5IUGA

Crystal structure of anaplastic lymphoma kinase (alk) in complex with 5a
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
312
structure length
285
Chain Sequence
NPNYSFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGGEVYEGQVSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMAGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Pyrazolylamine Derivatives Reveal the Conformational Switching between Type I and Type II Binding Modes of Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK).
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
total genus 101
structure length 285
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-03-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5iugA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5iugA01
2W06A 3ET7A 5I4NA 3NPCA 4ACDA 2YZAA 3BRBA 5HIEA 4I4FA 2WOTA 4B8LA 4BIEA 3FSKA 2C6OA 4QYFA 4JQ7A 4QP9A 5HTIA 5BPYA 5FXQA 2FH9A 4FIHA 4IB0A 3QGWA 4M0ZA 2B54A 3DNDA 1IASA 4I5CA 4UBAA 3D4QA 3E5AA 4JQ8A 4BDDA 4FTUA 3UG2A 2BAJA 4O0XA 4E20A 2ETKA 3PVGA 3FE3A 3PYYA 5CSWA 5JFSA 2R9SA 4UEUA 4PDSA 4ACGA 3FXZA 3GU8A 3QTSA 5HNBA 3CTHA 2R0UA 3EB0A 3NNVA 5TT7A 2FUMA 5DG5A 5M07A 3CGFA 2IZTA 3A7JA 4FTLA 1MQBA 1OIYA 4BKZA 3R9HA 3TJDA 2X1NA 1P4FA 1U4DA 3IOPA 2RF9A 4J7BA 4M67A 1H28A 5BUJA 3KREA 2WELA 4H3QA 5E8YA 4KRDA 5JGBA 3WIGA 4ZS4A 3AD6A 2PZRA 5KHXA 4M8TA 4YP8A 3PXKA 4ACHA 5HCYA 4TYGA 3UC4A 3CTQA 3EQRA 4NIFA 5FP6A 3ZDUA 2NNWB 4FKUA 3LXNA 4DH7A 2XIXA 3PE1A 4O6LA 4I20A 1OKZA 2BROA 2JLDA 3FL5A 4Y5QA 5CAVA 2OIDA 3KF4A 2R3LA 2YEXA 3ANQA 4RWIA 5HU9A 4ZAUA 4IAYA 2QR8A 5AUXA 5HVKA 3DB8A 2QI8A 4KWPA 4LYNA 4X6RA 5IU2A 5CAQA 2GU8A 2PVJA 4ZP5A 2IJMA 1ZARA 4ZLYA 3NUXA 5LWMA 3KVWA 3ZRKA 2J5FA 4UZDA 5GJDA 3COIA 3ACJA 5FM2A 2CCIA 4X0MA 3Q32A 4BCQA 1FGKA 3Q3BA 4GU6A 3A60A 3HRBA 3MB7A 3FAAA 1OKWA 4O7TA 2GNGA 4JBVA 3AT2A 3EKKA 4GG7A 5IH4A 1URWA 3M42A 3GVUA 4WG5A 1YDTE 5CLPA 2QG7A 1OPKA 3EFKA 5GIOE 2NP8A 5IA2A 3ORIA 1Q5KA 3OW3A 4FTTA 3TN8A 3VVHA 5E8TA 4NCTC 2FSLX 1LP4A 1JSTA 1OUYA 4QP7A 5ANGA 4DF3A 