5DEYA

Crystal structure of pak1 in complex with an inhibitor compound g-5555
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
DEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRNIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSEMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Design of Selective PAK1 Inhibitor G-5555: Improving Properties by Employing an Unorthodox Low-pK a Polar Moiety.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
total genus 94
structure length 295
sequence length 295
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5deyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5deyA01
4NWMA 4BCOA 3KRLA 3R30A 4KABA 3RHKA 5IF1A 3PSBA 4QP1A 4S31A 1Y6BA 3HV4A 5HIBA 4DFLA 1YDTE 3HV3A 4IB5A 2C5VA 2CDZA 5L3AA 3WF7A 4DGMA 5DT3A 3Q53A 2W17A 1JWHA 4ZLOA 4C4JA 4YJOA 4EJNA 2XJ0A 3D15A 4KKHA 4FTNA 2PUUA 2Z8CA 3DBFA 3DY7A 4QMYA 3ZBFA 4E5BA 5FP5A 3OP5A 4OTDA 1QPCA 2YLFA 4RLLA 2B9JA 3KCKA 2JDRA 3BHTA 3OROA 4JX3A 3RTPA 4ALUA 4BBFA 4RX9A 3KRWA 4A4OA 4AZEA 2RFEA 4E5WA 4I21A 2PVLA 3THBA 5CAPA 5KMNA 4FVPA 2BKKA 4PPAA 3B2WA 4UYNA 4C59A 4FEWA 2QKWB 4MKCA 4XJ0A 4K8AA 2ZM1A 1YHSA 2OJFE 3EQFA 1ZYSA 2R3OA 4UMRA 4NJ3A 1KE9A 4GL9A 3A8WA 4H3BA 1I09A 5CXHA 4LGHA 4RX8A 4EL9A 4EWHA 4LRKA 4QYEA 4ACMA 5CU2A 2Y7JA 1WMKA 2PMNX 4HYHA 4MWIA 3OCSA 4WRGA 5KNJA 5L2SA 4AW5A 5ICPA 1REKA 1STCE 4MBIA 4KBAA 4C37A 3PDTA 5KBQA 3HMPA 3QBNA 3UO6A 5JMSA 4YJUA 2R4BA 5EOLA 3F2AA 5L2QA 3HDMA 3HYHA 1CKIA 3JXWA 2OH0E 1LEZA 3UODA 5M44A 4WNPA 3IECA 3QTIA 5E8SA 1A06A 2QOKA 1OL2A 4CQGA 4PF4A 4ZTQA 4AW0A 4E20A 3KXHA 2JC6A 3HKOA 1PXJA 1PF8A 4WIHA 5LMKC 3C9WA 5KMLA 4FTTA 2CMWA 4GU6A 5K9IA 1AQ1A 2YIWA 2BROA 2WB8A 5JRQA 3KKVA 4XG8A 2OWBA 2QO2A 2ZVAA 3H9OA 2QOQA 4L8MA 4MX9A 4YMJA 1PMUA 2J2IB 4M14A 4G1WA 3SOCA 1XKKA 3FMJA 5F94A 1RDQE 3DCVA 3OS3A 4O0SA 3NAYA 4QO9A 3QGYA 4FODA 2DQ7X 4Q2AA 1HCKA 3KXNA 2EB2A 3FZSA 3EN7A 4IWPA 4L67A 5E8WA 3V3VA 3W2OA 1TQIA 4YHFA 4QMXA 5HBHA 4UMPA 5I9ZA 3MYGA 3U6HA 3FL5A 3LM5A 2VGPA 4FNYA 