5BVFA

Tetrahydropyrrolo-diazepenones as inhibitors of erk2 kinase
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
350
structure length
327
Chain Sequence
AGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVRWYRAPEIMTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tetrahydropyrrolo-diazepenones as inhibitors of ERK2 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 107
structure length 327
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bvfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bvfA01
3PJ8A 4EOSA 3UP7A 3NVKI 2J7TA 3BYVA 3FMJA 4QQJA 3R8LA 4HVGA 1LEZA 4YZBA 3HMNA 4UY9A 1XKKA 4L46A 3A7HA 4KRCA 3EWHA 3QQLA 5GZ9A 4O7LA 4UWCA 2ITQA 4E5WA 2UZUE 4WUNA 5DT4A 4D1SA 3AXWA 2CNVA 4DEBA 4M68A 5EDRA 4FT9A 4CRLA 1V0OA 3GC7A 3CPCA 2QO7A 4QTAA 3U9NA 4QTEA 4DTAA 4YJUA 4PDSA 5CLPA 5CYIA 4EQUA 2UZTA 2FVDA 3BI6A 5AUXA 4EBWA 4LV5A 3R28A 4IZAA 4EUUA 3EL8A 1FOTA 4LRJA 4LL0A 4NM7A 2JC6A 2R2PA 4YZNA 1ZOGA 2V62A 4O1PA 4D2VA 4MWIA 5JGBA 3A62A 4U97A 4IX6A 2OH4A 3NW5A 3M11A 4PPAA 4ZTLA 2ZM3A 2PULA 5CZIA 3JY9A 3S3IA 2XIKA 2B1PA 4PNKA 4A9YA 2P2HA 4DLJA 4EK6A 1OBDA 5JGAA 2OXXA 4JAIA 5CEKA 2E9VA 4FV0A 3F3TA 3RAIA 4ZY6A 4ITIA 2PHKA 2VTRA 5BNJA 4CFVA 3QU0A 2YCFA 5L2TA 4NYEA 5M09A 2XJ1A 2UW3A 3NWWA 2W9ZB 4QMSA 4X0MA 2OJJA 4XNEA 3TZ8A 5KMJA 2QU5A 2UZVA 4DGOA 2E2BA 4KAOA 4R1YA 3WARA 2C47A 3DY7A 2B7AA 3AD4A 4ANLA 1STCE 3VS3A 5I9WA 4L00A 4I6FA 2YITA 4M67A 3W2RA 4O7WA 2XIZA 4OTWA 5FEDA 1KV2A 1DAWA 2IZRA 5BUIA 3V5LA 2J0JA 5EI2A 3PSCA 3A7IA 2R3MA 3NUXA 2XKDA 3O2MA 1Z5MA 3VUDA 5AV0A 3SKCA 3NCGA 3FEGA 2OZAB 4EHVA 1ZWSA 4CFXA 5CSVA 1P4FA 4WNOA 3F3VA 5LVPA 5K5XA 5C4KA 4AG8A 3DNEA 3DAJA 2P33A 3U54A 1UA2A 1UNHA 2VN9A 3P0MA 4LOQA 4WO5A 2JEDA 5CNOA 4FTJA 4CMOA 1PXJA 5HE0A 2JFLA 2IVVA 3KXGA 3ALOA 2VTIA 2J0MB 4D9TA 4ALUA 3FQSA 2QOKA 2Z7RA 4O21A 3LLTA 5JGDA 4C59A 2XK6A 2PWLA 5A4CA 5EQEA 3JVSA 3Q2MA 4ALVA 3Q53A 3KC3A 3Q4CA 3U9CA 4LRKA 4QPMA 4DGMA 4DEEA 2R3OA 4K0YA 2IW9A 3AT2A 4OT5A 4C02A 