5E8UA

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (t204d,i211v,y249f,s280t, y282f,s287n,a350c,l352f)
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
GHMTIARDIVLQESVGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIFQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVTDFHEHGNLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCICDFGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 106
structure length 306
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e8uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e8uA01
2FA2A 2PVYA 1Q8TA 2QCSA 3FC1X 4GK3A 5D10A 3TJCA 3VBQA 5BYYA 4B9DA 4GRBA 4G3DA 4RWJA 1QPJA 4RJ4A 4KSQA 4BF2A 5BPYA 4OGRA 3SOAA 4IX6A 3WF5A 4BC6A 2OK1A 2HWOA 2WMTA 3DU8A 2KULA 5E8XA 5L2TA 3BU3A 2GNGA 4JX3A 3T8OA 1SNUA 1AGWA 4KRDA 3AOXA 4MNFA 5FG8A 5HX8A 3QC9A 3W2SA 3LHJA 1TQMA 4K2RA 4DEAA 5CSWA 4HVSA 1W98A 2R3HA 3HVCA 3MA6A 3PY3A 4KKHA 1FINA 3ANRA 3EQIA 3LQ8A 4YO6A 4BKYA 5KZIA 2BZHB 5ANIA 3ZCLA 5EHOA 2H6DA 3JVRA 4XHKB 5DE2A 2JEDA 1OUYA 4E5WA 4RA4A 3UMWA 4USEA 2OGVA 2GNHA 4G9RA 2WMRA 4PPCA 2VD5A 3GGFA 2VWXA 3SQQA 3VS7A 3R30A 4S33A 1IR3A 4WHZA 3BHVA 3LCTA 3Q2JA 4A9SA 4L7FA 5CI6A 4MNEB 3NX8A 3W10A 2IVUA 3A4PA 2PUNA 2B55A 3A4OX 5DFPA 3LXNA 3F3ZA 4C7TA 3QX4A 2XKCA 3R8PA 4WKQA 2UVYA 1E1XA 4V05A 4EEVA 4ID7A 2YIYA 3RWQA 4D0WA 5KMMA 2C6EA 4D2RA 3VBWA 4BCIA 2F9GA 4TWNA 5CEOA 5GIOE 2B52A 2B54A 5CEQA 4DGOA 1H28A 2W05A 3NLBA 3S00A 3KL8A 4I24A 5C01A 4BBFA 4N6ZA 1JPAA 4ZY4A 3FMHA 3TKHA 3HMNA 4ANNA 3KK8A 4NEUA 3VBTA 5BVFA 5CLPA 4ZSEA 3QLFA 3FZOA 3AXWA 5D11A 4L00A 5LXMA 2YCRA 3POZA 4RFMA 5HIDA 2C69A 3EFLA 5EW9A 2VU3A 3UMXA 1Y8YA 2CGVA 1BX6A 5DOSA 4GKHA 2X7FA 1MQBA 5M44A 5HO7A 2AC3A 2R0IA 3GBZA 3VN9A 4C02A 3JY0A 1O9UA 1Q61A 3R8UA 2A19B 3KCFA 2IZSA 1KE9A 3ZHPC 4FTIA 5A4EA 4RFZA 3TDWA 4U41A 3I6UA 1BI8A 4G2FA 5FDXA 3PJ2A 4EOPA 3G6GA 1IAJA 4WNPA 4IX3A 4I6HA 4FSTA 4JX7A 2XIYA 4UALA 3V5LA 2FGIA 2X9FA 3RNYA 3QGYA 4RVLA 4FEVA 2OSCA 3DBFA 4M13A 4J98A 4G16A 4I4EA 