5CAPA

Egfr kinase domain mutant "tmlr" with compound 30
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
323
structure length
303
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRADMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Noncovalent Mutant Selective Epidermal Growth Factor Receptor Inhibitors: A Lead Optimization Case Study.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 91
structure length 303
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5capA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5capA01
5EKOA 3ORNA 1XHAA 4PL5A 1CSNA 4HPUE 3HP5A 1XH9A 2JKQA 4OTGA 1H07A 4UBAA 2XRWA 5EI6A 2CNVA 2Q83A 3ALOA 4TTHB 4FA2A 2C5OA 1V1KA 3TEIA 4EH8A 3IDBA 2CKQA 3E8NA 3MY1A 4YC8A 2IW9A 2YM7A 4QYFA 4GIHA 2VTOA 3NWWA 4R8QA 5EHOA 2WELA 4RX5A 3ULZA 4F6UA 5C4KA 3ZOSA 3ZZWA 2OFVA 2YACA 4LL5A 3D2IA 3ZO4A 4YJOA 3KKVA 2IZRA 5C8KA 3RPVA 4GV1A 5CU3A 1JWHA 3T8OA 5EFQA 3V5PA 2ZMDA 3NUUA 4ZJJA 1UVRA 5HNBA 4U79A 3RAIA 3DNEA 1U54A 4RX9A 4RJ8A 2XA4A 3OFMA 4C34A 4ZS0A 4HZRA 4Z9LA 3O7LD 2PMIA 3ORKA 4RWLA 3GP0A 4PQNA 2VWBA 4IBMA 4ONAA 3VS0A 4FV6A 4F9CA 4I5PA 1R3CA 4M13A 4WRGA 5HORA 5TR6A 4Z7GA 4S2ZA 3EWHA 3MV5A 2XVDA 5HO8A 2KTYA 1YXUA 5DOSA 3I7BA 4GK4A 4GS6A 3OCSA 4B0GA 3SRVB 5IISA 4AU8A 4FEVA 4LUDA 3W32A 4AGUA 2PWLA 3PTGA 3UZTA 1PRYA 3D14A 1KWPA 4V0GA 1AD5A 4PDPA 4RJ6A 3QKKA 4WIHA 3RKBA 1OBDA 3KULA 5J5TA 4DFZE 3O17A 3KA0A 3OEFX 4EUTA 2C1AA 3E7OA 3M11A 3C9WA 3KF7A 4FKWA 4MXCA 2ZV2A 3QQHA 2WTKB 5A3XA 2W5BA 1PXMA 3UO4A 4BTMA 5A6NA 4C59A 3QC9A 5HE1A 2YIXA 3ZCLA 5AX3A 3FPMA 2J0IA 4ZZMA 3OS3A 4QP9A 5EW3A 3W33A 4HPTE 1BLXA 4QP6A 3UIXA 2B1PA 3AMAA 4X3FA 3LCOA 3POZA 2F4JA 3DJ7A 4XLVA 5HIDA 3ZH8A 4I5CA 3L8SA 4O7YA 5HU9A 1BUHA 3CXWA 4WHZA 5CF8A 3L9LA 4HNIA 2Y4IC 4M12A 4NKAA 3BYMA 2I0EA 5IQCA 5FEDA 