5BUEA

Erk2 complexed with n-benzylpyridone tetrahydroazaindazole
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
348
structure length
329
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVATRWYRAPEIMLNTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ligand efficient tetrahydro-pyrazolopyridines as inhibitors of ERK2 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 329
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bueA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bueA01
4S30A 1Q41A 3KXXA 3GOKA 3OXIA 3CKWA 3OUNB 3ZDIA 3MIAA 2CGXA 2IW6A 3GU6A 4DFUA 3PJCA 1PXOA 2F7XE 3OEZA 3NW6A 2W1GA 4IADA 3VF9A 3GU7A 4H1MA 3SAYA 5J1VA 4FICA 4NJDA 2W4JA 4HGSA 4YNEA 5KMMA 4O7RA 4ZOGA 2JDSA 4MXOA 4W9WA 4K77A 2JD5A 2YZAA 5IUIA 4AAAA 3LCOA 3U4WA 4BDIA 4QP6A 4M69B 4GYGA 4DAWA 3UIMA 1PXMA 4LGDA 4HVSA 4BBEA 3GP0A 4IH8A 3GXLA 4K1BA 5HE0A 2H9VA 1TQIA 1SZMA 3SG8A 3JYAA 4FYNA 2EU9A 5JSMA 1O9UA 4TRLA 3EZVA 1W0XC 2VWVA 3BI6A 3QCQA 3R7IA 3N9XA 4LL0A 2O0UA 4FNZA 2C1BA 2ITOA 3HMPA 3IDCA 3QTSA 3E8CA 4TYIA 3LFSA 4WT6A 1RW8A 1XO2B 5E90A 4YJPA 3JR1A 3IW8A 3PTGA 4BZDA 3UIXA 2IVUA 4TWCA 5A4EA 5LOHA 3FHRA 3D5WA 4G9CA 2BTSA 2GQRA 3RALA 2ZM1A 3IQ7A 4L01A 3FLQA 3QD3A 3MJ1A 3GC9A 2YIYA 5DR6A 3FMKA 4TNBA 4F09A 2XNOA 3Q2JA 3NIEA 2YCQA 4TKSA 3E3BX 2VWXA 1MRVA 2W1EA 4D2TA 5EDQA 4YJUA 1RQQA 4QMLA 5AFVA 4S32A 4DCEA 3QRUA 4AGWA 3LQ3A 1CTPE 1MQ4A 4Y46A 5CF6A 3R28A 4F9CA 3A60A 5IEVA 3VBXA 4IAZA 4ZTQA 5HTIA 2YJRA 1NT2A 1TKIA 3O71A 2WIPA 4HCVA 3AT2A 1Y57A 3QF9A 5C8KA 4BCQA 2VWYA 4RX5A 3PVUA 3Q96A 4N0SA 2ZM3A 2ZV8A 4ZEGA 3PSDA 5IQHA 4D9UA 3OT8A 4M12A 4TYEA 5FQDC 5K3YA 3R7YA 3VS2A 2W1FA 3ZO2A 4EWHA 2DQ7X 3C50A 4FV8A 4RGJA 3Q53A 2W0JA 3ATSA 3PXKA 4R5YA 4I6QA 2R7IA 3KB7A 5D10A 3S3IA 5GIOE 2C3KA 3M2WA 2ZMDA 3FZRA 1H07A 4OT6A 3TN8A 1YDRE 4YZCA 4YTIA 3SLSA 2R3NA 3EQFA 3PXZA 4AA4A 3UDBA 5HLWA 4YUQA 2J4ZA 4UZDA 2ZM4A 1GIHA 4F6WA 4FV2A 4ERWA 5KO1A 2PVFA 3RHKA 5J9LA 4PDYA 1IA9A 1PKGA 3UBDA 3RMFA 3ORKA 4YBKA 4CV9A 3L8SA 4F0IA 1JQHA 