5DLSA

Identification of novel, in vivo active chk1 inhibitors utilizing structure guided drug design
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
265
structure length
257
Chain Sequence
VEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of novel, in vivo active Chk1 inhibitors utilizing structure guided drug design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 78
structure length 257
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dlsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5dlsA01
3WILA 3IKAA 3ZMMA 1M52A 4F08A 2BROA 2HXLA 3EN7A 4BKZA 4C35A 3EQHA 4MNEA 2X2LA 4YZMA 4RC2A 4BBFA 2RIOA 5HZNA 4NUSA 2XYUA 5IQFA 2BUJA 2J0LA 3K3JA 4EC8A 5HO7A 2XK3A 4YO6A 5FTQA 4RWLA 4QP1A 4I24A 4QTAA 5M55A 4AGDA 3F5UA 1OKZA 4GMYA 4PNIA 3R8ZA 5AP4A 4IC7A 1OITA 3OTUA 4X2JA 4AE6A 5B2MA 4TNDA 5TE0A 2C47A 4NEUA 3NUSA 5HICA 3W8QA 3NS9A 4IXPA 3ZRKA 4O83A 4R7HA 4JG8A 2NRYA 4OTHA 4QMMA 2ERZE 4A7CA 1SVEA 3QZGA 3ROYA 5CAOA 2ZV2A 4A9RA 2YAAA 2P55A 2WQBA 2XIZA 3LOKA 3EQIA 4N6ZA 3QTWA 4DCAA 5AAGA 4AZSA 3E63A 3N51A 4CG8A 4BB4A 4FZ6A 4CXAA 5IQGA 5JRQA 2BFXA 4IDTA 4NZWB 3BCEA 5K4JA 2AUHA 3KRWA 4LOOA 4EOQA 2X8EA 3KRRA 3N9XA 2OH4A 1RE8A 3WZKA 3JYAA 2OJIA 4D4YA 4CMOA 4Q5EA 3IDBA 3E92A 4OTDA 5AUWA 2LAVA 3HV7A 1JKSA 4ZJVA 2PU8A 1OKVA 3Q5ZA 4QMYA 3DT1A 4J8NA 5IEXA 4CGAA 2VTJA 3ROCA 3OY3A 4F1OA 4CMTA 4DG0E 2BDJA 3DY7A 3U51A 4O22A 4BDAA 2CMWA 1GZOA 4HPUE 5A6NA 5M4UA 1ZZ2A 5DN3A 2C5YA 4PMPA 1WCCA 3UYTA 4G6NA 4S32A 3R8VA 3NW7A 3A99A 3OP5A 3D2KA 2PE1A 3OD6X 3ZFYA 5KKRC 3A7IA 3MH3A 2UUEA 4UMRA 4I5CA 4LGDA 4AFJA 4IAKA 4NT4A 3RTPA 3UQCA 4RIXA 4O27B 2J0MB 5CU0A 4RC4A 4DEEA 3F82A 3KFAA 1JWHA 1VYWA 5AA8A 3FMHA 5AUTA 4IVBA 3A2CA 4Y73A 2RSVA 2VO7A 4QPSA 4DG3E 3F5PA 3F7ZA 4BYJA 3VS4A 4MXAA 3SXFA 5F9EA 4PF4A 4J95A 2X8DA 4MAOA 3HRBA 4FKOA 2YLFA 3HNGA 4BCFA 1H08A 5L8KA 2I0HA 3AC2A 4IBMA 2O65A 3QUDA 4LL0A 5HE3A 5CEKA 4G9CA 3RGFA 3TIYA 2WTJA 5CANA 1Q24A 3HMNA 5HIEA 5L2SA 1BUHA 4F9WA 4M13A 4FKRA 