5CT7A

Braf in complex with raf265
Total Genus 78

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
273
structure length
257
Chain Sequence
DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLAGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of RAF265: A Potent mut-B-RAF Inhibitor for the Treatment of Metastatic Melanoma.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 78
structure length 257
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ct7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ct7A01
4ZSAA 4UYAA 5BNJA 4Y83A 1PXLA 2QHMA 2EVAA 5I9WA 2J0KA 4GFOA 4B7TA 4BDJA 2W4KA 3EL8A 4Y8DA 4EWHA 3LPBA 3ZDIA 4UMPA 4F1TA 3D14A 3FSFA 2YJSA 5DMZA 1MRVA 3LIJA 3ZH8A 3TUCA 3G15A 4I5MA 3OHTA 4DLJA 4LOPA 3SDJA 4CZTA 3BHVA 1YW2A 2PVYA 3OF0A 3QL8A 4XBRA 2GNHA 2HENA 1XH5A 4KUJA 5D7VA 2J0IA 3GVUA 4OTHA 5HNIX 5JGAA 2DWBA 5CX9A 4IXPA 1O9UA 5AR2A 4QMTA 3D83A 4QMNA 3HDMA 4FVPA 3FPMA 3NW5A 4QTDA 3HP2A 2J90A 1FVVA 2XK4A 4CTBA 4D58A 3CY3A 2R9SA 3C51A 3BI6A 4EH4A 4NCTC 4Y95A 3TJCA 1QPEA 5BVKA 4QMVA 5I3OA 4FKQA 4UYNA 3CQWA 3VBXA 5CEMA 2NRYA 3BQRA 5C4LA 4IAIA 4R78A 1H25A 5EDPA 1P14A 4NYEA 1CTPE 3JVRA 3KMMA 4UEUA 2DUVA 2PE1A 3EJ1A 3DFAA 5T6KA 4L3LA 2Y9QA 4IJ9A 4FICA 5FGKA 4I93A 4KIOA 4TTHB 2IZUA 4IB5A 4CT1A 1PF8A 2VO7A 4RX7A 1PXOA 3C4WA 5D9HA 2XNEA 4O0YA 4X2GA 3HMMA 5E8SA 3UP2A 3G90X 4D28A 4X2NA 4Q5HA 4FOBA 3HYHA 1U54B 2PY3A 2VN9A 4TYEA 3F9NA 4IJPA 4DA5A 4ZSLA 1TKIA 4FIHA 3FSKA 3KF7A 5M4FA 2B52A 3GQIA 1YXTA 3KK8A 4I6BA 5EK7A 5BVWA 2R0IA 4AUAA 4EL9A 5DBXA 5HD7A 4L44A 3IW8A 1JSVA 2WO6A 3KRRA 3V5JA 5HG9A 3KULA 4PL5A 3VW8A 1OB3A 2O2UA 1WCCA 3SQQA 2HAKA 5T3QA 4AACA 4DTAA 3QGYA 2C5VA 3DZOA 3RK9A 4WT6A 3ZXTA 2I0VA 5H9BA 2J50A 2ITPA 4BHNA 5EM5A 2XM8A 3K5UA 2B9IA 3QCSA 3ZSGA 1KOAA 2V5QA 4U79A 4G16A 3I60A 2PE2A 