5CSWA

B-raf in complex with dabrafenib
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
273
structure length
254
Chain Sequence
DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGSILWMAPEVIRMQDSNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELAREL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title A Novel RAF Kinase Inhibitor with DFG-Out-Binding Mode: High Efficacy in BRAF-Mutant Tumor Xenograft Models in the Absence of Normal Tissue Hyperproliferation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 75
structure length 254
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cswA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cswA01
4I6QA 1QL6A 3LFNA 4DLIA 3PJ1A 5ITAA 3ZBFA 4GIIA 3PSCA 5HBJA 4FSUA 4IAYA 5FDXA 3UPXA 5JGDA 4FIFA 4RA5A 3VO3A 3HV5A 3NW7A 4QQJA 2JLDA 4J71A 3R28A 2IJMA 2WMTA 3KXXA 4C02A 3ENMA 5E7RA 3D15A 3BIZA 4IFGA 2CJMA 3ZLYA 3DK3A 2WQBA 4JBVA 4F6WA 4FE2A 4O86A 4CYJA 4UXQA 3KVXA 3PTGA 5AX9A 5HE2A 3ZSIA 5KX8A 4BZNA 4IDTA 3PJ2A 5KE0A 2NRYA 4MD8E 4U6RA 5JRSA 4EHEA 4PMPA 3E92A 4AACA 4CYIA 4OTPA 3HNGA 3CCNA 2F2UA 4NCTA 4UY9A 4O0UA 2GQSA 2C6TA 1Y6AA 4CG8A 3ORIA 3QYZA 4GG7A 2Y8OA 3ACJA 3D5XA 4O2ZA 3RTPA 2QNJA 1ERKA 2R3MA 3MPAA 3H9FA 4IIRA 3VAPA 4DFNA 5HLNA 1ZY5A 4DLJA 4E1ZA 1U54A 4RG0A 4USEA 4O6LA 4EKLA 4CCBA 4O7WA 2DQ7X 2PVHA 2BHEA 1KE6A 3PLAE 2UW3A 1E1VA 1FOTA 1Q8UA 2ETRA 1CDKA 4FBXA 2XJ0A 3VC4A 2GS7A 2CHLA 3OWPA 3A99A 4B4LA 2ITXA 4QQTA 5BYLA 1I09A 4I23A 3D2KA 3HKOA 3E62A 5EDRA 3O7LD 4MQ1A 3PXYA 5TKDA 1PYEA 3QQHA 1BL6A 4J8MA 4D9TA 4GH2A 5CY3A 3ZC6A 1REKA 5FDPA 1NT2A 2E9VA 3GC0A 1I44A 3LXKA 2YIQA 4DFXE 4CRSA 4EL9A 3QRTA 3R9NA 4Y95A 1SVHA 3AGLA 4QMXA 2PZRA 4HVGA 1Q61A 2W4OA 1DI9A 3NYNA 4PPCA 4ZTQA 2X4ZA 3UZTA 4M0ZA 5HD4A 3UO5A 3PIXA 1OIUA 2R5TA 2UZEA 2QR7A 5CENA 3TKUA 5I4NA 2UW6A 2VGOA 4F7LA 3HL7A 4JX7A 4YUQA 5BMMA 3EN9A 4O0VA 5BUIA 3K5VA 4EQMA 1G3NA 3AC3A 2VWXA 4RA4A 4QYHA 4WSYA 5ANEA 5LCKA 4F6SA 3MN3A 3EN5A 4R78A 4K18A 1W8CA 1OL2A 3DNEA 3S2PA 2IVSA 5HO8A 1JSUA 