2W7XA 4O38A 4FTIA 5C1QB 4NEUA 1XKKA 4ITJA 4CFUA 2NRUA 4OTFA 4C4HA 2W4KA 2VU3A 1F3MC 2J0KA 2P0CA 3Q52A 1YXTA 2O63A 4HJOA 3HA6A 3MY5A 4BHNA 3TJCA 2VTPA 2NNWB 1ND4A 3ORXA 4J95A 5ACBC 2RIOA 4NSTA 4KBKA 3K3IA 2QCSA 1J1BA 3BQRA 3NX8A 3QHRA 5K0KA 5E8ZA 3EQDA 3IG7A 3A7IA 4F1OA 5CEPA 3D2KA 3QRTA 4G5PA 4DITA 3BPRA 5TF9A 4YR8A 2Q0NA 4FT0A 3V3VA 4NT4A 5DT0A 4KIOA 4ZMEA 4ZZMA 5JQ8A 2PWLA 3BHTA 4KABA 4GT5A 4M66A 2Z8CA 4O84A 3L8VA 3R73A 3LXLA 5DT4A 3HV5A 4L52A 3ZUTA 1SM2A 4ZP5A 3LM0A 2V7AA 3GFWA 2Y4IC 3H4JA 4YSMA 2C3LA 4FODA 5EH0A 4FZFB 2QVSE 3AD6A 2J5EA 3LJ0A 3NSZA 3OWJA 4AZTA 5JKGA 4H58A 3HZTA 2JBOA 1KOBA 3QBNA 5LARA 4XOYA 4BCKA 1WBPA 3LFAA 4IWDA 3UOLA 3TNPC 1CKPA 3GC7A 4WG5A 1DAYA 2O65A 2QU5A 2IZTA 2UZOA 2PVKA 3SRVB 3UZPA 4IZ7A 4G6NA 5EHOA 2WTJA 4RBLA 4F0FA 1Q8YA 2IZUA 2YIRA 4JOAA 5CU6A 3IW7A 2VD5A 3IGOA 3Q60A 4JI9A 3LXPA 4XRJA 4BDEA 2X9FA 4FOCA 2JFMA 2XIXA 3CS9A 3DBFA 4R7HA 5FBOA 3TV7A 1V0BA 2B54A 2YHVA 3RVGA 3ZYAA 4CFWA 4EK8A 2YA9A 5AUZA 4YTHA 2CKPA 2UZVA 4EOIA 4NJ3A 2HWOA 3KK9A 3FL4A 4KNBA 4UMPA 1B6CB 4AT3A 4IANA 4BCOA 3GU8A 4MH7A 4EZ3A 2JKOA 2R3PA 3V01A 4JQ8A 4ENXA 3UJGA 3KXMA 2W17A 1FMKA 4I6BA 1YOLA 2C3JA 3TNQB 4EOMA 1JSVA 2CMWA 3MW1A 1PMUA 2R7BA 2ZAZA 4GT4A 4U41A 5CASA 2BHEA 2YAAA 4L44A 4RRVA 4XG4A 3QD0A 3BE2A 2X81A 5HTCA 4FUYA 2Z7QA 5CEMA 2CGVA 3FKLA 2P3GX 3BIZA 3K3JA 4APPA 3JY0A 1IEPA 5IF1A 1OM1A 2HZ4A 3ZEWA 4O0YA 4IFCA 4MNEB 2Z7SA 4I4FA 5EYMA 2PMNX 2CDZA 4LV5A 4F1TA 5IA0A 2ITYA 4XV2A 5CX9A 5J8IA 3QC9A 1SNUA 5LVNA 1XHAA 3QKLA 3VHKA 3AGLA 5FTOA 4DEHA 5IDNA 5L2SA 3SGCA 2VN9A 3MFTA 2B9JA 5C03A 4LGHA 5A9UA 2FH9A 4D58A 3M42A 1H24A 4Z16A 1I44A 2BIYA 5LQFA 3TUCA 5HE2A 2VWUA 2UZLA 4FTMA 3G0EA 4YZNA 2UZBA 2VX0A 3EQIA 2Y6OA 1P14A 4YU2A 3E8NA 3PVGA 4Y95A 5F9EA 1PYXA 2PY3A 3FI4A 3ZSIA 4RIXA 2JAVA 2VTTA 3OHTA 3P9JA 2HZIA 4G2FA 4U3ZA 2BILB 3LW0A 5ANIA 5EHLA 5M55A 2VWZA 4GV1A 2GSFA 1UA2A 4IDTA 2V0DA 4XEYA 2IW9A 5A4TA 3HECA 3T9IA 3ZUVA 4EHGA 2J0IA 3NCZA 2BALA 5J87A 3VUGA 3DFAA 3VW8A 4R5SA 5AR4A 4O7ZA 3DDPA 4O21A 1WBWA 