5D1JA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 (cdk2-wt) complex with n-[5-[[[5-(1,1-dimethylethyl)-2-oxazolyl] methyl]thio]-2-thiazolyl]-4-piperidinecarboxamide (bms-387032)
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
265
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEYGVVYKARNKLTGEVVALKKIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title N-(Cycloalkylamino)Acyl-2-Aminothiazole Inhibitors Of Cyclin-Dependent Kinase 2. N-[5-[[[5-(1,1-Dimethylethyl) -2-Oxazolyl]Methyl]Thio]-2-Thiazolyl]-4-Piperidinecarboxamide (Bms-387032), A Highly Efficacious And Selective Antitumor Agent
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 265
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5d1jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5d1jA01
2FUMA 2UUEA 5AA8A 3MI9A 2BVAA 2XNGA 5M08A 3P0MA 3COMA 4PL3A 2F2UA 4QTCA 5M4CA 3PLAE 2JDVA 4NUSA 5EK7A 1OKWA 2QOBA 5M51A 2JDTA 3MVLA 3TKUA 3IK3A 5TO8A 4ZY4A 3OF0A 4FT0A 4XV3A 4TL0A 5I9WA 2VV9A 2GHLA 2XNBA 3LJ0A 3PPJA 4JDIA 3QTWA 2QOFA 4DTKA 2UW0A 4TTHB 3H9FA 1CTPE 2W17A 4FKTA 2PVRA 5H8BA 3I0OA 3PXZA 1W98A 5A4LA 2CKEA 4MD8E 4QYFA 1DM2A 2FSLX 4GL9A 3PJ1A 2I1MA 3LFDA 4HVDA 2QC6A 3VS2A 4FKRA 2BCJA 4CFXA 4FL1A 3LCKA 4U43A 4L3LA 2YM7A 4HNIA 5JZNA 4D1XA 2OZOA 4X2JA 4EZ3A 3OCBA 3FLSA 5IG1A 2FGIA 2WAJA 3CY3A 2J2IB 3OCSA 4ACMA 5EQPA 3RCJA 2P2HA 5JGDA 2W1CA 5EM8A 3CS9A 5HORA 2H6DA 2RG5A 3LFFA 3PVGA 3DBEA 4FSWA 5LCKA 2B0QA 3QQUA 4RIXB 4CSVA 3PXKA 2FO0A 2W99B 4QP1A 2X1NA 3AT3A 2VTLA 3U9NA 3ZZEA 1VEBA 4O27B 2XEYA 4YJRA 3HKOA 2CGWA 3TNQB 3OC1A 4G17A 3QA0A 2IZUA 2XA4A 2XIYA 3E92A 1ZARA 1W8CA 2VTRA 4R7HA 5AWMA 5CXHA 3GNIB 4AT3A 4YTHA 3MY1A 5LQFA 3NUYA 2R2PA 3PA4A 2C69A 5FBNC 1TVOA 2B55A 3N51A 4MXOA 5IMEA 1ZMVA 4WNOA 4CYJA 3AD6A 2OI4X 1FBNA 3EQPA 4CRLA 2W06A 3QQLA 1JKTA 2Z7RA 2P2IA 3NW5A 4O0SA 5FEQA 2XMYA 3POZA 1APME 4FEXA 4BC6A 3EN6A 1CKPA 3UQCA 3UVRA 3QYWA 4BDAA 3HP5A 5FGKA 4BTJA 3K5UA 4AZEA 1OL5A 2Y4IC 1A48A 4IANA 1G8AA 3MB6A 5M44A 4Y5HA 2IVUA 4UN0C 4MAOA 3H10A 3EFJA 4I4FA 