5CEKA

Pseudokinase domain of human tribbles homolog 1
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
255
structure length
237
Chain Sequence
PSRIADYLLLPLAHVSRALCIHTGRELRCKVFPIKHYQDKIRPYIQLPSHSNITGIVEVILGETKAYVFFEKDFGDMHSYVRSRKRLREEEAARLFKQIVSAVAHCHQSAIVLGDLKLRKFVFSTEERTQLRLESLEDALSCPAYVSPEILNTTYSGKAADVWSLGVMLYTLLVGRYPFHDSDPSALFSKIRRGQFCIPEHISPKARCLIRSLLRREPSERLTAPEILLHPWFESVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Mechanism of CCAAT-Enhancer Binding Protein Recruitment by the TRIB1 Pseudokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tribbles homolog 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 237
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cekA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cekA01
2PZYA 3C4ZA 3BGQA 2XYNA 1PMNA 2FSOX 5ANJA 4OTIA 5C4LA 4ZS0A 5HO6A 2UW8A 3LM0A 3VAPA 3KULA 4AWIA 3GP0A 5DLSA 4O7RA 2O2UA 4RFMA 1MP8A 3LFSA 4BN1A 3LMHA 1I09A 4BCFA 5C8NA 5LXMA 3L8XA 4L46A 5JGAA 3NYNA 1H1RA 3PXFA 5JZNA 2IJMA 3ORXA 3U6JA 5HIDA 3KREA 2GS7A 3ZXTA 3FXWA 4O0SA 3TT0A 3MIYA 3RALA 4DH1A 2Z2WA 3BGPA 3A99A 3UZTA 4DG0E 4XV9A 2XKCA 2PVFA 2R64A 4BCOA 3QZHA 2C4GA 4UMRA 4ZSLA 3VUKA 2JDRA 4F7JA 4FEWA 4G17A 4UWBA 3AD4A 3M11A 4JG6A 1FVRA 2R9SA 4CFFA 4DTAA 4C4EA 1QPDA 3PSCA 4ACHA 5KKRC 3IGGA 5JQ5A 1LPUA 3R7UA 5CEOA 3LFBA 4FKLA 4BBFA 5IQGA 2QOKA 4BICA 4BCQA 3ORMA 3EQHA 3NNWA 3ZC5A 4JIAA 2HAKA 3RMFA 4C34A 4PNIA 4UZDA 4QYYA 2C68A 3ATTA 1OBGA 3E3BX 4D5HA 3E92A 5AADA 2GU8A 5J9LA 4CFNA 3FBVA 5KZ0A 5CENA 2EXMA 3SRVB 5EOBA 3ZRKA 5M06A 4ZMEA 3G15A 4JQ8A 3MSSA 4O83A 3FHIA 3OS3A 3C51A 3VJOA 5AIRA 1XH6A 2FSTX 3R8PA 4C8BA 1YDRE 1F0QA 5J5TA 1NA7A 2PK9A 5G6VA 4DFNA 3E3PA 1YRPA 4LG4A 4MNFA 5M4IA 3BEAA 3PIZA 4NEUA 4ZS4A 1M17A 2O5KA 1Z57A 5HE2A 4RGJA 5JN2A 1VJYA 2UZEA 4CZUA 2WTKB 3NUSA 5JFXA 4X3FB 4JR7A 3NZ0A 2VD5A 3BLQA 4NCTC 2CMWA 4Q5HA 2GPHA 4HYSA 2QU6A 5EM7A 1A06A 4RIXA 4DC2A 4V0GB 4CYJA 4L9IA 4L7FA 4WSYA 4G3EA 2QQ7A 4V05A 1YI4A 2W9ZB 3R01A 2WU6A 3DOGA 4K11A 3OCGA 5D41A 2CGVA 2I0VA 2XNGA 3EMGA 3VUHA 