4QO9A 3A7FA 4RJ3A 4F63A 3WYYA 5LVPA 2Z7RA 4ACDA 2YDKA 3QD2B 4BDAA 5HI2A 2VTHA 2PK9A 2R64A 4MXCA 5FTGA 4X2FA 5IQEA 4JXFA 5DEWA 2ITWA 1ZOEA 3DTWA 4U5JA 3AMAA 4FG8A 1FVTA 4R6VA 2F2CB 4XHKB 4C4EA 1KE5A 4O7VA 3ENMA 3TNIA 1VYZA 2NRYA 4USDA 1ZMVA 3ZC5A 4F1MA 3LAUA 1XBBA 4KSQA 2WQMA 3F69A 2BFYA 4N6YA 3QTIA 4PNKA 4U81A 2G1TA 2GFCA 3HV3A 4EBWA 2HXLA 2OW3A 3ZLXA 3O8TA 3LFQA 3AC3A 4IVDA 4B8LA 2UW3A 3ALOA 1OPKA 2G01A 3PZEA 5JZJA 3ACKA 3HRBA 4GG7A 2VUWA 5F4NA 2VX3A 5IEXA 4V01A 3RWQA 3K54A 2QNJA 3VUDA 3ANRA 4QP3A 3D7TB 3ORZA 5CT7A 4EEVA 5DI1A 4FVPA 4K8AA 4B9DA 4DH8A 4RJ6A 3L9MA 2OFVA 5A46A 3MA3A 3BGQA 3BYVA 4MXZA 1H01A 5CALA 2B7AA 3EQRA 4PMTA 4AACA 2XK3A 4I5HA 3VVHA 5HIBA 4G9RA 4C4GA 2WAJA 3KULA 3RBWA 3W2CA 3WARA 2YAKA 4F6SA 4FKTA 5HE3A 3UNZA 4X3FA 2QHMA 5EHYA 4BGHA 1YOMA 3NAYA 3WI6A 4O86A 4RWKA 3ZXTA 1UKHA 1WBSA 4ACHA 5ETCA 4BCFA 3O96A 4O7LA 4TYHA 3CGFA 2W05A 4AFEA 3TZ8A 4Z55A 2OO8X 2XKFA 4YPSA 4EKLA 5FLFA 1YKRA 3FLNC 3P08A 4E5WA 2YCSA 2BFXA 2J0MB 2HAKA 2WB8A 2YDIA 3QQUA 4C4IA 3DB6A 3UQGA 3BQCA 3TUDA 2HZ0A 4E6CA 3OS3A 4FKSA 5AP3A 2BCJA 4OBPA 3RPVA 5AUVA 1Y6BA 2WQEA 4EK3A 2WTCA 3QZIA 4XOZA 5HKMA 3EN5A 4FTUA 2OH0E 3O8UA 3C13A 3NUSA 3VBWA 4AA0A 4F7SA 1KOAA 2VO0A 3M1SA 1H08A 4DFBA 3CQEA 4RVLA 1XH7A 3GEQA 3R1QA 1H00A 5CVHA 4G3GA 5EFQA 3ZC6A 4HVDA 4FC0A 3VS7A 2PUIA 3PDTA 4KA3A 3W2OA 5CSHA 4PMMA 4C38A 2V5QA 3CTHA 2Y0AA 3UYSA 2FSTX 3UYTA 4YJTA 2IZRA 2QOIA 2OZOA 3COHA 4LQMA 2ZMCA 5JH6A 4ORKA 4BTMA 3KRJA 4D2RA 4Q9SA 4RX9A 2BPMA 4UXQA 5HG8A 5EM7A 4XYFA 3AC8A 4KIPA 1WBOA 4MD9E 1FBNA 2ZDUA 2BDFA 1KV2A 3TDWA 2IJMA 4V05A 3VN9A 5DH3A 4BI2A 5IEYA 3VUMA 2XEZA 4LYNA 4MBJA 3RAWA 3VO3A 4OAUC 1M7NA 1ZMUA 3ALNA 4AWIA 4ACGA 4NTTA 2QLQA 4NM5A 1OIRA 3AC4A 3TNHA 2QR7A 3KU2A 4PTGA 3DFCB 3QYWA 2JDOA 3OWLA 4WRSA 4EBVA 3I79A 2C6DA 2B52A 3P4KA 1KE9A 3PY0A 5FEEA 5J5SA 3RAIA 1WVYA 2CLQA 3P78A 2YM6A 3CXWA 4G3DA 4U43A 3TJDA 4DEGA 3A61A 1M17A 4OTWA 2PZPA 2OGVA 4NM0A 1HCLA 3RI1A 1ZYSA 3HV6A 2AUHA 4L43A 2R3GA 4F99A 1JSTA 3MH3A 4NUSA 4IJ9A 3ZDUA 