4RJ7A 4FZFB 4EUUA 5AR2A 3M42A 3PTGA 2JDRA 2J0MB 3AD5A 3S2PA 5BPYA 1XHAA 2QODA 3ZRKA 4AFEA 3L8XA 4FZ7A 1BKXA 2P3GX 3MB7A 3RPVA 5M4IA 1NY3A 2JBOA 3O50A 4HZRA 4Q5HA 3ZUVA 4I5HA 4ENXA 4G3FA 5GZ8A 2BFYA 2H34A 2A2AA 4QMYA 4M0ZA 2YM4A 3MWUA 5C8NA 4DFNA 5EQYA 5KMNA 3ZHPC 1Q41A 4CMUA 4DC2A 1F5QA 4HGLA 3TL8A 3U55A 4FTUA 2UW5A 4BCIA 3QYZA 1W82A 2XNNA 2BIKB 3OXZA 2VTNA 3O7LD 4L01A 4DEIA 3P9JA 4KRCA 4GT4A 2Y0AA 4ANOA 3KN5A 4XV2A 3EN7A 1JOWB 2PWLA 4BCJA 4O2ZA 3NUPA 1JNKA 2O64A 3KRJA 5BUJA 4ZSJA 1J1CA 2C1BA 4LOOA 2OJJA 4M12A 1JKKA 2R3JA 3UPZA 5IZFA 3R8PA 5BMMA 2JD5A 3HUCA 3ZU7A 4EBVA 4PQNA 2NRYA 4ACDA 3HRCA 5C27A 3WZJA 2WOUA 2R5TA 5CI7A 4YP8A 4D2WA 4WUNA 4FTAA 4ITJA 3JY0A 3KXNA 5DT4A 4AQCA 2EB2A 5HBJA 4FTNA 3G6GA 3NWWA 4FOBA 3ANRA 2UZEA 4FGBA 4FKLA 2WFYA 4MXXA 4AS0A 2C3LA 3C4CA 4IB3A 3RPYA 3C4FA 2GNJA 3DDQA 4HPTE 4O1PA 3TNIA 3JVSA 3RVGA 4L7SA 3LW0A 5HX6A 3TEIA 2JKOA 4W9WA 3BEAA 5LXMA 1ND4A 1ZOGA 3DT1A 4N4SA 3SX9A 5BYYA 4FYOA 3SKCA 1SZMA 2JFLA 3Q2MA 3A7FA 4FIHA 2VX0A 2OWBA 4HYIA 5FRIA 3UJGA 5IA4A 1PMEA 4BN1A 2P55A 1JBPE 5T68A 4CYIA 3U51A 3U54A 5K5NA 3CCNA 3PYYA 4GEOA 4RC2A 3ODZX 2WU7A 3IPHA 3PWYA 2I0EA 4TWPA 3SXFA 4BZOA 3WYXA 3HV7A 3WYYA 4RFMA 4HGTA 1KV2A 4LRJA 2VWZA 4TYGA 1EH4A 3I79A 3R9OA 3P79A 3ZBXA 2PMNX 3LFEA 1CM8A 1YHWA 4GUEA 1WVXA 3KVWA 1OECA 3ZFYA 1JLUE 1R3CA 2XK9A 3ITZA 4O0VA 4TRLA 4BDFA 4H1MA 2W7XA 4RIOA 5D7VA 2IW9A 4D5HA 1Q8TA 5JFSA 1UU3A 3NCGA 2QKWB 4UB7A 4IEBA 4IH8A 1KE9A 2R0UA 4FNZA 3DAJA 4N6ZA 2CLXA 3BLHA 1KSWA 5CTPA 3VUTA 4EOKA 4F4PA 3AC1A 1MRYA 5CSWA 4YZBA 1BX6A 2QO7A 5CVFA 2I7QA 5AUWA 3U6IA 3ZUTA 4EI4A 3JYAA 3P5KA 2PVFA 2X8DA 3TIZA 2GNIA 2W1EA 3CC6A 1OMWA 3E5AA 5BVEA 2R9SA 3P78A 3KRRA 5KMIA 3BYOA 1H1WA 1CSNA 3AMBA 3OXIA 1ZRZA 1KOAA 2ZV9A 1Z57A 2E9UA 3QWJA 3II5A 3R6XA 2EU9A 4H39A 4A4OA 2G15A 2YAKA 2YIWA 3MH3A 4QYYA 4YUQA 4EH8A 2NO3A 5EHYA 4YJOA 5AUYA 2W4OA 3PXQA 2QR8A 2PE1A 4DH8A 3C5UA 5EHOA 4E3CA 3U6HA 3VRYA 4RJ5A 3ODYX 4LV8A 4AN2A 2YM3A 4BCHA 4BDHA 3C4WA 2PMOX 4D2SA 3W2QA 3TDVA 3D94A 3CIKA 2XBJA 4LL0A 3GBZA 3G15A 2VWYA 2CNQA 