3BBWA 4IVCA 4CFMA 4QQ5A 2I7QA 5ETCA 3FI8A 5HO7A 3P1AA 3W2QA 4YZDA 2W0JA 4NK9A 2V0DA 3GU7A 4I3ZA 4ACCA 4RRVA 2NNWB 5HE2A 3HA6A 1H4LA 1O6LA 3OZ6A 3VUIA 3GQLA 3EN4A 2QVSE 5DRBA 2O63A 1SNXA 1SZMA 4WG5A 3NWWA 3S1HA 3G0EA 4YP8A 4GK4A 4YJSA 2BDFA 3I1AA 3O8UA 5FWKK 3RGFA 4IMYA 4AGUA 3O17A 4G31A 4GT4A 3F7WA 4YZMA 4H3QA 4YZCA 3BGPA 3LLAA 3P23A 3AT3A 4WBOA 3RK5A 3WE8A 3SOCA 2EXCX 3H9FA 4C58A 3DAJA 4DGNA 3OUKA 4NKAA 4QTEA 4HGEA 3LHJA 3DPKA 3UO4A 5A4QA 4QP3A 4J97A 3FLNC 2ONLA 4NSTA 4EHZA 4F9WA 3DJ6A 3LQ5A 4XV9A 4AT4A 4D9UA 2I0YA 3PJ3A 4EONA 5LQFA 3DXPA 2V22A 1YDSE 2W4OA 1OPJA 2FUMA 4HVGA 3AQVA 3DFCB 3P7CA 4DG0E 5IH6A 3GU5A 4RJ5A 2BDWA 1W83A 1JPAA 3FLQA 4EOSA 3D7TA 5GZAA 2XNOA 3ZM9A 4AA0A 1YXVA 2XK8A 2C3LA 4MXCA 5EDQA 3ZXZA 4BIEA 3VS5A 2YIRA 1IA8A 3CTJA 4CZUA 2AUHA 3BYVA 4NTTA 4EH9A 4F64A 4L7SA 3HZTA 4FSWA 4YLKA 3VHKA 2J0JA 2I1MA 5IQIA 2R3LA 4R8QA 2GNIA 4F7JA 5LCJA 3I0QA 3O96A 1VZOA 4BTJA 4JG6A 2R7IA 1UV5A 5CTPA 5CEKA 3ZBXA 4NW6A 4EQUA 3PA3A 2JBPA 5CU2A 4BCMA 3ELJA 5AJQA 3SVVA 2W9ZB 4USFA 2IPXA 4HGSA 3ULZA 2YDJA 4MBJA 3RPVA 4TYIA 4RPVA 4F7SA 4HPUE 4RC2A 4BCHA 1PHKA 4L68A 5DR9A 5B0XA 3VO3A 4BCPA 4LGHA 3LQ3A 3AXWA 4FTLA 4EHGA 3O7LD 4N6ZA 5L2QA 4M12A 2XIKA 4MHAA 4F7LA 3TCPA 1CDKA 4M3QA 5FG8A 2YEXA 3KVWA 4AGDA 2GNFA 2H9VA 3DJ7A 4QMQA 3LCKA 3RM6A 5CSPA 5L6PA 2BKKA 2VTAA 4UWBA 5HGIA 4S34A 2VAGA 5AX9A 3A62A 1WZYA 3QRJA 4G3FA 3TV4A 4CLIA 2OH0E 2VX0A 3QALE 4MBIA 4ZTLA 5FM2A 4D4VA 1QPCA 2GHGA 2HELA 3FQEA 1WBVA 1WMKA 4F65A 3W8LA 4XOYA 2OXXA 4MEDA 4EH6A 1UVRA 2Y8OA 3NYNA 5M56A 1Q8YA 2PVFA 3HV7A 2O8YA 3Q60A 4LL5A 4O91A 4V05A 2IZRA 3AC4A 3FAAA 5JFWA 3RHKA 2YLEA 3VUMA 2CGUA 2OU7A 4F0GA 5AA8A 4ZAUA 5HU3A 3QTSA 3GCQA 3ZTXA 4ANOA 2ZVAA 2WAJA 3HV4A 3MBLA 4H39A 3HL7A 2PU8A 3GC0A 3MW1A 4O7WA 5FQDC 4PV0A 2IZTA 5HLNA 4YO6A 5K4IA 4NCTA 3FZPA 