3MY5A 1PKDA 5HCZA 5D11A 4FE2A 4L44A 3UMXA 3TACA 1H1WA 3QGYA 4JAIA 4P4CA 3QKLA 3LMIA 2YAKA 3PA3A 4G1WA 4OBOA 4O1OA 4OW8A 3ZO3A 4C0TA 2PTKA 3QD3A 4YZ9A 3RK5A 3FKLA 3E93A 3DZQA 5DLSA 4YGAA 4CT1A 5KKRC 5AAEA 5IQIA 4YURA 1PXKA 3TI1A 4FKQA 2OWBA 4QP4A 4DC2A 2YDIA 3MB7A 3E62A 2P33A 2FSLX 4RVTA 1XKKA 4OT5A 3IGOA 3BHVA 2BDJA 4EOOA 3A60A 5A4LA 4FIHA 3TJDA 5IG1A 2W1FA 4CZUA 3OTUA 4J98A 3V6RA 5EDQA 2BZHB 3ATTA 3C4ZA 4DG3E 2O3PA 3B2WA 2GU8A 4IB5A 5FLFA 2GFCA 4MXAA 2GCDA 2CKOA 2HWOA 1X8BA 3PRFA 3BU3A 3SVVA 4DH8A 2GSFA 4BIBA 3F3TA 4RC3A 4F9YA 4HYHA 3P5KA 3FL5A 2WKMA 3MB6A 2FB8A 4FG9A 5EOLA 2OW3A 2J9MA 3DAEA 3OXIA 5HVJA 2Y7JA 1JPAA 3LFAA 2HZIA 3LLAA 3EQBA 4V04A 4XG7A 3LFEA 3FKOA 3FZ1A 2VWUA 3HVCA 3KN5A 2PY3A 3EIDA 3PFQA 4U43A 3R9DA 3O8UA 4QMWA 4FV4A 2XCHA 5IQDA 5DT0A 3V6SA 4TYIA 3EFKA 4UXQA 2WFYA 4O7LA 1QCFA 4O91A 4G3EA 2C6OA 3KN6A 4LFIA 2WQMA 3ANRA 4X6QC 3BWFA 3TNQB 2OXDA 4DLIA 4KKEA 1H4LA 4JS8A 3QLFA 3TTJA 4R1VA 3QQJA 3QCSA 4IFCA 3ZFXA 4HW7A 4UMUA 1YOJA 5AADA 3UPZA 1U59A 2YN8A 5BNJA 2Z7LA 5CWZA 2YCFA 4ASXA 4BICA 1PMNA 4CCBA 2YWPA 4XG3A 3IO7A 4O27B 2IZTA 1H1PA 2HWPA 4JDJA 2PE2A 3CCNA 5CEPA 4O22A 1WBVA 5HKMA 4F99A 3EFWA 4TRLA 2I0VA 5LQFA 3KL8A 4A9YA 4BDKA 3LW0A 4K2RA 2VNYA 3O0GA 3IECA 2IN6A 3IG7A 5AR3A 5I3OA 2UV2A 4DGLC 2PYWA 3MFTA 1SVHA 3KQ7A 5L2TA 4LGDA 2W99B 3DDQA 2BHEA 3F69A 4ZTQA 4CEGA 1OPLA 2YITA 4GFMA 2ZDUA 3F3UA 1RQQA 4FYNA 4L01A 1FBNA 2B7AA 2PUIA 3KRWA 5D10A 4M97A 2W5HA 3F3WA 3COKA 3IK3A 3TZ9A 4W8DA 4HVHA 3LFCA 4XHKB 1K9AA 4YMJA 1ZMUA 1LPUA 3U9NA 1L3RE 1MUOA 4RIWB 5EI2A 3KXHA 2GNJA 4KWPA 4QMXA 4OTFA 3UTOA 2PZ5A 4PRJA 3H3CA 2QNJA 5KBQA 4G6OA 4CXAA 5TT7A 3NCZA 3WZEA 3I0QA 1Y8GA 2RFDA 4PP9A 5EQPA 3QQGA 4ASZA 3UO6A 3D5UA 4D2PA 4FGRA 5IDNA 2JD5A 4XMOA 3I1AA 1ZAOA 3LFNA 4EKKA 2OZOA 2YISA 3NZ0A 2PZIA 1CKIA 4NWMA 