4RFMA 3LFSA 1OKZA 2C1BA 2AC5A 5IQIA 2QONA 2PZPA 5DWRA 3NS9A 1GZNA 4QMZA 3W1FA 3R1YA 4BCMA 3VQHA 4WNKA 2WU7A 3LMHA 2VTNA 2X9EA 5FM3A 1MQBA 2W17A 5AUYA 3R1QA 4FSNA 3R04A 4MXYA 2ZJWA 4FKIA 3BU6A 4RJ6A 1PXNA 3VO3A 5J1VA 3KCFA 3KMMA 5E8TA 2OSCA 3A61A 2VTPA 2NRUA 5ANOA 4MXCA 2BZHB 4O7VA 3UMXA 4QMNA 2WTVA 5JKGA 4L3JA 4XG4A 3TZ9A 1U5RA 4CFUA 3NNXA 1FQ1B 2J0LA 2WD1A 4CQGA 2X8EA 2JFMA 1NXKA 4UXLA 4QTBA 2GU8A 3UZPA 1PMUA 2GDOA 3ODZX 3BHTA 3CQEA 4QMYA 5CI6A 4R5SA 1W7HA 5AUWA 2Y4PA 4FGBA 3H4JA 3FL4A 3O8UA 2YM6A 2I0EA 4U3YA 5KO1A 2C0OA 1APME 3BPRA 1BI7A 1W82A 2W1FA 1IAHA 3MTLA 5LVMA 3D2IA 4AACA 4L3PA 4I94A 1L8TA 1OPLA 5LVLA 3Q9WA 2XJ0A 3DK3A 5DHJA 1KE5A 5F95A 4APCA 2F2UA 3R2BA 5IA2A 1TKIA 4JXFA 4BCHA 4BF2A 1RQQA 5E4HA 1B38A 1H07A 3AOXA 3E88A 4JQ7A 2CCIA 3NDMA 4QO9A 3RPVA 5HI2A 1AQ1A 2JKKA 4RPVA 3QGYA 2PZYA 4AGWA 3KXHA 2YWPA 4C62A 3NX8A 4O83A 3BHYA 3VBVA 1UV5A 3P4KA 2W5HA 3VS1A 4C3PA 2ZB1A 5GJGA 4D0XA 4D5KA 5G1XA 3UOLA 4YJSA 4Q5EA 2HW7A 4AX8A 3W55A 5I0BA 4BY9E 4TWCA 2I0YA 4IFGA 5DH3A 3ENMA 4GSBA 3EKNA 3P08A 4I20A 2OFUA 5LMKC 3UNKA 3RALA 2ZV7A 5KBRA 2W5BA 4FNXA 2HWOA 4FSZA 5E90A 3BHUA 3VBQA 4CNHA 2ITTA 3FQHA 3FMNA 4DG3E 4O81A 1WVXA 3I7CA 2YM5A 3CGOA 1PXOA 2QOQA 4QYEA 3HV5A 4JR7A 4BBFA 4J71A 3PVUA 2XP2A 4JIKA 4DINA 4BWPA 1K9AA 2FH9A 3ZU7A 2B9JA 2XM9A 3HMOA 3O51A 3QTIA 4JBOA 4O6EA 3SV0A 5K9IA 4IM0A 3F3ZA 4MWHA 5KMMA 1S9JA 5ANDA 4DBNA 3DKCA 5HCZA 3EMGA 2J50A 3DS6A 1R78A 2QO9A 3OY1A 4OLIA 2WQOA 3HUBA 5CS6A 3ZBXA 4GKIA 5AX9A 1UNGA 4B8MA 5CZHA 1OUKA 1OBGA 4EH8A 3I6WA 5AA9A 3RCDA 2PVKA 4AZFA 1H1PA 5C26A 4DT8A 4OBOA 1JQHA 3OBGA 4FV6A 2H96A 3IDCA 4H36A 3R21A 4FE2A 4AFEA 4AOTA 1ZYSA 4HCUA 1MRVA 2CN8A 1O6YA 3ZO2A 3W2PA 2W1IA 1Q8TA 3ZXZA 3UVPA 3VULA 5HBJA 1YI6A 4LUDA 5JFSA 4JDKA 4RIYA 4I21A 3GFEA 3A7JA 4PV0A 1YI4A 1J7LA 2CPKE 5KZ0A 3R00A 5AAGA 4DF3A 1O6KA 1W0XC 4IX3A 2BIKB 4XEYA 3TV4A 4BIDA 4CG9A 3FI3A 3T9TA 3N4VA 1FVVA 4FG7A 4HOKA 4XS2A 3RNYA 4J97A 3TACA 3R02A 1QCFA 4FKWA 3FI4A 5C01A 3MJ2A 3UJGA 