5HKMA

Discovery of novel 7-azaindoles as pdk1 inhibitors
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
283
structure length
272
Chain Sequence
KKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIKENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETCTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYDFPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of novel 7-azaindoles as PDK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1
total genus 79
structure length 272
sequence length 283
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hkmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5hkmA01
2YWPA 4R3CA 3AG9A 4WG4A 4EZ3A 4I1ZA 4FUYA 5GJGA 2R3KA 5AUXA 5TF9A 3V5LA 2VU3A 2Z60A 4CKJA 5CEIA 3U54A 2J51A 3E3PA 4NKAA 3Q9ZA 3QCQA 4L67A 3OOGA 2QLUA 3G5DA 3PVGA 3P08A 3G9LX 2OIBA 5IA5A 1Q3WA 5DIAA 1WVXA 4ZTMA 3QLFA 1FOTA 3R9OA 3W2RA 4QP2A 4PV0A 4Y95A 4FT0A 1UV5A 2X81A 4F9BA 4YUQA 3ID6C 5BQ0A 2ZB0A 1CKIA 3GU5A 3KU2A 3UOHA 4DG0E 1OECA 3VBVA 3MB6A 5IMXA 3BE9A 5J87A 3V3VA 3DCVA 2VWBA 4DGOA 2C5YA 3MY0A 4H36A 5A46A 2PWLA 4G9RA 3I0OA 2RKUA 3ZHPC 4BI0A 4M68A 4IVDA 3VS2A 2QOHA 4AOTA 4QYHA 5CEMA 2DUVA 5AEPA 3A62A 1H1WA 3F61A 1TQMA 3R28A 2JD5A 1NT2A 5CSVA 4LL5A 4JDIA 3A7JA 3QTZA 4FUXA 3RM7A 4CZYB 3E63A 3OWLA 4IC8A 4FL2A 4O6EA 3SQQA 2WIHA 2W1CA 2WD1A 4OBQA 3VUHA 1BL7A 4XG7A 1Y57A 4JBPA 3ZZEA 5FBOA 2Q83A 3SD0A 4Y73A 4ASDA 4E4MA 3LXKA 4FKQA 2Z7QA 2PVHA 4IAYA 4XEYA 2BDFA 1JSTA 4YJUA 1Y6BA 5HVJA 5EFQA 3TNQB 4CLJA 2PMNX 3I7CA 4EHVA 4WSQA 1OITA 4BCPA 4DC2A 3VULA 2GS6A 4RJ3A 3NW7A 5LMBA 4EOLA 5J7BA 5FLFA 4I41A 3Q4ZA 5BYLA 3MTLA 5L6PA 1WBNA 3UIMA 3OT8A 3PLSA 2R7BA 3B2WA 1Y8YA 3KF7A 2HZ4A 4GJ2A 5DGZA 3EFJA 2UV2A 4QYFA 4QYYA 4YZBA 5T68A 5TE0A 5DVRA 4D1SA 4D5KA 3ATSA 3VHEA 4ORKA 4OTHA 2OXDA 2WMVA 4BDAA 4CQGA 2AYPA 4M0YA 2X8DA 3BYUA 2VO3A 5FBNC 4BCNA 3C7QA 3TEIA 2PL0A 4D5HA 1ZAOA 5HICA 3EZRA 3QTUA 5LCJA 3BGPA 2BRNA 3PUPA 3TTJA 4EK5A 4GFMA 4GW8A 4C3FA 2E9VA 3OP5A 4IZYA 5KMLA 2GFCA 2OICA 2VTJA 4L3LA 