5FTQA

Crystal structure of the alk kinase domain in complex with cmpd 17
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
309
structure length
293
Chain Sequence
GPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRCAMLPVKWMPPEAFEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of Entrectinib: A New 3-Aminoindazole as a Potent Anaplastic Lymphoma Kinase (Alk), C-Ros Oncogene 1 Kinase (Ros1), and Pan-Tropomyosin Receptor Kinases (Pan-Trks) Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALK TYROSINE KINASE RECEPTOR
total genus 99
structure length 293
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ftqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ftqA01
4FK6A 5CU2A 5HE3A 2J0MB 2HYYA 4FSWA 1YOLA 2DUVA 5AAGA 1URCA 3BYMA 4F1MA 3KMWA 2W17A 3Q6WA 2PUIA 3NUUA 4JRVA 3Q32A 3MA3A 4GVJA 4LI5A 4UALA 1XR1A 3E7OA 3HV7A 1MP8A 2EXMA 3H9OA 5I3OA 3K54A 2OICA 5F95A 1PXMA 5DT0A 3AC3A 4GV1A 2HW6A 5BPYA 3KRWA 4FNYA 4AGCA 1CM8A 3G6HA 4D4YA 3DT1A 2PPQA 3HA6A 5IQDA 2P2IA 1RE8A 1YHWA 2F2UA 3R83A 3EFJA 4JDJA 4A9UA 4BHNA 2BFXA 2W7XA 3EQHA 2ITPA 1WBNA 4EZ7A 3RTPA 2R3JA 2QOHA 3ZFYA 4WBBB 4C33A 5BMSA 3PPJA 4I20A 4FI1A 3QQHA 4TKSA 4EOLA 4IM2A 4EJNA 2BPMA 4IHPA 5HG8A 2X7FA 2VO7A 4BTFA 2YJSA 1U59A 2C5NA 3OBGA 2C69A 3UE4A 3D83A 3DU8A 5HCZA 3W2RA 4PV0A 3SQQA 4D2SA 2BZJA 4F1TA 3FI4A 3UMXA 2Y6MA 4FIGA 4F09A 1Q99A 2O8YA 3CKXA 2ETMA 3EQBA 2PUUA 3DS6A 2JITA 5E8SA 4EH6A 4W9WA 1JKKA 2R3RA 3HV4A 3ANRA 3F82A 4XUFA 1PXLA 1IA8A 3CXWA 4U9AA 3F3UA 3KKVA 3LFSA 4BDGA 1S9IA 1GZNA 4ZSEA 3FI3A 1JNKA 4GKIA 4FV7A 3RPRA 4BC6A 5M08A 2WQEA 4O6EA 3TM0A 3OP5A 3A7FA 4BDFA 2QKWB 2CNQA 4EK4A 2VWZA 3W16A 4ERWA 1M52A 1BUHA 3LFEA 4X2KA 3R8PA 4IM3A 4PMSA 4PTCA 5LQFA 2IZUA 4UX9A 4FKIA 1QPCA 5LCJA 2XUUA 4GIHA 3KB7A 2UZDA 3MJ2A 2ONLA 4EH5A 3QFVA 4D9UA 3ACJA 2GFCA 2J6MA 3NMUF 3LMGA 4MQ2A 2RFEA 4ZLYA 4FTIA 3QTRA 2X7OA 3PXKA 4TWCA 1Q3WA 1PXOA 4FV6A 2OFUA 4F9WA 5ANEA 3FSKA 5CLPA 3EN9A 4C3FA 4CKRA 4EQCA 4Z16A 4FSRA 3QKLA 3E93A 4O7TA 3Q53A 1QL6A 1H27A 2Y4IC 