5GJGA

Crystal structure of human tak1/tab1 fusion protein in complex with ligand 4
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
307
structure length
289
Chain Sequence
GPLHMIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPGRVEPYVDFAEFYRLWSVDHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of a Method for Converting a TAK1 Type I Inhibitor into a Type II or c-Helix-Out Inhibitor by Structure-Based Drug Design (SBDD)
pubmed doi rcsb
molecule keywords TAK1 kinase - TAB1 chimera fusion protein
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 289
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2016-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5gjgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5gjgA01
2JDTA 3MV5A 4GS6A 3Q5IA 3TZMA 4J1RA 2UVYA 4FIGA 3F2NA 3R0TA 3BGZA 5IQBA 2OJ9A 3GC0A 3LFSA 3MBLA 3F3ZA 3QXPA 3T9TA 4EBWA 5E91A 3PWDA 4BCPA 2B4SB 4XJ0A 4RX5A 2YCQA 3SAYA 2YAAA 4NM5A 4DFYA 3R9DA 4ORKA 4IVDA 3FUPA 4GU9A 4RFYA 3ITZA 3LZBA 5D9HA 5EYKA 2P4IA 3HNGA 3RK7A 4IVCA 2UW5A 3MVLA 3P78A 3QZIA 3IS5A 4OTHA 3RPRA 4M7IA 4KAOA 4O84A 4EYMA 2VO3A 4FKSA 5BUIA 3R7OA 5CENA 3NYVA 3VF8A 3A7JA 2XJ1A 3ZXZA 2I0YA 4AUAA 3QTQA 3ORZA 4TTHB 5AP0A 5JQ5A 5M07A 3ZDUA 3VS5A 4ACMA 1KE5A 4U3YA 3TNQB 3NUUA 2HZ4A 3N9XA 4F7SA 5JFXA 2WMTA 4IWDA 1W83A 3TKHA 3ZBXA 2XNEA 1KE6A 4GK2A 5BVNA 3AD4A 2BIKB 3KY2A 4RX9A 2Z60A 1Y6AA 2G2HA 1IR3A 2GNHA 4GW8A 3HYHA 3EN4A 4D2PA 4AT5A 4EK3A 4JRVA 5CF8A 4M8TA 4NTSA 4ZSAA 3K3JA 3V5LA 5CNNA 3JY0A 4ANNA 3LW0A 1MRYA 2OFVA 2WMAA 3CKWA 4BKJA 4FKWA 3ROYA 3HGKA 3SW7A 3VS2A 4V04A 5FDPA 3DLSA 3F82A 4TRLA 2NRUA 1DAYA 3ZYAA 4BHZA 5FTOA 1OL2A 5JZJA 2JITA 4NK9A 4LL5A 2YABA 2OXXA 3LFNA 4EOJA 3CD8A 4WUAA 5EYCA 4UXLA 3QTUA 3I79A 1KUTA 1H07A 3H9OA 4YO6A 3Q2MA 4WG4A 4EHVA 4R6VA 4X3FB 4D2VA 5E4HA 3PVWA 3DAKA 3CY2A 2I1MA 4DEAA 4U43A 4EK8A 4EKKA 5IQFA 4JBPA 5TKDA 2PE2A 2B0QA 5BVFA 3H30A 4Q5EA 1HCLA 1IAJA 1GIJA 4EOPA 3NDMA 5CAQA 4B6LA 2R7IA 5CU6A 2VWXA 2VGOA 3BYSA 3FPQA 4EQMA 4LI5A 5F94A 2OIDA 3Q04A 5LVLA 