5E8TA

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (t204d)
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
HMTIARDIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e8tA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e8tA01
3O2MA 1KOBA 4FL3A 3CPCA 3P4KA 4BI2A 2OK1A 3D94A 2YN8A 1PJKA 1PXOA 4PQNA 3RK9A 2BRNA 4S32A 2GPHA 5JFSA 3V6SA 2VO3A 3ORPA 4XJ0A 5JZNA 4BDEA 2BDWA 4TYHA 4X7QA 5GHVA 4FSTA 2WQNA 2E9PA 3KU2A 3E63A 4DFYA 4YUQA 5E8UA 3GC9A 3WZJA 4BCFA 4WUNA 4WT6A 4PV0A 2CLXA 5D11A 4CYIA 3PVWA 3GP0A 3AC8A 3HX4A 2JIUA 2BAJA 3CXWA 5CVGA 3E92A 2W9FB 4ITHA 4NTSA 4C38A 4EHGA 5CAPA 3OTVA 4AAAA 5KO1A 1H8FA 4HGLA 4FSWA 4IW0A 4KSPA 5TR6A 2XP2A 3ETAA 5FGKA 5AUZA 1WAKA 2QD9A 2RG6A 3QA8A 5AA8A 5IISA 1YDRE 2PVRA 3R73A 2YITA 4KBKA 4UBAA 4PP9A 2QR8A 5K4JA 2YWVA 1Q61A 3MV5A 3PXQA 2Q83A 1YWVA 3UZRA 3LCSA 5CQUA 1OGUA 3IOPA 3CD3A 4R6VA 5LJJA 4PMTA 2PU8A 2BAQA 3BGQA 4BHNA 5E8TA 5C9CA 4EH8A 5JGAA 4YNEA 5CSPA 1L3RE 4DC2A 4BC6A 3ET7A 2SRCA 2WZJA 4NFNA 4DITA 2ZJWA 4F09A 2X8IA 1PMUA 3MTLA 4LGGA 3R63A 3L8VA 4FEQA 5CTPA 5ACKA 3BE2A 3D5VA 4E6AA 5E4HA 2QHNA 4AGUA 2GHMA 4NIFA 4GG5A 5DI1A 5EOLA 5FM3A 4AW5A 2VWWA 3IQ7A 4JDIA 1UNGA 2Q0BA 4RFZA 4IB1A 2JC6A 3A7GA 3FC2A 3H30A 3AOXA 4V04A 5AV4A 2R4BA 1TQIA 3PUPA 1P4FA 2R9SA 5EDQA 4EQMA 3A62A 3OWJA 2GFCA 2HZIA 4XV2A 5D7VA 3DT1A 3QTXA 3R9RA 2R3MA 2YFXA 3VUGA 2IZRA 4QMPA 3TACA 2RF9A 4QP4A 4BHZA 3HZTA 3TNPC 5JFWA 3O23A 4G6OA 5M55A 5FTQA 4XRLA 5L3AA 4DTAA 2EUFB 2B55A 4IX5A 1YI6A 5HE1A 4Y8DA 5BYZA 4R8QA 4YURA 3V5LA 5EM7A 2W7XA 5K5NA 4TL0A 3PSBA 4J95A 3FPQA 5LCKA 2J5FA 3FY0A 3HV7A 3LQ8A 1MRVA 4FC0A 4M0YA 4UXLA 4M7IA 5FEEA 3ERKA 4UWCA 4ZS4A 3QYWA 4Q5EA 2G15A 4QYYA 4R3CA 4UXQA 4PDPA 3RTPA 2VWZA 4QP9A 2YAAA 3EL8A 4IDTA 4OBPA 5DIAA 5I9UA 2FSLX 4ACHA 3NIZA 4F6WA 1OIQA 2O65A 4M69B 3WOWA 4CSVA 3LMIA 2IW6A 5DR9A 2PVKA 4TYGA 4G9CA 4O7WA 1PXPA 4C7TA 2FSTX 4O7SA 2C5YA 4ONAA 1YHSA 2WTVA 