5CXZA

Syk catalytic domain complexed with naphthyridine inhibitor
Total Genus 93

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
275
structure length
269
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVTDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Orally bioavailable Syk inhibitors with activity in a rat PK/PD model.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
total genus 93
structure length 269
sequence length 275
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cxzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cxzA01
1KE9A 4BN1A 3LJ2A 5ETCA 3LQ3A 2C6EA 2WEVA 3O2MA 4I0TA 5EYMA 4DHFA 3FZSA 4G9RA 3F61A 3QA0A 4K2RA 5TOZA 5C9CA 2IVTA 4H05A 3PY3A 3ORKA 5IQIA 3FEGA 5F4NA 3ODYX 3OXIA 3WE4A 4U5JA 5HNBA 2HK5A 3MWUA 3CPBA 3QTSA 1YVJA 2R2PA 2VX3A 3BYVA 4FV8A 5CYIA 2IVSA 1XQZA 2BTRA 4FV9A 3Q9XA 1Q8WA 5T68A 5FM3A 3T9TA 1OPKA 5FP6A 4KIKB 1XHAA 3NPCA 5DT0A 2VX1A 5EQEA 4O0TA 3IW8A 5KNJA 2QOIA 2W99B 3Q60A 5E8YA 2UZEA 5CEIA 4YSMA 1YWRA 4J97A 3KGAA 2A1AB 4N0SA 4P2KA 2XKCA 2NNWB 4NH1A 3PXFA 4OTHA 3ROYA 5DMZA 4MXCA 1UVRA 4HNIA 5I9WA 1PMUA 5CQUA 2OH0E 5G6VA 4DLJA 4EUTA 3NRMA 3O8PA 4LM5A 1MQBA 3RBWA 4HVGA 1CKIA 5L2TA 4XRJA 3FL4A 4C62A 3ZMMA 4K11A 5EI2A 4F99A 5TT7A 1J7UA 2OGVA 1PXJA 3R1SA 2QO2A 4JG8A 5KCVA 3C0HA 2ZM1A 4GMYA 4KUJA 5M06A 3G51A 2VNYA 5L6OA 1KE7A 2BAJA 3H10A 1OZ1A 1VJYA 4BZOA 4C02A 4OAUC 4XX9A 4L44A 4CMTA 3SVVA 5AUXA 3LM0A 4KAOA 5CSVA 5BVNA 3R28A 1J3HA 2XRUA 4ZLZA 3AD6A 4G5PA 5ANIA 5GNKA 4O0VA 3T8OA 1I09A 2XH5A 3L9NA 3PZHA 2I0YA 2XIYA 2IO6A 2O5KA 1PKGA 1ZOEA 5D10A 5AIRA 3R8MA 4D9TA 2Z7LA 3LFSA 3V6RA 3NCGA 4IFGA 3FY0A 4L00A 3OF0A 4M8TA 3R7UA 1PRYA 3V5QA 4EJNA 4ZSAA 2UZBA 1RJBA 3P23A 4BZDA 1OITA 4CRSA 3VC4A 3HRCA 4YTHA 4XV2A 5AUVA 4D2RA 5IQCA 3I7CA 3R02A 3MPTA 4I3ZA 4J98A 3OY1A 4EH3A 4DCAA 3OTUA 4BI0A 5CASA 4LUDA 3R71A 1CKPA 4I93A 3A7IA 3OVVA 3R9OA 5HNIX 4F7LA 4CFNA 3ORZA 4RA5A 3UIMA 1JSVA 3FMJA 4DFBA 1ZZ2A 1Z9XA 4ZOGA 2QOHA 2A2AA 4O82A 2BTSA 4YO4A 