4NM7A 5DT3A 3TUBA 5LMKC 2UV2A 2PZIA 4O0RA 1ERKA 3FHRA 4ITIA 1BL7A 4O0SA 4RJ8A 3E92A 2LGCA 3F2NA 3OCSA 4ANNA 3TV6A 3GCSA 4BN1A 4NEUA 5EI8A 1PMEA 4FV6A 2WEIA 2GNGA 2W1GA 2C6TA 4PDOA 2G2HA 3DY7A 3VUTA 3ID6C 3F69A 5JFVA 4RJ7A 1PKDA 4C2WA 1TVOA 1A06A 4CMOA 2PK9A 4YJOA 2RSVA 3VS7A 3EN6A 2O0UA 1H07A 1Q97A 3RNYA 4AF3A 4RX5A 1GJOA 3M1SA 4FKRA 4P2KA 4L8MA 3WILA 4O84A 2REIA 5C1QB 3RTPA 5IA4A 4ACHA 4FV0A 1NVQA 4F1OA 4DGLC 4QTAA 4RIXB 4AWIA 5DIAA 4B99A 5B7VA 4GVJA 3FXXA 4F08A 2BRBA 3DB6A 3QZIA 4PL4A 3CPCA 4U45A 2YN8A 4C62A 4F99A 3RZBA 3ZEPA 2VTOA 2UW8A 3N4UA 2BROA 2YCRA 4B4LA 4F6SA 4XOZA 4AZFA 1CKIA 2YLFA 3TJDA 2XS0A 5HU9A 3VRYA 2HY0A 4WKQA 2YCQA 3U4WA 4EJ7A 3LFEA 1J7UA 5A6NA 2GS7A 3AMAA 3R2BA 5DEYA 4DBXA 4JIKA 5IQCA 2WELA 2FSMX 4M14A 5DNRA 2QU6A 3Q04A 3V04A 5IA3A 3FKNA 2XM9A 5LWNA 5E9EA 3KXGA 1MQBA 2QQ7A 5HNGA 4OAUC 4JDIA 3V5PA 4BFMA 5A46A 3KQ7A 4K11A 2W06A 4M13A 5CT0A 4MTAA 4XMOA 3C1XA 5EW8A 5IQGA 3W2OA 4C7TA 2JDTA 2VV9A 3QRIA 4JJRA 2ZOQA 4NIFA 5TE0A 4Y5HA 3VIDA 4II5A 5CEPA 2XUUA 4K8AA 4HYSA 4YLLA 4GH2A 2WOTA 3UE4A 2JBOA 5A4CA 4RIOA 2PHKA 3FUPA 4LGDA 3R8VA 4GYIA 4D1SA 5JGBA 4YZNA 5AR7A 4W4VA 1KOBA 2Y4PA 2VWBA 4L00A 3TXOA 3NYXA 4A07A 4CG9A 4AT5A 4B9DA 3Q9WA 2HOGA 2HWOA 2JKKA 2WMBA 5FTOA 4EYMA 1OKWA 5AIKA 3U4UA 5HX6A 2IVVA 5F95A 1QPDA 3BEAA 5CAVA 2ITOA 1Q8ZA 5JH6A 4PMMA 5BX0A 4BF2A 2V7OA 3LCSA 4UXLA 4CMUA 4FSYA 3RAWA 3QD3A 3ZM4A 2XJ0A 2C6EA 2F2CB 5E4HA 5KZ0A 2CCIA 3R7YA 1DI8A 4FTNA 4YC6A 1M52A 5C8KA 3HMPA 1V0BA 3UYTA 3P79A 4ZIMA 2YDKA 4CFNA 2OO8X 1FBNA 3VF8A 3UNJA 2WNTA 5E91A 4BKYA 1E1VA 2EXEA 3E3PA 4BCQA 3RPOA 5HIBA 1J7LA 3RBWA 3N51A 4LQMA 1URWA 2QURA 4OTFA 2PVKA 5IQFA 3L9MA 2ZV9A 3FMJA 3PXYA 2VWWA 2X7FA 2XYUA 4QQJA 3VN9A 4AG8A 4FZDB 4XBUA 3BE2A 3GU4A 3IW4A 1JVPP 5CS6A 4D4SA 4K6ZA 2VX1A 3W33A 3MGYA 4I5PA 3HV5A 4NU1A 