5M4FA 3WZJA 2B9FA 4ZLZA 3MESA 3VS1A 4BR3A 3KN5A 3PJ8A 4NKSA 4DH7A 5AV2A 3TIZA 4DLJA 3QTRA 3C9WA 4FBXA 4FICA 3ZFYA 2O64A 3U6IA 3F61A 1OKVA 2BZJA 2VTTA 3COKA 4NCTC 2R3OA 4X2JA 4BDHA 3GCPA 3KREA 4C3RA 2QLUA 4GJ2A 4QPMA 4FTRA 5M4CA 3BPRA 5F9EA 3QKMA 5T6KA 3RAKA 5EW8A 4O7NA 2R7IA 3WF7A 3ENMA 4DG3E 3QYZA 1YXTA 4O7WA 2EXMA 3W8LA 2R5TA 2W4KA 1OI9A 2XKEA 4P2KA 4X3JA 3UC3A 1DAYA 2WAJA 4RZVA 5H2UA 5EM8A 4F9CA 3F3VA 3KF7A 2C3KA 1YHVA 3QTWA 2YITA 5EYMA 3PIYA 4UBAA 3Q04A 3Q32A 2CMWA 4U81A 4QMSA 3W2PA 3RWPA 4J52A 1KE5A 1NVSA 3IDBA 2XKFA 3RALA 5M4UA 4JJRA 5ETAA 1H1RA 2WOUA 5J9ZA 2OJFE 3MI9A 2FUMA 2HZ4A 2QOFA 4RJ7A 3KRJA 4ZTQA 3TKUA 2CHLA 3C4XA 3PY1A 4JVGA 1GZNA 5AIKA 2QO7A 1UKHA 5FD2A 3F7ZA 2ZAZA 3QZFA 3V5PA 5I5ZA 3RPVA 4AE9A 4W4VA 4MH7A 4A4LA 5EM5A 1OVEA 2GQGA 4EBWA 3BWFA 2ITPA 5M53A 4IB0A 4BGQA 2R2PA 3Q4TA 1W84A 5IDNA 4GW8A 3R1NA 3R7EA 2VO3A 4USFA 5ANKA 4QO9A 2P3GX 2X1NA 2YJRA 4MD7E 4NM0A 4Q9SA 2IZRA 3OCBA 5CU6A 1MRVA 4ENYA 3RM6A 3CS9A 5HLWA 3VULA 2YN8A 4HPTE 3PA3A 3TN8A 3FSKA 4I93A 3TT0A 4HOKA 4BDGA 4PDYA 4IB1A 4J71A 3PXRA 4YZCA 1H26A 2WMQA 4IDVA 5EDPA 4HCTA 4ZEGA 3UNJA 5A4QA 2PVRA 3JUHA 2J2IB 4GSBA 4O0RA 3RGFA 3OF0A 3D0EA 3VF9A 4C37A 4F08A 1ZYSA 4QNAA 4ITIA 1UU3A 3R7OA 4ZTMA 3DK6A 2OFVA 3DQXA 3HRCA 4EOOA 5HZNA 3FJQE 3G6HA 4LOQA 3ZXTA 4JQ8A 2VWWA 3MGYA 3OEZA 3QALE 4X7QA 5A3XA 3REPA 3DLZA 4FT5A 3FV8A 5AAEA 3COHA 2YM7A 4USDA 3TEIA 3UIUA 1YOJA 5M4IA 3F2NA 3MWUA 3R1YA 5EI2A 4AW0A 1JOWB 4N4SA 2XJ0A 1NT2A 2RFEA 2WMSA 3D15A 3MY5A 1FPUA 5HHWA 3FZPA 1UV5A 2R3KA 3MPAA 1IRKA 1VZOA 4PP7A 3Q5IA 4E4MA 4C2VA 3G5DA 3D5VA 1ZRZA 2B9IA 4G3CA 3FSFA 4ZS0A 1OBGA 3DNEA 1QPEA 3EZVA 4PTEA 4GL9A 3EWHA 4J1RA 3OTUA 4DEBA 4DEGA 5CZHA 2BKKA 3A62A 1RJBA 4MVFA 2PUUA 5AMNA 4O7RA 2X4FA 4C0TA 4YR8A 2BFYA 2VTIA 2ZV7A 3PUPA 3ORTA 4FZAB 3R7YA 3TACA 4C62A 2BTRA 2JKOA 4PPAA 4YZ9A 4ZSJA 3MFRA 3MVHA 4CLIA 2ZMDA 4ENXA 4OT5A 3GC9A 3UP2A 4RIXA 4QMTA 2BHEA 5L3AA 5JZNA 2QNJA 1OL5A 2YAKA 2O8YA 1Y6BA 2YACA 3K3IA 5G1XA 3EL7A 3QF9A 