5BVDA

Tetrahydropyrrolo-diazepenones as inhibitors of erk2 kinase
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
350
structure length
330
Chain Sequence
AGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVTRWYRAPEIMLNTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tetrahydropyrrolo-diazepenones as inhibitors of ERK2 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 330
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bvdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bvdA01
2VTQA 5JGAA 5HG9A 3CSVA 4JBPA 2B55A 2HENA 4FG9A 1UVRA 4IFCA 4IBMA 5AP0A 4O0UA 3HUCA 3OY1A 3NNUA 1H1PA 2XK7A 3OZ6A 4PY1A 2W99B 4UWYA 4HCUA 2GQSA 2ITQA 4DC2A 3MVLA 4XCUA 2UW6A 4J52A 3VBWA 5ANKA 3C5IA 3CJGA 3MPMA 3TZ9A 4C2VA 1W83A 2WU6A 3RALA 1FQ1B 1ZXEA 3R6XA 4IXPA 3I7BA 3PG1A 3ZZEA 4FKUA 2QO2A 5DA3A 4LQMA 3ROYA 1LR4A 4XP2A 5EW9A 1ATPE 1E1XA 4G3GA 3RHKA 2PMOX 1IA9A 1IEPA 1F5QA 3BHHA 4MVFA 2F57A 3LXKA 4QMPA 4ZY4A 3GQLA 1ZOGA 3R2YA 5A3XA 4ZSAA 2VGOA 3ORTA 3ZUUA 3KGAA 5L2IA 3G9LX 3DDPA 5AP1A 5BMMA 3OWJA 4D9UA 5IUHA 4RIYA 4GS6A 4AN9A 3FZSA 4U40A 5IA0A 3CCNA 5AUXA 4LRMA 5CI6A 5HVYA 2EXMA 3PVWA 2NNWB 4D2WA 2UVZA 1G5SA 5AR2A 2OJIA 4YZBA 1NT2A 4ORKA 3A61A 5CTPA 3R8MA 3W2OA 3E8EA 3A7HA 1ZMWA 3ZS5A 3PPZA 5C26A 2CNUA 4KNBA 4FKGA 3WZDA 4CLJA 2HW7A 3V6SA 1U54A 4R6VA 2WQOA 3DZOA 4G5PA 2Y7JA 5CZIA 4QMMA 3UQGA 4AA0A 3QQJA 3WZEA 2CKOA 1SVGA 3UVQA 4L43A 4LG4A 5J1WA 3R7GA 2UZOA 4QMWA 4CCUA 4UWCA 3VN9A 3PWDA 3BCEA 2UV2A 4QMSA 4YR8A 4FG8A 4GV1A 3QTRA 2VNWA 2WEVA 2R7BA 3QTQA 4S31A 4BZNA 4L01A 3RVGA 4RVTA 3LCSA 2FUMA 4UEUA 2QCSA 4FTQA 3KMUA 2VTAA 3ULIA 3DQWA 4IIRA 3EHAA 3EQPA 1XKKA 3DJ7A 4LRKA 3RPRA 4FEXA 4O84A 4L00A 3V51A 4EH2A 2PMIA 1H0VA 5EYKA 5AM7A 3P4KA 2YHVA 2A2AA 3NDMA 4GYGA 4XOYA 4BGQA 4EWHA 3L9LA 2X2MA 2R64A 4ZSGA 3KB7A 4OTFA 4GT5A 5GZ9A 3R1YA 3DK3A 5DRDA 2WB8A 4AQCA 3DQXA 1OL7A 3R8ZA 4YBJA 3ZDUA 3ZC5A 4BKZA 1J1BA 3CLYA 4QTAA 2VTOA 3F3UA 2GHLA 4WIHA 3ZZWA 4QT1A 3HMNA 1V0PA 5CNNA 