2C0IA 2VAGA 4C3RA 4KINA 4L52A 4U8ZA 5I9YA 4L53A 5CALA 2VTMA 3A7FA 5EKOA 3EQHA 4TYGA 5E8XA 1QPEA 4KUJA 5L6PA 4JT3A 2C1AA 2ZM3A 2O0UA 4L00A 5AAEA 5J1VA 4K2RA 4N4SA 4PX6A 3K54A 3NUXA 3HZTA 4B0GA 4F0IA 3BZ3A 2B55A 1REKA 4CKJA 4FTTA 5DNRA 4UEUA 2WEIA 5L8LA 4OAUC 2VWYA 3QUPA 5A4TA 3W32A 1M2QA 3IW4A 3F3VA 5J1WA 2ERKA 2GDOA 3KULB 5EYDA 5ACBC 5L4QA 3RVGA 3KXZA 4KS8A 4MWHA 4ZLOA 1OGUA 4Y85A 1M2RA 1BKXA 2PL0A 5IKWA 5HZNA 2WMRA 3F5XA 3W2SA 4MD7E 5CVFA 3P08A 5G6VA 3VS3A 1GY3A 3FKOA 3L9NA 1PY5A 5K0KA 4DE4A 4L7FA 4IB5A 5DA3A 3ET7A 5JFSA 4E5WA 5F1ZA 3SVVA 3JPVA 3O96A 4Y83A 5CLPA 4LOPA 4FV2A 3GOPA 5L2QA 4ZJJA 3ORLA 2UV2A 2R3NA 4JAJA 3C4EA 3O23A 1XH6A 4JR3A 4XG3A 5EI2A 5A4LA 3H0YA 1GIIA 4G6LA 1Q8ZA 3UIMA 4IWOA 4L3PA 5CYIA 2QG7A 4TT7A 2X1NA 5KMIA 3VQUA 4FR4A 3QD0A 5CQUA 3ZFYA 3CBLA 3OC1A 5EW8A 5GZ8A 4PP9A 3N4UA 3MFUA 3W8QA 1A9UA 4WRSA 1OPJA 5AJQA 5HG7A 2XYUA 5HVYA 3LJ0A 3KREA 2JKKA 2WGJA 2VWVA 4YP8A 3UZPA 3PIXA 5K3YA 4O83A 3BYVA 4YC3A 4QP7A 5DYJA 2ZB1A 2NO3A 2QI8A 5BVWA 2R0IA 5E9EA 3V8WA 5IQGA 4FKLA 4CSVA 3II5A 4OAVB 2PY3A 2C6DA 4QMOA 2Z02A 2Y8OA 3COKA 2OK1A 3ZU7A 5A4CA 3O7LD 3BIZA 2YFXA 4IVBA 3FQHA 4RX8A 5IQIA 2CKEA 3CR0A 4RVKA 4I5MA 4BN1A 4FKRA 2UW6A 2C6MA 1Z5MA 1CTPE 3P23A 3C7QA 2WTIA 3GU5A 4DLIA 2JIVA 4GUEA 3MDYA 2HY0A 4ZTLA 3F7ZA 2XVDA 4L44A 4NWMA 4UWBA 3UMXA 4PL5A 4X2JA 4K9YA 3V5TA 2VWWA 1WVWA 3DV3A 3MIAA 3COIA 4C37A 4CQGA 3QGWA 4MBLA 4ZZOA 3OT8A 3D2IA 1E1XA 3OY3A 1QMZA 3QKLA 4WT6A 2J4ZA 2FSMX 3KQ7A 3UVPA 3ZLXA 3ZHPC 4OW8A 2R3JA 2QOLA 4AP7A 4BI0A 3BLQA 5BYLA 5IQDA 3VUIA 4FTKA 3K5VA 2OZAA 4QP9A 3C51A 4XRJA 3V5WA 4B8LA 5J7BA 5JT2A 4HJOA 2XEYA 3ACKA 3BX5A 3OBGA 3PE1A 3VULA 4A07A 4LRMA 4C4HA 5IQHA 4AT4A 4PP7A 5FGKA 3LFQA 3DJ7A 5KE0A 4ASEA 4IX3A 4ALVA 2PE1A 2YCRA 3C1XA 4O0SA 4DT8A 3CQUA 2YACA 4PTEA 3LQ5A 4R7IA 4ZLZA 5ANKA 3C13A 4L67A 4FSRA 2J0JA 3TV6A 4D0XA 5LVOA 3EKNA 3NWWA 3G5DA 5K5XA 5IEXA 3NMUF 1UNLA 2C0TA 4FKQA 4U3ZA 2PUPA 4WRGA 3ZO2A 5TF9A 3FI4A 4RWLA 3KVXA 3BKBA 1OITA 4R1VA 2O3PA 3RZBA 4X2FA 1GJOA 2ZYBA 1UKHA 3RZFA 3HRFA 4A4OA 3IDCA 