5JFSA

Crystal structure of trka in complex with pf-00593174
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
305
structure length
277
Chain Sequence
MHHHHHHLVPRGSVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Discovery of a Potent, Selective, and Peripherally Restricted Pan-Trk Inhibitor (PF-06273340) for the Treatment of Pain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 277
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jfsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jfsA01
1W84A 1GAGA 2YCQA 2OWBA 2XJ1A 4H39A 4NJ3A 4C4HA 1VYWA 3E7VA 4L6QA 4EH5A 3KXGA 4F6WA 5M53A 2QHNA 3RKBA 3CTQA 2OF4A 4FG9A 1XBAA 5KBRA 2C3IB 2GS6A 3Q60A 4NWMA 4V05A 5F95A 2IW6A 4KIKB 5F20A 1H00A 3UOKA 1KE5A 3E92A 4XBUA 2W0JA 5CZIA 1M52A 2UW7A 3PXZA 1F0QA 4U43A 3VS6A 2VX0A 3QU0A 4LMNA 5IQHA 4WG3A 5AAFA 1G3NA 4FOBA 3WF5A 4YZCA 2WB8A 4X2FA 1DI9A 4LYNA 4HZRA 4FEWA 2E9NA 2YJSA 4YJPA 4AUAA 4C4JA 2C0TA 2WD1A 3KVXA 4P7EA 5IZFA 3B2TA 3M1SA 4IZAA 4ZLYA 3GOPA 3QUDA 5LVMA 1XR1A 2J0KA 3R9NA 2GFCA 3DV3A 4I6QA 5HU3A 1UNHA 3DB8A 4FSRA 3DOGA 3BHHA 1H08A 2WGJA 4RIWA 4QD6A 4BKJA 3RPVA 3P0MA 4GKIA 2QOQA 3ATTA 2VTMA 4P5ZA 4FKTA 2YDKA 1PKDA 4BGQA 2OO8X 5KMIA 3IPHA 2I0VA 2IO6A 3SQQA 3EJ1A 3OS3A 5KUPA 4BGHA 1YI4A 4IWOA 5IQGA 1H1RA 2C6KA 5TKDA 4KS7A 4H05A 1MQ4A 1QPJA 3F6XA 3EFKA 2AUHA 2JC6A 3PXQA 5L2WA 4WHZA 5BVKA 3WF7A 4LGGA 2ESMA 5CF5A 3QUPA 4TYHA 4QYGA 4ANQA 2I0YA 3FMDA 1W8CA 4D2VA 1P4FA 3HRFA 3G51A 2BALA 3NGAA 1WMKA 3UMXA 4DFYA 3I7BA 3EQIA 5L4QA 2Z2WA 2BUJA 3QD2B 4FNXA 4GSBA 3DBCA 4LMUA 5LQFA 3MFTA 3BE9A 3R7YA 4B4LA 5EW3A 2JFLA 2R0IA 3BI6A 2UVXA 4QQJA 4QMPA 2ZV9A 4UMRA 1OIUA 4WNOA 2X7GA 3VBXA 2HELA 5EM6A 4H1JA 4I24A 5M4CA 3EN4A 3IW8A 4EHGA 4OTIA 2QR8A 1IR3A 3DB6A 3O7LB 3OP5A 4D4SA 3MPAA 5KMKA 3ZLSA 3WF9A 4FE2A 3EKKA 5C26A 1GIIA 2W9FB 5DHJA 5EFQA 3W16A 2PVMA 4X6QC 2B9HA 3NNUA 1NA7A 4EOLA 3KF7A 5J1VA 2X6DA 1JKKA 4LFIA 3R7OA 3WIGA 4FIHA 5KCVA 1L8TA 4YU2A 2IW8A 2PMLX 5CAPA 3UPXA 4YC3A 