3W2QA 1B6CB 4AZTA 3BGZA 4GT3A 2ETMA 3BLRA 3IW6A 1CDKA 2B9JA 3FZOA 3FQEA 3TN8A 3Q9YA 4UZHA 2YWVA 1Y6AA 4AE9A 1LR4A 3QHWA 2HZ0A 2NP8A 1H0VA 4QMYA 5M08A 5ANIA 3D4QA 2PVKA 1R1WA 2EXMA 5J9LA 3D2KA 2OJFE 1YHSA 2ONLC 1FMOE 3FMHA 5CF5A 3UQFA 4FIEA 3MFRA 3K3JA 3ZS5A 4DEHA 1J7LA 1Y91A 3BRBA 2W4JA 1WVYA 4ZMFA 5FXQA 2PULA 2C68A 3GNIB 2WMUA 4MQ1A 4R1YA 1AGWA 2X2LA 4FC0A 3VN9A 4IBMA 4BTJA 3C0HA 2PZPA 4S32A 1ZMVA 1DM2A 4L46A 4C4GA 5FXSA 3ZO2A 2ZB1A 4DG2E 3CKXA 3GC0A 4UY9A 3BYMA 2W1GA 2WOUA 3FXXA 3QCYA 3ZXTA 4KUJA 3ORPA 3TZ9A 2HK5A 2O2UA 3M11A 2UZNA 1GJOA 3UZTA 5CENA 4ZSJA 2HZNA 2W0JA 2WMAA 3R63A 1DI8A 1XKKA 2FVDA 3FWQA 3C4FA 3EB0A 3PZHA 5BVFA 2BHEA 3UVRA 5CF4A 4JBOA 4L68A 4CYJA 2C0OA 3QRKA 5DFPA 3OHTA 5B2KA 4K18A 2B9IA 4HGLA 2F49A 2VO0A 2W1ZA 3FI3A 3KA0A 4GRBA 5ANJA 2BRGA 3HRBA 3V5PA 3U6JA 3TM0A 4I0RA 4KBKA 2JKQA 4DEDA 3TZMA 2PZRA 4EK3A 4XBRA 1RW8A 4BF2A 3CPCA 4G3DA 4LYNA 3E3BX 4NUSA 4BCFA 4LOPA 2PU8A 3E5AA 1PRYA 2QKRA 3BQRA 4I20A 2YABA 2WQMA 3KCFA 3OXZA 5A9UA 2ERZE 3Q6UA 3D9VA 3DPKA 2WXVA 2G15A 2GNLA 2FSOX 3HA8A 4QO9A 1YOMA 4KKGA 4CMTA 4WBBB 3CTHA 3MA6A 5AV1A 5L3AA 4FKUA 1WBTA 4XRJA 2VWIA 2C6KA 3QD4A 5I9ZA 4D0WA 5L8KA 3GC8A 3KXHA 2XEZA 4DEIA 3HUCA 2ERKA 3CIKA 4FKLA 4C4HA 4PTEA 5HNBA 1KOAA 3VVHA 1ZYJA 4YMJA 1UKIA 4FMQA 4ANOA 3R30A 3DZOA 1WFCA 5TR6A 4WNOA 2C6MA 2GHGA 4HW7A 3WZUA 3N51A 2BCJA 2XS0A 2F7XE 1VYWA 4GIIA 4QQCA 4ANNA 3FL4A 3LVPA 4IX3A 4WG3A 4NM7A 4MF1A 3C1XA 3E8DA 4O0XA 3FC2A 1E1VA 3IDBA 3CQWA 3PVWA 3AC5A 2UW6A 2X7FA 5HD7A 1ZXEA 2OH0E 4LMNA 2W17A 4AG8A 2P4IA 3I1AA 4DGMA 4JBVA 1JVPP 5TKDA 4F6SA 4Q2AA 1PXIA 2R9SA 4W9XA 2VWVA 3IG7A 4FV1A 5BVWA 3VW6A 5HG5A 3NUPA 2BRHA 2VWZA 4JXFA 3FI4A 3WZJA 4M69B 4UWBA 3AMBA 4C33A 1ZARA 2REIA 2VTSA 3DQWA 5EYKA 4IADA 5JFXA 3HZTA 1U4DA 4R8QA 3QTSA 1XQZA 1Y8GA 1ATPE 1E1XA 2G2IA 2XBAA 3F5GA 2R0IA 4C4JA 2VUWA 4AT4A 5HCYA 2A4LA 3C4EA 2I40A 4AN3A 3C4WA 3QTXA 4YJQA 2OWBA 3QA0A 4YZMA 5J95A 5I5ZA 4U9AA 5J1WA 4GKHA 3NUSA 1PXKA 2ZV7A 3QQHA 4LL0A 2J90A 2VTIA 4ACMA 1UWHA 3DFAA 3D15A 