2OJ9A 5EK7A 1G5SA 3EJ1A 2W1DA 3W32A 3WZKA 1UNLA 3R7GA 3QUDA 3G6GA 2XM8A 3E8NA 5J5TA 5J9YA 3NNUA 4FTNA 3P9JA 4G3EA 3UC4A 4DTBA 3QYZA 3GCPA 3RK7A 3IKAA 1GJOA 2ETKA 3FQEA 4WD5A 4IDVA 3CD8A 2JDSA 5A6NA 4CT1A 4I92A 3ET7A 2C3KA 2BALA 3K2LA 4C3RA 3LQ5A 2YHVA 4PTEA 5CI7A 4CKRA 3KXNA 5EW3A 5CF8A 5DG5A 5M51A 3I0OA 3BLQA 4PMPA 2W1CA 3TT0A 4XUFA 2IW8A 3ZTXA 4D2RA 5L4QA 5CENA 2PVMA 3OWPA 4JDJA 1LR4A 4BI1A 3QRKA 2UW5A 5CF6A 4BGGA 2NNWB 1OITA 1HCLA 3PZHA 3LFBA 1YQJA 2WTDA 4M13A 2G2IA 4AS0A 2ITWA 3VHEA 1MRUA 3EL7A 5HG8A 2XNBA 4HPUE 3TNQB 5GIPE 3F88A 3EZRA 3QKKA 3R9HA 3K3IA 4JNWA 4EI4A 3O17A 3PP1A 3ZUVA 3EOCA 3FLYA 1H28A 5A6OA 1YDRE 4U8ZA 4XP0A 4NW6A 2WU6A 1NVSA 5FTGA 1K3AA 4LGHA 2QOOA 5EHLA 3TKIA 3EIDA 2PE1A 5F4NA 5IKWA 2FO0A 2XKEA 2H9VA 1A9UA 3QLGA 3QKLA 4W4XA 1UKIA 5CEPA 3OXTA 4S34A 1BI8A 3COIA 1OPJA 5AR4A 2VX0A 3DGKA 4IE9A 4MQ2A 2XA4A 4F1OA 3G90X 4RC2A 4DFUA 4MF0A 4NFMA 2WNTA 3RKBA 4EC9A 2VGOA 2ZOQA 2GS7A 3RWPA 4Z7GA 2V7AA 3EQPA 3F61A 3KGAA 4E6DA 1YKRA 5A4QA 4RMZA 3BGPA 3BKBA 3UTOA 4ZXTA 4F9YA 4O7ZA 3QUEA 4RC4A 4PDYA 1XJDA 2WTWA 4MQ1A 2WTKC 3GI3A 3MJ1A 4F7NA 1FINA 2CGWA 4EOIA 2C6LA 1Q61A 3PA3A 2RFSA 3FZSA 4MAOA 3SX9A 4AOJA 4D9UA 5JN2A 3ZOSA 1KV1A 1CMKE 4AA5A 2F9GA 5FBNC 4ZJJA 4BCQA 5IISA 4PL3A 5D41A 1OKYA 2YA9A 5GIOE 1KE6A 4JR3A 4ZLYA 3RHXA 3FMEA 5LWNA 3CY3A 3PLAE 4FC0A 4G9RA 2YLFA 1RJBA 4JBQA 3R83A 3KXZA 1JKTA 4Q2AA 3P1AA 4ZS0A 2B54A 4W9XA 3V5JA 1KE8A 5EM5A 5EYMA 4UBAA 2GNFA 2NP8A 5I5ZA 5JH6A 4MD8E 3GVUA 5C1QB 4TXCA 1L3RE 1KWPA 3NW7A 1HOWA 2V22A 3EQFA 5LCJA 1XBBA 1ZRZA 4AGUA 3D4QA 3EQGA 5EKNA 5M44A 4UZDA 2F57A 2PZRA 3QTRA 2W4KA 2VWBA 4TWPA 4FA2A 1QMZA 5ETFA 4DFZE 2Z60A 2EB2A 1H00A 1O6LA 4BBMA 5BVFA 3DZOA 4QMMA 2Y7JA 1KOBA 3EQBA 3B8RA 4EJNA 4R5YA 4D28A 3RTPA 4WG4A 5CT7A 1J1CA 1SNUA 3BE2A 1IASA 4R7HA 2V55A 5CTPA 2XNOA 5GINE 4EH9A 5HIEA 1GAGA 1VR2A 3C51A 5ANJA 4U81A 3ZUTA 4GFMA 3A2CA 3G15A 3TXOA 1GZ8A 4JG6A 4F6UA 2JDVA 1H26A 1Q8UA 3FZRA 4G6LA 2YAAA 3RWQA 4ACHA 2AYPA 2R3KA 2WMWA 