5J8IA

Crystal structure of tl11-113 bound to tak1-tab1
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
306
structure length
288
Chain Sequence
SLHMIDYKEIEVEEVVGRFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGCLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-guided development of covalent TAK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7/TGF-beta-ac
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 288
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2016-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5j8iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5j8iA01
4PRJA 4RIWA 3RK9A 4EORA 4BF2A 5DWRA 5CSPA 2YDIA 4FODA 3R6XA 4DFBA 4AOTA 4FG9A 4D9UA 2BILB 2OJJA 5EYDA 2DYLA 1A48A 2X8IA 3CKXA 3WF6A 2VUWA 2W4OA 2ITQA 4FTKA 3NDMA 3Q60A 4TRLA 5ICPA 5JK3A 4PPCA 5L4QA 3ORTA 2X6DA 4GYGA 4CZYB 3UNZA 3W10A 5HVYA 1UV5A 1M2QA 4RX8A 4C34A 4R8QA 3C4FA 1SM2A 2X8DA 5AP2A 5ACBC 1HCKA 2XVDA 2ITXA 3QCYA 4RSSA 4IAYA 4YHJA 4NTSA 5F94A 5FG8A 4XMOA 4AZEA 3HX4A 3WE8A 4E20A 2FB8A 1H01A 3S95A 3W18A 3PUPA 4IMYA 4K1BA 4KSQA 4TZRA 4OTQA 1ZZLA 3KN6A 2X9FA 3BYUA 4EWQA 3PVGA 2IO6A 4F1OA 4QP8A 4W8DA 4GKHA 4QMTA 3GT8A 4ZTNA 4LMUA 1KV1A 3EN7A 4DEGA 2IVSA 3DZQA 3VUDA 5M4UA 2O2UA 2VD5A 1Z5MA 2YABA 4HJOA 4OUCA 3E63A 5E92A 4L52A 2F7ZE 4FTNA 4LL0A 4RWJA 5GZ9A 4ZOGA 2CMWA 3QD4A 5E8VA 3E92A 4FKQA 1Q24A 2I6LA 4FT3A 4BDJA 3QKMA 1UU8A 5HEZA 5HGIA 5ETCA 3TL8A 4ZEGA 3HAVA 3RM6A 3LVPA 2IVTA 4BBFA 5M08A 5L8KA 4UWBA 2X81A 4GK2A 5AAFA 4DAWA 3EQCA 3D7TB 5JT2A 5E7RA 3ZLYA 3IONA 1PMNA 2C5OA 2QR7A 4LOOA 3R28A 3NEWA 3DDQA 4R7BA 1PW2A 2QR8A 1ZYJA 4DGOA 5BVDA 2XIYA 4NJ3A 4X3JA 3AXWA 4WSYA 4ZIMA 4IAAA 4IZYA 3W8LA 4CQGA 4EH2A 3W55A 1H1SA 4O7SA 4KIOA 4QP4A 2XNEA 4FF8A 1YOMA 4G3DA 1XHAA 4PV0A 4YC8A 4I5HA 5F1ZA 3H30A 3QD0A 3VAPA 4AZVA 5KZIA 4BN1A 3GU7A 3QA8A 3RPVA 3BX5A 4USFA 3RGFA 3MWUA 4JG7A 3CKWA 3AOXA 5EI2A 3LFDA 2YHVA 3BE2A 3HUBA 5AP6A 3EQRA 4FEXA 3BWFA 2JBOA 2ZDUA 3OROA 2PE2A 3LFQA 4Q9ZA 4ZLZA 3VQHA 5FDXA 