4FTRA 2B4SB 5IKWA 3DQWA 1DI8A 2W06A 4KB8A 4MHAA 2VGPA 3HA6A 2ZB0A 4U8ZA 5EG3A 3FV8A 3HRFA 3EZVA 4PF4A 1GZNA 5T6KA 4ZMFA 1ZARA 2Y7JA 3C0GA 3KB7A 4CEGA 5B2MA 3Q5ZA 4AZVA 4F9YA 3DK3A 2PSQA 5A3XA 2WIHA 1H4LA 4C3PA 3ATTA 4ENYA 1YOJA 2R9SA 2XMYA 5A9UA 4UWYA 5KMLA 3BPRA 4LGDA 1WBVA 3DGKA 4ZJVA 5HTBA 4MNFA 3F7ZA 2PUIA 4V0GA 1UU3A 3POZA 4A4XA 4QPMA 4YLKA 1J7LA 5E4HA 4EK3A 3DTCA 2G2FA 4QYFA 4MKCA 4OAVB 1YOMA 3DK7A 1GIHA 4BBEA 4HZRA 5CEOA 4PDYA 4O7TA 4BCKA 4BY9E 4KWPA 2ZMCA 4XV3A 3QD0A 4IWOA 2GFSA 2I6LA 1WBPA 3TCPA 5LVNA 4E5WA 4D1XA 3S95A 3BBTB 1ZAOA 3OBJA 4M0YA 4CSVA 3F5PA 2OJJA 3PY1A 1SMHA 4X2FA 3REPA 3GOPA 2R3RA 4L3JA 4NM7A 5CEQA 2YWVA 3FMKA 3A8WA 4O7LA 4A9TA 2UW4A 4Z16A 3LFFA 4AAAA 3FWQA 4F9BA 2FSMX 3VUMA 3EQBA 2GTMA 4GK4A 4C33A 3LCDA 4EH2A 5AP1A 3M2WA 3C50A 3GU5A 3G9NA 1M17A 2C6MA 2O65A 2OIDA 3BEAA 4K1BA 4NM5A 4QMXA 3FC1X 4FZFB 4AA0A 5KBRA 4ZMEA 4MVFA 4IX6A 2BRMA 4CYIA 4EQUA 3QD2B 1Y6BA 4YLLA 5IMXA 4ZS4A 5AP3A 3W2OA 3RNYA 5HG7A 1U5RA 1IRKA 3RHKA 4CTBA 3V3VA 3E93A 3UP7A 3SOCA 4JBOA 4XG2A 1JLUE 3OC1A 1SVHA 4YJPA 3OG7A 2JAMA 4RC4A 5EM7A 5IUGA 5DHJA 3MW1A 3QZGA 4II5A 4U42A 4G3GA 3PSBA 4YHJA 4QP8A 4TYHB 4GIHA 1GZOA 2AUHA 3BGZA 2EB2A 3VUTA 2Q0NA 3NIZA 1ZOHA 5I9UA 4RWIA 3LFNA 5ANOA 5CAUA 4LMNA 4KA3A 2YHVA 3PPJA 3JYAA 2PZRA 2CPKE 3NUSA 3R73A 4O22A 4YNOA 5FGKA 4BGGA 3LVPA 4H36A 3JVSA 4E1ZA 2F7EE 4HZSA 4IM2A 5FD2A 2C5OA 4BL1A 3DT1A 4FKOA 3DXQA 4O7RA 3W16A 4AWIA 1YHSA 3UG2A 3NW5A 2RKUA 2W0JA 3GENA 4YC6A 3NLBA 3NW6A 1H07A 1WBNA 5KE0A 4UWCA 1FVTA 5CZHA 5KMKA 4KIKA 5LJJA 4FVPA 4ACDA 4RFZA 4DTAA 4C61A 2HOGA 3BU3A 2NRYA 4FTNA 1H8FA 2ITXA 3PP0A 4IB0A 4FKJA 1Q4LA 4WUAA 4E6CA 2R3OA 2QLQA 1E9HA 4TW9A 1OPJA 1M7NA 4W4VA 2YIRA 4S2ZA 2ZAZA 4XS2A 4BKYA 3RNIA 2FSOX 3LFAA 2ERZE 4EONA 2J7TA 4BTKA 2ZDTA 2GNIA 3D94A 2KTYA 1PXNA 4DC2A 2X7FA 3E92A 3HP2A 2XS0A 4FODA 2FYSA 4ZZOA 4FNZA 4L6QA 4ZJJA 3GC0A 4CGAA 1XH6A 1H24A 1OL1A 4O0WA 2KULA 3OP5A 5BUIA 4DA5A 4MAOA 3V8TA 4BCFA 2W9ZB 4C59A 3QCYA 4UXLA 4KRCA 3OW3A 4BTJA 