3H9OA 1SYKA 2C5NA 2C6TA 4FGRA 2YHVA 4DEBA 4DEEA 4V01A 2XIXA 5DVRA 5AR8A 3G5DA 4YSMA 3BHVA 4O6EA 2C6LA 4F0FA 5K9IA 4GRBA 3UNJA 2B7AA 4A06A 5EHLA 4AT5A 3VWAA 3BYMA 3V5LA 3MH1A 4FYNA 5ITAA 3AC3A 4BVUA 3QCSA 4O83A 4F6UA 4O7RA 5IU2A 2C5XA 2JLDA 3NRMA 4KS8A 2OXXA 2OJFE 3FMLA 4RPVA 4NFNA 3R00A 3QZIA 4TN6A 3HP2A 2VTMA 3QC9A 4JLCA 4AW0A 2PVKA 2WD1A 4FA2A 3SVVA 4NU1A 4FTQA 4GVJA 4U7ZA 4WRGA 2VWWA 1Q61A 3BWJA 3P86A 3TJCA 3ZS5A 3DLSA 4EKLA 3TUCA 2WTKC 4GK3A 4DFYA 4FZAB 2R3NA 3M11A 3CD3A 3FC1X 2IZTA 3MW1A 1XH7A 1YXXA 4UWYA 4B7TA 4AGWA 2BHHA 1P4FA 5HTCA 2JFMA 3QUEA 2YERA 4DYMA 4K6ZA 4M15A 4M69B 3Q52A 4CNHA 3FLYA 4E5BA 5KO1A 4CFWA 3FPMA 3D4QA 3EZVA 1OGUA 3CTQA 2VGOA 3FPQA 3FZOA 4W8EA 4KBAA 4GYIA 4ZXTA 3ALNA 4AG8A 2R3HA 4DT9A 1Q5KA 2PSQA 4W4VA 1KUTA 2XIZA 3FSFA 5FD2A 4YR8A 3S00A 4H3QA 2BR1A 3COIA 3KK9A 3DA6A 4R1YA 3UOHA 3ZEPA 2FA2A 4BZNA 2GTMA 2AUHA 2WOTA 2BKKA 3Q60A 2YIYA 1GZOA 3KXGA 1W83A 5TR6A 3ZZWA 4IAZA 5EYCA 4FEUA 2JAVA 3W8LA 4D4VA 4FVPA 3ZSIA 3MPTA 3GCPA 2VO3A 3KGAA 3GEQA 3O17A 4XEYA 2IJMA 4YJTA 4NSTA 2VTTA 5BVOA 2W4KA 2BHEA 3RNYA 4DFLA 5CZHA 1PMUA 3IOKA 3DNDA 1REJA 1WZYA 3D2KA 4IZ5A 3FUPA 4TNBA 2C5VA 2GFCA 2XKCA 1MRVA 3BYVA 2J0IA 1H1RA 3ZDUA 2PK9A 2XJ1A 3SD0A 4OAVB 3EFKA 4O0TA 4BIDA 4BHNA 4K11A 4BBFA 3LM5A 5LJJA 4F9BA 4ACHA 4X6RA 3JS2A 5A9UA 3HMNA 3MTFA 5KCVA 2ITWA 4IAIA 4EH6A 4O82A 3VQHA 5CAOA 1YXVA 3W2RA 4IB1A 2LAVA 2YDJA 3SXSA 3ORXA 3N4UA 5D12A 4F7JA 4KS7A 4ZZOA 1ATPE 4MNEA 3JY9A 2PULA 2V22A 4JG6A 4AXAA 2OG8A 4GG5A 4YC6A 3RMFA 5KHXA 4E6DA 3HDMA 3OVVA 3R63A 2R3GA 4J97A 2PVMA 1J3HA 3FV8A 3NPCA 4Z9LA 3UQGA 2QO2A 2ITQA 4JQEA 5JRSA 3SLSA 4UMRA 4FIGA 3RHXA 1H26A 1G8SA 4Z7GA 5E8VA 4A4XA 2C0OA 2YCQA 3A99A 4QTBA 3TT0A 5KZ0A 1YOMA 3Q53A 3CTHA 4APCA 2YZLA 4AOJA 3IW8A 2X7FA 3GXLA 3PPKA 4GVAA 3O23A 1G3NA 2XRUA 3P7BA 4BL1A 2O63A 5AP2A 4X2NA 4UALA 2BDFA 3Q6UA 3HLLA 3NUAA 1U4DA 3MH0A 4D55A 2XUUA 4E73A 4DG0E 4ANNA 4G6OA 3R8MA 4ANSA 4U42A 4UWCA 5I9VA 2R0IA 4R77A 4FSMA 4YHJA 5L2SA 2ZB1A 4S32A 4AGCA 5IQHA 3WZEA 2W9FB 4C4FA 3A7JA 3DS6A 4YMJA 4UMQA 5IMXA 4DH7A 