1YOJA 1AGWA 5FXSA 4EWQA 4UMUA 3C7QA 4ZSEA 4CKIA 4Q2AA 3QU0A 5BYYA 3DNDA 5KBQA 4IZ5A 3JVRA 4FIIA 4EZ5A 4CKJA 4GFMA 4EH7A 4AZWA 4MXAA 5HX6A 5IQGA 1ZY4A 5BMSA 5CF5A 3MY1A 4D5KA 4HVIA 4DTAA 2YACA 5K0XA 2XCKA 3A99A 4O2PA 2VO6A 4LRJA 1Q24A 1GY3A 3LFNA 4A9YA 2C5OA 3NYXA 5BYZA 5CXZA 5LMKA 3EYGA 4FIJA 1OB3A 3V04A 2ETMA 2X2LA 3U55A 1FMOE 3LM5A 1HCKA 2P33A 3OTVA 3OW3A 2XH5A 3F61A 4I24A 5HNGA 2PUPA 4WNPA 4E73A 4EOKA 3G0FA 3E93A 4FL1A 4FYOA 1OIYA 3EKNA 4X3FC 4FKPA 2XM8A 5GZ8A 3QWKA 3KA0A 3UO4A 1MRUA 5CENA 4RQKA 2FA2A 3AQVA 4J98A 2FSLX 1A48A 4FKGA 3NRMA 1TQMA 3GFEA 4FV3A 3ZZWA 1PMNA 3UQFA 3H10A 1Z57A 5GZ9A 3RM7A 4AA5A 4C37A 2GNGA 2IVSA 4YBJA 4EZ7A 5K5NA 4FEWA 4O0WA 4O7YA 3Q4TA 4O27B 3I1AA 3KRWA 3AMBA 5AV2A 4R77A 3I7CA 2YIQA 3G51A 3GGFA 5HE1A 4C35A 4BIEA 2ZV9A 1G3NA 3VS1A 3TL8A 5IQAA 1YQJA 3CD3A 2UV2A 4DTKA 4AZEA 3V8TA 4NYEA 4MKCA 5HTBA 2GTMA 5DRDA 1OKYA 3PXRA 2W1IA 2JDTA 2R3KA 2VO7A 1KV1A 1JBPE 5HO8A 4D55A 2NP8A 5KMOA 2PUNA 5T3QA 4R78A 4M8TA 4ZAUA 3C4EA 5JRSA 3QZGA 4OBQA 3FY0A 2BROA 1QPJA 2XK9A 1GOLA 3HYHA 4IX4A 4QYGA 5I9UA 5HNIX 3KQ7A 1OL6A 1WZYA 4I1ZA 4JDHA 4QMQA 5JQ5A 5KHWA 3EQCA 3GU4A 3EH9A 3GT8A 3HA8A 3IOPA 1W83A 3MIYA 4RC2A 3Q4ZA 4U44A 4V0GA 3VS0A 4JDIA 4AZVA 3ZLSA 3CLYA 4ZY5A 1JKSA 3G9LX 4K2RA 2R3JA 1LPUA 3LXKA 4G5JA 4S34A 3OOMA 5AM7A 1E1XA 3BKBA 3KF7A 3C4XA 4P90A 4R3RA 1PY5A 2HXQA 2LAVA 3MS9A 3VJNA 4CCUA 4D0WA 3CPBA 3EIDA 4GJ2A 4RLLA 3EN9A 5HD7A 4JX7A 3R00A 4XH6A 4FGBA 2XK7A 3UO5A 1FVRA 4PRJA 4F9WA 5IMXA 1XH5A 3QXPA 5AP6A 2OXXA 3K2LA 3W2PA 4UX9A 4O7TA 3ORPA 3BU3A 4CD0A 4O0VA 3VW6A 3FKOA 2JIIA 4S33A 3BGZA 4TW9A 2X7GA 2UZEA 3H0YA 3H9FA 4KRCA 4U7ZA 4DGNA 4I22A 5TKDA 5AV1A 5HBEA 5EYCA 2BVAA 4XG3A 1GIJA 4GW8A 4GRBA 4M68A 5DHJA 3A2CA 4FTNA 3QTWA 4I6FA 1OL2A 2BIKB 5KE0A 5E8YA 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 2QR8 A;  2YJS A;  5GJD A;  2X6D A;  4AGC A;  3LHJ A;  2HY0 A;  4AU8 A;  4CGA A;  2RSV A;  4KIK B;  3DAK A;  4LOP A;  2C0I A;  5JFV A;  4DC2 A;  4FV0 A;  1CM8 A;  2W1C A;  4G31 A;  3S4Q