5AX9A

Crystal structure of the kinase domain of human traf2 and nck-interacting protein kinase in complex with compund 9
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
282
Chain Sequence
EIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTGDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLIKNTKGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPAPRLKSKKWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title TNIK inhibition abrogates colorectal cancer stemness
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRAF2 and NCK-interacting protein kinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 282
sequence length 296
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ax9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ax9A01
2VWIA 3FMJA 1Q99A 2Y7JA 5KE0A 3ZM4A 3FLZA 3GC0A 3FQEA 4M8TA 3UO6A 4QQJA 1XH7A 1WAKA 4U45A 5AUUA 2CN5A 3DXNA 4NL0A 5E8UA 4LFIA 2JKOA 1H00A 5BVWA 4F7SA 3TKHA 4LV8A 4PTCA 3GU4A 3R83A 2WMBA 4ACCA 1PRYA 3OY3A 5HE1A 4V0GB 4KIPA 3DB6A 1H1WA 2QR8A 3F5PA 2BDWA 3HMPA 2GHMA 3ZHPC 3VS4A 3W2PA 2OGVA 2Q0NA 1H8FA 3BHYA 4FEVA 3COMA 5CEIA 2C3IB 4RFMA 2ERZE 3EQCA 3V6SA 2JGZA 2R3IA 5IUGA 1M2QA 2H96A 3TL8A 3R1SA 2PZIA 1JKTA 4AFEA 3Q4CA 4DINA 3VBWA 3FAAA 3DJ6A 5FM2A 3OT8A 4CFUA 3QD0A 4CMTA 3G9LX 5H9BA 3V8WA 1J7IA 1Q24A 2WNTA 4I6FA 4GT3A 2BRNA 4QYYA 4IM2A 5CWZA 4WG4A 4FI1A 3G9NA 3QRJA 4V01A 3LMHA 1U5RA 4J97A 2XIKA 3KXNA 4XP3A 4QT1A 4AN9A 3AOXA 4ASXA 2ITOA 5JEBA 2WD1A 5LJJA 4W8DA 2J7TA 4AE9A 2YCQA 5CF6A 3IPHA 3N9XA 4NM3A 3UP2A 4O7VA 4DLJA 2UZTA 3A4OX 4QPAA 3SW4A 4YZBA 2CNUA 1JSVA 5LWMA 2OO8X 3VUHA 1J7UA 4WRGA 2WXVA 5DI1A 5HQ0A 3PPJA 3UYSA 3BI6A 5M4FA 2XZSA 3UQGA 1J1CA 1OECA 5HNGA 4ZLYA 4XJ0A 3ZS5A 3LZBA 3DU8A 3FYJX 4LUEA 5CAUA 4XG9A 4GS6A 2EUFB 3OG7A 5CX9A 3EN5A 5E8SA 5F20A 4C0TA 4QMUA 5M57A 3OTUA 3PXYA 3ZYAA 1XO2B 3ALOA 4WG3A 2B9IA 3MVJA 1WFCA 1YW2A 5BVNA 3ANRA 3V04A 4EYMA 5I4NA 1U59A 3FI2A 4R3RA 3ZEWA 5HVJA 4IB0A 4RA4A 2BKKA 4PDPA 3F9NA 1YXSA 4RIXB 3D4QA 4X2NA 4F64A 2YIYA 5DNRA 4K2RA 4EWQA 