1B39A 4S31A 3R9NA 2CHLA 1W83A 3D7TB 4QTAA 5BYLA 2QOBA 3HLLA 2XK3A 5BVNA 1T45A 2X2MA 4I20A 2WPAA 3R7YA 3VS2A 3U6IA 3HP5A 3EL7A 4U97A 2OIQA 3FJQE 4O0WA 2BKKA 2WHBA 5AX3A 4EQCA 2Y4PA 4ALVA 1OKYA 2IPXA 5DR6A 3FKNA 5I9ZA 1CM8A 4NFMA 4O7NA 3OCBA 4G9RA 4MD7E 3SRVA 4C2WA 1NY3A 4H1MA 4G6NA 4HVSA 3R1NA 2I0HA 1OMWA 3RBWA 4DLJA 4KBAA 3SOAA 3ORMA 3MFTA 4D2RA 4FA2A 4EWHA 3AC1A 4DEDA 2B9HA 3R30A 4G1WA 4M68A 1WZYA 4E20A 5K5XA 2OIDA 3I7CA 4LOOA 3OCGA 3TN8A 4LOPA 2KTYA 4W8DA 4IX6A 4DGOA 4BCJA 4EK3A 3ORIA 5KZIA 2HYYA 2EU9A 1JSVA 2W05A 3I79A 4I1ZA 5AV0A 3ROYA 1Z9XA 2I6LA 5AR7A 3BELA 4AACA 1O9UA 4FSZA 4E4LA 4UN0C 5AV1A 1FVTA 5IH6A 3BLHA 5AUTA 3NCZA 4QMVA 3G0EA 1G8AA 3NGAA 3EFLA 2BIYA 4EOPA 4NT4A 2C4GA 4DA5A 1PW2A 3L8SA 4D9UA 2GNLA 4CCUA 1PXNA 4GK2A 3LW0A 3DA6A 1YOLA 2XEZA 4LMUA 3PY0A 4MHAA 4YZNA 1K3AA 3CE3A 4PUZA 1H0WA 4BL1A 3KRJA 1HOWA 3ZFXA 2VWVA 3W18A 5AUXA 1RQQA 2B4SB 3F7WA 4FICA 2CNQA 4D4YA 1GZKA 3TV7A 4ZLYA 3LFDA 4D2PA 2HAKA 2VTOA 3D5XA 4ZTNA 5J9LA 5TF9A 3ZYAA 5EDRA 1FVVA 4YTHA 2ZV9A 1UU3A 1JSTA 3MW1A 5ANJA 3QKMA 3AC4A 3EN9A 4CFMA 4ZTLA 3EZVA 3BYSA 5AUVA 4F7LA 2XYNA 3DKGA 3LLTA 2UZVA 3V5PA 4Q5HA 2PZYA 4QQCA 5FBOA 3ZO2A 3QHWA 1H27A 3HMOA 4R1YA 3HV5A 3KXHA 2W17A 3TI1A 1W98A 2YIRA 4YNOA 4D4VA 3FKLA 4L43A 2ONLC 3II5A 3W1FA 4BKZA 3PG3A 5HG5A 3F3VA 3ZDIA 5E8YA 4MYGA 5F9EA 2JD5A 3UQCA 4BYIA 2X6EA 3IW5A 2QLQA 4YJVA 2CKPA 4L42A 3A4PA 3OEFX 3C4FA 4NEUA 4G16A 3MY1A 4WO5A 2J5EA 3ALOA 2CGVA 4RWJA 4HVGA 3U54A 3K54A 5CVHA 4WUAA 3RZBA 4ALWA 4BF2A 3ZBXA 5BMSA 3W2CA 1UVRA 1Q8TA 4X2JA 3WE8A 2PVLA 1M2RA 3E7OA 5K3YA 3QTSA 3TNQB 5DMZA 3NUYA 5DN3A 4D0XA 4DGLC 3ZM4A 3P86A 3HMPA 4RSSA 5ETFA 3OY1A 5EM5A 5HX8A 1PF8A 1BL6A 2IZTA 3QUPA 5EDPA 5A6NA 4E3CA 4C3PA 3PXFA 4JRVA 4OW8A 2WMUA 4YHTA 4BCGA 4CQEA 4QQTA 3QTZA 3MSSA 1XR1A 1ZAOA 4NYEA 2PVNA 3DK7A 2C6MA 3MA6A 4NU1A 5JGBA 1PKDA 2IWIA 4RWIA 4U0IA 4RC3A 2CCHA 3BCEA 1FQ1B 1YXUA 3FMKA 3PA3A 4XG4A 