3VUGA 3G6HA 4XBUA 3ZLXA 4H1JA 4JDIA 4R8QA 4D4SA 5FXRA 3CQEA 4HGSA 2W7XA 4R7IA 4ZOGA 3QRUA 2YIWA 4ZTRA 1FVVA 3HKOA 1OMWA 3NEWA 4H58A 4EC9A 4GU9A 4QD6A 4AS0A 2Y0AA 2XCHA 4YLLA 2X7FA 4P2KA 3FPQA 3TNQB 3OVVA 2NPQA 1Z9XA 3D83A 3OCBA 1WBNA 2AC3A 2R3FA 4AXAA 2VRXA 3F69A 1AQ1A 3I6WA 3IK3A 3RK7A 4ANMA 4YU2A 3E3PA 3F5XA 4G16A 5J79A 2JITA 2XRUA 5H9BA 5AV2A 2F49A 3GI3A 3DXNA 4IZYA 4M69B 1OECA 5CU3A 2OO8X 3VF9A 4GFGA 3PA3A 4FBXA 4O7VA 4RFYA 2BZHB 2I7QA 1W82A 2ZM1A 5HIDA 4GK2A 4CCUA 1U4DA 4O1OA 4QYYA 4E6DA 3DK6A 2GNGA 5LWMA 4KB8A 3VBXA 4BIDA 3QCSA 4OAVB 4IFCA 2PMOX 4IACA 2ITUA 4XRLA 5TO8A 4J8MA 3BBTB 5DYJA 2R3OA 5F4NA 4EK6A 5DEWA 1PHKA 4QTBA 2WPAA 5AUZA 5GJFA 5HE0A 5FM2A 4Z3VA 3ZFMA 5IQEA 3COMA 4PL3A 4AE9A 4QOXA 4ZY4A 3KN5A 3LCOA 4Y46A 1JOWB 1XBCA 1YDSE 3FL5A 4IWOA 4AX8A 3E8CA 4EZ7A 4D4VA 4JDKA 4PV0A 5D1JA 4CTCA 2Z7LA 4XG8A 1H0VA 4IWQA 5E1EA 4ZTQA 2YFXA 3ZXZA 4BGQA 4RT7A 3OXIA 2CLXA 4CRSA 4O84A 3S4QA 1YHWA 3ENMA 4BGHA 3LZBA 3DCVA 2BHHA 2GFCA 2VWXA 3DKGA 4WNOA 4MBIA 3PWYA 3SA0A 4BC6A 4AW2A 4G3DA 4U3ZA 1NA7A 3H0YA 5IZFA 3I60A 3HUBA 3GC8A 4IX6A 3ZFXA 2J90A 4O7NA 1HCLA 2UZEA 3TN8A 4KKGA 1FPUA 2NRUA 3KMUA 4QTDA 5BVEA 4CNHA 4K6ZA 4QQ5A 5I4NA 5IQCA 4DF3A 3D4QA 5C01A 3P78A 4BCGA 5M08A 1SVGA 5HNGA 4NTTA 4Y83A 4E4XA 4P90A 2CHLA 2JDOA 5FEDA 4QQTA 4CFXA 2W17A 1OB3A 2C69A 3AGMA 4C59A 5AA9A 5LVOA 2QC6A 4ANOA 1JSTA 1YXUA 4DGOA 1DS5A 2C3IB 4EH4A 1KE7A 4JQ8A 5EYMA 4TT7A 2OSCA 3BELA 2VTPA 3UP2A 4Y5QA 3ZS5A 2GNIA 4ANSA 3FHRA 2UZOA 3MH0A 1WVWA 2X81A 3I4BA 3SHEA 3MB6A 4UV0A 5CT0A 4ACMA 4BIEA 3UQGA 1XQZA 4MXYA 4NFMA 4JIKA 5M09A 3FV8A 2BPMA 3CR0A 2F9GA 3HRCA 4Y95A 2PE0A 2UW3A 4G1WA 5E8ZA 1CSNA 2GCDA 2BTRA 3O71A 3DBCA 4IB1A 3LCSA 2W1FA 2XK8A 4MYGA 5KMLA 1RDQE 2VTNA 3AT3A 3LXNA 4IX3A 2UW4A 3KEXA 4KSPA 4R6VA 3WF8A 4ASZA 4KD1A 4CTBA 4YTCA 4E6QA 4C62A 3TT0A 3RPSA 3WIGA 3OXTA 4BF2A 3FEGA 4L42A 4DTAA 4K1BA 5CI7A 3EQPA 3R22A 5ETCA 4C8BA 4DBXA 1XBAA 4PP7A 5HD4A 3MB7A 2YM5A 4E6CA 3IQ7A 1XHAA 2ZV8A 3GENA 3UDBA 2IVUA 