1V0BA 4G31A 3ROYA 2WTKC 4FI1A 4IC7A 4EH4A 3QGYA 3O8PA 1PXLA 3ULZA 4HVHA 3BU3A 3HRFA 3OWKA 4ANMA 2F7EE 1UA2A 2HELA 1BMKA 1S9JA 4KBCA 4EK3A 4DE4A 1JOWB 2XK6A 4GYGA 1APME 1OITA 5JFXA 4WBOA 1XH8A 2UW9A 3OTUA 4QMLA 2BFYA 3F6XA 3R8ZA 3BKBA 3O0GA 3HDMA 3E93A 3IKAA 4NYEA 2JDRA 2ZMDA 3I5ZA 4EYMA 4FG9A 5HBJA 3QTWA 4UV0A 2YM4A 4PX6A 5GINE 5EYCA 3HA6A 5A6NA 4DFLA 4FV9A 2PWLA 4TYHA 2UZBA 4GMYA 3DTCA 4FNWA 2PUPA 4ACMA 1YHVA 3HMOA 2Y0AA 2J4ZA 3HX4A 3UGCA 4DBNA 4MXYA 1J7UA 4X2JA 4C4EA 5DGZA 5H8BA 5C8KA 3UBDA 4U42A 1Z57A 3ERKA 1IR3A 4F99A 1IA9A 3A62A 2BVAA 4KINA 3UIBA 4PQNA 4KUJA 4LRJA 5AV1A 4D5KA 3UVPA 3SKCA 3ZLSA 3FWQA 3I5NA 1H0WA 3I7BA 3F5PA 4WRGA 2A19B 3LCOA 4L8MA 3GC8A 4QMUA 4XG8A 5AM6A 5CI6A 5JKGA 2XK7A 3KCFA 3ULIA 3V5WA 3EH9A 3NCGA 2WFYA 4CCUA 3VRZA 2HWOA 2OI4X 1H4LA 4W4XA 5H8EA 4EZ5A 2UW0A 3R0TA 1U54A 5C9CA 4C38A 3D2KA 4CNHA 4JX7A 3MBLA 4PF4A 2WMBA 1X8BA 1W82A 2XNBA 3ZBFA 5GZ8A 4PUZA 3BV3A 3EYHA 3A4OX 3QQGA 1XR1A 3ZSHA 4FV0A 4JVGA 4Q9ZA 1CTPE 3NNXA 4KRCA 3PIXA 4NK9A 3W10A 3C4FA 4D28A 4AT4A 4CT1A 3GC0A 5LMKC 3ZUVA 2R3QA 4MQ1A 4FT7A 4TW9A 3V5QA 4E4MA 2F57A 3FI2A 2FGIA 1K2PA 1XKKA 2BDJA 3GENA 2F2UA 2UZUE 3FZTA 3I6UA 4MK0A 4F08A 2CNUA 4GKIA 4EONA 2YM5A 3QCYA 1XO2B 4F09A 2BDWA 3VS6A 2JGZA 4AA4A 2FSOX 2X8DA 2ZOQA 3F3WA 3IW8A 3JXWA 4TRLA 4KSPA 3T3UA 3F7ZA 2ITNA 4QP1A 4IADA 4C02A 3PJ3A 4JAIA 5DR9A 2F7ZE 3NZ0A 2R7IA 5EYKA 4CMOA 3DDQA 1YXTA 3BLHA 5A4LA 4Z7HA 3ZTXA 2OZAB 4I6HA 4PRJA 1ZOHA 5HLPA 3CJFA 4O84A 2VX1A 2XNNA 5HX8A 4F9AA 2YAKA 3I7CA 3U8WA 2W1EA 2GSFA 1CDKA 1B38A 1YOJA 3MH3A 4D2SA 2BILB 4FV3A 1FOTA 2RGPA 1NVQA 3LFAA 5AP2A 4E3CA 4YO4A 3PDTA 3ORPA 1JKTA 3REPA 3ATSA 4PP7A 2XNMA 4RSSA 4CFVA 3MWUA 3SOAA 2PHKA 3PY3A 4RFYA 2UW3A 4LGDA 3P0MA 3R02A 4RIYB 4B99A 2JDSA 4WD5A 3UIMA 4G1WA 3V01A 3BBWA 2WQBA 4O0VA 4USEA 2C1BA 3FZRA 2UZLA 4FV5A 4TL0A 4EH8A 1WMKA 2O5KA 4GFMA 2GQGA 4L52A 4LG4A 2B9IA 3R7IA 3VN9A 3UNKA 1H1QA 2JD5A 4DFXE 3DLZA 4GIHA 5TF9A 4GV1A 4EH9A 3ORXA 3G90X 5AR5A 3RNYA 2X4FA 4YU2A 4DFBA 3U9CA 4EHEA 2G2IA 3N51A 4IB5A 3ETAA 3QRTA 4IVAA 3FMJA 