4IVBA 2G1TA 1M2PA 3KK8A 4IDTA 4AA5A 4USFA 3MDYA 2OG8A 3BLRA 1IAJA 3OBJA 3ZZWA 3R7OA 4ZTRA 4IQ6A 5KMKA 4EK4A 2BAJA 4LMNA 3F7WA 4EUUA 3EQHA 3QUDA 4JLCA 4FZFB 4PWNA 2PE1A 4YZCA 1Q8UA 3PJ1A 1H0VA 3A4PA 3KN5A 5CF5A 3ATSA 2BHHA 2XNMA 3G6HA 2OJIA 3ZUUA 1JWHA 1XH4A 3ETAA 4KSPA 5JKGA 4RIYA 2V22A 2X2KA 3H30A 3F2RA 3HAMA 2GNFA 4K0YA 2F2CB 3KF4A 5CU6A 4EH3A 2CKOA 4NJDA 3DQXA 3CQUA 4RVLA 4EI4A 1PXNA 3MY1A 2OF4A 1F5QA 5DH3A 3WZUA 1JKSA 4AT3A 4Q5HA 1P2AA 3W10A 1OUYA 3BEAA 3SAYA 4FBXA 2X8DA 4BZNA 5HE2A 1W8CA 2JEDA 4MXOA 4F7JA 4D0XA 5IUHA 3LAUA 3TDWA 3SLSA 2PUNA 1ZYCA 3F5UA 3P0MA 4PDOA 2YACA 2JKQA 4BF2A 5IMEA 1M17A 4H3BA 2V0DA 3VIDA 4DGLC 4NYEA 3JS2A 4EOMA 5CASA 2QO9A 4J71A 3OT3A 1KV2A 3LM0A 4BDDA 5HBJA 4QTEA 4BCNA 3LCKA 5DEYA 4QNAA 2PVKA 4IWPA 3TDVA 3M42A 2R7BA 2XUUA 3I1AA 4GFOA 1Q3DA 2PSQA 4U5JA 4AF3A 3NAYA 3NYOA 3NX8A 1M2RA 2QOIA 4AT5A 4Z7HA 1Y91A 2ZOQA 3HRFA 3F3VA 3NPCA 3ZXZA 3U4WA 3H0YA 3V8SA 3F2AA 4JX7A 4L43A 3NUXA 2YM5A 1Q8WA 5DA3A 3SVVA 4HNIA 5M55A 4D2VA 2R0UA 4FKSA 4JBQA 4C2VA 5EOLA 3ZUTA 4XRLA 3F3TA 4NTSA 3GC8A 4GV1A 1PW2A 3V01A 2VAGA 5I5ZA 2QOBA 1UVRA 5EI2A 3BV3A 4FIIA 2VU3A 4PX6A 4RZWA 3RK5A 3U51A 4O22A 3UIXA 2DUVA 2O2UA 3DZQA 3FJQE 3AD6A 2ITWA 3O50A 3POOA 4P2KA 5EI6A 3RCJA 5A4QA 2WQOA 4O91A 4DFXE 4JBVA 4IHPA 2YCRA 3FHIA 4PPCA 3LE6A 3T3VA 3ODZX 3LCTA 1I44A 4AOJA 4IXPA 1GOLA 3KB7A 4X3FC 3OWPA 2YZAA 3DPKA 5CEMA 4I4FA 2VTIA 4K33A 5FP6A 1CTPE 4U42A 3MH0A 3RCDA 4YU2A 3R7UA 4FTJA 4LI5A 4YJUA 3WARA 1Z57A 2VNWA 2YIWA 3IG7A 5CSHA 3MB6A 4KB8A 3ET7A 3FKOA 4CRLA 3PE1A 5ETAA 2ZMCA 2VUWA 3CIKA 3RHKA 4TXCA 3K2LA 4QQ5A 1BKXA 4YC3A 5FTGA 2B54A 4A07A 4JG8A 3LJ2A 1YDRE 4X2GA 1BX6A 2H8HA 4Q9ZA 1J1BA 3AT4A 3EHAA 1TVOA 5BVKA 4UWBA 4YZ9A 3U6JA 2JDSA 2O63A 4CV8A 3DJ5A 4WNPA 3VUIA 3KULA 1R3CA 3SG8A 3DQWA 3WE8A 4YTHA 4L44A 1YXUA 4Y5HA 5IQGA 4DGOA 2A1AB 2BKZA 3UPXA 3UZPA 5LMBA 2C6KA 4RWIA 2ITTA 5TF9A 2HWPA 4FSYA 1H01A 1OM1A 3QD3A 4BWKA 2CMWA 3LFNA 4CLJA 3HECA 4ERKA 3DKGA 3QTQA 5DR6A 4E6DA 4FKIA 2KTYA 1R39A 4J8NA 4GIIA 1UU7A 3FLSA 1YDTE 1H07A 3KULB 1JPAA 5JGBA 