4C58A 4EYMA 4TL0A 4PP7A 2IG7A 3KF4A 3KULA 4FZ7A 4D0WA 3QRTA 1H27A 4KKGA 3W33A 4RWLA 3UOLA 3LCSA 3BV3A 4PNIA 2GCDA 5KO1A 2J6MA 1KSWA 2X7OA 3E5AA 3KCKA 4GFMA 4K0YA 1OKYA 2W7XA 5DLSA 1TQMA 1OMWA 3RGFA 5A54A 3Q6UA 3B2WA 3CD8A 1R78A 3ANRA 2V55A 4CFFA 4O21A 4L3PA 3BKBA 5IA5A 4FV1A 3QYZA 3FYJX 5C8KA 3S0OA 4WUNA 3QZHA 4FKVA 5AIKA 4BHNA 1PHKA 5CF6A 3EN7A 4O2PA 2W5BA 4HCVA 5C27A 2C68A 3PWYA 3PXKA 3K5UA 2O8YA 3EQDA 4XBUA 3B2TA 3L8SA 4M14A 4C37A 2ITWA 1PMNA 2R3IA 3AC5A 5CS6A 3E3BX 3GCUA 4FUXA 4U43A 4FG9A 1FBNA 3VHKA 3EQCA 4L7FA 4EQMA 1YXUA 2J4ZA 4EQCA 2HIWA 3K5VA 3O8UA 1PJKA 3ZBXA 2OXDA 3DTWA 3II5A 3MH2A 3R2YA 3EQHA 3N9XA 4M15A 2GNHA 2XEZA 2WOUA 2OK1A 3V8WA 3ULIA 4N6YA 3CJFA 1Y57A 3Q4CA 3EQIA 4RIXA 4E5AX 3QKKA 2UZNA 5HTIA 3KKVA 4Q2AA 4E6QA 3QKLA 4F0FA 3QZFA 3FI4A 3ETAA 4R1YA 3BCEA 3CLYA 3PA3A 3H9FA 2JAVA 2IPXA 4RQVA 2IJMA 3TZ8A 4QMTA 3FZRA 3KXHA 4PMMA 5IU2A 2QHMA 4BBFA 1J1CA 3FQHA 5M09A 5F9EA 3Q4ZA 3G0FA 4CVAA 5CZIA 5J8IA 2YN8A 4IAIA 1APME 3FZOA 4HPTE 5AP5A 3AT2A 3EQGA 3MTFA 1O6KA 2CLXA 3CQEA 4EYJA 1T45A 3HDNA 4ITIA 5CF5A 3FLZA 2QG5A 2X1NA 2BALA 2PMLX 4XP2A 5AUZA 3FMDA 2PVMA 4DEGA 3FUPA 4IAZA 2IZRA 5H8BA 3VJOA 4BDBA 4D4SA 4G3EA 5H8EA 3IECA 4YZDA 2JITA 1OIQA 3D7TB 2X6DA 3QRJA 4RX7A 1H0WA 3RI1A 4HVSA 3ULZA 5HKMA 4KS8A 3G6GA 4OW8A 5HU3A 5DWRA 2ACXA 2JDTA 4CZTA 2GS6A 5HQ0A 1KV2A 2WIPA 2V7OA 3DBDA 3W2PA 3TEIA 1ZYJA 5J9YA 4O1PA 3V51A 3LPBA 3QD3A 3WILA 4B0GA 3K3JA 2OO8X 4AX8A 4ZY4A 5BMMA 3TUBA 3EKNA 5BUEA 2XNEA 2WOTA 3R01A 3D5WA 3C7QA 4IB1A 4K6ZA 5DPVA 3GU8A 4XG8A 4AT5A 2R0UA 4DGGA 4R5SA 2XK4A 4X2NA 4BCIA 1UU8A 2C30A 3PXRA 3KRWA 3R63A 3R30A 5CWZA 2R3LA 2XJ0A 5M56A 2PWLA 2ZV9A 4TZRA 1YQJA 3OUNB 3F3TA 1OIUA 2C6IA 2QG7A 4R3RA 2XBAA 2ITYA 3WZEA 3ZUTA 5HTCA 3FI2A 3H9OA 2IVUA 4AGCA 2RFNA 4UV0A 1YKRA 5HO6A 4I92A 4CKRA 3R1NA 3V5PA 5B7VA 3OT3A 3C51A 4YJTA 1GIJA 4XYFA 3TNIA 3E8EA 3L9MA 2JDOA 4FSYA 3BHUA 4ENXA 2OZOA 1GY3A 3BQRA 5F20A 2H6DA 1Q8UA 2UV2A 3F6XA 4LGGA 4EOJA 1JNKA 1S9IA 5E8VA 2YEXA 3S2PA 3TL8A 1OM1A 