5I4NA

Crystal structure of the e596a v617f mutant jak2 pseudokinase domain bound to mg-atp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
284
structure length
275
Chain Sequence
FHKIRNEDLIFNESLGQGTFTKIFKGVRREVGDYGQLHETEVLLKVLDKAHRNYSESFFAAASMMSKLSHKHLVLNYGVCFCGDENILVQEFVKFGSLDTYLKKNKNCINILWKLEVAKQLAAAMHFLEENTLIHGNVCAKNILLIREEDRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQERIPWVPPECIENPKNLNLATDKWSFGTTLWEICSGGDKPLSALDSQRKLQFYEDRHQLPAPKAAELANLINNCMDYEPDHRPSFRAIIRDLNSLFHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Uncoupling JAK2 V617F activation from cytokine-induced signalling by modulation of JH2 alpha C helix.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 275
sequence length 284
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5i4nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5i4nA01
2XM8A 4MQ1A 4XJ0A 4AGCA 4J98A 4QTEA 2R7IA 4NIFB 5HO8A 2BAJA 2OXDA 4CFXA 4DFNA 4D2WA 1PJKA 4GU6A 2R3GA 2ZJWA 4X2GA 4ZJVA 2UVYA 3NDMA 3OEFX 2QOOA 4QMWA 3SHEA 4OTIA 2YM3A 1K2PA 4DINA 2YIWA 2CNVA 4RJ3A 2ITOA 2PVLA 4XMOA 3GEQA 3B8RA 5DT4A 2QI8A 3FLSA 5HHWA 3CGOA 2UW8A 4U80A 4TNDA 2JAVA 2J0IA 2Z7SA 4RX8A 4XLVA 4CV9A 3NIEA 1YXVA 5DIAA 3NGAA 3PJCA 1MQBA 4FTLA 3R8UA 4FTKA 5F9EA 3LFDA 3FI4A 4FX3A 2BPMA 3TZ9A 5FP5A 5L2TA 3HRFA 1OIUA 4RVKA 1JOWB 2XKEA 2Z7QA 3OT8A 4FK6A 4IZYA 4RLKA 3VS3A 2JEDA 1WCCA 3MIYA 5EDPA 3LXPA 3ZRKA 2PYWA 3H3CA 3AMBA 4IC8A 2SRCA 5KMLA 5IKWA 4ZSGA 4EYMA 4RIWA 3DBDA 3OXTA 2XK6A 4JX7A 4QMVA 3QBNA 3H30A 4ARKA 2QONA 2WQBA 3A99A 3HMOA 4GU9A 4EUTA 4HGLA 4FEWA 4JVGA 3ZO1A 5M09A 4EZ5A 2JKMA 4RGJA 3MBLA 3NYVA 3REPA 5J79A 1XBAA 3C0IA 2OWBA 1UKHA 4FTJA 4WIHA 3I6UA 4G3GA 4QT1A 1UVRA 4YBKA 5CAVA 3R9OA 3OHTA 3TT0A 3PA5A 1FQ1B 5AV4A 3N51A 2YABA 3ALNA 4U79A 3CEKA 1ZY4A 3PTGA 4C3RA 4H58A 3V8WA 3HNGA 3VVHA 4EK3A 1DI8A 4OAVB 4MXXA 1FGIA 1P14A 2IVUA 4E1ZA 2JD5A 3FYJX 5J9YA 4O7SA 5LVOA 4M0YA 5L6PA 3MYGA 2OW3A 3DKFA 1SVHA 4Y8DA 5HCXA 5JK3A 2XVDA 2R3KA 4ACMA 4BHNA 4BCPA 3UQFA 1Q3WA 1GZNA 2V0DA 4BI1A 4D9UA 4DEBA 5JGAA 1PYXA 2ZYBA 2WTJA 