3UOHA 3VBVA 3VS4A 4ANSA 1QCFA 1RDQE 4JDHA 2EB2A 3KCKA 1ZXEA 3DPKA 3QQJA 4WG5A 4ZTSA 2FO0A 1OKWA 4IEBA 5G1XA 3ZO3A 4R7BA 2R7IA 4M15A 3BYSA 3DZQA 5J9YA 5DH3A 2YABA 3SXFA 3M2WA 1X8BA 2W1GA 3OXZA 5AR4A 4XRLA 5E8YA 2C6DA 2F57A 4YLJA 3ZFYA 5HCYA 3POOA 2V22A 2R3HA 4RPVA 4DG2E 4K11A 5DA3A 3VS0A 3D2KA 5DLSA 3CD8A 3CQWA 4QMMA 4BRXA 4ONAA 2VWVA 2KTYA 3CTHA 3TV4A 3TACA 3WZUA 4FKRA 5EDRA 2W1CA 4A07A 1YWRA 3NUYA 3QRKA 1RJBA 3NW7A 3NRMA 3VQHA 3BEGA 5IG1A 3R8LA 5C8NA 1ZLTA 5EYDA 3W2PA 1SYKA 2YDJA 1Q99A 3LHJA 5ANGA 4DH1A 4ENXA 5DIAA 2I0EA 3GCPA 4NCTC 5DR2A 5CAVA 4EK8A 4N6YA 4PL3A 4HYUA 3TG1A 3ATSA 1FINA 4KABA 4LUEA 2VO7A 3UQCA 2X2LA 2YWVA 5F1ZA 3E93A 5H8BA 3OEZA 4GT3A 4BTFA 3RINA 2W5AA 3R7GA 3U8WA 3NUNA 5LCKA 2XBAA 3PP0A 3UPZA 1LPUA 2VRXA 1E9HA 3MA3A 3Q9WA 4QTCA 1Y6BA 4CRLA 4MF0A 4D5KA 4C36A 4XNEA 3R04A 1CMKE 2C68A 4XOZA 5D7VA 3EB0A 4Z16A 4FL1A 4QT1A 4W9WA 4FUXA 1DI8A 1JNKA 3N4UA 2WXVA 2Q0BA 4ZS0A 4DGNA 1IAJA 3MYGA 3R02A 3VBYA 4EEVA 2EUFB 1M2PA 4FTNA 3BV3A 2BROA 3VUDA 2C1BA 4DEEA 3K2LA 1BX6A 4ZK5A 4DTKA 2AC3A 4WSYA 4I6BA 2V0DA 2Y4PA 5GIOE 3P86A 5HX6A 5L3AA 1ZARA 3PZEA 3A8XA 5CX9A 4L8MA 5E8XA 3HYHA 3TDWA 2UUEA 3QRIA 3PFQA 3UIBA 4IAYA 4DH7A 4E6DA 4IM0A 4DFZE 3CKXA 2Z8CA 2XK7A 5IA2A 4IAFA 1KE9A 2G2HA 2LGCA 3QZIA 5ANDA 3MB6A 3QD0A 3ZXZA 2ITOA 4O96A 5CLPA 4L00A 4FYOA 2RG5A 3F7ZA 3ZDUA 2UV2A 1XH9A 3RAHA 3ZXTA 4ANOA 2ITNA 1DAYA 1ZMWA 4XG3A 2PVKA 4JBOA 4U97A 3UQFA 3EQRA 2O2UA 4MD7E 2XJ2A 3K54A 4MWIA 4AGUA 5J7BA 1HOWA 4FEXA 3C51A 4TYIA 2BZIB 3OWKA 2UW3A 3AMYA 4FVQA 4NTSA 4L44A 4Y5HA 2OG8A 3RK5A 3S2PA 3TJDA 2WO6A 2YIYA 3R01A 4D4RA 5HQ0A 2ITYA 3C4FA 2W4JA 4C62A 3FMLA 3BWFA 4F9WA 4BTKA 5M44A 2HOGA 2XCHA 5J79A 2RFNA 5M09A 3MY5A 1NY3A 3E8DA 4YGAA 1FBNA 5EH0A 4AACA 4ERKA 3MVMA 4D58A 4PMMA 2Y0AA 4S2ZA 3E8CA 3ZM9A 3FLYA 3FMJA 1BYGA 2OZAA 4EOPA 2XM9A 4C4EA 2R3RA 4FKPA 4C7TA 4YURA 4FEQA 4FNYA 1Q8ZA 3BLHA 4TNDA 5E8SA 4YBKA 2GQGA 1EH4A 3H10A 5B7VA 3VUGA 4DC2A 2X2KA 5CNOA 5DR9A 4X2KA 1ZOEA 4ALUA 3AC2A 2YEXA 