3V04A 1G5SA 1OPJA 4APCA 4G6LA 3LAUA 4RIYB 2VX1A 3SD0A 4R7BA 1Q8WA 1VYZA 3KK9A 3H0ZA 4E5WA 4XV3A 4BGQA 4G31A 3OTUA 3VS3A 2WEVA 4GKIA 4U80A 3MPAA 2JEDA 2BAQA 2JIVA 3QD2B 5H3QA 1BX6A 3W2OA 5LWNA 1NY3A 1UV5A 3I0QA 3SG9A 4FTKA 1Q99A 4J7BA 3VUMA 4IX3A 4FIGA 1JKTA 1Q8TA 3DA6A 3WYXA 4UXQA 3UVPA 5LVLA 3OXTA 2QO2A 3K5VA 4I94A 4LOOA 4DEIA 3G51A 4QP8A 2GCDA 4U8ZA 4W4XA 4ZIMA 2PVHA 4AT5A 3AGLA 1U59A 5DMZA 3TNHA 5BUIA 2YCQA 3DTWA 4FSNA 3N4VA 2W4JA 4FKUA 5ICPA 4N0SA 1GIIA 3MVJA 4TWNA 5HOAA 4F9BA 3ZZEA 2PPQA 5IDPA 5HU3A 4QNAA 4OTDA 4IQ6A 4O7VA 4L3LA 2J50A 1W98A 5HQ0A 3DNEA 3O2MA 5E8VA 2OIBA 4GT4A 2YLFA 4C36A 5CAUA 3MBLA 4HVGA 3KRXA 4K18A 5AR3A 3O7LD 2WTKC 4O27B 1BMKA 4F63A 4I0TA 2PE2A 1BLXA 2YM8A 3EL8A 3PJ1A 4BIBA 1SMHA 2X2LA 3DGKA 4ONAA 3MGYA 3TV6A 4UMPA 5IQFA 4QYGA 2PUIA 2ERZE 3ORZA 1PJKA 3E63A 3Q53A 3LCKA 4RJ8A 5HVJA 4F0FA 3O71A 5B7VA 3HP2A 3KL8A 1V0BA 4PY1A 2IG7A 3WIKA 2Y6MA 4ZTLA 3E5AA 2XK9A 2G01A 3UOHA 4BDFA 3BEGA 4MHAA 3UIUA 4EWQA 4HCUA 1H0VA 3D15A 1IAHA 2BRNA 3TZMA 4BCGA 3QQHA 4M0YA 2Z7RA 5IQHA 3EN9A 4RX9A 2XIKA 3II5A 2J0MB 2YM3A 4EH7A 4E4MA 2WD1A 1WMKA 2CSNA 4FT0A 3ZOSA 4ZJIA 4O2ZA 5AUXA 5BYLA 4YLLA 4FTNA 5JRSA 5HLNA 4V04A 4HZSA 4RIWB 4EH3A 4RQVA 4BDAA 3AXWA 4EUTA 1OVEA 4QMOA 3RP9A 4ALUA 4CXAA 4OAVB 5AP1A 4FR4A 2WZJA 4EK5A 5A4LA 4EBVA 2PVRA 5BVWA 2CGXA 1UA2A 2Y4PA 4FC0A 4GIIA 4ZY5A 4GJ2A 1SYKA 2QHMA 3G6GA 4UEUA 2PY3A 4LRMA 3PVBA 3FZ1A 5BMSA 5C8MA 1W8CA 3ANQA 1FVVA 3IK3A 3QRTA 4P4CA 2CKQA 3WBLA 3ALNA 3D5VA 2ZMDA 3A7HA 5L2TA 3PXKA 2XK6A 4MBLA 3LXPA 4FZ6A 4RZVA 3V5QA 1BKXA 1YI6A 4G16A 3VBWA 2C3LA 4J98A 3NNXA 4LL5A 4PQNA 4BVUA 3IW5A 2XMYA 3NNVA 1QL6A 1PYEA 3UG2A 3OP5A 3OTVA 4E6QA 3MJ2A 2QO7A 3QYZA 4GG7A 4LI5A 2X8EA 3P08A 4I92A 4S33A 3RHXA 4AOTA 2VNYA 3BYUA 4EOQA 2J4ZA 2ONLC 3LW0A 4EK4A 4I4FA 3QKKA 3ELJA 5K0XA 2J0JA 3PDTA 2QO9A 3Q60A 3TIZA 3FLNC 5J87A 4ANBA 2B0QA 3RWPA 2J2IB 3CC6A 1J3HA 1JKSA 2VTTA 1O6KA 4QQ5A 4BB4A 1DI9A 3AGMA 2JC6A 2OJ9A 3EQCA 4XG3A 5A46A 2VO0A 2VTRA 2ETKA 5HX8A 4BDDA 4RX7A 1GJOA 4P5QA 5GJFA 4KABA 5HLWA 3DS6A 4CT1A 