1QPDA 4YJNA 4MXXA 3QBNA 3ROCA 3KL8A 4CLIA 5L2IA 2Z2WA 4FSRA 1XQZA 4RC4A 4EYJA 3HRFA 4HGLA 4C58A 4NKAA 4ACMA 4EH2A 2HZNA 4J98A 5GJFA 2HZ4A 3IDPA 4AZWA 4QP8A 2PE1A 2A4LA 3SQQA 1IG1A 2B9HA 4RX9A 4N6ZA 4JXFA 4D5KA 4YMJA 2O3PA 4HNIA 3FL4A 5E8SA 4BHNA 4C4GA 1Q5KA 1ZYLA 5C03A 3A7GA 5HOAA 1XH7A 2A0CX 2GSFA 4EKKA 3IQ7A 4M0YA 4BN1A 2PE0A 3PZHA 4HYSA 3C5IA 3OTVA 2W5AA 5FXQA 3COHA 4AN3A 3MH1A 4G17A 3WF8A 1ZAOA 3KFAA 2F7XE 4TYHA 2NPQA 1WVXA 5DVRA 2O65A 5CU2A 2BRGA 1GZKA 2OF4A 2PVRA 5HZNA 3ORPA 4FSNA 1UV5A 4CT1A 3MWUA 3DOGA 4M67A 4X2JA 2BRNA 3DV3A 1LEZA 1QPCA 3MH2A 3RPYA 3KKVA 5K3YA 1NXKA 2ZDTA 1OPLA 3ALOA 3QZGA 4FTNA 3VIDA 2R9SA 4D0XA 5CQWA 3U6JA 2BZHB 1OBGA 3LKMA 5HU9A 3G0EA 3RCDA 1REJA 4I5MA 3QQLA 3A7IA 4BI0A 5EHOA 3IW6A 3EYGA 4DFZE 2JIIA 4TZRA 4V01A 3Q96A 4FSTA 4JDIA 3CJGA 3VHEA 3GT8A 4MK0A 3TDVA 3ZDIA 4DH5A 3VS3A 3PJ8A 3VBXA 3TT0A 2UUEA 3WZUA 2GQRA 4AZVA 2FSMX 3ERKA 3MVLA 4MXCA 2BALA 4CG9A 4FV9A 2GMXA 4AOIA 4WNPA 4GSBA 2WB8A 3RINA 4D0WA 5L4QA 4ZMFA 5LVOA 2EXMA 4ZSLA 3F82A 3UO6A 3SXSA 3QA8A 4BIBA 2B4SB 4DGLC 3COMA 4HGTA 4JL9A 4FA2A 5IEYA 4S32A 1IR3A 5A6OA 4I0SA 4W4XA 2HIWA 2ZB1A 2B9IA 3QD3A 5ANDA 3W8QA 3NEWA 4AGDA 4GK3A 4YR8A 5ACKA 5IU2A 4Y8DA 3BELA 3MJ2A 3I5ZA 3RBWA 2XM8A 3WZEA 3RZFA 1BX6A 1NVRA 2BIYA 4FL1A 4FV7A 2F9GA 4EJNA 5IDPA 2BAJA 1HOWA 4I5HA 4WNOA 5LMBA 2C68A 2WOTA 3NAXA 4YTHA 2R2PA 5CZHA 4XG3A 4RIXA 1NVQA 2X6DA 5EYCA 3NIZA 4UZHA 3ZUVA 1E9HA 3DZQA 4RZVA 3JVRA 2HCKA 2BAKA 2HENA 2W4JA 3FI3A 3QRJA 3DLZA 3F5XA 4I20A 4K8AA 4M3QA 5E8UA 1PY5A 2HAKA 4IVAA 2CGUA 3LQ5A 3PXFA 4IWDA 4FYOA 3RAWA 3DXPA 4NIFA 5JQ8A 4X2GA 5FM3A 2CNUA 4UN0C 2W1FA 4LRJA 1ZLTA 3O8UA 4P5QA 4JR3A 4IVDA 4MAOA 5CF4A 3N9XA 1LEWA 2XKFA 2H8HA 3DT1A 2W1EA 4IDVA 2IVVA 2O64A 4E5WA 4PP7A 3FPMA 1JKLA 4H1JA 2UZLA 5M53A 1W83A 3D0EA 4CT2A 1W84A 1GZOA 3FY0A 4YHTA 5A14A 3HMPA 2ZM1A 3ORLA 5BVOA 3QX2A 5CXZA 4FZDB 3ZFYA 3HV6A 5M4UA 2UVXA 2X8EA 4ARKA 5JMSA 3OY3A 2Z7QA 3EQBA 4MWHA 4V0GB 4B0GA 3MI9A 2UZOA 4D5HA 1S9IA 3VBTA 3QX4A 4TWPA 4K1BA 5FWKK 4BBMA 2B1PA 4IVBA 