3UIMA 3A7GA 4EUUA 1PXJA 2E9PA 5D7VA 4QMZA 4FL3A 3RKBA 3HV6A 5AP5A 3V8TA 4HW7A 4BDGA 4B8MA 2IJMA 4X3FB 5CAPA 2P3GX 3P9JA 5EW8A 4HGEA 2GTMA 4G5JA 3E62A 2JKKA 2BIKB 4R3CA 4KUJA 5E8SA 3F3WA 3C4WA 3UPXA 4J99A 1P4FA 5CSVA 1ND4A 4U81A 3Q32A 2A0CX 4G3FA 4RWJA 1ZRZA 2CKQA 4ZS4A 1G3NA 2BILB 4NW6A 3R7GA 2E9NA 4FV8A 3IOKA 5CT7A 1QCFA 4TYGA 4WG4A 1OIQA 2VTHA 3AC4A 2UZWE 3HP2A 3QWKA 1DAYA 4GT5A 4RJ7A 4NIFA 4EHZA 4MVFA 5BMSA 2ITWA 5ANGA 1OI9A 3GP0A 2QO7A 4MF0A 5B0XA 5AV0A 5M57A 2W4KA 1DI8A 2YA9A 4LGHA 5CSWA 4NCTC 4L52A 4FKQA 3CD8A 2PSQA 4AOIA 4TYJA 3RWPA 2CDZA 4L43A 3R7IA 1J7LA 1H1QA 3R28A 2ITVA 3ORLA 5E7RA 4DINA 4WUAA 3A4OX 2WKMA 2ACXA 4FTNA 4EOLA 3DDPA 3H9FA 2BVAA 5FGKA 4A4XA 3OCSA 4EQUA 1Y8GA 3KULB 4IAFA 4K33A 4U42A 5EDRA 3PY3A 3NUAA 2PVKA 4JVGA 1V0PA 1KSWA 2G9XA 3BYMA 1MP8A 2ETMA 4X6RA 3SKCA 5CU2A 5C26A 3VBTA 5CF5A 3ZO2A 1U54B 4LMNA 1STCE 2XP2A 1Y91A 2C1BA 2OIBA 3TG1A 3ZH8A 3NVMB 4MCVA 5BYLA 2CGWA 4ZZOA 3OWKA 4GKIA 2WB8A 3PSDA 4C2WA 3QHWA 1VEBA 2VWBA 5FP5A 2BDFA 4TWCA 3C9WA 3EN6A 3DFCB 3FZ1A 3NDMA 4B0GA 2C5NA 3EFWA 2OJGA 2YCRA 3P23A 5CTPA 5AM7A 5F94A 4JQEA 5BNJA 3HLLA 5EDQA 4RVTA 2JDVA 2VD5A 4HNFA 3UVRA 4MEDA 4EH6A 3DU8A 5AFVA 2X1NA 3QD4A 4BWXA 1WBSA 2R7BA 3DBQA 4D2RA 3R02A 3GCPA 4DLJA 2W96B 5LCKA 4E8AA 1APME 5ANDA 2R3PA 1K3AA 2H6DA 3FMKA 5FD2A 3MPMA 4U45A 4RJ8A 2OIQA 4IIRA 4GUBA 3FYJX 4II5A 4RVKA 4U44A 3A8XA 4RX7A 4K77A 1ZYDA 2QKWB 3F3ZA 5H8BA 2Y4IC 4TNBA 3SGCA 2O63A 2O3PA 2O64A 3EIDA 3SVVA 2WMWA 3KREA 3O23A 4YPSA 4FODA 2IZUA 2WTKB 4BBMA 1OUYA 3JR1A 3C0IA 3BLHA 2JAMA 4ZJIA 3CBLA 3QKMA 5AV3A 3REPA 5EM7A 2C6MA 1YVJA 3MIYA 4ZXTA 5A6OA 2IW6A 3QX2A 5KMJA 3GFEA 4FV9A 5I9ZA 3JXWA 2BRGA 3R71A 4M0ZA 5AX9A 4CSVA 3EKNA 5E8WA 3UOJA 3N4VA 4EORA 3RM6A 2XK9A 2BALA 3BGZA 3MW1A 4MNEB 5AP2A 4FKJA 5AR4A 3U9CA 3G51A 4AQCA 4WIHA 3VS1A 4U40A 3LHJA 3R63A 1HOWA 4DITA 4PX6A 5KZIA 4KIQA 2B1PA 3AC8A 3RPYA 1H24A 4I93A 1NXKA 4E3CA 1MQ4A 2F2CB 1KE9A 4RQKA 5BVNA 5KCVA 2GHMA 2FYSA 4PL4A 3W2SA 2OK1A 5HCYA 3VC4A 