3OVVA 3EYHA 3AC1A 4JBOA 2JAVA 4YBKA 5ANGA 4FEQA 4JOAA 4D4RA 1QPCA 3VHKA 2WOTA 4Z16A 3OHTA 3EFJA 1JBPE 5ITAA 4R7HA 1MRVA 4YZMA 4C36A 4UEUA 3OTVA 4TTHB 3MVHA 4BTMA 4WIHA 5IDPA 4FKRA 3C50A 4OTFA 4ZJJA 3WIGA 2H34A 3D7ZA 2HXLA 3RWPA 3KXMA 4G6NA 2Z60A 5BVOA 4IJ9A 2XKEA 5J7HA 4FTMA 5TO8A 4I6QA 2ERKA 3EN9A 2B54A 3FDNA 3LCSA 5GJDA 4O81A 1CMKE 4ASDA 2CPKE 4PMMA 2XF0A 3G0EA 3UDBA 1UKIA 3ZFYA 4FKSA 2QO2A 3MFRA 3PJ3A 3R1QA 5HX8A 4YZ9A 5IQGA 2IVUA 4FK3A 2UW7A 4L53A 4I0TA 2UUEA 3CE3A 3NYXA 5D7AA 1ZZ2A 3OBGA 1ZYLA 4KAOA 4PP7A 1BL6A 4C3PA 5BVNA 5KKRB 1PXNA 1Q97A 2HELA 3QQLA 4XP0A 1PMEA 4FZAB 4FSTA 3R9NA 5CZHA 3VW6A 4BTFA 1Q8TA 1GZNA 3ORKA 4K2RA 1TQIA 3KXHA 5F20A 1BYGA 2W9FB 3UNJA 5HORA 5DR6A 3O0GA 4S2ZA 2GNLA 4CFMA 1XJDA 2PL0A 3I0QA 4FTAA 2FGIA 4ZTLA 4BHNA 4GUEA 4GW8A 5TE0A 3BU3A 4CCUA 3LE6A 3FZ1A 3VS0A 3TXOA 1VR2A 2OIQA 3DT1A 4D55A 3UP2A 3VWAA 2OI4X 4JDIA 3ZH8A 4CFVA 4Q9SA 3QQJA 5E8YA 3WF8A 4YUQA 4CEGA 5AP0A 5L2IA 3GCUA 2P33A 3MH0A 3HMIA 4ZJVA 3VW8A 1DI8A 4MXCA 3FZSA 2VTHA 1Y6AA 2WTJA 2GSFA 5KHXA 3DK7A 4KD1A 4TXCA 3V5QA 3DU8A 4Q5HA 2BPMA 4EJNA 5LCJA 1W0XC 3FI3A 4QMWA 2H9VA 3POOA 2XEYA 4GMYA 3PIXA 5LVPA 5M55A 3L9LA 4MXZA 5AA9A 3AD5A 5IUHA 1OI9A 2Y4PA 3ZM9A 2YM5A 2FVDA 3QYZA 5BYLA 5CLPA 3AC4A 4U9AA 3ZO1A 3NW6A 4XG6A 2BRMA 4K18A 4CSVA 5IQCA 4LV8A 5LXMA 2YLFA 2YJRA 3VVHA 2YERA 3G0FA 5JQ5A 4O38A 3OOGA 2RFEA 2JKKA 1OBDA 3CTQA 4OTGA 4R1YA 4QYYA 1WVWA 4IX5A 3VS4A 3LJ0A 2BMCA 3QTQA 3KL8A 5AR3A 3QC9A 5IG1A 1M2PA 4ANBA 4FV1A 1KE8A 3FKNA 1H8FA 4CFFA 4DA5A 4L45A 3ZCLA 3ZRMA 3DBDA 3QWJA 5KMIA 4AUAA 4KS8A 4M14A 3U51A 3P78A 3RNIA 3ZDUA 3HDMA 3EQFA 5M4FA 3WZKA 4FKOA 4I5MA 4A9TA 1WAKA 5FEDA 2CGWA 4AS0A 3O2MA 3OEZA 2BTRA 4G6OA 5FWKK 3SV0A 3OY1A 3PA4A 3JR1A 2VTAA 4DT8A 1KOBA 4NFNA 2OH4A 4TYHB 5BYYA 4FNXA 3ZO4A 4AG8A 3UOKA 5BX0A 1ZYCA 2E9OA 2PZIA 4Z7GA 4O6LA 3DAJA 4C02A 4BY9E 1HOWA 1ZY4A 4BDFA 3V8SA 4TWNA 3L8PA 4AU8A 2C4GA 5IU2A 4O7TA 4YZBA 5IQDA 4NCTC 1QL6A 3C0GA 4EK4A 4ZS4A 5A3XA 3TACA 2Y6MA 5A4EA 2C5VA 4H3BA 1CKPA 4LMNA 1QCFA 