4YU2A 1KV1A 2ETMA 5HORA 3OCSA 3AG9A 3AGMA 3DNDA 5GHVA 3HAMA 4BGQA 2UW8A 1YHVA 2YAAA 2I0EA 2XIZA 3RK9A 3NUPA 4XEYA 3TV7A 2OJ9A 3ZC5A 3IDBA 4CRLA 3MA6A 1W98A 5HO7A 2WQNA 3GFEA 4PMPA 3QQLA 2XRWA 4ANMA 5KKRB 4PDSA 1CTPE 3ALNA 3BLHA 4F6SA 4I6QA 3FC2A 2VTNA 3ORLA 5K4IA 1Y8YA 4UWBA 4PNKA 5EK7A 2LAVA 5FDPA 3VQHA 3I5ZA 3HV3A 5CU3A 2ITUA 1DI9A 4IJPA 5IDNA 1NVSA 4F0GA 1IA9A 2JEDA 2VTOA 5D12A 5LWNA 1YWNA 4TTHB 2V0DA 3NVKI 2XNNA 2W1CA 3OEZA 4I4EA 4XV9A 3LOKA 3TDWA 1UU9A 3OWKA 3U87A 4BICA 2Q83A 3ZBFA 2WQBA 5HU9A 5IQEA 5KX8A 4RZVA 5KZIA 2QI8A 4WG4A 3E8CA 4G6NA 2GHGA 4TY1A 5DN3A 4DH5A 4TNDA 2CNVA 2PZ5A 4ALVA 2WXVA 3FKOA 2G9XA 2AC3A 3HRBA 5HI2A 2BFXA 5KMMA 2QC6A 2WMSA 2YITA 4R8QA 4ITHA 4BF2A 3U55A 3GCSA 2W4OA 4IX4A 4X2GA 3RHXA 5C03A 4Y8DA 1MP8A 2C6KA 5DT3A 1VZOA 3WIKA 2ITQA 2WTDA 3FHIA 5KKRC 4UX9A 5IG1A 3EZRA 1WZYA 3O23A 5BNJA 2XIKA 4M68A 3BEGA 5ANEA 3PPZA 3UTOA 2JKQA 2W5AA 5ETAA 2JBPA 4QD6A 4DLIA 3R8ZA 3KRXA 4B7TA 5I9VA 4XLIA 4D1SA 1OKZA 4U41A 4BI2A 4ITJA 4NW6A 2ONLC 2Y4IB 4MNEB 4DCEA 3QC9A 4MYGA 4AW1A 2GSFA 4AQCA 4IJ9A 3D4QA 5FEEA 1Z5MA 4FTIA 2HZ4A 1CMKE 5ITAA 1NVQA 5HCZA 4HVDA 4C2WA 3W32A 5LMAA 4CFXA 4RLKA 3FZPA 4YJVA 1BL7A 3RK7A 5E7RA 4BTFA 3F3VA 5AADA 3SG9A 3RP9A 3MN3A 2HZNA 2X2MA 3C4CA 5HCXA 3OCTA 3FMNA 2GNJA 4PL3A 1UKHA 4BYJA 4CLIA 3SRVB 4PTGA 4DT9A 1A06A 1R1WA 2XIXA 3FI3A 3P7CA 5CAOA 4DGNA 4FTMA 1X8BA 4KBKA 3ZSGA 4F08A 3KMMA 3OZ6A 4CKIA 5A6NA 4MD9E 3E63A 4FICA 1DAYA 3OWJA 4RA4A 5JN2A 1OVEA 2GHMA 3WYYA 4X6QC 4DEEA 3VHEA 4U7ZA 3TG1A 2Y4IC 4DEHA 4LYNA 3DS6A 1STCE 3GI3A 4PQNA 1YDSE 2R4BA 3HX4A 2Z8CA 5CLPA 2CNUA 2FH9A 5HE3A 2VGOA 4CQEA 2A27A 2YIQA 4X6RA 3W2RA 4FSTA 1O6YA 1XR1A 3GNIB 4HGEA 4ZSLA 1DAWA 3UG1A 5HOAA 2XJ1A 5FM2A 4AE6A 4XJ0A 5IA1A 5CU6A 5HIDA 3TZ9A 4WG5A 4Y5HA 3KXMA 1URCA 2DYLA 3FJQE 3FMMA 3I5NA 3LIJA 3ORNA 4H58A 3ZUVA 5BYYA 4FTAA 2YIYA 2IW8A 1ZWSA 4RJ3A 3UC4A 4FSNA 4PL4A 4FTCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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