3C4XA 3TZMA 5I9ZA 4QQ5A 1ZAOA 4EOMA 4U7ZA 4C38A 2JLDA 1ZYSA 3KN5A 3HZTA 2QOBA 2C1AA 3DLZA 3EYGA 3R2YA 5I9UA 2W5AA 4BCMA 5JGDA 3COKA 3CTQA 4DC2A 4DT9A 4S31A 3RM6A 3DXNA 2RKUA 1IRKA 2UZTA 2I0YA 3OWPA 2C6TA 3QZIA 2HYYA 4O96A 3RALA 2WIHA 3VS5A 4D1XA 3G15A 3FZTA 4K11A 3POOA 4FKRA 3V8TA 5DE2A 4DE4A 4DGGA 3DDQA 1Y6BA 4B8MA 1YQJA 3FQHA 5IA4A 2W1IA 2OIDA 5FEEA 4R7HA 1PXJA 1JKKA 2XJ2A 4UYAA 2C0IA 2OJFE 4UY9A 3ROYA 2PY3A 4NKSA 4V04A 5DN3A 4FEUA 3OTUA 3JS2A 3C4CA 3L8PA 4U44A 3NRMA 3O2MA 5HCYA 1GOLA 4WBBB 5AEPA 2YACA 5D11A 4OTGA 4D4SA 3MTLA 2RFSA 1Q4LA 2UW3A 4FYNA 3A4PA 2PUPA 2C6DA 3O96A 3LVPA 3LKMA 4W9WA 1ZOEA 4L8MA 3LFCA 4GJ3A 5CXZA 4QYEA 5B7VA 1FINA 4II5A 3GVUA 4X2FA 3I7CA 4IB0A 4O7NA 4L44A 3PG1A 1CDKA 2RG5A 5KHWA 4IAIA 3AD6A 4YURA 3VBTA 2J5FA 5CALA 5AV2A 3TNIA 2B0QA 4ZTHA 3CR0A 1GIIA 3DAKA 3QD0A 4QP3A 4X3JA 4JOAA 3BQCA 4ALUA 4V0GB 5BYZA 4EK5A 4IIRA 4JI9A 2F57A 1YOMA 1YDTE 2WQOA 4QMSA 3QU0A 5AM7A 5K0KA 3VS2A 2IJMA 2VO6A 4C02A 1U59A 4IAKA 4CG9A 2QOIA 3ORIA 4N0SA 4ZTSA 1FMOE 2XRUA 4A07A 4DH1A 3Q52A 4R7IA 3CP9A 1H1SA 4ASDA 4E6QA 1QPCA 3MFUA 5E8VA 3FLZA 1MUOA 5TO8A 1BX6A 5CAPA 4G5PA 3ORLA 4KKEA 4AZSA 4O7VA 3PVBA 1XH7A 4MHAA 5D12A 1J7IA 1Q24A 1U4DA 3LXNA 4OTDA 5KX8A 4L00A 2X7FA 3L1SA 3R7YA 3KFAA 1Y6AA 5EQPA 2G9XA 3EQCA 3KULB 2F2UA 3QC4A 4OBPA 3OBJA 4O7RA 4RJ6A 3Q9XA 4HPUE 3OWLA 3P7AA 1W8CA 2ERKA 5CSVA 1GZOA 3UYTA 2VTQA 5CAOA 4IWQA 3Q4ZA 4IW0A 1H1QA 3H0ZA 4FKLA 4DEIA 5M57A 3R83A 4ZY6A 3DBCA 1NVRA 1P4OA 5KBRA 4ZY5A 4CMOA 2AYPA 4RC2A 5GZ9A 4DFYA 4X3FC 4AZEA 2HXLA 2W05A 3G0EA 3QRIA 4C2WA 3QQUA 2F2CB 3RVGA 2CKQA 2B55A 3N4VA 5ANEA 4EZ3A 4GIIA 3ET7A 5FEQA 2IVSA 3Q4UA 1J1CA 3RCDA 3LCTA 2DYLA 2WXVA 2Q0BA 4C4EA 3BE2A 4E3CA 3ODZX 4JR7A 3UPXA 4R3RA 3RBWA 3D2IA 4YZNA 5A46A 3RWQA 4R1YA 2P55A 4CEGA 5IH6A 4H3BA 2QO2A 4ZAUA 3QCQA 4E6AA 5FTGA 3FL5A 3PSCA 4MAOA 3I5NA 4ZZOA 3OXZA 4A4XA 3FUPA 4F7SA 3DLSA 2VTOA 3TUBA 4U3ZA 3KMWA 3TUCA 3E7OA 4PNIA 4GK3A 5FG8A 4U6RA 1OECA 4AN9A 4E20A 4ZTQA 5CF8A 3L8SA 3SG8A 3ZMMA 5EQEA 3NS9A 3QA8A 2XIZA 3EL8A 3R1SA 4NIFA 5EW9A 5BVEA 2BZKB 3TZ7A 3LJ0A 