5AV0A 5FDPA 4TW9A 5AIRA 2ZMDA 3FQEA 1BKXA 2RF9A 4QOXA 4QTAA 4F1OA 2HY81 4QMYA 4F7SA 2XK9A 4AU8A 4FGBA 3U6HA 4E4MA 4F7JA 4S33A 4AAAA 1YOMA 3AC4A 3TZ7A 4FSYA 2BRNA 5IISA 5J87A 3V3VA 3OW3A 3VS1A 3EIDA 2BZKB 1ZMVA 2IVSA 2X2MA 3LJ2A 3NWWA 5BVEA 4EOQA 4FZAB 3R8UA 5IQDA 2H34A 3ELJA 3EFJA 1UU7A 4I94A 4P4CA 4L46A 2XMYA 4X3FC 3R7UA 2XEYA 1MRVA 3L8PA 4WD5A 5B0XA 4BYJA 3A4OX 3FHRA 2FA2A 4EZ5A 3DQWA 5AJQA 3S00A 5GNKA 5B2LA 4GT5A 3PG1A 4CFFA 3G9LX 5BPYA 2C6TA 4C34A 2VTLA 4FV2A 1W82A 4BWXA 4RBLA 4RC2A 4R8QA 3K5UA 3BKBA 3I6WA 4WSQA 3K5VA 2YHVA 4BIDA 4CV9A 5HTIA 4GT4A 4JJRA 4UEUA 5K5NA 3KKVA 4WNMA 3ORTA 3S0OA 3Q3BA 2CHLA 3IDBA 4O6LA 2WU7A 5DBXA 3G9NA 4GEOA 1ATPE 4O0TA 4QMVA 3E3BX 3VUKA 3NEWA 4QRCA 4PMPA 5GHVA 3ERKA 4F9BA 4TYEA 5JRQA 2BTRA 2OH0E 3CIKA 3PVUA 2NPQA 2VWZA 3HV7A 2REIA 3PP1A 2JKMA 3PLAE 3QQFA 5BYLA 2ZAZA 1GZ8A 3CXWA 2BVAA 1YI6A 4BDKA 4Z7HA 1PXPA 1V0OA 3BHVA 3R63A 4HVSA 3VHEA 5J7HA 2ZYBA 1W7HA 1NVRA 3SV0A 1V0PA 2VO6A 3BWJA 3D94A 4RJ7A 3DDQA 4R3PA 3RM6A 4E3CA 4UBAA 3EFWA 5C03A 2PL0A 2W96B 3QZFA 4O7TA 4QTBA 2ZDUA 4H36A 1OKYA 5FTGA 4FV9A 3DY7A 4PNIA 2JAVA 2ZDTA 3CBLA 4AT3A 1NW1A 3LCDA 2VN9A 3KXZA 4PX6A 3MY0A 3OCGA 3L9NA 4DEAA 3FI8A 3LQ8A 2UZUE 3PVWA 4IB5A 3MDYA 5FXSA 3W32A 2P2HA 3OCTA 3FLZA 5IKWA 1J7LA 5ETCA 3I79A 4NU1A 3ZTXA 5AX3A 2PZYA 3OXTA 2PVLA 1PXMA 4FTMA 1JKSA 4G5JA 3DJ7A 4QYHA 3SAYA 4AN9A 4ZTRA 5EOBA 2BAKA 2OGVA 1O9UA 4ANBA 1T46A 2PYWA 1M7NA 5IH5A 1Q97A 4K6ZA 1ZYJA 3RNYA 3C4CA 3ZDIA 2CNUA 4YJTA 5DVRA 2PPQA 4CG8A 2HIWA 4BBFA 2PVYA 2QOBA 4IDTA 4YZNA 3KQ7A 2BMCA 2PMOX 3FXZA 3ROCA 4GV1A 4XP2A 4I93A 3OUNB 4EC8A 3LE6A 4YC8A 3LQ5A 4CEGA 1G8SA 4RVLA 4XHKB 2R3MA 3A7GA 3R7EA 3L8XA 4G34A 3EQPA 4L42A 5AUVA 4O6EA 4CFUA 3UVQA 3QWKA 3TKUA 4AFEA 4FNZA 3LFFA 4NFMA 3IDCA 4G3GA 4C37A 1JSTA 2X8DA 1UU9A 2XNGA 4MEDA 5FGKA 2WMXA 2A0CX 3DKFA 2OJJA 3FMMA 3KN6A 5KNJA 3BLQA 5HHWA 4IX5A 4KA3A 4X7QA 1AQ1A 4JOAA 4L7FA 4YPSA 3BU3A 1H1WA 4XH6A 2J0IA 3QX4A 3SHEA 2XH5A 2Z7LA 3EQFA 4UN0C 4HNIA 2JITA 