1YXVA 2Z8CA 2W1FA 3PZHA 4MEDA 4EOJA 3KU2A 4TZRA 4C61A 3F82A 4BRXA 4O7YA 4QTCA 3PVBA 4OUCA 4O7LA 2QOQA 4L3LA 2J51A 4GU6A 1O9UA 2YJRA 1VYZA 5HBEA 2C0TA 3FZOA 1XH5A 1PHKA 3BYVA 3MB7A 4Z9LA 1BKXA 4E1ZA 3U4WA 1J1CA 2OXDA 4QTDA 4M8TA 1SM2A 1MUOA 2OICA 2X7OA 3ORZA 3WOWA 3VRYA 3MH2A 3PA5A 4OBQA 4UZHA 4MKCA 5ETIA 5CEMA 1UNLA 3PJ8A 4GUEA 5GJGA 4FV0A 3SOAA 4TWCA 2RF9A 5T6KA 5HBHA 5GIOE 3VUHA 3N4VA 2NP8A 2V7AA 3KA0A 2I1MA 4HGTA 5DR2A 5FWKK 3KVWA 2BFXA 4BDFA 1YOLA 4O0RA 1ZYDA 2IZRA 3PE1A 5AP3A 3BZ3A 5HICA 3QCSA 3LJ0A 3UMWA 3WI6A 4A4OA 3ZRKA 2CGXA 4OTRA 1IASA 2BFYA 4D55A 4F9CA 3F69A 3RZFA 4KRDA 5GZ8A 4O7VA 1BUHA 1M2RA 4EH9A 3LKMA 1H0WA 3IDBA 2VO0A 3PLSA 2O5KA 3QRKA 4EJNA 4L46A 2VWBA 2ZDTA 4RIOA 3SG9A 5E1SA 3ITZA 4ANOA 1T46A 3OCGA 3EYGA 3FXWA 3QRUA 4Q9SA 3AC2A 4ZSJA 3FPQA 3VS4A 4BCOA 4CMTA 2PVFA 2BHHA 2H9VA 5IH6A 2E9OA 2VTMA 3SX9A 4JDJA 3FLYA 1TQPA 1GZKA 4GFGA 2CNVA 3LLTA 4F9AA 4ANMA 3VS2A 4F08A 2XB7A 4FKPA 4M7IA 3JVRA 3UIUA 1YXTA 4EOIA 2XH5A 3QZFA 3ZRLA 3LPBA 3PPJA 4JAJA 3ZO2A 3NUSA 4IZAA 4O96A 5AV0A 3C13A 5JK3A 3B2WA 2UZTA 3E92A 4MTAA 5BVKA 4D58A 4IFGA 5CEKA 4M15A 2WZJA 4WRSA 4D0WA 4KSQA 3L8VA 2YIWA 5E8YA 3CXWA 2QI8A 3OF0A 5E90A 3E8DA 4R3CA 4QMTA 4XS2A 4TTHB 3D7TB 4W4VA 3QL8A 1FVRA 3TXOA 4AZTA 2A1AB 3A62A 3H9OA 3FZRA 4JXFA 4TYJA 4XV2A 5K4IA 3NSZA 4CLIA 4GW8A 4UMTA 2VWUA 3HRCA 3LM0A 4J99A 3TV7A 4C35A 3UGCA 4ZY6A 1V0OA 4GG5A 3NYNA 5H3QA 3UOLA 4ZS4A 4YC6A 3KY2A 3OXZA 4FL2A 1KE9A 3QGYA 3Q53A 4N6ZA 4X2FA 4BL1A 5IQBA 3MY0A 2W1CA 1Q24A 4R7IA 2WIPA 2XIXA 3GCQA 4HVGA 5AR7A 4R7BA 5AR5A 3WYXA 4ACGA 4I24A 4Y5HA 3W2PA 3R8PA 5DRBA 4I3ZA 1ZOHA 4EQUA 5CASA 3GQIA 3UP2A 3KXGA 3R7UA 2J0LA 3BBWA 4GK4A 1TQMA 2X6DA 2I0YA 3N51A 4GH2A 5CF5A 4EHVA 4QYHA 4BGGA 2FSLX 2P33A 5K5NA 3DAEA 4CGAA 4U41A 4ALWA 4AE9A 4U6RA 3BX5A 2IG7A 4O7ZA 3R8LA 4Z55A 5GNKA 1DAWA 3RAHA 3OMVA 1H8FA 4PRJA 4FUXA 4PPCA 3CKWA 3CP9A 5AEPA 5GIPE 2HXLA 3GU4A 4G9RA 5AR8A 3D5UA 5M08A 3KFAA 1PXMA 3RM6A 4FT7A 5HE2A 3PJCA 2JKQA 2IJMA 4BBFA 