3QC4A 1BYGA 3C0GA 3NW7A 4BCKA 3KMUA 4O1OA 1WAKA 3GQIA 1YDTE 1YOMA 3I7CA 5M53A 5H8GA 1J7LA 2PL0A 4OR5A 3R7IA 3R7VA 4DGNA 4C33A 5HG5A 3PJCA 3KXMA 3SXRA 2FUMA 3CCNA 1TKIA 1NVSA 4DH7A 3CQWA 4TRLA 1Q62A 2C1AA 3RK7A 5M51A 2AYPA 4FSZA 3P79A 4JDKA 4HOKA 1SZMA 3BHVA 4FEQA 4KKGA 3V5LA 2IW6A 3EFKA 2O8YA 3DCVA 3ZO1A 4YBKA 3VF8A 5E8ZA 2CKOA 5KBRA 4EC9A 3AC2A 3UJGA 3E8DA 2VWUA 1F3MC 1PXJA 4MF1A 4R3CA 2WMVA 3DBCA 3LPBA 2EWAA 4MH7A 4QTEA 1ZY5A 4NTTA 4GT3A 2BZIB 4YJSA 5AV2A 2OF2A 1UWHA 4YGAA 3E7OA 4D1XA 3UP2A 3MY0A 3O8UA 1O6YA 3PXRA 4I0SA 4JVGA 4JX7A 3E8EA 4B99A 4C3PA 1YXXA 2BIKB 2GHMA 2XB7A 3BE2A 4RA4A 3BU3A 5J95A 5IA1A 2EB3A 2WMUA 3DK7A 2QNJA 1SM2A 4YLKA 5HCXA 2YDKA 3NS9A 3LM5A 4FUYA 4N6YA 3NUPA 4FNYA 3RAKA 3NEWA 3OFMA 4W8EA 3F5PA 3LQ8A 1JLUE 2VTNA 4C2WA 3KN5A 2CLQA 3NUAA 4XLVA 4AFJA 5EOLA 5BVEA 1OKVA 4GUEA 4ANSA 5AV1A 3FC1X 1YI3A 4XEYA 4E4NA 5L8LA 2R7IA 3ZFMA 2VRXA 2OH0E 2UW6A 2VO6A 4C4GA 5DWRA 4D55A 2ITWA 2HWPA 4F9YA 4I4EA 4D4SA 3CP9A 4C7TA 4UB7A 4ZTHA 5FLFA 1DAWA 3G33A 4HGSA 4BTMA 2C6IA 1LP4A 4ZJJA 3HRBA 3PSBA 2FSLX 2R3RA 3POOA 3OWKA 5CU3A 4YSJA 3WZEA 5EKNA 3QTXA 3CQUA 1LEWA 5AIKA 5D9HA 2HZ0A 1XWSA 2V22A 4M14A 5TR6A 3UOLA 3TKUA 3OBJA 4IM0A 4QP1A 5I3RA 3F5UA 3MESA 4FV9A 1WZYA 2BDJA 3RWQA 4QP4A 4NYEA 3IS5A 3MFSA 4N57A 5FXQA 3KMWA 4PDOA 2CGWA 2CGUA 4FTTA 2VTOA 4G3CA 4JRNA 5DNRA 4QPMA 3RBWA 5AR5A 2WMTA 4RJ4A 5E1SA 3HVCA 1Q3DA 2XEZA 4LQMA 4DEEA 2YWVA 3KN6A 2I6LA 5HGIA 4K77A 1J7UA 5EH0A 4FG7A 3PP0A 4GU9A 5AR8A 3KC3A 3QUDA 2O0UA 3AC3A 5K4IA 4FK3A 4ALWA 4M69B 2UW0A 4FL1A 5IKWA 5CI7A 3ZXZA 2J5EA 1Y8YA 4AA4A 4H58A 4ACMA 4FUXA 5LMKA 2PVYA 3G9NA 2UZNA 1B39A 4DBXA 3WOWA 1KUTA 5A6OA 4OBPA 3VBVA 3TUBA 5DRBA 4C59A 3LMIA 1QPJA 2WIHA 3LJ0A 3LXLA 4U0IA 3ZSIA 3FYJX 5ETIA 1H27A 4FKRA 5JGDA 4MVFA 1JNKA 5AV4A 4L67A 4TYEA 3KVXA 4A7CA 3TKIA 4MD7E 4GK4A 1OUKA 5LVNA 4UMUA 3W16A 4C57A 4XHKB 3IDCA 2BMCA 4F99A 2HIWA 2RG5A 4GG5A 4RJ5A 4FGRA 2FYSA 2IZUA 3G9LX 2HXLA 5A4CA 3W1FA 4CZYB 5HVKA 1G8AA 5JSMA 2W1HA 3D9VA 4BDIA 4IAAA 3R1QA 3L8VA 2VWWA 4I21A 2PVMA 2OK1A 2DUVA 3KXGA 