3VS1A 3D7TB 3FPQA 3NYVA 3W2OA 3RK5A 3ORIA 3IGGA 4FIFA 4E7WA 3D5UA 5HORA 4A9RA 4U42A 2UVZA 5GNKA 4DEAA 2WTCA 5HTIA 4RJ5A 4WO5A 3SRVB 3GENA 3C9WA 1ZYCA 5CU6A 5BVDA 1ZY4A 4V0GA 3RJCA 2XJ0A 3SA0A 4O2ZA 3T8OA 5HX8A 4IACA 5ANEA 5IMEA 2I0VA 3OMVA 4IZ5A 4PTGA 3ZM9A 2UVXA 1JQHA 2C5VA 3COIA 4F0FA 5IH5A 1H27A 2W9ZB 4FICA 2RGPA 5L8JA 5KHWA 3PJ3A 3QUPA 3DLSA 2OZAA 2W06A 4FTUA 2DWBA 2XNGA 2GSFA 3VBQA 4CFXA 3LXPA 4FVRA 3R22A 4LM5A 4EOQA 1A48A 5AAFA 2R3RA 5HBHA 1URCA 3EKNA 4FSWA 4RPVA 2VTMA 4YU2A 1MRUA 1JKLA 5E8WA 2GQGA 1WBSA 2C5XA 2OIDA 4MBJA 5HIBA 2V5QA 3A60A 3TKUA 4XYFA 2OFVA 3ITZA 3G9NA 4OBPA 3DBDA 4TRLA 3VUKA 3RM6A 3FSFA 2XIYA 4EC8A 1H25A 2BILB 5LMKC 1A9UA 5JSMA 1JOWB 5LVOA 2J0IA 3TUBA 1WBPA 3FMEA 4HNIA 2VX0A 2OXXA 4ONAA 1OIYA 3O50A 3MS9A 3RAKA 4UWCA 1YXXA 4PY1A 5IA0A 2C6LA 2VTAA 2WQOA 1ZZLA 3HNGA 1OIRA 4D9TA 3BLQA 5C1QB 3PPJA 5EHYA 1FGIA 2UZUE 3V5QA 3UIUA 1CKPA 4MCVA 2UW9A 2HY0A 3FEGA 1YQJA 1G3NA 2IVTA 3JVSA 3PRFA 4FTMA 5HOAA 5A6NA 3I7BA 3LXLA 4RC3A 2PVJA 2W1EA 4BWKA 4KABA 3DKCA 3GGFA 5DLSA 2R7IA 3QD2B 5CQUA 3QLGA 4NW5A 4MX9A 5L2TA 5IEYA 4ZSEA 2XIKA 3E93A 1JSVA 4FSTA 4IWOA 4AX8A 3KULB 3LCOA 4BKZA 1YVJA 3L9PA 4BB4A 2JAVA 2XIZA 3PXKA 5M56A 3AQVA 2JKMA 3ENHA 2VV9A 2GNIA 5AP1A 1IRKA 2ZVAA 1UKHA 4NEUA 3IS5A 4TWCA 4BHNA 2CHLA 1H00A 4HOKA 4BGGA 1W8CA 3EQBA 3THBA 1U54B 2JLDA 2ZJWA 1KE7A 4FV3A 4O0TA 1IR3A 2B7AA 4ZLZA 3TNIA 1UVRA 1F0QA 4FZ7A 4N6YA 3UJGA 4FEUA 5B0XA 1G8AA 2UW5A 4FG9A 5A3XA 4MWHA 4XOZA 5H8GA 4UN0C 3C5IA 4QMVA 3GFEA 4YHFA 2WMXA 2JC6A 4Z3VA 5FQDC 1W0XC 3MPAA 4QYGA 1DI9A 3DAEA 3S3IA 3VS5A 5I9UA 1IASA 4UMQA 3B8QA 2B9HA 2BTSA 2Y9QA 2X7GA 3NNWA 1ZWSA 4LOQA 2WMQA 4X3JA 5AP0A 4D1XA 3DTCA 4F63A 1PMEA 1GZNA 3VBYA 3PXQA 4AGDA 2NPQA 4DA5A 4G5JA 3BZ3A 4FYOA 2BVAA 2RFEA 5JRQA 3H0YA 5ACKA 4HCTA 2W5BA 5LARA 3ALOA 3ZSHA 3FXZA 5F20A 3A2CA 4D4RA 2QO7A 3DXPA 4CRLA 3JR1A 4JX7A 2ESMA 5E92A 5HVKA 3EHAA 4U8ZA 2YITA 5HE3A 1IA8A 4X21A 3UMWA 5IQIA 2XKCA 2XNNA 3N9XA 2JFLA 4IWPA 4EHEA 3DJ7A 3S00A 1PW2A 3IPHA 3NDMA 4HGEA 4K8AA 