5GJFA 5HESA 3CBLA 3LOKA 3EQCA 4FNXA 1Y6AA 1JAMA 4R7IA 4EL9A 3DZOA 4G3EA 1Q24A 3FLWA 4EZ5A 3HMNA 5J9ZA 3NRMA 1KV1A 3C0HA 4PTGA 2ZOQA 3R04A 1YXXA 3AQVA 1SZMA 2G9XA 4OAVB 3BZ3A 1XH8A 3VS5A 5HO8A 4WHZA 2VTPA 4FL2A 4QMTA 3W33A 2QOLA 3V5TA 5L6WL 4GIIA 4QPAA 4DN5A 1ZARA 4RVMA 2VTQA 1DI9A 3HA6A 2X6DA 3ZM9A 2UZDA 3TM0A 3JUHA 4QO9A 2JAMA 1H1RA 3GCSA 2FO0A 3OWLA 4TYIA 3TG1A 4EK4A 4R77A 3MTFA 4MF1A 3CPBA 2XF0A 2J4ZA 3COIA 4Y83A 3OD6X 5ANGA 5C01A 3W2OA 4DH8A 3TDWA 4M8TA 3LM5A 4EH7A 2C5NA 3O17A 1LEWA 3L8XA 4N4SA 5K4IA 4H1JA 4DG2E 2GQSA 2PSQA 5BUEA 4LL5A 2REIA 1VEBA 3EHAA 4L3PA 2C1BA 2OFVA 3KF4A 5HE2A 5J79A 5KMKA 3R8UA 5BVOA 2PUUA 1ZYCA 4AOJA 3R22A 5A54A 2OXDA 3R9OA 1U54A 3H0ZA 4M0ZA 5EW8A 5HBHA 5K9IA 3EZRA 3KY2A 3ZCLA 3VUIA 3R8PA 1W84A 4KKHA 4DLIA 3F2RA 5AFVA 2J0JA 4IAZA 1KE7A 4K9YA 5T6KA 4ZMEA 2YABA 3S0OA 2JAVA 4CKIA 3GVUA 3TKHA 3WF6A 4WRSA 2IVSA 5EW3A 4BKJA 5EG3A 1H26A 4UMPA 3U55A 4DFUA 4ANSA 1SVHA 4Y85A 3ZFMA 3Q9XA 2ITWA 1JNKA 3DK6A 5T68A 4D1ZA 3VHEA 3WZKA 5GIOE 4M3QA 4FNYA 3ZTXA 4AUAA 5A4CA 3LKMA 3VW6A 1Q41A 2VO6A 3TZ9A 3FV8A 3LCDA 4UYNA 4Q9SA 5KMJA 2NP8A 3OY3A 4UEUA 5HE0A 5I5ZA 4WBOA 4WNPA 2V22A 4L8MA 2BZIB 3FI3A 2XK6A 4MXYA 1YKRA 2IG7A 5AM6A 3O7LD 4DBNA 4FIGA 4EH4A 3LXLA 2ZAZA 4MXOA 3HMMA 3CS9A 3DXQA 5M09A 3U4WA 4OBQA 4WBBB 4KIOA 4ITIA 5DEWA 4MF0A 3KQ7A 4XCUA 1Q62A 3QGWA 3ENHA 4E8AA 3VRZA 3DS6A 2OIBA 4LI5A 4FKOA 4P4CA 4DFZE 4BBMA 2RFDA 4F0IA 1BKXA 2WIHA 3OP5A 4EH5A 5IEVA 4MXCA 4GS6A 3MY5A 3TKUA 4HZSA 3SV0A 3ACKA 5GIPE 3UMXA 3LFCA 3PY1A 4MWIA 2PHKA 3W55A 4AW0A 2PYWA 4IIRA 3VUTA 1LUFA 4W4WA 2G2HA 5EQYA 4O82A 4IVBA 4FKPA 4OGRA 4IX4A 4QOXA 4CRSA 2ZB0A 3F5UA 4AGCA 3FQEA 4IQ6A 4IEBA 4BCNA 4DH5A 4BBFA 2QO7A 3FLZA 3TNWA 4HGTA 2W0JA 4CD0A 5K0KA 4D9TA 4BFMA 4F64A 1J7IA 3FBVA 2GNFA 2GU8A 2X0GA 3PLSA 4N6ZA 2PMNX 4D5KA 3HNGA 3QRTA 4C4JA 3T9IA 3I6WA 3BYVA 4MBLA 3VQHA 5J5SA 4HGEA 3PSDA 2JBPA 5TE0A 4USEA 4KKEA 3ZMMA 3FMJA 