1PW2A 2EB2A 2JIVA 4TYEA 4CT2A 3BU5A 2VN9A 4YZ9A 3PY1A 1XH5A 4M12A 3PVGA 3BZ3A 5CZHA 2ONLA 3ACJA 2V5QA 3DGKA 3S95A 4D1XA 5L8LA 4L7SA 2NP8A 5AP1A 2GQRA 3LQ3A 2WMVA 2CGUA 4FMQA 4LGGA 3ZLWA 4ZLYA 4EH3A 3BEAA 3KXGA 3TUDA 3FE3A 4BY9E 2EVAA 1P2AA 3QD3A 2XNBA 4FT5A 2YABA 5DMZA 4DH1A 5EYDA 3NNUA 5HX6A 5A3XA 2OJ9A 3FSFA 3L8SA 3WE8A 3UZPA 5FDXA 4L9IA 2QG7A 4ZSEA 3JPVA 3R1SA 4HGLA 5AIRA 4OT6A 5CI6A 3P1AA 1IRKA 2XJ0A 3R01A 3MV5A 4FSRA 4J7BA 2XK7A 3WZUA 3Q52A 4M84A 1RJBA 4BCJA 4TPTA 4WUNA 5J8IA 1LP4A 3R2YA 3EQBA 4GL9A 2X7GA 3KCKA 4O21A 4RIYA 3DQWA 5I9UA 4GRBA 3AXWA 5JKGA 3GCSA 4FTUA 5TF9A 3ZDIA 4JQ7A 4ZJJA 3VS7A 4KAOA 5DWRA 4NM3A 4TWPA 4XEYA 3UZRA 4KWPA 4WNKA 4O81A 4YC6A 4DEIA 2J5EA 2PTKA 2HAKA 2HENA 4BCHA 3DDQA 5BVOA 3NCGA 1WBWA 4AFEA 4LRKA 4TRLA 4RJ5A 3D15A 5J9LA 2PZIA 4RIXB 1PMEA 2PMNX 2ZB0A 4QP4A 5A46A 4RZWA 4JBPA 3WZJA 3ORTA 4FEWA 4UZHA 4V0GA 5A4CA 3R7OA 3KMWA 2VU3A 3FMNA 1TVOA 4NM0A 3PSBA 4KBCA 3MFSA 4QP7A 3PJ8A 5E92A 3UGCA 2Q0BA 3FKNA 3OHTA 4W4YA 4CRLA 3D5VA 4DBNA 3N4UA 2QHMA 4NWMA 3NW5A 4U79A 2JDTA 3EH9A 3GU4A 3QD0A 4IAYA 2PMLX 2PMIA 3GT8A 4DE4A 3OTVA 2J50A 1IAJA 5JEBA 1V1KA 2XM9A 1YI3A 3FLYA 1H1SA 3BYSA 3NAXA 5EI2A 3HX4A 4BIBA 3BKBA 2XNMA 4MXXA 4OW8A 3TV7A 4RX8A 4FSZA 3QCYA 1DI9A 2RGPA 5HO6A 5TKDA 5JT2A 3JY9A 1YKRA 4HVSA 4I4EA 4EYMA 2VTIA 3PIXA 3S1HA 3OWLA 4MD8E 2ZM4A 2F57A 5EQPA 3ALOA 3DKCA 3ID6C 4OTPA 5KMOA 1URCA 4D5KA 1GIIA 1IR3A 5E4HA 3ODZX 2CCHA 3QCXA 4TYHA 1ERKA 5E91A 4ARKA 1GZKA 4QP8A 1CKPA 3ZOSA 4BI2A 4FT7A 4NKSA 1XH6A 3LJ0A 4MX9A 3VBQA 3CTJA 2GU8A 3FZOA 4OTQA 3WF7A 3FAAA 4F9YA 2C68A 5HCXA 4GKHA 3OEZA 2X9EA 3Q9YA 5DR6A 2E9UA 3PPJA 3Q4ZA 3CTQA 2WHBA 2UW6A 3R7YA 4AUAA 1J3HA 3OWPA 4DFXE 3HMPA 2X2KA 2R3KA 1UKHA 1P5EA 4L01A 4EQMA 5IMXA 4QYHA 3ZTXA 2JD5A 3P0MA 4HCUA 1S9JA 2YCSA 4HGTA 4N0SA 5CENA 2J6MA 3PE2A 1REJA 4JDJA 4KINA 3UC4A 2ZYBA 3QZFA 1O6KA 3EQDA 4ITIA 5J7BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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