4XP2A 4BCIA 4F0IA 2C6IA 5K5NA 1UKHA 5KHWA 2YM4A 4KBCA 3TKHA 2VWBA 3MFUA 3F5GA 4C3FA 4EOLA 2P55A 3B2TA 5BUIA 3NYVA 5KMMA 2WIHA 3HMOA 4V0GB 1S9JA 3GC7A 3QRTA 5FP6A 3OS3A 3GC8A 4IB0A 2I7QA 3QTIA 2C6MA 3DB6A 1PRYA 4BKJA 3LFSA 2QLQA 4UV0A 3P9JA 4QTDA 2R3QA 3MFSA 5IA5A 3SDJA 3R8MA 4O7NA 2F57A 5EQYA 2JIVA 1Q99A 5D9HA 5ANJA 5C26A 3MPTA 5HIBA 3VNTA 3DTWA 1JNKA 2PVFA 3GEQA 3Q3BA 3CY2A 4GK3A 2Y4IC 2XCKA 2VZ6A 4I22A 4JRNA 5FRIA 3A2CA 2OJIA 4IWPA 1KE6A 2BAKA 4YZCA 3PLAE 4QMUA 5DI1A 4CMUA 1PKGA 3V5LA 1Q8YA 3LQ5A 4BZOA 4C7TA 4W4VA 3RVGA 3QZIA 1ZRZA 1XH5A 3EN6A 3I6UA 4QYFA 3R7VA 4I23A 3UIBA 3DPKA 4YURA 4UMUA 4H05A 1IA9A 3LKMA 5CEMA 2J2IB 2QU6A 4D0WA 3EL8A 1BLXA 2B1PA 4MNFA 3QC4A 4C3RA 4X2FA 2JDRA 2I0VA 2UW0A 4QYGA 4CTCA 5HBEA 3C1XA 4FT9A 4YLKA 3QCSA 4IFCA 4RFMA 5J9YA 1ZYDA 5K0KA 4ZTHA 1E1XA 2VTSA 4GUBA 4PPBA 4GVAA 2GTNA 3DDPA 1JQHA 5EQPA 5KBQA 1KE7A 3RINA 4LOPA 4BDGA 3U6IA 1UU7A 2WOUA 3G90X 3SRVB 4F0GA 5IEXA 3PIZA 5AR4A 3OFMA 3PY0A 4TPTA 2F7XE 2XIXA 3FMMA 5HD4A 3TNIA 2UVYA 3EHAA 3G9LX 3KF7A 5F95A 1YXUA 4EJ7A 4HCUA 5JFVA 5A9UA 3DXQA 4N6ZA 2BIYA 1SVHA 4BZNA 2WO6A 3LCDA 4MXAA 3R7UA 3R83A 3WZJA 5CF4A 2C47A 2IWIA 1Q3WA 2V7AA 1AD5A 2WFYA 5A54A 3A7IA 3DJ5A 3W2RA 4CYJA 4J7BA 4EWHA 2C1BA 3UTOA 3OD6X 4O7RA 4QMVA 2VO3A 2WTDA 2VTIA 3Q5ZA 5CSXA 2YZAA 3TIZA 2UZBA 4RJ6A 3C0IA 3KRRA 2GNIA 3RZBA 3LFNA 1U54A 4KKGA 4OTPA 3VBTA 4EOMA 4BDEA 1LEZA 1LR4A 3OXTA 1H0VA 4FSUA 3TV7A 4LL5A 2A19B 3CJFA 3GVUA 3BRBA 3LM0A 1ZMVA 4DFZE 4E26A 2IPXA 3HZTA 2PMOX 1M7QA 1UWHA 2UZNA 3FXXA 3R1SA 4CD0A 2HIWA 5HU3A 2OIDA 1YWVA 2WMTA 1FPUA 2PVKA 4FTTA 5EH0A 3QLGA 3O8UA 4AE9A 4TNDA 3EYGA 2PMLX 4UY9A 3TZ7A 4FOCA 3JYAA 4FSNA 3PXKA 2W4KA 1YXVA 1ZAOA 2ITNA 3A61A 5KMJA 3BE9A 4XG8A 3T8OA 4AGDA 1Z57A 4C4GA 1O9UA 4CMOA 4RWLA 1U54B 5L8LA 4IWDA 5HD7A 4QNAA 4BYJA 4X21A 3UMWA 3LMHA 3BV2A 4L8MA 4MBLA 3WZDA 4Y5QA 3IK3A 1U59A 3WIKA 4EHGA 2J90A 3K5UA 4M7IA 5LWNA 4BFMA 2HZNA 3R04A 4PPAA 5AX9A 4A4LA 3R02A 5JKGA 2IG7A 1B39A 4MTAA 2A4LA 4ITIA 4XBRA 5I4NA 1YQJA 3R8LA 