3TWJA 5E8TA 3BQRA 1DI9A 1JWHA 4ZY5A 2BDFA 4QNYA 5CT7A 4D0XA 4HYSA 5DN3A 5J7BA 3OHTA 4IXPA 4U8ZA 4AN3A 1MP8A 4CFUA 2W5AA 2DQ7X 1VJYA 4GG7A 5D7VA 3C4ZA 4N57A 4BWKA 2UW3A 3R1QA 1CDKA 5EFQA 3VIDA 2YERA 4IVAA 5B0XA 3UQFA 3UZRA 2P0CA 2X8EA 1FOTA 2XNOA 3K2LA 2XEZA 4QP2A 3ZXZA 4BIEA 2AUHA 2XUUA 1F0QA 4XS2A 4GT5A 4RVMA 5E8ZA 4QYYA 4YNOA 5L2IA 1JAMA 1O6YA 4BTMA 2F2UA 5HO6A 4BCJA 4ZMFA 1OPLA 1YDSE 4FV4A 2UW7A 3BEAA 3IW6A 3G15A 4AACA 2HIWA 4D2PA 1RDQE 5FGKA 3MN3A 5ANGA 4FZDB 3U4WA 5FQDC 3LZBA 5HGIA 4C61A 3MFTA 2ETKA 2EB3A 2UW4A 3BV3A 4UXQA 5E8SA 3QRJA 3R9OA 3OY1A 4O0WA 1GZKA 3RZFA 5AAGA 4XRLA 3W2OA 2BHHA 1JKTA 5EKNA 3A8WA 3PIXA 2GDOA 1H1QA 3L8PA 1NY3A 3GOPA 4ALVA 1M52A 3R7IA 5HIBA 4EH9A 1H0VA 2JKKA 3K5VA 3PYYA 3E8DA 3OW3A 3Q9WA 5JEBA 4F9WA 2I40A 2CGWA 4FNYA 4R7BA 5CEKA 1ATPE 2CCHA 5HCZA 4FGBA 4E26A 3A7FA 5LMBA 3LPBA 4AU8A 3NMUF 5CNNA 5LMKC 5AP5A 4MCVA 3AGLA 3O8TA 3UGCA 4YJOA 5FLFA 2R3NA 3UJGA 3AG9A 3E87A 2XNNA 5E8WA 3DBCA 5CU4A 2WQBA 4M66A 4O6LA 2G15A 3PJCA 3Q5ZA 4RIOA 5IA0A 3TI1A 4A9YA 1WAKA 2KTYA 2XK3A 2YCFA 3FZTA 3WE8A 4EH2A 4R8QA 3FQHA 5K4JA 3FZ1A 1GAGA 3S4QA 4DAWA 3FLSA 5LCJA 2R3FA 4Y8DA 4RC3A 3RAHA 4DEIA 4BWXA 4BIDA 1E9HA 3AD6A 2X2MA 2C3LA 3WF6A 4BCHA 4HVDA 4UMUA 4JG7A 3VW6A 5IA2A 4HCUA 4MF0A 5LMAA 4Z55A 3FLNC 2R3JA 1OIUA 2J6MA 3HKOA 1YKRA 3IW8A 4P90A 5LVPA 2J7TA 5BVKA 1QL6A 4D4YA 4XLIA 3TJDA 1XQZA 3RPOA 5M09A 3PY0A 1YHSA 2C6MA 2V7OA 3E3BX 4PMSA 1ZY4A 2FO0A 3TL8A 4IIRA 4I22A 3HMPA 3KRWA 3S95A 5IQGA 4LUDA 4AWIA 5CEIA 4EUTA 4EJ7A 3U6JA 3EKKA 4MBJA 4F9AA 4FF8A 2FH9A 3FLZA 1OIYA 4FSZA 5FXRA 4KSPA 1YOLA 3BE2A 4MAOA 4E5AX 5JGDA 5HD7A 4EHGA 3GC7A 2W5HA 4B6LA 5AP1A 4KKGA 4O22A 2C6IA 3NCGA 4PL3A 3VRZA 3R71A 1GY3A 3DBEA 2FSTX 1JSVA 4MK0A 4BWPA 4PMPA 4ZMEA 3NS9A 3ZZWA 4FV1A 5BVDA 2HYYA 2BZIB 2XYNA 2YCSA 3IO7A 2PUPA 3NVKI 1REKA 3QQUA 4O21A 4U44A 4A9RA 4M8TA 3UOLA 3FYKX 3GCUA 5F4NA 5DYJA 4I5HA 5IQHA 4BVUA 5FDPA 5HU3A 2G1TA 4RMZA 5D1JA 4BDKA 3U9CA 4F9YA 3FEGA 4OTPA 2I0YA 5KMIA 3IG7A 4N70A 2VTAA 