2HZ0A 3MB6A 4GUEA 5CSXA 4ENYA 3ORZA 4D2RA 2OJJA 4H39A 3V04A 1OITA 3ZO2A 4N0SA 4CTBA 3U55A 1Y6AA 2HY0A 1CDKA 3A99A 4XG8A 1SMHA 3D7TA 4ZTSA 5ETCA 4L45A 4Z3VA 4RFMA 4UMTA 2C6KA 3KGAA 5CXHA 5EW8A 4EZ5A 3Q4ZA 5EM6A 3R8LA 4BDCA 2VTIA 5DBXA 3QZGA 4FA2A 4Q5EA 3EB0A 3OEFX 4RVLA 3KRJA 4NIFB 4X7QA 3F2NA 4YMJA 2BMCA 4JAIA 1OKZA 1YW2A 3I60A 4KS8A 5BYZA 1OL6A 4JQ8A 1KUTA 3DFAA 5ANOA 4ZY4A 2B1PA 2C6MA 1KE5A 3RAHA 1E1XA 2IZSA 2YCRA 5KNJA 3DKGA 2XNMA 5E8WA 3A8WA 4L44A 1U46A 2PMNX 3DK3A 2OIQA 2FH9A 5FP5A 5CYIA 1UU9A 3OTUA 4BN1A 4ZS0A 2C47A 2F9GA 4JNWA 3V8TA 3R1NA 4BF2A 4ZLOA 1YWNA 4R78A 2B9FA 2R7IA 2WEIA 5FQDC 3IECA 4DH7A 3FHIA 2HXLA 3RK9A 4IVCA 3G2FA 4FKTA 1NVSA 3DOGA 3Q3BA 4CRLA 1UU3A 4Y85A 3W1FA 4FV4A 4RGJA 1WBPA 1KE9A 3PFQA 4YJQA 1M17A 2X81A 5K4JA 4KSPA 4WRSA 3FLZA 3CJFA 5GNKA 3FKNA 4DN5A 1J7IA 4LRMA 5AR7A 4N4SA 3LM5A 3H0ZA 5KMJA 5IA5A 3G90X 4JT3A 3NUYA 4CG9A 3ORTA 4O91A 4C2VA 5K0KA 2IZTA 4YC8A 2B52A 2XRUA 3OG7A 4BTKA 3MVJA 4J99A 4DLJA 2ETKA 4FX3A 3WF6A 5ANIA 2WMUA 3TJCA 2OWBA 3TTIA 4OW8A 3IW6A 3VJOA 2YCQA 3DNDA 2C5YA 3UYTA 1OUYA 2UVZA 4XV2A 4L01A 4W4XA 3I6WA 2E2BA 3D5VA 3OXZA 5EM5A 4TYHA 2OSCA 2ZMDA 1ZYDA 4NW5A 4YJSA 3UGCA 2P4IA 3PIXA 4XLVA 4DFLA 2C5XA 3FMLA 3NNUA 4U3YA 4FTQA 4E4NA 4QMPA 1M7NA 3FXWA 4L00A 3C0HA 1BL7A 1OKWA 4QPSA 4ACDA 3U54A 3C1XA 4I1ZA 4QP4A 1W8CA 5LJJA 2W5AA 3VNTA 2J90A 3BU3A 2GNGA 5HVJA 1K3AA 4QP6A 2BCJA 4ANQA 4AS0A 1AGWA 4MWHA 4KBAA 2B9IA 2EU9A 2NNWB 1OKVA 1ZZ2A 5LVOA 3C5IA 1JVPP 4AW5A 2Y6OA 2C6EA 4RQVA 2AC3A 3OROA 4CYIA 1FVTA 3OWLA 4MD7E 4O0TA 4JL9A 5FBOA 5KX8A 4R7BA 5EOBA 1YXUA 2C6OA 3R2BA 3MH1A 2VO0A 4TPTA 4UWYA 4RVKA 5CEOA 5BYLA 1F3MC 4GU6A 3NUAA 4IX6A 4JAJA 3OWPA 4B0GA 3O50A 4BYJA 3CD3A 2JKOA 2BILB 2QHMA 4IIRA 2EXEA 4RJ8A 3BEAA 3GU5A 3LQ5A 4LGHA 3S2PA 5DYJA 1NVRA 1ZARA 2JIVA 4LYNA 4QTCA 5BMMA 4FZ6A 4O7VA 4J71A 4IJPA 5H8BA 3WE4A 3GQIA 5JZNA 3LFNA 4OBQA 3COIA 3L8SA 3HMOA 4DA5A 4YTHA 4YZDA 5C8MA 3FBVA 4NJDA 4BDAA 5D12A 3H30A 4EORA 3EKKA 3EYGA 1FVVA 5CANA 3NDMA 2QR8A 4GIIA 4XV3A 3ZUTA 4FV9A 2RG6A 