3NYNA 4ACDA 4FV3A 1H4LA 3GNIB 2OG8A 3V01A 4LGGA 1G8SA 3JY9A 5A3XA 4O2ZA 3DBFA 1JSVA 4HGSA 4J98A 5DR6A 3FHIA 3ULZA 1HOWA 5DRDA 3KRLA 3DT1A 1YDSE 3MIYA 5JRSA 2BZKB 2XNGA 4CZYB 4IC7A 2IW6A 3MY1A 1Q8YA 3PUPA 2R0UA 4AE6A 3PYYA 4YJVA 4ZTSA 5DFPA 5LOHA 4BKZA 4DFNA 4FT9A 4X3FA 2Z7LA 3O7LB 4ZSLA 4CT2A 1DI9A 1MQ4A 2KTYA 2XK3A 4O6LA 4WBOA 4XG4A 4CG9A 1PW2A 5AR5A 4BDFA 5DN3A 1L8TA 3HP5A 4D58A 1KE7A 4R78A 5H8BA 4NEUA 4FKJA 5IA1A 1H27A 3C4ZA 4FIJA 1ZYCA 1J1BA 4FODA 4BZOA 1Y57A 4NYEA 3NUSA 4BTFA 4BCJA 4EWQA 1NA7A 2J0KA 1REJA 4G5JA 5IH6A 2W4KA 2ZV9A 3PWYA 3UIXA 4IH8A 4J95A 1JBPE 1PXIA 4G34A 5ANJA 5CU3A 3FZTA 4EOQA 4UMUA 3R28A 3PXQA 2C6LA 2G15A 1JPAA 2E9NA 4EC9A 4NKSA 5J5TA 4ITIA 4MF0A 3RHKA 4E4LA 3GUBA 4PPBA 4Z16A 1ZAOA 2XEZA 4BIEA 4C4GA 2UZWE 4GEOA 2ZDUA 3DZQA 4C4IA 3FWQA 3LLTA 3IGOA 3EFWA 3I7BA 3FMKA 3OXZA 3QD3A 4WKQA 2ITYA 2R5TA 4RJ3A 4QPSA 4F09A 1Y91A 2QU6A 4D1SA 5EI8A 1FMKA 3MA6A 5E8TA 2WHBA 3EFLA 1BMKA 5FEQA 4RJ4A 3VW6A 2GCDA 1XHAA 4O22A 3CPBA 2ITPA 3BEAA 4ZP5A 4CNHA 4Y5QA 4BCHA 2YDJA 2FGIA 3QA0A 3R7YA 5CSPA 2WZJA 4YZDA 4XX9A 5HBEA 3DFAA 1RDQE 1ZYJA 3BELA 4YURA 2C47A 4N70A 4DCAA 4IAAA 4Q2AA 2CCHA 4GG7A 3GU7A 5IH4A 5FD2A 5D1JA 1U54A 2IVUA 3I6UA 3QRIA 3ZM4A 4O81A 5CU2A 2ERZE 3DQXA 2X2LA 4AFEA 1U59A 4D4SA 3A8WA 4IZ5A 1SVGA 2BAJA 2VTAA 3EJ1A 2VO6A 3R21A 4FF8A 3E93A 4JS8A 3DFCB 2W1EA 4KABA 2YM5A 4QMVA 4QOXA 4IZAA 3L9PA 4PTCA 4X21A 5EM6A 5AUZA 5AV3A 1QL6A 4ZIMA 4OUCA 4FV5A 3FE3A 3KXHA 4JRNA 4YHJA 3QQKA 3TZ8A 2OWBA 2PZIA 2OF2A 2BR1A 1ZMVA 4Y72A 4AOTA 2YM7A 3A2CA 4AX8A 5C8NA 2XIZA 1XJDA 2OJGA 4FKGA 1W98A 4QP8A 3I1AA 3TDWA 5CS6A 3PLAE 5JRQA 1LP4A 1Q97A 2C6IA 5AP2A 4MX9A 3MGYA 1MRVA 3HMPA 4U40A 4XNEA 3VIDA 1KSWA 3MPAA 4I3ZA 2OF4A 2VWUA 2XNMA 3EYGA 4FV7A 4FX3A 4EH8A 2VTOA 3NNXA 2W5BA 2BRBA 4BCKA 3D7TA 5CI6A 2BCJA 3WF7A 4BDEA 2V55A 1XBBA 1YKRA 3ZRMA 4YJUA 4FUYA 5KNJA 4YBJA 4Q5HA 1RQQA 4I6BA 4UZHA 3ENHA 3WZDA 4YBKA 5AR8A 4QQTA 2QR8A 5LMAA 4NW6A 3M1SA 2PMLX 3SKCA 1FVVA 2CSNA 4I0SA 1L3RE 4I4EA 3ZMMA 5BPYA 5C1QB 5HHWA 2RGPA 1NW1A 2A1AB 5HO7A 2QO2A 