5CNOA

Crystal structure of the egfr kinase domain mutant v924r
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
316
structure length
300
Chain Sequence
NQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMRKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Analysis of the Role of the C-Terminal Tail in the Regulation of the Epidermal Growth Factor Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 94
structure length 300
sequence length 316
chains with identical sequence B, X
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cnoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cnoA01
1YOJA 2CKOA 4MXXA 3KRRA 1M52A 5DRDA 3CBLA 3E87A 2R3QA 4AOTA 5E1EA 2PZ5A 4BDFA 3MVJA 3PY3A 3ZSIA 5FBNC 3I5NA 4CCBA 2R7IA 3FKLA 4IVBA 4EQMA 4NFMA 2VGPA 3TZ9A 5FTGA 3D2IA 1IRKA 2OIQA 4FT3A 4I4FA 3WZUA 3BYUA 3LAUA 3NR9A 2GDOA 4U6RA 3V6RA 1YI6A 2YIQA 2ITNA 3QZFA 2PWLA 3HV7A 4PDYA 2ONLA 3PWDA 2XKDA 4UN0C 4IW0A 5FUTA 2I0EA 5JGDA 4O7VA 1DAWA 3BE2A 4EC8A 5DA3A 4CNHA 3TJDA 5DWRA 3DLSA 4HYHA 4M13A 2PVFA 3VWAA 5DEYA 5CF6A 3D9VA 3KMMA 3RAWA 3IGGA 2ZAZA 5DR9A 4AXAA 3MDYA 4RC2A 4A9SA 3Q04A 4I21A 3EIDA 1SNXA 4CFWA 2PVNA 4GVAA 3EFWA 2X39A 3ZBFA 3BE9A 4ANNA 3A7JA 2OKRA 5CT7A 5EDPA 3FKNA 3R04A 3A2CA 3PY1A 4G3EA 4XJ0A 5CENA 3THBA 4D2TA 1H28A 3R9HA 4IWDA 5JFVA 3Q4CA 3BV2A 2CKPA 1Y91A 2J51A 4D1SA 4O0YA 1Q62A 4QTAA 3E8EA 3EWHA 2R3MA 2UW9A 4AGDA 3F2AA 4IDTA 1P4FA 4IM3A 2RF9A 2XEZA 4O1OA 5JGAA 3PIXA 5FWKK 3E93A 3D5VA 4E93A 1FBNA 3OD6X 2ZMDA 4CKJA 2OWBA 4HOKA 4BDDA 2YIWA 4FT0A 5IQCA 5AV2A 3IONA 4L67A 1PXKA 3GCPA 4AT3A 2QONA 1DI9A 2RG5A 3KK8A 4I5PA 2XM8A 5DBXA 3BPRA 5AAEA 3Q9XA 3CPCA 4RZWA 2C3LA 1BYGA 3HA6A 4EH3A 4G16A 4AA0A 5DE2A 3SOAA 2XNNA 3UP7A 3GCUA 5L8JA 2PZIA 5CI6A 1REJA 2C6DA 2PULA 3BELA 1NVQA 4I5MA 1H4LA 3HRCA 2R7BA 4RFZA 4UY9A 2WAJA 4IEBA 4PWNA 4HVSA 4NCTA 5CNNA 3FJQE 2UW8A 5HTIA 5JQ5A 1WBOA 2QOIA 5L2WA 2Z02A 1QPEA 1QPDA 4O0UA 5KX8A 2UW7A 5IA1A 2PYWA 2DQ7X 3FAAA 3MGYA 4RJ3A 4ZTMA 2WHBA 3PG3A 4QMYA 4ACMA 