4F9CA 4CQGA 3NIEA 4ANOA 3M2WA 3NAYA 3EOCA 4II5A 2HK5A 1H28A 4IX5A 4U79A 1DI8A 4WUAA 4CFNA 5BUIA 4B99A 1Q62A 2W1GA 5TOZA 4R5YA 3D5UA 4V01A 4XRJA 4FIHA 4PDPA 4YUQA 4GT3A 4G1WA 2GQGA 4KRCA 3EQRA 1JKTA 1GNGA 3EQFA 5EYMA 3JUHA 3RI1A 4U45A 3DNEA 4F0FA 3BRBA 4K9YA 2O0UA 2PMOX 4DFUA 4OGRA 3LAUA 4TXCA 4BBEA 3WILA 3TL8A 5TE0A 4AOIA 3AD5A 3PVUA 2R0UA 5J7BA 4GG5A 3ACKA 3FAAA 1R78A 2C3KA 4FTTA 2P3GX 3PWYA 5ANDA 4BBFA 4HCVA 2CNUA 2CNVA 2KTYA 3HZTA 3O23A 2Y8OA 4AFEA 2CN8A 3V8WA 3ORPA 4E5AX 2RG5A 3F69A 3PE1A 4JOAA 2Z8CA 2H6DA 2C1AA 4QYGA 3CKWA 3K5UA 1BYGA 2OIDA 2EUFB 1ZWSA 1GZOA 2HOGA 3NLBA 4JDHA 4IC8A 4KIKA 4MNFA 5CVHA 4O84A 4IWPA 2O3PA 3R7YA 1V0BA 2XKEA 3KVXA 4K11A 3UP2A 2UW8A 1S9JA 5AWMA 2O64A 3HDNA 2YDJA 3QD2B 5E8UA 5HNBA 2IVTA 3TTJA 5I4NA 5AP1A 2GFSA 3DCVA 3D5WA 4V05A 5B2KA 4NCTC 2YN8A 4MVFA 1JAMA 4XJ0A 1LEWA 3ZM9A 5H8EA 4I6BA 3NS9A 1XH6A 4FEQA 4K33A 5EI8A 5ACBC 4QP3A 2XBAA 5J95A 5L8KA 3F3TA 2W1HA 1CKIA 5K4IA 1Q8UA 2W9ZB 2J0LA 2W1DA 2PVFA 4S31A 4DGLC 4FVQA 3QZIA 4EOOA 5KUPA 2WTWA 2V22A 3GCVA 4F6WA 3MFSA 5K3YA 2WD1A 3U4WA 4ZSAA 3HEGA 4G9CA 1R1WA 2ITZA 3R9RA 3CBLA 3EQCA 1XWSA 1BKXA 2DS1A 4FIEA 4GW8A 4HVIA 5DIAA 1UKIA 3HUCA 3C4XA 2JBOA 1OL7A 1XJDA 4X2NA 5ANGA 5HO8A 4CFUA 2YFXA 4D28A 4AOTA 2BUJA 3CQEA 2CJMA 3D7TB 3FZOA 4CFFA 5KBQA 4L67A 3IONA 2HAKA 2QVSE 4FTJA 5HIDA 4BCJA 4F63A 3B2TA 4FVRA 5EW9A 4AT4A 3I7CA 3UODA 2ITXA 3ZU7A 4IB3A 4KIOA 5BVFA 4EYJA 5DOSA 2JDOA 1XBCA 1Q5KA 1J1BA 3AMBA 4XOYA 4YR8A 2VX1A 5CQWA 3VHEA 4FSQA 3FHRA 5JGAA 5EM7A 2QODA 4M69A 4RIYA 3PLAE 4TYJA 3QA8A 2GNHA 5HESA 4FT9A 4UB7A 1JOWB 4I3ZA 4FKLA 4YBKA 2XVDA 4MTAA 3JY9A 1OIRA 4RC4A 4OT6A 4YBJA 4ZMFA 1A9UA 2A2AA 3MA6A 2JDTA 4BIDA 3O51A 4LGDA 2HXQA 3ZC6A 2UW9A 4D0WA 3SG9A 4F7JA 3K3JA 4R6VA 2PVNA 4XX9A 4C34A 4NUSA 1TQPA 3ALOA 2XM9A 1WZYA 3DA6A 3IO7A 2J50A 2QR7A 4PNIA 4WG4A 5CSWA 3WIKA 4DF3A 4DAWA 4CSVA 3GCUA 3N4UA 4EK6A 4QP7A 4RQKA 4LRJA 2YJRA 4C57A 5JT2A 1TVOA 5BQ0A 1ZYLA 3IDCA 3R7EA 4H3BA 5EM8A 4R3RA 4K1BA 2YM6A 5DRBA 2W06A 4TYEA 4HOKA 2WMTA 5L6PA 2XK3A 4W9XA 