3FZTA 4LOQA 3RVGA 4FI1A 3PZHA 4KIKA 3N4TA 4CG8A 5JN2A 3CJGA 4FYOA 3ULIA 4MKCA 3VS7A 3F2NA 5KMOA 2XIXA 2XUUA 3FLSA 3MGYA 3JYAA 1NA7A 5AP2A 4C34A 4RX5A 5JRSA 4TWOA 3LHJA 4R3PA 3UO6A 1H08A 5AAFA 2X39A 3EQRA 4IAIA 3FMDA 4G5JA 1H28A 3V5WA 2C6EA 4ARKA 4EYJA 4DE4A 2VX3A 3MIYA 2PVYA 2JKQA 1YVJA 4U44A 3PG1A 4FV6A 4H36A 4O27B 4PMMA 5HLPA 4D5HA 3W2QA 3FPMA 1ND4A 1J3HA 1YQJA 4XBRA 2XRUA 3OF0A 3DCVA 3ZHPC 4IZ5A 2V7OA 4JBVA 4O0TA 3EFKA 2WTWA 3KL8A 4L44A 3EN5A 1BI8A 2GS2A 3MJ1A 4BDIA 1Q8ZA 3FXXA 2QR7A 2YISA 3BLQA 3P1AA 4FG8A 2XCKA 3KMUA 4QRCA 5LCJA 4X2NA 2W96B 3ZH8A 2QURA 4AW1A 2Z7LA 3G0FA 1HCKA 3WILA 4DEEA 3MPTA 3QQLA 5DNRA 4C33A 1K2PA 4RVLA 1OIUA 4U5JA 4C4IA 4CFWA 5IUGA 2YM8A 4H39A 4LG4A 4U45A 4CFVA 1U46A 4QQJA 2XK4A 2H9VA 5KCVA 3AD5A 1SNXA 3UC3A 4PTCA 5HG8A 3LMHA 2GS7A 3RI1A 2YA9A 4ANBA 1XH7A 4O81A 5BVKA 3BEAA 1O6YA 5C1QB 2BDFA 4BIBA 4RIWB 4QTBA 3PXKA 3D9VA 2PY3A 1G8SA 3LXKA 3EQFA 3OROA 4O0RA 4QP6A 2J0MB 5HGIA 4EQUA 3LJ2A 3I6UA 5KHXA 3KFAA 4DBXA 4JX3A 4EOOA 2OI4X 3KGAA 5ANDA 4EOQA 5DRDA 3M42A 3UZPA 3ZUUA 2F49A 5HI2A 1AGWA 4K0YA 5A46A 1I09A 2Y7JA 4H3QA 3SKCA 4ACGA 5EYMA 2Y4IB 4XG3A 2W4KA 2YJRA 3DOGA 1FGKA 4QMSA 3E8NA 4X0MA 4FV9A 4G17A 3ZOSA 1M7NA 4RIXB 3QXOA 3IG7A 4AT3A 5I4NA 3F5XA 1AQ1A 2O8YA 3EN6A 3QRJA 2BFYA 3DV3A 4CMUA 4NJ3A 4RVTA 2HOGA 5IQGA 1KE5A 5H9BA 3AT4A 2ITOA 3R7UA 5HX6A 3FLYA 1H07A 3W2SA 3EKKA 1VR2A 2C6TA 1ZMUA 2W5AA 4Y95A 3TJDA 2VTRA 3EJ1A 4IZAA 3ENMA 4AFJA 2HCKA 3NVKI 4M66A 5CLPA 3QFVA 1ZYSA 2HW6A 2XNNA 3CJFA 4MD8E 3PZEA 3RNYA 4BIEA 2X9EA 1OL6A 4U43A 2QLUA 3QQHA 2OGVA 5CALA 2RGPA 4M15A 5LMAA 4J96A 3R9DA 4RIOA 4EOMA 2C0IA 5HIBA 2Y6OA 3DBFA 2WELA 3R21A 1YWNA 5DT4A 5HG7A 3DKFA 2WNTA 4QPSA 2RFNA 4NKAA 3QXPA 4EH2A 4I21A 2A4LA 3K2LA 5CEKA 3BI6A 4J98A 3R01A 4YO4A 4OT6A 4I6FA 2BFXA 2JDOA 3Q96A 5EHYA 5JQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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