4ZSEA 2ERZE 2XRWA 3FZOA 4FKPA 2BIKB 3EQRA 4O0TA 3GCVA 4BWPA 3FKLA 3UBDA 4NTSA 3KVWA 5E1EA 3IW4A 2NRUA 4LRKA 4RVKA 3F3ZA 1X8BA 3ULIA 2LGCA 4ZXTA 4FT7A 4U0IA 4TNDA 5AWMA 4CFUA 4BDEA 4QOXA 2QD9A 2O63A 3EFKA 1Z5MA 2JKKA 2ITTA 4RIYB 4IX3A 3VS7A 4C3FA 5GHVA 2BKKA 4MWIA 3OCBA 4L01A 3E87A 3K2LA 4RC2A 5HVJA 3AXWA 5IISA 4DN5A 2J51A 4FTOA 4EZ7A 4K6ZA 4WHZA 3W2PA 2QOBA 4RVTA 4JR7A 4R3PA 5L8JA 2R3QA 3EYHA 5DMZA 2YIRA 4YZBA 4X6QC 5HG8A 4BCGA 1XR1A 2C6IA 5AV2A 4G6OA 4F9CA 1UKHA 5B2LA 4DFBA 2C4GA 3G0FA 3ZH8A 3SRVA 2C3KA 3K3IA 1OUYA 3F3WA 3LAUA 4M12A 1JSTA 1YKRA 3ACKA 3C13A 3M11A 3F2NA 1PKGA 2YCRA 4D2TA 4U3ZA 3ATSA 1K9AA 3FXWA 5D41A 3V5JA 2IO6A 2HW6A 4XG7A 5EFQA 4W9XA 5DIAA 2PUNA 1WBPA 4I6FA 2BILB 3ZSHA 4LGGA 2UZWE 2EVAA 4B8LA 4G16A 1YI6A 2XRUA 4E8AA 3NVKI 4BYJA 1PF8A 3LM0A 1JLUE 4XUFA 5CU3A 2G2IA 4F1MA 3S3IA 4M69B 2B9FA 4D4SA 4I3ZA 1M14A 3IDBA 3Q04A 3I6WA 4CFVA 3V51A 4QMWA 3I81A 3L9NA 3DFCB 1PXNA 2C3IB 3E88A 2X7FA 5LQFA 4DGNA 3AT4A 3U51A 5DNRA 2V5QA 2WQMA 4Q5HA 1U5RA 4U5JA 4XP3A 3KF4A 2W1HA 2WMUA 3NYOA 2BRMA 2BZJA 4I1ZA 2OZAA 3M1SA 4JBPA 1YRPA 4NT4A 4RRVA 1AGWA 4IZYA 4EOKA 4WBOA 3IW5A 1UNHA 4H05A 4FTTA 4CMUA 4NJDA 4RX7A 4E6QA 2EU9A 1W7HA 2J0JA 3BYSA 3RNYA 1JBPE 4HCTA 2OF2A 4YJUA 2RFNA 1XJDA 3MIAA 4FC0A 2YFXA 4UV0A 5KHXA 4NM7A 2QI8A 1OB3A 2FB8A 3R21A 5EM7A 5C1QB 4XOYA 2UW0A 5A9UA 5DEWA 4IH8A 3QRKA 4CZTA 5C27A 4DFUA 2PMIA 4WUNA 2R3LA 4O2PA 5EQPA 1YW2A 4IW0A 4ZMEA 3QFVA 3KF7A 4GV1A 5J9YA 4ZK5A 4ACHA 4DCAA 3SW4A 5EHLA 3ZRMA 2ITWA 2WTWA 3FJQE 4U43A 4ACDA 4L3PA 2I7QA 2YM4A 1Y57A 1P4FA 3D7ZA 1V0PA 3IW7A 3KXNA 3SOAA 3RHXA 4F65A 5J7BA 3UDBA 3NNWA 3RJCA 5IDNA 5M56A 2WGJA 4R1VA 1Z9XA 4L43A 4F99A 4BBFA 5AUTA 2OXYA 4AT4A 3RPRA 4EK3A 3MJ1A 4QNAA 4QQCA 5HESA 3QTXA 4J97A 2YJSA 2ZM3A 4RGJA 4GFOA 3W10A 2FVDA 5CTPA 3PPJA 1YOMA 3R1YA 4IM3A 2VTMA 3PE2A 3BKBA 2VRXA 3R7OA 5BUJA 3RAIA 4XV2A 3DXNA 3KRJA 5DH3A 3PA4A 5TT7A 1OITA 4FICA 5EG3A 3VF8A 4F7NA 2PHKA 4XV9A 2HYYA 2VTQA 4O82A 2HXLA 3BBWA 2R3IA 3IGGA 3BEAA 4AS0A 3KRWA 2IZRA 4CFFA 5B7VA 5H9BA 