3CLYA 4PL5A 3VJNA 2UW5A 1VR2A 2PVKA 3QCQA 4CT2A 5AIRA 2XKDA 3EQDA 4M8TA 2VWVA 3ZBFA 4TWPA 5BVKA 5C26A 2WU6A 3R28A 4K77A 4AZSA 4DCEA 3R30A 1UWHA 3GU8A 5T6KA 1YI6A 4LOQA 1G3NA 2G2IA 2Y7JA 1V0OA 2CGUA 3L8VA 3PVGA 4N6ZA 1Q61A 5M56A 3GCQA 3QRUA 4H1MA 4PTEA 4ZSLA 2BZKB 5CEMA 4YO4A 3ITZA 2PHKA 2X8IA 3WARA 3LFFA 2DQ7X 3LFDA 4DLIA 4E6CA 3EH9A 4FC0A 5EFQA 2BFYA 4EBWA 4AGWA 2QLQA 4N6YA 4GG7A 4U3ZA 3UBDA 4QTEA 5CAOA 5KMOA 5ETIA 3ZHPC 3AXWA 1I09A 4X2FA 1KWPA 2GS2A 5EHOA 3SAYA 2CKOA 4JX7A 2GU8A 4BI0A 5AUUA 1O6LA 5EI6A 3KN5A 4M15A 3AC5A 4PF4A 5CF8A 3LJ2A 2B55A 3LJ1A 5JFVA 3ULZA 3MJ1A 1MQ4A 5GJFA 2FB8A 3EN6A 4O7YA 3E88A 1REJA 3P9JA 4F70A 4E1ZA 4JS8A 1XH8A 4AX8A 1OPJA 3BCEA 5KMMA 3R7VA 4FT3A 4XP2A 1PYXA 4PTGA 3ZFXA 5C8KA 1YXTA 1JBPE 3K2LA 3KN6A 3OS3A 5KCVA 3GVUA 4XG9A 2YLEA 5AP2A 3CQWA 4BKJA 3DJ5A 3VULA 5J7HA 4CKIA 3WF5A 1XBBA 3RHKA 1LEZA 5JFSA 1NT2A 5DN3A 4IAKA 4HZSA 3REPA 4EI4A 2BZIB 5E8TA 4YURA 1ZOEA 3BU6A 2W1FA 3MIAA 5J1WA 2C6IA 3PSCA 3DQXA 4IANA 1LR4A 4NFMA 3G5DA 3LOKA 2AC5A 4TWNA 5EKOA 5HVYA 4ZEGA 5TO8A 3WF8A 4DFBA 4YHJA 4HGTA 4EH9A 3TUCA 4IACA 5JH6A 4HJOA 5HNGA 3DDQA 2O2UA 2BRBA 3NNWA 4LM5A 3DQWA 2GNIA 5T3QA 2WTJA 1X8BA 1UA2A 3OCGA 5BVOA 2R3FA 5BUEA 5CAUA 2BTRA 4AZWA 3W2OA 5A46A 4WNPA 1QPJA 5IH6A 4Z55A 2ZYBA 2FYSA 2QKRA 3L8PA 3R02A 3ZMMA 2PSQA 4FKJA 2J0KA 4A06A 2DYLA 3OD6X 1OECA 3F5UA 1UNHA 3MH3A 4PMTA 5L6WL 3TEIA 2PVYA 5JRQA 4JX3A 2QO2A 2ZOQA 2R9SA 4HYIA 3EL7A 4PQNA 5IMEA 5IQAA 4GT5A 4IADA 4LUEA 5AA9A 2VNWA 1FINA 3SLSA 1WVYA 2CHLA 2I0HA 4XBRA 3TV6A 2GDOA 3TZ7A 3V6SA 4G6LA 2GPHA 4OT5A 4M97A 3I1AA 1OKYA 4YZCA 4AUAA 1YXVA 2J0JA 4XV9A 3EN4A 5KMNA 2XBJA 1VYWA 3C4WA 3IW8A 2BHHA 4U41A 5AUWA 3WF9A 2PMLX 5DE2A 4DG2E 2IG7A 4X0MA 3LIJA 5CENA 4DEHA 2XNEA 4ANSA 3KU2A 5KMKA 4MEDA 2OZAA 3HGKA 4M68A 3G9NA 1ZZLA 3TT0A 2J51A 4C4GA 5BX0A 4JBPA 3O71A 3ELJA 2A27A 1JWHA 3DKCA 4LGGA 4QMUA 3SOCA 3E3BX 4QYFA 2BIYA 2HCKA 4WHZA 4DEIA 4EK3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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