4BDFA 4F9CA 4PDOA 5A14A 5CEPA 3QTUA 2CKPA 3Q9WA 3UDBA 5HG7A 3A62A 3CJGA 4XYFA 2FSOX 2R9SA 3HX4A 2C5XA 2C5OA 3TI1A 3RHKA 2AC5A 2XIKA 1YRPA 5TF9A 5ANIA 2RFNA 5IQBA 4LOOA 3OC1A 3PA4A 1WBTA 4CV8A 1PXLA 4IBMA 2XZSA 2OFUA 2YIXA 4S2ZA 4RZWA 1Q97A 3LCDA 3FDNA 4BCHA 3UOJA 2VO0A 3FZOA 4FSZA 3LCSA 3VUGA 4DCEA 3MH2A 3NW6A 4NK9A 2QOCA 1LUFA 4FTQA 4M84A 3QTSA 3HEGA 2E9VA 5IA5A 3O8TA 4TYJA 4BTKA 5HO7A 4FGRA 4D4RA 3DNEA 4QMYA 2G15A 3TNHA 2QLQA 3VIDA 1GNGA 1QL6A 3E88A 4ZLOA 3OROA 3R8LA 5JQ8A 1TVOA 4E26A 5LXMA 4BIBA 3MH1A 4C3PA 3LMHA 2W1CA 3VRZA 2QC6A 3NLBA 4A9SA 2VAGA 4CCBA 4DFXE 5GZ8A 3MESA 5KMKA 1OL6A 2C47A 2BFXA 3QTZA 3U87A 3WI6A 3O7LD 3PXFA 1UV5A 2IZSA 4YC8A 4R77A 5A9UA 2YM5A 3TTJA 3QUPA 4QYFA 4FZDB 3WF8A 4BBMA 3JR1A 2YWVA 4W4YA 2QLUA 1GAGA 5CQUA 5IH4A 2B9IA 3D7ZA 3DQWA 2YDIA 3HRCA 4M15A 4YJTA 5AX3A 5AR2A 3QD2B 1JAMA 2J0MB 4TYGA 1KE7A 2VWZA 3HA6A 3KC3A 5EYDA 5A54A 5EOBA 1VR2A 4FG7A 4Y83A 3C7QA 3H9OA 5LQFA 3GOKA 3DNDA 5ANKA 2PULA 3NUSA 2P4IA 2XIYA 3UODA 3BHUA 2R64A 4I5PA 4CZUA 3BRBA 3FLWA 3KQ7A 3Q96A 4N6ZA 1KSWA 3WF5A 5LVNA 1ZY5A 5M4FA 5LVLA 4EH5A 2J0KA 1CKIA 3ZO4A 2ITXA 4GFGA 4U40A 1R39A 1BL6A 2YCSA 2VO7A 4MNEB 1OIRA 4DEEA 2OIBA 3G33A 3V6RA 4UMUA 2UZWE 4AOTA 3D14A 4FGBA 4MD8E 2PVJA 4Q9SA 3C4WA 4MF1A 4GYIA 3U51A 2GNFA 2R3QA 2VTNA 3EN4A 3EQDA 4APPA 4QYHA 4LRJA 5C8MA 4Z16A 2FSTX 4DGOA 2O0UA 2FO0A 4F6SA 2XK3A 4ZJIA 4ZTMA 5IQIA 4I4EA 3NYOA 4O6EA 1LEZA 2A27A 4BFMA 5AV3A 1Y91A 4E7WA 4U41A 5T68A 4EOKA 2QNJA 3BYUA 3EN5A 3Q53A 4J8NA 4LMNA 2WMBA 4PL3A 4EOOA 2OZAA 5A4CA 3UC4A 3BHVA 1I09A 3LXLA 4N57A 3ZC6A 1PMVA 3FXWA 4F7NA 4FKIA 1R3CA 2W7XA 3F69A 4XG9A 4C2VA 3R30A 1VEBA 3R7EA 4NJ3A 1W7HA 2B1PA 5AP7A 3R28A 5B0XA 5CWZA 2ITWA 4IHPA 2CMWA 3UE4A 4BDGA 2F7ZE 3EN9A 5ANOA 4BGQA 3DOGA 5C1QB 4D2PA 4IADA 5ACKA 1Z9XA 4CLIA 4W8EA 3QHRA 2R3JA 4ENXA 4IWDA 4G1WA 4BGHA 3A7HA 2Y7JA 4ITJA 1TKIA 4G34A 2VWYA 5FRIA 4RVMA 4Y5HA 3I0OA 3TG1A 4EOIA 4EOQA 2VWUA 4NFNA 3LFQA 2OXYA 2YZAA 3BHTA 4DTAA 1M17A 1PKGA 3JY9A 4OBQA 4LOQA 4HCUA 4JG6A 2BHEA 3NR9A 2BZHB 5JGBA 5HGIA 4UYNA 3M1SA 4BCOA 3C4EA 4WSQA 