4QMQA 3KREA 2OJFE 4OT5A 4U9AA 3LXPA 2VWUA 3OW3A 2EXEA 4AWIA 4AAAA 2FUMA 1X8BA 2EB2A 3VS0A 3ZMMA 5KHWA 4BKJA 4OTFA 2XNPA 3Q2MA 3TNHA 3UVQA 5DOSA 2GQGA 5BNJA 2X6DA 3OW4A 5BUEA 2DS1A 3UC4A 5JGDA 3KFAA 2YA9A 3QALE 4TYJA 4XP2A 2UZDA 3EKNA 4XG4A 4UXQA 3R28A 3R2YA 4HJOA 4UMPA 4EHEA 3R02A 1STCE 3PXFA 2ZM3A 3FLQA 4M84A 1XH9A 4BCFA 3A2CA 1QPEA 1ZARA 2XJ0A 4A7CA 4ZMEA 3EQGA 3H9RA 2W4KA 3KRXA 2VWZA 4DTBA 1QPDA 3NW5A 4JQ7A 3ROCA 2WMQA 2YLEA 3OUKA 4FKLA 3AT2A 4BDGA 3Q52A 4WSYA 2XK6A 3QUPA 5EM7A 1SVHA 3D5XA 2B0QA 4G5PA 4X3FB 2C6DA 4GMYA 5GJGA 4M3QA 3TCPA 1Y57A 4UB7A 2JFLA 3RPVA 3L9MA 3ZH8A 4BCGA 5D7VA 3ID6C 3OBGA 5IQFA 4XUFA 2X0GA 3EZRA 3C51A 3GP0A 3I6UA 1DI9A 4ZSAA 4WSQA 3U6IA 2IW9A 3IDCA 5FQDC 2BCJA 3LCDA 3R63A 5AV1A 3FBVA 3OP5A 3WIGA 3WZJA 4FL2A 2UZBA 3GU7A 5HD4A 3PLSA 2O65A 4E7WA 2CPKE 3CBLA 3TXOA 4UMUA 5JK3A 3A7FA 4IAFA 1YHSA 3VF9A 3TUBA 4YSMA 4X2FA 4E4LA 4BYIA 4EQUA 4YSJA 3DY7A 2HOGA 3HDNA 3U9NA 4NJ3A 4W4WA 1CKJA 3U87A 1P4OA 2F4JA 4L7SA 5FG8A 3CEKA 1Y6AA 1U54A 3UGCA 4AFJA 4DA5A 4I93A 4TYIA 2ZB0A 3CY2A 3EB0A 5IG1A 4FSUA 3ZBXA 2WB8A 4C38A 3I0OA 1JBPE 5EQYA 3BU6A 1GZ8A 4HGTA 4KIQA 5GZ9A 5ANDA 5D11A 3MPAA 2ETRA 5LQFA 3Q4UA 1PXJA 3ZLWA 4N6YA 2XEYA 4U3ZA 3VWAA 4FIFA 4X2KA 3MFTA 4IBMA 3EQFA 5LVMA 3VBTA 3P23A 1K9AA 2V62A 3JY9A 3QWKA 3B8RA 4WUNA 3NUAA 2WHBA 3MB7A 4DCEA 4F0GA 4IANA 4Y5QA 3VW6A 4OBQA 5CU3A 2B7AA 3TZ9A 1JNKA 5D9HA 4AX8A 2F7ZE 4FVQA 5DGZA 3E93A 3ORLA 2JIVA 3HV3A 4RC4A 2PE2A 2W5HA 2R3KA 4Q5EA 4PL4A 2GFCA 1SVEA 2HCKA 3TNQB 4BCOA 3U54A 4YJRA 1YI6A 4NTTA 4AG8A 4B9DA 1RDQE 3ORXA 4O0VA 1JAMA 4IWQA 3GCUA 2BTSA 5M07A 1V1KA 3HUBA 2W9FB 3LPBA 4DEDA 4ITIA 4TWOA 4DTAA 2XIZA 4QP2A 3CD8A 2F9GA 3MA6A 3DFAA 2J5FA 5ACKA 5AR3A 4XV9A 4PMTA 3E5AA 4IZYA 4KWPA 4F9YA 4ANMA 2CGUA 3PG3A 4PTEA 3VRYA 3VS3A 4BI0A 4CFMA 3CD3A 4GK3A 4NCTA 4X3JA 4L3JA 4FL1A 2R2PA 2G2FA 3EYHA 3ERKA 2YN8A 3PA4A 3AC2A 3R7IA 2XRUA 3VHKA 4HYSA 4QYEA 4QYFA 3F3ZA 4OTPA 3KCFA 3E8NA 4GUEA 4X6RA 2JFMA 2IVVA 1KE5A 4YTIA 4JRNA 5ICPA 4I0TA 3ITZA 4M67A 4WNOA 4RFYA 2JITA 4IFCA 4E5AX 4IB5A 2WTDA 