1NY3A 2PULA 3PE2A 4XG9A 5GIOE 4FT5A 4LOOA 5HVJA 3FLYA 4FSWA 4FNYA 3E8NA 3LXPA 3GB2A 3MB6A 5EDPA 3LQ3A 3FPMA 5EHYA 1X8BA 2GFSA 3SG9A 4K8AA 4XV9A 3ORKA 5BQ0A 5LJJA 3F88A 3CC6A 3TI1A 2JKMA 1GNGA 2OW3A 3PXYA 4FTIA 4TY1A 4RBLA 3VHKA 5GJDA 3ZS5A 3WZJA 4AZTA 4DEBA 3ORXA 4JQ7A 1H1WA 3RAWA 4RZWA 4RJ6A 5JZNA 3C0IA 1XH7A 3R8VA 3WZUA 3PFQA 4BCFA 4D2WA 3F61A 4IXPA 4YJSA 3BGPA 4EJNA 3KGAA 3EH9A 4G17A 4PTGA 5H8GA 4JR7A 2YWVA 4TPTA 2C0OA 4M14A 3S95A 5I9UA 3TL8A 3VBVA 5M4IA 3BLRA 5EM7A 2XYNA 1YXUA 3MWUA 5FXQA 4BIDA 3MN3A 2VTSA 2HAKA 2BMCA 4I20A 5A4EA 4FV9A 3RGFA 3RKBA 3LPBA 4ZZMA 4FTOA 4AW0A 4L3LA 5CVGA 3FI2A 4JDKA 2R3PA 3WILA 5HESA 5HLWA 3VBTA 4QTCA 3LMHA 5BMMA 4AT3A 5BYZA 4DN5A 2R9SA 4JXFA 3FY0A 4CKIA 3QGYA 4RPVA 4XMOA 4ZLYA 1YHSA 2Y7JA 4RC4A 4B4LA 4EOKA 5FQDC 3W55A 4EUTA 3GCSA 2Y4PA 2NPQA 3CY3A 4YZCA 4ANQA 3HV5A 4EZ7A 5EI6A 5EDRA 5M51A 3C5IA 3AC3A 4PPCA 3NUAA 3PZEA 2RFSA 4BYIA 4AFJA 3GU8A 4HGEA 4BTKA 1OVEA 2UZVA 3RCDA 4XV1A 3DTWA 3QCQA 2PVYA 3GXLA 3UO5A 2QHNA 4HYUA 3RCJA 3GEQA 4F6SA 2PVKA 1Q3WA 2XBJA 4O0WA 2BRNA 4JI9A 1IAHA 3BE2A 2A27A 3R7GA 4QTAA 1W8CA 5EOLA 4C7TA 3P0MA 3R7EA 3VBWA 1ZY4A 4FTRA 3EQGA 4YNOA 4MCVA 4IIRA 5KX8A 2C5OA 3FMHA 3GU4A 3NEWA 4RIYB 4XOZA 5LARA 4UWCA 4D5KA 3NAYA 2DWBA 3UPZA 2FVDA 3AQVA 4L43A 3CQWA 5HLPA 4LRKA 4BWPA 3L8PA 2WMBA 3CCNA 4USDA 5AM7A 5ANEA 2R64A 1XQZA 4EZ3A 3NW5A 3M2WA 4IJPA 2PWLA 4CG8A 2YM8A 4C59A 5AAGA 5IEVA 3SXFA 5DH3A 3W16A 2PVNA 2GNLA 3PSDA 4AWIA 4X7QA 3ATSA 4FT7A 5J95A 1QPCA 5CWZA 2FSOX 1PHKA 3FDNA 3IDPA 1UV5A 2VNWA 4F0FA 2VWZA 2WTKC 2XK7A 4LRJA 3VUMA 1TKIA 3R83A 4LQMA 4GJ2A 4IADA 3BU5A 2AC5A 5D12A 2YCSA 1OB3A 4X0MA 3GENA 4E3CA 3LFCA 4ALUA 2QODA 4F0GA 3RNYA 2ITXA 3VJNA 4HZRA 5F4NA 4KD1A 3TKUA 4BDHA 4TZRA 4FEQA 3PJ3A 1F3MC 5AP5A 3LCTA 4PDYA 3A7GA 4EHZA 3ZXTA 4ACHA 2QCSA 4MAOA 4RJ8A 3C4WA 4B9DA 2HXQA 5AEPA 4XUFA 2W1ZA 4D55A 5DRBA 3HMNA 4KSQA 1OMWA 3D14A 4IQ6A 4IM0A 3PY1A 1OI9A 3CIKA 3IOKA 3NYXA 5BNJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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