5DRDA 5EKOA 1YVJA 3E93A 3UZRA 5BVOA 4G17A 3DPKA 4EK8A 4IDVA 4UXLA 5C01A 4KS8A 2E9NA 3DS6A 3VQUA 2REIA 4UALA 3K5UA 3W2CA 4U9AA 4J96A 4JRNA 1H28A 1JVPP 1WMKA 4C34A 2J9MA 4X0MA 5DT0A 4O86A 3TCPA 5I9YA 4WNKA 4FSTA 4M3QA 3CLYA 3SRVA 3GP0A 4DG3E 3G51A 5I9XA 5HNGA 1NA7A 3F3UA 5EM5A 2NO3A 3T8OA 3D5UA 4Y5QA 5LCKA 3ZRLA 4DFUA 5E1EA 2DUVA 5DA3A 2O65A 3KMMA 3PXKA 3MV5A 4DITA 5IA0A 5CSWA 1FVTA 4KB8A 5G1XA 4QMLA 3ZUUA 4XG3A 2UUEA 4RC4A 4M13A 5AUZA 3GT8A 4UWBA 3UO6A 3A61A 4BKJA 2WMAA 4IAZA 4O21A 2OGVA 1YOJA 4QP1A 2Q0NA 4RIWB 3IW5A 4HYHA 4WG4A 4U43A 4FKUA 3OCGA 3AC4A 4L3JA 3UOKA 5BYLA 1U5QA 3KK8A 3E87A 3EFLA 1PXMA 3NUYA 1V0PA 2FSMX 2YJSA 2YWPA 3FAAA 3FMLA 4R5YA 1MRYA 5JMSA 3ETAA 3D0EA 1YWVA 4JIAA 4WOVA 4YUQA 2UW9A 3H4JA 3HGKA 2XH5A 3HV7A 2YIYA 5GIPE 2W96B 2F9GA 3TIZA 1QPDA 1BKXA 4JIKA 4DEHA 3TV7A 5BVNA 4MXAA 2Y4IB 4M12A 2R3NA 3ORZA 4HYUA 5CLPA 4L68A 1JKSA 2WOTA 4O0VA 1FGKA 4P4CA 4ZXTA 4AA4A 3HV6A 4CZYB 2C3IB 5K4IA 4F0FA 1JWHA 3GGFA 4FT5A 5ICPA 3Q4TA 4AZTA 4BIDA 4RFYA 3W16A 3BYMA 5D10A 5HE1A 2RFEA 4W4XA 4UN0C 1A48A 4RSSA 3FQSA 3CTJA 3ZDIA 4Q9ZA 1J1BA 3IKAA 4G3FA 3RCJA 3ZSIA 4AXAA 1NT2A 5BNJA 2X8DA 1X8BA 1PMUA 1VYZA 4O22A 4PNKA 4C4HA 3FY2A 4ZMFA 5C26A 2PMNX 3QX4A 2VWIA 3K54A 2W4OA 3AC5A 4I22A 3DK3A 4DA5A 2UZLA 3IS5A 3B8QA 4F70A 2A0CX 4D1SA 3C50A 4G31A 4B7TA 2ZMCA 4ANQA 3QGYA 5AR4A 2FUMA 5HZNA 4BDBA 4K77A 3A7GA 3Q4CA 4U81A 2G1TA 2OJGA 2C5NA 1A9UA 4F64A 4O0SA 2O3PA 5HICA 1MRUA 5EKNA 5TT7A 2J2IB 2PUIA 5L2IA 1OL2A 5ETIA 4BICA 2HW6A 4O2ZA 4XRLA 4YO4A 3PG3A 2R0IA 4MX9A 2R3FA 1OKVA 3C5IA 3CC6A 2X4FA 2VV9A 2IW6A 1M7NA 1ZARA 4G9CA 3RI1A 3QGWA 3QZGA 5CS6A 4ZY4A 3UG1A 2BALA 1PXKA 3IW8A 1ND4A 2F7EE 4M66A 4NTSA 3DBQA 1XH5A 4EZ7A 2C5YA 5C03A 3PSDA 4HVIA 1YXTA 4C0TA 2JDRA 3OWKA 3MPAA 1OIQA 5HOAA 3HAMA 4WBOA 3CJFA 4FBXA 3V8SA 4MD7E 1T45A 2P2HA 4IVAA 3RHXA 5EW8A 4ERWA 4KBKA 4X2JA 4IFCA 4KUJA 2BVAA 1KOAA 5A4TA 2I1MA 1H8FA 5ANDA 2P33A 2X6DA 1CTPE 4KRCA 3PJ8A 4ZTNA 3TEIA 2WHBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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