1HCLA 3QD2B 4AW0A 4BWXA 3QXOA 3EQFA 3PA3A 4QMYA 3D5XA 3VW8A 3QCQA 4EOPA 2YFXA 1DS5A 2AUHA 2KULA 1QPJA 3EQPA 1RQQA 3F82A 3PJCA 5EM7A 4R7HA 1FVTA 1T46A 4NZWB 4FTIA 4Y85A 3FI4A 4F0GA 4Q2AA 4HYIA 4WOVA 1VZOA 3VQHA 4IVBA 3QRJA 3PY1A 2CSNA 3QQLA 5DH3A 2G15A 3D7ZA 1PHKA 3E8CA 3CBLA 3BHYA 2OFVA 2PY3A 3IO7A 4M3QA 3MFTA 3UYSA 3WZKA 4EHZA 2B1PA 4DEHA 1URCA 2OLCA 2OJJA 4R7IA 2EXEA 3QLFA 3QA0A 4BZNA 4EI4A 2BRMA 5FM3A 1QPDA 4NUSA 2RL5A 2B53A 5B2LA 2UVXA 5J79A 2BAQA 2CJMA 4EOJA 1HCKA 5HD4A 1HOWA 5KNJA 3QFVA 4DBXA 4FR4A 3BHUA 4EQUA 2WQOA 3ZLWA 4O22A 1UKHA 3BPRA 3R9RA 5E92A 5EQEA 3W2QA 2QVSE 5AP5A 3C4EA 4OT6A 4W9XA 3KXZA 2XJ2A 3AT4A 4WNPA 5J1VA 1ZOGA 4JDKA 3KCKA 3RKBA 5F20A 2VTJA 3OWLA 3MY5A 3RPYA 4U43A 1J1CA 3MA6A 3NWWA 4IH8A 4R5SA 4UMUA 3S1HA 4FUYA 4LL0A 4WSQA 4M66A 3ZRLA 3QZHA 3H9FA 3VUHA 4ZZNA 4NU1A 4RVLA 5BVFA 2C47A 3U4UA 1Q41A 2GS7A 2YABA 3FY2A 4BDEA 1JSVA 4JBOA 3O7LB 3U4WA 4BZDA 3OXZA 1KE6A 2PVYA 4LOQA 5C8NA 3ZEWA 4K0YA 4C37A 1VR2A 5M06A 3FYKX 3CCNA 3LXPA 1WBVA 4CFNA 5E8UA 4RA4A 5E8WA 5M4IA 2FB8A 3IDPA 5IKWA 4BN1A 5BVDA 4KD1A 4USDA 1SMHA 4BI1A 3I79A 3I1AA 4MTAA 3R71A 3W16A 3NYNA 2BIYA 4FKWA 3UOHA 4BCKA 3ZFYA 1W84A 4ZTSA 4GUBA 4O0TA 3FPMA 2C3IB 2C4GA 4GT5A 2HENA 4EK5A 1Q4LA 3RPRA 4OBPA 4JX3A 4K33A 5CU3A 3EL8A 1IRKA 2BMCA 3B2TA 2GQRA 2JDVA 5KE0A 3WI6A 2W7XA 4TXCA 5E8ZA 3RMFA 4XUFA 4GS6A 5I9VA 4A4LA 4FKVA 3V51A 5HU3A 4ERKA 4BDAA 1GJOA 5JT2A 1JKKA 3PE2A 2PMLX 1O9UA 1WAKA 4LOOA 1OL7A 3TUDA 4ANSA 4CZTA 5LVNA 3HV3A 5EHLA 1XBBA 1B39A 5KHWA 4HZRA 5AP1A 1P5EA 1K3AA 4NKAA 4BGGA 2QQ7A 2W05A 3CS9A 4FBXA 3VO3A 2C6DA 4EHGA 3AMBA 1FINA 2BZJA 4J95A 1JAMA 4CGAA 4CTBA 4A9RA 5KMOA 3PG1A 4G3FA 4DTKA 4FE2A 2XNGA 3G5DA 2AYPA 4Y95A 3D94A 2GTNA 1GZ8A 5EQYA 4DGLC 3A8XA 4XV2A 2B0QA 3SX9A 4KS8A 1A06A 2VX3A 4NFNA 4YGAA 4D1ZA 3P79A 3KU2A 4RIWA 4MD9E 4W9WA 5F94A 4QTDA 2HWPA 3T9TA 5L4QA 4UZHA 5IQDA 4KBAA 2ZV8A 5HVYA 4EOKA 5J95A 3QTZA 4N4SA 5IMXA 3RZFA 2R0IA 4PY1A 4XG7A 2OH0E 2VO0A 2PZIA 1EH4A 1KV2A 3E63A 3MTLA 4BDCA 3W2SA 3RCJA 4GT3A 4XCUA 2WOUA 4XOYA 1SNXA 3KN5A 2J0MB 2Z02A 