2XJ1A 2J0KA 3RK9A 3QA8A 5E8XA 4AGDA 4Y46A 4EHZA 4FK3A 3QTUA 2CLXA 5IZFA 4IW0A 4CFWA 5AP2A 3LVPA 4RIWB 2XJ2A 4CZTA 5GIPE 4RIOA 1W98A 2VX0A 3CXWA 3FUPA 5CEOA 1PXLA 2ZV8A 4MXZA 4D4SA 4TWNA 2GNJA 3QQJA 4H58A 4FTKA 4G2FA 5IQIA 5JZNA 3D5UA 1OKVA 1ZZ2A 2IWIA 2GHGA 2OBJA 3P7AA 5B7VA 3OVVA 3DLZA 3BWFA 3A61A 3W2OA 3ZXTA 2FO0A 2UZOA 3UVPA 3ROYA 5J8IA 5AFVA 3ORTA 5K5NA 5HEZA 4JAJA 2PYWA 4BBFA 4IAAA 4D9TA 2X1NA 5J1WA 2HAKA 3DT1A 5IA3A 3R9HA 3DOGA 4YJTA 3QRIA 4QTBA 4BIBA 3RPRA 3FLWA 4I21A 4DITA 5T6KA 3EQRA 4K77A 3QD4A 5FGKA 4A9YA 2XK3A 2GTMA 5JT2A 2WZJA 2UW5A 1ZRZA 3V5PA 4QMNA 2RFDA 1XKKA 2GQSA 5IKWA 5CQUA 3G2FA 3LOKA 5KBQA 3BV2A 3TI1A 2C68A 3CKWA 4KS8A 3PXQA 4WHZA 3CQWA 5I9UA 4ACGA 2JBOA 2R0IA 4QMWA 4H05A 4M0ZA 3ZDUA 4C59A 4U41A 3MGYA 3JUHA 5CU4A 2HIWA 5J1VA 2WPAA 4OW8A 1PMVA 1S9JA 2O3PA 5HX6A 1BMKA 2XP2A 4J8MA 5K9IA 5TT7A 5HTCA 3K54A 2B4SB 2XB7A 2JLDA 4FZ6A 4MWHA 5T68A 5L2WA 4JIKA 2CKQA 4UMQA 3DV3A 4RX5A 3O17A 4GVAA 1UNHA 2QC6A 2UW7A 3PP0A 5IISA 1F0QA 2W1GA 4U6RA 5TO8A 1JOWB 4MK0A 3EN4A 3D83A 3LXLA 1OIYA 4ID7A 1YRPA 4CCUA 5L3AA 4YC6A 4WBBB 3UIUA 1ZAOA 2VTLA 4Y8DA 4BDKA 1BUHA 4A4OA 2YM8A 5HIDA 1I09A 4O7RA 4Z3VA 2VNYA 2WFYA 5FEDA 4NM7A 3SD0A 5CXHA 3VS1A 4FVRA 5IA2A 2QO7A 2GDOA 3LKMA 3HV6A 4LRKA 4FTTA 2XEZA 2X9EA 3R21A 3HP5A 4L45A 4C3RA 4CMUA 3Q04A 3ZLYA 4C62A 4OUCA 3TEIA 4N70A 3D0EA 3PLAE 5E92A 3ENMA 4C36A 4ENYA 3E92A 2H6DA 3SDJA 2ITPA 2PY3A 3R7GA 4FSTA 4C37A 1YHWA 1M52A 1HOWA 3OUNB 4L3LA 3E7VA 4D2TA 4X7QA 2B55A 4TN6A 3VRZA 4CTBA 3PPZA 4E93A 4FEWA 3GENA 4ANBA 4CKRA 4DTKA 5HNIX 3LFCA 2J50A 5M06A 3VUMA 5IQDA 2R3NA 4F63A 5C1QB 3LQ3A 3SC1A 4HVHA 2E9OA 4UYAA 2VWYA 2W0JA 5KZIA 5ACBC 4EQCA 5H3QA 4B7TA 2R64A 3I60A 4M69A 1YWVA 2VO7A 3CJFA 3OZ6A 4M66A 4HVDA 5AEPA 3BHUA 4OAUC 5CI6A 4ACHA 4IX5A 2XNOA 4HGSA 2FVDA 2HW6A 1Q97A 3P79A 3RKBA 4IJ9A 5CAOA 5KZ0A 2OIDA 4BI2A 4H1JA 2FSOX 2XIYA 3R1YA 4M7IA 3KRLA 3FL5A 4EOKA 5CAVA 4CLIA 3JR1A 3W32A 4L8MA 4KBAA 5LARA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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