4YU2A 3KN6A 2FSMX 3E3PA 4RJ6A 4WSYA 4RIWA 2YWPA 3I7CA 3UC4A 4G3GA 3C5IA 1U54A 5HTBA 4BIBA 3PRFA 3AT3A 3F88A 5A54A 5JQ5A 1P4OA 4KRCA 3KRRA 2C6TA 1ZAOA 3SXSA 3SV0A 1Q8WA 4CRLA 3HV5A 3TV7A 3ZTXA 3VAPA 1J91A 3NIZA 3OXTA 4IC8A 4O81A 4CG9A 2GS6A 1PW2A 4M12A 2PZ5A 1A9UA 2XK8A 2F7EE 4XCUA 3UIBA 3UOJA 4RQKA 5ITAA 2J90A 5C4LA 4DA5A 3PSDA 4DH8A 3F9NA 2J0MB 2GTMA 2B53A 3DAJA 2CKPA 2ZB1A 3CE3A 4YZDA 3VUKA 4DITA 5KX8A 2NRYA 1OKZA 2BDWA 1XBAA 3KXGA 4PMTA 3ZFMA 3HGKA 4QPSA 4R7HA 1OITA 1F3MC 4RA5A 3SOCA 2BVAA 3BYOA 5JGAA 3I0OA 4KD1A 3VUIA 2G01A 1GIHA 5H8EA 1RW8A 5F20A 4CXAA 3I4BA 1JKSA 3TZ9A 4EZ3A 3WILA 4MWIA 4FTAA 3VUTA 4L45A 3U6HA 3P79A 4YZNA 4O7YA 4F0IA 4D58A 4RC4A 3I81A 4C3FA 3ORPA 2PVHA 3ULIA 3SXRA 3MVMA 3P78A 4DGMA 2GFCA 3BE9A 4Q2AA 3PG3A 4I3ZA 3GQLA 4XJ0A 3AD5A 3OBGA 3QTZA 2R3MA 4FK3A 5JN2A 3EFKA 2C6OA 5TOZA 3ZOSA 4ASDA 4MD8E 4XNEA 2F4JA 4GIHA 1W8CA 3QHWA 4KABA 2WGJA 4YMJA 4XLVA 3ZU7A 4PL4A 3VS2A 5EQYA 3PP0A 1YVJA 2IG7A 4RVKA 4B0GA 5DVRA 3S3IA 2ERKA 5C03A 4XV1A 1YWVA 4CCUA 1WBSA 1Q62A 4F1MA 1H4LA 2EUFB 3QAME 4O7VA 5BQ0A 4FIEA 3FLQA 3TZ8A 4BCKA 2V7AA 3LFSA 5CF6A 1KWPA 1AD5A 2CSNA 3LQ5A 4JG8A 4NH1A 3PDTA 4A06A 2HELA 1PMNA 1U54B 3QX2A 4ZSAA 3V01A 3NUAA 4GYIA 3CQUA 3BRBA 4XP3A 2C6DA 2HWPA 2OF2A 4O1PA 4Y72A 5DI1A 3DXPA 2PE0A 3F5GA 4LMNA 3ORMA 3P7BA 4Y5QA 2QHMA 1JLUE 4JIKA 2VO6A 4FKWA 1HCLA 1XH7A 4NU1A 4QMLA 2C0OA 2E9VA 2R3PA 3PPZA 4S2ZA 2QOKA 5JRSA 2XK7A 4CFXA 4NM5A 3C5UA 3FQSA 4WBOA 5B7VA 3NAXA 4RX8A 4W9XA 3EIDA 5L8JA 4AUAA 3R63A 4R1YA 1MUOA 4P5QA 4QTAA 3HL7A 2OXYA 4L44A 1FMOE 2O2UA 2O0UA 3QQFA 2VUWA 3LQ3A 3GUBA 4F09A 3U55A 5BVOA 5AEPA 1M2PA 4HGTA 3ZZEA 2ZDTA 4L9IA 3NUPA 4LGDA 3BHHA 2VWUA 2JDOA 2PSQA 5K3YA 3VHEA 3WZUA 4DEHA 4FE2A 4B7TA 2PZPA 5JFSA 3JS2A 3BIZA 3MB6A 5EYKA 3C51A 5C4KA 5DT4A 4BKJA 1K3AA 5IMXA 2XYUA 4ANBA 2V62A 3G0EA 3UPXA 4NJ3A 4I6QA 4DEEA 4HGSA 4BDCA 4MD9E 2JBPA 2QKRA 5BVNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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