3SC1A 4CZUA 5JRQA 3H30A 1DAWA 3UP7A 5HEZA 2R3JA 3R9OA 3TIZA 3R7EA 4FNYA 4U9AA 5LOHA 3C0IA 3P4KA 2YIRA 1V1KA 4FUXA 5AR7A 3COMA 3R2BA 3B8RA 3H9RA 3RPOA 3R00A 4LOPA 1L3RE 4OAVB 1ZYLA 4IJ9A 4BDBA 4DTAA 4RJ8A 3FZ1A 3ZO3A 4RQVA 3TNIA 4D1SA 4FKOA 5HE0A 4YHJA 4MNFA 2XK3A 5K9IA 3Q6UA 4IX6A 4JS8A 5EM5A 4I5MA 3BEAA 4CEGA 2E9VA 5CEKA 4J99A 3TZ9A 2X81A 3MPMA 5AP6A 4I0TA 2IZUA 4P2KA 2IW8A 3KMUA 3Q9XA 3PJ1A 4AF3A 4AN2A 5FBOA 4AT5A 3LFQA 5IQAA 2AC3A 5M56A 2XKFA 5DRDA 5JFVA 5AUVA 1ZMUA 3DQWA 1J3HA 3C5UA 4D2TA 4O81A 3O71A 4F1OA 1Y91A 3CP9A 4BBMA 4F70A 2PVNA 3ID6C 1WVWA 1ZY5A 2QURA 3HP5A 1YXSA 1Q61A 2WMWA 2H8HA 4KSQA 2QR7A 1DAYA 3OT3A 4BGHA 4L43A 2VTTA 5AAGA 5CF6A 5LVPA 1O6YA 4FIFA 3F88A 4F0FA 2BIKB 3UZTA 3VHKA 2X4ZA 4IAFA 3R9NA 2X8IA 2NRYA 4FZDB 2C5VA 3FXXA 3U54A 2W1DA 1GIIA 4XBRA 1OKYA 1YWNA 5HO7A 5L2IA 3GQLA 2YM8A 4FL2A 4MD7E 3GCQA 2RFNA 1IAHA 3DGKA 4IWQA 3C4WA 5AR4A 3NYOA 5EW8A 3L8SA 1IAJA 2I0HA 4BTKA 5I9ZA 4U41A 3PWDA 4J98A 4ZEGA 2C6IA 3TACA 5M4UA 3MW1A 4X2FA 4D4RA 4EK6A 2GHLA 3R28A 5D10A 3RALA 4QMZA 5I9XA 4C4FA 4ZTHA 4X6QC 3OS3A 2LAVA 4HZSA 5DNRA 3GGFA 4F1MA 5IEYA 2BKKA 2Z2WA 3PSCA 3Q9WA 3QZGA 1WBSA 5D9HA 5DN3A 1YWRA 4ZTQA 2VWBA 3HDNA 3BCEA 3VUTA 3OF0A 4C7TA 3FHRA 1PXKA 2QHNA 2UZEA 2VO3A 5HICA 4OTFA 2VWXA 4FV7A 1H25A 5AIKA 4ASXA 5A4EA 2EVAA 2C0TA 2J0LA 1UNGA 4C3PA 5C26A 1TQIA 3LFDA 3PPZA 5C4LA 3LCDA 4I41A 3WF5A 5AAEA 3Q96A 5G6VA 4RT7A 3QD3A 4IFGA 3PIYA 4AGDA 2C30A 3DBFA 4GCJA 3C4ZA 4NT4A 4DGNA 4UMPA 1H1SA 3G0FA 4K11A 4ZTRA 4U40A 4LM5A 3AOXA 1T45A 3DKFA 2C5XA 2HZ4A 3HV6A 3RTPA 1WFCA 1JPAA 5HBHA 3O51A 3P23A 5CZIA 4C4HA 2VTOA 5IPJA 4HYHA 5CEMA 3Q2JA 5FBNC 3E62A 3W1FA 5AV4A 4X7QA 2YCQA 4MCVA 4AX8A 1B6CB 4J8MA 2IVTA 1J91A 3FC1X 4IDTA 3H3CA 1WVYA 4IB1A 4O6EA 4PNIA 4U8ZA 5TO8A 3BGQA 3FMKA 2V5QA 3NUAA 4UX9A 3MGYA 5L6PA 4G5JA 4GK4A 3TZ8A 3ATTA 4HVSA 4L42A 3QRKA 3OMVA 4F7SA 5IZFA 4CFXA 4YURA 5J5SA 4MNEA 2Q83A 3FLZA 2C69A 3KXMA 4MEDA 1PXNA 4D4YA 3QTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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