4ZJVA 4DA5A 5M55A 2IW6A 5L2WA 1F3MC 5EI6A 4BI1A 4F1OA 2C30A 1U5QA 1GY3A 4ANBA 3RPRA 5CEPA 3DZOA 4N70A 3L9NA 1UNGA 5CZIA 4R6VA 2PVNA 4YTFA 4I24A 1H1SA 4P2KA 5IQCA 2BTSA 3NSZA 4I5PA 4EC8A 3F5PA 2F7EE 3CJGA 1XH8A 3OROA 3QRKA 3OWKA 3VUDA 3NAYA 3QQGA 5M4UA 1R0EA 5CASA 1IRKA 2XCKA 3E87A 4PMMA 4PL5A 4AT4A 2EVAA 4WBBB 4YPSA 4DLJA 4EHVA 1YDSE 4ORKA 2DYLA 2PPQA 4EZ7A 4FL2A 2RG6A 2YWVA 3VQUA 1ZYSA 4KAOA 4C8BA 4IW0A 5GZ9A 1KWPA 3NVMB 3R01A 3UOJA 4FT7A 4AZSA 4ID7A 4X3FA 1CMKE 3UVPA 4E5WA 4CLJA 2E9PA 3LE6A 3VN9A 3N4TA 1GIIA 3ANQA 3QX2A 2C6EA 1UNLA 1XBBA 4C4GA 4Q9ZA 5CALA 1NXKA 3PA3A 5BMSA 1K9AA 4KNBA 4QP3A 5L3AA 5ANDA 3UOKA 5HLNA 4QO9A 2YM5A 3R21A 4RVMA 3BQRA 2F57A 3B2WA 3MDYA 4FK6A 3MIAA 4KIPA 3R22A 4I94A 4CFNA 2HWOA 1OIQA 2RFEA 5AP4A 4U41A 4OW8A 4BCMA 3GT8A 1URCA 4ALUA 2ZVAA 4E7WA 2X6EA 2C6IA 2XNEA 4L9IA 3AOXA 5FQDC 3FY0A 5TE0A 3KC3A 3AXWA 3R1YA 3RWPA 2WMUA 2W1IA 2R3OA 4BDKA 4P5QA 2VWIA 3FKLA 1WBOA 4F65A 4MD7E 5I5ZA 1TQIA 4KB8A 5T6KA 3V8SA 3VS7A 2WMTA 3BELA 4KRDA 4AWIA 4WOVA 5FLFA 3R1SA 5EM6A 3LHJA 3FYJX 3PG3A 4QQCA 4FUXA 1UKIA 4ASXA 4L8MA 4FT3A 3KF7A 1YHVA 4BFMA 5HLWA 3R7UA 3LFNA 5I9ZA 4C3PA 5C9CA 2VRXA 4EH2A 5IH5A 2YCSA 4AOIA 4EK5A 4PV0A 3O8PA 4DBNA 2UZLA 2VWVA 5TF9A 4JBQA 2YISA 5AP0A 2Z02A 4JX3A 3ZBFA 2RFDA 4BDDA 2W5HA 3A7GA 3SW4A 4QP9A 3E63A 4CFMA 3QL8A 3W55A 4Q9SA 3MFUA 4QT1A 4CVAA 2QOQA 2G01A 2XK3A 4PTGA 4UBAA 4G5PA 2ZMCA 3FC2A 2JBPA 4UEUA 5E1EA 4EOLA 4OTQA 3WE4A 4QMQA 2QU5A 5AJQA 4PWNA 3IDPA 4NYEA 4EONA 1YOLA 4HYUA 4XG6A 4ZTHA 4AE6A 3A62A 5ICPA 3DY7A 1XWSA 5EFQA 1QPDA 2H9VA 2HZ0A 4XV1A 3EHAA 3LCOA 3CD8A 3EL8A 1TQPA 3KEXA 3G90X 4XBUA 3DFAA 3CQUA 3TXOA 2OIBA 4FTLA 4KINA 3U8WA 4BDGA 3W18A 5B7VA 3HMIA 3U87A 4O84A 2PVHA 3SAYA 2R7IA 4IWPA 3ZFMA 2ETMA 3PJ8A 4FKVA 5TOZA 4CFUA 3MBLA 3PRIA 4O0XA 3UVQA 3VBWA 2X9FA 4QP7A 3W33A 3L8VA 5HVKA 3D9VA 4X0MA 3KMWA 4O96A 4I23A 3UIMA 4YTCA 3EQRA 4FVRA 4Q5EA 4U3YA 2OH4A 5E8WA 2PZ5A 3LCDA 4O7YA 3E3PA 3Q32A 2WQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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