4I0SA 4IAYA 2PHKA 3ULIA 3RMFA 4GK3A 4PMSA 4KIPA 1J91A 1YXTA 2WB8A 2VWVA 1GZNA 4A4OA 2YCQA 5FXQA 2A4LA 4U3YA 4V0GA 4C4FA 2RSVA 3R01A 3IW4A 3LCDA 4GEOA 5LMKC 5DVRA 3N9XA 3HDMA 3NW7A 3PXQA 3UNJA 5IU2A 2UZVA 5KMIA 4E3CA 2VNWA 3MTLA 4I24A 1IG1A 3FZOA 5E8TA 2X2KA 4AZTA 4AP7A 3M2WA 3DBFA 3PSDA 4IHPA 5AR7A 1IR3A 1OIUA 2QU5A 3FXXA 5HX6A 5CT0A 5ANOA 4HNFA 4BIEA 3KXXA 3MY0A 3UVPA 4E20A 4C2WA 5AUXA 5M51A 2C5XA 4FEWA 2OZOA 2FSMX 3HRBA 2VWYA 3EN5A 2X81A 4LL0A 5K5NA 2BFXA 3TM0A 4XEYA 1Q41A 4YJRA 2UW4A 5ANKA 4XS2A 3ITZA 5FGKA 4QMPA 3U9CA 3C0GA 3ZH8A 3R8ZA 3TZ8A 1ATPE 1IA8A 3ORZA 4HNIA 4J96A 4BZOA 4B8MA 2W5HA 4BICA 4FK6A 4CFVA 1JNKA 3EYGA 2Y4PA 4QMQA 3UZPA 4KA3A 2XEYA 4E4NA 3FSFA 4J1RA 5A4CA 4FV0A 3A4OX 4U0IA 3TUBA 2CMWA 4J71A 3QQGA 4QMXA 4IFCA 5HLPA 4PRJA 4AFJA 4G9CA 5CAVA 4DEEA 2WOTA 2WMTA 3PG1A 3CJGA 4J99A 2KTYA 3SG9A 5HKMA 5EI8A 3LFCA 2BDJA 4M68A 4Y72A 4ZZOA 3G15A 4LRJA 3OVVA 4KWPA 2FVDA 5GIOE 2P33A 4MK0A 4XP0A 5HNGA 4X2GA 1H25A 4L68A 4BDJA 4OLIA 3V5LA 3ZO2A 3NYVA 3NZ0A 1R3CA 4B8LA 3BEGA 3DK7A 5JMSA 4H36A 1OM1A 5GHVA 2BTSA 2O64A 1Q24A 4XUFA 5ANDA 4ENYA 3QTRA 2UW5A 1KSWA 3FI4A 3RK9A 4I22A 4BCGA 5EW9A 1A06A 3MWUA 4Y46A 2IPXA 4O7WA 3VBQA 2R0IA 3LOKA 4U43A 4FK3A 2FSTX 4O7YA 5JT2A 3ENMA 2HIWA 3KFAA 3D0EA 4L52A 2IW6A 4BIBA 4F7JA 1MRYA 4JQEA 3ANQA 3COKA 2RGPA 3BGZA 1DAYA 3EFJA 3ODZX 5B2KA 3LFAA 4BTJA 5EYCA 2B4SB 5CTPA 5IH5A 4IX4A 3BQCA 2VWUA 1FQ1B 3P0MA 4CQEA 4Z55A 4EK5A 3COHA 3PP1A 3ULZA 2C69A 1U54A 2G2IA 2W1CA 4C38A 2IWIA 1OVEA 4RVLA 5A6OA 5EYKA 4HCUA 4IQ6A 2VWIA 1ZMWA 2FSLX 2W96B 5TE0A 3VUGA 4FTUA 4M15A 2H8HA 1UKIA 3ZRKA 4C4EA 4FGRA 1ZYSA 1ZOEA 4B99A 1IASA 5A14A 4TW9A 4D2WA 4I0RA 5BMSA 5KZIA 4XCUA 2IO6A 3EMGA 2OICA 4X7QA 2XP2A 3LJ1A 5FBOA 3OF0A 2X6DA 4FGBA 5FEDA 4F6UA 3LCKA 1F3MC 5FG8A 5GJDA 3AD5A 4DFXE 1ZAOA 5KHWA 3I60A 2DS1A 3U54A 2QO7A 4FTAA 3KXMA 3MFRA 3BGQA 4MVFA 2OJJA 3F5UA 2ZVAA 3MVHA 4Y5HA 5BVWA 4YSJA 5JN2A 3QCXA 2C1AA 3C0HA 4B7TA 2X0GA 4F0FA 4XV2A 3LKMA 4UZDA 3EN9A 5CXZA 2C3KA 1WVYA 3BYSA 3UGCA 3FI8A 