5FBOA 2JIIA 4E6QA 3R9OA 3AT4A 3EQRA 4R5YA 3RPOA 4OGRA 5H9BA 2C6IA 5HOAA 2QKRA 3DBDA 4OTGA 2WO6A 5F20A 5K4IA 4DEHA 3Q4CA 4MNFA 5AP5A 5KO1A 3LXNA 2J9MA 1WBTA 3DS6A 1Q8WA 3HRBA 1YOLA 4LV5A 2A0CX 3FC2A 4TZRA 4EK8A 3O23A 4FK3A 3ZLSA 1VYWA 4L53A 1XQZA 3DB6A 3H10A 4PP7A 3BYVA 4PDPA 4D0XA 4L42A 4B8LA 1YI4A 5DH3A 2YCFA 4YPDA 4F1TA 3FZPA 4ZMEA 3TJCA 5IMXA 2XIYA 4JBOA 3CY3A 4I4FA 4ZY6A 3LJ2A 3OUNB 1YHWA 4FIHA 3JPVA 4FNXA 3MPAA 4U80A 4FTOA 1K9AA 1TQPA 3VF8A 3WF5A 4MXYA 5E8ZA 4WNOA 4I4EA 4XH6A 5C1QB 3GEQA 5HI2A 3DT1A 2QC6A 3QZIA 4IX3A 3GC7A 1CDKA 3MBLA 1JSTA 2B52A 3ULIA 4BTJA 2JD5A 5HIDA 3UDBA 2IZTA 3Q5IA 1S9JA 4L43A 3CGOA 5JGAA 4GH2A 2X9EA 3GFEA 4ANMA 5HZNA 4MXOA 2BIYA 2C68A 4PPBA 3RVGA 3O51A 5M07A 3NVKI 4O0YA 5D10A 2O63A 2WEVA 3UBDA 3QC4A 3QQHA 2J0MB 3D94A 3QC9A 1KWPA 4BYJA 5J9LA 3FY0A 2WOUA 3G33A 1OL7A 1A9UA 4JQ8A 4QMWA 3R71A 3QYWA 2AYPA 3ALOA 3DJ6A 3RPYA 4F6SA 1P14A 2CLXA 5HNIX 3NYNA 3V6SA 5HLWA 4ZEGA 4EBVA 1Y8YA 5A6OA 1O6YA 3COIA 3A7IA 3CKXA 4U81A 2X4FA 1OL1A 2YHVA 3C4CA 2C69A 4LOPA 2QLUA 3UTOA 4FIEA 3F3UA 3W2PA 3COMA 4QMOA 4EOIA 1BL6A 1QPEA 2G01A 4F08A 3JVSA 4F7SA 3IS5A 4TYGA 5M55A 4BCNA 3HV7A 2PVHA 5EKOA 1LUFA 5HESA 4EUTA 2VTNA 5J87A 3BLQA 2Y4PA 3QHWA 4D5HA 2YISA 4AFEA 5TKDA 4YJSA 2HZIA 2JFMA 4D1SA 3KC3A 2J5EA 3K3JA 4JNWA 3UPZA 3A4PA 4FZFB 4NTSA 4I20A 4GT5A 2IWIA 1Y8GA 3EZRA 4DG0E 5AEPA 2VTJA 1ERKA 3C5UA 4FKWA 3ZUTA 2P2IA 1R0PA 2VO7A 4NKAA 3ANQA 4FTJA 2YIQA 3E7OA 3TTIA 3EL7A 4BYIA 5E90A 4X3FC 1XR1A 4PL5A 4PUZA 4C38A 3C4XA 5HLNA 5CAOA 3JS2A 1JNKA 4XYFA 2QI8A 2VU3A 3DOGA 3U4WA 3FAAA 3V6RA 2YCSA 3QZHA 4BDFA 4W4VA 4BB4A 3PXYA 4FKIA 3KRXA 1XBBA 3LKMA 3ZFYA 3QTWA 4AFJA 2Y6OA 3I7BA 3JVRA 5LARA 2LGCA 2C5YA 3FJQE 4Y83A 2E9OA 3PIYA 5CANA 3HMIA 4G5JA 3OTVA 4HOKA 3V04A 1FVTA 2WTJA 3LLAA 1IA8A 3GC0A 5AP0A 3TZ8A 3KRJA 3GBZA 2BALA 2B9HA 3UMWA 4U5JA 3G51A 3U8WA 4I23A 3RMFA 3W2RA 3FXWA 3R7UA 1CKPA 3E62A 5TOZA 3EOCA 4DGOA 4DLJA 2CCHA 4AT4A 5HO6A 4B8MA 4ASEA 3NUXA 2BTRA 3IKAA 3LOKA 4F1OA 4XV1A 5H2UA 5BVOA 1OGUA 4BWKA 