5E1SA 4A07A 5C4LA 4JOAA 3BQCA 3TV6A 3DAJA 4RG0A 4CG9A 2R3KA 2X4FA 5I9VA 5IPJA 3CY3A 1FQ1B 4ZTLA 3Q53A 5LMKA 3G0FA 2XM8A 1ZOGA 2BDWA 3D5VA 4NIFA 4UZHA 3CLYA 2WQBA 3MSSA 3FJQE 3BYUA 5DG5A 4EYMA 2J6MA 4E6DA 3O7LB 1GIJA 3DBFA 4ITIA 3TKUA 3VW8A 3K3JA 4M69A 3UYSA 1BX6A 2J2IB 5G6VA 4Q9ZA 3UZPA 5IQGA 2WMXA 3CEKA 5K4JA 4EJ7A 2JDVA 2XKCA 5E7RA 1OL6A 2R2PA 3E63A 3OBJA 5D12A 3COIA 3OVVA 5ANOA 2UZTA 1H8FA 2VO0A 2WU7A 2ZB1A 3F5GA 4QP3A 4M7IA 2WQOA 1WAKA 4Y72A 3RNIA 5GNKA 2G2FA 4RIYB 4BVUA 2WNTA 4HNFA 4BYJA 3CIKA 4G9CA 4ZLOA 4WG4A 4F1MA 3JY0A 3R7YA 4MNEB 2PVJA 4YTCA 4IX6A 4BHNA 2XS0A 2C6DA 5CF4A 3VIDA 3RM7A 2UVZA 3IGGA 2WOUA 3DCVA 5DVRA 3VS5A 5J5SA 3L9PA 5AAGA 4PMPA 4AE9A 5AV3A 1O9UA 4X7QA 2UW0A 2GDOA 5DE2A 3PSDA 5KZIA 3FLNC 1GNGA 5FUTA 5FP5A 4EHEA 4N0SA 1MP8A 4IM2A 4RQKA 4RT7A 2IW8A 2C5NA 5HO6A 4D2RA 3UQCA 3MH1A 4EH5A 4NU1A 5AM6A 3PDTA 1Q8UA 2UW4A 3GCPA 2XNOA 3GUBA 3ROYA 4TYGA 2YZAA 1KOAA 4S33A 1GZKA 1UWJA 2LGCA 5GZ9A 2HW7A 4EH4A 3U55A 5FM3A 5K5XA 4QP2A 1Q8YA 2UVXA 5I9UA 2DWBA 3FUPA 4RFZA 3TT0A 3VWAA 4J99A 2P4IA 3DKOA 5AAFA 4FSZA 5M4CA 3Q9YA 4U97A 4E8AA 4IW0A 3V04A 4JG6A 1PXOA 4B9DA 3DNDA 3QRIA 2F49A 3DS6A 3Q4CA 4BCQA 2YHVA 2B54A 2G9XA 4XUFA 4C4IA 2B9JA 2E9OA 4C8BA 5M56A 1A48A 3NAYA 3R2BA 4NTTA 4ZTMA 4GFOA 5GIOE 3DB8A 3PG1A 3WF6A 4UYAA 3QAME 2R3LA 5I9XA 1QPJA 3PG3A 4TXCA 4PPBA 3W55A 5AV4A 3SC1A 4YJVA 1STCE 3C4EA 2ZOQA 2XIKA 2ZM4A 5ANJA 1URWA 5K3YA 4EK4A 1P4FA 3EQIA 4P5ZA 4FKGA 3O8PA 4MF1A 2QKRA 4ITJA 4FTRA 4B8LA 2FH9A 1SNXA 2A4LA 4WUNA 5EW9A 4X0MA 5AP7A 5IQBA 3U9CA 3BHTA 3P7BA 3R7UA 3DBQA 2OK1A 5HNIX 4PPAA 5KMLA 5BVEA 3UP2A 3HGKA 4AZEA 5JH6A 4E6QA 4BY9E 5CZIA 1JVPP 2VTSA 4FIJA 1DS5A 4D4YA 4L00A 4I24A 4JG8A 2WMBA 5C26A 5JGAA 4AA4A 4H3BA 4ZSJA 4IVBA 4FF8A 4XP3A 4ZTHA 2O2UA 1YDRE 4PNIA 2PZRA 4YHJA 5BQ0A 2ITXA 3SRVA 