2RFSA 3TV7A 4EJNA 3HV6A 1PXNA 3D2IA 4XG3A 5HHWA 5A6OA 2BRHA 4I22A 4FEVA 2OFVA 4BDDA 1DS5A 4XJ0A 4LUEA 4RG0A 5HVJA 2PMNX 4IVAA 3QGWA 3FQSA 4C37A 4QYEA 4FT7A 4DCEA 3ORPA 4RBLA 3MPAA 4FKPA 1H0WA 3IOPA 1H26A 5DT0A 3F3ZA 3KU2A 4HW7A 3QHWA 1LR4A 3ZSIA 5M57A 1H1RA 3E8CA 2WIHA 2WB8A 4TPTA 1WAKA 1ZRZA 3FY2A 4TNBA 3E7VA 3RINA 3DAEA 4V04A 4AW0A 3EQPA 4OBPA 1F0QA 4O7LA 1YOLA 2QOIA 5JRQA 3A2CA 1V0OA 5HE0A 2UW6A 4UBAA 4XH6A 3HECA 2ITYA 4YTHA 2YM5A 4X3JA 3VS2A 4FR4A 4YSJA 5HIEA 5CY3A 1JAMA 3P08A 4MXYA 4HGLA 4ASXA 2W05A 4K77A 5BVOA 3GT8A 3GEQA 3I4BA 5KMOA 3BLHA 2GCDA 3FYJX 3G9NA 3NS9A 3CJFA 2R3PA 3SX9A 4YHJA 2A1AB 5IEVA 1BYGA 2HZIA 3OTVA 4S32A 5HCXA 1NXKA 4WG3A 2HY81 3EHAA 4CV9A 3DDPA 4A06A 2VTIA 4G3CA 3UOKA 5IKWA 2VTSA 2F7XE 3QAME 1JLUE 4AT3A 3PVUA 4Z7GA 5KBQA 2HWPA 3ZU7A 2PUUA 4HCVA 5AWMA 4G3DA 2C5XA 5E90A 4AS0A 4DC2A 5DOSA 3QQGA 3WF7A 4D0WA 3V6RA 2QD9A 3QBNA 2HCKA 4I24A 4QPMA 4ENYA 1KSWA 3DGKA 4CXAA 2ZV8A 2IO6A 2OIQA 3R7UA 4YGAA 5IA2A 4Y73A 2C6MA 3Q5IA 2OIBA 4DH3A 5FP5A 3I6UA 3KRLA 4E8AA 1G8SA 1IA9A 1PYEA 5I3RA 3AD5A 5I9XA 2R3FA 4MKCA 3CD3A 1OIUA 3AC3A 3H4JA 4U43A 4ZTRA 4J52A 4LRJA 3W55A 5JFXA 4OTGA 3Q4TA 4ITHA 2A19B 2BVAA 5HLPA 2Z60A 3BHTA 4PWNA 1G8AA 3LKMA 5I9ZA 5FBOA 4RZWA 5DN3A 3EFJA 3KY2A 3MY0A 3Q9YA 5HEZA 2XK7A 4UV0A 5HI2A 3UTOA 5J5SA 4EZ7A 1PMVA 4L3JA 2VO0A 3MVJA 3M11A 3S95A 2W1FA 2R3HA 3NDMA 2XF0A 3PRFA 3NCZA 5LVOA 5EHLA 4LRKA 4C0TA 3WIGA 3U8WA 3FEGA 4M0YA 4BZNA 3GOPA 1H28A 4RWLA 4JLCA 5LOHA 2ITWA 3GI3A 3SXSA 2CHLA 3KRXA 3MTFA 4YMJA 5BVFA 5BYYA 2UZOA 4DT9A 2YACA 3TKIA 2IZSA 2XEYA 3PLAE 3D5XA 4C59A 4RIWB 5L8JA 1QPJA 3OS3A 1H24A 3LFNA 4FF8A 4FNZA 4M69A 3QLGA 5EFQA 4UALA 5C03A 3A7JA 2XA4A 3L1SA 3A60A 4MNFA 4XLVA 4C38A 4FI1A 1WVYA 2UW3A 4G3GA 4TKSA 5EI6A 2OJFE 4YZ9A 5A4LA 3S3IA 2WU7A 4R7BA 4KIQA 3PJ2A 4MH7A 3SA0A 