3ERKA 4NM5A 5CY3A 4E20A 4WOVA 4X0MA 1CKJA 4YJTA 4BDCA 4LRKA 1H24A 2XRWA 3CY3A 4W8DA 4F65A 4IAIA 4RIYB 5JH6A 1QPJA 3ZZWA 2X9FA 5C9CA 4IJ9A 1OB3A 4KSQA 3A7GA 5ETFA 1J1BA 1ZOEA 4XV2A 3W16A 3EN7A 5HO6A 2IZSA 2R3PA 4QTEA 2C6DA 2J0MB 3R8UA 1PKGA 4IX5A 4Z7HA 3DBCA 2V7OA 4S33A 5F4NA 3QWKA 4CTBA 4YPDA 4BCIA 4KD1A 3JUHA 3P5KA 4RIXB 4ARKA 5HGIA 3VS7A 3QXOA 3DK6A 4IIRA 4XV1A 3VIDA 2HW6A 2OJGA 1OKZA 2CN5A 1OL5A 3AC2A 3HRCA 5FXRA 3QBNA 4W4XA 4F1TA 4RT7A 4JX3A 4JAJA 5DPVA 1ERKA 5IG1A 3MPTA 3QCSA 3LCKA 1J7UA 2EU9A 3TT0A 3AD5A 3W8QA 4ANSA 3OBJA 4AN2A 2R0UA 4QRCA 2UZBA 2CSNA 2IVVA 4O7TA 4FTQA 1PHKA 5FDPA 2WTJA 1CTPE 1WCCA 2OG8A 3TNWA 1JKSA 5HE1A 3FPMA 2J0JA 2Y0AA 3UOJA 2XM8A 2Y4PA 3F66A 4EOIA 4EONA 5IDPA 4BFMA 2VNWA 2IZTA 3FHIA 3EQRA 5L2QA 4EK8A 1W7HA 3MBLA 4EK4A 4IFGA 4BKJA 2WGJA 4RG0A 1GZKA 4IVCA 4FZFB 2VGOA 3ZXZA 2CKQA 4DTAA 4MNEB 4O86A 3VRYA 3C5UA 3R0TA 3UQGA 4D28A 3OT3A 3D5VA 5D10A 1ZLTA 4XRLA 4E5BA 4F4PA 5AP6A 4AGUA 3F2NA 4JAIA 1H1QA 1M52A 3QQUA 4NFMA 4FTKA 4OT6A 3UP7A 2IW6A 2H96A 5H8EA 3ZONA 4NIFB 5JGBA 4DAWA 3SV0A 1OZ1A 4U7ZA 4AACA 5FTGA 5JGDA 5KCVA 4AZFA 3SW7A 4KS8A 2EVAA 4AT5A 3UO5A 4KRDA 3V8TA 2X39A 4D9UA 3RTPA 1BI8A 3BV2A 4FV0A 4DHFA 2P55A 4GJ3A 3IQ7A 5AADA 4A4XA 4UZDA 4JDJA 1ZYLA 3HDMA 4QMSA 1LEWA 3NZ0A 1G5SA 4ITHA 4ZOGA 3GB2A 1MUOA 3POOA 3P4KA 5CEPA 5JFSA 2WEVA 4O1PA 4IB1A 3AC3A 4C37A 5CWZA 1OL1A 3F69A 4GCJA 2QG5A 5D41A 1K3AA 4I94A 2A0CX 1QPCA 4L43A 4L7FA 3HUBA 2W1FA 4GIHA 1JKKA 4Z55A 4UEUA 3PWYA 2F2CB 5GIOE 4FOCA 1YXSA 3OVVA 5AUWA 5ETAA 2UZTA 3RINA 2OLCA 5CU3A 4WRSA 3FLNC 2WMWA 4GT4A 3R7OA 1XJDA 1J3HA 4ZSLA 3BHUA 2GDOA 4UMPA 4ZZOA 2QO2A 3KRRA 3CS9A 1P2AA 3NX8A 4X2JA 4M14A 1OL2A 3DK3A 5KUPA 2VTNA 4O0VA 2PE0A 4K6ZA 4XLIA 5DEWA 3EQIA 4WD5A 2PZ5A 2W1HA 3KVWA 5AUYA 3UNKA 4GVJA 4EH2A 4W9WA 2Z7SA 3T3VA 3O8PA 4BY9E 3RK9A 4HCUA 1XH8A 2C47A 4BYIA 3Q5ZA 4KNBA 2B4SB 2XNMA 4W4WA 5AA8A 4UX9A 1OI9A 4J52A 4MWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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