1H00A 3IQ7A 4EBVA 3KXGA 3RTPA 1ZOEA 3HV6A 2VUWA 4J96A 4W4WA 3SV0A 2VX0A 4QYEA 3QF9A 3IPHA 3CC6A 2Z8CA 3GQIA 3MDYA 3RPYA 3PJ2A 3GQLA 2JKOA 4FEQA 4I22A 4GU9A 5ANEA 4X3JA 1V0BA 2XNNA 3EN4A 4EQUA 4YTHA 3DBEA 4EWQA 1OI9A 2QOIA 4IAZA 4FG8A 3H30A 3UC4A 5KHXA 3C51A 4NCTC 4QRCA 3F7WA 4BN1A 2WTJA 4UB7A 3R7GA 5AIRA 2F2CB 3Q4ZA 1O6YA 4EZ3A 2CNUA 1ZMWA 4HGEA 1G8AA 3QTRA 4FZFB 5LVLA 3D94A 2B53A 4EC9A 1UKIA 3H4JA 3LM5A 4K1BA 3Q52A 5E8SA 1IEPA 2XRUA 1OIQA 4E4NA 4EBWA 5AR7A 3HRCA 2JBPA 3PUPA 2RSVA 2Y4PA 4FL3A 4G2FA 3QL8A 5IA4A 1W84A 3OT8A 4A9RA 3FXZA 2BPMA 4QO9A 3VS6A 2W0JA 3OROA 5ACKA 2V0DA 3V5WA 2VWVA 4LUEA 3CTJA 4IVDA 3VBQA 5HQ0A 4EOPA 2PULA 3W2RA 3KRJA 4K8AA 4OLIA 5HI2A 1UU8A 4BZOA 2YIWA 5CAQA 3VNTA 3D7TB 2PVLA 5F94A 3FZPA 4D1SA 2QODA 4YLKA 3GB2A 4YZCA 1FINA 3N9XA 3D2KA 3DOGA 1GY3A 1OUYA 3PVUA 4FTCA 4NFMA 5HTIA 5LCJA 2EXCX 3AT4A 4O38A 3GU4A 1Q41A 3BELA 1FVRA 3OHTA 4J8MA 4U44A 3EQRA 5DHJA 3OUNB 2CN5A 1URCA 5FRIA 3FZTA 3HMNA 3W2OA 4FEUA 3V5JA 3EMGA 1UV5A 3LFSA 4FR4A 4QMYA 4BBMA 4E1ZA 5M4IA 5HIBA 2R3JA 4GT4A 1KE9A 3MPMA 4HYSA 3E5AA 3TL8A 4EK5A 4FEWA 1SVGA 2R0UA 3EL8A 3ZDUA 1V0OA 4XBUA 4AT4A 4DEIA 2C4GA 3BPRA 3NW7A 4UXLA 4BCOA 4EOMA 4IX3A 5FWKK 3C0HA 5CEQA 3AGMA 3TV4A 2WZJA 2H6DA 3A4PA 1PW2A 3OCTA 2W4KA 4FSRA 2GQGA 3BBTB 1OVEA 3LQ8A 1YOMA 5FBNC 3ZRLA 1HCKA 2BAQA 3W8QA 1OUKA 3U6JA 4IZ5A 4P5QA 4Y5QA 2YCQA 4O7TA 1P4OA 1UU7A 5HZNA 1Q99A 1BL7A 1H1SA 3OG7A 4C62A 4L9IA 3UVRA 1GOLA 3ZSHA 1W98A 2OSCA 4XG8A 4L52A 5L8LA 4MQ1A 1V0PA 3DTCA 3AMYA 2XMYA 4II5A 1M2PA 4YLLA 2VX1A 3KRLA 5EM5A 3UNJA 5E8TA 4OAUC 3Q32A 3FC2A 4OTRA 1BMKA 4AFJA 4D5KA 4QYGA 1SVEA 5I4NA 4O7ZA 5K4IA 3UGCA 2BKKA 4O84A 4OT6A 4ZSLA 3RALA 5LARA 2V7OA 2XIYA 4KBAA 4MEDA 3SHEA 2BRGA 2BRMA 4MD8E 4UMQA 3RK7A 2W1CA 3ZEWA 4P7EA 2X8EA 4BCHA 4PNKA 3BLRA 2JAMA 1AQ1A 