2QD9A 4NW6A 3GOKA 1AD5A 1YOJA 4X2JA 4E6DA 4U42A 2XRUA 4IWPA 3UC3A 3C0GA 5L6OA 3UZTA 5C27A 4KSPA 1YHWA 4QNAA 1WVWA 1XO2B 3DKFA 4HGEA 4AXAA 5CF6A 4WSQA 4E3CA 2BALA 3PXQA 5DR9A 3SC1A 4CFUA 2UW3A 3COMA 2OFVA 4YBKA 5IA2A 1GZ8A 1PMUA 3GXLA 3AT3A 4AGWA 3CQWA 4BI1A 2Q0BA 2WTDA 1YRPA 3THBA 4F70A 3DXPA 2JDRA 2X2KA 4H58A 4JVGA 4K9YA 1QMZA 2NRUA 3Q4TA 4NM3A 4F6UA 2QG5A 3OWPA 5CYIA 4A9TA 4TY1A 4AOTA 4N57A 3CJFA 5FXRA 3LIJA 1YDTE 3POOA 2R7IA 4X2GA 4PPBA 2JEDA 3SQQA 3C4EA 4LL0A 3IW4A 4XV1A 3ROCA 5IG1A 3IOKA 2X8DA 5CT0A 4CT2A 2FYSA 4YJRA 3FMJA 2WTVA 4UB7A 3M11A 3HNGA 3IECA 2PHKA 3PXFA 4AW0A 2IVUA 5BYYA 4NU1A 5LJJA 3UODA 2JGZA 4DFUA 4XP0A 1ZLTA 4EZ5A 4F9WA 1H26A 4IW0A 3UG1A 3PVGA 4NCTC 2YDKA 2ZJWA 5EHOA 3ZXTA 4D4YA 5EKNA 4FV9A 4JX7A 3UOHA 3DAKA 2PULA 2ITYA 2VO3A 3LXLA 1Y91A 4EQCA 3PA3A 3IQ7A 3WBLA 2WD1A 4PDYA 5M53A 2WAJA 3O51A 4RFYA 4WG5A 3E87A 3NUNA 4D2VA 1PRYA 3U9CA 4EWQA 4JL9A 1VEBA 2RGPA 5FEQA 4A9YA 2WOUA 1YDSE 4DH3A 3FC2A 5F94A 3VC4A 3AGLA 3F3TA 4WSYA 4E6CA 2GNIA 2UZLA 1LEZA 1URWA 4WBOA 3ALOA 5FTGA 3ZYAA 3C51A 3ORKA 4IM3A 4EH8A 5FLFA 4D28A 2ZV7A 4HOKA 3BIZA 4Q5EA 3VBVA 2A4LA 4ANBA 1PMNA 3BQCA 1RDQE 2VWIA 3GCVA 2YM6A 2X39A 4KKEA 3EYHA 3U9NA 3EQRA 5BVFA 4N70A 1M7NA 2PK9A 4FICA 4HYSA 3TN8A 5A4TA 2R3NA 2F4JA 2OIDA 5KBRA 3PIYA 2P0CA 2XJ2A 2Z7RA 5AFVA 2VO6A 4S34A 4X6QC 5CU0A 2UZBA 4FSNA 4MF0A 3E62A 3CTHA 2W06A 1UKHA 3WF9A 2HK5A 3QU0A 3LFAA 4YC3A 5BQ0A 3RTPA 4QTEA 4FTIA 2YABA 4ZOGA 4EOPA 2W9ZB 3ODYX 4KD1A 3RNYA 3KULA 2WTKB 2C5VA 3MY5A 3QCQA 3QTIA 5TT7A 5ICPA 3RMFA 4NZWB 2BVAA 3KXZA 3W8LA 4WT6A 1KE5A 1OKWA 5KCVA 3Q60A 5JFVA 2UW8A 4KIQA 3BYSA 2R9SA 3ODZX 4USDA 4YTIA 4Z7GA 2PTKA 3GCPA 4KIKA 3IO7A 2XJ0A 3R7VA 3R8VA 3UC4A 4UN0C 4UV0A 4TYGA 4UXQA 4DG3E 5HBJA 3KVXA 4FTCA 4RJ6A 2XBAA 4PDPA 4XV3A 4FZ7A 4IVDA 2VX1A 5EM8A 3LFBA 5CSPA 4EC8A 5JSMA 3PRIA 3LFEA 3D14A 4FR4A 5TF9A 3ZLXA 2CN5A 3LCTA 5HE1A 5FUTA 2QOBA 4JR7A 4O86A 1OL1A 4L8MA 5EG3A 3F5XA 3H0ZA 3UO6A 1YVJA 3PXRA 1AGWA 3TIYA 4FKOA 4W4YA 