4QP9A 5HICA 4C36A 2R3NA 3L8SA 4GK3A 2WELA 2OZAA 5F95A 5GZ9A 5HTCA 3F2RA 2W7XA 5ETAA 4C59A 4XCUA 4O0YA 3I6WA 1ZY5A 3SRVB 3CP9A 4IVCA 4XP0A 3LHJA 4D4YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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