3C4FA 4JDHA 5TOZA 3UVRA 4OR5A 3DB8A 4YC3A 5DHJA 5CF6A 3GUBA 2CGVA 2FSLX 3NGAA 3LFBA 4GJ2A 4FV3A 3R28A 1PY5A 4RJ6A 3VVHA 3FZSA 5AUUA 2JITA 3HRCA 3ODYX 3JPVA 3PVGA 3FJQE 4FYOA 4IWDA 4WD5A 3DXQA 4JNWA 4O0WA 1P4FA 4EKLA 5G1XA 3PIXA 3M2WA 3QYWA 5C26A 3HAVA 2JDSA 3OCBA 2QO7A 3AC8A 4LI5A 1RJBA 3BYMA 4IVDA 5CSXA 4ZJVA 4MD7E 2QKWB 1UNHA 5CEIA 4L45A 3LCDA 3RPYA 4XG7A 2QG7A 2NPQA 5EOBA 4B8LA 3SRVA 4FSNA 3V8TA 2YM3A 4WUAA 4EOPA 3R9HA 3OC1A 1RDQE 2YWPA 4IE9A 2OF2A 5ACBC 4E6QA 2YZAA 4AW5A 4X0MA 4HCTA 3FL4A 3TI1A 2WMTA 3R8UA 2BIYA 4CD0A 2PYWA 4AOTA 2PVLA 3QUDA 2WTWA 4RX9A 4YO4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5FGK A;  4I93 A;  4KIO A;  4TTH B;  2IZU A;  4IB5 A;  4CT1 A;  1PF8 A;  2VO7 A;  4RX7 A;  1PXO A;  3C4W A;  5D9H A;  2XAR A;  2XNE A;  4O0Y A;  4X2G A;  3HMM A;  5E8S A;  3UP2 A;  3G90 X;  4D28 A;  4X2N A;  4Q5H A;  4FOB A;  3HYH A;  1U54 B;  2PY3 A;  2VN9 A;  4TYE A;  3F9N A;  4IJP A;  3P5J C;  4ZSL A;  4DA5 A;  1TKI A;  4FIH A;  3FSK A;  1W2C A;  3KF7 A;  5M4F A;  2B52 A;  3GQI A;  1YXT A;  3KK8 A;  4I6B A;  5EK7 A;  5BVW A;  2R0I A;  4AUA A;  4EL9 A;  5DBX A;  5HD7 A;  4L44 A;  3IW8 A;  1JSV A;  2WO6 A;  3KRR A;  3V5J A;  5HG9 A;  3KUL A;  4QDE A;  4PL5 A;  3VW8 A;  1OB3 A;  2O2U A;  1WCC A;  3SQQ A;  2HAK A;  5T3Q A;  4AAC A;  4DTA A;  3QGY A;  2C5V A;  3DZO A;  3RK9 A;  4WT6 A;  3ZXT A;  2I0V A;  5H9B A;  2J50 A;  2ITP A;  4BHN A;  5EM5 A;  2XM8 A;  3K5U A;  2B9I A;  3QCS A;  3ZSG A;  1KOA A;  2V5Q A;  4U79 A;  4G16 A;  3I60 A;  2PE2 A;  3BBW A;  4IVC A;  4CFM A;  4QQ5 A;  2I7Q A;  5ETC A;  3FI8 A;  5HO7 A;  3P1A A;  3W2Q A;  4YZD A;  2W0J A;  4NK9 A;  2V0D A;  3GU7 A;  4I3Z A;  4ACC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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