1MQBA 3E87A 1H1RA 4RIOA 5FBOA 4YZNA 3DXNA 3CGFA 4PTEA 3MVJA 2JIIA 4GYIA 3RGFA 4ACDA 2WIPA 3AC1A 1YI4A 2IG7A 3TZ7A 5AR5A 2XK8A 4FTUA 4ZEGA 4IANA 4QP8A 4CQEA 5KE0A 1ZY4A 2JIUA 3MPAA 3HECA 4FMQA 4G5PA 3JPVA 4LRKA 2WGJA 4QNAA 5L2IA 4N4SA 2C6MA 4AN2A 1J1BA 3A2CA 3OWJA 3QTQA 3COHA 4JR3A 1MRYA 4EJNA 4TL0A 5I9YA 3R21A 2HY81 4IX4A 2C3KA 4AFEA 5GZ8A 4IZAA 2REIA 5B7VA 2BVAA 2BROA 3GT8A 1OPJA 5CT7A 3OOMA 3PYYA 3MTLA 2AUHA 3DQXA 3O96A 2JEDA 5M55A 4C4HA 4CSVA 4U41A 2PMLX 3FYKX 5HNGA 3OBGA 4LG4A 4XYFA 2PU8A 3TG1A 3G6GA 4IWPA 4R77A 2OJFE 4FIIA 4RIWA 4ALVA 4X2NA 3QQUA 5CSWA 5AP0A 1R0PA 4BZDA 1GJOA 5CF6A 4MAOA 1J3HA 1YDSE 3ACJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EKO A;  3ORN A;  1XHA A;  4PL5 A;  1CSN A;  4HPU E;  3HP5 A;  1XH9 A;  2JKQ A;  4OTG A;  1H07 A;  4UBA A;  2XRW A;  5EI6 A;  2CNV A;  3PUF C;  2Q83 A;  3ALO A;  4TTH B;  4FA2 A;  2C5O A;  1V1K A;  3TEI A;  4EH8 A;  3IDB A;  2CKQ A;  3E8N A;  3MY1 A;  4YC8 A;  2IW9 A;  2YM7 A;  4QYF A;  4GIH A;  2VTO A;  3NWW A;  4R8Q A;  5EHO A;  2WEL A;  4RX5 A;  3ULZ A;  4F6U A;  5C4K A;  3ZOS A;  3ZZW A;  2OFV A;  2YAC A;  4LL5 A;  3D2I A;  3ZO4 A;  4YJO A;  3KKV A;  3UDS A;  2IZR A;  5C8K A;  3RPV A;  4GV1 A;  5CU3 A;  1JWH A;  3T8O A;  5EFQ A;  3V5P A;  2ZMD A;  3NUU A;  4ZJJ A;  1UVR A;  5HNB A;  4U79 A;  3RAI A;  3DNE A;  1U54 A;  4RX9 A;  4RJ8 A;  2XA4 A;  3OFM A;  4C34 A;  4ZS0 A;  4HZR A;  4Z9L A;  3O7L D;  2PMI A;  3ORK A;  4RWL A;  3GP0 A;  4PQN A;  2VWB A;  4IBM A;  4ONA A;  4O4C A;  3VS0 A;  4FV6 A;  4F9C A;  4I5P A;  1R3C A;  4M13 A;  4WRG A;  5HOR A;  5TR6 A;  4Z7G A;  4S2Z A;  3EWH A;  3MV5 A;  2XVD A;  5HO8 A;  2KTY A;  1YXU A;  5DOS A;  3I7B A;  4GK4 A;  4GS6 A;  3OCS A;  4B0G A;  3SRV B; 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