4OR5A 2V5QA 3P9JA 4DGNA 3HA6A 3NW7A 3EN5A 3P7CA 3SXFA 3QQGA 3VUDA 5E91A 2PZYA 3MDYA 3G15A 3H9RA 5DT3A 5KMKA 3PSBA 4A4LA 3NUPA 4FEVA 1Q97A 3K2LA 1SNUA 4LFIA 5F20A 4CXAA 4FGRA 3ZM4A 4O7SA 4ERWA 3I6WA 2CJMA 2OZAB 4HCTA 2XIRA 2WTKC 1WCCA 4XYFA 4IAKA 4L3JA 4BDEA 5AV4A 1WAKA 1PY5A 1I44A 4BDAA 3GNIB 3FWQA 5J7BA 5IQCA 4ZTHA 1WVYA 3BU5A 4EOLA 5JH6A 1JKKA 3MTFA 4MK0A 3P08A 5GJDA 3Q4UA 5E9EA 1A48A 3MN3A 3GFWA 2PL0A 2QOHA 2B9FA 3MH0A 4CNHA 3F66A 1ND4A 4NM7A 1BL6A 5AP7A 3DBFA 3ZXZA 4AX8A 4FF8A 3QGWA 3ZOSA 4QNYA 5FDXA 4AN3A 3OUNB 4TWOA 4AF3A 4L45A 1Z9XA 3ORPA 4QYYA 3D5WA 4PTEA 3P0MA 1G3NA 2R0IA 1J7IA 2LGCA 3TTIA 3HDNA 3OOMA 4IE9A 4AW5A 4F99A 4AN2A 3T9IA 4I0RA 5KE0A 4I5HA 4XMOA 4RFZA 4EHEA 4BYIA 4K0YA 2ZMCA 3Q5IA 3ETAA 3VUGA 3SRVB 3GC9A 2PZRA 3AD5A 4TPTA 4KKGA 5IA1A 3TUCA 2PUIA 3FMHA 3NUAA 2PVMA 1I09A 4MQ1A 1R3CA 4AACA 4C3FA 5LOHA 5IZFA 1XHAA 2G15A 3DZQA 5I3OA 1J3HA 5CXHA 3M1SA 2IVTA 2BAKA 2PVJA 4DT8A 1VZOA 3FKNA 1YHVA 2WMTA 1H1QA 1P14A 5HX6A 2JKOA 4QQTA 3AC1A 5AX9A 3SHEA 4O7TA 4ZTNA 4D1SA 3LQ3A 4PTCA 3OHTA 3FMNA 3P86A 4FV6A 2XCHA 5IDNA 3NAYA 2W1HA 3MVJA 4R1VA 5C8NA 4O2ZA 2ESMA 1P4FA 3QQUA 4CFVA 4DGMA 4RJ7A 4QYEA 2XK6A 3PY0A 3FLQA 1JAMA 2R3MA 2W5HA 3R00A 4O83A 1PW2A 4D2TA 2FB8A 2IPXA 4E7WA 3ID6C 4C7TA 3GI3A 2EXCX 2RFNA 2WTJA 4NM5A 4FNWA 4WOVA 3NZ0A 3UMXA 3R63A 3LMIA 2ITUA 4ZTMA 4ACMA 4FA2A 4ZMFA 3WE8A 4DT9A 3KKVA 4YGAA 5HO6A 4C02A 4BHNA 1KUTA 3PY3A 2X8EA 4Y46A 3LXNA 3TEIA 3DA6A 4H1MA 1GY3A 3ZBXA 1PXIA 2VNYA 1WBWA 4ZK5A 4F1MA 3KRJA 5AR3A 3LAUA 3FSKA 2OH0E 3K5VA 3KMMA 5E8TA 5AUTA 2XRWA 4MH7A 3NIZA 5F4NA 1Q5KA 2YAAA 3MFRA 4M12A 5KO1A 2GHGA 4O21A 5T3QA 3OROA 1YQJA 4NIFB 4ZSEA 5JQ8A 1W98A 4B4LA 4E6AA 2HAKA 5IF1A 1WFCA 2IZSA 3FI3A 1ZY4A 4WHZA 3KEXA 4WA9A 3F3VA 2QOKA 4WG3A 2UZVA 4F9YA 4QYGA 4OTQA 3RPSA 2AC5A 4RC3A 2UZNA 5JKGA 3EQIA 4IVBA 3TCPA 2ETKA 3V8WA 2ONLA 4KUJA 4C59A 3O8UA 5TR6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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