4JDKA 4XG6A 2WMVA 3HA8A 4JDIA 2R3GA 4LG4A 4YSJA 4B9DA 4IWPA 3FE3A 3Q96A 4MD8E 2BHHA 3O17A 2WTIA 5FTQA 4M84A 5LMKA 4IVCA 3KC3A 3ZONA 4C8BA 1R1WA 1H8FA 5ANJA 5GZAA 5DEWA 3DNEA 4OT5A 4BZNA 2HAKA 4F1MA 3OWLA 3EFLA 3D14A 3DK3A 3JVSA 3OW4A 3PTGA 1STCE 2HZIA 2VTAA 2WELA 4HCTA 3MFSA 3TZ8A 2O8YA 3T9TA 3VIDA 5FBNC 2PY3A 3O7LD 4CCBA 4ZMFA 4BYIA 1U46A 3PSCA 2ERZE 3CGFA 3ZC5A 2PWLA 4EOKA 5FBOA 3F3VA 2YIXA 4ITIA 1YHWA 2VWIA 2C6LA 3F2AA 1H24A 4U81A 4U80A 2WMTA 5FEDA 3WYXA 2ZM1A 3GB2A 3UP2A 1MQBA 2WZJA 4C0TA 2BAJA 4IVBA 2XNPA 3UE4A 3R22A 3QTUA 4FX3A 5KE0A 4A06A 3PIYA 5LWMA 4XG9A 5JFXA 3LQ3A 3QC9A 3EN9A 2R3KA 5EM5A 3OMVA 3PA3A 2XK6A 2X9FA 3FMKA 4KKGA 4XBRA 1GZOA 4PPBA 4C4IA 4CQEA 3KN5A 2XKEA 1OL6A 1YXTA 2OJ9A 4DG3E 2Q0NA 3GQLA 4PPCA 4QMLA 3ITZA 1FGIA 2PVJA 3V8WA 2E9PA 2UZOA 3FYJX 3QHWA 4G31A 3UJGA 5CT0A 3NYVA 3QHRA 4AP7A 3L9MA 2YN8A 3A7IA 4RZWA 3RI1A 2BTSA 4YJVA 4WBBB 1YHSA 3EMGA 4RIYB 4FSNA 5HE3A 4FTAA 3C0HA 3JXWA 5HLPA 4R1VA 3FXXA 4Z9LA 5HICA 2QC6A 3VJOA 3I5NA 4N70A 4XOYA 3DKOA 4FSZA 3TM0A 2BRGA 3BZ3A 3EL8A 5AMNA 5DNRA 4ACHA 4EYMA 4O7WA 3NDMA 3EZRA 2ZB1A 2J0JA 3F3TA 3F3WA 4RX7A 4U5JA 1WBTA 3LJ1A 5BYYA 2JD5A 2IVTA 3V5LA 4FKVA 3II5A 4PY1A 2HZ4A 1ZOHA 4PL4A 3CY3A 3H0YA 4X6RA 4FL2A 3QGYA 1PJKA 3ANQA 2OFVA 3WF8A 1H01A 3LFBA 3DU8A 1IRKA 3TL8A 3HNGA 2WIHA 1IA9A 5LVLA 2AC5A 1XO2B 3O96A 4I3ZA 4OLIA 3MI9A 1Z9XA 3GC8A 2QURA 4U79A 5KMJA 4ZSEA 4MWHA 4XV3A 1AGWA 1OVEA 3V5PA 4QYYA 4L52A 4D2PA 4HYIA 4A9UA 4YZDA 4D1ZA 4HZSA 4IJPA 2QO2A 4O0WA 3HAVA 2IVUA 3MJ2A 3A62A 1NVSA 1T45A 2WMBA 1KOAA 3R9DA 1PRYA 4FSTA 3QTRA 4KRDA 3Q53A 3B2WA 5ETIA 2O3PA 1W83A 1YVJA 4TT7A 2B9IA 3PRFA 4L68A 4WA9A 4Y85A 1R3CA 2PVHA 3PYYA 4EC9A 4QPMA 2X0GA 3OEFX 2X4FA 3PIZA 1XHAA 4MXCA 3QCSA 2W1FA 1PYXA 4ZLOA 4UXQA 3BE2A 2VNYA 3F61A 3QTQA 2O0UA 4ZZNA 5HG9A 5J9LA 4AGWA 1TVOA 3LLAA 4LV5A 4GL9A 4M12A 4Y5QA 2ERKA 3UZRA 3ETAA 4FKJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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