2HAKA 4KKEA 3SRVB 5HE0A 3FEGA 3FL4A 5E8YA 4ANQA 4D2PA 3BE2A 5AV2A 3QWKA 4YTHA 1WFCA 4H39A 4EKKA 3D7ZA 3MDYA 3W8LA 5I5ZA 3FKOA 4OT6A 5F95A 3I5NA 5C9CA 5FWKK 4RJ8A 3R1YA 1K3AA 3ENHA 3NAXA 3OT3A 4C4FA 4DINA 5A4EA 3C7QA 3OOMA 2OIDA 1KE6A 1JVPP 1B38A 1JSUA 1OIUA 3IQ7A 4GG7A 4K6ZA 2UW7A 4NW5A 3EKNA 3QQKA 5DGZA 4BZOA 4CQEA 4ACDA 1SVEA 4AUAA 3OCGA 2PU8A 5IUGA 1WVXA 4ZZMA 2WQBA 4O2PA 3FMDA 3H0ZA 4G31A 3DQWA 5TR6A 4F0GA 3NUUA 4LOQA 4CGAA 4H58A 4GKIA 4U43A 3FXZA 5HGIA 3H4JA 4ZY5A 4AN3A 4NYEA 1BL7A 2IZUA 4J1RA 4KIPA 2VWZA 4F9CA 3CP9A 3F69A 2PPQA 4O84A 1NXKA 1PW2A 3PSCA 2WKMA 4FL1A 3ZONA 2Z7SA 3PY1A 4GFOA 5LQFA 1UNGA 3HZTA 4IWQA 3HECA 5E1SA 3U51A 4AA0A 5I4NA 4BFMA 4LL0A 3T9IA 2PL0A 5KMJA 3P1AA 1ND4A 2PMIA 2R7BA 3KL8A 3UQGA 2CKPA 4EI4A 3S1HA 1CMKE 4RFMA 1DI8A 3F3WA 3QTXA 3IDPA 3NR9A 4OAVB 4ZLYA 3DBCA 3HAVA 1HOWA 5DE2A 4EYMA 3NUYA 4M97A 2HWOA 2V0DA 3HLLA 1LEWA 3F61A 4FTKA 5BX0A 1H1SA 2XJ2A 4IZ7A 2WTIA 4KIOA 5CEIA 4AT5A 3PVBA 1LP4A 2R0UA 2UZDA 2H8HA 3CLYA 4C2VA 4P5QA 1H26A 3IPHA 3VUMA 3CXWA 3ROYA 3R22A 2WTDA 4MQ2A 5BNJA 5F9EA 3N51A 4RGJA 4C34A 4TL0A 3RAIA 2BRMA 4BC6A 2XNEA 1NY3A 5AIKA 4O81A 3DU8A 2YM3A 4D55A 4AX8A 2JKKA 5D7AA 3OEFX 2OJJA 4OLIA 4DFUA 1OPKA 2E2BA 2XRUA 1BX6A 2ACXA 5E91A 1JPAA 5IMEA 3GFWA 2JDTA 5EW3A 3R2BA 4KSQA 4QPMA 3RPRA 5ETFA 4BDDA 4HVDA 3O8TA 3RAHA 2XK7A 3R8LA 4OR5A 3P7AA 4LGDA 3SQQA 4D9TA 2JIVA 2QO7A 2PY3A 3RM7A 3O8UA 4R1VA 5J5SA 3HDNA 4CRSA 2OH4A 5DEYA 5BYLA 3C13A 5AP4A 4TNDA 4DE4A 2QHNA 3WZEA 4E6CA 3EN9A 4D4VA 5DNRA 1U59A 4X2GA 3LFEA 3PPZA 3DB8A 1XBAA 4QQTA 4IEBA 1KE5A 2NRUA 3MH0A 1G5SA 3VJOA 3TWJA 2VN9A 4NJDA 5A6NA 2QVSE 5AAGA 2WTCA 1JLUE 2CGWA 4FV3A 4GT3A 3PY3A 3VBXA 4EK3A 5EYCA 3QX4A 4GMYA 2W1ZA 4G5PA 4V0GB 3UOHA 2DUVA 3BU3A 4BIEA 2JDOA 4BTKA 3RINA 1L3RE 1ZY5A 3FQHA 1PMVA 3LXPA 3R2YA 3W16A 1JKTA 1UVRA 1OUYA 2I0HA 1MQBA 3EMGA 2J90A 3UC4A 3D2IA 4I24A 2OJIA 4CCUA 4RIOA 5JFSA 3SG8A 2QLQA 5T3QA 3HA8A 4O1PA 2GS2A 4O22A 2XK3A 1M7QA 4LYNA 4P4CA 3RK9A 3WZKA 4HYIA 2F7XE 4G3FA 2VTAA 4UZDA 4USFA 2BILB 