4IVCA 5DT0A 2XBAA 3MFRA 5D7AA 3PPKA 4WKQA 2F7ZE 1E1XA 2HELA 4G16A 5KKRB 4XRJA 3R9OA 3HV4A 3WOWA 4CGAA 3KRRA 4EC8A 5JFXA 2Q0NA 3BLRA 4RZWA 4A07A 4FNWA 3FLNC 1YOMA 4OTHA 5LCKA 3MFSA 4ASDA 2F7XE 4FMQA 4NSTA 3FWQA 3PVBA 5DR9A 4G6OA 1FMOE 4OTRA 1PY5A 3LFFA 4H58A 4JI9A 3GU5A 4AZEA 5J7BA 4GT4A 5EDQA 3UIUA 3SGCA 2DUVA 2VD5A 1WAKA 1BYGA 1SVGA 4F9WA 3KQ7A 4MKCA 2PZ5A 1PF8A 4J8MA 3QX2A 4K18A 1R0PA 4KS8A 4MBJA 4H3BA 2H6DA 3FLZA 4JIAA 3MB6A 3M2WA 4KS7A 4E8AA 3DU8A 2IZTA 4Y85A 4GUBA 4FI1A 4I3ZA 5EM6A 4QMXA 1Q97A 5EI6A 4JBVA 3U4UA 3Q9XA 1QPDA 3IW8A 4P7EA 4U45A 3FBVA 4A9UA 3TNIA 3O8PA 2WAJA 2Z02A 2OKRA 1ZOHA 1MRYA 4WHZA 4ID7A 4F63A 3BU3A 4FTLA 5CVHA 5CX9A 2PVNA 3EYGA 3HYHA 3KRXA 4F08A 4F9CA 5HG7A 4RVMA 2PUUA 1JVPP 2E9UA 3EQDA 3NEWA 3SD0A 4HVDA 4P2KA 3IDBA 4E4MA 3U8WA 4CLIA 3BWJA 3FE3A 3OT8A 2H34A 5HVYA 4TWNA 4IJPA 2H8HA 2E9NA 2VWZA 2YCRA 4RT7A 5C8MA 2J9MA 1CKPA 3LMGA 4AZWA 4ZZNA 3RPOA 4Z9LA 4L43A 5DI1A 4E4XA 3QBNA 4BR3A 2JITA 5D10A 1RW8A 4G2FA 4GT3A 3RNIA 3VBTA 2QOHA 1NT2A 2QOIA 5FUTA 3IW5A 3JYAA 3LM5A 1YHWA 2W5AA 3WZJA 4ZTSA 5TR6A 3KK8A 5TE0A 1WVYA 2YCQA 3ZXTA 2XVDA 1TVOA 3C1XA 4QMPA 1OL2A 3GCSA 2HY0A 5F94A 2A27A 2DS1A 4YJRA 4ASZA 2ITXA 2C5NA 4YC8A 3FL5A 4YJOA 4E26A 3IONA 4TPTA 3ZRLA 4C4GA 2ZYBA 1SZMA 4Y83A 3A4OX 5I3RA 2B4SB 4X6QC 4FKLA 1ZXEA 3QXPA 3QTXA 4O91A 3N4TA 4RJ4A 3OW4A 4AXAA 5AUZA 5HZNA 3JUHA 4AZTA 4BDDA 4O0SA 4RFZA 5CU0A 3EH9A 2R3FA 5AP7A 5HU9A 4WRGA 1SMHA 2WPAA 5ANKA 2RSVA 2JKMA 4XRLA 2EXMA 3OVVA 4HYUA 4JX3A 4RWLA 3PWDA 4CXAA 5M4FA 4D1ZA 5H2UA 5AUUA 5ETAA 4HYSA 4NM3A 5HKMA 4XG3A 4DEDA 5H3QA 3ZM9A 4DYMA 4TNBA 3O7LD 3W18A 3VIDA 5KMOA 3MBLA 3W8QA 4W4VA 3BQCA 5B0XA 1YOJA 3ZZWA 1LPUA 4PL4A 3UNZA 3F66A 2XK4A 2VWYA 4F9AA 2BPMA 4XX9A 3DK7A 4YLLA 3HAMA 1JKKA 4TWOA 3OBJA 5D9HA 4ZSLA 3DFAA 4BCFA 3PRFA 2J5EA 3DBDA 5HIDA 4EH4A 5JSMA 4RFYA 1J3HA 2R3NA 4QD6A 3ZLSA 4FYOA 3BYUA 4XMOA 4D2WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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