3IW4A 2J4ZA 3CIKA 5EG3A 2W5BA 2XBAA 3HDNA 5IQAA 1ZARA 1CSNA 2OXYA 4FG8A 3FYJX 4F08A 4W9WA 5BVFA 3U6HA 5K4JA 5AV2A 3P79A 3F2RA 2QCSA 4IX4A 4DCEA 5KMNA 4LV5A 1X8BA 3I79A 5JEBA 4C57A 1Y8YA 2P2HA 2XJ1A 4HPTE 4TYGA 2H6DA 5EYKA 3UZPA 5B2KA 3ZM4A 3CJGA 3DA6A 2OZAA 4WUNA 2R64A 3NIEA 4BTKA 5AP1A 3V6SA 4M12A 4FV9A 4APCA 4I6BA 2IZTA 4NEUA 3HYHA 4CFXA 4JIAA 1Q8WA 1UA2A 3ULIA 3OZ6A 5HCZA 3VS5A 5A46A 5LMAA 3MIYA 2GNHA 2HZ0A 3S00A 4IX3A 4DITA 2W05A 2Y8OA 4NKAA 1H1WA 1W8CA 5CNNA 4ORKA 4EH4A 4FUXA 3ENHA 3LIJA 4I20A 4MKCA 5L2SA 5CXZA 5IQEA 3NMUF 2XK4A 3IO7A 5BVKA 3ZEPA 4BBMA 1Q8UA 2O5KA 3LCOA 3RKBA 3RTPA 3KK8A 3PXZA 4QMZA 3ZZEA 4EH9A 3AD6A 3KULA 4QQTA 1ZLTA 4HZSA 3RALA 5H8EA 4G31A 4M67A 3EKNA 1WBSA 2B7AA 4G9CA 3OT8A 4CYIA 5ANIA 3AT4A 4FMQA 2LAVA 1YOLA 2R3GA 3TDWA 4FIFA 5CSHA 2OJGA 2ITZA 3Q32A 4O27B 3CQUA 2GHLA 2XM9A 2AC5A 4AN2A 2BDJA 4IBMA 4I24A 4RBLA 3QX2A 3KCKA 2GPHA 3SC1A 3SW7A 3HLLA 5I9XA 2VWVA 3N4UA 3PFQA 4F7NA 5IISA 2XK3A 2XKDA 3PWDA 5DT0A 4FYOA 2C5NA 2XNPA 3KQ7A 4FI1A 5JFSA 2X6EA 5EM7A 5AR5A 2XCHA 1PXOA 2WQNA 3W32A 3CC6A 4GCJA 3W2QA 3LZBA 5DGZA 4E6CA 4EOQA 2QOIA 3RCJA 4UB7A 4WRGA 5HG7A 3NVMB 4G3EA 5KNJA 3C4WA 2W9ZB 4QPMA 5IA4A 2I0HA 2WMVA 5HO7A 4N0SA 5IQBA 2DQ7X 1GIIA 4TKSA 2W1EA 2FSTX 4YZDA 3RP9A 4JX7A 3QTRA 5K3YA 2XK8A 4FT7A 3PJ1A 3BLHA 3P86A 2UZTA 3R8ZA 3KN5A 5HCXA 4ZP5A 2HCKA 5JRSA 3QBNA 4RIYA 2ZYBA 2W99B 2B0QA 3JPVA 1JPAA 3CD8A 1RQQA 2PZYA 4W9XA 4HVSA 4QMQA 4MNEA 1GAGA 4UWCA 3UIUA 5I9ZA 2XEZA 2PWLA 4HYIA 3ZONA 4IB1A 4RLKA 2RFNA 1H1RA 2GS2A 4ENXA 3EKKA 4U6RA 2WMAA 4AGWA 4OLIA 3TEIA 3NUAA 3M11A 3FPMA 1R0PA 4ITJA 3O96A 3ODYX 3ZRKA 4BIBA 2BTSA 2RIOA 4FVPA 4P5ZA 5EOLA 4YJSA 4IWQA 2OK1A 2PYWA 2YITA 4PL5A 2C3KA 4FIJA 4RIYB 4I21A 1PXLA 2ERZE 3F3ZA 5E9EA 2J0IA 3GU5A 2Y4IB 2BAJA 2ZB0A 4IB5A 4O0VA 3ID6C 1PKDA 3ET7A 3CXWA 5J9ZA 4IQ6A 4IM3A 4MCVA 5CT7A 3WF5A 4A9UA 1JKLA 4DGNA 5HVKA 4FIEA 2YCFA 3AC3A 2J50A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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