5AA9A 2WEIA 4ZSJA 4HJOA 5AV0A 1DI9A 2OGVA 2W06A 4ENYA 5F4NA 3UVPA 3D0EA 3OCBA 3PJCA 4EZ3A 2R3LA 2B55A 2QONA 4M0YA 3AG9A 5EW9A 5AR4A 5GNKA 1NW1A 4O83A 4GYIA 3FKLA 3K5UA 4RIYB 4XBUA 3Q9XA 2BR1A 4E1ZA 3IOKA 4BRXA 2ETKA 2Z7RA 4CKJA 4I41A 1GOLA 3TV4A 4DH7A 1O6LA 2XCHA 2QO9A 4IMYA 4F4PA 3AGMA 1W0XC 2C5XA 2O3PA 2GDOA 4KAOA 3PXRA 3VWAA 3MA6A 1W8CA 3S4QA 4UWYA 4DEIA 1JAMA 3EYGA 5TF9A 2PVKA 2PZPA 2VV9A 2JDSA 3VS4A 4XLIA 5K5XA 4X0MA 2V5QA 5AP7A 3GUBA 3N4UA 3PJ8A 2XP2A 4RMZA 3IW4A 1HCLA 4TW9A 5CVFA 4NH1A 3TACA 5L4QA 3R1QA 1H1WA 1H24A 4OAUC 5CQUA 2CKOA 4I92A 3BYOA 5IQEA 3VAPA 3AT3A 4GV1A 4J99A 4V04A 3V5PA 4XEYA 5L2IA 4QMZA 5ETCA 4NK9A 3UNKA 1FOTA 4O7NA 3UO5A 1OITA 3Q9WA 1KUTA 2PE0A 3MW1A 4FC0A 4DGLC 3MVLA 4GVAA 3L8SA 4ASZA 4FV7A 5KMIA 4O96A 4WT6A 3F5GA 5G1XA 4QPSA 5ETAA 4F7NA 5IDNA 1FBNA 2PYWA 3ZO1A 4JDJA 2YACA 3PFQA 4OTPA 4AQCA 4G9RA 1J1CA 3D7TB 4RWIA 2A1AB 5LVOA 1OBDA 2ESMA 5FD2A 4WD5A 4FV8A 5BQ0A 2VWIA 3HRCA 3HP5A 2GQGA 4DH5A 4KUJA 3TM0A 4XS2A 1JKKA 2UZNA 4FTLA 2YIYA 3AMYA 3PWYA 5CSWA 3V51A 4C35A 5IISA 2YM6A 1H27A 5I9UA 1UWHA 2ITWA 1VEBA 3C4ZA 4IJ9A 4QQJA 4N6ZA 4RG0A 4BIBA 5I9XA 3A8XA 4CXAA 1TVOA 4U44A 4WO5A 4RIXA 4QP3A 1GZKA 4ITIA 2OICA 4C57A 3Q4UA 3F6XA 4UV0A 4L7FA 3SKCA 4CSVA 2X8DA 4YPSA 3L8VA 3TIYA 1GY3A 3VNTA 3OWLA 4U3YA 4ZAUA 3FDNA 2C3KA 3AGLA 5EG3A 4EONA 3GU8A 3WZJA 1MRYA 4AA4A 4JRNA 2OI4X 4NIFB 4FIFA 3P4KA 4IX5A 3DKCA 2C4GA 4O0RA 4HZRA 3ZXTA 4CRLA 4YLKA 4R78A 1UWJA 1OZ1A 1Q4LA 4U41A 5DI1A 2QR7A 4RVTA 2OZAA 4UMTA 1PMEA 4WOVA 5EOBA 5IEVA 4Y72A 4F99A 1PXLA 2VRXA 4MXAA 5FXSA 5M09A 3A2CA 4G9CA 4GYGA 5EYDA 3R8PA 3TNWA 3ZCLA 4AE9A 3V8SA 4F0FA 4YO4A 2XVDA 3Q9ZA 4ITJA 4BGQA 3VRZA 4GFGA 4CZUA 3QYZA 2R3RA 4ERKA 4FV4A 3ZZWA 2YDJA 3WARA 3VHKA 4W4YA 3UIMA 4O82A 4Y85A 1XO2B 4AOIA 3PLSA 5FUTA 3KULA 4BKJA 4YSJA 3UQFA 2R3MA 4FT0A 3GENA 2WXVA 1G8AA 1OKWA 4PTCA 4A4LA 5BUEA 1WBSA 3W10A 5EQEA 3QA8A 5TE0A 3UC3A 4I5CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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