3NMUF 3FXZA 3MPTA 3OY1A 3EOCA 3L9LA 4BZOA 4IAZA 4KSQA 2V55A 4R5SA 3V5QA 3KMUA 5HE0A 4EZ3A 1H1WA 1KE9A 5A3XA 4S31A 5C01A 4O7ZA 4O21A 4DYMA 5EYDA 4QYGA 1XH9A 4QYEA 3OUKA 4DEHA 3E8NA 1Z57A 2VTPA 3DDPA 4AGUA 2WU6A 4K0YA 4EH4A 3O96A 3TZ9A 2R3FA 5K5NA 3T3UA 4R8QA 3UJGA 3HMMA 4IBMA 3R83A 3F5UA 3QQJA 5CSXA 4AG8A 1UU7A 3ULZA 3F66A 1Q8ZA 3CXWA 2QHNA 3LJ0A 3TNQB 3Q9YA 4LV5A 4M14A 3G2FA 2V0DA 3PJCA 3D9VA 4EOMA 3SW7A 3L8SA 3OTUA 1O6LA 4FG8A 3VULA 1H24A 5H8EA 5AR4A 4EOLA 4I93A 2W1GA 2X6EA 3KREA 3W2QA 4DTBA 3D94A 2RIOA 4R77A 2QO7A 4BI1A 2OJGA 5CVGA 2BFXA 4DEGA 3W33A 5DRDA 5CQUA 4FK3A 5CAVA 2Y4PA 3QRIA 4C2WA 4O0YA 4V04A 5EM8A 4ZTRA 2BZIB 2GNHA 4FVRA 4QP3A 4WG5A 5DA3A 4A9SA 2XMYA 2XZSA 5M07A 2BPMA 2E9UA 4QT1A 4X3FA 3RHKA 3TWJA 4EEVA 5LVPA 1YOLA 3OEZA 2X2KA 2X7OA 1F3MC 4U7ZA 3PRFA 3O2MA 1XBBA 3U54A 2VTJA 3FZRA 3C9WA 2XNNA 4FKQA 4QP7A 3QL8A 3ZM4A 4EHGA 4RZWA 3R1NA 4BKZA 2BKZA 4XS2A 4M15A 4YLJA 2XNMA 5AR8A 4CFNA 4RIWA 2C5YA 1OECA 4DC2A 3QUDA 1WAKA 5I9YA 4IM0A 2Z7RA 4FSWA 4BR3A 5DR2A 4LL0A 5LOHA 4EI4A 4AXAA 4A7CA 4EZ5A 3NDMA 4FSZA 4GL9A 5JFVA 5A4EA 1APME 2GPHA 1WBTA 4L53A 2VTRA 3BHVA 3UNJA 3UOHA 5HIDA 5DEYA 5H2UA 1URWA 2RL5A 4BCNA 2EXCX 3WZKA 1SM2A 3CKXA 4EYMA 1F5QA 1ZY4A 3GBZA 4BDCA 1J3HA 5CNNA 5CX9A 1A9UA 4IQ6A 3EQFA 3UZRA 1Y8YA 4GYIA 4PPAA 2VWUA 4D2RA 4RC3A 4B99A 5HNGA 5J79A 2ZMDA 3OCGA 2B53A 3QHRA 4GK4A 5CS6A 5T3QA 4F08A 4O7NA 3MB7A 5FQDC 3OOMA 3UP2A 2CKPA 1JQHA 4I0TA 4BCMA 3BQCA 4I21A 3ID6C 1IEPA 2C6DA 2JFMA 2XIXA 5M4FA 2XK6A 3BE9A 4AW2A 1SMHA 2CPKE 3EB0A 5HLPA 4C8BA 4MNEA 1VR2A 4RBLA 3G90X 5F4NA 1PKDA 5DLSA 3UIUA 1L3RE 4KRDA 1QPJA 4BDFA 2WKMA 3R8UA 3PVWA 4DBXA 1MUOA 3R7EA 2VWVA 2BZKB 2JGZA 2OIDA 4OTWA 3U4UA 2PZ5A 3Q2MA 3Q53A 4U41A 2Y6OA 5KMIA 4OW8A 4Q9ZA 4AA4A 5FBOA 4IZ7A 2C0TA 3P79A 3FWQA 3Q4ZA 4FZFB 4EUTA 2WTVA 2PZYA 3MPMA 4ZS0A 5CT7A 2Z8CA 2R7IA 2B55A 3OROA 1XH5A 2C0OA 3G9NA 3HVCA 2X0GA 4JDHA 5G6VA 3ZZEA 4BWKA 1MRYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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