3NX8A 3GB2A 3V5WA 1WBPA 5A6NA 4WG5A 4RPVA 3P86A 5KMJA 2QLUA 4FTMA 2OZOA 1G8SA 3H3CA 3R9RA 1Q8ZA 4J53A 5HBEA 3U6IA 2OXXA 2YZAA 2YLEA 1CKPA 2H6DA 5TO8A 2GSFA 4AT4A 4PDPA 3FPQA 3P7AA 4WO5A 2RL5A 5L8JA 4IADA 3PE1A 2C69A 5GZ9A 5KMNA 3K2LA 3VF9A 4ZSGA 4AW0A 5F4NA 1IA8A 5IH5A 3FMNA 4OTWA 3JXWA 3UO4A 1YXVA 1HOWA 1ZXEA 3ORPA 4RJ3A 3LLTA 5AUZA 4CKIA 4HVDA 4C35A 2R3QA 4NUSA 4AT3A 2NRYA 5GZ8A 2PU8A 4HVIA 3SGCA 4JT3A 3EQFA 3DDQA 4ITJA 2XKDA 3FI3A 4ACDA 3LXKA 5EI2A 1UKIA 2UVXA 3DNDA 3HDMA 4HNFA 5FEEA 4AZTA 3OD6X 3F3UA 4U6RA 4DAWA 5DEYA 3HLLA 5AP5A 5E9EA 3F88A 1ZZLA 3CD8A 5DYJA 3AC5A 4BDJA 4FNZA 3MA6A 4OUCA 2F2CB 5KMOA 3OUNB 2IZSA 3OF0A 2GTMA 5HG7A 3VS6A 3KA0A 4PL5A 4CVAA 3VWAA 2B9HA 5J9YA 4OT6A 4EUUA 4Z16A 2HWOA 2JDTA 1J1BA 3R71A 3WF9A 3CSVA 3PVGA 3DDPA 3F61A 4Y83A 4RIXB 5EK7A 4IC7A 3M1SA 3ORTA 2OO8X 1GZ8A 1UNHA 4DCEA 3MJ1A 4CV9A 3UQFA 3RAHA 5DHJA 3LFDA 3V6RA 1A9UA 4CKJA 3O0GA 2WAJA 5AEPA 3QD3A 4TYHA 3GI3A 2OIDA 3ODZX 5HTBA 4LFIA 3LZBA 4EK6A 1UU3A 3AT3A 2OJGA 3C5IA 3G90X 3HV5A 3K3JA 4RJ7A 4A4XA 4DBNA 4EKKA 4TT7A 3LJ1A 4JR3A 5CXZA 3LIJA 2HW7A 2PMNX 5CSPA 5FP5A 4TW9A 4PTCA 3IDBA 3HMNA 4CNHA 4ENXA 1JQHA 2PVJA 3DQXA 4F64A 1JOWB 4JQEA 1M2QA 4GYGA 2GQRA 3QCXA 4EOOA 1ND4A 4O0RA 3ETAA 4AZWA 4NH1A 5IQAA 5FGKA 2HZIA 3SA0A 2C5NA 3F66A 3ZC6A 5M55A 3OC1A 5IMEA 3DKOA 2YZLA 4EHZA 4R1VA 2W1FA 4Q2AA 4F6SA 2R3LA 4MF0A 3N4UA 5KHXA 3TI1A 5D12A 2UW9A 3A7GA 4ARKA 1FVTA 4MXAA 2OKRA 2BPMA 3IW8A 2X8IA 3LHJA 2GNIA 2YIYA 1PXOA 1UVRA 3E88A 4Q5EA 3FC2A 3OW3A 4IVCA 5GZAA 2H34A 4GK2A 2WO6A 3VQUA 4FSQA 5AJQA 4BI2A 4BYJA 2CNQA 2UVYA 2YACA 3ENHA 4DINA 2WFYA 3UC3A 3ZCLA 3NMUF 4DTBA 3CIKA 2CHLA 4NJDA 4KSPA 1URCA 3LJ2A 4G6OA 4HPTE 3JYAA 3W2RA 4IW0A 3FHRA 2HXQA 5CSWA 2I1MA 1JSVA 3QRIA 4FIEA 4XOYA 3A8WA 2R2PA 1ZRZA 3FZTA 3QTUA 4YHFA 4UY9A 2QOCA 3PYYA 3C1XA 3LCDA 3E64A 4PMMA 4WA9A 5AX9A 4AGDA 4F1MA 3SX9A 5ANEA 1P14A 2Z8CA 5I0BA 4LV5A 1K2PA 4H3PA 5FTOA 2VWVA 4PMPA 3C4CA 5HKMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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