5IH6A 2Y0AA 4TXCA 3NAXA 4D4YA 1YOLA 4G3FA 2J0KA 4O96A 5DGZA 4RBLA 4H3BA 3DXNA 1TQIA 2W5AA 4K6ZA 3H4JA 4R6VA 3MH2A 3OFMA 2VN9A 3SV0A 3WBLA 3NIEA 4JG6A 4JOAA 4RLLA 3AD6A 2OU7A 2EB3A 5A4TA 4YO6A 2C6IA 1R0EA 4DBXA 4AW2A 3BLRA 3SRVA 2F7ZE 3ZUUA 3U87A 4E6QA 4N57A 3OUKA 5F9EA 2BALA 2EU9A 4EK3A 1PMUA 5F4NA 3QHWA 2JDOA 3W10A 4TYHA 4I3ZA 5KBRA 4ZTRA 4AOJA 4CRSA 1BX6A 2YERA 3T3VA 2CGVA 3QYWA 2RFNA 4G6NA 2PMNX 2Y6MA 1KE9A 3DOGA 4JAIA 4UEUA 3ZXTA 3OTUA 3BWJA 2VTMA 5ETIA 2Z7LA 3RNYA 4HVDA 3RZBA 3PJ8A 1XH9A 2YLFA 3VN9A 4YHTA 2QLUA 3QQKA 4L6QA 5ACKA 1XH8A 4O0WA 4CRLA 4UX9A 3DJ7A 5EM8A 4DH3A 2YHVA 2BDFA 2JIIA 3DKCA 4CKRA 4EYJA 5L2TA 1U59A 1J1BA 1FMOE 4KKHA 3FZRA 3ZEWA 1M17A 4E5AX 3LFSA 3W33A 2ZM1A 4M69A 4TY1A 3PXKA 4NM3A 3GVUA 1G5SA 3OEZA 2CN8A 2O8YA 4YLJA 3ZSGA 5I4NA 2PSQA 3BIZA 2ERKA 3WZKA 4ZSGA 1IA9A 3UC4A 1HCLA 3FZSA 3ELJA 5ANJA 2IVSA 4EC9A 3PXFA 2UW6A 4FKQA 2P2IA 3BHHA 3F2NA 3LXPA 4LGGA 3O0GA 1Q8WA 4Y5QA 4TT7A 1M2PA 4QT1A 2NO3A 3ZRMA 1YQJA 2X1NA 2XIZA 4QYFA 4BTKA 3IW6A 2YZAA 4WSYA 2ITUA 4WNKA 5HE3A 4Z7HA 5JFWA 4QP3A 3FXWA 3BEAA 4WNMA 5CNOA 4GT4A 3FMEA 1PKDA 1URCA 4LFIA 5HO8A 2W1IA 2IZRA 2BKZA 3CR0A 2FGIA 3RCDA 4J7BA 5C26A 4UMPA 1MRUA 3KULA 1U46A 4ANSA 2WKMA 5HE1A 4E1ZA 1WCCA 3R2YA 1S9IA 3E3BX 3R22A 1JPAA 3GUBA 1QMZA 3KF4A 3QL8A 4W9XA 5AJQA 2IW8A 4QNAA 3V6SA 4EHGA 1TQPA 1WBSA 2FUMA 5FDPA 3Q4TA 4R7IA 1FPUA 4F0IA 5CU3A 3AD4A 3OC1A 4ZSEA 3L9NA 4JBQA 5EW8A 5IMEA 4CTCA 3MB6A 4NW6A 4RT7A 3TL8A 1PJKA 3LFNA 4RIYB 5AADA 3GU5A 1LEZA 1O6KA 2GCDA 4NSTA 3CLYA 2E9UA 4RQVA 4U40A 3BI6A 3WYXA 4QPAA 1SVGA 3BX5A 1CM8A 1PXJA 3L1SA 1ZY4A 4IZ5A 3L9MA 4ZS0A 5K3YA 2C0IA 3ALNA 4IVAA 4QTDA 1V1KA 2QOQA 4O83A 5EQEA 2FO0A 4X0MA 5HIBA 3VUDA 1WBTA 1JWHA 3VS0A 5AP3A 2Z7RA 3RPRA 4AS0A 4J52A 1WBNA 3FZ1A 3R28A 5E92A 3F69A 4RG0A 4CFXA 4CMOA 3MYGA 2XRWA 2CJMA 4XMOA 2F7XE 2VO7A 1PXOA 3HEGA 4F1OA 4FSYA 3ZMMA 4F64A 4EOSA 2YJRA 5AR3A 4ASDA 2VTLA 2GTMA 4MNEA 4E8AA 3CQUA 2XK3A 2CHLA 3K3IA 5EOBA 1GY3A 4L45A 3UYSA 3EQIA 3EL7A 3LQ3A 5T68A 5C03A 