A;  5AX9 A;  4H39 A;  2C6I A;  3P7A A;  1MQB A;  2PVN A;  4FKO A;  3QTU A;  5I3O A;  3QXO A;  4LOO A;  3ORO A;  2XIZ A;  4BYJ A;  3KN5 A;  4LL5 A;  4DFY A;  2BKK A;  2QC6 A;  5BVF A;  3ZO1 A;  5CEK A;  5J7B A;  4CVA A;  4YC6 A;  4YTC A;  4EL9 A;  2CHL A;  2WMT A;  4DGG A;  1JAM A;  2ITN A;  4I0R A;  5CQW A;  5FED A;  3ZBF A;  4BWP A;  5IME A;  4ZSJ A;  2XJ0 A;  4WBB B;  1S9J A;  2YLF A;  4WBO A;  2WXV A;  3HRF A;  5IDP A;  3ZSH A;  3O7L B;  3SVV A;  4FT9 A;  5IQF A;  3NNW A;  3QGY A;  2R5T A;  4M15 A;  4XJ0 A;  5EYD A;  4JQ7 A;  2YM4 A;  4RFY A;  4EH3 A;  2RKU A;  4WRG A;  5G6V A;  4DA5 A;  1OIT A;  3NLB A;  3EL7 A;  1GJO A;  2XIY A;  4FEU A;  5F20 A;  1XQZ A;  5CEO A;  2BAJ A;  3ODZ X;  4O22 A;  4H3P A;  3C5I A;  3THB A;  4UBA A;  3A7G A;  5CLP A;  2YAB A;  4CSV A;  5IA1 A;  4I20 A;  3QKM A;  3TIY A;  3FI3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4S30 A;  1Q41 A;  3KXX A;  3GOK A;  3OXI A;  3CKW A;  3OUN B;  3ZDI A;  3MIA A;  2CGX A;  2IW6 A;  3GU6 A;  4DFU A;  3PJC A;  1PXO A;  2F7X E;  3OEZ A;  3NW6 A;  2W1G A;  4IAD A;  3VF9 A;  3GU7 A;  4H1M A;  3SAY A;  5J1V A;  4FIC A;  4NJD A;  2W4J A;  4HGS A;  4YNE A;  5KMM A;  4O7R A;  4ZOG A;  2JDS A;  4MXO A;  4W9W A;  4K77 A;  2JD5 A;  2YZA A;  5IUI A;  4AAA A;  3LCO A;  3U4W A;  4BDI A;  4QP6 A;  4M69 B;  4GYG A;  4DAW A;  3UIM A;  1PXM A;  4LGD A;  4HVS A;  4BBE A;  3GP0 A;  4IH8 A;  3GXL A;  4K1B A;  5HE0 A;  2H9V A;  1TQI A;  1SZM A;  3SG8 A;  3JYA A;  4FYN A;  2EU9 A;  5JSM A;  1O9U A;  4TRL A;  3EZV A;  1W0X C;  2VWV A;  3BI6 A;  3QCQ A;  3R7I A;  3N9X A;  4LL0 A;  2O0U A;  4FNZ A;  3KIO C;  2C1B A;  2ITO A;  3HMP A;  3IDC A;  3QTS A;  3E8C A;  4TYI A;  3LFS A;  4WT6 A;  1RW8 A;  1XO2 B;  5E90 A;  4YJP A;  3JR1 A;  3IW8 A;  3PTG A;  4BZD A;  3UIX A;  2IVU A;  4TWC A;  5A4E A;  5LOH A;  3FHR A;  3D5W A;  4G9C A;  2BTS A;  2GQR A;  3RAL A;  2ZM1 A;  3IQ7 A;  4L01 A;  3FLQ A;  3QD3 A; 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