2XNGA 2YWPA 5C8NA 4XBUA 3KN5A 2ZDUA 3F7ZA 4I23A 4CZTA 2WTCA 2PVRA 2C1BA 2VWXA 4QYYA 4FKGA 4LOPA 3ZHPC 2QD9A 3I1AA 3F88A 4LOQA 4QQ5A 4U41A 3R7YA 1Q97A 3ORKA 4QRCA 3RCJA 3QQUA 5HEZA 4C4HA 4WUNA 3LMGA 5E90A 1PW2A 3ZO4A 5J7HA 2WTJA 2XBJA 3DXPA 4JDIA 3K5VA 2GNFA 3F3TA 5CU6A 4ZLZA 4GKIA 2R3GA 1OPLA 4I6HA 4Y85A 5HBHA 4CFMA 4IAAA 3DKGA 3ZDUA 5JKGA 3SG8A 5M44A 2PTKA 5H8GA 3U55A 2WQBA 2F49A 2JIVA 2XM9A 4WKQA 1JKTA 2BCJA 4AN9A 5HE0A 1W0XC 3QZIA 2B9JA 5HESA 2R3KA 4OTRA 1APME 4NEUA 3LZBA 4JJRA 3G6HA 2O0UA 4ZP5A 4EL9A 3QHRA 1QL6A 3ZFYA 3E8DA 3H9RA 4MXAA 4E6CA 5LMBA 4F9BA 4X3FC 3QTIA 5DYJA 3EJ1A 4AE6A 3DK3A 4UV0A 2IZUA 1UV5A 5DN3A 5F20A 1BI8A 4D2PA 3NUAA 4U79A 3QGWA 5EQYA 2IN6A 3LLAA 2W7XA 3VQHA 3MH1A 4PL5A 3JUHA 4ZTNA 2YEXA 1WMKA 4FTOA 3HA8A 3C4EA 4DLJA 2F7EE 3PJ3A 4MQ1A 4EONA 2G15A 4L46A 2W05A 3ZXZA 1LP4A 4C37A 4CLJA 2VGOA 3PUPA 4P7EA 2W0JA 5KHXA 5K5XA 3LFDA 3DJ6A 1Q99A 4FUXA 4GS6A 4KKGA 4YZ9A 3C50A 4TWOA 1KOBA 2VO6A 2XJ2A 3NNXA 4I5CA 1UU7A 4XH6A 2JLDA 4Y83A 3GBZA 5ETAA 5AUYA 4AW0A 4TWPA 4NIFB 3GQIA 1H08A 5GZAA 1JOWB 4QMVA 3BCEA 3C4CA 4JX3A 4EZ3A 1B39A 4GJ2A 3A4PA 3FC1X 3DKOA 1UA2A 3NGAA 1J7LA 5AR4A 3RPYA 4F0GA 5HIDA 2C47A 2I0VA 2B1PA 4RFYA 3I4BA 3QBNA 4QTEA 1AGWA 5CX9A 3JVSA 3E64A 3BKBA 3LIJA 3BBTB 2OF2A 4ZJJA 3TJCA 4KINA 4PV0A 4U5JA 3UG2A 3V3VA 5L6PA 2W17A 4DGMA 3WARA 4GG7A 4XG8A 4DYMA 4JRNA 3C13A 2WTKB 3AXWA 2VTHA 3EQHA 4MXYA 5JQ8A 2OW3A 5EHYA 3H9OA 1VEBA 4FKOA 3IGOA 4FNYA 4GSBA 2WD1A 5M4FA 4U97A 3IECA 4FZFB 3UOJA 3ZYAA 1EH4A 4L8MA 4MX9A 5HTBA 3U6IA 4O6LA 4ZZMA 5GJGA 4D4SA 1ZOHA 4F65A 3VS5A 2XNOA 3OXIA 5HU3A 2WFYA 3EFKA 2B54A 4GUBA 3HECA 1JQHA 4NUSA 5CSVA 5CF5A 2FYSA 4O86A 3TI1A 4BCPA 4O91A 3OTVA 4HGLA 4BDHA 1F5QA 3QD3A 4FF8A 4R78A 4R1YA 4DAWA 2BIKB 2C6KA 3R1NA 4LV5A 1YXVA 4CFUA 3RINA 3UIUA 5H8BA 2QI8A 3FV8A 5FP6A 3H0ZA 2ITQA 5HVKA 2HZ0A 5FM3A 4CEGA 4AGCA 4Z9LA 2J0LA 2JKMA 3QWKA 2XB7A 4WG5A 4QP9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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